4DWSD

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
539
structure length
532
Chain Sequence
PTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDKDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 191
structure length 532
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsD01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsD02
2Y8KA 3WSUA 2ZX5A 2CETA 1SYTA 3VPLA 4C7GA 2J7FA 3WD3A 1NM9A 4V2XA 3AXXA 4UQDA 4Y7EA 5FL1A 1UH3A 2YA2A 4UR9A 4WSKA 2VOTA 4Z2KA 2D3NA 4CU8A 1FHLA 1EDGA 3MSDA 4QLKA 3ARPA 1B3XA 3WFLA 3T2QA 3N17A 2V38A 4AIEA 1RP9A 2YL6A 3CMJA 4M29A 3UESA 3VX1A 3WF3A 1VAHA 4AISA 4PRWA 3GXFA 3AQUA 5DO8A 2J4GA 3AYSA 1E6NA 1C8YA 1CXIA 3WDHA 1QPKA 1CBGA 2Z1SA 1J0JA 3GTNA 3AICA 4HZ6A 5CLWA 5JBEA 4PMQA 4CU7A 1E55A 1VFUA 4QFUA 1UZ1A 2WMGA 4HOWA 1LG1A 1HL9A 4AIOA 1J01A 2J7BA 3QHOA 4HMCA 4M81A 1QNQA 2VQUA 4PMRA 4F8XA 2D2OA 1VFMA 1XHGA 1X1NA 4Z2GA 3W6MA 1KXTA 4Z2JA 2PB1A 4ACZA 1UHVA 4PMDA 1W2VA 3VGBA 3WENA 3WNMA 1JAKA 2J7DA 3RCNA 3FN9A 1V0MA 5CG0A 1BPLB 4F9JA 3N15A 2WANA 2YJQA 1K9EA 4GI8A 3SUUA 2DSVA 1B30A 2CIPA 2WVUA 2WC4A 3S2CA 1RP8A 1WDSA 4GZJA 2QPSA 3VD9A 1M04A 3NDYA 2J8FA 3VUPA 5F7UA 5CQ1A 3MMDA 1DWJM 4FLOA 4CVWA 1ODUA 3VU2A 3VDAA 1GOOA 4PYSA 4IPLA 4FK9A 3M07A 3EDJA 3W24A 4XB3A 1LLOA 3ARZA 1V6UA 2E40A 4CD5A 3U5YA 2DQXA 1JD7A 3AHYA 3CZEA 3L2MA 4UQ9A 1R7AA 2CYGA 1J18A 3PZIA 3OG2A 1UA3A 3WF1A 3PZ9A 2PBGA 1W9DM 4V28A 1UWSA 1XC6A 2IXUA 4ACYA 1JFXA 3W38A 4PN2A 2DH3A 1XYFA 5AY7A 4CD8A 3VKKA 2CKSA 1CECA 1VEOA 1KQYA 4AD4A 3BCFA 4J3VA 1J10A 1FFRA 1TA3B 3GBEA 2PWHA 5HPCA 3ZJ7A 3ALGA 1CZ1A 3AJ7A 2VTFA 5IXEA 4AZGA 3DYMA 5E0CA 5D4YA 4W88A 2CXGA 3ZOAA 3BLKA 1M53A 4S3JA 2MANA 3WNKA 1DP0A 1LQ0A 1CNVA 2VRQA 5DMYA 3AMLA 2VNCA 3FXYA 3LMYA 1V3LA 3A47A 3RO8A 3WNNA 1GOIA 1M01A 2JEQA 4D6JA 5LYRA 1TA3A 2CESA 3A3HA 1K9FA 3NUKA 4DM1A 4MB5A 2UY2A 3AMCA 4W7WA 1U30A 5A6LA 3CTTA 1TZ7A 3B9AA 4F9DA 3KWXA 4KWUA 4N0RA 3WNOA 4AY1A 4DUVA 4R27A 3K1DA 1QBBA 3UEQA 2VCBA 3FW6A 1ZU8A 2BXYA 3RJXA 4QDMA 3VO0A 1WB0A 4L4PA 5A6BD 2BVDA 1XV8A 2WHJA 2WXDM 4NI3A 1N82A 4CCEA 4UZUA 1CWYA 4WKFA 1C8QA 2UWFA 1EGZA 3WF2A 3VINA 4UFJA 3F5KA 2G3JA 4U2YA 2V3EA 1HP4A 2E9MA 3ARUA 3VVGA 1AMYA 3WEMA 1QW9A 4FLSA 1EXPA 1HJQA 2X2YA 3MSGA 3A6OA 2CCRA 4ZE4A 2ZWZA 3TTQA 4YPJA 3MANA 1UG6A 4PSPA 2WHLA 4UQBA 3ARXA 3GXMA 4CCDA 3PZGA 1XD0A 2GFTA 1BAGA 2DSUA 5E9AA 2XTKA 1MQRA 2C8NA 4UNIA 2A3EA 5EFFA 4U5IA 3OB8A 1VFFA 4TVUA 2VRKA 2V3GA 4HZ8A 1PZ2A 1W2PA 2E0PA 4ATWA 1W1YA 1HJWA 1W9UA 4W5UA 1CENA 1NARA 3IAPA 7TAAA 1PEZA 3UR8A 1DWGM 3B8SA 1V03A 2HISA 4PMVA 5HOSA 3WKZA 2E3ZA 3ZR6A 4AZ6A 2FGLA 3I3BA 3BAWA 2EBNA 5EB8A 1W1PA 1X6LA 4HMEA 3BSHA 1NWSA 2EPNA 1FFQA 2XVNA 5A6KA 1GQIA 4CU6A 4J3SA 2DPEA 2WYSA 3WNLA 2G8ZA 3AS1A 1UWIA 1H09A 1L0PA 2NT0A 4H41A 5LA1A 5IFPA 3PN8A 4YHGA 2WVSA 3IAQA 1QHZA 2ZUSA 3PZOA 1JG9A 2QF8A 5CPSA 4CVUA 1K6AA 1CEOA 4J3XA 2CNCA 2Y24A 4W87A 1ISWA 1V3JA 1XCWA 4UQCA 2GDVA 1NOWA 2FH8A 1ODZA 1G94A 1U33A 1V02A 1BVNP 1HJVA 4CGTA 1X6NA 1QVBA 4JL1A 3FNDA 3AS3A 4WKAA 2DSWA 4QCEA 3THCA 2EPOA 3KEHA 4BQ2A 1GW1A 3TONA 2BY3A 3CHCA 2NT1A 1GZJA 3L4YA 4GXPA 1ZBKA 1HP5A 1EQCA 1DWAM 3BAIA 4PMOA 8CGTA 1BGGA 4GIAA 1Q6FA 1ITCA 1JI2A 4MAVA 3ZJKA 1QNSA 3WEZA 1VBUA 2EPLX 3OLIA 4JZ5A 2WC3A 3FY1A 3AMDA 2XIIA 1UD5A 1JZ2A 1HKMA 1B0IA 2BY1A 1LL7A 4HP5A 1FA2A 3SCQA 2C0HA 3M46A 1CPUA 3O2LA 1OGBA 4KGJA 4KRUA 1JDCA 2X09A 5GNZA 4MB1A 3IJ7A 2GDUA 4AIUA 2PBOA 4OUEA 4PBGA 3CUHA 3I3DA 4LX4A 2FHFA 4KH2A 4PEEA 1MXGA 3QHNA 4GPNA 4UOZA 2CBIA 3B9DA 6A3HA 1E3ZA 2XGBA 3SCVA 1LJYA 5LA2A 2NW0A 4R5EA 4UFLA 4J7RA 2ZXQA 3WDRA 1GUVA 1KQZA 3AHXA 4UCFA 1UD4A 1UWTA 2J7HA 3NYDA 1UWQA 2OLHA 4MB4A 4IUGA 2DGAA 3T0BA 1XH1A 2O9PA 2AOSA 2YOCA 3GXDA 4C7DA 3D3AA 2WSPA 5ABEA 1JYXA 4HOXA 5E09A 4IISA 3AHZA 5HXMA 4LGXA 1AQMA 1UR8A 3FHQA 3WUEA 3AZSA 3CIVA 4HPGA 4U3CA 5C71A 1H49A 3GH5A 2XFRA 5CPTA 2JIWA 2YL9A 1BHGA 4Z2LA 3N18A 1UZ4A 4UFMA 1A3HA 2WMFA 1GPFA 3L2LA 4MAZA 2XFFA 4AEFA 2HVMA 1O7AA 3ZT6A 4MPKA 1W3HA 3NSNA 1D3CA 3W27A 3G6MA 5I77A 1RD6A 5BXSA 1JDAA 3EBVA 3WL1A 2ZUUA 3PTMA 4J27A 1QI4A 1TVNA 2XPKA 4UQEA 3VD3A 1E9LA 1J9YA 3W81A 3AROA 3T2PA 1C93A 1W91A 1WDQA 1KR1A 7CGTA 4P7NA 1ISVA 1UD8A 3F5JA 4J3WA 3SCUA 5BYWA 5EFDA 2XJ7A 4AZ7A 3RIKA 2G41A 1VIWA 1ISXA 1BVZA 1OIFA 1OD8A 1V3MA 2FHCA 3VGFA 1V3IA 1QW8A 1PPIA 4WK9A 2TAAA 4Q7NA 1JD9A 5E6YA 3II1A 3MUY1 4UQAA 3F4VA 1B3VA 3AS2A 3DECA 2AAAA 3WDQA 1E40A 1BF2A 4D6HA 2A3BA 1UH2A 2W91A 3W37A 4MTVA 1E0XA 3AHTA 2OWXA 3CHDA 1G5AA 2D23A 1V08A 1WDRA 3KL3A 5A3HA 4W7UA 3VGGA 2DEPA 4TXEA 2W66A 2WLYA 3UG5A 3CMGA 3OLDA 5A8NA 1J0ZA 4HA4A 2QLYA 1BYDA 1VJSA 4P7QA 5M3WA 3SCWA 3UERA 1NP2A 1WZLA 1Q6EA 1Q6DA 4S3KA 3EMZA 2VL4A 3FAWA 2G3IA 3CLWA 1BG4A 1US2A 2WKGA 4H8HA 4W5ZA 1GQKA 1CXLA 2EJ1A 1ZL1A 5ABHA 4TX8A 4A4AA 1WKYA 3RJYA 4D71A 1EOMA 1OT1A 1UR4A 1E6XM 3ARVA 1OSEA 2W4XA 3CZGA 4EANA 3MS8A 2XVGA 3HU7A 1HKIA 1MYRA 1JL8A 3L4ZA 1V6YA 3HJEA 1FOBA 4W8BA 3LPGA 3AIUA 1H11A 2WAGA 4NRSA 1P6WA 1XCXA 2BFGA 5D9MA 3W6LA 4E8DA 3IJ9A 2QV4A 2CBVA 3I3EA 3GNOA 3AIVA 3VDCA 3AHVA 3PTQA 1BYCA 3SCNA 3GZAA 3W0KA 1IT0A 1CXFA 2X1IA 4BQ3A 5GPRA 1TUXA 3TOPA 5A8OA 1XYZA 1UKTA 3OGRA 1GNXA 3WQWA 4AMCA 3TTYA 2VZTA 5A69A 4D1JA 1J11A 3VDHA 3VDBA 1E1EA 1GORA 4KGLA 4DWSC 4ZE5A 2VZSA 4EAMA 1W9XA 4AZCB 2J77A 1PAMA 1B31A 3SCSA 5FOOA 4X0NA 2BNJA 1QI5A 2Y5EA 2WKLA 2CKRA 1GHRA 4PUEA 3CZ8A 3BAXA 4B3LA 3EDFA 1CGXA 5CJ5A 4CD4A 2OYKA 2BHZA 1EIBA 3W26A 2G3NA 5ABGA 4JCMA 4OOUA 1ZB5A 5AYBA 5GNYA 2PWGA 4A3YA 3MMWA 2QMJA 1TFVA 2A3CA 1C7TA 2ZXDA 3SIMA 3TTOA 3ARRA 1MFVA 1TR1A 2DIJA 1QNPA 2WK2A 2YL8A 4HPHA 1SMAA 2RGLA 5IHRA 4AZCA 2YL5A 1KWKA 1LF1A 1OWQA 1Q6CA 2YIHA 1DTUA 5FIPA 5A6AA 3OGSA 3GYCA 2VO5A 2ZX7A 4GI9A 9CGTA 1VEMA 2PWDA 2BHYA 4J3TA 4OBSA 3A4XA 5FCZA 5A1AA 2CHOA 2GJRA 3VTRA 2GSJA 4WIWA 3T08A 2X0HA 4PSRA 4RL3A 5FL0A 3WNPA 1UD6A 4W7VA 4W8LA 1CLXA 4BQ5A 3QOMA 5I5RA 3RM8A 2ZWYA 2ZX9A 1JZ5A 4GO8A 4W8AA 3ZJ8A 5E70A 2G4FA 1CDGA 4AZHA 1M7XA 1CGTA 3LPFA 2G3MA 5TD4A 1K9TA 5IFTA 1UD2A 2VURA 1UYQA 1DWIM 3TP4A 3MUIA 2YBUA 1WP6A 3GBDA 3WFZA 2PI6A 5JBDA 3U7VA 1W1VA 4B3KA 3VM5A 4U3AA 1W1TA 2YDSA 1OCQA 4PTWA 1EA9C 1G01A 1E4IA 2V5DA 1GOQA 1SMDA 4D6GA 1JZ8A 2FDMA 2D22A 1LWHA 1DWHM 1ESWA 1U2YA 1V3HA 4P8WA 2O92A 3MV11 4UFIA 3VIGA 3GH7A 3T0AA 1JYWA 1XRVA 4V27A 4JFUA 1FH9A 3SUVA 5D8ZA 4Q22A 2FGZA 1I1WA 5I24A 1MVYA 4B9ZA 1W3LA 3CH9A 2XYLA 1B90A 5BXRA 2DT1A 1ZBVA 1WO2A 1QI2A 2CERA 3K8MA 2WBGA 3ZSTA 2W63A 1UD3A 1KFWA 2XVPA 4ZENA 5EBAA 2J74A 1BQCA 2E4TA 1LL4A 4Z2HA 2VC9A 3AFBA 3ZR5A 1ISYA 1CYGA 3U57A 1VRXA 3W25A 3VGDA 2VR4A 4H7VA 2WMIB 5A6BA 1RPKA 1GHSA 1H5VA 4M82A 3PZUA 4JCLA 1B2YA 2WNWA 2DH2A 1WNOA 3ECQA 3MV01 3RM4A 3CUFA 4CKQA 2E9LA 4YN5A 4WJXA 3ARSA 1KCLA 1NWTA 2ZUWA 5ECUA 4URIA 3POCA 1ECEA 4LYRA 2CITA 4GINA 1EDTA 2OSXA 3BC9A 3MO4A 2GVYA 2DIEA 3IANA 1B3WA 3IJ8A 3OIHA 3VILA 1JGIA 4PCSA 3OA5A 2ZUVA 4ZXOA 1IV8A 5JIWA 2WMIA 1R85A 4KRTA 3UCQA 1PIGA 1FP9A 3L4TA 3ZO9A 4X9YA 1US3A 3WN6A 1HT6A 1QHOA 2OYLA 2J75A 4MJ2A 1NP0A 1GCYA 4JKMA 1FH7A 3QR3A 3W82A 2YLAA 4CUCA 1C7SA 2X05A 3AZRA 4AEEA 2WZEA 2OSYA 2E9BA 2D0FA 2UY5A 1Z32X 1UKSA 1VJZA 1XSJA 3CGTA 1DEDA 1OGSA 5I78A 2VVNA 4BCEA 4WF7A 2Z1KA 1FH8A 2WPGA 3KL0A 4M1RA 3BGAA 4MNMA 2ZUMA 3VMNA 4AZBA 1B3ZA 3MU7A 2JEPA 1GJWA 3WDJA 3A4WA 1E4LA 2J25A 3CZKA 1E5JA 1HL8A 1QBAA 4JKLA 3WQ6A 3BCDA 4P8XA 4W85A 4J28A 5CLTA 1SFSA 1AQHA 5D9OA 4AYSA 2AMGA 3AMKA 1W9PA 4GI6A 3GNPA 2D3LA 2FH6A 1H0GA 1D2KA 5A8MA 2QMKA 1WAWA 1MQQA 1BYAA 3GXIA 4JFVA 4BF7A 1JZ3A 2J7CA 4BA0A 4TX6A 3AIBA 1E5NA 1YHTA 3BAJA 3VMPA 5M5DA 3DYOA 3WMSA 2WVVB 2W5FA 2XSBA 4PTMA 5DFAA 3GH4A 1W9VA 2JE8A 4H8UA 1HNYA 2YBTA 3BSGA 1H0IA 3NJ3A 2PF0A 3EDDA 1MFUA 1WZAA 1QNRA 3LPPA 4TUFA 4MNLA 4AXNA 1EO5A 1GQLA 1J0HA 1I75A 2F61A 4DUWA 1FP8A 4WLCA 5BXPA 1MW0A 2EXOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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