4NZCA

Crystal structure of chitinase d from serratia proteamaculans at 1.45 angstrom resolution
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
398
structure length
397
Chain Sequence
AHAASYLSVGYFNGGGDVTAGPGGDINKLDVTQITHLNYSFGLIYNDEKQETNPALKDPSRLHQIYLSPKVADLQLLPVLRKQNPELKVLLSVGGWGARGFSGAAATAESRAVFIRSVQQVIKQYHLDGIDLDWEYPVNGAWGLVESQPADRANFTLLLAELHKALDKGKLLTIAVGANVKSPQEWVDVKGIAPYLDYINLMTYDMAYGTQYFNSNLYDSKQWPTVAAADRYSANFVVDNYLAAGLKPAQLNLGIGFYGRVPKRATEPGIDWDKADAAKNPVTQPYFTARETAVFKAMGLDLTKDSYFKYNDIVSKLLNDPQRRFTAHWDSDAQVPYLTMKSAEGKPLFAISYENPRSVALKADYIKSKGLGGAMFWEYGADDNNRLAHQLAESLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Serratia proteamaculans
publication title Structure of chitinase D from Serratia proteamaculans reveals the structural basis of its dual action of hydrolysis and transglycosylation
pubmed rcsb
molecule keywords Glycoside hydrolase family 18
total genus 128
structure length 397
sequence length 398
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4nzcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4nzcA01
2Y4SA 3L4WA 4GQRA 1DWJM 1HN1A 5IFTA 2YBUA 1E70M 1XH0A 3FW6A 2GK1A 2ZXQA 3FY1A 2ZUVA 3WIJA 5BRQA 5JBEA 3ARRA 2ZUUA 2J47A 2XPKA 3TTSA 2O9PA 3AYRA 2OWCA 4X0NA 2J8GA 3A47A 1ODUA 5DEZA 4YHGA 5CJ5A 2XFYA 3SCUA 1V3MA 1GVIA 4DM2A 1TFVA 5JIWA 4ZENA 4W86A 3AICA 3N13A 1BLIA 5A94A 3AS3A 3N17A 5D9PA 2UY3A 4MDOA 1EHAA 3TONA 5FKYA 3FHQA 2W4XA 2JIEA 2YBTA 5LA1A 1MQQA 4CKQA 2YOCA 4BS0A 3CHCA 2PWDA 5I0DA 2XVLA 3OA5A 1E4NA 1E5JA 2F8QA 2FHCA 2J7FA 4HU8A 1V3JA 3AZTA 4MB3A 4ATWA 1LL6A 1V0MA 1W1TA 3OGVA 4ZFMA 4AIEA 4AD1A 1Q4NX 2JE8A 4JKMA 1R7OA 2A3BA 2WXDM 2ZWYA 2JEPA 3LPPA 3O9NA 1E15A 1OCQA 2RGLA 4HMDA 4B3LA 3MSGA 3ZO9A 4W93A 1PJ9A 1ECEA 1UZ4A 4MAVA 3AIWA 3K8LA 5CSYA 2XGIA 3RM4A 3SCPA 4EAMA 2GUYA 5A6LA 1EQCA 2W61A 3ZJ7A 3U5UA 3O6AA 1V03A 4EE9A 3L4TA 1EGZA 3WL1A 3WUBA 2WWDA 1GOKA 1ISXA 4UOZA 1GQKA 1XH2A 2Y24A 3T2OA 3WUGA 1W3LA 8CGTA 4KRUA 1J11A 1FP9A 3VPLA 1XHGA 1VFMA 2DSWA 1CXFA 1ISZA 3CUJA 2BY2A 4PMNA 5BROA 4CD4A 1M01A 1JDAA 1PEZA 2XWDA 3ECQA 1R87A 1HJQA 1EOMA 2BXZA 3T2QA 1R86A 4JHOA 5A8OA 4OKDA 3PZTA 2OYKA 3W25A 2O9TA 4AYSA 1C8YA 3W37A 2YL8A 5ABFB 2BY3A 3GNPA 4PTWA 1J12A 1E6NA 4M82A 3ZJ6A 1V3KA 4PN2A 5GQBA 2VO5A 2VCBA 1CEOA 4JKKA 3GH7A 3PTKA 2EQDA 5GNYA 2PBOA 2BXYA 3ZOAA 3VDBA 3UG4A 5A6MA 4J3VA 3SUSA 1OT1A 3I3BA 2E4TA 1F4AA 4B3KA 1OT2A 3EMCA 4FLQA 4CN1A 4UTFA 3GH4A 2VR4A 4FLOA 3CTTA 1CXEA 1JAKA 4D6IA 2G4FA 3PZ9A 4RE2A 4CGTA 5D8WA 1E4MM 3W0KA 2VRQA 1VEPA 2PBGA 5CPTA 1QI3A 4AD2A 5A8QA 4U3CA 2CCRA 2GJXB 2VZOA 1AVAA 3WD3A 1OGGA 1WKYA 8A3HA 4OBRA 2J8FA 2PWHA 2XUCA 1WDRA 3G6MA 1MQPA 2QHAA 5C70A 2WVSA 1G0CA 3B9DA 3WSUA 3WD0A 3ARYA 5CSUA 3UESA 2WLYA 1TG7A 1NQ6A 7CGTA 4GZJA 4CN4A 1UWRA 4D6CA 1KR0A 5FIPA 3UG3A 2G3IA 1XGZA 3OLEA 3CZGA 2PWGA 2HVMA 2VQUA 3TOPA 4W84A 1W9DM 3EMZA 2DGAA 1PX3A 3AHVA 3WNNA 4YN5A 2WC7A 4GO9A 1OIFA 1WZKA 3CPUA 1M03A 1ZBCA 1V0KA 4JAWA 2AAAA 3WD2A 2C7FA 3MU7A 2ZXDA 4UNIA 4WIWA 1VFOA 1KXVA 1A47A 3CUHA 4QFUA 1KQYA 2FGLA 2WVVB 3BLKA 2VX4A 3U5YA 2CKRA 4AD3A 3WUEA 2NSXA 1VAHA 1H2JA 2GDUA 3WQ8A 1ZS2A 2J74A 3GXFA 4W85A 2CYGA 1PBGA 1E9LA 3SCTA 5IFPA 2EPLX 2EXOA 1JAEA 4BQ5A 1BYCA 5EBAA 1G94A 2G8ZA 3WH7A 2WMFA 2WMIB 4W7WA 3OZPA 3THCA 1V6VA 5GPRA 3GXDA 1UR4A 1HXJA 3VX1A 1SYTA 5AYBA 3W6LA 2FHFA 1CTNA 3WH8A 3RDKA 1ZBVA 5BXTA 2BVDA 2Y8KA 5LA0A 4DWSD 4W89A 5EFDA 3RM9A 2CBVA 3OZOA 4P7OA 1ZJBA 1HJWA 5ABFA 4ML4A 1XD1A 1ZL1A 4UOJA 1CENA 3GNRA 2VQTA 1E56A 5M3WA 1N82A 2X1IA 1J01A 4V28A 2WHMA 4D1IA 4GQQA 1UD4A 3WNKA 3BLPX 3CHDA 1XSJA 1GOQA 3ALFA 1HP5A 1Q6FA 2CBJA 1GW1A 4TTGA 2ZE0A 1BVZA 3WMCA 5BXPA 4HOXA 4NI3A 1BG9A 4UFMA 1UHVA 4AZBA 4PYSA 3HMCA 1UD6A 3HU7A 3IAQA 1JDDA 2J62A 4BCEA 2XVNA 2VR5A 2FH6A 3GH5A 1PPIA 1B3VA 2WAGA 3BGAA 4Z2JA 4L4OA 2XVGA 1NWTA 4RL3A 2QPSA 1JFXA 1JDCA 2GJXA 2VZTA 2TAAA 1SR0A 4OOZA 2CNCA 5IHSA 2YDQA 4NRRA 1UG6A 2CBUA 1EH9A 2WMKA 4GINA 1JYVA 4ATLA 3VOCA 5I3DA 1BTCA 2WZEA 2A3HA 2QLYA 2DDXA 5C71A 2DSUA 1XH1A 4H8UA 1DWFM 4AEFA 1QI0A 4J3XA 3JUGA 5I2UA 3CH9A 3EDJA 1XSKA 1J0YA 5ECUA 3CZEA 1UD2A 3L2MA 1GUVA 2E9BA 1LJYA 4HA3A 2W92A 3RILA 3MUZ1 2Z1SA 1CGXA 1BGAA 1GQLA 3PN8A 1JI1A 3BAXA 3AXIA 2FGZA 3I3DA 2BHZA 4P8UA 2UWFA 4UFKA 3SIMA 4UQDA 5D4YA 1B3XA 2D2OA 4IISA 1HX0A 4P8XA 1W9BM 3PTQA 1BFNA 5I24A 2W67A 1XYZA 1UWSA 1JI2A 4PTVA 2WVVA 3MV11 2VRKA 5EMYA 4D6JA 4CU8A 2JIWA 4PTMA 3VD4A 4PTXA 3ZR6A 4R5EA 4TUFA 4HP5A 2BVTA 2VX5A 1LWHA 3VDAA 4MJ4A 3OLDA 1KB3A 4FK9A 1U2YA 5E6YA 2DEPA 3J7HA 3K8MA 2GSJA 5HOSA 1UR2A 2YDRA 1EOKA 2J25A 4E8CA 4LQ1A 4AEEA 2WMIA 1B9ZA 4Z2KA 1IZJA 1DEDA 3BC9A 3FXYA 3KEHA 1C93A 1Q6CA 3A6OA 1E55A 5CPQA 5M5DA 2MANA 3EMQA 2XVKA 2CIPA 4D6EA 1PIGA 4KRTA 1XCXA 4R27A 4U3AA 1NM9A 3VX0A 3SUUA 1QHPA 1DTUA 3LPFA 1GONA 1OD0A 1LG1A 2BS9A 2XJ7A 1RH9A 3L4UA 3FNDA 1U30A 1ISYA 1WZMA 5LA2A 3VKKA 1JXKA 3M7SA 1ISWA 1J0IA 2PWEA 1EO7A 1B2YA 2WBGA 1QOXA 3PZMA 3GXMA 4CD8A 3W24A 1YHTA 4DM1A 5A3HA 3MMWA 1R85A 4AZ5A 3I3EA 4MADA 1FOBA 3CMJA 2WWCA 1UQYA 1GZJA 4GXPA 3CZLA 3EDDA 4DWSC 1SMDA 3CHEA 4OJYA 1EDGA 2VZVA 3QHMA 2Y5EA 3G6LA 3EBVA 4FLRA 1OGBA 1HIZA 3NJ3A 4XB3A 1LLOA 3AXHA 3MV01 1Z32X 4TVUA 5I6SA 2OSYA 4NSBA 3AHYA 4CCEA 4AZ7A 1QI4A 4IPLA 1PAMA 4MNJA 5HDRA 1HJXA 1W2PA 1DWGM 1E6XM 7TAAA 2V5DA 2A3EA 3MSDA 1QNRA 3BAIA 3WEOA 3ZT7A 2WC4A 1E71M 2NT0A 2ZXBA 3AROA 1WE5A 3WDRA 2EEXA 1P6WA 1E40A 3KL5A 4JHZA 1UKPA 2VTFA 4RE3A 1HKKA 1E6PA 4TOQA 3BCDA 1W3KA 4PSPA 5CZKA 1UWIA 1S46A 1C90A 5KEZA 1KBKA 2CXGA 4X9YA 5D9NA 3VIIA 5A2CA 4PMXA 2PB1A 1HKJA 2XGBA 1H0GA 1V6XA 4AMCA 4J3WA 2AMGA 2CEQA 2BHYA 2D0FA 2WHKA 3ALGA 4LYQA 2YA1A 4HTYA 4AZHA 1TR1A 1JF5A 1JNEA 1UR1A 3RIKA 4GI6A 1TVNA 2DT1A 1O7AA 1W32A 2VRJA 1OIMA 4S3KA 3GDBA 1QBAA 5CPSA 3W6MA 3VILA 3POCA 5A8MA 1JZ3A 3K1DA 1DWIM 1LL4A 4CN6A 4CCCA 4H8VA 1UD5A 1UH2A 1XYFA 1WB0A 2VVNA 5E70A 3N12A 1C7TA 4CVUA 6CGTA 1UD3A 2WKGA 3FHAA 1GCYA 1V0NA 3CZJA 4U2ZA 4P7RA 4Z2GA 3ZJKA 1LL7A 3HN3A 1JYNA 2Y2WA 1E4LA 3WY1A 4FLSA 3WH9A 4PMZA 3DHUA 2ZX9A 3AYSA 4P7QA 5ABGA 3VGDA 1RP9A 4JL1A 1SFSA 5DT5A 2B31A 3B8SA 4W7VA 1PIFA 5I5RA 2QMJA 4W87A 3AI0A 4AISA 4XV0A 3WBAA 4ACZB 5ABEA 4FF5A 3CZKA 3FAWA 5M03A 5DO8A 1QNQA 4W8BA 1MFVA 1GOWA 1CWYA 2QMKA 2XM2A 2WNWA 3UCQA 1PX8A 3WQ4A 3N9KA 4TX6A 1MWOA 3AIRA 3WEMA 1IV8A 2VUYA 1W1VA 4C7GA 4E8DA 2Q8XA 3AOFA 1KGXA 2CETA 1BSIA 1U33A 4HPGA 4ZE4A 3GYCA 3LPOA 3L4ZA 3WH6A 2VT0A 1I75A 3WKZA 1B3ZA 1UA3A 2JF7A 3AHZA 1W9UA 1WPCA 1J10A 2WBKA 3SEPA 1HVQA 2DQXA 5A6BA 5AY7A 2J75A 5JBFA 3CZ8A 4PUDA 5BWFA 4UZSA 4ZXLA 3PHAA 1KBBA 2YLAA 1HF6A 4AIOA 1E72M 3UEQA 2VCAA 4H7VA 3WQWA 1MXDA 4GO8A 2DH2A 3ARXA 1XD0A 1NOUA 5CGTA 2VZSA 1K9EA 4PUEA 2J79A 5JIPA 2J77A 2ZOXA 3N11A 2D0HA 1HNYA 1XSIA 1V3LA 4AZCB 1H41A 2O9RA 1UOKA 1V6YA 4P7NA 3U7VA 5A69A 4B9ZA 2BY0A 1I1XA 1XC6A 1VEMA 2WSKA 3W81A 4H2CA 2XIIA 3GBDA 4N42A 5M17A 4JZ5A 3WNPA 3K4DA 2QV4A 2FDMA 3S2CA 4D6FA 1JYXA 1NH6A 2O9OA 2QF8A 3ARTA 3GNOA 3AZSA 2XIBA 4BQ3A 2ZWZA 4B9YA 2D3NA 4M56A 3CHFA 1CGUA 5BCAA 5A6KA 1JZ2A 1JZ5A 1LWJA 1B1YA 3RCNA 4DUVA 4B16A 3WD4A 2C8NA 1W9XA 1W1YA 3AMKA 2ZICA 5A2BA 2YA2A 1ZBKA 4P8VA 3DYMA 3WFZA 4JFUA 3A4AA 3PZUA 3SUTA 3ZIZA 5BYWA 3VIKA 4A4AA 3VIMA 4PMRA 3ZQ9A 3MUIA 4D6GA 3RO8A 4UQEA 1QI2A 2CESA 2OLHA 1JIBA 2PWFA 3ZM8A 3AFBA 4MTVA 2Y8VA 2J78A 1E73M 1QHOA 3UR8A 3D5HA 3F5KA 1GQJA 1VBRA 3ZJ8A 2E9MA 1UWQA 1OWQA 4LPCA 4WKFA 1NP0A 1G9HA 4J3SA 2D24A 2UY5A 4AD5A 4HPHA 3T0AA 1EXPA 4MNLA 3EDKA 1HJSA 4JFVA 2XHYA 3A4WA 2V3DA 1UQZA 2BHUA 2CBIA 4KGLA 1RPKA 4F66A 4WSKA 2V38A 3VMOA 4CU7A 1LF1A 3LMYA 4BF7A 1XV8A 3WMBA 4ACZA 1FH8A 4W8AA 3N18A 4F79A 1GVYA 4P7LA 1VENA 4JL2A 2PI6A 4XZBA 4JFTA 3PZQA 2VCCA 1E0XA 1ODZA 2GDVA 1KXTA 4DWSB 3W27A 1TUXA 4V2XA 5HBFA 1H49A 3WN6A 4QLKA 2V3EA 3VGFA 3WBEA 1DWHM 1VBUA 4GIAA 1C3FA 2DPEA 4W7UA 3WUFA 1VJSA 3MANA 5IXEA 3L2LA 1V02E 3GXIA 2BV9A 3VNYA 1E1EA 1M53A 4MB4A 2DT0A 2W63A 3WDQA 2E40A 1E6RA 4F9JA 2OYLA 3ZT6A 2J7GA 4QCFA 5A8PA 5AC4A 1AMYA 1L8NA 2G3MA 2YL9A 2JALA 5D9MA 1GOOA 1B30A 1HKIA 3DC0A 2FH8A 1MYRA 3VDHA 3VIFA 1G01A 4XZWA 1TCMA 2GFTA 1ITXA 4W88A 3VIGA 5E09A 4U5KA 3ARQA 3SCNA 2DSZA 2X8RA 4MB1A 3BSHA 4AZCA 4LGXA 2V3GA 5HPCA 4GPNA 1JD7A 4N0RA 3CBWA 4M29A 1E4IA 4UZUA 4IM4A 2WYSA 1J0ZA 2G41A 4ZXOA 1X6LA 2XG9A 2OSXA 4M81A 5FL1A 4UCFA 1TMQA 3TP4A 1W1PA 4JCMA 4RE4A 1J0HA 3DECA 5A6AA 5CLWA 5D9OA 4U31A 1H5VA 3VU2A 4HZ6A 3VM7A 2WKLA 1KQZA 4BQ2A 4MAZA 2W66A 3NCOA 4OIFA 1E1FA 2BNJA 3FAXA 3DYOA 4PMDA 4KH2A 3NYDA 3A3HA 1MW2A 3SURA 1V08A 4DUWA 4JKLA 2VZUA 1NWSA 1L0PA 1FA2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1XUU A;  2QJJ A;  4C7D A;  3OZM A;  4WEV X;  4Q7I A;  5FJO A;  1CXL A;  3SCO A;  4I6K A;  2PTW A;  3T4C A;  1XRV A;  2Q6Z A;  1BG4 A;  1QPF A;  4AWS A;  3FKK A;  3F5J A;  4MPK A;  3MZ2 A;  2E9L A;  2YB1 A;  2ZID A;  5F2I A;  2ISD A;  2YKK A;  3FVM A;  4MKN A;  4OOU A;  3WEN A;  3EYP A;  2KI3 A;  1OAD A;  4OGZ A;  4UWM A;  3BLD A;  1ZZM A;  6ALD A;  1SW7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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