4MNMA

Crystal structure of gh18 chitinase (g77w/e119q mutant) from cycas revoluta in complex with (glcnac)4
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGWGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYQYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDPNSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cycas revoluta
publication title Crystal Structure of GH18 Chitinase from Cycad, Cycas revoluta
rcsb
molecule keywords Chitinase A
total genus 122
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4mnmA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4mnmA01
4DWSB 2QMKA 3DECA 1XYFA 5E9AA 1CXIA 3GXMA 4GI6A 1HJWA 1B3YA 3W27A 1UKSA 3CUGA 1UWRA 5CSUA 5FIPA 2YLAA 3FNDA 4U31A 5DFAA 3WF0A 2Y8KA 6TAAA 4XZBA 1OBAA 4YN5A 1JD9A 1UH3A 3NYDA 4J3XA 5LA2A 4XX6A 4AIUA 5I24A 2V5DA 3PTQA 4ZFMA 4OJYA 5CPSA 1PBGA 1J01A 1ZBWA 2Y5EA 2X1IA 1ECEA 3T08A 5BXRA 2VCBA 5CXPA 4PCSA 4FF5A 5A6KA 4AMCA 1X6NA 3OA5A 2WCGA 2CKRA 1QI2A 1W9BM 3SCNA 3WFZA 3BGAA 2WWDA 1J18A 2ZX5A 4UZUA 1W9DM 3L4ZA 4U2YA 4UFIA 1NWRA 3QGVA 4D6CA 2HISA 2C8NA 1PZ2A 1J0ZA 1I1WA 1VBUA 3CH9A 1UKTA 5A8NA 1OIMA 3GXDA 1UD2A 1VBRA 3TTYA 2A3HA 1QPKA 4CU6A 3WMBA 1J0IA 2WM0A 2NSXA 5EFDA 1KGUA 5A2AA 1K9DA 5A1AA 2WBKA 1ZJBA 2V38A 2PI6A 1CZ1A 2BV9A 1GHSA 4MB5A 1P6WA 2CITA 3HJEA 1W2VA 2VRKA 1HT6A 1PZ3A 1NOFA 5I77A 1XCXA 4BQ2A 2W63A 3B8SA 2XGBA 2Y2WA 3A4XA 3W81A 2WVVA 1OT2A 4H8HA 6CGTA 4ZXOA 2W62A 2OSXA 4ZE5A 4MDOA 4JKKA 5JBFA 1UR0A 5DF0A 2VTFA 1CGXA 3AMDA 3CUJA 3PTKA 1Y7VA 2EO7A 2WVTA 1HJSA 1UZ4A 3BMVA 4AD2A 4M81A 1CGTA 4PUDA 1TMQA 4J7RA 5C8BB 1GORA 4D6JA 2VZUA 5ABHA 4XB3A 3AHTA 2A3AA 3PZOA 2WWCA 1PX3A 3CBWA 4B3LA 3CLWA 1BYBA 2XVPA 2ZXQA 4OUEA 2WMFA 3VDHA 3MMWA 1H5VA 4CD6A 5E6ZA 2XGIA 4OKDA 3W29A 2O9OA 3L4VA 2D0HA 2WB5A 4D71A 4ATWA 5HBFA 1EO7A 1SFSA 1WZAA 4Q22A 1J9YA 2VZOA 1W91A 2W92A 3MU7A 2E9BA 3SURA 3KL3A 1B90A 1HNYA 3TTOA 2DDXA 3MSGA 1HKIA 4NSBA 1JYWA 1H11A 5DT5A 3OLGA 3ARRA 3RM4A 3AQUA 2PBGA 3N13A 4UQAA 3MANA 2QPUA 2FGLA 5D9PA 3SCPA 3I3EA 4QLJA 1F4AA 1ODZA 3ALGA 3ZJ7A 4UFKA 4ML4A 2PF0A 1V3HA 1GVIA 2J62A 1NOWA 2Y8VA 4W8BA 4D6EA 4MNKA 3GNOA 5E70A 1FH7A 1V0KA 3B9EA 1DWHM 4UOQA 4CCCA 1V3IA 1NH6A 1G0CA 1WDPA 4W8LA 1EHNA 4PTMA 2B31A 5A8QA 3PZIA 1C3FA 4IPNB 1EA9C 4UR9A 4JHZA 4CD7A 2JIWA 1CGWA 1HKJA 2VZSA 3NSNA 4DWSD 3VIHA 1UR4A 3UR8A 4LYPA 2AAAA 3NDYA 5CLWA 2DSVA 3WDIA 3SCTA 1V02A 3LPOA 4NRRA 5JUVA 5CLTA 3WN6A 1HXJA 3DYOA 3AOFA 4AD0A 4WF7A 1ISVA 4PMUA 4UFMA 1RPKA 4PMYA 3WUBA 1OT1A 2WVVB 1TE1A 3NSMA 4RE2A 3MMDA 1C8XA 4XV0A 5EMYA 5AY7A 4BF7A 4MDPA 4TVDA 4W7VA 1NWTA 5FOOA 1GPFA 3QHNA 2YBTA 5I6SA 3AMCA 4CN4A 2WKGA 2C0HA 3AHXA 2VI0A 2JEQA 1LG1A 1R85A 3WKZA 1GCYA 1KGWA 3VM7A 4M56A 2VUYA 2NW0A 3BH4A 4CU7A 1R7OA 1KGXA 2J25A 3W0KA 1UWTA 1HF6A 3ZMRA 2XYLA 4KGLA 1RP8A 3BLKA 3N1AA 1S46A 3WY1A 1D3CA 1W1VA 2E8YA 2JE8A 4ACZA 4P8VA 1TA3A 3CMGA 4NI3A 4NZCA 1CLVA 2CPUA 1XCWA 2X09A 1EO5A 4URIA 3BAWA 2OWWA 4F79A 4UQBA 1XD0A 4B9ZA 3JUGA 4GI8A 3MV01 4JKLA 3UETA 3B9AA 2X0HA 5A2BA 2VL4A 3W6MA 3GXIA 3A6OA 4JFWA 1NP2A 1PPIA 2JF6A 4GZJA 3WNMA 3OLEA 4DUXA 2X05A 3VILA 1ISZA 3NCOA 1PJ9A 1NOUA 2BNJA 1K9TA 3MO4A 4JFTA 1DWAM 2YL6A 2OWXA 3WH7A 2ESCA 1CWYA 4W88A 2PWGA 3GYCA 2W66A 5CPTA 1JZ4A 4YPJA 3ARTA 4X0NA 4AC1X 1VAHA 3U5YA 1W9XA 1BYDA 2EPNA 1W2PA 1VENA 3AXIA 1UR2A 4U3AA 3BAYA 3T09A 1KQYA 1MFVA 3OBAA 4JHOA 3CZKA 3NIYA 1KBKA 1E6ZA 3AMGA 3NDZA 3SUTA 4KMQA 4J3VA 2WMKA 4X0VA 3SIMA 3F5JA 1W1TA 1HJUA 5AYIA 4AD5A 4QAWA 3RPMA 5A6AA 2QLYA 1HKKA 2BY1A 3SCRA 3AHZA 1SR0A 4W7UA 1UUQA 4GKLA 5ABFA 5HNNA 2XVLA 1W3LA 3CHFA 4U5IA 2GJPA 2WPGA 1XRVA 4WJXA 1J0KA 1C7SA 3KE0A 3U7BA 1QI5A 2BS9A 4AEEA 4GI9A 1IZJA 3ARWA 1US3A 2J79A 2YL9A 4DUWA 1R8LA 1CGUA 4Z2KA 3ZJ6A 4KH2A 5CQ1A 4CKQA 4S3KA 5BXTA 4W7WA 1JZ7A 3AFBA 3WQWA 3D3AA 1OINA 2Y4SA 1EIBA 3ARUA 5A8PA 1CXHA 1GVYA 4BCEA 3UR7A 2VR4A 1U33A 3W53A 1WP6A 1Q6CA 4J28A 4W5ZA 5C71A 4MAVA 1IV8A 4D1IA 1G94A 4MTVA 1CLXA 2ZWYA 3WSUA 4Z2LA 1KBBA 2WHLA 4AD1A 4LPCA 4AISA 3WD3A 4JZ5A 4CVWA 2WCAA 1Q6DA 1E40A 1KQZA 3VNZA 3VX1A 5JIPA 5A69A 4LQ1A 2WK2A 2EBNA 1C8YA 4PUEA 3K8LA 3SCQA 3FXYA 1G01A 4AZGA 3AYRA 4DUVA 3D5HA 2D0GA 4ACZB 1TA3B 3OG2A 3ZO9A 6A3HA 2DGAA 5BWFA 2WLZA 1KXVA 4P7OA 3ZR6A 2V3EA 1JAEA 2J7HA 4M24A 1W9VA 3IJ8A 1KXTA 2XPKA 4KRTA 4HMEA 5IHRA 4DWSC 2Z1KA 3BLPX 1L0PA 1I75A 3OLIA 3PBGA 2BXYA 2PC8A 1UKOA 2WNWA 3GZAA 4PSRA 4X9YA 2EJ1A 3AZRA 1QHPA 1J0YA 1VEMA 3F5LA 1GONA 4AIOA 1E1FA 4W89A 3CMJA 1JI2A 4GO8A 1FHLA 2CBIA 2YOCA 2XWEA 3WDPP 3OZOA 1QBBA 4AZIA 4UOJA 2UY2A 2J7CA 2UY4A 3VGHA 4AW7A 4MAZA 1CIUA 4QLKA 1GQIA 1M04A 1E0VA 3MUAA 4JL2A 4H7VA 3VD9A 1DWFM 2CETA 5A2CA 4CD8A 1N82A 3MMUA 2WC3A 4JL1A 1HL9A 1QNSA 3L4UA 5I3DA 2CESA 1UH4A 1BVZA 2VZTA 1CDGA 2AOSA 3AMKA 1V3JA 1QI4A 4B15A 1DWIM 4U2ZA 1DTUA 2YKKA 2VMFA 3IAPA 4QCFA 2QMJA 3CZ8A 5IHSA 5ABFB 1M7XA 1NQ6A 1XC6A 5GNZA 2GK1A 5A6SA 2VX7A 1MVYA 2BHUA 1O7AA 2DT2A 3WBAA 2PB1A 3IANA 3I3BA 5ABGA 1BSIA 4MNMA 2FH8A 1UHVA 2YA1A 1NM9A 1JAKA 1VF8A 3F4VA 1XHGA 1WKYA 3KWXA 3AS0A 3VINA 4DM2A 3WQ4A 1TUXA 3VPLA 2DT3A 1WZLA 3M7SA 2CBVA 1V6UA 2OWCA 1LQ0A 2VC9A 1RD6A 2VZVA 1MXDA 2CBUA 4HOXA 1JDAA 3VOCA 2J7GA 3RM8A 1CGVA 2XVKA 2EXOA 1IT0A 3AI0A 1E6NA 3GTNA 1OGSA 5ABEA 4YHEA 2F8QA 3L2LA 1EDGA 8A3HA 2WW5A 2O9RA 5A6LA 1GZJA 1JL8A 2GVYA 2QPSA 4LYQA 1YQ2A 4P8XA 2BVYA 1O6IA 1JDCA 5GPRA 1HP5A 1V3LA 4E4PA 1B0IA 1IZKA 1GHRA 3IJ9A 4HMCA 2J74A 2V3DA 2VRQA 1E3XA 1C91A 1QNRA 4ZXLA 2WHKA 1V0MA 2EPKX 1FP9A 3AROA 4H8VA 1H2JA 4WLCA 4P7LA 4CCEA 3AZSA 4PMNA 3GH4A 3VD4A 3M07A 1GUVA 5D4YA 1F4HA 1DP0A 1BPLB 2ZX8A 1E9LA 2IXVA 2XM2A 3PZVA 1ZBCA 3VGBA 3ZT6A 4WKHA 3MKKA 4CD5A 2EPLX 1JZ5A 1JYVA 2VNCA 2XFRA 3CUFA 2WBGA 3A4AA 3AIVA 1C92A 1XGZA 4HMDA 4TTGA 2WYSA 4BQ4A 1WDRA 1DWGM 5M5DA 2J77A 5EB8A 5D8ZA 4QP0A 4CGTA 1UKPA 1JZ2A 4WK9A 1JIBA 2J4GA 3GXFA 4WSJA 3WDRA 4AD3A 1JNDA 1E4LA 3LPGA 4WKAA 1GQKA 1UR8A 1QW8A 4H2CA 1E55A 1JDDA 2WMGA 3CIVA 5CPQA 4B16A 3PZQA 9CGTA 3I3DA 4PEEA 1ZBVA 3VGEA 1V3MA 2IUZA 4CVUA 4ATDA 2JEPA 1EOMA 2WMJA 1FFQA 3VMNA 3VNYA 3OZPA 4MJ4A 1C7TA 2FHFA 4PCTA 4UCFA 1OM0A 2GK1B 3WEOA 2G4FA 3VMOA 5JIWA 1B1YA 2WMIA 1KR1A 3OB8A 4V28A 4FLSA 3G6MA 2VQTA 2HVMA 1SYTA 2PWDA 3L4TA 4PSPA 1XSJA 2D0FA 4AZ5A 2J75A 3RM9A 1KXHA 4HA1A 1JXJA 5BYWA 3IAQA 3UERA 1NWSA 4Z2GA 3ZR5A 4PBGA 3A47A 3W25A 2BHZA 1X1NA 4QFUA 4PTWA 1CXLA 3AIEA 1GOQA 4PTVA 1QNPA 3WNOA 4D72A 2VURA 1UR9A 3PZ9A 1W3HA 3BCDA 3PZMA 3DC0A 2GJRA 4F66A 3SCUA 4HZ7A 3WD4A 4GINA 3UEQA 4M29A 1VIWA 1V6WA 2YLLA 5ECUA 4RE3A 2O9PA 2WZHA 2YDQA 3AIBA 3VU2A 3AYSA 1ITCA 3AIQA 1JGIA 4UFJA 4B9YA 3PZNA 4FMVA 3PN8A 3WF3A 3BSHA 1JG9A 3WDQA 4F9JA 4UTFA 2BY3A 4PTXA 3ZSTA 1XH0A 4W86A 3O9NA 3IJ7A 4OOZA 1B3WA 2CIPA 1AMYA 5FL0A 1E6PA 1JF6A 7TAAA 2J78A 2DSKA 1WO2A 5E6YA 3SCWA 1GQJA 1UG6A 3WQ6A 1C90A 2FH6A 2V3GA 1UD5A 2YA2A 2CYGA 1UD6A 2OYLA 2GSJA 3AIRA 3LPFA 3ARSA 1G9HA 1H09A 1H1NA 1HP4A 1KR0A 3M6DA 5DT7A 3FY1A 1JZ3A 1FA2A 3WD0A 5BROA 2WVUA 2WXDM 5BXPA 3L4XA 2CEQA 5KEZA 4TVCA 5FD0A 1KWGA 3ZM8A 1JNEA 4PYSA 3AXXA 4PRWA 4WIWA 2OSWA 4R5EA 4A4AA 2VX5A 3ZJ8A 2CCRA 3K8MA 2DPEA 3AS1A 2J7FA 1PIGA 5I2UA 4TUFA 3N18A 1RP9A 1H3GA 2YBUA 1FFRA 2D2OA 4V2XA 3WDHA 2RGLA 5EBAA 4BQ3A 3RDKA 2DQXA 1GW1A 5AYBA 2VJXA 4C7DA 1FH9A 3J7HA 3AICA 3BAJA 3UG3A 1E70M 1HVQA 1UKQA 1Z32X 1HJXA 2NT1A 3RMEA 4JFSA 2WVSA 2IXUA 1AQ0A 1UZ1A 2F2HA 2WMIB 1JF5A 1EDQA 3PZGA 7A3HA 1FP8A 2ZX7A 4NRSA 4Z2IA 2ZUSA 4M82A 4MB1A 5I5RA 2V5CA 4WKFA 3EMQA 3BCFA 1I1XA 1US2A 3MSDA 3WL1A 5M03A 1WB0A 1V0NA 1NARA 2WSKA 1BVNP 1E72M 1D7FA 3AIWA 5IDIA 1AQMA 5I23A 4MJ2A 2A3BA 3S2CA 1DEDA 4AXNA 1W32A 4H04A 1TFVA 1E0WA 1M53A 3HMCA 1MW3A 2E3ZA 3SUUA 3TTSA 2FHCA 4LXFA 1ZL1A 2PWEA 5E09A 1J11A 2ZIDA 4LX4A 5D8WA 2RGMA 4KGJA 4AZHA 4J3WA 3UG4A 5FCZA 4XZWA 1MW2A 3W26A 4PMOA 1E3ZA 1CXEA 2VX4A 4QCEA 4P7NA 3FN9A 1GQLA 2BHYA 2DH2A 3VD5A 4MPKA 3BAKA 5D9NA 3ZJKA 4KWUA 1B3ZA 2EQDA 2CBJA 1V6YA 3IK2A 2ZXDA 2JALA 1H49A 3VD3A 5I79A 4J3UA 3O2LA 4FLRA 1H41A 5KZ6A 1OD8A 2W5FA 4D6IA 3UCQA 3SCOA 2WCSA 2OYKA 5TD4A 4HZ8A 2WSPA 2YJQA 2GUYA 2A3EA 1UQZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1MW0 A;  4BS0 A;  3VUP A;  1HJQ A;  4A3H A;  4GIA A;  4J27 A;  1EXP A;  5CGM A;  3SUW A;  3K1D A;  1V6X A;  4HP5 A;  1K6A A;  2WC7 A;  2WMH A;  1H0I A;  1HX0 A;  3CZE A;  3T2Q A;  2WHM A;  7CGT A;  4U5K A;  3CHD A;  1YHT A;  5CGT A;  4CD4 A;  1SMA A;  2GJX B;  3DYM A;  1BFN A;  5GNY A;  1ISY A;  4M80 A;  3W28 A;  3QOK A;  1V08 A;  2XG9 A;  1HKM A;  1MW1 A;  1ZB5 A;  3SUV A;  1OWQ A;  5A6B A;  1B31 A;  5DEZ A;  1TR1 A;  1JXK A;  3FHQ A;  4AY1 A;  1WCG A;  5HXM A;  2G41 A;  2YL5 A;  2YL8 A;  1CGY A;  4RL3 A;  1LWJ A;  1R87 A;  1UA3 A;  4C7G A;  1E6Q M;  1WPC A;  3SCS A;  1BG9 A;  3W24 A;  1ESW A;  2D3L A;  5HDR A;  1FH8 A;  2XII A;  1VFO A;  2DSU A;  4CN1 A;  3ZOA A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1BL4 A;  3LGE A;  5TIM A;  6CGT A;  2GYI A;  3G1A A;  2RFG A;  3RGC A;  2WPB A;  2H90 A;  3CIX A;  4UNK A;  4JKK A;  4MHB A;  1UR0 A;  3QR1 A;  2P10 A;  7PTD A;  2VTF A;  3ID7 A;  5K2Z A;  1CGX A;  4ZQP A;  1KT1 A;  7REQ A;  3PTK A;  3W7K A;  4BY3 A;  4E4F A;  4KPL A;  1F76 A;  1UZ4 A;  3ZXW A;  1JPD X;  3PZO A;  2WWC A;  2EKC A;  1J5T A;  3CBW A;  2KR7 A;  3WBY A;  1M7P A;  3CLW A;  4B3L A;  3O5E A;  3VDH A;  2PTD A;  1H5V A;  4CD6 A;  3EX2 A;  4D71 A;  4Q22 A;  2PV2 A;  3GE7 A;  4L9X A;  2W92 A;  1ADS A;  3MKV A;  3SUR A;  3N73 A;  1HNY A;  2VEL A;  4EP8 C;  1H11 A;  1YE6 A;  4DBW A;  3PP7 A;  1QOQ A;  3W7E A;  3RM4 A;  4MM1 A;  3AQU A;  1UPM B;  3SSZ A;  5IBX C;  2AWG A;  1JJK A;  5D9P A;  3PUD A;  3P8J A;  1AJ0 A;  1O94 A;  1X8F A;  5FF0 A;  3CL6 A;  1HO1 A;  3ABQ A;  1SO4 A;  3ZJ7 A;  1BKH A;  3C3N A;  4LSB A;  1R9H A;  4OU1 A;  2QS8 A;  3BO9 A;  1VFT A;  1NSJ A;  1Q3N A;  2J62 A;  3N4A A;  3GIY A;  2YXX A;  3GNO A;  5E70 A;  1FH7 A;  3B9E A;  3V35 A;  3W6Y A;  2DQW A;  1V3I A;  1M7J A; 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 4U5K A;  4CD4 A;  1SMA A;  4C6D A;  5T9C E;  1BFN A;  3KOW A;  4M80 A;  2QUN A;  3T44 A;  4IFR A;  3GS6 A;  3SUV A;  4DJD C;  3LN3 A;  2NQ5 A;  4UMC A;  4XWU A;  1GWJ A;  2G41 A;  1ALD A;  1CGY A;  4RL3 A;  2CLO A;  4GYP C;  2ISW A;  3EKL A;  3AO0 A;  1THF D;  3R1Z A;  1WPC A;  3O8A A;  1BG9 A;  5C2G A;  3WLI A;  1FWW A;  2QVH A;  4JFI A;  1VFO A;  4ODQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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