4DWSD

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
539
structure length
532
Chain Sequence
PTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDKDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
molecule keywords Chi2
total genus 191
structure length 532
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsD01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsD02
3ZT6A 1JXKA 1UWQA 3NSXA 1LL4A 1NWUA 4FK9A 3SUVA 4IM4A 4MADA 4PYSA 3WBEA 1HP4A 4H8HA 4ATWA 2XJ7A 3RM9A 2ZOXA 4GI6A 3L4TA 1O7AA 1KBBA 4CVUA 2BV9A 1GHSA 3HMCA 4U31A 1CPUA 2WWDA 1UKQA 3RIKA 3DC0A 4WF7A 3CZKA 4TVUA 1JZ7A 1B30A 2GDUA 1V6YA 3GZAA 4V27A 1TUXA 3CHDA 4GIAA 2CYGA 3SCOA 5I5RA 2J7CA 1G5AA 2DSWA 2XTKA 4D1JA 1YQ2A 1QW8A 3THDA 1XRVA 3A47A 3AFBA 2VX7A 4YHGA 3SURA 8CGTA 1VBUA 2Y24A 4PUEA 1E0VA 1K9FA 2WPGA 4B15A 3EDKA 1ZB5A 2OSXA 1R7OA 2OWWA 1JYXA 3VMPA 1G0CA 1E3XA 1V0KA 1B1YA 5I23A 1FP8A 5GPRA 3ZJ8A 3W25A 1V02E 4EANA 3NIYA 5BXSA 3EDJA 1KCKA 4FF5A 4W8LA 5DO8A 3BCDA 3ZSTA 1ZBKA 3EMQA 5CSYA 1YHTA 4JL1A 4U5KA 5GNZA 5GQBA 1A3HA 2WWCA 3N15A 3T2QA 1UOKA 3VILA 3A4WA 2WC7A 1TA3B 3ARQA 2JALA 3FY1A 4GQQA 3WH7A 3VGHA 1V3HA 1R87A 1VJZA 2JF6A 1R8LA 1VFFA 2WCSA 5A1AA 2DH2A 2E3ZA 4P7OA 3PZNA 1JNEA 3CZJA 3VNZA 1UR9A 1QNSA 1ZS2A 4J27A 4CD7A 2XUCA 3AI0A 2PBOA 3LPOA 2FHFA 1UUQA 5ECUA 1UKSA 1OT1A 5BCAA 3VIHA 4C7DA 2DQXA 4IISA 2F8QA 2FGZA 2VZTA 5I79A 2W63A 1E3ZA 5ABHA 1LLOA 1UA3A 2CPUA 3OLEA 2C0HA 1KFWA 3W81A 1UH3A 2J8GA 1GQLA 1B3YA 1TVPA 3MV01 3G6MA 2IUZA 1UG6A 4N42A 1Q4NX 3OZPA 1KQZA 1VENA 3SCSA 1QOXA 4JFSA 3QR3A 1XSKA 2J79A 4EAMA 2DIJA 1E1EA 4N0RA 1C90A 3WUBA 5FD0A 5GNXA 3K8MA 3FNDA 1E56A 4UQ9A 2YL5A 1UR4A 2G3MA 1W1PA 1JZ3A 1TCMA 1LL7A 3WMCA 3CGTA 4HZ7A 2WCGA 3ARTA 4GQRA 5JUVA 3WDHA 1ZBCA 2XM2A 1E43A 3FN9A 4PMDA 2YA0A 2PWGA 4Q22A 4UQCA 4UQBA 5D9NA 3ZIZA 4J28A 4RL3A 1M03A 2BY1A 1JAKA 3BAKA 4AZ6A 2BY3A 3AMDA 1ESWA 2XVNA 1BFNA 2GFTA 4UFLA 2QMJA 4HU0A 2E8ZA 1E15A 1J01A 5BYWA 1S46A 3T08A 1XCXA 5DF0A 1J0HA 3PBGA 2FGLA 2WMKA 2UY5A 5CG0A 4W8BA 3VINA 1PBGA 2J7FA 5DMYA 3T0AA 1E6ZA 2OWCA 1IZKA 2VT0A 1LJYA 5DT7A 4PMNA 2D20A 4M8UA 2G8ZA 1OINA 3HN3A 3BSGA 3WL0A 4C7GA 4QCEA 2WZIA 1E73M 4AZ5A 1HJSA 3CHEA 4AZIA 1VJSA 4ZENA 5M3WA 2ZUTA 2YKKA 3IJ8A 3WQWA 5M03A 4MTVA 3DHUA 4AD1A 4F8XA 2PF0A 1K6AA 2OYLA 3BLPX 3APGA 1BVNP 3MUAA 2TAAA 1CXIA 1GOWA 1XSIA 1IV8A 3AJ7A 3WF0A 3VOCA 1C8QA 3FAXA 4AIUA 3A4XA 2QLYA 2Y8KA 4YHEA 3RMEA 4HA1A 5CPSA 1KGWA 5ABGA 1B3WA 3DYMA 4MPKA 5JBEA 1JL8A 4PMQA 4UQEA 1CXLA 4MB3A 5LYRA 1HVXA 1UH4A 3WF2A 4A3HA 3AMCA 2W4XA 4W93A 4UFHA 1E40A 2NT1A 4A3YA 2OYKA 3AOFA 3WSUA 4LYQA 3W82A 3VIPA 4R5EA 3NDYA 3VD7A 1D3CA 3WN6A 1UR2A 3IAPA 4V2XA 1QNRA 3CLWA 2E9LA 1QNOA 2W5FA 2ZX5A 4OIFA 1C8XA 5BXTA 2WHKA 3VM7A 4ACZB 5HXMA 5BXRA 1PAMA 1UD6A 5CJ5A 4CD4A 3T2OA 5E9AA 1HKJA 3ALGA 1FP9A 4PTMA 4NSBA 2YBTA 1OD8A 2QPSA 4FLSA 3POHA 3RM4A 1WZKA 4Z2LA 3AISA 5CXPA 1M7XA 3M46A 5DT5A 1JFXA 1W9VA 1VRXA 3TONA 4TVCA 2WVSA 5A3HA 4J7RA 2YDSA 1EOKA 2WKLA 3VMOA 2YLAA 1Z32X 1J0IA 1CECA 1V02A 2EBNA 2XSAA 2NSXA 4DM1A 1WB0A 2V3FA 2WHLA 4WIWA 3GXIA 2YIHA 4GZJA 1HF6A 2VX5A 2VVNA 1H09A 5D4YA 1MXGA 1Q6CA 1C93A 1EO7A 5BXPA 1UWTA 1E0XA 4M24A 3T09A 2J7GA 3GH7A 3VD5A 4XB3A 5A8MA 3WFZA 3GH4A 1GOQA 4AZHA 1ECEA 3MV11 1GCYA 2PBGA 3CZGA 1WDRA 3AZRA 4EKJA 1ZBVA 2G3NA 5JH8A 3VIGA 3SCQA 3TTSA 1ISXA 1MQRA 3VVGA 4WSKA 1BF2A 2CKRA 1HIZA 1J0YA 2VR5A 1LL6A 1QHZA 1VFOA 5EFFA 4UTFA 1R7AA 4W7VA 1MXDA 3F5KA 1QHOA 1GQJA 4P8VA 4QAWA 1WCGA 2QV4A 1EO5A 1EIBA 1B3VA 4UQAA 3AXHA 5JBFA 1E6QM 4W84A 1J10A 1N82A 3WUEA 3EMCA 1JZ4A 1US2A 5ABFB 2WSKA 3WD0A 4ZE4A 1HL8A 1AQ0A 1HJQA 3W37A 4MNKA 1QPKA 3IJ9A 1BYDA 2WZHA 5FIPA 1V0NA 3O6AA 4JFVA 3GNOA 3M07A 1BYCA 2J77A 2BNJA 3WNPA 3WMBA 2XWDA 1PZ2A 3CPUA 5F7UA 1QBAA 4MAVA 4UFMA 2CBJA 1MW0A 3W27A 4CD6A 2A3CA 3WDRA 3D3AA 1WDQA 3BMVA 3CTTA 3W0KA 2GDVA 3MANA 5HDRA 3AMKA 3SCNA 4AXNA 1WAWA 3BGAA 1MQQA 3AYSA 2DEPA 2E4TA 4D72A 2YL9A 2O92A 2CKSA 2PWEA 3L4XA 3OLGA 1CBGA 3F5LA 3WNMA 2WMHA 1IZJA 2ZXBA 2D24A 3CUFA 2GJXB 5ABFA 1RP9A 1CDGA 1HX0A 2XFRA 9CGTA 1RH9A 3BH4A 1E4NA 3WQ8A 1V0LA 3WD2A 4CU8A 3UETA 5HPOA 2WKGA 1WP6A 1OD0A 4AZCA 5IHRA 1CEOA 2UWFA 1JGIA 1I75A 1MW2A 1TR1A 1UD8A 4D6DA 2V3EA 2X1IA 1ISYA 3KL5A 4B3LA 2ZXQA 3W29A 4JKLA 1BTCA 1V3KA 2W61A 2ZX8A 1HJXA 2XIBA 4LYRA 4BZYA 3ZO9A 1XH2A 2V5CA 3N13A 1DP0A 4JKMA 1US3A 5ABEA 4Z2JA 1E1FA 3O2LA 4YN5A 4DWSC 1HKIA 4LX4A 4CN4A 3WDJA 2DH3A 3AZSA 4RE3A 4DM2A 4MJ2A 1UQYA 4CU6A 1QVBA 3VD3A 1MVYA 1VFUA 4W7UA 1QNPA 1GVIA 2GJXA 2AOSA 2CEQA 4FLOA 1WKYA 4TTUA 2O9OA 4UOZA 1NARA 3IAQA 4IPNB 2IXVA 3QOKA 4XX6A 4H8UA 1JYNA 4L4OA 2XFYA 4JCLA 4H7VA 1E5JA 1UD5A 2W92A 1M01A 2VX4A 4BCEA 1K9DA 1HKKA 3B8SA 1UKTA 2WSPA 3EBVA 2OSWA 3MMDA 4GXPA 3UERA 1FH8A 4U2YA 1KGUA 1TFVA 1NWSA 3NSNA 3I3DA 1ITXA 4M56A 2XHYA 2VRQA 3RO8A 2GK1A 1CGUA 3OGSA 2ZE0A 4AYSA 3B9EA 2JIWA 4PMXA 3RJXA 4IUGA 2FHCA 4OJYA 5E6ZA 2FH6A 1W1VA 1XH0A 2VZOA 3OGVA 4HP5A 5A8NA 3WEZA 1JD7A 5FKYA 5EBAA 1E71M 2BY2A 4U3AA 3WF4A 2Y5EA 1HNYA 3WH8A 3L4YA 1OSEA 4ML4A 1AMYA 1MQPA 3MSDA 4E8CA 4PRWA 3CUGA 2A3AA 2J47A 2DT1A 2VZUA 1XGZA 4NF7A 1PIFA 3AHZA 4QCFA 3OA5A 2PI6A 2WB5A 5D9PA 4HTYA 1Q6DA 2UY4A 2YA1A 5JIWA 2VCCA 1E6RA 4KH2A 4CKQA 1GNXA 3ZQ9A 4D1IA 2JEPA 1GUVA 1WE5A 3ARZA 4ATLA 1DHKA 3UR8A 4ZFMA 5E09A 4UZSA 2CERA 5IFPA 4AZGA 1HKMA 5IHSA 5C70A 2ZXAA 3L4VA 5E6YA 4EE9A 3SUWA 4LGXA 1FOBA 2VQUA 1V0MA 5FCZA 3PZGA 4FLQA 4W5ZA 1W9DM 1CXKA 3KWXA 3OGRA 3WQ6A 3NCOA 4QLLA 1HT6A 3BAIA 3WUFA 4D6HA 1EQCA 2WYSA 2YL8A 5M17A 3WH5A 1EHNA 1DWGM 3N11A 7CGTA 1E6NA 3K8LA 4S3KA 1W3JA 1VIWA 1ISZA 4HMCA 2F61A 3WH6A 2A3BA 4BQ5A 2JEQA 3SUUA 1UA7A 1E72M 4D6JA 1O6IA 4MB5A 3CZ8A 3O9NA 3PZIA 3BLKA 4FMVA 5HPCA 4ATDA 2W62A 4B9ZA 2VX6A 1TMQA 1CGTA 2G3JA 1W2VA 1Y7VA 3N12A 1TA3A 3QHNA 3PZVA 5I0DA 1LWJA 3T0DA 7A3HA 4MNJA 2WCAA 3AIEA 1VEMA 1JG9A 2CHOA 4MAZA 4DWSD 4B3KA 4CU7A 4P8UA 2DSZA 3T2PA 3L4UA 1NH6A 3GH5A 2OLHA 2BY0A 1PEZA 1SYTA 1AQHA 1EQPA 4CN6A 1HVQA 2XPKA 4PSPA 3VTRA 5A6KA 4J3WA 1C3FA 4Z2GA 2WHJA 1JFHA 5I6SA 4W5UA 1C92A 3ZJ7A 3GYCA 3HU7A 4HA4A 4NRSA 1CGWA 3BC9A 4HZ6A 3W4RA 3ZR5A 3CMGA 1UR0A 2EXOA 4JFWA 2UY3A 3PZTA 2HISA 3ARPA 1J9YA 1L0PA 3VX1A 3ZMRA 3UEQA 2OWXA 4OZOA 3BXWA 4OOZA 5IDIA 3AIRA 3BCFA 3T0BA 1CZ1A 1GOIA 1H41A 4B16A 5I77A 4NZCA 2D2OA 1GOKA 1NOUA 1VFMA 1NWTA 3SCWA 2CXGA 4Y7EA 2XSBA 3F4VA 1BLIA 5CGTA 1J11A 2XVKA 3AS3A 3W38A 1JZ2A 3TTYA 1H4PA 4F9DA 4PN2A 3DYPA 1WZLA 4CCCA 1B0IA 3BAJA 1H11A 3WBAA 1DWJM 2VUYA 3WD1A 4RE2A 1UWIA 2V3DA 2WLZA 3UG4A 1C8YA 3DECA 3WQ4A 2X8RA 1KCLA 2CCRA 4W89A 3W28A 2ZUSA 3I3EA 1EHAA 2XVLA 2D0GA 4DWSB 2EPOA 3AMGA 1KXHA 3VMNA 3VGBA 4QLKA 2J4GA 3GNPA 4UOQA 1MYRA 2D3LA 2BS9A 4AY1A 4H2CA 4WJXA 1X6LA 1EH9A 5D9OA 3WH9A 2X05A 3QHOA 3POCA 4B9YA 1U30A 2E9MA 2BFGA 4D6GA 1E5NA 2YOCA 3SCTA 3L4ZA 4XZBA 1GORA 3B9DA 4BF7A 1E6SM 1UWSA 3ZJKA 3CHCA 4JL2A 2FH8A 1CXEA 1CGVA 2EJ1A 3TP4A 4JKKA 2VCAA 1CIUA 4JFTA 7TAAA 1JZ6A 3HJEA 3WL1A 2JIEA 4BS0A 3KL0A 2XVGA 1Q6GA 2W66A 4H41A 3W6LA 1PZ3A 1XV8A 4X9YA 4UZUA 2EO7A 1U33A 2ZUUA 4HMDA 1E70M 2WBKA 2YJQA 5KZ6A 2WZEA 2O9PA 3L4WA 1FFRA 1QW9A 1LG1A 2X2YA 4KRTA 1PJ9A 1MFVA 1WO2A 3ARYA 3AIUA 1D2KA 4AC1X 1DWHM 1G94A 4U3CA 4DWSA 1H49A 1JDAA 2F2HA 1J0JA 4MJ4A 4P7RA 5CQ1A 2QF8A 4LXFA 3WDPP 1V3IA 3ALFA 1P6WA 4XZWA 2AMGA 3ZT5A 3RM8A 2WMFA 3MUIA 1K9EA 5LA0A 1XYFA 3N17A 2VURA 2WMGA 4ACYA 5A8OA 2MANA 3AIVA 3IJ7A 1W32A 1UH2A 4JHZA 1MFUA 3VD4A 1C7SA 1UWUA 1UR8A 3ARVA 1E6XM 4ACZA 1E6PA 2V5DA 2VCBA 3PZMA 5C71A 3GM8A 1XCWA 5D8WA 3RILA 1BYAA 3MUZ1 5A2AA 1BG4A 4J3UA 2DDXA 4JFUA 3U57A 1M53A 5A6MA 5E0FA 3AXIA 1JIBA 4MDPA 1KXTA 1QBBA 2J7HA 4Z2KA 2J7BA 4AEEA 4OBRA 4PSRA 3U7BA 1KB3A 1Q6FA 3WELA 3ZM8A 1CGYA 1WDSA 1CLXA 1G01A 1B3ZA 3ARUA 4PUDA 1OGGA 1ISWA 1BGAA 3AHVA 2C8NA 1W1TA 1UYQA 1QI3A 1W9UA 4CCEA 2ZUNA 1NWRA 1NP0A 2XGBA 4W87A 1PIGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3VU2 A;  3LMY A;  5GNY A;  2GSJ A;  2RGM A;  4PTW A;  1CGX A;  1PPI A;  3WEO A;  2EPL X;  2PC8 A;  1CXH A;  4MNM A;  2V3G A;  2VTF A;  1CWY A;  6TAA A;  5I78 A;  3PHA A;  5HNN A;  1V6V A;  1D7F A;  1OT2 A;  1G1Y A;  3KE0 A;  1W9B M;  3CO4 A;  1ZL1 A;  2ZIC A;  3W26 A;  1J0K A;  1JF5 A;  2DSU A;  4PMV A;  4PMO A;  1R86 A;  2WK2 A;  2GK1 B;  5A94 A;  4QDM A;  2JFE X;  4XV0 A;  2XG9 A;  1JXJ A;  1H3G A;  4PBG A;  2D1Z A;  1DWA M;  4KWU A;  2J74 A;  1C7T A;  4W88 A;  3WD3 A;  3SCP A;  3AIC A;  3VIK A;  3VIJ A;  2J62 A;  2VVS A;  6A3H A;  2HVM A;  4KGL A;  3ARO A;  3CZE A;  3PZ9 A;  1H0G A;  3N04 A;  1CYG A;  2Y2W A;  3CIV A;  3AML A;  1X6N A;  3EDD A;  5CLW A;  3VIF A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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