4DWSC

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
539
structure length
526
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGEIYLKSISEIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Chi2
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia entomophaga
total genus 184
structure length 526
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsC01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsC02
4WJXA 4ATDA 1YQ2A 1JZ7A 2YL6A 4AMCA 4LYRA 5I6SA 2W91A 2V5CA 5DO8A 3TTSA 1F4HA 4UTFA 3WELA 1M03A 2CBVA 2OWCA 2DH2A 5A95A 1QHZA 3SCPA 2O9TA 2DDXA 1GOOA 3AI0A 4IUGA 3WENA 1XYFA 2YDQA 1G94A 4AW7A 4B9ZA 4JL1A 4Z2GA 1GPFA 3ARVA 2VNCA 4AIOA 4UQBA 4LYPA 3QOMA 1CGWA 3VIMA 3VIFA 2EQDA 4PMXA 1HKKA 4GQQA 1OGSA 4MJ2A 5CLTA 3T2OA 3F5LA 1DEDA 1GW1A 1UD4A 1BYDA 4Z2JA 3CZ8A 4CCEA 5CG0A 2D0HA 1FHDA 2XTKA 4XB3A 3NCOA 1WNOA 1OT1A 3W6MA 5A6LA 1OD8A 1HN1A 2XWDA 3CTTA 1E40A 4PEEA 2QPSA 3NUKA 1H11A 5ABHA 1OCQA 1X6LA 4PMUA 1B0IA 1C3FA 4D72A 4UFKA 4MNKA 4OJYA 3W28A 4TX6A 1ZBKA 2X1IA 2BHYA 2QMKA 1R7AA 2WWDA 3WF4A 4V2XA 4XZBA 4JKLA 1JI1A 3WMSA 2J25A 2WZHA 4U2YA 1HX0A 1H41A 3CUIA 5A2BA 4RE4A 3SCQA 2VQUA 2CKRA 3WDRA 4BF7A 5A8OA 4LX4A 1NP0A 4WKFA 2YDSA 1JYVA 1AMYA 4TVUA 1BVNP 3AZSA 1G9HA 4PMNA 3RPMA 1N82A 4BQ3A 2ESCA 2J7HA 1LLOA 2CXGA 2G8ZA 1NP2A 4W89A 3UG5A 3S6TA 4W5ZA 3PZGA 3WD1A 3ZIZA 1A3HA 1RP8A 3DECA 3TOPA 1O6IA 4D71A 3N18A 4X0VA 4AD5A 2Q8XA 4MAZA 1E72M 1EDGA 1BYAA 1E56A 1XHGA 1VFUA 2Y2WA 2G4FA 3L4XA 1E6ZA 3GDBA 2W4XA 2VX7A 4F9DA 2WC4A 1US2A 1KFWA 1QHPA 2WCAA 2EPLX 2BS9A 2W5FA 3VM5A 1K9DA 1VFOA 4Z2IA 5A69A 1HP4A 3ALGA 2G3MA 1J0JA 1FOBA 3BGAA 2W63A 3KL5A 3N17A 4TTGA 4QDMA 1EO7A 3AHYA 5KEZA 1W3JA 3N11A 4XX6A 5HPOA 1KQYA 3IAPA 1PX3A 2DSVA 1QNSA 1WE5A 5FL1A 3SCUA 3BAKA 3VGHA 3CZKA 2UY2A 3VD3A 1E6SM 2CESA 1E71M 2WPGA 2XSAA 4AD3A 2WVUA 2WXDM 1CIUA 3ARPA 5E6ZA 4IISA 1VFMA 2ZX7A 3W0KA 4QLJA 1E4MM 1RH9A 2ZX8A 5I24A 3CZEA 1JZ6A 2XM1A 3BAIA 2CITA 3VKKA 4HOZA 3IJ8A 2PWEA 3U5YA 3QOKA 2AMGA 4NI3A 4CU8A 4IPLA 4UQDA 1CENA 2XVKA 1B30A 5CGTA 1BYCA 5JUVA 3MKKA 3AS2A 5A1AA 3E1F1 4RE2A 1R87A 1KCKA 4ZENA 2XVLA 2A3EA 1UH4A 1QBAA 1HVQA 4F79A 1HT6A 2E9MA 1VBRA 2QLYA 3WNMA 3L2LA 1LQ0A 4P7LA 1GUVA 1HNYA 2WHMA 2WMKA 4LXFA 3WSUA 3BMVA 4D6EA 3CO4A 1EO5A 1MW3A 3GNPA 3UERA 3WEMA 3ARWA 2XPKA 4M29A 3WF1A 1K9FA 8CGTA 3MV01 2ZX5A 1H5VA 2WYSA 3WD4A 5FCZA 3L4ZA 5C8BB 5FIPA 4HZ7A 4JIEA 1CWYA 1TA3B 1UWQA 4JAWA 1DWHM 3I3DA 3O9NA 1HJWA 5LYRA 1Q6CA 3AIUA 4YPJA 3WDPP 4MNLA 4PTMA 2DPEA 2PWHA 2WHJA 4H8VA 1VEMA 3M07A 3BCFA 4J3WA 4LGXA 5I2UA 2JE8A 5EB8A 3WMBA 2ZOXA 4UFMA 4PMZA 1MFUA 1BG4A 1BF2A 2BY2A 1V3MA 3QHNA 3VDBA 2YA2A 5JBDA 3GNOA 2VVSA 5IXEA 5BCAA 1OIFA 1NOWA 2Y5EA 3KL0A 3CHDA 1VAHA 2V3GA 3ZT7A 3F5KA 2EBNA 4UQEA 3GXFA 4HOXA 4AY1A 4TVDA 1PZ2A 1UYQA 2V5DA 1OWQA 2BVYA 3VIGA 1E15A 1MQPA 2VZTA 2XIIA 2A3AA 1ZJAA 1ZBCA 3ARYA 3S2CA 1UQYA 4AXNA 2D2OA 4JKKA 4RL3A 1W2PA 4CVUA 1JXJA 4FLRA 1XYZA 1LG1A 2J7FA 5CPSA 5CSUA 2WMGA 1JFXA 1JD9A 4ZXLA 1JZ5A 3GBEA 3EBVA 1V03A 4P8UA 2VJXA 2YJQA 4AIUA 2BY0A 4U5IA 1BTCA 3AS0A 4Y7EA 4F66A 4P7OA 1FFQA 3T0AA 4AYSA 3CUJA 4P8XA 2FGZA 2VRJA 3N04A 1A47A 2D24A 3W26A 1CGTA 5I77A 3THCA 2WBKA 4UOZA 4V27A 1UA3A 2MANA 4PBGA 3VVGA 3PTKA 3WFZA 3GTNA 3B9EA 2J7BA 2IXUA 2RGLA 4QP0A 4AEEA 1JIBA 1KCLA 4PMOA 3ZT5A 4MDOA 2WZEA 1MWOA 2XWEA 3FW6A 2GK1A 3DYOA 3RM9A 3GH5A 2Y8VA 2DT2A 1UR4A 2DIJA 1KGUA 4AZBA 4ZE5A 2IXVA 2DT3A 4L4PA 5BXSA 1WB0A 2X0HA 5D9MA 1DWFM 4PCSA 3SUTA 3WBAA 4HU0A 3RO8A 2UY5A 4MNMA 3VIHA 4JHZA 1ZU8A 1VFFA 4JFUA 4HPHA 1CTNA 2XUCA 1DP0A 1WP6A 2XVGA 3SCNA 3AZTA 3M6DA 3BH4A 4K68A 4AZ6A 2VO5A 5M5DA 4UCFA 5BROA 5I3DA 4JCLA 1BHGA 4FF5A 1XH0A 3BAYA 2FGLA 5ABGA 1HVXA 3AYRA 4WK9A 4LPCA 3VNZA 5I78A 2E0PA 2XFFA 4FLSA 1E70M 1M04A 5D8ZA 1ISWA 4YHGA 1AQMA 1QW8A 5CZKA 9CGTA 1OM0A 1RD6A 4W8LA 1OB0A 2XYLA 2CKSA 2PBGA 3O6AA 4Q7NA 5EMYA 3K1DA 4ACZA 1CLXA 3A4XA 1GOMA 4WLCA 2W66A 1V02E 2ZUSA 3RDKA 3PTMA 1B1YA 3N1AA 2CBUA 4OOUA 5AYBA 3SUUA 3L4UA 1UOKA 1OBAA 3WL0A 3PZVA 1W9PA 4CGTA 1CEOA 1Q6DA 5A6MA 2WSKA 1E0WA 1E6NA 1BVZA 1FP9A 3M46A 1XSKA 1C93A 1AQ0A 3AFBA 4U3CA 1GZJA 1UR2A 3OGRA 3SUSA 2D20A 2AOSA 3UR8A 1XC6A 1UWUA 2GDUA 2VQTA 2YBTA 1UKQA 1W1PA 1QI2A 3EMQA 1NARA 3AXIA 4HU8A 4CD7A 4M82A 1XH2A 1PX8A 1QNOA 3KZSA 2ZICA 2VRQA 4BQ4A 3N15A 2WLZA 4AZCA 1EOKA 1XCXA 3FAWA 2PB1A 1EDTA 3WNPA 1KXTA 5JBEA 1Q4NX 4IPNB 3ZJKA 3SCWA 2ZUMA 1WKYA 1J0KA 1BLIA 1JDCA 1V6WA 1E9LA 1V0LA 3IANA 1KXVA 4PN2A 4E8DA 3CUHA 3VM7A 3ZM8A 3AXXA 4PMDA 4HTYA 3GXDA 4D6IA 4XUYA 3F4VA 1GOKA 4B3KA 5CGMA 5TD4A 2WMIA 1UZ4A 1UR8A 1JL8A 1R8LA 3VGFA 1Z32X 1OIMA 2VZVA 5JIPA 1HKMA 4E4PA 3D3AA 1GQKA 4CVWA 4R5EA 1J11A 2Y4SA 2GJXA 4KGJA 2G3NA 2YL5A 4R27A 3BMWA 2GFTA 1WDQA 1G5AA 4ATWA 4J3SA 3W4RA 4UOQA 2J75A 4QAWA 4DUVA 1YHTA 1B9ZA 2WMHA 1X6NA 3DHUA 4M1RA 3WUEA 3U57A 1QW9A 4CKQA 2X09A 3FHAA 1ISXA 5EBAA 4UQ9A 4D6FA 2F8QA 5D9NA 5A8QA 3CUFA 1UKSA 3AHZA 4H41A 2E9BA 3II1A 2Z1KA 4FLQA 3AMLA 1E6XM 3VIKA 1HKIA 4F9JA 1JYXA 3N9KA 1SR0A 1VEOA 2G3IA 2XM2A 1AQHA 2ZWYA 3EDEA 1J0HA 3WDQA 1MQQA 1S46A 1LF1A 4UZSA 5JIWA 1E55A 1ZBVA 1IT0A 3B8SA 3ARSA 4WSJA 3L4TA 3NSNA 1GOWA 4GPNA 4AD0A 1ITCA 1LL6A 1D3CA 2EPOA 4AIEA 3EYPA 2CCRA 1RP9A 3VDHA 3AIBA 3NSXA 1XV8A 1JZ3A 1V3KA 4PTVA 1KXHA 3VUPA 1QNQA 1FP8A 1ISVA 3GH7A 1WDSA 4GO8A 1EOMA 4U31A 1JYNA 4W8BA 3UETA 3CLWA 5EFFA 1WO2A 3BSGA 4C7DA 4IM4A 1B3YA 3WQ5A 1KQZA 2A3BA 4PMVA 3J7HA 4W85A 3VNYA 3ZR6A 5DFAA 2BY1A 4AZIA 2O9OA 1ZBWA 3QHMA 1FH8A 3OA5A 1V6YA 4B3LA 1FHLA 1B3XA 3A4AA 1EHAA 2W92A 3W37A 4GI8A 1SMAA 4GO9A 2BHUA 3VPLA 2BNJA 3K8KA 1EH9A 3MUAA 1BSIA 1L0PA 3I3EA 4F8XA 2XVNA 1JNEA 3QR3A 2GK1B 4J28A 2ZXQA 4PSPA 1B2YA 1WZLA 3T0BA 2Y8KA 4QCEA 4WKHA 4UFIA 2VZSA 2E8ZA 3CMJA 4AC1X 4S3KA 4GXPA 5A3HA 5JBFA 2JF7A 2VT0A 1TFVA 2HISA 3VMPA 1C8XA 4GINA 5BXRA 3SCRA 2CBIA 2DGAA 3KE0A 5A8MA 1E4NA 1JI2A 1ISYA 1UD5A 4CD8A 4RE3A 3GH4A 3ZJ7A 2CERA 1W1VA 4CD6A 1PZ3A 3RM4A 1W2VA 1TZ7A 4YN5A 2EEXA 2XSBA 4KWUA 4UOJA 3EMZA 2WAGA 5AC5A 1V6UA 1E6PA 1WZAA 3WH8A 3CUGA 2GSJA 1V08A 2FH8A 1EQPA 1FH9A 3FAXA 1I1XA 2VUYA 3AIVA 1TVPA 4MTVA 1UH2A 5ABFA 2XGIA 3WH7A 1B3WA 3WBEA 3AROA 2CYGA 1V3HA 4PSRA 4XZWA 5A6KA 3TTOA 1E0VA 4JFTA 2VR4A 6CGTA 4ACZB 1E5JA 4M80A 4AZ5A 1QI0A 5DEZA 5FKYA 1C92A 3I3BA 1VIWA 3BC9A 3W25A 5JH8A 3DHPA 4J3VA 2J7DA 1MFVA 2TAAA 2WKLA 7CGTA 5M3WA 2AAAA 3WEOA 1F4AA 4GZEA 1TCMA 4AWEA 2ZUWA 4ZEPA 1ISZA 3WH9A 1DWGM 3FNDA 3WQ6A 3HMCA 4W7UA 3VIOA 4MJ4A 1IZJA 1NWSA 3UESA 1FFRA 4E8CA 4P8WA 4PTWA 3OLDA 1PPIA 4AEFA 3AICA 1E1EA 1KGXA 3WDHA 2DSUA 3T0DA 2FHFA 1BQCA 1FA2A 3K4DA 1C7TA 1H1NA 4LYQA 4ZXOA 3VGBA 2VI0A 3ARTA 1PJ9A 5CLWA 4EE9A 3W53A 2EJ1A 1JF6A 2DQXA 3EDFA 1LL4A 4TOQA 2ZE0A 3WEZA 2J4GA 2VX5A 3ARQA 4TXEA 1IZKA 1CNVA 3ZSSA 2J47A 3HJEA 1KWKA 4J3XA 1TMQA 1QI4A 4AZCB 4BS0A 3MSDA 5GNYA 2UY3A 4EAMA 2EPNA 4JFVA 5E70A 3MMWA 3THDA 4EKJA 1JD7A 3ZJ6A 1K9EA 3MMUA 3ZSTA 1GOIA 5E0CA 2YIHA 2BXZA 1GJUA 1M01A 2FHCA 3AIRA 4W88A 1X1NA 2VL4A 3RIKA 1LL7A 5E9AA 3VINA 1J9YA 4PUEA 1NWTA 4XV0A 2D1ZA 2DEPA 1GVIA 2BVTA 3FHQA 1ODZA 1VJZA 1W3HA 2WMIB 4PYSA 4H2CA 1MW0A 4EK7A 2XIBA 4B9YA 2YOCA 1KBBA 5BXPA 2PBOA 1JYWA 3VU2A 2GJXB 1ZJBA 3MO4A 2C7FA 3VTRA 3AS3A 2CPUA 2NW0A 3LPFA 4BCEA 2ZXAA 2XHYA 4DUWA 1W9BM 2FH6A 2WNWA 2DIEA 4HMCA 2V38A 3KEHA 3AXHA 4UZUA 1L8NA 1H0GA 1EGZA 2JALA 2ZXDA 2JF6A 3BLKA 2VURA 1UD8A 2WHKA 4LQ1A 4OIFA 4FK9A 1VEPA 1B3ZA 1E6QM 3EDDA 1E3XA 2IUZA 3D5HA 3NJ3A 4KRUA 4DM1A 1CXIA 4CN6A 4TVCA 2F2HA 4QCFA 5BYWA 2VX6A 4J3TA 4D6HA 3VILA 3WKZA 3VGDA 1CECA 4OZOA 4BZYA 3WIJA 1DWAM 2PWGA 5FD0A 3BXWA 3OBAA 1H3GA 3AHVA 3VIPA 2PWFA 4D6JA 2WLYA 3N12A 4MB3A 1WDPA 1XCWA 1W3KA 1JAKA 2O9PA 2CIPA 2ZXBA 1E73M 2QV4A 4GZIA 3EDKA 4WIWA 3DYPA 4P7RA 1EIBA 3BAWA 4JL2A 2DSWA 5BRPA 5DMYA 1UR9A 1P6WA 2VTFA 1UWSA 7TAAA 3CZLA 4UFHA 3B9DA 1HXJA 2F61A 3GXIA 3PZ9A 3UCQA 4WF7A 5A94A 5C71A 1BFNA 2VCAA 2DH3A 2OYMA 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 3PZU A;  2CHO A;  3ECQ A;  3G6L A;  4W7W A;  1US3 A;  4BQ2 A;  3PZO A;  3L4V A;  2WCS A;  6TAA A;  3VD7 A;  3CMG A;  2JEP A;  3K8L A;  1TA3 A;  3RM8 A;  5CJ5 A;  1H0I A;  1JFH A;  2XVP A;  1U30 A;  1Q6G A;  1NWU A;  1VJS A;  2WC3 A;  2DSK A;  1EHN A;  3AOF A;  1BG9 A;  3PN8 A;  1V02 A;  2HVM A;  1UQZ A;  1CBG A;  3CHF A;  3WUB A;  4PMY A;  3SCO A;  1E4I A;  1CXF A;  4MPK A;  3WH5 A;  2WWC A;  3A6O A;  4QFU A;  3AMG A;  3N13 A;  3OLE A;  4DUX A;  4V28 A;  3CPU A;  2J7C A;  4J7R A;  3ZJ8 A;  4P8V A;  1GHR A;  2QHA A;  2YL9 A;  2BHZ A;  2W61 A;  3AJ7 A;  2JIE A;  2WB5 A;  3U5U A;  5HXM A;  3AIE A;  3VMO A;  3AYS A;  5I0D A;  3VDC A;  1DHK A;  4MB4 A;  1MXD A;  2D0G A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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