4WK9A

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain in complex with chitobiose (0.3mm) at 1.10 a resolution
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
369
structure length
368
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTENDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitotriosidase-1
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 132
structure length 368
sequence length 369
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wk9A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wk9A01
3WQ5A 3BXWA 1CGVA 3EDFA 2WVTA 4UTFA 2PBGA 1K9FA 2F8QA 1I1WA 2J78A 2ESCA 2VX5A 2VVSA 1JD7A 1E6ZA 1KBKA 4ZXLA 1GZJA 3ARQA 5CPSA 3ZQ9A 3CHDA 1PJ9A 1CIUA 1CYGA 3VMOA 4EAMA 1UQZA 4JFTA 1W9UA 3FY1A 2VO5A 3VD7A 3WNOA 3VKKA 1XH1A 3VNZA 5JH8A 2VQUA 3LPFA 2J25A 1KB3A 3PZGA 1WZAA 4YPJA 4MDOA 4KH2A 4U5IA 2VX6A 3ARVA 1EDTA 5D9OA 2WK2A 3BAWA 1TFVA 3TOPA 6CGTA 1V3MA 2J77A 4CD7A 2X05A 2JALA 3AMDA 4ZENA 3DECA 2VT0A 1I75A 2C8NA 2WMHA 2E9LA 4J28A 3F4VA 4C7GA 3N1AA 1QVBA 4UNIA 4BQ2A 1OD0A 2YA1A 5FOOA 1E5JA 1I1XA 3BLKA 4TVUA 5HNNA 4QCEA 1NOUA 1H4PA 1J0JA 3SCQA 1QI3A 2VRKA 2W92A 1QI0A 1UD3A 1EOKA 4XZWA 2GVYA 1UD2A 1GOIA 1KFWA 2E8YA 3WELA 4AZGA 4DWSB 2NT1A 3VMPA 1W1TA 4Z2JA 3VDCA 3AIQA 3K4AA 3WF4A 3RM8A 1XD0A 2HVMA 2DT3A 3ZM8A 3WDPP 3BAYA 4JAWA 1FP9A 1QHPA 1VJSA 4M82A 1DWIM 2VX7A 1HT6A 1K6AA 1FH8A 4JKMA 2DSWA 3AYSA 5HBFA 1E56A 2WCAA 1UWRA 4QFUA 1NOFA 3L4WA 1J18A 5A2AA 2EPNA 3ARPA 3W28A 2XIBA 1KXHA 3SUTA 1CLVA 1VEPA 2GDUA 3VGBA 1R7OA 3MV11 4J27A 4CN6A 1A47A 1B1YA 5D9MA 5JBEA 3BCDA 4HOXA 3IK2A 3WQ6A 5A6BA 4Q22A 3NSXA 1D7FA 3RMEA 3ZR6A 1V3LA 3MUZ1 4AIEA 1X6LA 3T08A 1B3YA 2Z1KA 3WN6A 3HMCA 4UOJA 4DWSD 1GVYA 4PMRA 3VIPA 3OLDA 1UD8A 3CH9A 1ZBVA 1BFNA 2FH8A 4DM1A 5CJ5A 1J12A 3EYPA 3UG5A 1IT0A 3MS8A 1HX0A 2CEQA 4TTGA 3IAPA 1HL8A 4P7LA 1JZ4A 2CBJA 1V0KA 2DQXA 2WANA 4RE2A 2A3CA 2RGLA 5CPQA 3WNNA 1E43A 5DT5A 5A69A 3RM9A 4MPKA 2Y8KA 4CVUA 2JEQA 1ZS2A 2XFYA 2FHBA 6TAAA 3N13A 2CERA 2WHKA 3PZIA 4R5EA 2WKGA 3K1DA 1OWQA 3SUSA 4OJYA 4WJXA 3LMYA 4AWEA 1P6WA 1JL8A 2GJRA 1ITXA 1WE5A 2OLHA 4W84A 2YL8A 4PEEA 1UKTA 3NUKA 1VF8A 1NARA 2G41A 1JZ5A 3ZT5A 5EFFA 4QP0A 5I78A 1US3A 1ZU8A 3WD3A 4R27A 4W86A 2O9RA 3TTQA 2PWGA 5E0FA 3VIOA 3AZSA 3OB8A 3N12A 3ZMRA 2DEPA 2YDRA 5A8NA 2OWWA 4OOUA 3W25A 1OIFA 4QDMA 1W2VA 4OBSA 4B16A 2D0FA 3M6DA 2VR4A 4OBRA 2FH6A 1W1VA 3B9EA 5E70A 3AISA 1UUQA 3PHAA 5FL0A 4E2OA 4AD1A 5E9AA 3W53A 3VVGA 1MW0A 2XWEA 3EBVA 4X0NA 3WF0A 2Q8XA 1W91A 3OLEA 3OGVA 2JIWA 5E6YA 3ZT6A 3VIHA 2YBUA 1VBUA 5DFAA 1V03A 2VCCA 1G5AA 1XYZA 1WO2A 3WH7A 1HJSA 4W93A 4U2YA 4V28A 2ZE0A 4PSPA 2B31A 1JYNA 5ABFA 1MQQA 3WBAA 1L8NA 3J7HA 4W7UA 1UH4A 5FL1A 3MSDA 4IUGA 5I5RA 4H41A 3UR8A 1WZKA 2ZX9A 4ATWA 2CHNA 1CENA 3MO4A 1PX8A 1HJUA 1KXVA 3OIHA 2FDMA 3CUFA 2DGAA 4J3VA 2DSKA 1KBBA 1VRXA 3I3DA 1UKOA 3WDRA 1E3ZA 1CXEA 3VTRA 1EO7A 1JZ3A 2NT0A 2WMIA 2VC9A 3OGRA 4J3WA 5BWFA 4D1JA 4A3YA 2BY2A 2J75A 4J7RA 1PZ3A 1OBAA 2UY3A 3WSUA 1UR1A 3AS0A 3MUAA 5TD4A 2OWCA 1GCYA 1WAWA 4MB1A 4CU7A 4U5KA 6A3HA 3AXHA 5A6AA 2RGMA 1HL9A 1LQ0A 1RH9A 3GDBA 2CBUA 1CEOA 3WD0A 1OGBA 3WF1A 2HISA 4TTUA 3FAXA 2PI6A 1CWYA 5GQBA 1AVAA 2XWDA 3D5HA 5A95A 2XM1A 2EPMX 3M46A 4AC1X 4ZEPA 1H0GA 4MAVA 4WSKA 3AS1A 2DPEA 5A8PA 4HTYA 5GPRA 3AZTA 5LA0A 2FHFA 1MYRA 1F4HA 2D24A 1J11A 1VBRA 1V6WA 3DYMA 1E73M 4RL3A 1E1FA 4NRSA 1GNXA 3RILA 2VQTA 2CKSA 5BXSA 4AZ5A 4WKFA 4XZBA 5M3WA 1LF1A 4C7DA 3N17A 1JGIA 2XFFA 1BQCA 2WWDA 2G3MA 4GZIA 3W6LA 4P7RA 1KWGA 3O6AA 1TVNA 1V02A 1W9XA 3PZUA 3DC0A 1SR0A 5HDRA 2D22A 3IJ9A 4PTWA 1UR9A 3QR3A 2PWHA 1VFFA 3L2MA 2VUYA 3THDA 1KXQA 1PZ2A 4JIEA 3VUPA 2CNCA 1GPFA 3WH8A 5BRQA 3ZJ8A 3BC9A 3KWXA 2X2YA 1HJVA 2BVYA 2V3GA 5M5DA 4QLKA 1OINA 2G8ZA 1B2YA 4IM4A 3N9KA 1JZ7A 1VIWA 1IV8A 1GQIA 1UD4A 1KXTA 2FGZA 1LL7A 3AMGA 3KL3A 2AMGA 2WMFA 3NDYA 1HVXA 3WL1A 4UFHA 1XCXA 1GW1A 2YJQA 1C8XA 1DEDA 4XV0A 3VMNA 2GFTA 3SCVA 1Z32X 1TA3B 4KWUA 3SCRA 1QBBA 1MFVA 1R8LA 4BCEA 3EMQA 1E9LA 1E0XA 1RP9A 1LL4A 4HMCA 3SCNA 3W0KA 2BS9A 5BXRA 1WZLA 2BV9A 2PWEA 5D9NA 1BPLB 3BLPX 3W38A 2EXOA 4PBGA 5A6SA 1VFOA 1C7SA 5E6ZA 4P7OA 1J0ZA 5BXPA 3NSMA 3UERA 2CYGA 4AEEA 3EDKA 4U31A 4W8LA 1VEOA 4NRRA 3S2CA 3TTSA 3VGDA 1OM0A 1KCLA 3ARZA 1WDRA 3U7VA 4RE4A 2VX4A 3CZGA 1K9DA 4KRUA 4M29A 5CLWA 3AMCA 2DT1A 3UG3A 4OKDA 1WKYA 4NF7A 3KE0A 2V5CA 3A6OA 4BA0A 2OSWA 3OBAA 3U7BA 1CDGA 1R7AA 1V6YA 4LYQA 1U30A 1JIBA 2X09A 1US2A 3VGEA 1JFXA 3TP4A 2BHUA 3CUIA 1E6XM 4P8UA 4AZCA 4F66A 5KZ6A 2AOSA 4ZXOA 3SUWA 4HMEA 4UQCA 2VVNA 3A4AA 2WLZA 2DH3A 4LX4A 1OGGA 1CXFA 4AD3A 4OUEA 1M53A 1V0LA 1TMQA 3FN9A 3WQ4A 4GPNA 2WVSA 3W29A 4ATLA 4BS0A 1ISWA 3VDHA 2IXUA 4W7WA 1JG9A 3CPUA 1C8YA 4FMVA 4FF5A 1HP5A 4PTXA 1UWUA 2EPKX 2VZTA 3CMGA 4ATDA 2XSBA 1B9ZA 4WIWA 1XRVA 4WSJA 2WC7A 2CPUA 2WC3A 3WD2A 1C90A 2D3NA 1CLXA 5DEZA 5A8OA 3I3BA 4CKQA 1LWJA 1PX4A 4JHOA 2V3DA 2YL5A 4F79A 1NWRA 2AAAA 1E0VA 3GH7A 1E5NA 4PMOA 4P7NA 1BHGA 4PMDA 2ZX5A 2ZUVA 3SCOA 1FA2A 3FNDA 3UETA 4V27A 1BGGA 4MJ2A 4AISA 1EQPA 1H1NA 4UQBA 2GSJA 4HU8A 3BAXA 2XSAA 3CHCA 3CZ8A 1J0KA 1NWUA 5I3DA 4XB3A 2JF6A 3T0BA 3SCTA 4B3KA 2CXGA 2EPOA 2WM0A 5DT7A 2W67A 3VIFA 4EANA 1JFHA 3G6LA 1SFSA 3A3HA 2D2OA 3G6MA 2OYKA 1V6XA 1XSJA 1XD1A 1IZJA 1JAKA 4M81A 1CBGA 1JF5A 4BQ5A 1EO5A 2X0HA 1BSIA 4H8VA 2YIHA 4LXFA 1V6VA 1C91A 1MW1A 3AIVA 3UEQA 4TX6A 2VI0A 2IXVA 1EXPA 4P8WA 3FXYA 3ALFA 2QF8A 2V38A 2XTKA 3AOFA 1VENA 4TVDA 2ZXQA 3CUHA 1OD8A 1V3HA 4J3XA 2ZWZA 1BVNP 4OIFA 4GIAA 4HA3A 3WUBA 2ZUMA 2JFEX 1B3VA 1J10A 1M01A 4IISA 1TCMA 4MB3A 2BY0A 3F5KA 1GHSA 3MANA 1QW8A 3VGGA 4YHGA 1LG1A 3U5YA 4LYRA 4FLQA 5AYIA 4AD5A 3AQUA 1QW9A 3QHMA 1W2PA 1MVYA 1OIMA 4CD5A 2VL4A 2PWFA 1U33A 3BMWA 3WUGA 1QNRA 2WYSA 4PN2A 3ZJ6A 3K8KA 4MJ4A 4L4PA 4H04A 5ABEA 1ZBCA 5M17A 4AZBA 3L4TA 1ISXA 4D1IA 5A6BD 2ZWYA 4LPCA 3EDDA 1QOXA 4WF7A 1GOQA 1HXJA 3T2OA 2J7EA 1HJWA 4W85A 1XHGA 2WWCA 4JFWA 1W9DM 3W6MA 1DWJM 2WXDM 1RPKA 1NQ6A 3AS3A 3ZOAA 1HJQA 2V3EA 3LPGA 2XVGA 1GOMA 2EBNA 4A3HA 3AMKA 1HJXA 1VAHA 5DO8A 1CPUA 4A4AA 1GQLA 2XVPA 1GOKA 4GQQA 5A2CA 3WEZA 4QLLA 3SCPA 4MNMA 1QI2A 2W62A 2J4GA 2QV4A 1V3KA 3GNRA 1E55A 1NP2A 1ODUA 3OZOA 1QNOA 2D0HA 4BQ3A 4Q7NA 2BFGA 3T2PA 2YL9A 4CCEA 1DTUA 4CU8A 5FKYA 4D6EA 1UZ1A 3KL5A 3AYRA 5IDIA 4K68A 2D20A 3VIGA 2X8RA 1LJYA 5AC5A 5IHSA 3KEHA 2Y2WA 1GQJA 5LYRA 4MNKA 1QNPA 1VFUA 5ABFB 4ZE5A 3VM5A 4WKHA 2QLYA 5E09A 3SUVA 2X1IA 1KR1A 3SUUA 1AQHA 1AMYA 4WK9A 1UA3A 2CCRA 3QHNA 3WNPA 4AIOA 3TA9A 4GO8A 1J0IA 1CXLA 1GJWA 4CD6A 4MNJA 4W5UA 1CECA 3A47A 4MDPA 4AZ6A 3VIJA 1E4IA 1VJZA 3TTOA 3HJEA 2V5DA 3T09A 3AHZA 1UWTA 1JNDA 1JXKA 3PZOA 4UFJA 3PZMA 2WMIB 3B9AA 3AXXA 2ZIDA 1QHOA 1LWHA 3AIUA 1KGXA 3SIMA 1JYVA 3CHFA 3SCUA 1G1YA 1W3JA 4JCMA 4PCSA 2J47A 5HOSA 5M03A 3ZO9A 4B9YA 2ZXDA 3AIRA 4H8UA 5A8QA 4NSBA 5EB8A 4BF7A 3OGSA 1FHDA 5GNXA 3VNYA 4Z2KA 2YKKA 4CD4A 1KGUA 4ACYA 3W26A 3T0AA 3CHEA 2VJXA 4DUXA 2XYLA 4YHEA 3APGA 3FW6A 1VFMA 1C8QA 1R85A 2WHLA 1BYCA 5A3HA 1BG4A 1C7TA 1EIBA 1EH9A 3QOKA 4DM2A 3POCA 4TX8A 2C0HA 2QMKA 4PSRA 1LG2A 4D6DA 1WCGA 2BXYA 1JI2A 4F9JA 3IJ7A 2QPSA 5I0DA 1G9HA 1H5VA 1Q4NX 2ZUWA 1EA9C 1JD9A 4EE9A 3ARXA 3WNMA 4GO9A 3K8MA 1G01A 2UY5A 1EHAA 1E6PA 2XIIA 2XJ7A 2XM2A 3AIWA 2PWDA 3U5UA 3AFBA 1VEMA 4MTVA 1CGXA 2VZVA 4KGJA 7A3HA 2VTFA 2CETA 5D8ZA 2DT0A 1A3HA 1UKQA 4CCDA 1AQMA 3WNLA 2WB5A 2W4XA 4IPLA 3LPPA 1QI5A 4M56A 1SMAA 4AXNA 1JXJA 3N18A 4KGLA 4B3LA 1FOBA 1GJUA 1W9PA 3CBWA 3UG4A 1UQYA 2GDVA 3ZT7A 1E71M 1OT1A 3VD9A 3OZPA 2DSZA 1HVQA 5A2BA 4LYPA 5CGMA 1QPKA 1HNYA 1D3CA 1NP0A 3ZJ7A 4DWSC 1ITCA 2YLAA 1ISZA 3F5LA 1UR4A 4TOQA 3K8LA 3MUIA 3WD4A 1PEZA 1R86A 4WKAA 2BXZA 1DWHM 4KRTA 2FHCA 3BSHA 4D6FA 5I79A 1WPCA 2EJ1A 1H0IA 1CXKA 3BGAA 2E9MA 1C3FA 3NJ3A 3GXIA 4UCFA 1EHNA 2GJXA 3OA5A 1PX3A 2BVDA 2YA0A 2ZX7A 2OYLA 2BY1A 1SYTA 1MW2A 4UFIA 2JEPA 4PYSA 1QNSA 1W1PA 3FAWA 1WP6A 5JBDA 4DUVA 3CO4A 1B3ZA 3E1F1 4CVWA 2CBVA 1DWAM 4NI3A 1XSIA 2VRQA 2WVVA 3BAIA 2A3HA 1LLOA 3WBEA 3CTTA 3QHOA 4JL2A 3WL0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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 1KWK A;  1W3H A;  4L4O A;  5A8M A;  1UH3 A;  1JZ2 A;  4D6H A;  2VZS A;  1YQ2 A;  2UY2 A;  3CUG A;  1ZJB A;  4B9Z A;  4D6G A;  4J3U A;  3EDE A;  3GH4 A;  2W5F A;  1O7A A;  4HU0 A;  3T0D A;  2EPL X;  1JYW A;  2A3A A;  2BHY A;  3WD1 A;  3CZJ A;  3WH9 A;  2V3F A;  3A4X A;  3OG2 A;  4PMN A;  4PMZ A;  4C7F A;  1M7X A;  2GJP A;  5LA1 A;  4D6I A;  1ZL1 A;  2ZUN A;  1FH9 A;  4JFS A;  2WZE A;  3HN3 A;  1UWQ A;  4N42 A;  3GXD A;  1EGZ A;  2WMG A;  3WMC A;  3MMW A;  4LGX A;  4UQ9 A;  1TA3 A;  5CQ1 A;  1HN1 A;  4Z2H A;  4JCL A;  2J79 A;  5BRP A;  3VX1 A;  1Q6G A;  1J9Y A;  4GI6 A;  1BGA A;  1XGZ A;  3CMJ A;  4QCF A;  1QBA A;  1CNV A;  1QI4 A;  4E8D A;  5IXE A;  2WKL A;  1UR0 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5AHF A;  5G1Y A;  4TU1 A;  3VKB A;  1RAK A;  4MYX A;  2ZUN A;  4JFS A;  3CHV A;  1Y0O A;  4NL1 A;  1WXY A;  3BW4 A;  4RZ5 A;  3GXD A;  2Z2B A;  4UQ9 A;  1P43 A;  1HN1 A;  1ZSX A;  4B92 A;  4K38 A;  3SFK A;  3P82 A;  2J79 A;  1LOQ A;  2F2K A;  3TYD A;  1XIM A;  1XYA A;  5HNR A;  1Q6G A;  4E3V A;  3E0F A;  1J9Y A;  4WQ6 A;  4GI6 A;  4QCF A;  4E8D A;  2WKL A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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