4S3JA

Crystal structure of the bacillus cereus spore cortex-lytic enzyme slel
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
431
structure length
429
Chain Sequence
FAIQIVTVRSGDSVYSLASKYGSTPDEIVKDNGLNPAETLVVGQALIVNTKGNNYYVQPGDSLYRISQTYNVPLASLAKVNNLSLKSILHVGQQLYVPKGTKRSVESIAYLQPSTIPIKESLVNATRAINPFLTYLAYFSFEAKRDGTLKEPTETAKIANIATQGQTIPMLVITNIENGNFSADLTSVILRDATIQNKFITNILQTAEKYGMRDIHFDFESVAPEDREAYNRFLRNVKIRLPSGYTLSTTLVPKTSSNQKFFEAHDYKAQGQIVDFVVIMTYDWGWQGGPPMAISPIGPVKEVLQYAKSQMPPQKIMMGQNLYGFDWKLPFKQGNPPAKAVSSVAAVALARKYNVPIRYDFTAQAPHFNYFDENGVQHEVWFEDARSIQSKFNLMKEQGIGGISYWKIGLPFPQNWRLLVENFTITKKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional analysis of SleL, a peptidoglycan lysin involved in germination of Bacillus spores.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cortical-lytic enzyme
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus cereus
total genus 148
structure length 429
sequence length 431
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-02-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4s3jA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4s3jA02
2WMJA 2WNWA 3SEPA 4B3LA 4KRTA 4UFKA 2G4FA 2WMHA 3ZSTA 3VIKA 1QPKA 4PCTA 1TMQA 2VVNA 1KCLA 1KBBA 3OZOA 3W29A 2VX5A 4E8DA 3CUGA 3WENA 1MXGA 2O9OA 2DSZA 5IHSA 3MV11 2WZHA 5E70A 2XYLA 4J27A 1CZ1A 5EFFA 2W4XA 2ZUTA 1V02E 1VF8A 2BNJA 4BZYA 1TA3A 1AVAA 1JZ5A 3CO4A 1WP6A 1GQIA 1CGYA 2ZX8A 3CPUA 1ZJAA 1KCKA 2PWEA 2ZUSA 1WDSA 4HMCA 1BYAA 4KGLA 4MNMA 3B9EA 1B3YA 3CUFA 2V3FA 1E40A 3U7BA 3VMPA 3N18A 3ARWA 3PBGA 2D0HA 3MUIA 3IK2A 1J0JA 3WD4A 2GDUA 2VTFA 1H0GA 3FNDA 3MO4A 5A3HA 3AFBA 3N15A 1UKPA 3UERA 4HOZA 4A4AA 1ZBWA 5AC5A 3D5HA 2F61A 2JF6A 5E0CA 2F2HA 3NYDA 3WNKA 5BRPA 4UFHA 4IPNB 2IXVA 3II1A 3ARYA 4FF5A 4WJXA 3IAQA 2WSKA 4AZCB 3BCDA 3GBDA 1G01A 1KXQA 1DEDA 3EYPA 1UWSA 2OLHA 3QGVA 4HMDA 1JF6A 2E40A 4RE4A 3SUTA 4QFUA 4PUEA 1ZBVA 1VFOA 2VR4A 4P7NA 1O7AA 2OYKA 3SUSA 4CVUA 4B15A 4WSJA 2FH6A 5HPOA 4W7UA 2Z1KA 4N0RA 1W9UA 3GH4A 1E71M 2B31A 3CHCA 2XPKA 2Z1SA 5A69A 3WQ5A 4S3JA 3WMBA 3AJ7A 1J18A 1JXJA 1B1YA 4AZCA 2A3HA 4UFIA 1RD6A 3WDRA 4K68A 1UQYA 1PIFA 3L4VA 2EJ1A 3GZAA 4FK9A 3L2LA 2WM0A 4HZ6A 2FHFA 1JAEA 2XHYA 4W8AA 2BY0A 5F7UA 5AYIA 4P7OA 3W6LA 1V03A 2QV4A 1EO7A 3EDKA 5CLTA 2QLYA 4J3VA 3SIMA 1UQZA 3MMUA 2BVYA 5A1AA 2D0FA 1V6VA 1OGGA 1CXFA 2PWHA 2E9BA 4CCEA 3KWXA 2VX7A 3TTQA 3PZIA 3UR7A 1NOFA 3RM8A 2ZXDA 4JKMA 4UOZA 5BWFA 1UWRA 2HISA 4HOXA 1R85A 4UZUA 4AD5A 4MAZA 3RJXA 1R8LA 2CESA 4ZXLA 1KBKA 4LX4A 4Y7EA 1C7TA 2ZUWA 1UH3A 3A6OA 2FHBA 3AIWA 2NT0A 3WF4A 3NJ3A 4NI3A 5CPTA 7CGTA 4DUXA 5M03A 1X6NA 3CZKA 2D24A 3SCSA 3QOKA 1MFVA 3AMKA 4AEEA 3PTKA 5HOSA 4TVDA 3EMZA 4PRWA 2DIEA 3T2OA 3NDYA 2BV9A 3SCUA 4RE2A 4FLRA 3QOMA 4OKDA 4UOJA 3PZ9A 4TX8A 3AHXA 1QI5A 2E9MA 2A3BA 4OZOA 2XWDA 4JZ5A 1OINA 3W27A 3G6LA 5CXPA 3WUEA 1WZLA 1V02A 1MW2A 9CGTA 1VEMA 3PTMA 3AROA 5CPSA 1KQZA 2VRQA 1QOXA 3RPMA 3PHAA 3AIRA 3SURA 2A3AA 3AS3A 5EBAA 3ZT5A 3CHDA 5A95A 3RDKA 2XIIA 4JKLA 1BF2A 1V0NA 3VIOA 3WF0A 1B3XA 1QHOA 3TONA 4W88A 1AQ0A 2XIBA 4AYSA 5HPCA 3BAIA 4PMYA 2YKKA 4ZFMA 2YL8A 1UWIA 3PZTA 3F5JA 5A6BA 4LQ1A 4OOUA 1NARA 4BA0A 1ZBCA 1DWIM 1UOKA 2VI0A 1E1FA 1EQCA 4J3UA 4AISA 1PIGA 2YOCA 3BC9A 5LA0A 4DWSB 2VCBA 2WK2A 5HDRA 5D9PA 4GZJA 1UR1A 4JFWA 2DSWA 1HKIA 1KXVA 3VNZA 5E9AA 2X0HA 2GVYA 5D8ZA 4H41A 2VCCA 3TP4A 1UD4A 1NP2A 3NUKA 3WL1A 3WKZA 2UY5A 3WUBA 3CZGA 1FH8A 1OIMA 4A3YA 3UESA 1PX8A 1EDTA 1U30A 1MW3A 3WQVA 1V6YA 5IXEA 1GOOA 5A2AA 1FOBA 1HVQA 4JHOA 4MB3A 3WF3A 3NSXA 2W66A 4DWSA 4AIUA 2E0PA 4MNKA 3K4AA 3ARPA 1NWSA 1C92A 4CGTA 2ZWYA 5DF0A 1E3XA 2W61A 3CZLA 4GZIA 4J3TA 4AZGA 4R27A 1NH6A 2W91A 2G8ZA 1HKJA 3WNLA 5CG0A 1E4MM 2WLYA 1KGWA 4NF7A 3WFZA 4D6EA 2EPLX 3GH5A 1Q6CA 3GXMA 3AMLA 1GW1A 3SCQA 1B90A 2JALA 2ZX5A 1XGZA 2W67A 3W38A 2YL5A 2J79A 1H0IA 3EMCA 1B0IA 3OLDA 1ITXA 5IHRA 1JDDA 1QW9A 1XCWA 2VZTA 3K46A 4HU8A 1GOKA 5JIWA 3VGHA 1C8QA 3VTRA 4PMUA 3VIGA 3NIYA 3VMOA 4PEEA 3GNRA 4B9ZA 4YHEA 2C7FA 5A6BD 1KGXA 2E4TA 1ZU8A 2FHCA 2BVTA 3U5UA 4U31A 3GXDA 2D0GA 1K9FA 4MADA 4ACYA 1CENA 2A3EA 3W24A 3DHUA 1J9YA 5IFPA 3ZJ6A 4FLQA 2WBGA 2GJXB 3MU7A 1CXHA 1W9PA 1D2KA 1Y7VA 2CKRA 4W87A 2VZUA 2VCAA 1FFRA 1M53A 4OJYA 3ZQ9A 3GXFA 2X09A 1EA9C 4LPCA 1Q6FA 3VMNA 3WDIA 3SCOA 3WH7A 3AS1A 2VZVA 2TAAA 3ARSA 2OSWA 3UG5A 2D3NA 4MB5A 1VB9A 3CMJA 1K6AA 1ZBKA 1QNRA 1WDPA 3OLEA 2J7FA 2FH8A 3EBVA 1ZB5A 4D71A 2GJXA 1JG9A 3VIFA 4NRSA 3T0BA 3I3EA 1W32A 3OIHA 4DM2A 2OWCA 1ESWA 1ZJBA 4W8BA 1YQ2A 1LWJA 1JZ2A 3RCNA 2W62A 4J7RA 4BF7A 1WPCA 4DWSD 4W85A 1M03A 1NWUA 1JYWA 4EE9A 4AZBA 2VOTA 1EHAA 4PTWA 1XC6A 4W8LA 1LG1A 1E6SM 4AMCA 1E6RA 2JE8A 3KEHA 4P8UA 5FD0A 1G9HA 3U7VA 1UWUA 2VZOA 3CTTA 3AIEA 4PCSA 3EMQA 4FLOA 3IJ8A 1WNOA 4U33A 2PC8A 4HPHA 3VD5A 5M5DA 2A3CA 1BGGA 3VD4A 2PWFA 3BAWA 4PYSA 2ZX9A 1VEPA 2YA2A 1R7OA 2VC9A 1J01A 1TG7A 1TVNA 2V5CA 1SYTA 1FFQA 1QNPA 4H8UA 1H2JA 3VIPA 2J7EA 2O9RA 1WE5A 3RO8A 1E55A 3EDEA 4CU6A 4JFUA 2PBOA 5M17A 1V6WA 1V3JA 1UD8A 3CUIA 3VKKA 4PMRA 2YDSA 1WCGA 3RJYA 3SUVA 4CN1A 3OLIA 4RE3A 3K8LA 1HF6A 1FHLA 5M3WA 1KGUA 2PWGA 3WDHA 1V6XA 3RM4A 2ZX7A 1BYCA 3GXIA 1J0HA 1BG4A 4AD3A 4W5UA 1KXTA 4UFMA 3A4WA 4MJ2A 1GHSA 1JZ6A 3EDFA 1WZAA 1W2VA 2CBUA 3KE0A 2WW5A 1JNDA 4AC1X 4EAMA 4EKJA 1GHRA 3NCOA 4ZEPA 3AQUA 1HL8A 4PTVA 2WC7A 3A4XA 2O9TA 1ODUA 4RL3A 4GI6A 3AXXA 4LYPA 4A3HA 1DTUA 1GZJA 1KB3A 4M80A 3VDBA 1GVIA 1CDGA 1XHGA 1A3HA 1V3KA 3EDJA 1CGTA 4B9YA 2VQTA 1QNSA 3TOPA 2UY3A 2GUYA 2G3IA 1R86A 4WKHA 1QNQA 3T2QA 3TA9A 1DWJM 2VX6A 2YBTA 3BSHA 2CXGA 2NSXA 3GTNA 3ARQA 1QBBA 3WDJA 1UH4A 1QW8A 1CEOA 2QHAA 3IANA 4E4PA 2AAAA 5JBEA 2QMKA 4HZ7A 3VIJA 3PZVA 3ZMRA 3VGFA 3I3BA 3DYMA 1ISZA 3U5YA 4UCFA 3GYCA 4GQRA 4XZWA 1UUQA 4TXEA 1XYZA 2J4GA 3TTOA 4M1RA 2DH2A 3O6AA 3WQ6A 4W93A 1VJZA 1UZ4A 4PTXA 5DEZA 1OD8A 1OM0A 2C8NA 2XVPA 4JKKA 4M8UA 1OT2A 3WD1A 4W84A 1JXKA 1UA3A 3WN6A 2DGAA 3VIIA 3VUPA 4MDPA 4UQEA 4D6FA 5CJ5A 2J62A 5BXPA 2J7DA 4DUWA 3MS8A 1UR9A 4D1JA 1JD7A 1HJVA 1ZL1A 3VD9A 2VQUA 2ZE0A 3ZM8A 2VJXA 2XFFA 3THDA 4PMDA 4PUDA 1CLXA 3KL0A 3GM8A 4MAVA 2DQXA 2JIEA 3CIVA 3BH4A 4OIFA 1G94A 5I78A 2D23A 2E3ZA 3SCTA 2YJQA 3PZOA 3ZT7A 3VIHA 2GJPA 1HJQA 5I6SA 1JZ8A 1I1WA 1MWOA 1BYDA 5A6SA 1C91A 1UR4A 1DHKA 1E4NA 4JHZA 3G6MA 1UD6A 4JCMA 2XGBA 3WEZA 5KZ6A 2YLAA 3VDHA 2DPEA 5BROA 3ZJ7A 2WHKA 4PMOA 1B9ZA 2CYGA 4NSBA 3UR8A 4D6GA 2YDQA 1I1XA 1QHPA 3NSMA 3WMSA 4D1IA 1HL9A 1JYNA 1MQPA 2YL6A 3T0AA 2J8GA 1DWAM 3CUHA 5FCZA 5FOOA 4M24A 4AZ7A 2VNCA 4C7DA 1B31A 3OGRA 4DM1A 4OUEA 2XSBA 1L8NA 4CD7A 3AISA 4AD0A 4W7WA 5I5RA 1D7FA 1VFUA 1ISWA 5I79A 3AHYA 1BHGA 3WH5A 3L4WA 1GOMA 4E8CA 1HVXA 2ZXAA 1XCXA 3PZUA 1MW1A 1E4IA 1W3JA 1NWRA 4AZ6A 3GNPA 3LPGA 4ATDA 3M07A 3O9NA 3VVGA 3DHPA 1GORA 4HOWA 1E6ZA 3AS0A 1SFSA 2DH3A 3W53A 4ZXOA 1W3HA 2WMFA 1CXKA 5A6MA 3CBWA 1E6XM 6A3HA 5I24A 3ARVA 3AIBA 4TUFA 4HA4A 1O6IA 2DT2A 3BGAA 3VILA 5CSUA 1FH7A 7TAAA 4MB1A 1KFWA 1JI1A 4D6JA 3W37A 2WVSA 2XJ7A 1M01A 2XSAA 3ZJ8A 2ZXBA 4U2ZA 1XH1A 1CGXA 3FN9A 4BCEA 4C7GA 3K8MA 2G3NA 1OGBA 4PMZA 3THCA 1W1VA 1UKSA 1E6NA 2WXDM 4GI9A 1B30A 1CGWA 4MJ4A 2OWWA 1LF1A 5I2UA 1W2PA 1EOKA 4AZIA 5BCAA 1GJWA 2CHOA 1X1NA 2DT0A 1TCMA 3WBEA 1QI0A 4CUCA 3AHZA 2BXYA 1WDRA 1MQRA 4CN4A 2EEXA 2WSPA 3WMCA 3FAWA 1ISYA 1PEZA 2YA0A 5I3DA 2JFEX 5GPRA 5E09A 4F9DA 1KR1A 1FHDA 3PN8A 1LJYA 2XVGA 3N12A 4GINA 1MXDA 4H7VA 4AY1A 2WPGA 5D8WA 3VM7A 3SUUA 4CKQA 2CEQA 1M7XA 2CERA 2J7GA 2CIPA 5CGMA 5A8MA 1TR1A 3QHOA 3UCQA 1TVPA 2VRKA 3HJEA 3MUZ1 5C8BB 3WELA 1IV8A 3WH8A 3RILA 5I23A 3WD2A 1E6QM 1V0KA 4UQAA 3PTQA 1D3CA 1TE1A 3AIVA 4H8VA 4S3KA 4BQ2A 5CLWA 1UWTA 3WDQA 3W26A 3M46A 5EFDA 4X0NA 3D3AA 3OBAA 3ARXA 1CECA 1MFUA 2WKGA 3AHTA 4YPJA 5DMYA 2O92A 4HA1A 1PX4A 1OGSA 3ZOAA 1US3A 1BVNP 1H1NA 2XVNA 3AXIA 1JDCA 4J3SA 1OIFA 4ZE5A 1JZ3A 1V3MA 4ACZB 4PBGA 1GCYA 1PZ2A 1QNOA 3BSGA 3CZEA 3L4TA 4D6CA 5GNYA 1PBGA 3VGGA 3WD3A 3OGVA 5AYBA 3W28A 3N13A 5JUVA 4AZ5A 1AMYA 2ZUUA 2ZICA 1JFXA 3WQ8A 3BCFA 2BS9A 3WFLA 4XZBA 1JYVA 3CZ8A 2GDVA 5EB8A 5A6KA 3IJ7A 4M56A 4WF7A 1L0PA 3AZRA 3SCPA 2HVMA 4D6DA 1UD3A 1DWFM 4H8HA 3F5KA 2J77A 4U3CA 4QLJA 1W1TA 3GH7A 3B9DA 3T2PA 3VDAA 1NQ6A 3HMCA 3GNOA 1EQPA 4B16A 1R87A 1JFHA 4AIOA 1E5NA 1PAMA 4ACZA 5BYWA 4JFVA 4AW7A 3MSGA 2DDXA 2WB5A 4P7LA 4D72A 4WK9A 1NP0A 2W5FA 4YHGA 2WWCA 4GPNA 3LPOA 3AMDA 1B3VA 2WMKA 4CD5A 1A47A 3W4RA 2CPUA 2WKLA 1WZKA 2D2OA 4PMQA 3TTYA 4F9JA 4PSRA 2IUZA 3SCNA 5A8NA 1CGVA 1C90A 4FMVA 3VX1A 4U3AA 2DSUA 4ATLA 1UH2A 2OSXA 1UKQA 2BVDA 3POHA 2O9PA 1RH9A 5LA2A 4UQBA 2BY1A 3K1DA 4P7QA 3WD0A 1XSKA 5JIPA 2JEQA 1IZKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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