4MNMA

Crystal structure of gh18 chitinase (g77w/e119q mutant) from cycas revoluta in complex with (glcnac)4
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGWGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYQYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDPNSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of GH18 Chitinase from Cycad, Cycas revoluta
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Cycas revoluta
molecule keywords Chitinase A
total genus 122
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4mnmA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4mnmA01
4L4PA 3NSXA 2XWEA 4Z2JA 3CLWA 1HX0A 2XHYA 4HU8A 1NP2A 4CU7A 3ZOAA 3ZJ6A 4U3AA 5I0DA 4MTVA 1NOUA 3OIHA 3WF4A 1OWQA 5HPCA 4M24A 5AC4A 1UOKA 1FFRA 4UR9A 3ZT7A 1ITXA 1E55A 2VQUA 3WEOA 1E0WA 4BQ4A 3KL0A 1CLVA 1JD7A 4J7RA 1XD0A 3BLKA 4BQ3A 3CUIA 3IAPA 4W5UA 3ZO9A 5E70A 1ECEA 3AIRA 4FK9A 4EKJA 1GOIA 2PBOA 2PB1A 4PRWA 1PPIA 3MMUA 4UOQA 5BWFA 1EA9C 1FH9A 1CXIA 4MJ2A 4HA4A 5EB8A 4HA1A 1ZBKA 2E9BA 4WKFA 4A4AA 1XYZA 2ZE0A 1RP9A 5LA2A 4E8DA 2PWEA 3EMCA 1GOWA 2OWWA 1XH0A 5E09A 2XVKA 2WLYA 1GQJA 1EDQA 1UA7A 2ZX7A 1AMYA 1E5JA 4JFTA 1NWSA 1QI4A 4AIEA 2XVPA 1J0HA 4CCEA 2A3HA 3MUIA 3M7SA 4JKLA 4TVUA 4E8CA 1ZB5A 3JUGA 1DWGM 5CGTA 4PEEA 4Y7EA 2JIWA 1NWRA 4RE4A 1E6NA 5D9MA 1MWOA 2W66A 1SMDA 3WN6A 2X09A 1B3XA 2OWXA 4ATWA 3AS1A 3BSGA 1XC6A 4MNKA 2ZX6A 2WZHA 3HJEA 3NSNA 1V3JA 3AYRA 4PMUA 3U5UA 5ABEA 2VNCA 4KGJA 3W29A 2QPSA 1W1PA 1V0NA 1V3LA 2GJPA 3VDCA 5A95A 3A47A 4W93A 4BA0A 3CUGA 1K9TA 4GO8A 3VIPA 1V6XA 2J47A 3THCA 1CGWA 1LL4A 1WPCA 4W8AA 1JYNA 4B3LA 2BNJA 4TTUA 2E40A 2VT0A 1W1VA 1V3MA 4HP5A 3NCOA 2E3ZA 3K46A 2CBJA 5DF0A 2WAGA 1H09A 3B9EA 5GNYA 2V3DA 1W9PA 5A2AA 1R87A 1M53A 1UKOA 3PHAA 4FLOA 1JNDA 4J3VA 4UFLA 1E15A 1CTNA 1CNVA 1HJSA 3SUUA 3W38A 3WDPP 4GI8A 4P7RA 4OOZA 3PTKA 3KE0A 3VMOA 1UH3A 4JKMA 5CZKA 3CUFA 2WMFA 4GI9A 1EHAA 4D6FA 1JF6A 3MO4A 3CZKA 1X1NA 3UR8A 1BGGA 5BXPA 3FXYA 2XG9A 3AI0A 3WENA 3CH9A 2ZWZA 2DSWA 4B9ZA 3SURA 5ABGA 2VZUA 3AIUA 2XIIA 5A1AA 1HKJA 1HJQA 3MU7A 4KMQA 2O9TA 3GH7A 1OCQA 1FOBA 4A3YA 4JKKA 5BCAA 5BXTA 1UR0A 4PMQA 5DFAA 1LWJA 1E4LA 3GBDA 2VR4A 3CZ8A 1VRXA 1QHZA 2W63A 1BG9A 4LYRA 2JEPA 3CMJA 2GDUA 3ZJ7A 1JXJA 1UWTA 4Q22A 1PJ9A 3WD3A 3RPMA 3W28A 3LPGA 3WUEA 3DECA 2DGAA 1ZBWA 2Y4SA 1V0KA 1M04A 1OD0A 2X05A 4ACYA 3MKKA 2G8ZA 2WB5A 1AVAA 2DIEA 1B1YA 2ZUWA 3WQWA 4GXPA 5AC5A 4F9JA 1HJXA 2QF8A 5A94A 1WKYA 4C7DA 1E71M 5A6SA 4J27A 1TFVA 4XZBA 5E9AA 1QW9A 3S2CA 3U57A 4LXFA 3OLDA 1BTCA 1F4HA 2XVGA 2WWCA 4UFHA 4U2ZA 1EH9A 3OGRA 2VRJA 2WC3A 1WNOA 4X0NA 1UKTA 5LYRA 1LWHA 1UZ1A 2VR5A 3VD4A 1L8NA 2BHZA 2Z1SA 3A4AA 3GXIA 3II1A 1EQPA 1B3YA 3TTQA 4UCFA 3EBVA 2XWDA 2BHUA 3UR7A 2AMGA 1BVZA 2WCGA 3UETA 4S3KA 4XUYA 4PN2A 1GCYA 2WVVB 1XH2A 4H2CA 1IZKA 3RO8A 3CZJA 4ZE4A 4HOXA 3BAYA 3W4RA 4F8XA 2FHCA 1GNXA 3SEPA 2WYSA 3VGDA 1GORA 4Z2HA 4OZOA 4H8UA 2DSZA 2ZUTA 1G5AA 1F4AA 2OWCA 3SCWA 4PCSA 3RM4A 5E6YA 2GSJA 1UWRA 1W1YA 2X1IA 4P8WA 2CIPA 1HF6A 1KXVA 1V02A 2J75A 5BXRA 3AS3A 1M7XA 2G3NA 1TA3A 2YLAA 7TAAA 1MW1A 4PMZA 3RJXA 4MNLA 1V08A 1V6WA 1NARA 3UESA 1V0LA 1UD4A 1J0KA 4PTMA 1IT0A 4NF7A 1LJYA 3WY1A 2WC4A 4CN4A 1MVYA 3IK2A 4B16A 2VCBA 4IUGA 4MDPA 1HNYA 4U3CA 3KZSA 1H2JA 2XFFA 3AMGA 1I75A 3GZAA 3THDA 1ZJBA 3VDAA 2E8YA 2VVNA 3PTQA 1B30A 1PZ2A 2NT1A 3NDYA 2CETA 2YA0A 3BAIA 4JL1A 3FNDA 3J7HA 4AYSA 2CPUA 2VZTA 1VFMA 2ESCA 2V5CA 1JDAA 4CU8A 3D5HA 1Q6GA 5IHSA 4MB1A 4ACZA 2JFEX 1E6RA 3NDZA 1J0JA 2X2YA 3WBEA 4BZYA 4HOZA 3IJ7A 3UERA 3AZRA 3BGAA 2J74A 1BGAA 3W53A 2WZIA 4NI3A 5CJ5A 4OOUA 3GXDA 5JIPA 5DEZA 3EDFA 1Q6EA 2YLLA 1E4MM 2GJRA 4QDMA 1VIWA 3ZJ8A 1FFQA 1W3JA 3DC0A 2YOCA 1DWJM 4K68A 3K8KA 3AOFA 4WLCA 3AXIA 1KWGA 1PX8A 3AIWA 4AMCA 1OB0A 1CBGA 5I24A 5I23A 2EEXA 4KRUA 1Q6CA 1EHNA 1MW2A 2GK1A 2PWHA 2W92A 1V0MA 2WC7A 3MS8A 1JZ6A 1WCGA 4GZIA 3ZSTA 3POCA 4P7OA 1DHKA 2E0PA 4YPJA 3RCNA 2OSYA 2BY1A 3TA9A 2Y8VA 1XSKA 2DQXA 3KEHA 2MANA 3PBGA 3AHZA 1GOOA 1VFFA 1PX4A 4AD5A 1CENA 1CXEA 2BVDA 2AAAA 1TUXA 1G94A 1BYAA 2JE8A 2FHBA 5LA1A 1XH1A 5GQBA 5M17A 1E4NA 2D23A 4PBGA 2DIJA 4AZCA 4ZXOA 4JCMA 4J3UA 2WKLA 4TOQA 2VX6A 2WMJA 1WZKA 3ARPA 5IXEA 3PN8A 2FH8A 3AISA 5FKYA 3WF3A 1W3LA 3OLIA 3VMPA 2EQDA 1HVXA 3BMWA 1R7AA 4W88A 5I6SA 4EAMA 3VIHA 2V5DA 4MADA 1EXPA 2C7FA 1E3ZA 1B0IA 2J7GA 4WF7A 3A6OA 4CN1A 3CO4A 2W67A 1E4IA 3GNPA 1JI2A 4PYSA 3ALGA 1K9DA 2FGZA 5AYBA 1CGXA 3VNYA 3MUZ1 1UD8A 4IPNB 1DWHM 3SCRA 4W7WA 3AICA 4ACZB 1NWTA 2PWGA 1D2KA 3WH6A 1C91A 1C7TA 1HJVA 1JFHA 4DWSA 1U30A 1QI3A 2UY3A 2CEQA 1XRVA 4PMNA 3RM8A 2YDSA 1H49A 2ZWYA 2J7HA 4JFVA 3VPLA 1GONA 1DWIM 4Z2IA 4QP0A 1WB0A 2G3MA 3T0AA 2C8NA 3OGVA 3APGA 5JH8A 4M82A 1UR8A 4R27A 4M29A 1EGZA 1X6NA 1QNRA 1GVIA 3MMWA 1ZBVA 4J3WA 1E0XA 1FP9A 3TP4A 1U2YA 2J7EA 1G9HA 1BFNA 4MAVA 4D6HA 4Z2KA 1IZJA 2GK1B 4HMEA 2YDQA 4OKDA 1QW8A 4UNIA 4FLQA 2ZXBA 4AC1X 3CUJA 3N1AA 5A8QA 3PZNA 5KEZA 3WQVA 2NW0A 4WSKA 1GW1A 3WQ8A 1Y7VA 1MQQA 3BCFA 3N12A 4F9DA 1VEOA 3HN3A 4UFKA 3RDKA 2RGMA 1JD9A 8A3HA 4WJXA 2BVTA 4UQDA 4BQ2A 3W0KA 1JDCA 1UUQA 2D3NA 3NSMA 1E70M 3SUWA 4M56A 4TUFA 1QBBA 2WK2A 1QHPA 3AS0A 3T0DA 3SCVA 3EYPA 4YHEA 1WZAA 2GJXB 1NOWA 1US3A 3WH8A 3QOMA 1LLOA 1WP6A 2F61A 2EBNA 1JFXA 3GXMA 4P8VA 3MANA 2WBGA 3L4VA 4NZCA 1KQYA 4HOWA 1GHRA 4URIA 4FLSA 2NT0A 4CCDA 1WDRA 4JAWA 3OZPA 4AZHA 4FLRA 3CHCA 2YA2A 3SCPA 1O7AA 3WH5A 3T08A 3VM7A 3VIGA 3ZT6A 3CZGA 1C7SA 2D24A 3BAJA 1VFUA 4PSRA 2XSBA 4KWUA 3VIIA 3RM9A 1V3KA 4UQAA 3WDRA 4HPGA 2ZUSA 2XTKA 3FY1A 4ATLA 3LMYA 5ECUA 2J8GA 3RIKA 3TTOA 3WMCA 4ML4A 4C7FA 3T2OA 3I3BA 3GH5A 2WANA 2E8ZA 3AFBA 1MXGA 2WMIA 3CZLA 1CWYA 2WMGA 4GZJA 2FHFA 3F5KA 1KWKA 4KRTA 2QV4A 3VINA 4LX4A 1EOKA 2ZXDA 4AD0A 3OB8A 1B31A 3VX0A 3SCOA 1WZLA 1JZ5A 1LF1A 5M03A 5A6LA 4CD5A 3LPFA 1IV8A 5A8PA 4XX6A 1UWSA 2CYGA 2J78A 1CLXA 1ODZA 1W32A 5IFPA 1CGVA 2FGLA 1E6SM 4UQCA 3OGSA 4AIUA 5GNZA 4B15A 5LA0A 4DUXA 1UYQA 3CMGA 4QLLA 2G41A 3U5YA 5I5RA 2GVYA 1OIFA 4Q7NA 2DSUA 4AISA 2VX4A 3QR3A 1WE5A 1N82A 1OM0A 5D8WA 1Q4NX 4U5IA 1LQ0A 3VIFA 3ARWA 2BY3A 4AEFA 2V3EA 1C8XA 2J25A 4PTVA 1EDGA 5I77A 3WNOA 1VBRA 3MMDA 1PIFA 2VURA 5CSYA 2YBUA 4WKHA 2J7BA 1MW3A 2F2HA 4U33A 4UQEA 3VIKA 1W9XA 4D6EA 1J18A 4PMYA 4H41A 1XYFA 1W2PA 1C92A 5DT7A 5A8NA 3WD1A 2X0YA 1E9LA 2CESA 5DO8A 3VIJA 3OBAA 3QOKA 3PZIA 4V2XA 1BPLB 4W7VA 2GDVA 2WLZA 3ARVA 1JYXA 2EPKX 1Q6DA 1MYRA 2CITA 1FA2A 4YN5A 3IAQA 2JF7A 1J10A 4M8UA 2J7CA 2VL4A 4PTWA 2J79A 4TXEA 3O9NA 4P8UA 4JFSA 4LPCA 1NH6A 5GNXA 4W8BA 2J8FA 5E0FA 2OSWA 4F79A 2DH3A 1W2VA 5TD4A 3A4WA 2VX7A 2VC9A 1KGXA 1PIGA 3IJ8A 3L2LA 3CHEA 1XCWA 3MV11 2BV9A 1VBUA 3VGFA 3GBEA 3ARYA 1W9BM 1E6XM 1QPKA 1H41A 2RGLA 3DYMA 1B2YA 1XHGA 1EQCA 2V3GA 5EFDA 3W25A 3U7VA 2VQTA 4AZ6A 3BSHA 1GOMA 3CUHA 5FL1A 3VTRA 2VRKA 5A8OA 5C8BB 3WDQA 4WSJA 3G6LA 5CPSA 3WNMA 3S6TA 1J01A 4OIFA 2JALA 1FHDA 3LPPA 5JBFA 2ZXQA 4JZ5A 2DT2A 1ZBCA 1W9DM 2JEQA 1HVQA 5I78A 2BS9A 1KQZA 1JZ8A 1TE1A 3WEZA 3CHDA 4MPKA 1RD6A 4EE9A 2DT0A 4U2YA 1JIBA 2FDMA 3EMZA 1V3IA 3ZIZA 2ZIDA 1JYWA 2QLYA 5HPOA 1H0IA 3W81A 3T09A 2Y24A 4E2OA 3FHAA 3B9AA 2BY2A 3PZTA 3ZM8A 9CGTA 3UEQA 2PWFA 1W3KA 5HXMA 3F5LA 5CPQA 4LYQA 3WFLA 4TTGA 2BY0A 4W8LA 2XYLA 2Y2WA 4WK9A 4OUEA 2WCSA 2XGBA 1XD1A 2ZOXA 4QLJA 2O92A 1UR9A 3A3HA 4MNMA 3L4XA 2QMKA 4MNJA 3EDKA 1KGWA 1TG7A 5ABFA 3WUBA 1JF5A 4DUWA 2WVUA 3W82A 2XVNA 2QMJA 3W24A 4GINA 1NM9A 4TX6A 5M5DA 3CTTA 2OYMA 2Y8KA 3BMVA 3ZR5A 1ITCA 1KXTA 3SCQA 3CPUA 2WWDA 2VX5A 4H7VA 4AZBA 3WEMA 1EIBA 4CVWA 3AHXA 1M03A 4HU0A 1UKQA 4RE2A 1V02E 1KR1A 3WFZA 2A3AA 1HIZA 3NIYA 4CGTA 2WSPA 4PTXA 3RMEA 2JIEA 4M1RA 2PI6A 2ZUMA 3WDHA 3PTMA 4PMDA 2J77A 5AY7A 1UG6A 4M80A 4CKQA 3ARZA 1R85A 4ATDA 2WSKA 1PZ3A 5CLTA 4AWEA 3VKKA 3B8SA 2D20A 1X6LA 3FAXA 3UG4A 1QBAA 4AD4A 3WNKA 2VVSA 1E73M 1TR1A 1Q6FA 1RH9A 4W89A 1VJSA 1C8QA 4PUEA 3AMLA 5IDIA 3QHOA 5CGMA 1ISXA 3WQ6A 4FF5A 5BRPA 2X0HA 4CU6A 2QPUA 2UWFA 2XIBA 4GO9A 4J3XA 2BXYA 4OBRA 3WNLA 2J4GA 4UFIA 1JNEA 3VNZA 1JZ7A 1ESWA 1E72M 1LG2A 1TA3B 3I3EA 1CXLA 1B3VA 1XSJA 1NQ6A 1HJUA 1UQYA 5BROA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2IUZ A;  5F7U A;  1UR1 A;  1KCL A;  4UTF A;  2OSX A;  4W85 A;  5ABF B;  1BSI A;  4HPH A;  1C93 A;  5A6K A;  3GTN A;  2DT1 A;  3D3A A;  4QCE A;  2VZV A;  4DUV A;  1R8L A;  1CPU A;  4P7Q A;  2XFR A;  5JBE A;  4V27 A;  3AIQ A;  4Z2G A;  1E1F A;  1UA3 A;  5GPR A;  1B3W A;  3WF1 A;  4FMV A;  2D22 A;  1GHS A;  3TOP A;  1W3H A;  2A3C A;  1JL8 A;  4MB5 A;  3AXX A;  1E6Z A;  3RIL A;  3B9D A;  3GNR A;  2VUY A;  2Y5E A;  4HZ6 A;  5HOS A;  1GOK A;  4JCL A;  2WM0 A;  3N9K A;  2FH6 A;  1QOX A;  1W91 A;  3O2L A;  1H5V A;  3CIV A;  1K9F A;  1KBB A;  1C8Y A;  2CKR A;  5D8Z A;  2JF6 A;  1CIU A;  3FHQ A;  3WF2 A;  3POH A;  2WCA A;  1JXK A;  2EPN A;  1UH4 A;  3WBA A;  2WMK A;  1WO2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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