4DWSB

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
540
structure length
527
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Chi2
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia entomophaga
total genus 190
structure length 527
sequence length 540
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsB01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsB02
1UR0A 2ZIDA 1AMYA 1C91A 3HN3A 1C8YA 2WVVB 1JF5A 1V6YA 3I3DA 4J3XA 4LYRA 1UR2A 3AMGA 4JKLA 4QLKA 1TCMA 1KXHA 1E6SM 4MJ2A 4JHOA 4GPNA 3VMOA 4OOZA 4ACZB 1GOIA 4C7GA 3AS3A 4AZHA 1GQKA 4CKQA 2VZTA 5BRQA 1BYDA 2J7FA 1CGXA 1GZJA 1CGYA 2VZVA 5BWFA 3WBEA 4PTMA 2VL4A 4W88A 2VUYA 3VX1A 2BY2A 1CYGA 1B1YA 2E8YA 1R8LA 1V3IA 4UQCA 5DFAA 4BQ3A 2ZXAA 4FF5A 4HU8A 1QHOA 4MB5A 2G3JA 1RD6A 1G01A 2PF0A 1A3HA 1FOBA 3TTSA 5LA0A 1VFFA 2ZWYA 5BYWA 3ZQ9A 3WD2A 1MW3A 2JEQA 1ISXA 3NSXA 1MWOA 3B8SA 3EDKA 4UZSA 3VD4A 1E3ZA 3MMDA 2NSXA 4JFWA 4PMZA 3PZVA 2ESCA 2ZUTA 1WO2A 3VNZA 4ZFMA 3PN8A 1UWUA 1E55A 2VURA 4H7VA 3KZSA 4JKMA 4JFSA 5CQ1A 1GW1A 2ZE0A 1PEZA 2PWGA 4RE4A 2D23A 1B2YA 1IV8A 1ECEA 4ZXOA 4UOJA 3CZGA 1E3XA 4TVDA 1JNEA 3WMSA 4ZXLA 1UZ1A 1NP0A 5JIWA 4UFMA 2D0FA 2GK1A 3GZAA 3GXDA 3A4AA 3W28A 3RM8A 1UWQA 4K68A 1GOQA 4ZE5A 2YLAA 4GI8A 5A3HA 1AQ0A 1W9BM 1W3KA 3OLEA 3AZRA 4GZEA 2JIEA 4PEEA 4CCDA 2XWDA 1YHTA 3S2CA 2WBKA 4NSBA 3M46A 4P7OA 2WMGA 1VAHA 3PTKA 4AMCA 4KGLA 5JBFA 5FL0A 1BTCA 3APGA 1ISYA 1U33A 5JUVA 4KH2A 3QHNA 3WN6A 1AQMA 1CEOA 1NOUA 3WKZA 2VT0A 3OGRA 1W9PA 1NP2A 2WWCA 2J77A 1B30A 2X8RA 4AYSA 1GOOA 1JNDA 2YA0A 3VGEA 5TD4A 4EK7A 1E0XA 3GTNA 4F66A 1V6WA 1JI1A 4OBSA 2XHYA 1K9EA 4S3KA 3AS0A 1OSEA 4BS0A 3K4DA 5M17A 1KGUA 2G3MA 2ZX9A 2VRQA 3ARZA 3UG4A 3VD7A 6CGTA 5BROA 1FHLA 1R7OA 3WNMA 5A6BD 4AD5A 4D6HA 2VQUA 3IJ9A 4M29A 1C93A 4L4PA 2YLLA 2XUCA 3T2OA 3N9KA 3SCVA 2DSUA 2CIPA 3THDA 2X1IA 3N1AA 3ZJ6A 1CXLA 5A6SA 2YOCA 2VNCA 2WVSA 1OM0A 2XFFA 4Z2GA 1B3VA 1DEDA 1GJUA 3SCWA 4UCFA 1PX4A 3W27A 4CVUA 3SCQA 4CD4A 3N17A 4PMVA 3U5YA 1QOXA 2JF6A 2OWWA 3SUTA 2VR5A 1J0YA 3CUFA 1B3YA 4M1RA 1J18A 4W7UA 2IXVA 3WF1A 3VILA 1GQIA 1UWTA 1JDCA 3VINA 3VO0A 4U2ZA 3WF4A 1SFSA 5JIPA 3WBAA 3NSNA 5E70A 1HJXA 4EE9A 2J7GA 3SUWA 1E70M 4P7NA 1M01A 3VDCA 3W37A 5ABHA 4AZBA 4AD2A 3TOPA 3OLDA 2E9MA 3ZT5A 3ARVA 2J4GA 4D6JA 2ZUWA 3UG3A 2UY5A 4GZJA 4W93A 3VIHA 4FK9A 4UQAA 3MV11 3ZJ8A 3CO4A 2V3EA 1TE1A 3I3EA 3AIVA 1NH6A 1XYFA 3T08A 3IAQA 3W25A 4YHGA 1Q6DA 2XGIA 5D8ZA 5E0FA 5E09A 1W1YA 3BAWA 1V0NA 3BH4A 3FW6A 4PTXA 4WSKA 4D6EA 4AWEA 4B9ZA 4J28A 4WF7A 1B0IA 2EJ1A 2DT3A 4JL1A 1HJWA 2D3NA 4LGXA 4CU6A 4QP0A 4E8CA 3ZSSA 1EHAA 1CGVA 1Q6GA 4HMCA 2YKKA 5HXMA 1JIBA 3WFLA 1O6IA 1FHDA 3RM4A 1UKOA 1V3JA 4HOWA 2IXUA 1H0GA 1UD4A 4KMQA 3MUZ1 5E6ZA 2WSPA 4HA3A 3MSGA 2A3BA 1VFUA 4UR9A 1UWIA 2DSKA 3W0KA 1E6ZA 4WIWA 1WDQA 1V3MA 4HOZA 1VEOA 1I1XA 2DGAA 4LXFA 1V6VA 4WKAA 3RJXA 3WDHA 4F9JA 1BSIA 5FKYA 2VCAA 1GVYA 1H11A 5D8WA 3CHEA 4CVWA 2BVDA 5CJ5A 3WF0A 3VIOA 2QMJA 1E6NA 4ATLA 4AY1A 4EANA 1OB0A 1V02E 4U5KA 1IZKA 2V3GA 1VB9A 4AEEA 2BXZA 1AQHA 3F4VA 2RGLA 4CN4A 2YIHA 4NZCA 1CENA 5BRPA 2A3CA 4PMUA 3SCRA 2IUZA 4XV0A 5D9MA 3CHCA 2VCBA 1VFMA 1WB0A 1TFVA 1E15A 2CESA 1JL8A 1UHVA 4MNKA 1W3HA 2YJQA 1Y7VA 3VIKA 3OIHA 3OG2A 4P7LA 5AC5A 6TAAA 1VBUA 2WCGA 4XZBA 5A1AA 2PWDA 1CXKA 1JDAA 1B3XA 1MQRA 2V38A 1DWIM 5A2BA 4Z2KA 1D3CA 4CD6A 1ODUA 3CLWA 1JZ5A 1W91A 1H4PA 1FP9A 2PWHA 3K8LA 1W9DM 5ABEA 3K1DA 1JZ8A 4UQEA 1B9ZA 3AMLA 5A6KA 1EA9C 4QLJA 1TVPA 2ZOXA 1UR8A 3KL0A 2G3IA 3BAKA 4U5IA 3U5UA 3BMWA 1LL7A 1ZBVA 3ZR5A 4KWUA 1HP4A 3MUIA 3SCUA 1E6QM 2Y24A 4BA0A 5CPQA 4HA1A 1UR1A 3WQ4A 4UZUA 2PBGA 1LG2A 4AZIA 4OZOA 2DIEA 4CD7A 4B3LA 5FD0A 4H41A 2Z1KA 2GJRA 4QCFA 3SCOA 1CZ1A 2BXYA 2PBOA 3FAXA 3VDAA 1W9VA 2WKGA 4B16A 3A47A 2W91A 4W8AA 1W9UA 1JGIA 3N18A 1EOMA 1HNYA 4L4OA 1PJ9A 1H3GA 3JUGA 4LYQA 5I3DA 5LA1A 1JZ3A 3AS1A 4RE3A 4DWSD 4CN6A 4PTVA 3DYPA 4PN2A 3MU7A 4B9YA 4IPNB 1YQ2A 1E4NA 4MNJA 1CGWA 2E9LA 2JEPA 2W63A 5EB8A 1N82A 4XZWA 3AHXA 1J12A 4H8VA 5GNXA 4HA4A 1JYVA 1BLIA 2CNCA 1OGGA 2J78A 1SMDA 3THCA 3I3BA 5ABFB 2OYMA 5M03A 2WCSA 1UA3A 4AW7A 2BS9A 3GDBA 3BSGA 2GDVA 3VPLA 1WNOA 3M6DA 3ECQA 1JF6A 1HT6A 1GORA 3PZ9A 3TP4A 4MDOA 1TA3A 2FGZA 1PZ2A 1XSIA 3LPFA 5KZ6A 4P7QA 3AIBA 4PYSA 1M04A 4GXPA 3L4VA 3N04A 2ZXBA 3QHOA 3FNDA 2XVKA 2PC8A 1KXQA 3WUBA 4LPCA 3L4WA 3F5KA 1ISWA 2WWDA 1UQYA 1KCLA 1H09A 3MV01 3BXWA 3CHFA 4AIEA 3BAYA 3WNPA 3ARRA 1A47A 1KCKA 1E0VA 1VRXA 1KWKA 2G3NA 2VVSA 3ZOAA 2GSJA 2YDSA 2W66A 1DHKA 3SCSA 2F8QA 1CNVA 2CEQA 1GQJA 3DYOA 3WEOA 1XD0A 4TXEA 3IJ8A 4Y7EA 2BY3A 2J7EA 1XGZA 4AISA 1GOMA 4OJYA 2EXOA 3WMBA 4CCCA 5JH8A 2F2HA 4FLSA 5C8BB 3SUVA 3CGTA 4U31A 3NCOA 2XPKA 2VR4A 3AROA 3W82A 1JZ7A 4U33A 3NDYA 1FH8A 2XJ7A 2WHKA 1FP8A 5LYRA 1UZ4A 3KWXA 3W81A 3MO4A 3VGDA 2QV4A 2D0GA 4D72A 3RILA 1PX3A 1ITXA 3M7SA 4D6FA 3VU2A 3PTQA 1HIZA 5FIPA 1VEPA 5AY7A 2G41A 1KR0A 2DIJA 3QR3A 4MJ4A 3CUJA 3GNRA 2J8GA 3ZIZA 4EKJA 4FMVA 1H0IA 1V3HA 1ZU8A 1H41A 2CETA 4UOQA 2ZX6A 2WLZA 4TTGA 4MNMA 2DPEA 2VI0A 1ZL1A 3F5JA 3VGFA 3CPUA 1SMAA 3IAPA 1JYNA 1WP6A 3PZTA 3PZGA 1LWJA 2XM2A 2XWEA 3WH8A 3VGBA 3ARPA 1J11A 1QNSA 3IJ7A 3O2LA 3LPOA 3UR7A 3MS8A 1OGBA 1WZKA 4ATDA 1E6RA 1Q6EA 2QPSA 3VMPA 3AMCA 2ZXDA 3G6MA 4YPJA 3EDFA 1SR0A 2XM1A 1TZ7A 5D9NA 3NYDA 1GCYA 1J0JA 2VX7A 1EDGA 1LG1A 1NOFA 2WMJA 2W5FA 1PX8A 2CCRA 5E6YA 3VIPA 2XYLA 1LJYA 4CUCA 3WH9A 1ISZA 2ZX8A 1DTUA 2Y8VA 3WEZA 1FA2A 2BHYA 3U7BA 2BHUA 4M81A 3HU7A 1OD8A 2UY3A 3K8MA 2EPLX 5CPTA 1J9YA 1KGWA 3DHUA 1ZBCA 3QGVA 3VUPA 3BLPX 2OSYA 2X09A 4B15A 2DQXA 1G9HA 3AZSA 3VIIA 2YA2A 1VEMA 2FH8A 1V08A 4H2CA 3RM9A 2D22A 1NQ6A 4NI3A 1DWHM 4YHEA 2CYGA 4CU7A 1US3A 2FHFA 5EBAA 1EDQA 3BSHA 1UD2A 2O9OA 3NSMA 1BGAA 1RP8A 2VOTA 1DP0A 2CBVA 4TVUA 4PMOA 2VO5A 1HN1A 2WMIB 3NUKA 4W5ZA 1EHNA 4A4AA 4GQQA 4UQDA 4XUYA 4Q7NA 1DWAM 3K46A 2J75A 1BG9A 1RPKA 1MVYA 3VGGA 2DEPA 3ZSTA 2GJXA 5BXSA 1QHZA 1V3KA 3WDIA 3WL1A 4CCEA 1U30A 3AXXA 3AS2A 4AZCA 1BF2A 4PUDA 2WW5A 4IUGA 3VD9A 1W9XA 2O92A 2ZICA 5GNZA 4J27A 3CIVA 3OGSA 1OWQA 1HJUA 2DT0A 5A2AA 5I5RA 1E73M 3NDZA 4MDPA 5IHSA 3SUSA 2Y4SA 2EQDA 4CD8A 2NW0A 3S6TA 1B90A 2W62A 3ZM8A 5CLTA 1E4MM 5IDIA 4CN1A 4MB3A 2CBJA 3UETA 1W1PA 2YL9A 2CHNA 4PMNA 4LYPA 3VX0A 2AMGA 4JFTA 2VMFA 2EPNA 1WCGA 2EPKX 3QHMA 3G6LA 1EQCA 1C8QA 4UFHA 2VC9A 1IT0A 2NT1A 3TTYA 1HJSA 5HPOA 2WKLA 3VIFA 3L4UA 1WDPA 1BPLB 3CMJA 3EMQA 1QVBA 3BCDA 1OT1A 4Z2HA 1W2PA 1NWRA 1QI3A 3T0AA 2G8ZA 5FOOA 5IXEA 1H5VA 2YBUA 5A8QA 2CKRA 2GJPA 2CERA 1LF1A 2DDXA 1UH3A 2WMFA 2DSWA 1HF6A 3L4ZA 4QFUA 4UFKA 5M5DA 2D24A 4D71A 2ZUSA 3WQ5A 4C7FA 3K4AA 2ZXQA 4AZ7A 4JFVA 5AYBA 1ZJAA 4WK9A 4D1JA 1BG4A 3WFZA 1ZB5A 2XFYA 5A8MA 2XIBA 2VJXA 3WDPP 1E43A 3LPPA 3GH7A 1UKPA 3A4XA 4HZ6A 4D6GA 2WVVA 3WL0A 2D3LA 1E9LA 4NF7A 2WVTA 4BQ4A 1EO5A 1W3JA 2F61A 9CGTA 5DO8A 1ESWA 3WQVA 4FLRA 5CSUA 2PWEA 1BVNP 4WJXA 1ZBWA 1ISVA 1C90A 1DWGM 5C70A 3EDEA 4HZ8A 4MB4A 4ACZA 1SYTA 2WXDM 2OSXA 1QI2A 4U2YA 4AD3A 2E0PA 1UH2A 3J7HA 2JALA 2TAAA 5A8NA 3EDDA 2WZIA 4FLOA 1H1NA 2UWFA 1V0MA 1M53A 2JIWA 4QDMA 1W3LA 1OT2A 1JAKA 1GPFA 3AIEA 4N0RA 4UFIA 1XSKA 1OIMA 3U7VA 2VCCA 1MW1A 3T0DA 2J7CA 1JXKA 4PMRA 4AD4A 2G4FA 3ARSA 1EGZA 3QOMA 1KB3A 4JKKA 4W86A 1NM9A 4DWSB 1AVAA 3QOKA 3VIMA 1OGSA 3ZJ7A 2CHOA 2DH3A 1PIFA 4D6IA 5FL1A 2V5CA 3VDHA 4V28A 8A3HA 5A6BA 2OYLA 2Y2WA 3MMUA 4URIA 4QCEA 3KL3A 4LX4A 4M82A 3BAJA 3VM5A 4J3UA 2X05A 1UA7A 2YDRA 3WD3A 2CBIA 1E1EA 4PCSA 4U3CA 3EBVA 1KWGA 4W8LA 3FY1A 3AIWA 3AIRA 2PWFA 3AICA 4DM2A 1KGXA 2A3AA 1E0WA 1X1NA 5CZKA 3PZQA 2PB1A 1UKQA 4A3HA 1CDGA 4PSPA 4HZ7A 2BY0A 3T2PA 3WMCA 1WZMA 3POHA 4YN5A 3O9NA 3VIJA 1F4AA 2GK1B 3RMEA 1ZBKA 4S3JA 3AHTA 2A3HA 4HMDA 2VQTA 1NOWA 2BNJA 4JIEA 3DYMA 1WZAA 1CXHA 2PI6A 1G94A 2BVTA 3W29A 1EXPA 1DWJM 3ZR6A 4J3VA 4F9DA 4GI6A 5I24A 5KEZA 2ZUMA 1G1YA 2J7BA 1OINA 1C92A 3CZKA 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 3M07 A;  1BQC A;  4Q22 A;  3FXY A;  1HVX A;  2WCA A;  1HKI A;  4W87 A;  3AYS A;  5EFD A;  2WAG A;  4Z2I A;  4GI9 A;  5I78 A;  1UWS A;  5GPR A;  1MW2 A;  4BF7 A;  3GH5 A;  3FHQ A;  5IFT A;  3W4R A;  1UG6 A;  2VZS A;  2W61 A;  1D7F A;  1PPI A;  4MTV A;  4JL2 A;  2FDM A;  4V2X A;  3K8K A;  5IFP A;  5AC4 A;  1J0I A;  1TR1 A;  3AZT A;  1Q4N X;  2E4T A;  1XSJ A;  2FH6 A;  2NT0 A;  4OBR A;  3WQW A;  1V6U A;  5LA2 A;  3SCT A;  1MFV A;  2AOS A;  3N12 A;  2O9P A;  3T0B A;  1UD3 A;  3AQU A;  4HU0 A;  4F8X A;  3IK2 A;  2XSB A;  2J7D A;  4PMQ A;  1X6L A;  2Y5E A;  3GYC A;  3POC A;  4U3A A;  3GM8 A;  3VKK A;  5I6S A;  1CEC A;  1XHG A;  5A2C A;  1E56 A;  3WSU A;  1JFH A;  2WHJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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