4DWSA

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
543
structure length
526
Chain Sequence
GAVPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEKIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADETIDMGPLYNPGEIYLSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
molecule keywords Chi2
total genus 186
structure length 526
sequence length 543
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsA02
3RILA 3AXXA 4H8VA 2FGLA 1TR1A 2ZUSA 4HP5A 2WHMA 6CGTA 4LX4A 4FLSA 3JUGA 3U5YA 1IT0A 1X1NA 1PBGA 1AQMA 1VFFA 1ZBWA 4Z2LA 5E0CA 1JZ7A 1MYRA 1MW2A 2G3IA 1TUXA 3OA5A 4LYQA 2V3DA 5BXTA 4BCEA 4M1RA 1HJVA 1UYQA 1NWSA 3MKKA 1K9TA 2BFGA 2CCRA 2X0YA 3L4TA 3II1A 3A6OA 4DWSC 5CPQA 2YOCA 3PBGA 2VUYA 3SUSA 3VIJA 1BYAA 3GYCA 2WK2A 1GOOA 3MANA 3K8MA 1VRXA 1ZBCA 2WHLA 3UG4A 1GORA 3FXYA 4W8AA 3PZMA 1OB0A 4A3HA 2DT0A 2VCCA 1OD0A 4EE9A 4Y7EA 3GNPA 4JIEA 3L4UA 1GOMA 2VQTA 2EPKX 4Z2JA 3F5JA 2XYLA 4E8DA 2W62A 1GONA 4ZE5A 1JNEA 2YDQA 2X1IA 1JAKA 1C7SA 1Q6DA 4JKLA 4B16A 1VEPA 1QHZA 3M46A 2CEQA 2WVSA 2DH2A 4CKQA 3UR7A 2VZVA 2AAAA 1N82A 1V02A 4U31A 4U3CA 3CHFA 1GW1A 3T2OA 2TAAA 1V3KA 1CGYA 2JEPA 1W9DM 1JZ8A 5IXEA 4AZCA 2ZUTA 1OIMA 1D3CA 4PMQA 6TAAA 4M81A 3VX0A 2ZXBA 3OLIA 3WELA 1BF2A 2WAGA 3ZR5A 4KWUA 5LYRA 4FLQA 3VIHA 4L4OA 4V2XA 3BMWA 3L4YA 4H41A 2CHNA 2GJRA 4CD4A 2A3HA 1XH0A 5FIPA 3VIOA 1NARA 4PMRA 4AD3A 5CPTA 1EA9C 1DHKA 4HMEA 3W82A 1ODUA 3O9NA 5AY7A 2PB1A 1ITXA 1H0GA 1FP9A 2YA2A 1C90A 3VIKA 5CXPA 2ZUMA 4D6CA 5DT5A 3CHCA 1P6WA 5CGTA 1ZJBA 2W67A 1XGZA 4V27A 1U30A 3B9EA 1FFQA 4KMQA 4HMCA 2J74A 3AMKA 3ZT7A 3T0DA 1E4NA 2O9RA 4AD2A 4PCTA 1RH9A 3N18A 3RPMA 4BQ4A 3CUIA 2ZIDA 1KCLA 3ARVA 2ZE0A 1UOKA 3AIVA 1RP8A 2YA1A 3GM8A 4ZEPA 5BYWA 1R86A 5A1AA 1MW0A 3U5UA 2PWHA 1WB0A 5FOOA 1MW3A 1KBBA 2EO7A 2ZUWA 4CVUA 4H8UA 1CGVA 5HPOA 1HF6A 1XCWA 2OYMA 4L4PA 3WBAA 4UFHA 1GOWA 3N17A 3SCNA 4LYRA 4NRRA 3CZGA 3OLEA 2XWDA 3VIIA 1ISWA 1HKJA 1OCQA 3I3DA 2F8QA 4WIWA 1NWUA 1HIZA 2WCSA 3WH6A 2OSWA 1J0IA 1HT6A 2YKKA 3CUGA 3MUIA 1XSJA 1KQZA 1J10A 2XVGA 4W7WA 3A3HA 3OZPA 2OWWA 3WEMA 2BXYA 3EDDA 4ML4A 1RP9A 5CPSA 2ESCA 4TXEA 4DUWA 2XVPA 4FLOA 2X8RA 1BYCA 3CTTA 1FHLA 4OIFA 5BRQA 3VUPA 3OGVA 3KL5A 2BS9A 5BROA 3WDHA 3PZIA 3CBWA 1W3JA 2J7CA 4F79A 4P7NA 3EMCA 1C8QA 3GNRA 5HNNA 5CG0A 2GK1B 4AWEA 2W4XA 3ZT5A 2V5DA 4MJ4A 1KQYA 1XC6A 1CGXA 3KE0A 1UR0A 3MMWA 5ABGA 3VMPA 4OUEA 3WFLA 2DT3A 4CUCA 2J8GA 3WQ4A 3BAJA 3ZJKA 5E6YA 2BXZA 4KH2A 4J3WA 2O92A 2IUZA 2PF0A 5DFAA 2W5FA 3DHUA 1UKSA 5JBFA 3NYDA 1KR0A 1QNRA 3U57A 5BRPA 1UWIA 2W92A 3A47A 4JHZA 3BH4A 3WD3A 1JI2A 1PZ3A 5BWFA 1CENA 3W29A 1JZ5A 4AZ6A 5GNZA 7CGTA 3CZ8A 3AROA 2PWDA 3T0BA 3O6AA 1UH4A 1NP0A 4NZCA 3DC0A 3AIEA 4AIUA 4TTUA 4XUYA 3SCOA 4LXFA 1ZU8A 3W37A 2VOTA 1EH9A 3ECQA 1JG9A 2YL9A 1M53A 3VGDA 1UA7A 3GBDA 1W91A 3F4VA 4OZOA 3OZOA 1WO2A 1LLOA 3ARUA 3N04A 5DF0A 4PMUA 1J0HA 3ZR6A 4YHGA 3QOMA 2QPUA 3GH4A 3VGFA 1KXVA 1GHSA 4UOJA 1ZBKA 4ACZB 4HU0A 3B8SA 2WKLA 3QHNA 4UFIA 1UD3A 3T2PA 1JFXA 1W2VA 1L8NA 1OT2A 1UH3A 2G3NA 4P7OA 4YN5A 2D1ZA 1J0ZA 4BF7A 2VZUA 5ABHA 1XYFA 2E9MA 1E0WA 4GINA 3KL3A 2WHJA 1B30A 4DWSA 1UQYA 4WSKA 3SUTA 3GNOA 1K9EA 2JEQA 5CLTA 1HVXA 2ZX7A 4U5IA 4CCCA 1UA3A 1C93A 2JIEA 3CH9A 2A3AA 2ZXDA 3PTKA 4U2ZA 4UFLA 1I1WA 1TE1A 1JZ4A 1W1PA 4YPJA 3MUAA 2YL5A 3WUBA 2WHKA 2G41A 5AYBA 4TTGA 3WDIA 3ARXA 2J7EA 1J11A 3E1F1 1B3YA 2QHAA 4CD7A 4W85A 4ACYA 2ZXQA 4CD5A 1UZ4A 2W61A 1TA3A 3K46A 1HKKA 4Z2HA 2XSBA 4JKKA 3N15A 1XSIA 4CN6A 1ITCA 1LF1A 3POHA 4QCFA 4UR9A 3VDCA 1F4HA 1HX0A 4HOWA 3HMCA 3WDJA 2CESA 3T2QA 4B3KA 1HP5A 3AHXA 3L4VA 1MXDA 2OYLA 2PBOA 4AZBA 2CYGA 2F2HA 2JF7A 2X2YA 3M7SA 1QI4A 5HDRA 1WZMA 2J7HA 5BXSA 1BYBA 2CBVA 3CPUA 1R7AA 2UY5A 3O2LA 2XFRA 4AIOA 4CN4A 1O7AA 1W9BM 4D6GA 4W87A 4M29A 4H2CA 1CGUA 1E72M 3ZSSA 3PZOA 1PIGA 2CBUA 1PPIA 1UH2A 1WAWA 4J3TA 1M01A 3HN3A 4WLCA 3RDKA 4E2OA 3VPLA 3NSMA 3WQ6A 4UNIA 1V03A 1XH2A 3FHQA 4JCLA 1R85A 1QPKA 4QLLA 1CXFA 4ATDA 5I24A 3VMNA 4QP0A 2DT1A 4PMNA 4WF7A 3QHOA 3U7VA 3MUY1 1CXIA 3VOCA 2DSWA 1QW9A 1JYVA 3ZSTA 5HPCA 4XZBA 1VIWA 1BGAA 2JF6A 2PWGA 1KWGA 2EQDA 2GDVA 2WMHA 4ATLA 5IHSA 1JD9A 3CUHA 1HJWA 4AXNA 4RL3A 4UQEA 4D6JA 3ARTA 5GQBA 3PZ9A 3SEPA 1BGGA 1KXTA 1B31A 4V28A 5JIPA 3VGBA 2WMIA 3SUVA 1YHTA 1QI0A 4DM1A 5I5RA 3SCQA 4GZIA 2NT1A 4C7FA 2VZOA 2VRQA 3CIVA 3VINA 4J3VA 2XJ7A 3NUKA 4MB5A 3AMGA 4Z2IA 3WNLA 1GQLA 1WDPA 4LPCA 1GJUA 1E6RA 3VD9A 2QLYA 2NSXA 1J01A 1WDRA 1Q6GA 2FGZA 1G01A 1B3WA 3ZJ6A 3VDBA 1E40A 4CCEA 3W53A 1QBAA 2V3FA 1Y7VA 1V3LA 1QVBA 1Z32X 3WNOA 2YBUA 3L4WA 2WMKA 1UD8A 1PJ9A 2EJ1A 1ZL1A 3FN9A 7A3HA 1JAEA 4U5KA 2DEPA 4DM2A 3VTRA 2BY2A 1LWJA 1TCMA 2Q8XA 3WENA 5GPRA 1C7TA 2EXOA 3DYOA 1UKQA 5JUVA 2XG9A 2J7BA 1PIFA 5DMYA 1UWUA 1H09A 4M80A 1LL4A 5AC4A 4HOXA 1CZ1A 2WVVA 1GVIA 1CLXA 3AYRA 1OM0A 2X09A 1FHDA 2XM1A 1NWTA 1GQJA 2BVYA 4M56A 1UD5A 1M04A 3ALGA 1B0IA 3VVGA 2XIIA 3OLGA 4DUXA 4P7QA 1NH6A 3VDAA 5C71A 2ZX9A 1W32A 3W26A 2C8NA 3UESA 2WZHA 1WE5A 4CU6A 4JKMA 2E4TA 3WD4A 1GQIA 1SMAA 5FL1A 4F9JA 1UR8A 1SFSA 2WWCA 1E55A 2CHOA 3AMLA 1H1NA 4OJYA 1HKMA 1PAMA 3TTYA 2QMKA 3WH9A 4U3AA 1ISZA 1ZJAA 5A6AA 1CPUA 2WMFA 1UKOA 2XM2A 2WSKA 5D9OA 1W3KA 2V3EA 1MQQA 1HJSA 1VFUA 2XPKA 3KEHA 2VI0A 3MU7A 4UCFA 1RD6A 2VR4A 1OGGA 1HXJA 2YLLA 1XD0A 2ZOXA 1C3FA 2X05A 1BTCA 4HPGA 1UHVA 2PI6A 3PZTA 1JGIA 6A3HA 4EANA 1W1YA 2V5CA 2BV9A 3WH8A 2QPSA 4PSRA 4PSPA 4EAMA 1DWIM 1MQPA 3GH5A 1M7XA 1XD1A 4AC1X 2VX6A 3TONA 2J62A 3VM5A 1J0JA 2VMFA 1JDAA 3CMGA 1LL7A 1CYGA 3BCDA 4QFUA 3CMJA 2JE8A 2VZSA 1LJYA 4TOQA 2BVDA 3W25A 4S3KA 1EQPA 3AZRA 1UUQA 1WPCA 4FMVA 3OBAA 1V0LA 2CIPA 1DWGM 4TVCA 1QI2A 1GZJA 1MXGA 1V08A 3VM7A 4AZ5A 4F8XA 2PC8A 2J77A 1HP4A 3CGTA 2EPOA 2CITA 4PMVA 1E4IA 3AS3A 4GO9A 1HVQA 2OSXA 3EMQA 3WBEA 4UTFA 3WD0A 2GJPA 3GXMA 3D3AA 2E9BA 3VU2A 3ARWA 4HTYA 4B3LA 3VD7A 1JYNA 3AZSA 5EB8A 3WQWA 1HJQA 1BPLB 2WXDM 4P8VA 3A4WA 1VFOA 1CECA 2OWCA 1H11A 2V38A 3BLPX 4Q7NA 2WNWA 1E15A 2GFTA 4HZ7A 2VNCA 2Y8VA 1W9XA 4N42A 1EDTA 1XHGA 4TX8A 1CXLA 3AZTA 2CERA 1JNDA 3IAQA 4HA3A 1S46A 3NSNA 5HOSA 1RPKA 2CNCA 3WF0A 3OLDA 1FH8A 3AOFA 1VJSA 4MB4A 3J7HA 1XRVA 3GXIA 1K9FA 1UG6A 3IAPA 4M24A 1V6YA 2D0HA 5C70A 2GJXA 2YIHA 5I6SA 1C8YA 2D20A 3IK2A 3CUFA 3ZQ9A 3VDHA 1JYWA 4TX6A 2J75A 1PX8A 1QOXA 1GHRA 1NOWA 1EDQA 5M17A 5CQ1A 3NIYA 5ECUA 3W6MA 3VD5A 3GZAA 4IPLA 2ZX6A 5EMYA 1KB3A 2WSPA 2FDMA 1H4PA 5CGMA 3AIUA 1ODZA 4PTXA 3RM9A 2QV4A 1I1XA 2G8ZA 2VX4A 1OSEA 1VEMA 4AYSA 1WDQA 5IDIA 4GPNA 2WCGA 3HU7A 4JFVA 3I3BA 3MSDA 1Q6FA 1JYXA 3NSXA 1CWYA 4UQ9A 2WVTA 2J25A 3OIHA 4MDPA 1GNXA 1UD6A 4J27A 2VZTA 1CIUA 3WMSA 3TTSA 2WWDA 3VNYA 1MFVA 1H49A 1VEOA 3LPOA 5FCZA 1V3HA 3WNMA 4MB3A 4P8WA 3T09A 4C7GA 1ISXA 4D72A 2CBJA 3M6DA 2MANA 1B3ZA 1DP0A 1JL8A 2D0FA 1BAGA 2WW5A 4PBGA 3W27A 3WQ5A 2W91A 5A8NA 3SCUA 2VC9A 3MO4A 3LPGA 4YHEA 4BQ3A 3GTNA 2VL4A 3AYSA 4HA4A 1KXQA 4PTVA 4CN1A 4PMDA 3VGHA 4D6DA 1BLIA 4W93A 3TTQA 1HN1A 2WM0A 5A6MA 2DSUA 1LG1A 1DWFM 2VCAA 4UZUA 4D6HA 3L2MA 3LPFA 2VQUA 1UD2A 3SUWA 2E3ZA 2VTFA 1JZ2A 1JD7A 3BAIA 1D7FA 1UWRA 5ABFB 3WIJA 1EOMA 5DT7A 2FHFA 1HJUA 3EDKA 3BSHA 5BCAA 3AI0A 1R7OA 4RE4A 2XGIA 1JDCA 4XZWA 5LA0A 2JIWA 3L4ZA 3B9DA 1JF6A 4OKDA 3VIFA 1CXEA 1H2JA 3SCPA 3PTQA 1U33A 3VKKA 4GQRA 3RJXA 1BVZA 3DYPA 3KZSA 3THDA 4E4PA 2GDUA 4CD8A 5A2CA 3WQ8A 4MNKA 3W81A 3N11A 1VFMA 4C7DA 1W3HA 3WEOA 3EYPA 2C7FA 2YJQA 4JFTA 2WC7A 2AMGA 2XSAA 1MVYA 4ZE4A 1TZ7A 4PTMA 1J0KA 3NJ3A 1ZS2A 3MV11 2X0HA 5E9AA 1E4LA 2ZICA 3SCVA 3FHAA 3OB8A 3WQVA 2DSKA 2BY0A 5D9PA 3ARRA 2EEXA 3QHMA 2DSVA 3UG3A 1F4AA 2E8ZA 4D71A 3K4AA 2WB5A 5FL0A 5GNYA 5A94A 1CGTA 1AQHA 4M8UA 3MUZ1 3W38A 1ECEA 1UR1A 1SR0A 3PZVA 4P8UA 4MPKA 4F66A 2BY1A 3BAKA 1Q4NX 3GBEA 4HA1A 1K9DA 2GUYA 2BHUA 3W0KA 1QNPA 4U33A 3WMCA 2YL8A 4UQCA 3S2CA 3BC9A 5D8ZA 5LA1A 4J3XA 1LQ0A 3AHTA 5KEZA 4ZXLA 2VX5A 1CGWA 4OBSA 2D0GA 3PZNA 2YLAA 2J4GA 3VMOA 2D2OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RIL A;  3AXX A;  3UWV A;  2PN0 A;  4LUS B;  3IS4 A;  1EPX A;  1WQ5 A;  1QAS A;  3TVA A;  4FLS A;  4JNZ A;  3UWW A;  1IT0 A;  1X1N A;  3L68 A;  5F4W A;  1AQM A;  4L6H A;  3S83 A;  4H9M A;  2QAP A;  5LNW A;  4ZB2 A;  3TWB A;  4FA3 A;  4PH6 A;  3PTD A;  3OA5 A;  3GU1 A;  4MJM A;  1GKP A;  5BXT A;  3GD6 A;  1FKD A;  1Q6I A;  4BKN A;  4RDV A;  1HJV A;  5D75 A;  3A22 A;  1TIM A;  1WXY A;  3T81 A;  3V5O A;  4GC3 A;  4X60 A;  3L4T A;  5CPQ A;  5GPG A;  4GUF A;  1KFB A;  2B0M A;  3BDK A;  2YOC A;  3PBG A;  1IQ8 A;  3VIJ A;  3RFA A;  3EB2 A;  3SBF A;  3UG4 A;  4W8A A;  2HPM A;  4BI5 A;  2BGQ A;  4A3H A;  4PC8 A;  3VNM A;  1OD0 A;  3BAN A;  3CAV A;  4PRT A;  1XF0 A;  2TOD A;  2VQT A;  4WXZ A;  2EPK X;  4Z2J A;  2DP3 A;  4DN1 A;  4YTT A;  1JNE A;  4GJI A;  2BVW A;  2X1I A;  1JAK A;  3W7P A;  1C7S A;  3B0P A;  4ZR8 A;  4IIF A;  2ALD A;  3M46 A;  2CEQ A;  4DJD C;  3IHZ A;  4S3D A;  3EPN A;  4C6F A;  5BU6 A;  1YE4 A;  3NM3 A;  4QM1 A;  1O5Q A;  3HQN A;  2Y85 A;  4U31 A;  3GX9 A;  2PC4 A;  5F2G A;  2FMN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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