4MNKA

Crystal structure of gh18 chitinase from cycas revoluta in complex with (glcnac)3
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
344
structure length
342
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGGGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYEYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase A
publication title Crystal Structure of GH18 Chitinase from Cycad, Cycas revoluta
rcsb
source organism Cycas revoluta
total genus 122
structure length 342
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4mnkA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4mnkA01
4H8UA 5LA1A 1CXLA 4GQQA 2DT1A 3ARVA 1LL6A 2V5DA 4ATWA 1G01A 4PMXA 2JE8A 4GO9A 2WWCA 2DQXA 3IK2A 1NARA 1OGSA 2ZE0A 2O9RA 4MB4A 3W0KA 3VD7A 1E56A 1V6WA 4AD2A 5BXPA 3MV11 2E8ZA 1J0IA 2ZX6A 4W86A 2WMGA 3SUTA 1CNVA 1I1XA 2ZUNA 5E0FA 4JCMA 3CBWA 5A94A 1TA3A 3ARYA 2CESA 1HVXA 5FD0A 5CSUA 1GOWA 1C93A 1UHVA 1CXIA 1UUQA 3ARRA 1J0JA 1E70M 3ZJ6A 1QI3A 3II1A 2D1ZA 1UKTA 1V3IA 2ZXQA 4S3KA 3WUGA 2C7FA 2AOSA 4KGJA 2J77A 2WMHA 1UA7A 3WDJA 1HIZA 1JAEA 3I3DA 3VO0A 3WF0A 1U33A 2WMIB 3ARUA 3ARWA 1B9ZA 4CU7A 1W1TA 3J7HA 1XRVA 3BMWA 3RJXA 4W8AA 3AIVA 2WCGA 1KGXA 4TX8A 2EJ1A 2X1IA 4D72A 3WMBA 4W84A 1V6VA 4CD4A 2VL4A 4Z2HA 3VKKA 4A4AA 1CGTA 4AZ7A 1WE5A 3UETA 3AHXA 1GJUA 4M81A 5BWFA 4TVDA 2DT0A 1LLOA 5JIPA 2E0PA 3T2QA 1JF5A 3W28A 4HOZA 1J11A 5A2BA 2G3MA 2G8ZA 1DWHM 5DFAA 4AXNA 5C70A 2A3EA 2VRQA 2PBOA 5JBFA 3AZSA 3O6AA 4HU8A 4W88A 4AD5A 4MNKA 3LPOA 4D6FA 4HMDA 5E6ZA 4UFIA 2JIEA 1E55A 4PTMA 1CGXA 2EPOA 3IJ7A 2XVLA 4HZ6A 2W92A 3WF3A 1B3VA 3M46A 2EPKX 1FP8A 1G9HA 2O9TA 2VZUA 3CZEA 4MB1A 2XYLA 3MU7A 3F5LA 3SCPA 1JG9A 1BYAA 4JKMA 1OD8A 4XZBA 1JYVA 4W8LA 4IUGA 4RL3A 3NJ3A 3BAJA 2FHCA 1E6RA 2D3LA 4HA3A 4ZXLA 3S6TA 3GH7A 5I23A 3NDYA 3TTOA 3GXFA 4AZGA 2YL8A 4HMEA 4P8UA 3PZIA 2DSZA 3ECQA 3EDDA 2EXOA 3CUHA 3BGAA 7CGTA 1B3WA 3OGSA 1BYCA 2CHNA 3VGFA 5JIWA 3VD5A 4RE4A 2GJXA 4CU6A 3WKZA 4R27A 1G1YA 1GOMA 4J28A 2JF7A 1Q4NX 4UQBA 2YJQA 3VGGA 3O9NA 3FN9A 4TUFA 3BAWA 2WC3A 1ODZA 4LQ1A 2WBKA 3GYCA 1B31A 3AMDA 5LA0A 1KXQA 3PZQA 5KEZA 1LG2A 3VUPA 3PTKA 1TVPA 4PUDA 2DH3A 5IHSA 1GOIA 3T2OA 2XM1A 3NSMA 1DWGM 5ABGA 2BS9A 1W3JA 4CN6A 4XUYA 2BXZA 5A6MA 4LYRA 3UCQA 4CN4A 1AQMA 4W7VA 3WDQA 3GXDA 2CXGA 2Y4SA 2D2OA 1JZ7A 3CMJA 1ZB5A 1ODUA 3AZTA 3UG3A 4AZCA 2NW0A 2PC8A 2A3BA 1W9BM 2OYMA 3T0DA 2D0GA 1MQQA 2YLLA 3CZJA 4BQ5A 4P7LA 3L2MA 5ECUA 1U30A 2VZSA 2WAGA 1FFRA 4JL1A 1V3KA 3ALGA 5M17A 2VC9A 1NP2A 3RPMA 2J7BA 2XJ7A 1JYWA 3ZT7A 6A3HA 4HZ8A 2PBGA 2BY1A 5GQBA 1YHTA 2E8YA 3WF2A 5I77A 1FHDA 4WSKA 1UR8A 1ECEA 4TVCA 1LL7A 1VENA 3THCA 3ZJKA 2DGAA 3BSHA 1NQ6A 2D3NA 2ZUVA 1CEOA 2YA2A 2YDRA 1PJ9A 1EA9C 2CIPA 3WDPP 3BLKA 2XVNA 1WDPA 2Z1SA 3L4UA 1B3ZA 2VVNA 1PEZA 3EMCA 2V3FA 2F8QA 4P8XA 2CBUA 2VCCA 2XPKA 3CHFA 1E6XM 1OIFA 5AC4A 3VIIA 1NWUA 3ZSSA 2X8RA 3VNZA 3POHA 1E72M 2VVSA 2XFRA 2CPUA 1HKJA 1V3LA 5LYRA 1JXJA 2J8FA 2X05A 4UQCA 1OIMA 2YA1A 1HVQA 4ZXOA 3AIWA 3N04A 3VINA 1EOKA 1I75A 2CHOA 2QPSA 1EQCA 1IZJA 1FH8A 3UG5A 4FLSA 4KRUA 1ZBKA 1W9VA 2JEPA 3BCFA 1NM9A 3CZLA 1PX4A 1CBGA 3VX1A 4YN5A 1JYXA 1HXJA 3VTRA 4AW7A 2PWEA 1NWRA 4CGTA 6TAAA 2ZUSA 4H8HA 3W37A 4HPHA 1UD8A 2NT1A 5BRPA 1HP5A 2BVYA 3ZOAA 3WQ8A 1LJYA 1UWTA 1QW8A 5ABHA 1FFQA 3WDHA 4ACYA 5I2UA 2EPMX 1OINA 4N42A 4V28A 2PWGA 3MUAA 1UQZA 3UESA 1SYTA 3MMWA 3MUY1 2CYGA 3CIVA 3CLWA 3BH4A 5GPRA 1BVNP 3VIOA 1QNPA 2YA0A 4D6IA 3OA5A 5BXSA 4D1JA 1MFVA 3OGVA 3SCRA 4DUWA 1B30A 2AMGA 4EK7A 3W6MA 1UZ1A 1UD6A 2Y5EA 3B8SA 1RP8A 3GTNA 5JBEA 2VZVA 1HJXA 1PAMA 2XM2A 1H09A 2WWDA 1UR4A 1ITCA 2ZUTA 5A8NA 3VVGA 4AMCA 5IHRA 1GJWA 3OLDA 1QOXA 1W3LA 5D9PA 1D2KA 3D3AA 2Y8VA 1WKYA 5CGTA 4WKHA 1E40A 5A1AA 1OCQA 1EHNA 3AXHA 1BFNA 4HA1A 4GINA 5A69A 2CBVA 4Z2GA 1DWFM 3BC9A 4QAWA 1UKOA 2YL9A 1SR0A 3AROA 1EDQA 2WMFA 3W6LA 4NRSA 5ABEA 1GUVA 2BVTA 1CYGA 1IV8A 1TMQA 2DSWA 4HU0A 3ZQ9A 2FH8A 1KBBA 1Q6FA 1E3XA 2VX5A 4X0VA 2V3GA 1E6SM 5GNYA 3VOCA 1BYBA 3T2PA 4M8UA 3CHEA 3WSUA 4Z2JA 1ZJAA 1XH1A 4WIWA 1BG4A 3CH9A 2W5FA 5EFDA 1E71M 4J3WA 4A3HA 4UTFA 1KCLA 1H0IA 3MSDA 3T08A 4J3TA 1FP9A 3BAKA 5A2CA 4JFWA 3S2CA 3FAWA 3RMEA 2VT0A 3N11A 3VD9A 2EQDA 1M53A 4Y7EA 5DMYA 3L4WA 3PTQA 2XFYA 2PWHA 2V3EA 3O2LA 4HP5A 2CBJA 3WUBA 5A6BA 1ZL1A 4BCEA 3AS2A 1HJQA 4CD8A 3SIMA 1HNYA 2HVMA 3TOPA 3IJ8A 2GFTA 2WNWA 3FY1A 1B90A 5DEZA 1VJZA 1QHZA 5IXEA 1RP9A 4S3JA 3SCWA 4D6HA 3VD4A 1XC6A 5JBDA 3PN8A 2BV9A 1XCXA 1V03A 2VUYA 2XVGA 3I3BA 3QHMA 1DWIM 3GNRA 4DM1A 4WKAA 4GZJA 4GIAA 3VMPA 4MNJA 5E6YA 4D6EA 3VDBA 5CPQA 2YDQA 3WQVA 1GPFA 4PRWA 4BQ4A 4M1RA 3WD3A 2FGZA 3AIUA 3A4WA 4L4OA 1PZ2A 3AIRA 4BA0A 1V3MA 2HISA 4MJ4A 3JUGA 1KWKA 2VR5A 1JI2A 3AIBA 3GXMA 3K8LA 4JHZA 3ZO9A 3AI0A 2UY3A 1OT1A 5A8OA 1P6WA 4CCEA 5GNZA 4AISA 4F9JA 3GDBA 2JF6A 4AD4A 2J79A 5D8WA 2VCAA 3ZT6A 4GI8A 4PCTA 2WKGA 2D22A 1LWJA 1WZMA 4FMVA 2OYKA 1JZ6A 5CJ5A 5C71A 2WVTA 2C8NA 2X0YA 1QNSA 5ABFA 1W3HA 4W5ZA 3VNYA 3WQ5A 3W38A 3AYRA 1GQKA 3KZSA 3DYOA 2VJXA 2G4FA 4QCFA 3GM8A 3AOFA 2W4XA 1TUXA 1D3CA 1UQYA 3W29A 4PBGA 4CD6A 3SUSA 1JZ2A 2DSVA 1XCWA 1XH2A 4AEFA 4OBSA 3ZJ7A 1V02E 3ZM8A 1PBGA 4MPKA 2WPGA 2WVUA 2CERA 3RCNA 1BLIA 4WKFA 2J8GA 4E8CA 4U31A 1CLVA 3LPFA 2YOCA 4M82A 4WSJA 3GNPA 4AZIA 1O7AA 1PIGA 2XSBA 2G41A 4IPLA 1UH3A 3L2LA 1MXDA 1XD0A 2OWWA 3WDIA 4LX4A 5CQ1A 2PB1A 3K8MA 4AZHA 5A6BD 1VFUA 1GOKA 2DDXA 2XWEA 8A3HA 3OLGA 3OLEA 3ARPA 1Q6GA 2WVSA 3K4DA 3WQWA 5CLTA 1VB9A 3EDJA 1J0HA 5I0DA 2A3CA 4ATLA 1GOOA 5A8QA 2B31A 1VEOA 3AZRA 1E4NA 4E2OA 1ISVA 4PTXA 2CITA 1I1WA 1GVIA 1EHAA 1KQZA 1DEDA 1QI2A 3HJEA 3WDRA 3AXXA 3ARZA 2WHKA 2BHUA 1GQIA 5EBAA 3SCVA 2JIWA 3HU7A 2F2HA 1BGAA 3AIQA 3N1AA 4ZENA 3WFZA 2OSYA 5F7UA 3VM7A 1CTNA 1OBAA 5AYIA 2WKLA 2JALA 2ZWYA 4NF7A 1QBBA 2WSKA 1R85A 2UY4A 4C7DA 3EMZA 3WBEA 1V0KA 3VDHA 3AICA 3SUWA 1A3HA 1DTUA 4P8VA 2YIHA 2WANA 2IUZA 4PSRA 4HZ7A 4PSPA 1UKPA 4M24A 3ZJ8A 4CN1A 3PTMA 3DC0A 2OSXA 2WVVB 3MKKA 1ZU8A 3CUJA 3WQ4A 1ISYA 5A6SA 1J9YA 3EYPA 3KEHA 4JFSA 1W32A 1ZJBA 5FOOA 2VRKA 3OBAA 3PZTA 1W91A 4V2XA 1OWQA 4GI6A 3W82A 1F4AA 4PMYA 2XWDA 3AS3A 4DWSA 5DO8A 2PWFA 1JFHA 4JL2A 3MMDA 3WD4A 1OD0A 2XVPA 3ARQA 1ISXA 1E73M 1J01A 4J3SA 2XHYA 1SMAA 2XIIA 4U5IA 1WZLA 1J12A 2J25A 4AIOA 3LMYA 3W26A 2W66A 1K9DA 3ARTA 3ALFA 5C8BB 4MDOA 1VEMA 5DT5A 1CIUA 4ACZB 3ZIZA 1KXTA 3OZPA 2UWFA 1H5VA 3WMCA 4GQRA 3N9KA 3T09A 1J0YA 1QPKA 3ZR5A 1RH9A 5D9NA 5I3DA 3ZMRA 3IAPA 4BQ3A 4JZ5A 4JCLA 1FOBA 4GPNA 1D7FA 1QNQA 3RO8A 1G0CA 1MXGA 1XHGA 1E0VA 3ZSTA 1WDRA 1WO2A 4CD7A 1PIFA 4AC1X 1EOMA 2GJPA 5BCAA 1C90A 4UR9A 2CCRA 5HOSA 1OT2A 5E9AA 2WHJA 1OGBA 2QLYA 2E3ZA 2G3JA 1ZS2A 2DIJA 3EDEA 5HPCA 4KWUA 3B9AA 4PMOA 4OUEA 3AS0A 1JZ3A 3PZUA 1B3YA 3HMCA 1IZKA 1KXHA 3WH6A 5LA2A 2UY2A 2YBUA 1JI1A 1HT6A 2WMIA 3GH5A 1Q6CA 2WYSA 2FGLA 2Q8XA 1VIWA 3AYSA 1KWGA 4Z2IA 4U5KA 1V08A 2AAAA 1JZ4A 2WB5A 3W24A 4F66A 1ISZA 2GJRA 3SCUA 4B16A 3BAXA 4X9YA 1JZ5A 2D23A 1K9EA 2DSUA 3U5YA 3A6OA 1GQLA 3IAQA 4WK9A 1J10A 2YL6A 1QNRA 3WL0A 1JDDA 2J7GA 1E4LA 1C92A 1VBRA 2VR4A 4PTWA 5FKYA 3CUIA 3UG4A 4BZYA 3SCSA 3NSXA 3WUFA 2ZIDA 2WC4A 1MFUA 3RM4A 3CZGA 1W1PA 2X0HA 1AQHA 1B3XA 4DWSD 1KQYA 2E4TA 3G6MA 3L4YA 5HDRA 1JF6A 3KL5A 1GONA 3N13A 2NT0A 5A6LA 3RM8A 4J27A 1QI5A 1CGWA 4ZE4A 1VAHA 1MW2A 1UOKA 1U2YA 1QVBA 4YHGA 4XZWA 1E0XA 4BQ2A 2E9MA 4QLKA 1VRXA 3SUVA 1K6AA 1RD6A 1CWYA 3CZKA 1EO5A 1BVZA 3AJ7A 3DHUA 4TVUA 1TZ7A 1VFFA 1BF2A 2E40A 4R5EA 1DWJM 2VNCA 3N18A 3NSNA 4H7VA 3TTYA 1Q6DA 1X6NA 4UZSA 1E4IA 4HMCA 3L4XA 3AQUA 4GZEA 4URIA 2ZUWA 1QI4A 4NSBA 4OIFA 1JYNA 3WL1A 1H11A 3PZOA 1BG9A 4UNIA 1M7XA 3WH8A 2XFFA 2EPNA 3MUZ1 2EO7A 4F79A 1ZBVA 3WQ6A 1E6ZA 1CLXA 1XYZA 1MYRA 4CVUA 2CNCA 4B9YA 1DHKA 5BYWA 4UCFA 2WM0A 3MO4A 1PX3A 1BQCA 3PZVA 1KB3A 3WH5A 1EDTA 1AVAA 1M04A 1E3ZA 5HXMA 1TA3B 3PZMA 4OOUA 2YL5A 1WP6A 3MMUA 1JIBA 4PMUA 1E15A 3GH4A 1TG7A 1MQRA 5A6KA 1HJVA 4E8DA 1WB0A 4TOQA 3WNLA 1E0WA 1UR1A 3WNOA 1BAGA 2OYLA 4XB3A 4F8XA 1YQ2A 3VIMA 3VPLA 4MNLA 2W91A 3QHNA 4PEEA 1LF1A 5EFFA 3CTTA 3CUGA 3OG2A 3KL3A 1LQ0A 2X09A 4W93A 2ZICA 4FLQA 1JD9A 1EXPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1QBA A;  4CD5 A;  3BXW A;  3T0A A;  4PMZ A;  2ZXB A;  4H41 A;  2D0F A;  4U3A A;  5CG0 A;  2MAN A;  3NYD A;  1KR0 A;  1QW9 A;  1W3K A;  1H4P A;  1UYQ A;  4OJY A;  1WNO A;  2TAA A;  3VDA A;  1H3G A;  2BHY A;  2WCA A;  2V5C A;  4PCS A;  5D9O A;  2CEQ A;  3WD1 A;  1NWS A;  5TD4 A;  4MDP A;  5M5D A;  3UER A;  2G3I A;  4AD0 A;  1L8N A;  1V02 A;  5HNN A;  1BGG A;  4LGX A;  4DUX A;  2J4G A;  1C91 A;  4UFK A;  5CPT A;  1VBU A;  3QOM A;  3RM9 A;  3AHZ A;  2VCB A;  2ZX7 A;  1X6L A;  2PF0 A;  2WW5 A;  3U7V A;  2FH6 A;  2X2Y A;  2ZX9 A;  3E1F 1;  3TTQ A;  1XSJ A;  4U2Z A;  3WH9 A;  2VQT A;  1W2V A;  4P7R A;  5M03 A;  1J18 A;  4FLO A;  4PMD A;  2IXU A;  1UWS A;  1UD2 A;  2QMJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NF0 A;  1CXL A;  2EG8 A;  1LCO A;  2V5D A;  3W7O A;  3MHU A;  5BU6 A;  4S3C A;  3ONB A;  5HAT A;  4XAY A;  1L6F A;  1M6J A;  1TVL A;  4DYJ A;  1F7B A;  1E56 A;  3RPD A;  4AD2 A;  4MMW A;  4QAI A;  3MV1 1;  5AZ0 A;  1G4S A;  2ZX6 A;  1FKX A;  1OYB A;  4X3Z A;  1RCO B;  5E0F A;  4QIS A;  1BXB A;  1IXP A;  4QIU A;  2D2H A;  1TA3 A;  2C16 A;  3O6Y X;  2DG3 A;  5FD0 A;  7REQ A;  1GOW A;  4G2D A;  1UMY A;  1I0D A;  3G5E A;  5HJL A;  2CZE A;  3S47 A;  3HFY A;  1OFQ A;  2C7F A;  2AOS A;  4WD0 A;  3NQ7 A;  1I6N A;  4LC6 A;  2WMH A;  3EY6 A;  4HNT A;  3ARU A;  1AMK A;  3O07 A;  3ABS A;  4UUI A;  4GY1 A;  2XU2 A;  1SPQ A;  3BMW A;  1ZCC A;  2ZR4 A;  3QLD A;  4W8A A;  3NGJ A;  3V0T A;  1RR2 A;  4AY7 A;  4JIC A;  4QX4 A;  5DBU A;  4TX8 A;  3SIZ A;  2X1I A;  3N6J A;  3WMB A;  4W84 A;  3T44 A;  3TAK A;  4AZ7 A;  3UET A;  4NNA A;  4WDX A;  4O18 A;  5LKY A;  4M81 A;  3I7S A;  2C79 A;  4E2B A;  4A29 A;  1CLK A;  1JF5 A;  2NXH A;  4AX7 A;  5EGR A;  4I9M A;  4AX6 A;  2Y7G A;  4XKY A;  3EOE A;  4L61 A;  3O5E A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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