4DWSA

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
543
structure length
526
Chain Sequence
GAVPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEKIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADETIDMGPLYNPGEIYLSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Chi2
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia entomophaga
total genus 186
structure length 526
sequence length 543
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsA02
1AQ0A 1C7TA 2G41A 4W8AA 1DHKA 1UG6A 3W26A 4AD3A 5KEZA 1CTNA 4JFTA 3M6DA 2D24A 3K4DA 4NI3A 5IXEA 2BVTA 1ISYA 4XB3A 1BAGA 1W3HA 4Z2LA 1UR4A 4GIAA 4GINA 1AMYA 2J7EA 2VZOA 4D6FA 1EO7A 3WD2A 3S6TA 4CD7A 4U5KA 3MS8A 1M04A 1WAWA 1JD9A 1NP2A 2JF7A 2ZUNA 3VIMA 2VCCA 4M8UA 4PMNA 2MANA 2WWCA 1D7FA 3SCNA 1BF2A 4CKQA 3AXHA 4GO9A 1C8XA 1BGGA 2WC4A 1V3LA 5EBAA 4RE4A 2GJPA 3TA9A 3MANA 3F5KA 4PMYA 4N0RA 4LPCA 3AIQA 4KGLA 3AS2A 1MW2A 3CO4A 4F79A 1KR0A 3ZT7A 3WH7A 3SUVA 3ARXA 3ARWA 4FK9A 3T2PA 5M03A 3UG3A 3AIEA 3MO4A 3PTQA 3ZJ6A 4ATLA 3MSGA 1W1PA 4CCEA 4BZYA 3WQ6A 1BYCA 2D22A 4DWSC 4IPLA 4QCEA 2VJXA 5A8MA 4KH2A 1E4IA 3ECQA 1GNXA 5DFAA 1HX0A 4TVCA 3ARRA 1J18A 3PZIA 1V02A 1LWJA 2PBGA 4AY1A 3ZO9A 1WO2A 1B3ZA 4CD6A 3TTSA 2ZUSA 1QBBA 4JFUA 1I75A 2X2YA 1HF6A 5DMYA 3EDJA 1PAMA 3ZSSA 3VUPA 4U2ZA 4W8LA 5EB8A 3CH9A 1W2PA 5CPQA 3U7BA 3ARQA 3ZR6A 4J27A 2VX5A 1FA2A 1ISXA 3A3HA 3VD4A 1J12A 1NWRA 5AC5A 3HN3A 4Z2HA 3ZIZA 3WELA 1FHDA 1OM0A 1UUQA 1UH4A 3AROA 1NQ6A 2XIBA 2J7FA 4WLCA 1EDTA 3T0DA 4HZ6A 2UY3A 3CHFA 1JF5A 2QLYA 4ACZB 6TAAA 4PMOA 1ITXA 1BFNA 3VGGA 4W89A 4KRTA 2CBVA 4N42A 1C8QA 3RDKA 3VGDA 4D71A 3W6LA 2CBJA 1V3JA 1JYNA 1HJXA 1CLXA 3EDDA 2PC8A 2E40A 5D9NA 2XFFA 1V6UA 4M82A 2EO7A 3VDAA 7TAAA 4D6HA 1W32A 3D3AA 1IZJA 1W3KA 3AS3A 4Z2IA 5FD0A 4OOUA 2V5CA 2CEQA 2HVMA 2QPSA 1KXHA 4YHEA 1DWFM 4D6GA 2WSPA 4U2YA 3NSMA 5GNZA 1XD0A 2DSVA 4Q22A 1H11A 4JZ5A 4AMCA 4BQ5A 4UFHA 4Y7EA 2WHKA 5A8NA 1FFQA 2UY5A 2OWWA 2CHNA 1QW8A 2VOTA 3AYSA 4KMQA 3VO0A 3CZKA 3QHOA 3ALFA 3SCQA 3BCDA 4KGJA 2J7CA 1OGBA 3EDFA 1KQZA 2Y8VA 1FOBA 2ZUWA 4ATDA 5CXPA 3WQ4A 4HZ7A 4P7LA 1W91A 7CGTA 4ZXLA 4S3JA 3DECA 1MWOA 4ZENA 1NARA 1BSIA 3RO8A 1UWSA 4UZUA 2CHOA 1QNQA 2GK1B 2CESA 3OLIA 2WMJA 2FHBA 5M3WA 2GVYA 2JEPA 5ECUA 1MYRA 2X8RA 3L4VA 3SCTA 5IHRA 3W53A 4A3HA 3RM9A 4EKJA 1CGWA 1EGZA 3RJYA 4GZEA 2WMIB 2W61A 3FHQA 5FL0A 5CLWA 3SEPA 2CNCA 2WAGA 3ARZA 4B9ZA 5CGTA 1ODUA 1GQJA 1UD5A 2VMFA 3AIBA 3ZT6A 3VKKA 4TVUA 2YL8A 5A69A 4H04A 5A6BD 2OSYA 4M24A 4PTXA 3W0KA 3WNOA 1VFFA 3NDZA 4URIA 3NYDA 2D0FA 4F8XA 3IJ9A 5E9AA 4WIWA 2ZXAA 4UQEA 2YDQA 1WP6A 4HA4A 4MPKA 3QOKA 1UOKA 2BVDA 2WVVA 1KGXA 1LL4A 3K4AA 3WDIA 4NF7A 1ZBKA 2QF8A 3PTKA 5A6BA 2WBKA 2XPKA 5A6SA 1CWYA 2YKKA 1F4AA 3FAWA 2BV9A 4JCLA 1DP0A 2EEXA 5EFDA 3F4VA 5LA1A 2CITA 4UCFA 5LA2A 1B30A 3GXIA 3O9NA 1CGXA 1E73M 1E3ZA 3SCRA 3VIFA 1HVXA 1CIUA 3T0BA 1FHLA 1OGSA 4OJYA 5D9MA 3VX1A 3VD3A 4Z2GA 3I3BA 4U5IA 2NSXA 2WSKA 3UG5A 1E0WA 1ZB5A 1PZ2A 1GOOA 3BAJA 1IT0A 1V0NA 4H8UA 4W5UA 4V28A 5D4YA 3OGRA 3FAXA 2GUYA 1CGYA 2GJRA 2QMKA 3VNZA 3EYPA 3T09A 1JZ6A 1JXJA 4HU0A 2XSBA 4Z2KA 1E1FA 1QVBA 3HU7A 5A8PA 1GUVA 1SR0A 3THDA 4AD2A 3PZQA 3VIOA 4YHGA 1E4LA 3AICA 2WVUA 3CMJA 3K8LA 3VOCA 4PSRA 1DTUA 1CZ1A 1G94A 2PBOA 4MB1A 2WLYA 2BFGA 2XIIA 1WDSA 2VTFA 2AOSA 1CXIA 5A8OA 3WF0A 1FH9A 4PUEA 1E9LA 2OSWA 4UQDA 4OBRA 3W6MA 1Q6FA 3N04A 1HJUA 2CERA 4GI9A 2IXUA 2J74A 4P7QA 5EMYA 3ZSTA 2E8ZA 4D1IA 1E6NA 2ZXDA 4TX8A 3S2CA 4LYQA 3M7SA 4MJ2A 4PMZA 1VFUA 5FCZA 1US3A 1JF6A 4HMDA 1WZKA 3ZMRA 2YOCA 2YLLA 3K46A 5I77A 3FXYA 1TR1A 3ZJ7A 1E6ZA 4CN1A 1K9FA 3AFBA 1HJVA 4UQBA 3GNRA 2WYSA 4HPHA 4P8UA 4FLSA 4XZBA 3ZM8A 3SUTA 3VX0A 1G0CA 1J0IA 2XGIA 4FLOA 2PWHA 4E8CA 3WIJA 2J4GA 3CLWA 2WMKA 2ZXQA 1JI2A 1UWIA 3PZNA 2W91A 3U5UA 4XV0A 4MNMA 3CIVA 3CGTA 4AZ6A 2WWDA 1Q4NX 1ODZA 1US2A 2JIWA 2Y24A 2D23A 3QGVA 3WQWA 4PCTA 4MADA 1UQZA 3KWXA 1D3CA 2E9LA 4L4PA 1E0XA 5CZKA 3W29A 4E8DA 5IFPA 3T08A 1V08A 2VNCA 4K68A 1RH9A 3W37A 1TE1A 5A6MA 4HTYA 1H0GA 5BRPA 1KXTA 1CENA 5D9OA 2ZE0A 1E1EA 1GOWA 3AYRA 4EAMA 3VGFA 1VF8A 2YJQA 3HMCA 1G01A 3MV11 1Y7VA 4NRSA 1B3WA 1Q6CA 1CXKA 1HT6A 3CZJA 1UD2A 1IV8A 4AD1A 4WF7A 2J8FA 3GZAA 2J47A 2F8QA 2F2HA 2VQTA 4TTUA 3VM7A 4TOQA 1U30A 3F5JA 1KB3A 4NSBA 3AIWA 4XZWA 4J3UA 1M03A 3II1A 1UHVA 1WZLA 4X0NA 4D6EA 1CXHA 2D20A 3AS1A 4J3WA 3VGBA 4PMVA 4YN5A 2E8YA 3WN6A 4QFUA 3GM8A 1ZL1A 2XVKA 2DGAA 2G3JA 4AWEA 3WD0A 2DSWA 1TVNA 3WUGA 3MSDA 3CHEA 3A6OA 2WW5A 1XGZA 1E72M 1HL8A 1W3JA 1O7AA 2E9BA 3L4UA 2D3LA 1J0KA 2YDRA 3WEMA 5CLTA 4UOJA 1OCQA 1GQLA 1TZ7A 4QAWA 3N15A 5C8BB 2C8NA 4GQQA 3RJXA 3M46A 3K1DA 1PIFA 5DT5A 3L4YA 2ZX6A 1GVYA 3TTQA 3OLDA 2F61A 4MAVA 4TX6A 4AC1X 5A94A 4D6JA 1NOWA 3WDPP 5HXMA 3ARVA 2Q8XA 5I24A 1ISWA 3GBEA 3AISA 4LYPA 3WQVA 1L8NA 3SCPA 3M07A 1V6XA 1KBKA 4F9DA 3UEQA 1CXEA 4CD4A 2C0HA 1OGGA 2QV4A 1CPUA 1HN1A 3WF4A 3CUFA 4TXEA 2JFEX 1C7SA 1VBRA 3CPUA 1RD6A 3K8KA 1W9PA 8A3HA 2WC7A 3CUJA 2WM0A 4PSPA 2Z1KA 4ZXOA 4ZEPA 1EQPA 2CBIA 3VVGA 1ESWA 4HMEA 4FLQA 1TG7A 1FH8A 1MQRA 1VEMA 5GNYA 1XSIA 3UG4A 1W1TA 4AIUA 1EHAA 1UKTA 4MB5A 1XSJA 4QLJA 1J01A 1TA3B 1Z32X 1EOKA 3A4XA 2BNJA 5E0FA 2WC3A 3G6MA 3W25A 3WBAA 4CN6A 2PWGA 2X09A 5IHSA 4PBGA 2PB1A 1JI1A 3RM4A 2BY1A 3NSXA 1HP4A 4WK9A 4AZBA 5JUVA 2OLHA 2WZIA 4GI8A 3CUGA 2NW0A 1W9DM 4BF7A 3BMWA 2CIPA 4BCEA 2WMGA 5HNNA 5BXRA 4AISA 2YDSA 2VZTA 4D1JA 1H3GA 3KZSA 1CYGA 3VPLA 4MDPA 1UR9A 3W28A 5ABFA 5FL1A 4IISA 1VEOA 4D6IA 5I0DA 4DWSD 3B9AA 2RGLA 2XM1A 3SURA 1E4NA 4UFKA 1U33A 1UD3A 3WNKA 1UQYA 2OYKA 1TFVA 3AHVA 1V3IA 4UR9A 2V3EA 3WUEA 3LPFA 4UFLA 6CGTA 2DDXA 1I1XA 1QBAA 1OIFA 2O9TA 2VZVA 3SCUA 4W7VA 3VMNA 5JBFA 1JGIA 1JL8A 2ZUUA 2YIHA 3WF2A 1R7OA 4E4PA 1VEPA 2V3FA 4DWSA 3WL0A 1UWUA 4KRUA 3ZR5A 3T2OA 1C3FA 1VJZA 1BTCA 2X0HA 2WKLA 3EDKA 3WSUA 2WB5A 1JZ7A 3ARSA 3PZGA 4BA0A 1JG9A 1W1VA 3GH4A 5E0CA 3CBWA 4QLKA 1KGWA 1B90A 5A95A 2J8GA 1B9ZA 1V6VA 1W1YA 2DH2A 3T2QA 1WDRA 3RM8A 4AD4A 1LL6A 3WD1A 5E6ZA 3DYMA 3GH5A 1B0IA 1H41A 1QNSA 3PBGA 3WDJA 1QPKA 2CXGA 1UR8A 2GDVA 2CBUA 3LPOA 3BMVA 2FHCA 2W63A 3WD3A 4ACYA 2DH3A 1JAEA 5A2AA 1V6YA 4GZIA 1HJSA 3L4TA 2YL9A 4MNKA 2CPUA 3QR3A 1KGUA 1XCXA 4U33A 1PPIA 3TONA 3WQ5A 1TMQA 3CZ8A 1KQYA 2ZX5A 2V5DA 1JNEA 3WMCA 1GHRA 1CNVA 2FGZA 1W9BM 2VT0A 3KL3A 5LYRA 3WFLA 2DSZA 4S3KA 2DT2A 1I1WA 1OIMA 3VMOA 2ZWYA 1VENA 2D3NA 3VGHA 3BCFA 3NSNA 3N13A 1F4HA 4Z2JA 1DWHM 1WDQA 4LYRA 3VIPA 1UZ1A 1PIGA 3FN9A 1C91A 1GOIA 1H0IA 3RIKA 5JBDA 1YHTA 1JZ2A 3BH4A 1HKKA 1TCMA 3WNNA 5I5RA 3EMZA 1LJYA 3W24A 1CBGA 2ESCA 3GBDA 3AHZA 5I79A 1MW0A 1SFSA 4PTVA 1L0PA 5A1AA 2W67A 3TP4A 3UR7A 1ZJAA 2YA2A 2HISA 2BVYA 1ZBCA 1GONA 3OZOA 3GDBA 4C7GA 4ZFMA 1EDGA 3WENA 3IJ8A 3PZMA 4GO8A 3RILA 1V3KA 2VURA 1HKJA 1GQKA 2OWCA 4JFWA 1UD4A 3BAIA 1CGVA 1FH7A 4HMCA 4A4AA 1WPCA 3PZ9A 1OT2A 3J7HA 4AZ5A 2VX6A 3DC0A 2GSJA 5A3HA 3UESA 4CCDA 9CGTA 5HOSA 4PMQA 1GOKA 4MNJA 1QHPA 1E56A 2YA1A 4MB4A 4XX6A 1U2YA 4PMRA 1AQHA 2UWFA 2WCSA 3ARUA 1CXLA 1KXQA 2WMHA 4MDOA 2X1IA 1UKQA 3OLGA 1HIZA 3EBVA 1K9DA 1CGUA 3WH9A 1EXPA 3WNMA 4J3TA 1E6RA 4M56A 1EH9A 3KEHA 2YL6A 1E6XM 5BWFA 3APGA 5A6JA 1PX8A 3WH6A 1TUXA 1BPLB 1UR1A 3AHTA 5D8ZA 3UR8A 1WDPA 2PF0A 2J7GA 4M29A 4D72A 4HOXA 3WY1A 3GXMA 4H8HA 4H41A 1J9YA 1MQQA 1WKYA 3NUKA 1N82A 1XC6A 4JL2A 4LQ1A 2CYGA 1G1YA 4GXPA 3WEOA 1JD7A 4OBSA 2G4FA 4UFIA 1GCYA 3VGEA 5M17A 2GJXA 2UY2A 1JDDA 1ZBVA 3VDBA 4J28A 2DPEA 1LL7A 1BYBA 3RMEA 1R86A 4A3YA 2VR4A 5D9PA 4ML4A 3GH7A 2J7BA 2XM2A 4CN4A 1B2YA 1QNPA 5LA0A 1C92A 2E4TA 2E3ZA 3U5YA 3AJ7A 1H1NA 2TAAA 3WF1A 1EA9C 1WNOA 1J10A 2WNWA 2VRQA 4OOZA 2BXZA 3VMPA 3B9DA 5CSYA 4GZJA 3GXFA 2C7FA 1JYWA 1VBUA 1C93A 1ZBWA 1LQ0A 1HVQA 1O6IA 2BXYA 4W8BA 1B3YA 1ISVA 2XG9A 5BXPA 3F5LA 2VUYA 1XH1A 4AD0A 3VM5A 3WUBA 5CQ1A 4R5EA 2A3CA 1E15A 3WEZA 4J3XA 4IM4A 1EDQA 1G9HA 2WHLA 5M5DA 3VDCA 2DT1A 4PN2A 2EPMX 3VD7A 1Q6DA 2ZXBA 1XCWA 1RPKA 2VR5A 4IUGA 4WSKA 2FDMA 1KBBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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