4DWSB

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
540
structure length
527
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
total genus 190
structure length 527
sequence length 540
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsB01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsB02
5BRQA 1UWIA 3OZPA 5DT5A 1V3MA 5EMYA 2A3EA 4DUVA 4MTVA 3ARQA 4QCEA 4TXEA 1P6WA 2XGBA 1BVZA 2BY2A 4FK9A 5D9PA 3M7SA 2WHLA 4F79A 1JGIA 1H4PA 4PTXA 1RD6A 2QLYA 5DFAA 3T0DA 1J01A 1D7FA 2YA2A 3FN9A 2G41A 1BSIA 2VVNA 4DM2A 2OSYA 3ZOAA 2GDUA 3VX0A 2J25A 2VOTA 3ARTA 3GZAA 1FOBA 5A69A 3MU7A 2O9TA 3WDHA 2CKRA 3GXFA 2J7GA 1GOMA 3AMDA 5FOOA 3WUEA 4GI9A 5FCZA 1RP9A 1H2JA 3HN3A 2OWCA 3WL1A 2G3JA 5CG0A 1E40A 2DH2A 1I1XA 1ISZA 5F7UA 4GQQA 1HT6A 4H8VA 3WNLA 4JHZA 2CBIA 5CPQA 3PZ9A 1E6QM 3U5YA 5A6LA 1BF2A 5CPSA 1E55A 4FF5A 1N82A 1CPUA 5HDRA 4AD4A 5CLWA 4UNIA 2JFEX 4GI8A 1A47A 4XZWA 3CO4A 1QW9A 4W7UA 3QHOA 3UR7A 2VQTA 5M17A 1E70M 1UR4A 7CGTA 4Z2HA 1K9EA 5AYBA 2X05A 1W9PA 2ZUVA 2WMIA 2PC8A 2JF7A 1HJXA 3GXMA 4IISA 2HISA 3T0AA 4BQ4A 2G8ZA 3WNMA 4WSJA 3OA5A 2XVKA 1UKQA 2YBUA 3A6OA 1UD3A 2UY4A 1E15A 3BAWA 1GW1A 3WMBA 2PWFA 1G1YA 3AZTA 1R86A 3SCTA 2UWFA 2WMHA 3W4RA 4CVUA 1JZ6A 2OYKA 1GOOA 1OD0A 1WDRA 3AIUA 2VTFA 4BF7A 4MNMA 5D4YA 1HJSA 1KWKA 5DF0A 2ZXDA 1JAKA 2YOCA 1JIBA 3MUIA 3ZT7A 2W62A 4UQAA 1V6UA 4MB5A 1VAHA 1W91A 2HVMA 4PUEA 3VD9A 3ZT6A 2WW5A 5M03A 1TR1A 3T2OA 2OYLA 2F2HA 4JFWA 3TTSA 2UY5A 2YDQA 1KCLA 2XYLA 4TVCA 2FGZA 4R27A 1VRXA 3SCRA 4CD6A 4LYQA 3DYMA 4TX6A 1PIFA 4JZ5A 4KRUA 2X0HA 2X1IA 3CZEA 2XPKA 3CUFA 4JKKA 1R7OA 1PAMA 4A4AA 2A3AA 2O9RA 4HPHA 4JFSA 3MKKA 1TA3A 3WQ5A 4ACZB 1V0KA 1H0IA 4R5EA 1GORA 1W9BM 3WNKA 1V6XA 1KFWA 2V5DA 4GZIA 1VBUA 3EMZA 2EPLX 3T09A 5M5DA 3AIEA 1CGXA 4CN4A 2OYMA 3GBEA 3L4WA 4P7OA 1CGTA 5I24A 3AYRA 1E1FA 2J7FA 4D6CA 4GI6A 4QLLA 3IJ9A 3MSDA 4U2YA 1WCGA 1DP0A 1CTNA 2VCAA 1CIUA 3AJ7A 3DYPA 5E70A 1MW3A 1R7AA 1OBAA 3CUHA 2VCCA 1QHZA 4HA1A 1NOFA 2FGLA 1R87A 1ISYA 1VJSA 5A2CA 1W9XA 3TTYA 3L4YA 1QI4A 2OSWA 4CKQA 4PBGA 1WZLA 4UFKA 2YL8A 3FXYA 1W3LA 5ABFA 1UWTA 3AIVA 1NP0A 4IM4A 1EOMA 2VCBA 4JIEA 1F4AA 3AMCA 2RGLA 2CERA 5I5RA 4JAWA 1X1NA 3NJ3A 2EPMX 4OOZA 3TA9A 2XVPA 1JF6A 3O9NA 4DWSD 2J62A 3RDKA 4LYPA 1PJ9A 1TZ7A 4OBSA 3WD0A 2ZX8A 4AZBA 3VNYA 1J0ZA 2TAAA 1BYAA 1UH4A 4TVUA 1RPKA 1B3ZA 2ZXBA 3THCA 5CGTA 2D1ZA 3K4AA 1Q6EA 3A4XA 1HL8A 1DHKA 1WAWA 1CXLA 4E4PA 5ECUA 3OGSA 3EDDA 2ZUSA 4QLJA 2F8QA 3QOKA 4WKFA 3KWXA 3U5UA 3OG2A 3BH4A 1W1PA 3F4VA 1V6VA 2YDSA 1GZJA 3WDJA 3VU2A 1Q6DA 4EE9A 4AZCA 4TVDA 1BHGA 3FY1A 1SR0A 4L4PA 2Q8XA 1UR8A 2WZHA 2ZE0A 1QOXA 1KXVA 5D8ZA 5A95A 4HP5A 1EO5A 3W37A 1VB9A 4F9JA 5I77A 2XSBA 1D3CA 2WMKA 2V3DA 2VJXA 4UTFA 1F4HA 2WNWA 4PMZA 3J7HA 3VIOA 4AIOA 3CMJA 1HF6A 3T0BA 3OIHA 1DWIM 1FH8A 3D3AA 3APGA 4JFVA 1VIWA 5JH8A 3S2CA 1UWUA 3K8KA 3AIRA 1J11A 1HVQA 3OGVA 3ZJ8A 4D72A 5JBFA 1VF8A 1UA3A 1W9VA 3GXDA 3VGEA 3WF2A 1UR0A 2VNCA 1UKTA 1S46A 3AFBA 3OZOA 4QP0A 3AMGA 4XX6A 2BHYA 3GBDA 2JEPA 2J7DA 2EBNA 3WQ4A 3FNDA 2WLZA 2XJ7A 1HIZA 2G3MA 4WLCA 4KGJA 4MNLA 5C70A 5E9AA 4HOXA 3WIJA 2E8YA 3OB8A 1JZ4A 1AQ0A 5EFDA 3MUAA 3UG4A 2WPGA 3GDBA 2YLLA 4X9YA 5HPCA 1ZJBA 3VO0A 1E4IA 1G94A 3L4TA 3AS1A 3PTQA 1E4NA 2AAAA 4QFUA 1CZ1A 2VUYA 4D6IA 1UR2A 4U2ZA 3EMCA 4C7DA 4PCSA 2YIHA 4KRTA 2V3EA 1G0CA 4DWSC 1Z32X 2W61A 2YA1A 4E2OA 1C7SA 4M81A 3WF4A 2G4FA 4C7FA 3GXIA 1RH9A 2WMJA 1NWTA 1UH3A 3IJ8A 2XVLA 1WKYA 2E4TA 2PI6A 4CCEA 3VM5A 5A6MA 4Z2JA 4AD2A 5E6ZA 1W3JA 4MDPA 4W7WA 5A6BD 1MQPA 1EH9A 1X6LA 4U3AA 1TUXA 1XYZA 4J28A 2DSKA 3AIWA 3HMCA 1EDGA 2CNCA 3CMGA 2QF8A 1CEOA 3ZMRA 3ZIZA 1CGWA 3W38A 5A8OA 2WMGA 3WBEA 3FAXA 2ZUMA 4RE3A 3AQUA 1GQIA 2PBOA 2C7FA 1EXPA 2VRJA 4PUDA 4HMCA 3K1DA 4W84A 1EHAA 2IUZA 1KQZA 4U3CA 4ACYA 1EQCA 4TOQA 2BVDA 4GKLA 4NSBA 3L4XA 3KL3A 1KGUA 3D5HA 4W8LA 2A3CA 3CGTA 2PWGA 2WMIB 3ZJ6A 3PZIA 3VIKA 5A8NA 4W8BA 4Z2LA 3N1AA 1W1TA 2D0GA 2XHYA 5D9MA 1UR9A 3ZSTA 1XRVA 4M80A 1NOWA 3UCQA 2Y8KA 2J74A 4BQ5A 1B0IA 4Q7NA 5JBEA 1BFNA 2CXGA 2WSPA 3VGGA 4PSPA 2DSUA 3AROA 3RJXA 1ODUA 4MJ4A 3SUWA 1GJUA 1ESWA 1KBBA 1WDPA 3B9DA 2VX5A 3DECA 3PZMA 3CUGA 1U30A 2Y2WA 2BV9A 4GIAA 4ATLA 1M01A 1E6NA 2YLAA 2D0HA 5BRPA 4YHGA 5D8WA 2XGIA 4UQCA 5KZ6A 2WYSA 2O9OA 3CPUA 3I3BA 3WQ8A 1WP6A 4B15A 2D2OA 2ZUTA 1NH6A 3PZGA 2VZVA 3N17A 4UZUA 5HNNA 2D22A 2W66A 5EFFA 1LL7A 1B3WA 1W32A 2QMJA 1W3HA 4UOQA 4BZYA 2MANA 1MW2A 4P7NA 1UQYA 3N9KA 4XZBA 4UFIA 3ZO9A 4FLQA 4M24A 3ZM8A 3TTOA 3ARXA 5FKYA 2D3LA 3E1F1 5FD0A 1OGSA 3W29A 4WK9A 1MW0A 2WCSA 1ZU8A 2OLHA 1Q6CA 1V6YA 1GONA 5EB8A 1E5JA 1TA3B 3AXHA 3L4VA 3A4AA 5TD4A 3EDEA 4PTMA 4UQ9A 2WANA 1V0MA 2VX4A 3CZGA 5CXPA 1W1YA 4HZ6A 2ZUUA 1OWQA 3ARYA 2GDVA 3A47A 1E6SM 2XSAA 1C8YA 3CH9A 3VMPA 1C91A 1ISWA 3RMEA 4U31A 5A1AA 1UOKA 1ZS2A 3PHAA 1OCQA 1KBKA 3VIHA 3CTTA 4NRSA 1PZ2A 4AD0A 4NI3A 3OBAA 4W86A 1HKMA 3MV01 4UFJA 2J8GA 3N11A 5I6SA 2WK2A 2D3NA 5ABFB 3W6LA 4MPKA 1EGZA 1CENA 2J4GA 3EDJA 1J12A 4HPGA 3ARVA 4PMVA 1ZL1A 5A8MA 4KGLA 1D2KA 1KXHA 1TMQA 4LXFA 4UZSA 1UUQA 3QGVA 5ABHA 1MFUA 1B3VA 1IT0A 3AIBA 3VM7A 2VZUA 2J7HA 3AICA 1ISVA 2PB1A 1JNEA 2XTKA 4U5KA 1E3XA 4JL1A 4CN6A 1JD7A 4EK7A 3NSNA 1CBGA 2JALA 3LPOA 1JG9A 2D23A 1Q6FA 4D6JA 1PPIA 1FHDA 1JXKA 4OJYA 2VX7A 4UR9A 2E9BA 3RO8A 3II1A 3ZR6A 3TTQA 2V3GA 4ZXLA 3VIMA 4B16A 4KWUA 1V08A 1K6AA 3W53A 1AQHA 3POHA 4AZCB 4TUFA 4PYSA 3AXXA 3ARUA 3QHNA 2ZWYA 4PMOA 2GJRA 1C3FA 3KZSA 1NARA 3MANA 1WZKA 2ZX9A 3AIQA 4AZHA 1QPKA 2BHZA 2XFFA 2PWDA 2EEXA 3BLKA 2VR5A 4Z2GA 3UERA 2XFRA 2YL5A 3U7BA 5BCAA 3IANA 4JL2A 1MXGA 1XD1A 3AZSA 3BGAA 1CXEA 4NZCA 3MUY1 4PEEA 1V02A 4MDOA 4DWSA 1E1EA 2GFTA 4OIFA 1ZBKA 4D6FA 4GINA 4W5ZA 4LPCA 3WUBA 3U7VA 2XM1A 4YN5A 1U2YA 1XC6A 3AMKA 4CCCA 1QNOA 3F5KA 3VMNA 4PMQA 3T2QA 2YBTA 3SEPA 4CD8A 2Y4SA 3VIPA 4ZE5A 5I78A 2XM2A 1U33A 1OGGA 4CD4A 3AS3A 3WELA 1PX3A 1QHOA 3QR3A 3ZQ9A 4PMRA 2ZXAA 5HOSA 1JYNA 1W9UA 3PZNA 1DTUA 1UKPA 3GNPA 2XG9A 1PBGA 3VIJA 3MS8A 4PMUA 1FH7A 2BHUA 2VMFA 1M53A 3CZ8A 4J3XA 1GJWA 2CHOA 4D6EA 4AEEA 3ECQA 4H04A 1ZJAA 2Z1KA 2EXOA 4D6DA 3SUSA 3W28A 4URIA 2WCGA 1HVXA 1XYFA 2J8FA 3BSGA 3VTRA 2G3NA 1LG2A 1OM0A 1TFVA 2VZOA 3CHDA 1BAGA 2CBVA 1H1NA 1DEDA 1M04A 4EKJA 2CEQA 2WZIA 4HMEA 4AZ5A 3L4UA 3DC0A 2XUCA 2CHNA 2BXYA 4FLSA 1CGUA 1QI2A 3AHXA 2JF6A 2ZIDA 3KEHA 1TE1A 3RM4A 4DUXA 1LL4A 1E0XA 1BGGA 1MWOA 2QPSA 5A6AA 1HX0A 1UD4A 1W2PA 3W26A 4QLKA 3WD3A 1UD2A 1Y7VA 1JAEA 1J0IA 1NWSA 2J77A 2EPNA 1GVIA 3WF0A 3RIKA 3CIVA 4C7GA 4JFUA 3B9EA 4UQEA 2J7CA 4AISA 3OLDA 4GXPA 2WHJA 2BY0A 2BS9A 4M8UA 2YA0A 1KWGA 3SCPA 1OT1A 1Q6GA 1JZ2A 1E5NA 2FHBA 3GTNA 4P8WA 4UOZA 3RCNA 1TG7A 2A3BA 3PZTA 4V27A 3UETA 7A3HA 5DT7A 2DT3A 4AC1X 1E4LA 4ZXOA 3VGFA 3AOFA 1JI2A 2D24A 3UG3A 1JF5A 2VT0A 2A3HA 3WH5A 1E0WA 2FHCA 4XV0A 3VD5A 1LG1A 3CZLA 2YKKA 5A2BA 2XVGA 1K9TA 2X09A 3DYOA 2FH6A 5BXSA 3OLIA 5CLTA 3BSHA 2W5FA 4M56A 3VDCA 1UG6A 5GQBA 4AW7A 1R85A 3WFLA 2VR4A 1JYVA 5A6KA 5IDIA 5A6BA 4CU6A 1BLIA 1PIGA 2QV4A 4AD1A 1C92A 5IHSA 3WMSA 3ALFA 3ZR5A 5JBDA 3PN8A 1LF1A 4UFMA 4Z2KA 3WD4A 1EO7A 4LX4A 3VIIA 3ARSA 1JNDA 1OSEA 1US3A 3VMOA 5DEZA 1KB3A 2X2YA 1V02E 3W6MA 2DSVA 2CETA 4JKLA 4BCEA 1GHRA 2V3FA 4QAWA 5BROA 1G5AA 4AWEA 1E6PA 1Q4NX 3NDZA 5BWFA 4MB4A 3VPLA 4JCLA 5A8PA 3WFZA 4M29A 1MQQA 1XSKA 1WDQA 1B90A 4PRWA 4MADA 5HXMA 1VEMA 4WSKA 4Y7EA 3BLPX 3SCWA 5HBFA 1IZKA 7TAAA 3PZUA 4IPNB 3GNOA 1EIBA 3NUKA 3AISA 3WUGA 5GPRA 1BYBA 1EQPA 3GH7A 1GPFA 5LYRA 5IFTA 2WC7A 2JIEA 2WVVA 1G01A 5CZKA 1CGVA 5BYWA 3BAJA 3SCUA 3BCDA 5CSYA 4U33A 1HJVA 3FHAA 4PN2A 1QNRA 3PZQA 2XVNA 1B3YA 1XH0A 1QW8A 1V6WA 4IPLA 3W0KA 1DWJM 1V0NA 3B9AA 4D71A 2D0FA 3F5JA 3WQVA 2VC9A 4Z2IA 2NT0A 4BQ2A 2WKLA 5AYIA 3WY1A 1O7AA 4CU8A 1BYDA 4F66A 2WHMA 1GNXA 1UZ4A 3KL5A 4PMDA 2DT1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4CD5 A;  1GOI A;  4W89 A;  5CQ1 A;  4ACZ A;  1KXT A;  4HU8 A;  4ZE4 A;  5I0D A;  2E9M A;  2E3Z A;  1QNS A;  2Y24 A;  4BA0 A;  3SCS A;  4YHE A;  1JFH A;  1LLO A;  4PSR A;  3WEZ A;  5FL1 A;  1BG4 A;  3S6T A;  4FMV A;  1I1W A;  1VEP A;  4QDM A;  1AVA A;  3WH6 A;  1VFO A;  3AI0 A;  1UHV A;  3T08 A;  3AHV A;  1CGY A;  4FLO A;  1XSI A;  4W5U A;  4AD3 A;  1HKJ A;  4UQB A;  3L2L A;  5CGM A;  2EPK X;  2WCA A;  1UD5 A;  3BAK A;  3OLG A;  8CGT A;  4PCT A;  4AY1 A;  1FFQ A;  3WH9 A;  3NSX A;  3IAQ A;  4GPN A;  2GK1 B;  3CLW A;  2WC3 A;  2J79 A;  3MO4 A;  1CLX A;  1E6Z A;  1C8X A;  2FDM A;  1CLV A;  3BAI A;  1E4M M;  2JE8 A;  2WBG A;  1UKO A;  5BXR A;  4CN1 A;  3WEO A;  2BXZ A;  3GM8 A;  2CPU A;  3A4W A;  5E0C A;  4OUE A;  4D6H A;  1OT2 A;  2JIW A;  1KR1 A;  1LL6 A;  1M03 A;  1NWU A;  1CEC A;  4OZO A;  6CGT A;  1UWQ A;  1HKK A;  2Y8V A;  3CZJ A;  3WDP P;  1C8Q A;  1CXI A;  6A3H A;  1WB0 A;  3BAX A;  5I23 A;  1X6N A;  1WNO A;  1HP5 A;  4TTG A;  4WKA A;  2WWD A;  3WH8 A;  3VD3 A;  2QMK A;  1VEN A;  4MNK A;  1J0J A;  1QI5 A;  3AZR A;  4P8U A;  1ITC A;  3BMV A;  3VDH A;  1W2V A;  1FFR A;  4E8D A;  1HXJ A;  3DHP A;  2Y5E A;  1UZ1 A;  1VFF A;  1GUV A;  3MUZ 1;  4B3L A;  2J78 A;  4HA3 A;  1UYQ A;  1JFX A;  1XHG A;  2WLY A;  2GUY A;  3CZK A;  3N12 A;  3HU7 A;  1QVB A;  2DGA A;  2PWE A;  1DWG M;  3WBA A;  4H8H A;  4Q22 A;  4KMQ A;  4OKD A;  2AOS A;  4UQD A;  1XV8 A;  2PBG A;  2VL4 A;  4GQR A;  3AML A;  1GOK A;  4P7Q A;  2J47 A;  3SCV A;  1AMY A;  2BFG A;  5AC4 A;  1QNQ A;  1KXQ A;  2UY3 A;  1JZ8 A;  1E43 A;  1BQC A;  1CXK A;  1ECE A;  1H11 A;  2C0H A;  3AYS A;  3AHT A;  3RJY A;  3ZT5 A;  2UY2 A;  1V3L A;  2W91 A;  3L2M A;  3ZJ7 A;  2B31 A;  4S3K A;  4J3V A;  2IXU A;  4H2C A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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