4DWSB

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
540
structure length
527
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 190
structure length 527
sequence length 540
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsB01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsB02
3A4AA 2VX4A 4JKMA 5JBDA 5AYBA 1WO2A 3RIKA 1EO5A 1BYBA 3WNPA 2VX6A 3NYDA 4GI6A 4D6FA 1O6IA 3EMZA 1YQ2A 2CETA 1V3LA 4ACZA 4PSPA 1UZ4A 1UWQA 2PBGA 4GO8A 1SR0A 3W6LA 3VGHA 1HJSA 3SEPA 4AY1A 2Y4SA 4MJ4A 1EGZA 1N82A 1WPCA 1VEOA 3UG5A 1HL8A 2YDRA 3AHTA 3OGRA 3ALGA 1BQCA 1OINA 1G9HA 3F5JA 4OBRA 1E55A 4FLSA 3FN9A 2UY2A 1BAGA 1VEPA 1KXQA 2V38A 2FGZA 4CN4A 1Q6DA 4B3LA 3AHVA 3OGSA 1ISVA 4PEEA 2YBUA 1QNOA 2FHCA 3EMQA 3VUPA 3CPUA 1E6RA 1W2PA 3AIUA 4XB3A 1XH2A 2AMGA 3FXYA 4AIOA 4KWUA 1QNSA 5IFTA 2CHNA 3NJ3A 3ZT5A 1GVYA 2DEPA 3PZUA 3CZJA 1KB3A 4MNKA 2V3EA 3BMWA 3FW6A 2WMJA 4B16A 4GZIA 5BRQA 2OYLA 2V3FA 2YL5A 4GQRA 1DHKA 1J0IA 1HKIA 4IISA 3MU7A 1HJQA 2JF6A 2ZX6A 5CSUA 1EIBA 2YLLA 4W89A 1EHNA 1QNRA 5F7UA 1US2A 3GXDA 3L4ZA 4F8XA 1UH4A 1EA9C 1MXGA 3T0BA 1WZLA 1ODZA 3PTKA 1W91A 3WH8A 2VZUA 2FH6A 4UQ9A 1BPLB 2A3CA 3SCTA 1JZ8A 1W9UA 3MO4A 2VVSA 1CBGA 1B3XA 2VX5A 4HA3A 4U3CA 2WVVA 3SCUA 1OIMA 2E8ZA 4LPCA 1J0ZA 3AXHA 5JBEA 3APGA 1KQYA 3VGEA 2WKGA 5A94A 4CGTA 2PWEA 4GINA 3VIJA 1BVNP 2VZVA 4M8UA 3GNOA 3NUKA 1KWGA 4BS0A 4MB4A 1JDDA 1CXLA 1ZL1A 3ZOAA 3ZIZA 5CPSA 5HXMA 1QI4A 2J79A 4BCEA 3VMOA 1ZJBA 3WD3A 1KCKA 1BG4A 4AD0A 1K9FA 3PBGA 1UWUA 2J62A 1EDTA 5ABEA 1LQ0A 2VVNA 2UWFA 1B30A 4UZUA 4M81A 4WSKA 4P7RA 1J0YA 2A3HA 1LG1A 4X0VA 2YKKA 3ARYA 3WDJA 2PWHA 2BXYA 3A6OA 3A47A 5GNXA 1ISZA 3MS8A 1W1YA 1JZ2A 5I5RA 1QI5A 3VIFA 3IK2A 3RO8A 4R27A 3PZNA 1W32A 3ZJ6A 2ZUSA 4HU8A 1U2YA 3WQVA 3QHMA 2UY4A 3WF2A 3VIHA 1UD5A 1F4AA 4FLRA 2YL6A 1EOMA 3WD1A 1CZ1A 1CYGA 4Z2LA 4AYSA 3LMYA 1HKMA 3GBDA 4MTVA 4JKKA 4P8XA 1VFFA 1HL9A 1DP0A 3WEOA 2ZIDA 2DT3A 2XIBA 4FK9A 5CXPA 1ISXA 2BY1A 3MUAA 4RL3A 3UG4A 4CU8A 3TA9A 1ZS2A 5BXTA 4H8UA 3I3BA 3AOFA 1H5VA 1KFWA 1VJZA 1DEDA 1CNVA 3DHPA 1LLOA 2BVTA 4J3SA 1UWRA 4JFUA 3UCQA 1M7XA 2VCCA 1HKJA 2PC8A 1P6WA 2CBVA 1QHZA 1V3JA 1XHGA 4P8VA 1UG6A 3L4TA 4DWSA 4AIEA 1V3KA 4H41A 4PMVA 4UQEA 2G3IA 4D6JA 1C8QA 2CHOA 1H41A 3LPGA 3WDIA 1JYWA 1UA3A 1E6XM 3K4DA 4R5EA 3VOCA 2GUYA 2F8QA 2ZX8A 3FHQA 2DIEA 1VF8A 5FCZA 2BXZA 3ARZA 2DPEA 3MSDA 4PRWA 1ISWA 1GUVA 1KGXA 3BAXA 3GYCA 2VTFA 4CN6A 3NSNA 4JHZA 4CUCA 1V0NA 1H3GA 1CLVA 2GDVA 2JF7A 3QHOA 1K6AA 1B2YA 3W82A 1GOOA 1Q6EA 1LWHA 1SYTA 1QPKA 3IAPA 4B9YA 5AYIA 2GJRA 3II1A 2CIPA 4PBGA 3GH5A 1J11A 3K1DA 1Q4NX 3I3EA 4JCLA 5A8MA 6CGTA 1E0VA 3VGBA 2X1IA 1KXVA 2WHJA 4U5KA 3U5UA 5ABFA 1V0KA 2EXOA 4KH2A 1SMDA 3M46A 3WH5A 1UD6A 1DTUA 1PX4A 1HJUA 1AQHA 4QAWA 5IXEA 1TUXA 1FH8A 4D6CA 4F9DA 3EDDA 1WZAA 4D6EA 1D3CA 4H7VA 1EHAA 2W62A 4GPNA 4IUGA 2DSWA 4M80A 2D22A 3KL3A 3GNRA 2E4TA 1E9LA 1G94A 2WVSA 4UFIA 5D8ZA 3AIEA 3MMWA 5A6SA 1RD6A 4PTWA 5EB8A 1EDQA 3WQ6A 3PZ9A 1NWSA 2O9TA 3KZSA 3E1F1 1SFSA 2W63A 2XVPA 1BTCA 3CLWA 1NWRA 1JFXA 5I78A 3BAKA 2D24A 5E6YA 1OD0A 2WBKA 2ZXDA 1MVYA 3RM4A 2GJXA 3SUSA 2CITA 3T2QA 4ZFMA 4CCCA 4ATWA 2W67A 3LPPA 3AS2A 1ZU8A 4UFLA 2PI6A 3SIMA 4HA4A 3DYOA 1J0HA 3VIMA 2XVNA 3WL0A 3BMVA 2D23A 3L4VA 3VDCA 1KGUA 1XYFA 1UKSA 1UR4A 2WMGA 3AZSA 1QNPA 1MWOA 3AYRA 4AZIA 3MANA 2JFEX 2Y8KA 4OJYA 3UETA 1WAWA 4W7WA 3ZJ7A 1JI2A 4YN5A 5D9OA 2DH2A 2RGMA 1D7FA 1MQPA 1MYRA 3SCWA 3ARTA 2J7GA 1RP9A 3WIJA 2EPKX 4P8UA 2J8FA 1KBKA 3MMDA 1UWIA 2DSUA 1PAMA 4H8VA 5E09A 3WNOA 2VUYA 3WMCA 1WZKA 4FF5A 5A8QA 1V6YA 1VFOA 2ZICA 1WB0A 5LA0A 3TTYA 3CZKA 4L4OA 6A3HA 3MKKA 4KGLA 4OOZA 4D71A 1B90A 4U5IA 2NSXA 1I1XA 4A3HA 1WNOA 1EQCA 4U33A 2IXVA 3VIGA 2WZEA 3CZ8A 3RCNA 1ITCA 2VO5A 1LL7A 2FH8A 5JBFA 3GM8A 1EH9A 3PN8A 3VGFA 1ZBKA 2BY2A 1QVBA 3GZAA 1W3JA 3ARVA 3OA5A 2BV9A 1E70M 4PCTA 4ZENA 1V02A 3TTSA 1XH1A 3W81A 4URIA 3SCQA 1JFHA 3W25A 4M1RA 4TUFA 4AD4A 5A3HA 3WUEA 2D3LA 3IJ9A 4KRUA 4MAZA 1JZ4A 3WDRA 2ESCA 2WC4A 3W26A 4U2ZA 4UFKA 1IZKA 5CGMA 1JZ6A 1OIFA 4DWSD 2WPGA 3HN3A 4P7NA 1CXIA 1E1EA 3GNPA 3OBAA 2QMJA 3L4UA 5ECUA 4JKLA 4ZEPA 1JZ7A 4A3YA 4PTXA 4OZOA 5D8WA 2VZTA 3BH4A 2E9LA 1G5AA 4K68A 4J27A 4XZBA 1UH2A 4MNMA 1A3HA 3POHA 4BA0A 1W1PA 4NRRA 1QI3A 4LYQA 2JEPA 3UERA 5ABHA 3VD7A 4MNJA 5DT5A 3WFLA 1FP8A 1NP0A 3W0KA 2CKRA 1GOMA 5AY7A 3EBVA 1BGGA 2ZX9A 5FOOA 4KGJA 3VX1A 1J9YA 8A3HA 3GTNA 1U30A 3UR8A 1NP2A 3NCOA 1E4LA 1C93A 1FH9A 1JF6A 3KWXA 3ARPA 1GOKA 3OB8A 3AHYA 1UWSA 1UR2A 1VFMA 3BSHA 2CXGA 2X05A 4AEEA 2WYSA 1JDCA 2DDXA 1DWGM 1CIUA 2JEQA 2XFFA 5CSYA 1HP5A 2E8YA 3CZEA 1CDGA 4LX4A 2GFTA 1JF5A 5EMYA 4PMXA 3PZQA 3M7SA 3BC9A 5FL1A 1VB9A 3G6MA 2YIHA 2AOSA 4AW7A 2XGIA 2QHAA 2BVYA 5I6SA 3ECQA 2XWDA 1V3IA 2HISA 1C7TA 2G3JA 1CPUA 3PZOA 4AZ7A 4H2CA 4ZXLA 1H0GA 4LQ1A 2G3MA 1OSEA 1UKTA 2WCAA 3CBWA 2VX7A 4XV0A 5BXRA 1VENA 2J7CA 4W8BA 1ECEA 3N18A 6TAAA 1WE5A 3SCRA 2J7BA 3TTOA 1TVPA 2DIJA 3AMDA 4EANA 3L4XA 2WMIB 2O9PA 3IANA 4JFSA 4ACZB 3T09A 2BVDA 1WDRA 1PZ3A 4LYPA 3HU7A 1EO7A 4HOWA 5A69A 5D9PA 1W3LA 3CUGA 5A95A 4D1JA 4EAMA 3U7VA 4OUEA 1XSJA 2XVKA 4AZCA 3WUFA 2XM2A 2XVLA 1WKYA 3UEQA 1UA7A 4PYSA 3GXFA 1E6NA 1CGXA 1CXFA 2VZSA 2ZUTA 1FP9A 4AZHA 2ZUNA 1UD8A 3N04A 1EDGA 1H2JA 1PPIA 3IJ8A 3W29A 1HXJA 4HP5A 4AISA 3VU2A 1MW1A 1E3XA 4JHOA 1R7OA 4PN2A 3WQWA 1R86A 5A1AA 3PZVA 1DWJM 1E73M 1PJ9A 5A6BA 2VR5A 3N15A 2WK2A 2CCRA 1EXPA 3OLIA 3WUGA 1MFVA 3QOKA 1M53A 2WHKA 1M03A 4XZWA 2WC3A 3J7HA 4WK9A 2ZXBA 3M07A 2WCSA 5GNZA 1CGTA 2J7EA 2JE8A 4H04A 2JIEA 3SUVA 5EFDA 3ARXA 1W9BM 3VD9A 2DT2A 4N42A 3EDEA 4W93A 1E6SM 1V3MA 2XSBA 5I3DA 4N0RA 4WSJA 1ODUA 1XD0A 2VMFA 3W4RA 2OSYA 1KCLA 2VT0A 1WZMA 4HZ6A 3CO4A 3A4XA 1G0CA 2DQXA 4BZYA 1FHDA 1C8YA 1LJYA 1GPFA 3N13A 4JCMA 1E5JA 4ZE5A 1HKKA 3AQUA 4HPGA 4WKAA 3WMSA 4DUXA 3VX0A 2QMKA 3WF1A 1NARA 4CCDA 3SUTA 3VMNA 5BWFA 1V6XA 4C7FA 5LA1A 1JZ5A 2E9BA 5E9AA 1UD3A 1J0JA 1WCGA 2CNCA 1NH6A 1W1TA 1HJVA 2W5FA 4QDMA 4Z2IA 2VCAA 5GPRA 3VINA 4UQBA 1TMQA 4GO9A 1PX8A 1V02E 1R87A 3BAJA 4BF7A 3TOPA 1JG9A 4J7RA 1UR8A 4Y7EA 3O6AA 1UQYA 5DF0A 1Q6FA 2VR4A 3UG3A 5CGTA 4LGXA 2JALA 3ARUA 1JZ3A 1M01A 4FLQA 2GSJA 3N11A 2BFGA 2ZOXA 2W61A 4D6HA 4UFHA 1UYQA 1A47A 1LG2A 3K8MA 2YA1A 1OGGA 4OIFA 5A8PA 5EFFA 1V03A 1FHLA 4MAVA 4JZ5A 2O9OA 1MW0A 5CG0A 3CGTA 1E43A 2F2HA 2Y5EA 1V6UA 3VM5A 5A6JA 1K9TA 5LYRA 1AVAA 4ATLA 5M03A 3VM7A 1XH0A 2WVTA 2Y8VA 2X2YA 1GZJA 1VFUA 3I3DA 3AMKA 4CU7A 1W3KA 7CGTA 1G01A 3SCSA 2X0YA 2NW0A 2J78A 1US3A 3WNNA 1JNDA 5FIPA 2Q8XA 2ZWYA 2FHBA 3WNMA 4AMCA 4P7LA 1XSKA 2C8NA 3F5KA 2WMFA 4JL1A 1B1YA 4UOJA 1E4MM 4WIWA 1ITXA 1HVQA 2GDUA 4AWEA 3RDKA 1GQIA 2VI0A 3DYMA 1B3VA 1C90A 4OKDA 5BYWA 3BAIA 4PMDA 4UNIA 5A8OA 4NRSA 4DUVA 2WXDM 1OGBA 2XUCA 4A4AA 3VDHA 1X1NA 1HNYA 2WZHA 1J12A 3WD0A 2A3EA 4H8HA 4ZE4A 2DSZA 4YHEA 2WM0A 1UH3A 3PZMA 1CEOA 1CECA 4UQAA 2E9MA 2V5DA 1B9ZA 3AS0A 1VAHA 4OOUA 2CBUA 2ZUVA 1NOFA 5EBAA 3N17A 5HBFA 3CH9A 3AMGA 4UOZA 1JYXA 4PMNA 5BXPA 4HMEA 1E40A 5CQ1A 2Z1KA 1BYCA 2YOCA 3N1AA 5FL0A 2XSAA 4TX8A 3LPOA 5A6MA 3EYPA 2W92A 1XSIA 1WDSA 1GHRA 2EPOA 3MUZ1 3AIQA 3OGVA 2D20A 5A6BD 2WBGA 4E2OA 3CHCA 5ABFB 2OWXA 4WLCA 4CU6A 1W9DM 4C7DA 4DM1A 2G41A 1KGWA 2YDQA 1VBRA 5A2CA 3T0AA 2D1ZA 2J8GA 3B9AA 3ZMRA 4YHGA 4CVUA 4UOQA 1RH9A 4AD5A 3A4WA 3BLKA 3PHAA 5E0CA 3ZM8A 3VDBA 4W5UA 4J3VA 3VTRA 3SCNA 7TAAA 4C7GA 3VNYA 1E6PA 2QLYA 1ZBVA 3WEMA 1DWFM 3HMCA 1Q6CA 2XG9A 2D2OA 4F79A 5HOSA 2V3GA 3GDBA 4D6IA 1BYAA 4W85A 4PCSA 3NDZA 3ZR6A 1NWTA 2BHYA 2DT0A 5ABGA 4NI3A 1JIBA 4P7QA 2A3AA 1GONA 3RMEA 2PF0A 4QFUA 3K46A 3CUIA 1WP6A 3WQ8A 4BQ3A 4CD5A 4PUEA 4B3KA 4W8LA 1HF6A 3MV11 4M29A 1H09A 2NT0A 4BQ2A 2QF8A 1U33A 1C3FA 1TR1A 1OB0A 3OZOA 1JD9A 1E6ZA 2D0HA 1IV8A 3ARSA 4HOXA 5A8NA 3W28A 4JIEA 2WVUA 3BXWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1XC6 A;  1AQM A;  3AIB A;  1LL6 A;  1R7A A;  2J74 A;  4GI8 A;  3CMG A;  2QV4 A;  2A3B A;  1J18 A;  2YJQ A;  4J28 A;  1V3H A;  2B31 A;  4AXN A;  2YL8 A;  2YL9 A;  4U2Y A;  2YDS A;  3NIY A;  2EPL X;  4J3X A;  3QGV A;  4GZJ A;  1PIF A;  2C7F A;  4UQD A;  1EQP A;  3TTQ A;  3VD5 A;  4UQC A;  2XPK A;  2D3N A;  5BXS A;  1GOQ A;  2OSX A;  3AML A;  3EDF A;  3BSG A;  1GJW A;  2WCG A;  4E8C A;  2W91 A;  1E6Q M;  1JAE A;  5I0D A;  3CUH A;  4HPH A;  3N9K A;  5CZK A;  1X6L A;  1FFR A;  4XUY A;  1E5N A;  2WSP A;  3PTQ A;  3WFZ A;  1TA3 A;  3BGA A;  3POC A;  3WH7 A;  1BF2 A;  2VRJ A;  1UR1 A;  4PMR A;  1RPK A;  3WF3 A;  2XTK A;  3GXI A;  4PSR A;  2GK1 B;  1GNX A;  2XVG A;  4CD7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GVE A;  4HNN A;  2HWG A;  2V5L A;  4JTC A;  4NNC A;  2GWG A;  2GOU A;  4FX7 A;  2J6V A;  3JR2 A;  6ENL A;  4I8D A;  4GI6 A;  3NYD A;  4DAI A;  1O6I A;  1J4H A;  2D2G A;  2YCL B;  1GKP A;  4TMC A;  1ZSX A;  1UWQ A;  2PBG A;  1SR0 A;  3STC A;  3W6L A;  1G7U A;  1HJS A;  1VRD A;  3KHD A;  4XZN X;  4AY1 A;  3SEP A;  3KAB A;  3O0K A;  4NIL A;  3GR7 A;  1N82 A;  1WPC A;  1HL8 A;  2YDR A;  3OGR A;  2MNR A;  3U4F A;  1H7W A;  3F5J A;  3FN9 A;  3SI9 A;  1VR6 A;  1ICP A;  2Z6I A;  1IEV A;  1RUS A;  2FGZ A;  1XS2 A;  1SSG A;  3W7K A;  2YXG A;  2YB4 A;  4TNS A;  2YBU A;  1SO6 A;  1POK A;  3GE7 A;  2V68 A;  4PEE A;  3PSW A;  2KAU C;  1RLC L;  4AB4 A;  1XG3 A;  4FB7 A;  4IIH A;  3GDT A;  3ABS A;  1NF7 A;  1S3H A;  5JXQ A;  3FXY A;  4AIO A;  4KWU A;  4P5U A;  5D04 C;  4GVI A;  5C9R A;  3CZJ A;  3PVF A;  4IPI A;  5EL1 A;  1TQJ A;  3BMW A;  4B16 A;  5BRQ A;  4PR4 A;  2V3F A;  4YTS A;  5DX7 A;  4L72 B;  1UOZ A;  5E93 A;  3W7N A;  4LWW A;  4DRS A;  3CQH A;  5CSU A;  3OZM A;  5FEZ A;  2XP7 A;  1O94 A;  3GXD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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