4DWSA

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
543
structure length
526
Chain Sequence
GAVPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEKIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADETIDMGPLYNPGEIYLSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 186
structure length 526
sequence length 543
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsA02
4AZ6A 1X1NA 4JCMA 2W61A 3AJ7A 2BXZA 4AXNA 3THDA 2GFTA 4P8UA 2QPUA 3KE0A 3SCRA 1ZB5A 4Z2LA 4XZBA 1KR1A 2VO5A 3HMCA 3ZT7A 1UWQA 2NSXA 4AZGA 1AMYA 4S3KA 2GUYA 2DH2A 4ZENA 3T2OA 4RE2A 1UG6A 3OLIA 1UR1A 3OG2A 2GK1B 3VIOA 4KMQA 3TP4A 1GOWA 1CENA 4AIOA 5A2CA 5ECUA 3VINA 5A95A 1XC6A 1JL8A 1MXGA 4QCEA 2WKLA 3QGVA 1LQ0A 2BFGA 1JNEA 2J4GA 5A8MA 1UR4A 1D7FA 4PYSA 3VIHA 2O9OA 4AIEA 1V6XA 4U33A 4LPCA 5AC5A 3WQVA 3LPPA 4GZJA 5I6SA 3GZAA 3GYCA 3L4TA 5E9AA 1UKTA 2E3ZA 3KEHA 1B3WA 4HOWA 3WELA 1UD2A 1XSKA 2VX4A 1UD3A 3U57A 1B30A 2A3EA 1CXIA 4XB3A 1KWKA 5HXMA 1CLVA 4MJ4A 1A47A 4HP5A 4PMUA 4JZ5A 1CGXA 1GQIA 2BV9A 2BVYA 3BAKA 5A8OA 5CPSA 1HIZA 2WLYA 2X0YA 4TXEA 2D0GA 4U3CA 1EOMA 3FHQA 4LX4A 2WZIA 4J3VA 4MDOA 2WHJA 2XVLA 1DTUA 2FGZA 4YHGA 1WPCA 3TTSA 3MMDA 4KRUA 1SMAA 5KEZA 2YL5A 2YBUA 3WD3A 1W1TA 4OIFA 2XIIA 2E8YA 1KCKA 2OYMA 3SCNA 3PHAA 1UWIA 2Z1SA 4UQ9A 2IUZA 5A6MA 1KQZA 1NOFA 1Z32X 3ZT5A 4QCFA 2EPMX 3N9KA 5IHRA 2EPOA 2VR4A 1PIFA 2VZSA 1PX4A 2GJRA 3MSDA 1ODUA 1B31A 3SUTA 1BYDA 4D6JA 3W4RA 1MW2A 2WSPA 2OYKA 4PTXA 4IPNB 2D1ZA 2AAAA 4V28A 3WFLA 1N82A 4CU6A 2Y8KA 3UG4A 2Y8VA 2PBGA 1HKIA 1TCMA 3ALGA 1J0KA 5DF0A 2WBGA 4NRRA 1HJVA 1XCXA 4Z2IA 4A3HA 1J9YA 3HU7A 1JZ2A 2E4TA 3AZTA 2OWWA 1JXJA 5JBEA 1XH1A 3GH7A 4F79A 3NYDA 1WDRA 5FL1A 1BYBA 2WHLA 3EDFA 4F9DA 4H41A 4PRWA 4PUEA 3K46A 4CN1A 3WUFA 3THCA 1R7OA 1HF6A 2VZOA 3AIVA 1D2KA 3NJ3A 3WBAA 3QR3A 1YQ2A 3VIJA 3NSNA 3NSXA 3ARYA 4JCLA 2O9TA 2D3NA 3DYOA 3AI0A 5DFAA 2WBKA 4U2YA 1BGGA 1O7AA 5IDIA 2J77A 2VL4A 1UZ4A 2DSWA 1MYRA 2FH6A 1CLXA 1SR0A 3HJEA 5CPTA 5HBFA 4CD4A 2QV4A 2EJ1A 4AZHA 3WNOA 4D1JA 1V6UA 1E4MM 1NP2A 3UR8A 1ZU8A 3MANA 3APGA 2YIHA 1W3KA 4JIEA 1GOMA 1E4NA 2J8FA 4W89A 4MNMA 2ZXQA 5I5RA 3AIEA 3RPMA 5I79A 1KFWA 1BLIA 3UCQA 4M24A 1G01A 3W0KA 3WUBA 1JZ4A 2NT1A 4QLKA 2WCGA 3VD5A 2J7BA 1E40A 1JXKA 3SUUA 4NF7A 3W26A 3M07A 3VGFA 4C7GA 1BYCA 1B0IA 3W27A 3MV01 3SUVA 2YKKA 1IT0A 5M03A 3O2LA 5A6JA 1J0HA 2DIJA 4QLLA 4CKQA 5A6BA 2G3JA 3AHYA 4J27A 4WIWA 1G1YA 1JI1A 3CIVA 3QOKA 3BLKA 4K68A 1HXJA 4PMQA 1LG2A 2WAGA 1E71M 8CGTA 2ZX8A 5D9OA 1WZMA 5DMYA 4W7WA 5E09A 3PZGA 4CN4A 4HA3A 3MMWA 5DEZA 3AS3A 2A3AA 1VB9A 3FW6A 2WMFA 1UD6A 2J7GA 5BWFA 4HA4A 1MFVA 3SCWA 2UY5A 1PJ9A 3BCDA 3FXYA 4Z2HA 3UETA 3UERA 3CPUA 5CSYA 2V5DA 1EHNA 3DC0A 5JBFA 1E6ZA 3PZNA 4P8XA 1E43A 1OGGA 4ZEPA 2JEQA 1OT2A 1FFQA 2WHKA 4B3LA 1MQPA 2XM1A 1OGSA 4MNKA 2FHBA 1PX3A 3M46A 4D6FA 2PWEA 3JUGA 1F4HA 1UR2A 2XFFA 1E1EA 5BXSA 3GDBA 4DUWA 3WF3A 2BHYA 2PC8A 3CO4A 3CZJA 5IHSA 2F8QA 2VUYA 1W9PA 5M17A 4WF7A 4W86A 5E0FA 4FF5A 1OINA 2ZUVA 3WN6A 2J7EA 1OD8A 3N17A 1VFUA 4PTMA 1KQYA 4HPHA 4HZ6A 4J3XA 4ATDA 4UQBA 3T09A 2CKSA 4CD8A 1QBAA 3A4WA 5FD0A 1H11A 5IXEA 1C8XA 3ZSSA 2XWDA 1JD7A 1HX0A 1JZ8A 3AMKA 4WK9A 3IJ7A 4JFWA 4RE3A 3UG3A 3AXIA 1K9FA 1MW0A 2E40A 2WCSA 3SCSA 3A6OA 1JD9A 3BH4A 2CBIA 4LGXA 3AMGA 2D0HA 3EMCA 3MV11 1BFNA 4J28A 4W8LA 4PMXA 3IJ8A 2G4FA 5FIPA 4W84A 2ZUUA 1V0KA 1JF5A 1FH7A 2ZXAA 2C7FA 3EBVA 1B9ZA 3SCTA 4GIAA 1W9VA 2DT2A 2XUCA 1VBRA 4J3UA 3WDRA 3AS2A 1H0GA 3WD4A 1OIFA 1H1NA 2WVVA 4TVDA 2X0HA 3CZEA 1J0JA 3ZMRA 4W87A 4UOQA 2UWFA 1CWYA 1PX8A 4PMZA 3EMZA 1GPFA 5CJ5A 1CYGA 2GVYA 4JFSA 3ZO9A 5A6KA 1L8NA 3CUJA 2HVMA 1UD8A 1E0VA 4JKMA 2BNJA 3BGAA 5EBAA 1TVPA 4Q7NA 3WBEA 1NWTA 4WKAA 3VD3A 1QNOA 1KXHA 4UZUA 1R87A 3N13A 4D1IA 1JZ7A 5CSUA 1M04A 1LL7A 3PTMA 1W9XA 4M82A 2O9PA 3VTRA 3AIWA 3VIKA 2DSVA 1W3JA 2JF6A 1BQCA 4LYQA 1WE5A 1H41A 1KXQA 4A3YA 2BY3A 3WSUA 3K8MA 4J3SA 1VENA 1VJZA 2G3IA 3WL1A 1BSIA 2BHUA 3VMNA 3KZSA 5A1AA 1E6PA 1WZKA 3ARXA 1DWJM 4MDPA 5A94A 3DYPA 3WF2A 8A3HA 4U2ZA 3WIJA 3VKKA 1JYNA 1E72M 2D0FA 3WUGA 1Q6EA 1CECA 1NWUA 4GI6A 2XVPA 1HL9A 5JUVA 2J78A 1B3XA 1U30A 3AIUA 3VGEA 1TMQA 4OOUA 3N11A 4AZ7A 3WQ6A 4AD4A 4E4PA 3ZJ6A 2VZVA 4CU7A 1QI3A 4C7FA 1C7TA 4OOZA 3PTQA 1BYAA 1V6VA 3SIMA 2X8RA 1CPUA 5CLWA 1JAEA 4GI9A 4PUDA 1C8QA 1GQLA 3B9DA 3W24A 4AZCB 4MNLA 3L4VA 1W1VA 1UH3A 2J75A 4C7DA 2O92A 3VIGA 2XYLA 4KRTA 2WMJA 3W6LA 4EE9A 3K4AA 2FHFA 3WNKA 3WF4A 4QFUA 4LYRA 1V08A 1CZ1A 2J79A 4DUVA 2WZEA 1CXHA 4CD6A 2CERA 3SCPA 1XH2A 3U5YA 3T0BA 2IXUA 3RIKA 1B3ZA 4CCDA 3A47A 1CXFA 2X09A 2W91A 1CDGA 5HPOA 2GDVA 2J7CA 4E8DA 1IZJA 1NOWA 1VEOA 2VCAA 2OSYA 5GPRA 4PTWA 4Z2GA 3E1F1 1B1YA 3WDJA 1LL6A 4WKHA 3FHAA 4W8AA 1V3IA 3BSHA 4NI3A 4P7LA 2AMGA 3VGHA 4QDMA 4D6CA 3N18A 3WQ8A 4M56A 1OSEA 4E8CA 2DIEA 3GBEA 1FFRA 4M81A 2VJXA 3CUGA 3U7BA 3RJYA 2JFEX 4HPGA 3ZSTA 3W38A 2UY3A 4WSJA 3VD4A 1M01A 1XYZA 3AHZA 3AIRA 4XX6A 4P7QA 3CHDA 1J12A 1FHDA 2DEPA 2GJXB 1CEOA 1QNRA 4AIUA 4YN5A 4CGTA 4CVUA 1HJWA 3DECA 4UOJA 4M80A 4CUCA 1C8YA 1VFOA 1KCLA 2WM0A 1E56A 4UQEA 1ZJBA 1E3ZA 3A4XA 2X2YA 3LPGA 2WHMA 4AISA 3DYMA 2JIWA 2DSKA 1QPKA 1VIWA 2VNCA 3CHFA 4Z2KA 4M29A 5BYWA 1VFFA 3F5KA 3G6MA 4R5EA 1JAKA 3PZQA 1Q6CA 4UOZA 1J10A 3AMLA 1WDQA 4ATWA 4UFLA 1GOQA 3L4WA 1E0WA 4BF7A 4X0VA 3VO0A 1NWRA 1HJQA 2W92A 1TA3A 4PSRA 1I75A 3OB8A 2XWEA 1OWQA 1B3VA 3GH5A 1ISYA 3CBWA 1JYVA 1HP4A 2XVKA 1UWRA 2YL6A 1V6WA 3CZKA 4F8XA 2PWHA 3EDKA 1QVBA 2Y5EA 1ISWA 4AZ5A 2E9BA 2ZXDA 1JFXA 4GINA 5A8NA 1C91A 4IPLA 4PEEA 1OB0A 2GJPA 3ARRA 3CUFA 1W9DM 2J8GA 2PI6A 3GBDA 3ARZA 1US2A 2WW5A 3RMEA 2CKRA 1PEZA 1K9EA 3WENA 2C0HA 2YLAA 3T0AA 3T2QA 2D20A 2W5FA 2W62A 2VCCA 4ATLA 5JIPA 1JGIA 1QNPA 1UKPA 1UH2A 4ZFMA 4GQQA 1J0IA 1DWGM 3CGTA 3CTTA 2DPEA 1GOKA 4W7VA 3BAJA 1BGAA 2ZUWA 3I3DA 3WFZA 5A6LA 3WKZA 1VBUA 2O9RA 1XD1A 1LJYA 3AQUA 3S2CA 3ZT6A 1VF8A 4AD3A 4UTFA 1OGBA 1O6IA 1QNSA 3NDYA 3EMQA 3L2LA 4JKKA 4UQDA 2CYGA 2Q8XA 4F9JA 2RGLA 1V6YA 1KB3A 4L4OA 1M03A 4H7VA 1W1PA 1TG7A 2ZX5A 5D9PA 1BAGA 1XCWA 2HISA 2DT3A 2E9LA 3WH8A 3L4ZA 3VM7A 3SCOA 3BAXA 2WWDA 3PZTA 3ZOAA 3FY1A 4AZBA 2OYLA 1CIUA 4IUGA 3W81A 5BCAA 2NT0A 2WMGA 2QMJA 1HKMA 1GHSA 1TE1A 1QBBA 3WQWA 3WNMA 2VRJA 3BMVA 1FOBA 3WQ4A 3PZUA 4MPKA 3BSGA 5CLTA 3VM5A 3NCOA 2CESA 4AEEA 4MJ2A 1XD0A 1C7SA 1QW9A 2Y24A 3MSGA 1C90A 1FP8A 5D4YA 1LWHA 3OZPA 3VD9A 3TTYA 5A6SA 4ZXLA 1HVQA 1EA9C 2YDQA 3D3AA 3GH4A 1AQ0A 3OZOA 3ARWA 2C8NA 3W25A 1E6SM 2VRQA 1GONA 2CEQA 1WDPA 4HU8A 3HN3A 4KGJA 3RILA 5JH8A 2GDUA 2JF7A 5A3HA 3GNOA 2VR5A 1KGUA 2E0PA 1J0YA 1KGWA 5HOSA 1BHGA 3VDHA 1HP5A 3B9AA 3OA5A 1E0XA 3WH5A 1UD4A 1VJSA 1E5JA 2JALA 3WDQA 4ACYA 1GOIA 1FH9A 3QHNA 3EDDA 4MB3A 3ARUA 4BZYA 3FAWA 1EQPA 1MW1A 2ZIDA 2VT0A 2WMIA 4UFHA 2V3EA 3ZJ8A 1HJXA 5ABEA 3WDHA 2WWCA 1H2JA 2DDXA 2VRKA 5A8QA 1B90A 5A6BD 1KGXA 1G9HA 4H8UA 1UR0A 2J7HA 1EIBA 1BVNP 4AWEA 4CCCA 4MB4A 3M6DA 1AQMA 2J47A 2OLHA 4BS0A 4BQ4A 5C8BB 5JBDA 1UR9A 1Q6GA 5A69A 3BMWA 4HMEA 3VOCA 1UHVA 1E9LA 2FDMA 1LF1A 3AICA 2J7DA 4BQ5A 1BF2A 1G5AA 5I23A 3W37A 3NIYA 4KWUA 1NQ6A 3RO8A 1V0LA 2CETA 1OIMA 2W66A 2V3GA 1UKQA 1AVAA 2X05A 2WPGA 3WDPP 2WCAA 1JG9A 3L2MA 5D9NA 2A3BA 3PZOA 2X1IA 4NZCA 1B3YA 4TVUA 1H0IA 4Z2JA 1C3FA 5D8WA 1XH0A 3GXMA 1UD5A 4UCFA 2FH8A 4PTVA 1WCGA 4PMOA 4FLRA 2GK1A 3BAYA 2J7FA 3L4YA 2WANA 3NDZA 1LWJA 4GXPA 3OGVA 1HJSA 2BHZA 4X0NA 5CQ1A 4TTUA 5FOOA 3VPLA 3M7SA 4AD5A 3SUWA 3WH6A 3K8LA 2CPUA 3O9NA 4D6EA 1G0CA 5TD4A 4N42A 2GSJA 1ISZA 3CHCA 3OLGA 2QMKA 1XSIA 3MU7A 4JL1A 1EHAA 3J7HA 3WMSA 2QPSA 1ZBKA 1HKKA 3CH9A 5CGMA 4GO8A 2G3MA 4W5UA 3VNZA 2VMFA 1BTCA 2V5CA 3WD0A 4MNJA 1Y7VA 2DSZA 3W28A 5LA0A 4P8VA 3A3HA 3B8SA 2WKGA 4YPJA 4OUEA 3K1DA 1GCYA 1ITCA 5A6AA 1SFSA 1E70M 2J62A 2BVDA 3MO4A 5IFTA 5EB8A 5CPQA 1ZBCA 1GUVA 7TAAA 2ZWYA 1E6RA 1RD6A 4JAWA 3W82A 1UYQA 1V0NA 1I1XA 3WDIA 1R7AA 1V03A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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