4DWSC

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
539
structure length
526
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGEIYLKSISEIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 184
structure length 526
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsC01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsC02
1VFFA 2VC9A 5E9AA 2VL4A 3PZ9A 5A8PA 2BVYA 3AZTA 4U2ZA 1G5AA 4GI8A 1K9TA 1OGSA 3ZJKA 1UD4A 4W84A 2JIWA 3VMNA 1FHDA 3DHUA 1NP2A 2UY4A 1ZS2A 3VDHA 2G4FA 4W5UA 4B3LA 1V6YA 4M80A 3CHDA 3WL0A 2O9RA 2XM2A 3SIMA 1GOIA 2C7FA 8A3HA 4IPNB 4W8AA 1J12A 3SCPA 1B31A 2OWXA 2PB1A 3DC0A 4W86A 2OYLA 1GHRA 4UFMA 3W81A 1VIWA 1B30A 1V02A 4DWSA 1MQQA 4PMVA 4V28A 2ZUNA 1GQJA 2DT3A 4OIFA 5BRPA 3GNPA 5BCAA 5IXEA 1PIFA 4PMNA 1JYVA 3TTQA 3SUVA 1W1TA 1C3FA 2DSKA 2J8FA 1BGAA 2HVMA 2ZWZA 1C92A 1V3KA 2FHCA 1ZBVA 4OOZA 1XRVA 3WD1A 3VDAA 4C7FA 4FF5A 1M04A 1NWUA 1ESWA 1LQ0A 4TTUA 3BAIA 1XC6A 2BXYA 3OGSA 3ZO9A 1H09A 5DT5A 4J3TA 5IFTA 3SCWA 1MYRA 3PZNA 3W38A 1MWOA 1WCGA 1VFMA 3WSUA 2ZOXA 2VZSA 4XX6A 4EAMA 4H2CA 4EANA 5M3WA 2DSUA 3WD4A 2G41A 3L4ZA 1CXFA 3OIHA 3KL3A 4JHOA 3LPGA 1VBUA 3CHCA 1GHSA 3D3AA 4W89A 1JF5A 2A3HA 2O9TA 1ISVA 3II1A 3VO0A 2JIEA 3BGAA 3W53A 4UNIA 4PBGA 4AXNA 3WQWA 5CQ1A 4PMRA 3WNKA 4JAWA 1XH0A 1OIMA 4AZ6A 4W8LA 4JHZA 3WMSA 1UWQA 5LYRA 5JBFA 2V3DA 1G1YA 1UH3A 3CZJA 1E6PA 4JKLA 4WKFA 1TVPA 3QHNA 2J8GA 3CUFA 3PZUA 5D9PA 5EFFA 1QHZA 5HPCA 1B3XA 2IUZA 1BLIA 2D22A 2CITA 2CESA 1U33A 2E9LA 1KQZA 1W3JA 4GQQA 2XWEA 3VNZA 4FLOA 1H1NA 5A3HA 1E6RA 4CD7A 3SUUA 2WVTA 3BAWA 1FFQA 4UOZA 3TP4A 2WHKA 1E71M 4C7GA 4S3KA 5GPRA 2ZE0A 4J3WA 2X8RA 4D6FA 4CU6A 2IXVA 5EMYA 1LF1A 7TAAA 1WZLA 2Z1KA 4GZEA 3AHYA 4FMVA 2GJPA 1NP0A 2WCGA 3A6OA 2ZX8A 1CXLA 1E4NA 2E4TA 4CCEA 3BMWA 2WHJA 4BQ3A 2VMFA 5CPSA 2BVDA 3KWXA 3VM5A 3W37A 2ZUVA 1CECA 4UQEA 3CUGA 1EDTA 4TTGA 3GBDA 2DSZA 5A95A 1G01A 1D3CA 1C93A 4LX4A 2DSVA 4DUWA 4WKAA 4P7QA 1W91A 1GOQA 1UQYA 2XVKA 2JFEX 4KRUA 2W5FA 1BYCA 1CPUA 1KBKA 1UR1A 5I79A 3ZT7A 2TAAA 4UR9A 1ISZA 2D0HA 2YL6A 2NSXA 4WKHA 4WF7A 1PJ9A 3AMLA 2DH2A 5CPTA 1BG9A 3FY1A 4BZYA 1QI4A 2WMIA 2PC8A 1Y7VA 1BG4A 4CVWA 1FHLA 1ZBKA 4H41A 1KQYA 1TA3A 3AHZA 2AMGA 3PZGA 4JZ5A 1E3XA 2DIJA 2IXUA 1NARA 3W4RA 3WELA 5M17A 3ZOAA 2WSPA 4EKJA 1JI2A 3UG4A 2QV4A 2XVPA 3OA5A 1J0YA 5FKYA 2O9PA 2D0GA 2Y8VA 4JFWA 2GK1A 4HZ6A 1BVNP 3E1F1 4NSBA 3BLPX 4PMYA 3ARQA 1TMQA 1JYWA 4PUEA 3BMVA 3UCQA 1JNEA 4CGTA 3PTKA 4PTXA 3AS0A 1HN1A 1KGUA 1VBRA 4W85A 3B9AA 5A1AA 3OG2A 2VRQA 2F8QA 4H04A 4NF7A 5LA0A 3VNYA 4ACZB 4W7UA 1NWTA 3EDFA 4GO9A 1G0CA 5GNZA 2WHLA 2BHUA 1NWRA 4JKMA 5AY7A 4MNJA 2UY3A 2W92A 1HP4A 3CZGA 1L0PA 1HVQA 2WLZA 4F9DA 3GH5A 3FAWA 2OSWA 3RPMA 4BQ2A 1E0VA 3MV01 1V6XA 3CHEA 5IHSA 3CUIA 6CGTA 4N0RA 3L4YA 1W1PA 5DT7A 3WBAA 4JCMA 3CTTA 1FA2A 3T0AA 5KZ6A 3AROA 3VM7A 3AS3A 2VVNA 1DP0A 2BS9A 1E0XA 3GTNA 5BROA 4J3UA 3AIUA 5C8BB 1HKIA 3IJ8A 4MNKA 3VKKA 3WL1A 3K8KA 2V3FA 2JF7A 1OIFA 1OT2A 1TUXA 1V6VA 4HOXA 1EHAA 3SUWA 4LPCA 1UWIA 2DDXA 1J11A 2J7HA 3THCA 2XM1A 3RILA 4F8XA 4JL2A 1GPFA 2FDMA 1JDCA 1FH8A 1V02E 3WF2A 2OWCA 2ZX7A 1KBBA 1XD0A 2A3EA 4OZOA 4D6DA 2VVSA 4PN2A 5D8ZA 1W9PA 3WEOA 2VO5A 4MNLA 2XTKA 3EDDA 4AZBA 1QPKA 2GDUA 3N11A 3UEQA 4WK9A 1MXDA 3MMUA 3BCDA 4AZHA 4EE9A 1Z32X 1W1YA 4TX6A 5A6LA 2E3ZA 1J9YA 2ZUSA 1GOOA 1XGZA 3U7VA 3SURA 1M53A 3F4VA 2CYGA 4HMDA 4GIAA 1ZBCA 2UY5A 3MS8A 4P8UA 4M29A 1WDSA 4QP0A 1JXJA 4W7WA 3ARUA 1WZMA 1CTNA 4U5IA 2WCAA 3VD5A 1JZ4A 3NJ3A 2VX7A 4KRTA 1OB0A 2WMHA 3AXXA 5CPQA 3MKKA 3GXMA 4JFUA 5LA2A 1IV8A 4CD8A 2DT2A 1PAMA 1TG7A 4AZCA 1JZ7A 5F7UA 1FP8A 3NSXA 3N18A 1CGXA 3DYPA 4D1JA 3KL0A 3ZM8A 4PSRA 2GSJA 4UFIA 3RM4A 5A8NA 1JXKA 2XFRA 2XSAA 4U33A 7A3HA 1CYGA 2VZOA 4JFVA 4QLLA 1OD8A 3TONA 2VCAA 1JL8A 5CLTA 4Z2GA 1E43A 3UR7A 4E8CA 1BPLB 3MO4A 1HKKA 3FXYA 4HA3A 4W5ZA 4NI3A 1UKTA 1XH1A 3S6TA 4QLJA 4E4PA 4IM4A 2ESCA 4M8UA 4JFSA 1EHNA 2D3NA 1DWHM 3POHA 1YHTA 2XJ7A 2GVYA 3WH8A 1AVAA 1QNSA 1NOUA 1CGTA 3QHOA 4MNMA 2VR5A 5E0FA 4Z2JA 3W6LA 2ZUWA 4MJ2A 5AYIA 1BGGA 1UWRA 6TAAA 1NOFA 3L4TA 2FHFA 5A6JA 1WAWA 4OUEA 4AY1A 3N9KA 1VAHA 2OSXA 1A3HA 2JF6A 3F5LA 2WZIA 4V2XA 1UR4A 3WD0A 5DFAA 2QMJA 2GJXA 4YN5A 4S3JA 3VD4A 4AISA 5A94A 3WNNA 1H4PA 1WE5A 5GNXA 1EA9C 1CZ1A 3CLWA 1UD6A 1DWJM 4ZENA 2VTFA 3GM8A 4X9YA 1UR8A 3W0KA 2CBIA 5CXPA 2XWDA 4RE2A 1M01A 3BSHA 1LG2A 3SUTA 2VCBA 3MMWA 1UZ1A 3VUPA 2J7CA 1KGXA 4P7OA 3SCQA 1GOWA 4HPGA 3VMOA 1QHPA 3LPOA 1GZJA 2VRKA 3NYDA 3AI0A 3POCA 1B1YA 1EOKA 4JL1A 1CXIA 4OOUA 3K46A 4TVUA 1OT1A 4PMXA 4AIEA 5A8OA 1RP9A 1H11A 5I77A 1QVBA 4EK7A 1C91A 2W67A 3VGDA 3D5HA 2AOSA 4Z2HA 1BYBA 2ZWYA 3WEMA 4B3KA 1US2A 1O6IA 3WIJA 1CIUA 1E73M 5A6BD 2EPMX 2VZVA 2DGAA 3N15A 1HVXA 5BYWA 1J10A 3WBEA 3WH9A 3CUJA 3GDBA 3VIGA 1GQIA 3L4XA 5A6AA 2YA2A 2CKSA 3WUBA 1PX3A 3K4AA 4JIEA 1A47A 3M6DA 2J7EA 1AMYA 5D8WA 4PTWA 2W63A 1JZ8A 1G9HA 2PWFA 3EDJA 4E8DA 2W4XA 2OYMA 4KGJA 1XSKA 1KB3A 3HN3A 3RIKA 1UWSA 1VENA 3T08A 4AEEA 4C7DA 4U31A 1MW3A 4CVUA 4PTVA 5KEZA 3WNLA 3F5KA 3VDCA 4ZXOA 8CGTA 2WMFA 3WQ4A 1BVZA 3WDRA 3AICA 3WUGA 2BHYA 2XGBA 2QPUA 1UG6A 3PZVA 1R7OA 2A3AA 4PTMA 2VUYA 3AHTA 3ARRA 2VR4A 5ABGA 4IUGA 1B0IA 1VEOA 1ITXA 3AIRA 1GCYA 1V0LA 4ATWA 4GINA 1WB0A 3VIPA 2WMJA 1JFXA 3DHPA 2OWWA 2XYLA 4MAZA 3CUHA 3ZJ7A 1Q6EA 3AYRA 3ARSA 2X0YA 3APGA 1W9BM 4AW7A 2VI0A 5I2UA 4DWSB 3AMCA 1GUVA 3WF3A 1H3GA 1LL7A 5D9MA 2CHOA 3B9EA 2EPNA 1DWIM 2Y5EA 3U7BA 4MB3A 3TTSA 1UA7A 3L2MA 3K8MA 1VF8A 3PTQA 3WD3A 1ECEA 3ZJ8A 3ARTA 1E0WA 3NUKA 5JH8A 3WDJA 5JBEA 3AMDA 3UERA 4AZIA 1NOWA 3IJ9A 4NRRA 1XD1A 5ECUA 2D3LA 3VTRA 1QOXA 1OD0A 2W66A 5A6MA 4WSKA 3WDIA 2G3JA 2OLHA 2VX5A 5JUVA 2ZXBA 1KFWA 3ARVA 4YHEA 4X0NA 5JBDA 2YOCA 4M1RA 2G8ZA 3WQ5A 4YPJA 3I3EA 3SCRA 3AS2A 3AFBA 1F4HA 3L4VA 1V0MA 3OGVA 1BYAA 5AC5A 3FNDA 3FW6A 4DM2A 4HPHA 1E56A 2J7DA 1F4AA 1E5JA 1VJZA 4AD2A 1BFNA 4LYPA 3WMBA 3VU2A 3AYSA 4AWEA 1UQZA 1YQ2A 5CG0A 2PI6A 1UR0A 1CGUA 3ZSTA 3PZMA 3SCOA 4JKKA 1VJSA 2V5CA 2HISA 3CH9A 3IAPA 1UKPA 2BY3A 4FLRA 3GZAA 1LG1A 1EQCA 1NH6A 3ZQ9A 3N13A 1KWGA 3WUFA 2WW5A 3OZPA 1JDDA 1Q6DA 3IANA 1AQHA 4MDOA 4OJYA 4J28A 1E4IA 3M46A 3WY1A 5FL1A 1Q6FA 2W61A 3MU7A 2EJ1A 1HX0A 4GI9A 2XUCA 1ITCA 4H7VA 3DYOA 2OSYA 4PUDA 1FP9A 3BCFA 4ML4A 1X1NA 3VIOA 2A3BA 3GXFA 1QI0A 2ZUMA 4AZ7A 1OSEA 1R86A 3K1DA 2XVGA 4MADA 4XUYA 2CERA 3A4AA 4R27A 3VIMA 5FOOA 5CSYA 3FHQA 4NZCA 4B16A 5ABFA 7CGTA 1Q6GA 5BXPA 1UKSA 4PMOA 3CGTA 3RM9A 2VT0A 3GXDA 1DEDA 2VZTA 3VD3A 4D6CA 2EPLX 1JAKA 1QI2A 3OB8A 1HXJA 1PBGA 1V3HA 1GORA 4MB5A 4HP5A 3WDQA 1E40A 9CGTA 3VOCA 3QOKA 1E55A 1MVYA 2CKRA 2J7GA 4OKDA 3SCTA 2C0HA 3VGHA 1JD9A 2WBGA 1AQ0A 3VX1A 3W28A 2QF8A 2DT1A 2YKKA 5M5DA 1PEZA 4M56A 2V38A 2UY2A 1H41A 3RM8A 1MQRA 3U5YA 3EMCA 1GNXA 1CDGA 3UG5A 2YDQA 1C8QA 3I3BA 5ABEA 2G3NA 5D9NA 2WMIB 3L4UA 3CPUA 4HOWA 3OLIA 2CEQA 1W9UA 5I0DA 1HT6A 4LXFA 4FLSA 2B31A 4LYRA 1BYDA 1B3WA 5HNNA 1V03A 3VILA 6A3HA 1E6XM 1NWSA 3WMCA 2EBNA 2V3EA 2XFYA 1C7TA 3WF0A 5A2AA 1UUQA 1CXKA 2J77A 5BXRA 2EEXA 2NW0A 3SCSA 4D6EA 3L4WA 2J74A 2WVVA 5EBAA 3K8LA 3DYMA 3O2LA 4MPKA 4CU8A 2G3IA 4OBSA 1J18A 3MSGA 4AYSA 1JYNA 3ECQA 5ABHA 3WH6A 1KR0A 2C8NA 4L4PA 4HU8A 3AS1A 3N04A 3IK2A 1JDAA 1JZ6A 2XPKA 3BAYA 1OGBA 3PZIA 3PZOA 1K9DA 2J7FA 3MUY1 1QI3A 5A2BA 2Y8KA 1RD6A 4U3CA 3M7SA 1UR9A 3O6AA 1W2PA 3KZSA 2NT1A 4UQDA 3ALGA 3DECA 1HP5A 4UZSA 1QW9A 2VOTA 2YDRA 2EQDA 1RP8A 5HOSA 4TUFA 4HOZA 4P8WA 4HA4A 3WUEA 3GNOA 3AIEA 1CBGA 5FIPA 3ZR6A 4L4OA 1K6AA 1EDQA 5CJ5A 4UQCA 2PBOA 1TVNA 3EBVA 2WSKA 4MDPA 1U2YA 4CN6A 3PZTA 5BXSA 2WVUA 3QHMA 4CD5A 1DWGM 4RE3A 2J7BA 1OCQA 5HPOA 3W29A 4J3VA 1IT0A 4W87A 5DEZA 1D2KA 1S46A 4W88A 3U57A 3LPPA 2ZXQA 3CMJA 4BA0A 4D6GA 5I6SA 3VPLA 2W91A 1E6SM 2ZUTA 2WKGA 4W7VA 1I75A 1R8LA 2DH3A 4GPNA 1D7FA 1JFHA 2WMGA 1QNOA 1B3ZA 1C8XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4DBU A;  3TN3 A;  1WDQ A;  4PB5 A;  1C8Y A;  1Q85 A;  1ZNN A;  4S3A A;  2BY2 A;  3TTY A;  1VYS X;  3W26 A;  1W2V A;  4HPJ A;  2KE0 A;  2FJU B;  3EXR A;  3DBN A;  3F2C A;  4AZC B;  1RAL A;  4QG6 A;  3BAN A;  3FVD A;  1M03 A;  2W9M A;  1I6N A;  1XLK A;  1X96 A;  3A47 A;  3AIB A;  1CLV A;  4JTQ A;  2FZN A;  4HK7 A;  3PN8 A;  1PCW A;  2J62 A;  1G94 A;  1J6P A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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