4MNLA

Crystal structure of gh18 chitinase (g77w/e119q mutant) from cycas revoluta in complex with (glcnac)4
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
344
structure length
342
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGWGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYQYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cycas revoluta
publication title Crystal Structure of GH18 Chitinase form Cycad, Cycas revoluta
rcsb
molecule keywords Chitinase A
total genus 121
structure length 342
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4mnlA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4mnlA01
2W91A 5CPQA 3WSUA 1VBRA 4AIOA 1UD8A 2ZICA 5IFPA 1E40A 3ZT6A 3BSHA 1TCMA 1BYDA 4HZ8A 1J0HA 1WZMA 2J25A 1PX8A 1W1VA 3ZSSA 1GOOA 1IZKA 2ZOXA 2VRJA 1DWFM 2ESCA 4JFUA 1JD9A 3PZIA 2WHLA 4CCEA 1H1NA 3ZMRA 4KH2A 2WC4A 3W28A 8A3HA 3VGEA 4J27A 4DWSC 5DFAA 3WH6A 3TTQA 1EA9C 2WZIA 3UR7A 3T2QA 1Z32X 1GOMA 3QOMA 4ZE4A 3ZIZA 2PF0A 5I0DA 2W5FA 3VGGA 3AYSA 3EBVA 1R7AA 1C8QA 2UY2A 2DSZA 2ZE0A 3NYDA 2UWFA 4HPHA 3WDIA 1V0MA 1NP2A 2E8YA 2J7EA 1HP4A 4PN2A 4W8LA 4PMDA 1OGBA 3WF2A 1QI3A 3ZQ9A 1OD0A 2CXGA 4ACZB 3SUVA 1W2PA 4A3HA 1IT0A 1UKPA 3CBWA 3AMGA 5D9NA 4S3JA 5I23A 1BGGA 2BY3A 2VVNA 1H2JA 2XPKA 2OWXA 5D4YA 2CBJA 1KXTA 1M01A 4CN1A 1U2YA 4CN6A 3AZSA 2J75A 3UESA 3QR3A 4GPNA 1G0CA 2PBOA 5I6SA 1WP6A 1QI0A 1MQPA 4JCLA 3SCRA 1TR1A 5D9PA 4HMDA 2E0PA 1UR4A 3N13A 2A3HA 4PTXA 2ZX6A 3WQ6A 1OT2A 4OOUA 3W29A 5FL0A 3WMCA 3WF3A 1HT6A 1ZBCA 3SEPA 1KQZA 1GQIA 5D8ZA 2VZSA 5EBAA 1AQHA 1HKKA 4GKLA 1XGZA 3K8KA 1Q6CA 3WNPA 1PX4A 3AZTA 5BXPA 1UWSA 1HX0A 4U31A 3SURA 2AOSA 4QLKA 4EKJA 1PBGA 4FLOA 3W25A 1A3HA 2UY4A 2WZEA 2IUZA 5KEZA 1XH1A 2A3BA 3MMWA 3OLDA 1NH6A 3AS3A 5FCZA 3OA5A 3K8LA 4M80A 1DTUA 1GVIA 1CXEA 1QPKA 4KRUA 3WBEA 4HOZA 5A6MA 1JZ3A 1CPUA 1A47A 2EPMX 1XCWA 3BSGA 4AZ6A 2ZUVA 3RIKA 4S3KA 3OGSA 2BHYA 2PBGA 1MXDA 1KR0A 3AMKA 1UG6A 4F8XA 3KL0A 2D0HA 2G4FA 3VDHA 3ZT5A 3SUTA 1AMYA 3BMVA 3OBAA 3AS0A 2WLZA 3FN9A 3VMOA 4CD5A 1M53A 4GO8A 1ISWA 2VCBA 2ZUTA 8CGTA 4DWSA 2ZIDA 2WMFA 5A6LA 4MNLA 1F4AA 1XH2A 1V3LA 2O9TA 4CU7A 6A3HA 4L4OA 4LYQA 2WAGA 4BZYA 2Y8KA 1JZ7A 2D1ZA 4CU6A 1PIGA 2J74A 4LYRA 3QOKA 1F4HA 1ITCA 4AZBA 4J3WA 1UWRA 2EPOA 3MMDA 3MUIA 3RCNA 4CVUA 1HKMA 1MQRA 1NOUA 4M8UA 3VGHA 3THDA 3W6LA 5GPRA 3WH5A 3FY1A 2WVTA 4JAWA 1E4IA 1MYRA 5BCAA 4AY1A 2VUYA 3CTTA 5CZKA 2B31A 1UYQA 2BY1A 2YL5A 3SUUA 3WD2A 4RE3A 4WKHA 3WMBA 4MJ2A 3CUGA 1R87A 3AIQA 5BXSA 3WIJA 4PYSA 4UFJA 2XSAA 2OLHA 2WCSA 1D2KA 2BXYA 1UD5A 3M6DA 4AD1A 1XSKA 3APGA 3BGAA 4PMRA 2A3EA 5A6SA 1VF8A 1E0WA 4MNMA 3BMWA 3UG4A 4E2OA 1J9YA 4D6JA 5HXMA 1KBBA 2VX4A 4UQBA 1UD3A 1V0NA 4MDOA 5DMYA 1BLIA 3VPLA 1J01A 2PWDA 3U5UA 4KGLA 3W27A 3WNNA 1UHVA 3CHEA 3F5LA 1NOWA 2O9RA 1CGTA 5CSYA 5A2CA 2VQTA 5A8MA 2JF6A 3A47A 5A1AA 1GZJA 1X6NA 1R86A 3GBEA 5A6BD 3VDAA 2WSKA 1XRVA 1I1XA 1UQYA 3ARQA 4C7GA 4X0NA 3AHXA 1US3A 4JZ5A 3GXMA 7A3HA 2VNCA 2D24A 4DUWA 3PTQA 3OGVA 2FGLA 2FGZA 1EO5A 1NWRA 4YHEA 1W3HA 1MW1A 4R27A 2Y4SA 4PMYA 1HKIA 3WD4A 3IANA 1OGGA 3VVGA 3M07A 4ZENA 3B9DA 5JIPA 4PSPA 4TXEA 2E9MA 1JAEA 4TTUA 1TE1A 4TVUA 1B31A 3ZJ8A 4KMQA 2CHOA 4UR9A 1XSIA 3WH7A 2WVVA 1DHKA 3GNOA 5I24A 4M1RA 4W8BA 1UR1A 1GOWA 4HA4A 3HN3A 2D22A 2XVGA 2WZHA 5A6KA 1Q4NX 3L2MA 4P7RA 4D71A 2ZXAA 1EOMA 2GVYA 3WF0A 1QNQA 1QI4A 2BFGA 3ZR5A 4WF7A 1SR0A 2VCCA 5D9MA 3WELA 4XX6A 3CLWA 4EAMA 1CXKA 1L0PA 1CGXA 1X1NA 4WKFA 1TMQA 1NQ6A 1MQQA 2J7DA 1EDGA 1JIBA 1LJYA 3SCQA 2DSUA 1G1YA 5HBFA 1JZ5A 1J18A 3EDEA 2O92A 1CEOA 2OYKA 1ZBKA 1HXJA 1UZ1A 1VFOA 3WDPP 5HNNA 4DWSB 4MAZA 1GNXA 1JFHA 1MFUA 2D23A 5KZ6A 1NARA 4HPGA 2CBUA 1VEOA 1V08A 3N17A 3UEQA 3ZT7A 1KWGA 4CN4A 4AEEA 4RE2A 1QHPA 1KFWA 3KE0A 5BROA 4GXPA 2QMJA 1B3ZA 3TTOA 2OWWA 5ABEA 3B9EA 1HVXA 3L4TA 5AYIA 4GINA 5DT7A 1CBGA 4X9YA 5M03A 5E0FA 4BQ5A 1B30A 1NWSA 3T08A 4L4PA 2GSJA 1E6XM 4WLCA 3VIGA 4B3KA 3WH8A 2UY5A 3ZSTA 1N82A 1BAGA 4BQ2A 3WNKA 4PTWA 2V38A 3AXXA 4TVDA 2CERA 2ZWYA 3PZQA 5JIWA 1VAHA 1XYZA 2V3FA 5BWFA 3U7BA 1V3JA 2GJXA 4GI6A 4UCFA 2EXOA 4AIEA 1ITXA 3A6OA 4HZ7A 3BCDA 1E0VA 4B16A 1EHAA 2EBNA 1XD1A 2W66A 1QNPA 2OSXA 4U2YA 2YA0A 4WIWA 1W3JA 3W0KA 1WDRA 4XUYA 4J3VA 3WFLA 2WMJA 2W62A 2YLLA 1J0ZA 3LPGA 1UD2A 3WH9A 3OG2A 2VOTA 2ZXBA 3WL0A 3BAXA 1KGUA 2W67A 3CZKA 4F9JA 1E6QM 2CBIA 2GK1A 5M17A 2WBKA 1FHDA 4IUGA 1LL4A 4GIAA 3EMZA 4ZXOA 1E70M 2UY3A 3AXIA 3ZO9A 2WMIA 3MKKA 1E6RA 1BYBA 4NRSA 1WDQA 4EE9A 1MXGA 3MS8A 3AROA 3VU2A 3MANA 2X8RA 1KCLA 2C0HA 4JHOA 3SCTA 1XYFA 3F4VA 4OUEA 4MB1A 1M03A 4HMCA 1BF2A 4M82A 1QNSA 5CQ1A 4CD4A 2VI0A 2WBGA 1JNDA 4PRWA 3CGTA 3GNRA 3VD5A 1FH8A 3VINA 1UKQA 1V6XA 3WD1A 3W53A 4KWUA 2VR5A 3PTMA 3L4XA 1BG9A 2OWCA 2VX7A 4AD3A 1JI2A 1QBBA 5C71A 3EMQA 3CZLA 2GJRA 2ZUWA 1CGVA 2YL9A 5JBEA 2CBVA 1JYVA 3G6MA 3UCQA 2GJPA 1GONA 5CSUA 1ISVA 3EDFA 1IZJA 1JF5A 1KGXA 1MW0A 4D6DA 3WUGA 1XD0A 3L4UA 1VFMA 1WPCA 4AEFA 3VNZA 1Q6EA 3VX0A 4QLJA 2YBTA 4GZJA 4CD7A 4UFIA 1BTCA 1CGYA 1M04A 2J79A 3BAYA 4W5ZA 1GOQA 4GZEA 4OOZA 3GH5A 5E9AA 1EQCA 1CGWA 1VBUA 4GQQA 1ISXA 1CYGA 1UZ4A 1K9FA 1UOKA 3AJ7A 1KR1A 5JUVA 4MB5A 1HNYA 3OGRA 1BHGA 1KXQA 3W38A 1KXVA 4JFWA 1MFVA 5ABFA 1E71M 3EDJA 2RGLA 4H7VA 1RPKA 4HZ6A 3NDYA 3TTSA 1QBAA 3L4VA 1C91A 2NT1A 4BCEA 4V2XA 3S6TA 4HTYA 1VIWA 3ARTA 3M46A 4GI8A 5M5DA 3WBAA 1C8XA 4F66A 5I2UA 1HL9A 3ARUA 3WDQA 3NJ3A 1GOKA 3SCPA 1GUVA 5ABGA 2XGIA 4AWEA 1PAMA 3MMUA 1BG4A 5DT5A 1QHOA 3AOFA 3TOPA 4M56A 4Q22A 4GQRA 2D2OA 3W82A 3CUHA 3VIMA 1W9VA 3RILA 4W7WA 1ISYA 2JEPA 2DH3A 2VC9A 1JDDA 2WVUA 2XGBA 2YL8A 3AXHA 3DYPA 1ODUA 2BY2A 1JD7A 1ZBWA 1O7AA 3CIVA 1JG9A 5CLWA 2DGAA 4QLLA 3N1AA 3WUBA 2V5DA 2VVSA 3I3EA 1FP8A 4P8WA 2PWEA 3D5HA 4JKLA 3CUIA 1Q6FA 1R85A 2ZX9A 3K4DA 1OWQA 2J77A 4PSRA 1CXFA 4LX4A 4AD0A 2J8GA 3F5KA 3T2PA 3MV11 3CZGA 1J10A 4B9YA 3N15A 1TVNA 4MPKA 4ACYA 3WY1A 4JL2A 1ESWA 2YL6A 3GDBA 4WJXA 1BYAA 1VEMA 2BHZA 3ARVA 2XM2A 4AMCA 3WDRA 2XVPA 5GQBA 2YIHA 2WW5A 1C7SA 1HJWA 4ZE5A 1B3YA 1OIFA 2J7BA 2QV4A 4BQ3A 3WNLA 1WO2A 3EDKA 1E1EA 2WC3A 3IK2A 3I3BA 4D6EA 2DIEA 4ZFMA 2EPKX 1QOXA 2PWFA 1ZU8A 1B0IA 1LLOA 4KRTA 1H0IA 5ECUA 3AFBA 2TAAA 4EANA 3WUFA 4IPNB 2ZX5A 1GOIA 1NP0A 2ZUMA 3ZJKA 4F79A 1O6IA 3LPFA 5BRQA 3CZ8A 3J7HA 4UZSA 1ECEA 2GK1B 1GJUA 3II1A 4A4AA 2WCGA 1B3XA 2YBUA 1E55A 5E09A 2WWCA 1E5NA 4P8UA 1OT1A 2WMKA 5D9OA 3FW6A 3VIJA 2WKGA 4MB4A 3RPMA 3NDZA 1WB0A 3UG5A 4C7FA 1C90A 1HF6A 1GCYA 2W63A 1V0LA 3OZPA 1HN1A 2VX6A 3TONA 5CJ5A 2YDSA 3K4AA 1H5VA 3CMGA 3GXIA 5FIPA 5FOOA 1WZAA 3QHNA 4CKQA 4Z2IA 4WSKA 4HOXA 3AIUA 2XJ7A 1UR9A 5A2AA 3AQUA 3TP4A 5FL1A 5D8WA 1G9HA 5HPOA 4KGJA 4UQDA 1UR2A 4P7OA 2GUYA 4BF7A 3ECQA 4J3SA 1BQCA 1E4NA 1J0YA 1MW3A 4UFHA 1U30A 1E9LA 3VIPA 4UOZA 1JI1A 2J47A 3PZMA 1B2YA 5EMYA 3WUEA 4J3XA 1VENA 2OSWA 2DSVA 5AY7A 2CIPA 2VR4A 2NT0A 3THCA 4IISA 1EO7A 4ZXLA 1WNOA 2DT3A 2J8FA 5ABHA 3AIBA 4E4PA 4QFUA 1JGIA 3GH4A 2CESA 5EFDA 1OIMA 2AAAA 1J0IA 3ZM8A 1XV8A 1JZ4A 2JE8A 4OKDA 2DDXA 1CIUA 2EO7A 4AZHA 4OBSA 1BSIA 4NSBA 4H41A 1ZJBA 3CZEA 4H2CA 3AIRA 1NOFA 2XWEA 1QW9A 2O9PA 4J3TA 3VKKA 4PMNA 2DH2A 6TAAA 4M81A 1JDAA 3W24A 1PJ9A 1NM9A 1UWQA 1W1YA 3VD3A 5BRPA 3K46A 5AC5A 1J0KA 1VJZA 2XYLA 3VMPA 1TFVA 5I5RA 3IAQA 3SCVA 2CCRA 3TA9A 3FHQA 2DT1A 1KQYA 4CCDA 2G3MA 4IPLA 3WDJA 4DM2A 1OGSA 5JBFA 5A8NA 3FHAA 1C8YA 2DPEA 1GQJA 4V27A 5IDIA 4CD6A 3G6LA 2J62A 1EIBA 1LQ0A 3NSXA 3UG3A 1E4LA 1ZL1A 3CHDA 3CUJA 3UERA 5IFTA 2E3ZA 1YHTA 4AZ7A 1VFUA 3VUPA 1DWGM 3EDDA 1E5JA 1R8LA 4DUXA 2VZUA 2X1IA 4H8HA 9CGTA 1PIFA 4CU8A 5CLTA 5A95A 1SYTA 3WL1A 5A6BA 2HVMA 4HA1A 1ZBVA 4MNJA 4A3YA 4CUCA 4Q7NA 2F2HA 4RL3A 4NF7A 1ZS2A 1X6LA 2F61A 1OBAA 1CXHA 1WZLA 2Y5EA 3SCOA 4AZGA 4AIUA 4FF5A 4IM4A 1LWJA 4D6HA 2JALA 5LYRA 3UR8A 4W8AA 1CXIA 2YJQA 1TG7A 1B9ZA 4GO9A 1E3ZA 1KGWA 2VQUA 3GXDA 4UFLA 1V02E 4W88A 3IJ9A 4WKAA 2WSPA 2BVTA 1WKYA 1HVQA 4F9DA 1UWUA 4ATWA 1LWHA 4PMVA 1E6PA 5E0CA 4CVWA 4U5KA 1W32A 4H8VA 1W1PA 4MTVA 1US2A 3WQ5A 3PTKA 2IXUA 4MDPA 4UQ9A 1LL7A 2JIWA 4AD5A 1BVZA 1JZ8A 3IAPA 1R7OA 3N9KA 3N04A 2YA1A 3WNOA 4LQ1A 5E6ZA 3L4WA 5LA1A 3T09A 1CECA 4UZUA 1V02A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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