4MNMA

Crystal structure of gh18 chitinase (g77w/e119q mutant) from cycas revoluta in complex with (glcnac)4
Total Genus 122

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGWGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYQYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDPNSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
5010015020025030030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTVIII1 (27-30)AH9 (336-345)S1 (4-10)TIV1 (13-16)3H1 (11-13)3H2 (19-21)TI1 (14-17)AH1 (50-64)TIV2 (15-18)3H3 (24-26)TI3 (65-68)S3 (69-75)S2 (29-35)S5 (154-159)S8 (185-188)TVIa1 (38-41)AH3 (92-109)TI2 (39-42)TII1 (47-50)S4 (113-117)TIV3 (118-121)AH4 (124-148)S7 (169-173)AH6 (216-226)TVIII2 (160-163)S6 (164-166)TIV4 (164-167)AH5 (176-182)3H4 (230-232)S10 (233-238)O1 (188-190)S11 (240-246)TI5 (195-198)S12 (256-261)TI6 (248-251)TVIII5 (196-199)S9 (200-201)TIV5 (203-206)AH8 (306-319)TIV10 (286-289)TIV6 (206-209)TIV7 (209-212)O2 (213-215)S13 (267-269)TIV9 (263-266)S16 (299-303)TIV8 (262-265)TII'1 (296-299)S15 (291-296)TII2 (253-256)TVIII6 (246-249)AH7 (270-279)S14 (282-286)TI7 (287-290)S17 (323-327)TIV11 (326-329)TVIII4 (192-195)3H5 (329-331)AH2 (79-90)TI8 (332-335)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Cycas revoluta
publication title Crystal Structure of GH18 Chitinase from Cycad, Cycas revoluta
rcsb
molecule keywords Chitinase A
total genus 122
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4mnmA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4mnmA01
4JCLA 2CNCA 4OZOA 5A6BA 4OUEA 3CUHA 4PTVA 3WEZA 3VDBA 1UZ4A 3N12A 2CXGA 3LPPA 3CGTA 4YPJA 4AD2A 2V3FA 1TR1A 1EXPA 1ISVA 1TCMA 3VKKA 2GSJA 2BY3A 1QOXA 4UCFA 1VFMA 2WAGA 1HKKA 1V3JA 2VMFA 3QR3A 4N0RA 1DWFM 3K1DA 1ESWA 1X1NA 2E8ZA 4CD6A 5ABHA 5GQBA 5DF0A 1ZBCA 3AHTA 2YJQA 2XGIA 1UQYA 3VMPA 5M5DA 1BG4A 4AZBA 1MQRA 1IV8A 3O2LA 6CGTA 2W92A 3VTRA 3SCPA 4ATWA 1W9UA 1JAEA 2W5FA 4E2OA 4J28A 3D5HA 3WD2A 4AZGA 1WZLA 3T08A 2DGAA 7A3HA 3ARVA 2YBTA 2WHKA 3T09A 4D6FA 2Z1SA 3RMEA 2V3GA 2ZOXA 4ZE4A 3UR7A 3ZSSA 1HN1A 3W0KA 5DO8A 1E6RA 4BQ5A 4AZCA 1BYAA 2BFGA 1VFFA 4GI8A 2XVLA 4X9YA 5A8OA 2UY2A 4WKAA 2X2YA 1CXLA 1OT2A 2VRJA 4KGLA 1X6NA 4Z2KA 4CN4A 4UQCA 4OBSA 1VBUA 2E3ZA 4OIFA 1H5VA 3K8MA 4D1JA 4ZXLA 3WIJA 2W61A 3GXIA 4GIAA 5IDIA 4HU0A 1GHRA 1M53A 4TOQA 1HKIA 2PI6A 3WF2A 1JYNA 2XIBA 1GOIA 5FL1A 2PWFA 1UKSA 1QHZA 2FH8A 2XFRA 4JKLA 4KH2A 4FLSA 4L4OA 5AY7A 4W7UA 4AZCB 2D22A 3VNZA 1GOMA 1GQIA 2XSBA 4P7LA 1GNXA 1V0KA 4NRRA 4U3AA 2GDUA 4MDOA 2MANA 3WQ5A 2Y24A 5A69A 2ZX6A 4D6CA 2FHCA 2AOSA 1UD4A 1RP8A 4XX6A 2E0PA 1UKOA 1DP0A 3GM8A 2VZUA 4UOQA 5A6KA 1DEDA 4EE9A 1LQ0A 4WIWA 3WL0A 2VO5A 2XYLA 1JD9A 4PYSA 1LWJA 1PBGA 2GUYA 4WKHA 1CXEA 4B15A 1BGAA 3W6MA 1EQCA 1KWKA 1V6XA 5M03A 5HPCA 1QVBA 5A1AA 3WNOA 2J8GA 2WM0A 1D3CA 3VGHA 3MKKA 1V02A 5FCZA 1US2A 1N82A 1J0YA 1W3KA 3WQWA 1B3XA 1GVIA 4HOXA 4PUEA 3EDDA 4PN2A 3CHCA 3K8LA 2AAAA 3N9KA 5GNYA 1QNSA 2XUCA 4J7RA 5DT7A 2O9TA 1E0XA 1GQJA 4MNLA 1CDGA 2QMKA 2ZXBA 1UA7A 2XPKA 1ECEA 3N11A 1B9ZA 3ZJ7A 1JIBA 1HVXA 3NJ3A 3AS1A 5LYRA 4Z2LA 4B16A 1CGVA 3T0BA 4LQ1A 1E43A 2VR5A 3EDKA 4GINA 3ARRA 1JZ3A 1Q6EA 1B2YA 1H09A 2F8QA 3WKZA 4BQ3A 2DDXA 3PZTA 1UWRA 5I3DA 3ARUA 1B1YA 1HJSA 1K9EA 3ZO9A 4QFUA 3TTOA 1JAKA 1I75A 3KZSA 3M46A 3PZGA 5D9PA 2DEPA 4NSBA 2D3LA 2Q8XA 4MB3A 5CGTA 2BHYA 3OIHA 3G6LA 1KCKA 4FK9A 2FGLA 2YL6A 5HNNA 4TTGA 5FKYA 4D6IA 1CXHA 1OIMA 1HL8A 1DTUA 1C7TA 2WCSA 2E9LA 4H8VA 1EHNA 1E4IA 2J7HA 2QHAA 4ZXOA 1BYDA 4Z2GA 2CETA 4HA4A 3L2LA 4JL1A 2VCCA 1FH9A 1XYZA 2WKGA 4ZFMA 3DYMA 4W7WA 1OCQA 4AD1A 2J77A 3N13A 1UH4A 2EQDA 4HPGA 4GKLA 1DWAM 1EDTA 3CH9A 3B9DA 2EPLX 2V5DA 4B3KA 1UA3A 1NM9A 1GOOA 2V5CA 1UR9A 2OWWA 1JDCA 2JEQA 2VR4A 4XZWA 1GQKA 2C7FA 4UFHA 1CGTA 4AWEA 2PBOA 2RGLA 1MVYA 2ZE0A 3VMNA 3ZR5A 3WF4A 4AMCA 1OIFA 3WUBA 1LG2A 2CEQA 2BV9A 1IZJA 2WMKA 3L2MA 3HN3A 4PRWA 1CGXA 1EDGA 4QLJA 2JEPA 1UD5A 2XWEA 4UOJA 3T0AA 3VGFA 3ARPA 4FLQA 3AXIA 1C8QA 5HDRA 3AHYA 4QAWA 2QLYA 1UR4A 2CHOA 1SMAA 1UD8A 1AMYA 1RP9A 5E0CA 4MADA 3J7HA 4W89A 1XSJA 3A6OA 4HMEA 4N42A 2XJ7A 1ODUA 1TA3A 1EDQA 4D6EA 4AYSA 2XFFA 3L4YA 1WZAA 1PAMA 3ZJKA 4R5EA 2ZXDA 1KXHA 2ZUUA 1ITXA 3VM5A 4U31A 4CVUA 2YDSA 3GXDA 1XV8A 3BGAA 4QP0A 1XHGA 1QW9A 4PTWA 2WNWA 1KBBA 1JI2A 4Q22A 2ZXQA 5CJ5A 3AI0A 1BGGA 3WNPA 3WENA 1E40A 3EMCA 5BRQA 2OWXA 5BYWA 5FOOA 3OGRA 4JFWA 1W3LA 3EDFA 3WNLA 3RIKA 4U5KA 4CD5A 5BXPA 1KXQA 3I3DA 3PZUA 3VD9A 4M82A 3N15A 2GK1A 3CHEA 3AQUA 1F4AA 5A6AA 3B9AA 1EHAA 4P8WA 2DSUA 1EGZA 2WMIA 1C93A 3MSDA 3WH6A 1UH2A 2C8NA 2WWDA 3U7BA 2WBKA 4UQAA 1K9FA 3N18A 1V0NA 4F9JA 3AIVA 4CGTA 2WZIA 2WXDM 4GZIA 3CHFA 1QNQA 3AHVA 1OT1A 1HJUA 5JUVA 1Q6CA 4P8VA 3KEHA 1EH9A 4UZUA 1CXFA 3L4WA 2YDQA 3W82A 3WMSA 1W1PA 3PBGA 1W1VA 3SUSA 3MU7A 3ARSA 2EXOA 3AZSA 4XB3A 4HZ7A 3AS2A 3VU2A 2FH6A 1NOUA 2YL5A 3VX1A 2WC7A 2Y8KA 3PZVA 2IXUA 1FFRA 2PWHA 2O9PA 5CSYA 3VPLA 2FHFA 1LL4A 4W5ZA 3OLEA 3VD7A 3BC9A 4NZCA 1QHOA 3B9EA 2YA1A 1QHPA 1E3XA 3FAXA 3U57A 4C7GA 3W28A 4PMRA 1QNOA 3RJYA 3F5LA 1JDDA 2ZUWA 1NWRA 2J7DA 1OBAA 1GUVA 1UWIA 9CGTA 1XCWA 2J4GA 4GO9A 1HVQA 2CBIA 3GXFA 1OINA 2XVPA 2WC4A 2YLAA 1H0GA 4TTUA 4TX6A 1DWJM 1UR0A 2G3JA 3AICA 1EOMA 1PJ9A 1NOFA 1UUQA 2AMGA 2YL8A 5BWFA 3W26A 3VIFA 4P7QA 1KB3A 4YHGA 3EDJA 1JL8A 1V08A 1UWQA 4PSRA 4MNKA 3OA5A 1W1YA 5ABFB 2PF0A 4AZ6A 2YBUA 3KL3A 4UQDA 1EO7A 1MXGA 1WDSA 1TFVA 1H3GA 1MXDA 4KRUA 2A3AA 2WKLA 1E73M 5FL0A 3RM8A 1DHKA 2ZICA 1ZU8A 1EIBA 1JDAA 3AIRA 2WHJA 2BY2A 1G0CA 4D6GA 1WNOA 2J7EA 1TE1A 3LPOA 1R7OA 5E0FA 5EMYA 2BVYA 4HOZA 3CZLA 1UR8A 3AS3A 3AOFA 3WMBA 4UQBA 2VZVA 1BTCA 2W4XA 4URIA 4J3VA 5E6YA 4ACYA 3O6AA 4R27A 2BY0A 5I2UA 4LXFA 2DSWA 1VFUA 3RCNA 3L4XA 3WFZA 1MFUA 3CO4A 2ZUVA 2V3DA 1ZJBA 2WW5A 4LPCA 2ZX5A 3MUIA 3TONA 2DQXA 4PMUA 1MWOA 1TUXA 4KRTA 1YQ2A 4UOZA 5A94A 1JFHA 3SCOA 3TOPA 5D8WA 3ARTA 2X1IA 2HISA 3W4RA 4GPNA 4M1RA 1CLXA 3EDEA 2OWCA 2X8RA 1WAWA 2WVVB 4LYQA 3GBDA 4D6JA 8A3HA 4LYPA 3ZJ8A 3IK2A 5E09A 2J47A 5A3HA 3POHA 4PEEA 3VIGA 1WP6A 4M29A 4P7NA 2QPSA 2D3NA 4PMXA 2YKKA 3CUIA 3U5UA 4AEEA 3WF3A 1VEOA 2A3CA 3W81A 2ZWYA 1KCLA 2JIEA 4WSKA 5LA0A 1LJYA 3ALFA 1UWSA 5I0DA 1VAHA 3AIEA 2DSKA 1BG9A 4GO8A 4CN6A 3WBAA 3AMLA 1DWIM 5HBFA 3WNKA 5E6ZA 2VI0A 1W2PA 2CESA 1I1XA 2CBVA 2YIHA 2G8ZA 3VOCA 3AZTA 1PZ2A 1AVAA 1E71M 2UY3A 2FGZA 1FOBA 5E70A 4M24A 1ZL1A 1J9YA 3UESA 3VUPA 4AIUA 4ATLA 3A3HA 1B3WA 3NCOA 4AY1A 3HU7A 1WZKA 1O6IA 4MDPA 2WC3A 4OKDA 5AC4A 3PZMA 3AIQA 4H7VA 3WNNA 4CCCA 3GDBA 1E72M 5DFAA 2PBGA 1XD1A 1SR0A 2DPEA 2E9BA 2J74A 2JIWA 3WDIA 5D9NA 1BHGA 1UG6A 2XVGA 2EPMX 3BMWA 4UQEA 3BAXA 4UFJA 3EBVA 5A8NA 1OGGA 4HZ8A 3W29A 1WDPA 4QDMA 2WWCA 1E56A 3VD3A 5CGMA 2VZOA 1M01A 3RO8A 1MFVA 3WQVA 1GORA 1C92A 3A4AA 2OSWA 3WDQA 4P7RA 1B90A 1R7AA 3BAYA 3SURA 2GJRA 3CZ8A 1V02E 3TTSA 1UKTA 1WO2A 3AIUA 1J12A 5A6JA 5AYIA 3AXXA 2WB5A 1GW1A 2HVMA 1OGBA 1Z32X 5D8ZA 5A6LA 2BHUA 3M7SA 4H8HA 2FHBA 4LYRA 3TTYA 1MYRA 3W24A 2J7BA 4C7DA 4DUVA 2QF8A 3PZQA 5BXSA 2NT0A 2X0YA 4ML4A 1DWGM 3OZPA 3ECQA 4Z2JA 4EK7A 3SCUA 3BSHA 3MV01 5LA2A 1EQPA 3QHMA 3BSGA 3MMWA 1GOKA 3OZOA 1RH9A 2EEXA 4Y7EA 1M7XA 4FLOA 1UHVA 4ZEPA 2UWFA 1CTNA 1E4NA 2VCBA 3SCSA 4MNMA 3WDHA 3W53A 5JIPA 1H2JA 2UY4A 1VRXA 2VVSA 1WE5A 4NF7A 2FDMA 1VEPA 2CITA 4J3TA 4AIOA 4A3YA 2E4TA 2BVTA 4X0NA 2XVKA 1NP2A 1I1WA 1M04A 1GCYA 1VBRA 2VX4A 2G41A 3UG5A 4PCTA 4DM2A 1PX3A 5BCAA 3VINA 1SMDA 2J8FA 3I3EA 5CPSA 2YDRA 3MS8A 1EOKA 2C0HA 4W8LA 1EA9C 1V0MA 1HKJA 2DT3A 1UR1A 4WSJA 1E70M 3AXHA 2E9MA 2D24A 3L4ZA 3SCNA 4TX8A 1CGWA 3TA9A 3WUEA 3WD4A 2DT0A 4L4PA 5IFTA 3OB8A 4M56A 4RE3A 3GNRA 4J3SA 5I78A 5ABEA 7TAAA 3WDPP 2F2HA 4MB4A 4ZE5A 5CSUA 2A3BA 5F7UA 1Q6FA 3AJ7A 1KXVA 1CNVA 1UWTA 1KGWA 4CCDA 4MB5A 4W88A 3VIPA 2D0HA 3VILA 2F61A 3MUZ1 3S6TA 3II1A 1UYQA 4AZ5A 2VZTA 2XHYA 1HX0A 1J0IA 2CERA 1KXTA 1A47A 3WH5A 3CUFA 4PCSA 1U2YA 1ZBWA 4ZENA 2EPOA 4PMVA 3ZOAA 4V2XA 4XZBA 1V6VA 2GVYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1EO5 A;  1XSI A;  2DIJ A;  5I5R A;  2XSA A;  3FW6 A;  1CPU A;  1NWU A;  5A95 A;  3THC A;  3BCF A;  3LMY A;  3CIV A;  3WQ4 A;  3VDC A;  2J78 A;  1PIG A;  1Q6G A;  1FFQ A;  1C8X A;  5I79 A;  5FIP A;  3WH8 A;  2J25 A;  4JL2 A;  3IAN A;  3W27 A;  4JZ5 A;  1H4P A;  4U33 A;  4YHE A;  3MUY 1;  5BXT A;  1E4L A;  3ALG A;  4KMQ A;  5M3W A;  4CKQ A;  2G3M A;  4V28 A;  3VVG A;  4BS0 A;  4RE4 A;  1VEM A;  2V38 A;  4CU6 A;  5LA1 A;  1WZM A;  5AC5 A;  2DSZ A;  3PZO A;  1TA3 B;  3MO4 A;  1XSK A;  2WMH A;  1QNP A;  3WUG A;  1NOW A;  2RGM A;  2GJX A;  1V3L A;  3ZST A;  3PN8 A;  1J18 A;  2PWD A;  1UWU A;  1UH3 A;  3EMQ A;  4BCE A;  2E40 A;  1HF6 A;  5I24 A;  2EPN A;  2XM2 A;  4D6H A;  2O9R A;  4CU8 A;  4Z2H A;  2WSK A;  2WSP A;  5D9M A;  1MW2 A;  4AXN A;  5HPO A;  1G01 A;  4ATD A;  2XVN A;  1K9T A;  1C7S A;  2CYG A;  3OG2 A;  1WDR A;  1KQY A;  2GK1 B;  2VRQ A;  4CD4 A;  1OD8 A;  1CEO A;  2VQT A;  3ARO A;  2OSY A;  2D2O A;  2GJX B;  1E6P A;  2WMI B;  3CZJ A;  1QI5 A;  1BVZ A;  3CPU A;  1YHT A;  4HU8 A;  4XV0 A;  4KWU A;  1PX4 A;  1KR0 A;  1UQZ A;  4GXP A;  3SEP A;  2ZWZ A;  1W9P A;  5A2A A;  1G9H A;  4NI3 A;  1E6X M;  1C91 A;  4GI6 A;  3WN6 A;  4DUX A;  2ZUN A;  2G3N A;  3CZE A;  1O7A A;  2VZS A;  3WD3 A;  1TMQ A;  3GH4 A;  2ZX7 A;  1OWQ A;  4UZS A;  3TTQ A;  3AMC A;  3RM4 A;  2GJP A;  1OD0 A;  2ESC A;  1CXI A;  5CPT A;  1LL7 A;  2NW0 A;  3VM7 A;  1TG7 A;  4GZE A;  1ISW A;  3LPG A;  4PUD A;  4EAM A;  3ARW A;  3WH7 A;  3VII A;  5DT5 A;  1ZBV A;  1FHL A;  1QI0 A;  2OYK A;  4A4A A;  2ZX8 A;  4HMD A;  3E1F 1;  1HL9 A;  3ZIZ A;  1B3V A;  3VGB A;  1HJQ A;  3FAW A;  4P7O A;  2VX5 A;  4AW7 A;  2VC9 A;  5A8P A;  1G5A A;  1W9X A;  5EBA A;  3APG A;  1M03 A;  4DM1 A;  3TP4 A;  1IT0 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2FH8 A;  2X42 A;  4NL1 A;  4L4O A;  4AZC B;  1AH0 A;  4JTD A;  5D2T A;  5A6T C;  2XSB A;  1GW9 A;  4K1G A;  3CU2 A;  3WQ5 A;  4H8N A;  3E02 A;  2ZX6 A;  4D6C A;  3NNT A;  2FHC A;  2AOS A;  1RP8 A;  1P0B A;  2F84 A;  3P60 A;  1UKO A;  1DP0 A;  2G5W A;  3FA4 A;  1DED A;  3PWA A;  1QXL A;  3UFY A;  1XF0 A;  4WY0 B;  2J9Z A;  1LWJ A;  5J04 A;  2CZ5 A;  2GUY A;  2BTM A;  3IUI A;  2Y8U A;  1LOQ A;  4DJF A;  1KWK A;  3QST A;  1KV5 A;  3WNO A;  2J8G A;  5XIN A;  1R3T A;  1D3C A;  2IQ0 A;  1BRL A;  3RPT A;  5FF3 A;  5D75 A;  4HIB A;  2ZRV A;  2PLK A;  3WQW A;  1GVI A;  2FTY A;  5LXX A;  4HOX A;  2E5D A;  4PUE A;  4GFI A;  4PN2 A;  1RCQ A;  1P5B A;  2Z1V A;  3CIW A;  3T9P A;  2FGB A;  2HBX A;  1KT1 A;  2KZH A;  4J5N A;  5GNY A;  4ODM A;  3I4K A;  1F3X A;  2XUC A;  4L3N A;  1E0X A;  4M6U A;  1GQJ A;  4HYW A;  4JFM A;  2A5H A;  5CCZ A;  3OHI A;  1CDG A;  4XUG A;  3KM8 A;  1K6W A;  1ECE A;  4WVX A;  1VLW A;  3UGR A;  1YRR A;  1NSJ A;  2R94 A;  4GVI A;  2DW6 A;  3DAQ A;  3M5X A;  1K70 A;  3CQK A;  3AS1 A; 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 4CCZ A;  3LPG A;  3PBW A;  1A0D A;  4JS3 A;  4PUD A;  2JBM A;  1W5O A;  2IW0 A;  1PTG A;  4ODR A;  4L65 A;  5DT5 A;  1ONW A;  2D73 A;  1ZBV A;  3MA8 A;  2O56 A;  1ZY9 A;  2OEJ A;  3B4Y A;  5F2M A;  1R3Q A;  3FK4 A;  3LD5 A;  3FAW A;  2VX5 A;  5AYY A;  5A8P A;  4F0H A;  1S5V A;  3M5Y A;  4AX6 A;  1W9X A;  3UBP C;  3VYL A;  1M03 A;  1F40 A;  1A5A A;  4N6F A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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