4R5EA

Crystal structure of family gh18 chitinase from cycas revoluta a complex with allosamidin
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
344
structure length
343
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGGGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYEYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDPSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and inhibitor binding properties of plant class V chitinases: the cycad enzyme exhibits unique structural and functional features.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase A
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Cycas revoluta
total genus 120
structure length 343
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4r5eA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4r5eA01
4E8DA 1M03A 3FAWA 4RE2A 4TUFA 2C8NA 4FK9A 4AY1A 3K4AA 4AC1X 5BRPA 4A3HA 4D1IA 5C8BB 4HP5A 3NIYA 2DT1A 3PZTA 4W7WA 4UNIA 1ZL1A 3ECQA 1NP0A 4X9YA 3N15A 3U57A 5A95A 4ACYA 3MS8A 1UYQA 1NP2A 4GI9A 1H0GA 4JKLA 1H5VA 1R85A 3GXIA 5HDRA 3CTTA 4CD6A 3AHVA 3F5KA 4B3KA 5CLWA 4P8XA 4FMVA 1SFSA 2YBTA 4KRTA 1OGGA 1CGVA 1BAGA 1UR4A 5JBDA 2PWEA 3CUGA 2J4GA 3W82A 3I3DA 1NOWA 3I3BA 5HPOA 1JIBA 2VT0A 3AHYA 2V5DA 1E3XA 4AD4A 2VMFA 1XC6A 3SUSA 3VM7A 1F4HA 1NWTA 1GCYA 5HPCA 3CIVA 3UERA 3VM5A 3II1A 4Z2LA 3CZGA 3MUAA 3RDKA 1MWOA 1E5NA 1EA9C 1UHVA 4MDOA 2XFRA 2PWGA 2DSWA 4WSKA 3WUGA 2BS9A 5IDIA 4WKFA 1V02E 2BHUA 2GK1A 1W3KA 1SMAA 1GONA 1L0PA 1JDDA 2W62A 4J28A 4J3UA 4UQAA 2O9PA 5A8MA 1ESWA 1H11A 5EFDA 1E56A 3CUHA 4CGTA 4XZBA 5A3HA 3J7HA 3WN6A 1R7OA 2D1ZA 1JZ3A 1JZ7A 4GKLA 4TXEA 4B3LA 1WZMA 4P7NA 1PAMA 5A6BD 2WHLA 2J7EA 3B8SA 1JDAA 3AS2A 4JFUA 2VZTA 3GNRA 2ZUWA 4AWEA 3WNMA 1JFHA 3RJYA 4D6HA 4C7FA 2XTKA 4H04A 2UY5A 1UD3A 2RGLA 2WVSA 2PC8A 1CBGA 2OYKA 1IT0A 1HP4A 3A47A 3AQUA 3FAXA 3QHMA 2C7FA 3AMCA 2XIIA 2VCCA 4D71A 1XYZA 1GJUA 1TZ7A 4BCEA 3HN3A 1OT2A 4PEEA 5I6SA 2CBIA 3PZVA 5I77A 3UR7A 2E4TA 3PTQA 4MDPA 3TONA 3U5YA 2YA2A 4F9DA 1GOIA 1E73M 5A8PA 1W3JA 2UWFA 3VGGA 3N11A 3PZMA 1B31A 4AZ7A 4PCSA 4P8WA 2BVDA 3EMQA 6CGTA 2GSJA 2PWFA 1ISXA 2PWHA 3K8KA 1W9PA 1J0HA 1AMYA 1ISVA 2BXYA 3TTQA 2CKRA 1W2PA 3BXWA 2J47A 3RCNA 1CXEA 1CDGA 5EBAA 5GPRA 4M80A 3MUZ1 2X09A 4AD2A 3SCPA 3K1DA 1W9XA 4GPNA 3VX1A 4JHZA 4Z2GA 4P7RA 1SMDA 3WQ4A 3PN8A 3VNZA 4TX6A 2Z1KA 3AXIA 1O6IA 3CHCA 1E72M 2CHNA 2GJXB 1C8YA 5A6KA 1B3WA 1E15A 4PTXA 3AS0A 1UA3A 1W9VA 1J0YA 5F7UA 1ZJAA 4M82A 2ZUMA 1EIBA 2WNWA 4H41A 2NW0A 1CYGA 2XIBA 1PZ2A 2EXOA 2OSXA 3VDHA 2YDSA 2YLLA 4J27A 4W8BA 2Y8KA 2A3AA 4PMXA 3AIWA 4UFIA 4PUEA 1W2VA 2VCBA 4PTVA 2FHFA 2PI6A 3MV01 3CHEA 3AXXA 4W84A 4UQCA 5IFTA 4NI3A 1DTUA 3AMDA 1CXIA 4CU8A 2WLZA 3GDBA 3ARPA 4GI8A 2UY4A 5CQ1A 1CEOA 3CO4A 2D0GA 1S46A 2BXZA 1FP9A 2AMGA 4HU0A 1HT6A 3QHNA 2A3BA 1DWJM 2XG9A 5EB8A 3BCDA 2D24A 1E6RA 2ZIDA 1GNXA 1E55A 1QPKA 3AJ7A 1M04A 5A8QA 3DYOA 3RPMA 1KWKA 1UUQA 1FH9A 1V3MA 1OM0A 3GXFA 4CD4A 1W1TA 3WL0A 1E71M 1EOMA 5M3WA 1TG7A 4FF5A 3ZM8A 2DT2A 3CHFA 3OLEA 1W3LA 3WD0A 2DPEA 1EO5A 2G3MA 3GNOA 4LPCA 1B1YA 1MW3A 1BFNA 3MMUA 1ZB5A 3B9DA 2QPUA 1UWIA 2ZX6A 4PMVA 2YOCA 1ITCA 3NCOA 2PBOA 4MB4A 2XJ7A 4AD1A 4HU8A 4AXNA 3MMDA 2WSKA 3W4RA 4CN1A 1OD8A 2A3EA 3PTKA 1PX8A 5C71A 3O9NA 5FD0A 1TVPA 2X1IA 5LYRA 3OA5A 1UH3A 3KL0A 3SCUA 1UKOA 1UD5A 4B15A 4CD5A 3VU2A 4IM4A 5AY7A 1UKSA 4MNJA 2WCAA 5CPSA 3CZJA 2YL9A 1RP8A 4AZCB 4BZYA 2FHBA 1H3GA 2E3ZA 1RPKA 1VENA 3EDFA 1HL8A 3UCQA 1RD6A 1HIZA 1J0KA 3AZSA 1A47A 3BSHA 2BVYA 1KBBA 3TA9A 3WD4A 1JZ4A 1MQQA 4JFSA 5E70A 1J01A 1CXKA 5BWFA 3KEHA 1B3YA 2XFFA 2G41A 3VKKA 1PIGA 1JXJA 1D2KA 4UR9A 3DYPA 3AIUA 1G94A 4YN5A 2BFGA 3ZO9A 4M8UA 3NSNA 3PZUA 2EPOA 2GDVA 1VIWA 3BMWA 3SUTA 3T09A 1W1PA 5ABFB 1KR1A 4J3XA 4HA1A 3MSDA 3F4VA 1E6PA 4S3JA 2WWDA 4UZSA 3BAIA 3K8MA 3K8LA 4FLQA 8CGTA 1UG6A 1O7AA 4UQBA 4ZENA 5FCZA 1WDRA 3BMVA 4W7UA 4PRWA 2WC3A 4XB3A 1NWRA 4TOQA 3VD4A 3LPFA 3WD1A 1V3HA 3PHAA 4DWSB 1B3ZA 5HBFA 2RGMA 2WAGA 3OIHA 1V0LA 2OWXA 3WENA 3CZKA 3GXDA 4DWSD 1QNSA 2E9LA 2J77A 2W61A 4Z2KA 2EPMX 5KZ6A 5BRQA 3POCA 2D20A 1GQIA 4PUDA 3WUEA 3AHTA 2WWCA 4JFTA 5HOSA 3RJXA 2UY3A 3PZQA 1BTCA 1OT1A 4ZFMA 3TTYA 1W1YA 1HJVA 4GO8A 4WSJA 2Y5EA 7TAAA 4OBRA 5JIPA 2CBVA 4RE4A 4PMRA 4ZXOA 2Q8XA 1WP6A 4NZCA 3UG3A 1FHLA 3WDPP 2VZVA 3AZTA 1TMQA 5M17A 4P7OA 3WH5A 1E5JA 3WMBA 1UWRA 1JAKA 5D9NA 1KR0A 1AQMA 3K4DA 1L8NA 1B2YA 2PB1A 1GHRA 2FH6A 3KL3A 4F9JA 5IHRA 2Z1SA 3OLIA 1CTNA 4JL1A 3ALFA 3WD3A 2J75A 3N17A 2OYMA 1GOKA 3BAJA 1EH9A 4TVDA 4X0NA 1FFQA 1FA2A 1VEMA 4J3TA 3OZPA 3VIFA 4DUXA 1QI5A 5EMYA 2VQUA 2ZXAA 3WIJA 2CEQA 1JYXA 2WMIA 1ZBVA 2IXUA 2WBKA 2XGIA 2WKGA 2XPKA 4HOZA 1VFUA 3L2MA 4QP0A 1MYRA 3WNPA 4N42A 3SUVA 3MO4A 3WMCA 4ACZA 4J3VA 5ECUA 2J8GA 1QHPA 3VVGA 1IV8A 1BYCA 2XM1A 3WF3A 1JYNA 4CCDA 4UZUA 4QDMA 3W26A 1NOFA 1RH9A 4OUEA 2WYSA 3CZEA 4Z2HA 1ISYA 1G9HA 3GZAA 2YBUA 2VRKA 2VCAA 2J25A 2DSKA 2D22A 1UKQA 2CXGA 1DEDA 4W86A 1VF8A 5I78A 3WL1A 4OZOA 2WPGA 3AMGA 4AD5A 1G5AA 4WIWA 1TFVA 1H49A 3GTNA 1UOKA 3RO8A 2FHCA 1EHNA 1VEOA 3L2LA 1XH0A 4AIUA 9CGTA 4R27A 3AI0A 3L4ZA 1QNRA 3POHA 3AS3A 1GOWA 2QHAA 3BAWA 5A6LA 2XVKA 3AIVA 4M1RA 3WF2A 1LWJA 1KFWA 1CLVA 4PN2A 1BYDA 3GM8A 1V6UA 1HX0A 1PX3A 5GQBA 3AS1A 4AZBA 5ABEA 4LYQA 2ZXQA 3ZT5A 5D8WA 5ABGA 2J7DA 1HVXA 1DWHM 4AYSA 1E6NA 1BPLB 1C7TA 3WNLA 5BYWA 1B90A 3G6LA 1V6YA 2IXVA 1BQCA 1GUVA 1V3KA 4JZ5A 4B9ZA 1W9BM 5BXPA 3ZT7A 1E0VA 2WLYA 1HVQA 1HKIA 1CPUA 3BAYA 3VD3A 5CGMA 4OKDA 3MV11 4HZ7A 3WH8A 1E0XA 4ZEPA 3UEQA 2F61A 2OWWA 4JIEA 1W9UA 3VINA 1QBAA 1BHGA 1OBAA 4UQDA 1B30A 2XWDA 3MMWA 3FN9A 1W1VA 1LJYA 1OCQA 4QLKA 2DIEA 4GQRA 3MUIA 4J7RA 4H8UA 4U2ZA 1WDPA 1GHSA 1US3A 3N13A 5CPQA 4PMYA 4W87A 4BQ3A 2JEPA 3W53A 2E9MA 3ZT6A 1XHGA 3ZJ6A 1JNDA 4UOQA 1U33A 3N18A 1CNVA 4PMQA 3LPPA 5JBEA 5ABHA 1HJSA 3WEZA 1Q4NX 2MANA 3M6DA 3IJ9A 5A69A 3VDCA 2WVVB 2G8ZA 3K46A 4GI6A 1UWTA 2D3LA 2G3IA 1XD1A 3ZJKA 1BGGA 1Q6FA 1EDQA 5FL0A 1E0WA 3LPGA 2AAAA 4C7GA 3QR3A 2DH3A 2CBJA 2ZX7A 2JIEA 4PTWA 4M56A 2VL4A 4UOJA 3VDBA 4UCFA 3KE0A 3SEPA 3GH7A 2YLAA 4WF7A 1U30A 4P7QA 3BH4A 5HXMA 3DHUA 2GK1B 3NSMA 3EBVA 2YIHA 3T0BA 5BXRA 2FDMA 2JF6A 3FXYA 4IUGA 2DEPA 3T08A 1CECA 2V5CA 3D5HA 1WAWA 2BHYA 3DYMA 3ZR5A 1EXPA 2E40A 3VPLA 2IUZA 2VX6A 4PYSA 1E70M 5DT7A 2ZOXA 5E0FA 1JD7A 3WF0A 5AC4A 1WCGA 2VUYA 3WH7A 1OINA 5JIWA 4W8LA 4DUWA 1NWUA 5DFAA 1LL6A 1V3IA 2CETA 2CNCA 5CLTA 1G1YA 4A4AA 2A3HA 1VJSA 3ARZA 4M81A 1BSIA 3GH4A 1WZAA 3DC0A 3AFBA 2D23A 1UQYA 1PEZA 1GZJA 4LQ1A 4XUYA 5I24A 1UKTA 3MUY1 3WELA 1UWQA 2X8RA 3W29A 3ARRA 5CSYA 3GBDA 4U31A 3AMLA 4CUCA 1E6ZA 1JI2A 3A4WA 3WFZA 1JZ6A 2QMJA 4YHGA 1CZ1A 4ATWA 1V03A 1UR1A 4UQEA 4PMNA 1NM9A 2CCRA 2YA0A 3CPUA 4QCEA 3VGFA 5FKYA 2ZWZA 1LF1A 4D6GA 3VMPA 2XVGA 4WKAA 2NT0A 2D0HA 1BYAA 2D3NA 1QHZA 1QW8A 1QW9A 5M03A 4QLLA 2WKLA 3AICA 3SCVA 2WBGA 1DHKA 1CGWA 2VZUA 4MAZA 2WC7A 1HKMA 5I5RA 5KEZA 3AIBA 4W93A 5BXSA 1C91A 8A3HA 3VUPA 2J78A 3EMZA 6A3HA 1ZBWA 1FHDA 2GJRA 2O9TA 3GBEA 1IZJA 4NRSA 3WF1A 2W63A 4E2OA 4H2CA 4U3AA 4CU7A 1GPFA 5AYIA 3EDKA 5A1AA 2VX4A 3SCOA 4HA4A 3A4XA 4V2XA 1UD2A 3RM4A 2Y2WA 3AHZA 4EAMA 1WPCA 1MQPA 1C92A 2VO5A 1TCMA 4NF7A 1LLOA 3U7BA 2EJ1A 1C7SA 1K9TA 1I1WA 2XHYA 3VGEA 3NDZA 4PBGA 2UY2A 4AZ6A 1LL7A 3T2QA 1UR9A 4AD0A 3NDYA 4JKMA 1JF5A 4EANA 1AVAA 3SIMA 3WDHA 5A6SA 1E4NA 4UFKA 3L4UA 3PBGA 1FFRA 4W5UA 3F5JA 3VGDA 2PWDA 3KZSA 4ZE5A 4UFMA 2VX5A 2FGLA 4CD8A 2DT3A 3WDRA 2BNJA 2VNCA 2QMKA 1GOQA 4LGXA 3W0KA 4AIEA 4UFHA 4EK7A 3CZ8A 2YDQA 3IAPA 5IXEA 1ODZA 4HOWA 2WZHA 5ABFA 1E1FA 7CGTA 1H1NA 3OG2A 2YL5A 3WNNA 1TVNA 3WQVA 3VIIA 1GOOA 1OIMA 2FH8A 1UD4A 2CPUA 3THCA 1ECEA 1V08A 3VMOA 4U2YA 4A3YA 2W67A 2CYGA 2DGAA 5I0DA 4QLJA 1WKYA 1UH4A 4MADA 4AD3A 2VQTA 2CIPA 4WKHA 5LA2A 1DWGM 2ZE0A 5A6AA 1ODUA 3B9AA 4NSBA 1Q6CA 3FNDA 2XSAA 3WUFA 1OWQA 1EOKA 2DSUA 2Y4SA 1XCXA 2TAAA 4J3SA 4HPGA 4CD7A 2ZXDA 5E0CA 2DDXA 1DWFM 3VMNA 3ZMRA 3I3EA 2BY3A 3AXHA 3VNYA 2ZXBA 3WDIA 1MW1A 4JHOA 2B31A 3IJ8A 1ZBKA 4MB3A 5CXPA 1OSEA 1E4IA 3OGRA 2J7FA 3PTMA 1AQHA 2J8FA 3QHOA 1E3ZA 5DO8A 2VRQA 3WD2A 1OD0A 4YHEA 2WMKA 4D6DA 2A3CA 5IFPA 1KWGA 4BQ2A 2NT1A 2WMJA 4GINA 4FLOA 3CHDA 1ISWA 2OWCA 3OLGA 4N0RA 4DM1A 3L4XA 4KRUA 4D6EA 3UESA 2WXDM 3ZSTA 2DQXA 1TA3A 4TVCA 1V0KA 1E6XM 3VIKA 1UWSA 3THDA 4HMDA 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 4L4P A;  1H41 A;  3BCF A;  3BC9 A;  2O9R A;  3TP4 A;  1JZ2 A;  5E9A A;  4BQ5 A;  3PZ9 A;  4IPN B;  2EPN A;  2J7C A;  3ZJ8 A;  4LXF A;  4OIF A;  3WDJ A;  3CMG A;  3L4W A;  3ART A;  1KXT A;  2QF8 A;  1GQL A;  3FHQ A;  1M7X A;  3ARY A;  7A3H A;  3D3A A;  3AZR A;  3VOC A;  3WQ8 A;  1UH2 A;  1MXD A;  4MJ4 A;  3APG A;  3VIJ A;  3ARW A;  1UQZ A;  3AOF A;  2ZX5 A;  1HXJ A;  1E1E A;  1KCL A;  3VX0 A;  1CGU A;  3TTO A;  1H4P A;  1V0M A;  1WE5 A;  4BA0 A;  1X6N A;  1KGW A;  3VDA A;  3BGA A;  4HZ6 A;  3FY1 A;  4GQQ A;  3VIL A;  1FH8 A;  2WC4 A;  3VIO A;  1D3C A;  4PCT A;  5CSU A;  2DSZ A;  2WMI B;  4OOU A;  2WVT A;  3ZJ7 A;  2G3N A;  5DEZ A;  3CMJ A;  2W92 A;  3VIM A;  3VD7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HHL A;  3F4D A;  3FAW A;  4M19 A;  4JYF A;  3LNM A;  2C8N A;  2E6A A;  1FKK A;  3K4A A;  4XK2 A;  5CBB A;  1B57 A;  1OYC A;  2OKT A;  4HP5 A;  4H83 A;  3QPE A;  3NIY A;  1LT8 A;  4CQD A;  4GY7 A;  3DFS A;  3KOY A;  4UNI A;  3VFL A;  3UND A;  4PUK A;  3IPW A;  2YW3 A;  1IR1 A;  3TFC A;  1NP2 A;  1H5V A;  3GXI A;  1F2J A;  3F7J A;  5HDR A;  2HNE A;  4IMC A;  2LLE A;  1XFC A;  3S83 A;  4CD6 A;  4ERG A;  4B3K A;  3OQE A;  4Q4S A;  1CGV A;  3TU9 A;  5FJP A;  1E44 A;  2PWE A;  3CUG A;  2NUY A;  1ONR A;  3I3D A;  4UR8 A;  2VT0 A;  4L9X A;  5AVN A;  2VMF A;  3QGA C;  4C1L A;  3VM7 A;  1GCY A;  1ZP3 A;  3UJ2 A;  3CIV A;  3VM5 A;  3II1 A;  3KVL A;  1NVM A;  2MPH A;  2NQL A;  2Z7G A;  3DAQ A;  5LGX A;  2PWG A;  4IQD A;  2CWN A;  2W9M A;  4JIQ A;  2BS9 A;  1F74 A;  2QCD B;  4JIH A;  1R30 A;  3IUD A;  3DFP A;  3D47 A;  4DRI A;  4P61 A;  1PKM A;  1L0P A;  2W62 A;  5A8M A;  3H55 A;  2FKE A;  5CJM A;  3CUH A;  3F2B A;  3J7H A;  1RD5 A;  1R7O A;  2D1Z A;  4GKL A;  4IIF A;  3JYM A;  1WZM A;  4P7N A;  1PAM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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