4DWSD

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
539
structure length
532
Chain Sequence
PTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDKDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Chi2
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia entomophaga
total genus 191
structure length 532
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsD01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsD02
5M17A 1XCXA 1E40A 5BCAA 1K9TA 1PEZA 3LPOA 5KZ6A 3GXIA 1B1YA 5JH8A 2W5FA 4ZXOA 2PWEA 1CGVA 1EHNA 1RP9A 2FHBA 1E4IA 4DUVA 1V3IA 2ZX5A 3GH5A 2G3NA 3EBVA 2IUZA 1DTUA 3HJEA 3VVGA 2WC7A 1WDQA 2OWCA 1KR1A 1QNRA 1X6LA 3MMUA 1MFUA 3WDRA 1HNYA 1PIGA 1GOKA 3MV11 1OM0A 3UG4A 4E4PA 1DWIM 3W0KA 4D6IA 3EMZA 2D3LA 1ZBCA 1HVXA 1UWQA 1GCYA 4F9DA 5I5RA 3VD4A 3T2QA 4TVDA 4BS0A 4M1RA 5IHSA 2XM1A 3N04A 1ZB5A 1XD1A 4QAWA 5I2UA 3VNZA 4QLLA 3TP4A 1Q6DA 3RJYA 4L4OA 1GQLA 3KL3A 1MYRA 1B3VA 3WQWA 3OLEA 1LLOA 4H8UA 4TUFA 1C90A 2VTFA 2X1IA 1PZ2A 1AVAA 4M81A 1EO7A 2G3JA 1E1EA 5JIWA 2TAAA 3KL5A 1GVYA 1BVZA 4P7OA 3I3EA 2YKKA 1CYGA 4D72A 4DUXA 1ODZA 2V3FA 4D6GA 5E0FA 2J7GA 2XSAA 5CJ5A 2DH2A 3BCFA 3PZUA 4ZXLA 5IFPA 1VEOA 1NWRA 5A2CA 1VJSA 2BVYA 2VOTA 4HA4A 2DSKA 2YBUA 5D9NA 3ZR5A 3CIVA 1E9LA 4D6CA 3GNOA 2A3HA 5IFTA 3IAQA 4KRUA 2CKRA 3MSGA 3RPMA 2WSKA 1W2VA 1IZJA 4BZYA 1VFFA 1B30A 1CGYA 1KQYA 5CZKA 3WF3A 1HJWA 3FW6A 4P7LA 4OJYA 4PMDA 3L4VA 1XYFA 4W5ZA 1XH0A 3CZJA 2EBNA 2YLLA 2VX6A 1GJWA 4W7WA 4HTYA 4TXEA 3TA9A 2WB5A 3GNRA 3WFLA 2WZHA 1V6UA 3RDKA 5DMYA 3MUZ1 1W32A 5A8NA 3WD1A 4AEFA 1E3XA 2PBOA 3EDFA 3MSDA 3EMQA 2CBVA 2C8NA 1W9XA 4QCEA 3T0DA 3BAXA 2JFEX 2WVTA 3FY1A 3F5LA 4TX8A 1ISXA 2G41A 3WD4A 3WH9A 1OD0A 3OZPA 2BFGA 3BXWA 3W25A 1UG6A 3G6LA 3TTQA 1W9BM 1OBAA 3VOCA 1WO2A 4HP5A 3WEMA 2FH8A 3ARZA 3WDPP 4HMEA 2NT1A 3O9NA 1UD5A 4W8AA 1L8NA 1JYVA 2YJQA 2OSYA 2BHYA 4J3XA 3AIEA 2IXUA 3SURA 3WFZA 3VMNA 2D0FA 2UY4A 1ZU8A 2VRQA 3VDCA 2VZTA 2OWXA 2E3ZA 2EPOA 5M5DA 3WF0A 2J8FA 3WEOA 1C93A 1GQKA 2WC4A 1HKJA 3UG3A 3AIQA 4AD1A 5E70A 3BAWA 3SEPA 3AYRA 5DT5A 1JD7A 1RPKA 2DGAA 2YL5A 3VM5A 3WKZA 3EMCA 2XVLA 4WSKA 2WWCA 4JKLA 4LQ1A 4CU6A 3WH8A 3GBEA 2BS9A 4A3YA 1DWAM 1QI5A 4M8UA 1VEMA 5A6MA 4XV0A 2J62A 2Y8VA 2VZUA 1QHOA 3DYPA 2J77A 4KH2A 1VFMA 1KXHA 5JBDA 3CLWA 5ABEA 1J12A 1V3HA 1SR0A 1EHAA 1JIBA 2DPEA 2YA2A 3EDJA 3BH4A 2Y2WA 3MV01 1WPCA 1H5VA 4ACZA 1LL6A 6TAAA 2D0GA 4YPJA 5FCZA 1EOMA 1Y7VA 3NCOA 4PUEA 1UZ4A 3B9EA 4CU8A 4WK9A 1UKTA 1JG9A 3PZTA 4OOUA 4FLRA 3PZIA 4ACYA 1E56A 1MQRA 1QHZA 1UH3A 2CITA 4Z2JA 3GYCA 2WMHA 2JIWA 2DT2A 4AZCA 3S6TA 3MMDA 2ZX7A 3CHFA 2HVMA 4MB4A 3PZGA 2PI6A 4OBSA 5FL0A 2J47A 4Q7NA 4J3TA 2DSZA 5A6KA 1ZBWA 1VEPA 4M82A 5I77A 3WQ6A 5CGMA 2WM0A 2EPKX 2VJXA 4EAMA 1BYAA 3CH9A 4N42A 3L4WA 1XSIA 3BAKA 2DIJA 1EXPA 4GIAA 4KMQA 1UA7A 3CGTA 3SCQA 2Y4SA 4QLJA 5A6AA 5I6SA 2CBJA 2XG9A 1XC6A 3AQUA 4JL1A 2QLYA 3GZAA 1NOWA 2JF6A 1OGSA 2W61A 2PWDA 4U5IA 4PRWA 2VT0A 1DWHM 2W67A 4UOJA 5TD4A 2FHCA 3FHQA 3ZSSA 1GOMA 4PSRA 2HISA 1V6VA 4J28A 1VENA 4WKHA 1WCGA 3W27A 4FK9A 3AMDA 1HP4A 1JI2A 5D9PA 1GVIA 1DWFM 1MVYA 1ZJAA 2ZWZA 1JZ7A 4W84A 4UFLA 4Q22A 3NIYA 1ZS2A 1HL8A 4GQQA 3DC0A 1JZ4A 3WUEA 1W9DM 4ML4A 1JI1A 3WQ8A 2BY2A 1PPIA 5JBFA 4GKLA 3CBWA 3APGA 1GONA 3RJXA 1AQMA 1TFVA 4W88A 3J7HA 3TOPA 3ZT6A 2YA1A 3GH4A 5I23A 1NM9A 4CVWA 2J74A 3W53A 3BAIA 4PCSA 3CHDA 1H1NA 2GK1A 4V28A 2ZUWA 1ISWA 2Y24A 4PMXA 1UH2A 3AICA 1M7XA 2D22A 4P8XA 1TVNA 6CGTA 3OA5A 2XIBA 3ZSTA 3NJ3A 1H49A 2VR5A 1BPLB 4DM1A 1QI0A 1I75A 9CGTA 4HA1A 1ZL1A 4JCLA 1HKIA 2YL6A 3O2LA 1JNEA 2NSXA 4B9ZA 1V08A 4YHGA 4AWEA 3A4XA 2WZIA 2WHMA 3W24A 3WQ5A 4XB3A 2DH3A 5EFFA 1FA2A 3AZSA 4PN2A 3VD3A 2VO5A 4Z2KA 4WJXA 2VVNA 2QF8A 3CUGA 1HF6A 3WNKA 2X09A 3EYPA 4JFWA 4MB1A 1B2YA 2J7CA 1V02A 4F79A 2PF0A 1AMYA 5FD0A 1C8XA 1WZAA 3E1F1 3ARTA 5A8MA 5M3WA 2ESCA 1U33A 4NI3A 1X1NA 3KL0A 2VQTA 3PZVA 1Q6FA 2XVGA 4F66A 2BNJA 4YN5A 1VB9A 3VIHA 4HOZA 5BXSA 1FP9A 4BQ5A 4X0VA 2PWFA 4LPCA 2DT3A 4JKMA 1HJUA 4P8VA 1KGUA 3WNOA 2W4XA 1EH9A 3SCOA 5E09A 1W1VA 5A6BA 3ZM8A 4IUGA 3CO4A 2UWFA 2W91A 1JAEA 4CD7A 3LPGA 1KGWA 2VX7A 4K68A 1UYQA 4CCEA 2BVDA 3K4AA 5BXTA 1E6XM 2VCAA 1R86A 1XV8A 2VRJA 2QMJA 2DSUA 1MW2A 4MPKA 4PEEA 1WNOA 4X9YA 3SUTA 1WAWA 1ITCA 1FH9A 5CLTA 4HMDA 1UD2A 1WDSA 1VIWA 1QVBA 1XGZA 4GO8A 5ABFB 1CENA 5DO8A 4AD3A 3PZMA 2Z1SA 3VKKA 5GNXA 2ZIDA 3AXIA 3WENA 4KWUA 3N11A 3T08A 3FHAA 2D2OA 1HN1A 2G3MA 1E15A 3ARSA 1E0WA 4PTXA 1CLVA 3FXYA 2WCAA 1US2A 2DEPA 1DWJM 2ZXQA 3SCPA 3SCNA 2PWHA 1TVPA 2V38A 4WSJA 5BWFA 3VIGA 4RL3A 4RE2A 1CBGA 3VDHA 3KZSA 2J7FA 3WBAA 4AXNA 3OGRA 1LF1A 3KE0A 4W7VA 4HPHA 1BF2A 3WNNA 3ALGA 1UWTA 5CPQA 3G6MA 1E1FA 2CEQA 3AHTA 3WY1A 2G4FA 3QOMA 2Y5EA 5LA0A 1G9HA 4W87A 3CHEA 3AI0A 2VUYA 3L4YA 1DHKA 3CHCA 3ARPA 1PZ3A 3S2CA 2WHLA 1H0GA 1OIMA 1QNSA 2QMKA 1ZBVA 4AZGA 1W1TA 3CZGA 1V6YA 3VGDA 3SUVA 4ACZB 3WH6A 3L4XA 3N18A 1XSJA 2J7DA 3PN8A 1K9FA 5A2BA 1WP6A 4J3VA 4UQCA 1NWTA 4W85A 2EO7A 2J79A 2CETA 4AISA 5A8OA 1E4NA 3W38A 4MB5A 2RGMA 1NH6A 5HXMA 1J18A 1HP5A 2WBKA 1CGUA 4NF7A 2Y8KA 2ZUNA 3RIKA 2O9RA 1Q6EA 4L4PA 2DSVA 1J0KA 4BQ3A 2W62A 2WZEA 4BF7A 4MJ2A 1BQCA 3N17A 3NDYA 2CCRA 4AZCB 1TG7A 3PZNA 1RD6A 2CIPA 4H04A 1F4AA 3T0AA 1V3MA 3OZOA 4ZENA 4RE4A 5I0DA 1VFOA 4MNLA 3PHAA 4CN4A 2MANA 2XPKA 3VTRA 3K4DA 3WF1A 1CIUA 4NSBA 3FNDA 2G3IA 3F4VA 3AMLA 4EANA 1QHPA 3VGFA 1GHSA 4H7VA 3AFBA 1HT6A 3AMCA 1H11A 4P8WA 1Q4NX 4IPNB 2UY5A 5CQ1A 1OB0A 4B3KA 3CZKA 4XZWA 3DYOA 1SMDA 4WKFA 2OSXA 5BYWA 4JZ5A 4PYSA 1C91A 4GZEA 4WF7A 4EK7A 5I24A 4DWSA 3ARWA 1KGXA 1P6WA 4MNKA 2BV9A 2WMJA 3TTSA 4AZBA 1XSKA 3VGBA 1VBRA 1TCMA 4TTGA 2GUYA 1B3YA 3IK2A 2V3GA 5AC5A 2F8QA 1KBBA 3RM8A 4GINA 1GJUA 3UEQA 1A3HA 2PB1A 2WHKA 3CPUA 1A47A 1H2JA 4P8UA 3AYSA 4Y7EA 1E0VA 2YA0A 5LA1A 1WZLA 1OT2A 2CNCA 1W1PA 4P7QA 5GNZA 3AIUA 5M03A 3PZOA 3BSGA 1XYZA 4A4AA 2RGLA 4JFVA 1V6XA 2WMKA 3A6OA 1QW8A 3MANA 2DSWA 2VZSA 3UCQA 4FMVA 1I1XA 1OD8A 1JDCA 4AZIA 3T09A 4HZ8A 1WDPA 2XVNA 3I3DA 1UWUA 5A8QA 2VZVA 4UNIA 1J01A 4UFIA 4UQEA 3WUGA 4TVCA 1TR1A 3MUIA 3QHOA 4PUDA 1ISVA 2GK1B 3N15A 2VCBA 1V3LA 3T0BA 2BVTA 3WD3A 3LMYA 2WCGA 5CG0A 4UQ9A 2O9PA 3OLDA 2VZOA 1DWGM 3VPLA 4GI9A 3L4TA 4LYQA 1ISYA 1MXDA 2DT1A 1M53A 2V5CA 3K8LA 2XSBA 1C7TA 3MUAA 5D8ZA 5BXRA 3W6LA 1NWUA 2JE8A 3VO0A 1BVNP 2IXVA 3VIOA 4OIFA 3II1A 2W63A 3AMKA 1B31A 1HXJA 4B9YA 4FLOA 1UA3A 1UKQA 3VU2A 7TAAA 2CBIA 3CUJA 3AOFA 4JFUA 1TUXA 3VIKA 5EBAA 4J3SA 3L2LA 7CGTA 1US3A 4HPGA 4PMNA 2G8ZA 3L4UA 2ZUSA 4HZ6A 3A3HA 2QV4A 5A6BD 2YL9A 4XX6A 5A6JA 2E8YA 2DQXA 4WLCA 1O6IA 1UKPA 2J75A 2CBUA 3U7BA 2XFYA 3WNPA 2VI0A 2ZICA 2ZUVA 3IJ8A 1W2PA 3AMGA 4ATWA 4MDPA 1BYCA 1QNPA 4GZJA 4AYSA 3F5JA 2EXOA 1UD4A 1SYTA 1J0YA 2ZXAA 3FAWA 4D6EA 4AIEA 1VBUA 2BY3A 3GH7A 5CGTA 2XUCA 1UZ1A 1M03A 4AZ5A 3T2PA 1MFVA 4MDOA 2XWDA 4CN6A 4UFMA 1CXFA 3ARUA 1J0JA 3KWXA 1E5NA 1H4PA 3N13A 2CPUA 2OYKA 2V3EA 1V0LA 4E8DA 3AHXA 4A3HA 1JDAA 3WUBA 1QI3A 5GPRA 4W86A 2WANA 2FGZA 3NSXA 5CPTA 4AEEA 3BLKA 3NDZA 4PTWA 1G01A 5IDIA 1HJSA 1BG4A 1FHDA 3KEHA 3UESA 1XH2A 2O9TA 1E71M 2WYSA 2WMGA 2XFRA 2YBTA 1CXHA 4PMQA 4JHOA 1BSIA 4TVUA 1C8YA 1GQIA 4OBRA 4GI8A 4UFJA 5ABGA 1MQQA 1G0CA 3VM7A 1DEDA 1KWGA 1LL4A 3THCA 5ABHA 1J0ZA 2JIEA 3OG2A 1HKKA 1JNDA 3VIPA 1E0XA 1TZ7A 2WVVA 4W7UA 2AAAA 2AMGA 4FF5A 1F4HA 3WSUA 5HPCA 2VX4A 4V2XA 3FN9A 3AS2A 2QHAA 4PMYA 1CNVA 3U7VA 2WPGA 4E2OA 2WW5A 3WELA 1I1WA 1JXKA 2XTKA 4HA3A 1LG1A 5CSYA 5BROA 3WQ4A 5CLWA 5A2AA 4F9JA 1EGZA 3N12A 2OLHA 1X6NA 1KB3A 3FAXA 4LX4A 2E4TA 2YL8A 1K9DA 3CZ8A 4MAZA 2GJXA 3WBEA 1GHRA 5BRPA 3BAYA 1V0MA 1KCKA 5AYIA 3WMCA 5EB8A 5FOOA 3ZIZA 2UY3A 4BQ2A 4UOZA 2ZWYA 4MTVA 4FLQA 2E0PA 1TA3A 4BCEA 1IV8A 5CXPA 1PAMA 3L4ZA 4M56A 4F8XA 1G5AA 2ZUUA 1NOFA 5C71A 4KRTA 2ZOXA 4DWSD 3UR7A 1JYWA 1E4MM 8A3HA 1FFQA 2F2HA 4AIOA 1E6RA 3QHNA 2FDMA 4D71A 3UG5A 3AIWA 2Z1KA 3WL0A 3SCRA 1UR0A 3WUFA 2VVSA 4AMCA 1CEOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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