4WJXA

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain at 1.0 a resolution
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitotriosidase-1
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 137
structure length 369
sequence length 369
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wjxA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wjxA01
4HA4A 2DSWA 2FHCA 1UD5A 4TOQA 5ABHA 2PB1A 3TONA 5C71A 3CHDA 4MB5A 3VDCA 1E6QM 1QW8A 2V3FA 2FGZA 3U7BA 2ZUWA 4HOXA 2CBIA 5CJ5A 1UKTA 2XWDA 3ARSA 3B9DA 4J27A 5JBEA 1V0MA 1LWHA 4TTGA 4PMXA 1EQPA 4CVWA 2MANA 2V38A 3NDZA 2ZE0A 5KEZA 2J8GA 3PTMA 3PZQA 7TAAA 3AMDA 3WNMA 4CU8A 4QCFA 3M7SA 2DT0A 5BXTA 1J11A 1UA7A 3GZAA 4GIAA 3AIBA 1JZ4A 4PMRA 3ARYA 3CZJA 1RP9A 3UERA 1FP8A 1XH1A 2WVSA 4EAMA 1NOUA 2OYMA 1B3VA 1W2VA 1LL4A 4ZE5A 3GBEA 2BY1A 4AIOA 3OLIA 4MDOA 4DUWA 4PMDA 1UD4A 4W88A 3MMUA 4PSPA 1E72M 5A6SA 3TOPA 1E71M 4GINA 3ZIZA 5C70A 1JYVA 1XC6A 2XVNA 3U57A 2JIEA 3BXWA 1H5VA 1ODUA 1KFWA 3A4XA 3OIHA 3CMGA 4XZBA 3AIVA 5JBDA 1CXEA 3UG4A 2WZEA 4DWSA 3IJ8A 1PEZA 5A95A 4X0NA 5BXSA 4B3KA 3VO0A 3THDA 1VF8A 2WHKA 4KMQA 1M7XA 1F4HA 2E9LA 3AXHA 7A3HA 5HDRA 2Z1SA 4UFKA 1GOMA 4KRTA 4CUCA 4DUVA 2E8ZA 3IAQA 3K4AA 4LYRA 2Q8XA 1OT1A 3N17A 1EO7A 2ZXAA 1B1YA 1NWSA 2NW0A 1UR4A 2DDXA 1EXPA 4MDPA 3LMYA 1TE1A 1ZBVA 1PJ9A 1NM9A 4AXNA 3VIPA 3L4VA 2GJPA 3BGAA 3SCQA 1RPKA 1J12A 1CECA 3WEZA 1J0JA 2WVVB 1PBGA 1TCMA 3NSNA 3WD4A 1ZS2A 5CPQA 3K8MA 1KWKA 2CYGA 3U5YA 3WNPA 2V3EA 2YL6A 1ESWA 4AWEA 4J3XA 4PRWA 2J7EA 2WVTA 2XSBA 3AHYA 3DC0A 3LPGA 6A3HA 3VINA 4JFUA 3VM7A 3VIOA 4F9DA 1CWYA 3D5HA 4UFIA 2JEQA 3RDKA 1HIZA 3VDAA 5I78A 1E15A 3CBWA 2WMIB 3VDHA 1BYCA 2UY4A 4ACYA 2WZIA 4AD5A 5CG0A 2G8ZA 2WWDA 2WHMA 2VO5A 4PMQA 3RPMA 1BFNA 1XH2A 2UY2A 2ZICA 2CIPA 1QNPA 3WKZA 3A4AA 1Q4NX 5AYBA 3VGDA 4M1RA 4YN5A 4P7OA 3WDHA 1C7SA 1W3HA 5D9MA 3MU7A 3S2CA 3ECQA 1E0VA 3I3BA 4D6CA 1U30A 4JFTA 3ZQ9A 3MV01 2CBUA 1ODZA 4WSKA 4AC1X 3PZTA 3BSHA 3UR7A 5IFTA 1QNSA 3TTSA 2WLZA 3KL5A 2WC4A 2Y8VA 1EO5A 1JF5A 1MXGA 3RILA 5A8NA 3ARTA 1E5NA 4QP0A 3AS0A 1GQLA 4YHGA 5M5DA 5A8QA 1H1NA 1AVAA 1JXKA 3RCNA 2YA1A 1C91A 5BCAA 2CBJA 2EO7A 4MAVA 1HX0A 2ZUUA 3MMWA 4M24A 3MV11 2W61A 4UOQA 2E40A 3VM5A 4AZIA 2X0HA 3VIFA 3ZT5A 4IISA 3DHUA 1W9PA 3GXMA 1KWGA 5BYWA 1AQHA 2WC3A 1UWIA 1R8LA 1JXJA 3T2QA 1ZJBA 2O9TA 3WENA 2XGBA 4WLCA 3G6LA 1FP9A 3T0AA 2BVDA 1W9XA 1V6UA 4TX6A 1DTUA 1OM0A 4AEEA 1FH8A 4OUEA 4FF5A 4WF7A 5EMYA 3L4WA 2Y8KA 5A2BA 1W9DM 4C7DA 2WMJA 3IJ7A 1UR8A 3PZMA 4H04A 4UFJA 4PMOA 1E6PA 5CLTA 1QHOA 5A69A 4UZSA 4AZCA 5DT5A 1VJSA 2W62A 4HZ8A 1LG1A 2WXDM 1EIBA 3CZGA 2V5CA 2FHBA 3EDKA 1E6ZA 2VT0A 1PZ3A 2YBUA 2DSKA 1Q6CA 3IJ9A 2PWFA 2J74A 1JZ8A 1FH7A 4IPLA 1JD9A 2YJQA 1OD0A 3T2OA 2VQTA 2PC8A 4N0RA 1HKKA 3FHAA 4GZJA 3CIVA 3ZSTA 1UA3A 1XSKA 2WVUA 3W28A 1KBBA 5HBFA 5CPTA 1FFQA 5A6LA 3WF2A 1JDDA 1XH0A 4ATWA 3WFZA 3W37A 4CVUA 3VGHA 4WK9A 1H0IA 1NWTA 1GJWA 1G1YA 4AD4A 1H09A 2WBGA 1BTCA 2XHYA 3NDYA 2VX5A 2VRQA 2ZX5A 3L2LA 4BQ2A 1C3FA 2E4TA 3S6TA 3RO8A 4D1IA 2BY3A 2VMFA 1ISXA 1K9EA 2YKKA 1UUQA 4YHEA 2BVYA 2WBKA 1WO2A 2J75A 3U5UA 4CCCA 2VCAA 3UESA 1E4LA 2TAAA 5A2CA 1JAKA 1PZ2A 4UQEA 3WIJA 4A4AA 1PX4A 4ACZB 3OA5A 4PTXA 3WQ5A 4JHZA 3TTQA 3WH7A 2VC9A 2E9BA 1JYWA 3ARWA 4LQ1A 4W87A 4JKKA 1NOWA 4AZGA 3GYCA 1W3LA 3W26A 4WKFA 1V3MA 2ZX7A 2YIHA 4ZXOA 5I3DA 4W8BA 1QNOA 3VIJA 1UOKA 3GNPA 3AHTA 3ZJ6A 3VDBA 2ZIDA 1WZKA 2OSXA 1V6VA 3AS2A 2OWCA 2XGIA 4GO9A 5ABFB 4M56A 1HKJA 4E8DA 1W9UA 2VCCA 3N18A 1SFSA 2GFTA 1QVBA 1E0WA 1E4IA 3DHPA 1EGZA 4GXPA 3BAJA 1CXHA 2DH2A 3WH6A 3FN9A 1JF6A 4AW7A 1E4MM 3VD3A 5A8OA 2CPUA 2E9MA 2EPOA 2JFEX 2WANA 3IK2A 4JFSA 4PMNA 4J28A 4E2OA 4IPNB 2Y5EA 4KH2A 1KB3A 4AZBA 3W82A 3W53A 4A3HA 4FLSA 3VD4A 1B3YA 1BLIA 1WPCA 2ZUVA 5A2AA 1US2A 1WDPA 1XRVA 3VIIA 5CZKA 1D7FA 4RE4A 1EDGA 1UH2A 3SUUA 5IDIA 2RGMA 1E43A 4QCEA 5EBAA 2PWDA 3T09A 1TZ7A 1VBRA 1UKQA 4W84A 1M04A 2GK1B 3CHFA 4TUFA 4Q7NA 2VZUA 1VENA 5CPSA 4UTFA 1XHGA 2B31A 3AS3A 1VB9A 4V2XA 3WQ6A 3GM8A 4W8AA 1CGUA 1UWRA 3WF3A 1UD2A 4QLLA 2DPEA 1BYBA 5FCZA 4N42A 3SEPA 1JFHA 2QV4A 3GXFA 4HPHA 3T08A 4F8XA 3AXIA 3KE0A 1LJYA 3L4YA 4XUYA 2GSJA 3WQ8A 1V6XA 2WKLA 4CN4A 1TA3A 5FOOA 3ARZA 1CIUA 2XM2A 1UWUA 1JD7A 1N82A 2D0HA 1W9BM 4TVCA 2WSPA 3VU2A 2D20A 2DGAA 4WKAA 1KXTA 3F5LA 1LG2A 4MNMA 2ZX9A 1LL6A 2W5FA 4D71A 3OGVA 1RH9A 1VJZA 3QHOA 5AC5A 1E56A 1GONA 4BA0A 4NZCA 3HJEA 3AICA 1WDQA 3VD7A 2O92A 1OGGA 2CESA 3AXXA 2VX6A 3ZJ8A 1JYXA 1GOOA 2CHNA 3KL0A 1XV8A 5E9AA 5IHSA 1A47A 3UG3A 1UWSA 1Q6EA 3VVGA 1JG9A 3SURA 4UZUA 1BPLB 2EBNA 2V5DA 5IHRA 2DSUA 4AD3A 3N12A 2G41A 2ZWYA 3AS1A 3IAPA 4F9JA 2FGLA 4KRUA 1UZ1A 3BH4A 2BHUA 4X0VA 1R7OA 1ZB5A 4OKDA 4WSJA 2BHZA 4P8XA 1KXHA 5AYIA 1QNQA 1QBAA 2G3MA 5LA0A 5C8BB 4P7RA 4B9ZA 2VZVA 5GPRA 4ZENA 3WDQA 4MJ4A 1UKOA 1DWAM 3NYDA 4LXFA 4OOUA 2W92A 1ISZA 5DF0A 4RE3A 3W6MA 2YL5A 4HU0A 4PSRA 3GH5A 4HOZA 1VRXA 3BLKA 1VFMA 4AMCA 2HISA 1C7TA 1KR1A 2GJXA 1B3WA 4JFVA 6CGTA 3ZO9A 1UKPA 4GQRA 2D23A 2DH3A 3GXDA 1ITXA 2WW5A 3MMDA 2YL9A 3K4DA 5HPCA 2CCRA 4JHOA 3WDJA 2XIBA 1GQKA 1MYRA 4KGJA 2O9OA 4FLOA 1K6AA 1VAHA 1HL8A 3AQUA 4J7RA 4OJYA 4C7GA 1XGZA 3CUFA 1UQYA 4P8UA 1B90A 2FDMA 5DEZA 4PMVA 1KGXA 4W5ZA 5DMYA 1QI2A 4W7VA 4EKJA 3N04A 4AZ5A 3QHNA 3WD2A 1E6XM 2WMHA 2VJXA 4GZIA 3MKKA 1BSIA 4GI9A 3SCSA 2J77A 4PTWA 2DT2A 1BGAA 3CZ8A 1E73M 2J79A 4Y7EA 3AOFA 1G0CA 2QPSA 3W25A 1QI5A 2VI0A 1E70M 3GTNA 3SUSA 1JZ3A 1XSJA 5I24A 4ATDA 1QPKA 5BROA 4Z2HA 4XX6A 1JI1A 2BS9A 5E6ZA 3G6MA 1E55A 3VX1A 2DIEA 1CTNA 1HJXA 4U33A 2D3NA 2YDRA 3T0DA 4E4PA 2YDQA 3UETA 4R5EA 1D3CA 2X8RA 3VPLA 5EFFA 3WDIA 4IM4A 1QI4A 1GOIA 3FXYA 3GXIA 3EDEA 1SYTA 4HMEA 1XSIA 5A6KA 4UQ9A 1HKIA 4HOWA 5A6MA 3TP4A 3WH5A 4NI3A 3JUGA 4P7NA 2GDUA 1I75A 4JKLA 1H11A 1IZJA 1QW9A 3CUJA 1YHTA 2DSVA 3K8LA 1C90A 3WL1A 1CNVA 4TVDA 2YA0A 3WMSA 4GKLA 4UQCA 1CBGA 5A94A 2BHYA 1OINA 1Z32X 1OCQA 1J18A 2D1ZA 1H41A 5A6BA 1UR2A 2ZOXA 2W66A 5DO8A 1HNYA 3ARPA 2XVGA 5HXMA 1NARA 5FD0A 1JIBA 5CGTA 3N13A 4M80A 4W8LA 1PIFA 4XV0A 5GNZA 4NF7A 1VBUA 1H49A 4PBGA 1KCKA 4AD0A 2EPMX 2PF0A 5F7UA 4B9YA 3N1AA 3VGFA 1NP0A 4JZ5A 3RM4A 5A8MA 4P7QA 1IV8A 3OZOA 3ARRA 1KCLA 2QMJA 3WF1A 1E1EA 1WZLA 1PPIA 4QDMA 5ABGA 3PN8A 4CD7A 4UNIA 3SCVA 4W5UA 3LPFA 2VZOA 1BAGA 4J3WA 1MFVA 2IUZA 2AOSA 2J7FA 4HZ6A 2VNCA 1OIFA 4ZE4A 4B15A 1MFUA 5BXRA 1CYGA 4GQQA 2XVPA 2CKRA 2G3JA 3F5KA 2CITA 3PTKA 4U5KA 1PX3A 3K46A 4KGLA 2WK2A 2W63A 5JIPA 3WH9A 3A4WA 1VFOA 2WHLA 2BXYA 5FIPA 1GZJA 2J7DA 1FOBA 1HJVA 2NT0A 4L4OA 1CLXA 3BMWA 2BY0A 3ALGA 3WF0A 1W2PA 1C93A 1MQQA 1DEDA 2WVVA 1DWFM 1K9TA 3VILA 2YLLA 2WKGA 3AZSA 1HJUA 2YOCA 3W4RA 3O6AA 3B9AA 3N9KA 2X09A 3MUZ1 3WUEA 2VURA 4D6GA 3WQWA 1C8YA 4AYSA 3NSXA 1ZBKA 3PZOA 1WZMA 2Z1KA 4QLJA 1G5AA 3NUKA 5TD4A 5LA2A 1WZAA 3VMOA 3F5JA 3L4XA 3MO4A 2GDVA 4IUGA 1BG9A 5DFAA 3KZSA 4HU8A 4U3AA 2OWWA 1MQRA 3AIEA 4P7LA 1UG6A 1OT2A 3VGBA 4OBRA 4JAWA 3ZJKA 2DEPA 3GNOA 4H8VA 1V0NA 1UZ4A 2FH8A 5D9NA 2XYLA 3T0BA 1GVYA 3FHQA 2WMFA 5JH8A 1UH3A 2JEPA 4Z2GA 3VIMA 3OLGA 1EHNA 3NJ3A 1KXVA 4OZOA 4MJ2A 1SR0A 1MQPA 3O2LA 3AMLA 5M03A 3CO4A 3ZOAA 2CXGA 3AHXA 1R85A 3HU7A 1OBAA 1E1FA 1SMAA 4W86A 4U2ZA 4W7WA 3RMEA 1ZU8A 1E9LA 1KGUA 5M17A 1US3A 2WNWA 1UH4A 2QPUA 1B30A 4WKHA 3ZT7A 2ZUTA 2J47A 3ZR5A 2VX4A 1J0YA 2V3DA 4GI6A 2W4XA 3SCWA 2J8FA 4ZFMA 4UQDA 1GW1A 4PEEA 3PZUA 4ATLA 3CGTA 3MSGA 4KWUA 1WDRA 3AZTA 4CD6A 4M81A 1PAMA 3CTTA 1MW3A 3AMCA 5DT7A 3B8SA 3N11A 5D8WA 3L2MA 2D22A 3WY1A 1QNRA 3QHMA 2WCGA 2Y24A 4CN6A 2DIJA 4UFHA 4PMZA 3GBDA 1GOKA 2CERA 1PX8A 2DT1A 4Z2IA 4K68A 3EDJA 3MANA 3SUTA 6TAAA 2D2OA 5A6AA 2BXZA 3DYMA 2RGLA 3ARUA 2PWGA 4CCDA 2VCBA 3OG2A 1RP8A 2OYKA 4H41A 1QI3A 3CZKA 5JUVA 1HT6A 1JDCA 3BAWA 3QGVA 4EK7A 4Q22A 3VUPA 3ALFA 3PTQA 2BVTA 4PN2A 3CHCA 3W27A 1CGWA 1ZJAA 3PZGA 1P6WA 3AZRA 1DP0A 2XSAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1R7A A;  3T2P A;  4FK9 A;  1U33 A;  2VRK A;  2VL4 A;  1JZ7 A;  2A3E A;  4J3V A;  3M46 A;  4PUD A;  3TA9 A;  2ESC A;  1NP2 A;  1NWU A;  5BRQ A;  3EMZ A;  2X0Y A;  2EPK X;  1MW2 A;  2ZUM A;  3SCR A;  1ZBC A;  2VVN A;  2GJR A;  5E0C A;  1UQZ A;  1WNO A;  1DHK A;  5E70 A;  4WJX A;  5A6B D;  4MNK A;  2E3Z A;  4XZW A;  1ISV A;  2UWF A;  5BWF A;  5D8Z A;  3WSU A;  3MS8 A;  2IXU A;  5A3H A;  1H0G A;  2DQX A;  4D6E A;  2GK1 A;  1MXD A;  2X2Y A;  1X1N A;  2JAL A;  4EAN A;  1JFX A;  3W6L A;  1GHS A;  1R86 A;  4HTY A;  1XCW A;  4J3U A;  4RE2 A;  3L4U A;  2WCS A;  4GZE A;  4XB3 A;  1U2Y A;  1K9F A;  2F8Q A;  1MWO A;  2G3I A;  3ZT6 A;  1KBK A;  1NQ6 A;  3OB8 A;  3A3H A;  2BFG A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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