4MNMA

Crystal structure of gh18 chitinase (g77w/e119q mutant) from cycas revoluta in complex with (glcnac)4
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGWGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYQYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDPNSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase A
publication title Crystal Structure of GH18 Chitinase from Cycad, Cycas revoluta
rcsb
source organism Cycas revoluta
total genus 122
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4mnmA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4mnmA01
1CGWA 2DEPA 1BSIA 2D24A 5GNYA 3VVGA 4J3UA 1W9UA 1GPFA 3L4XA 5I77A 2Y2WA 1WAWA 3DHPA 1UR9A 4RE2A 1E40A 4PMVA 3ZJKA 3ZT7A 3F5LA 2VR5A 3IAPA 1KFWA 4CD7A 4PMDA 5DO8A 2YLAA 4U5IA 3W82A 2ZWZA 4KRUA 1WDQA 1XH0A 1VBUA 3RM9A 3MU7A 3RIKA 1XYFA 2OSXA 4B3LA 2CKSA 1C8XA 1PZ3A 4Z2GA 5CLWA 2WB5A 4UTFA 2DDXA 5I6SA 5IHSA 5BRPA 3OB8A 3IK2A 3IJ7A 4J28A 2CBVA 1NWTA 5D8WA 5FD0A 3UR7A 6A3HA 2QF8A 1BHGA 1E6SM 3BLKA 1E6PA 1FHLA 1KXTA 5I78A 2VQUA 5GPRA 3W26A 1E0WA 4FF5A 2JIWA 3I3DA 1FA2A 3GBEA 4L4OA 5BRQA 3NDYA 3A4WA 3GXDA 5E0CA 1MQRA 4P8XA 1VEPA 1JDAA 4F9DA 3BAXA 3BMWA 3NJ3A 4UOJA 5HBFA 1W1TA 5DT7A 4DWSD 4ML4A 4YPJA 1UD4A 1NQ6A 1K9FA 1G01A 5DF0A 3N1AA 4XX6A 5A94A 2UY5A 5DFAA 3VMNA 2Q8XA 7TAAA 3PZNA 2BNJA 3T09A 3GH7A 3U7VA 3U5YA 3MMUA 5BXSA 4PCSA 2ZXQA 4ZEPA 3OZOA 4W5UA 3MMWA 2QPSA 1CXIA 3FHAA 3WY1A 2CYGA 1B0IA 1ISXA 3EMZA 1QW9A 1QHOA 5KEZA 8A3HA 3CHEA 3BAWA 1US3A 4JL2A 1TG7A 3O6AA 3PZVA 4D6CA 4MB4A 2VX7A 5CQ1A 1FH7A 1XHGA 2YOCA 2WVUA 4PEEA 3PHAA 1NWUA 2XVPA 1EDGA 2EXOA 3EYPA 1VJZA 3A4XA 1UD2A 4A3YA 1H4PA 5BROA 3EDFA 3VD9A 3WDJA 2XHYA 1ZBCA 3ZQ9A 1QNQA 4CGTA 4P7QA 2V38A 5JUVA 4UOQA 1KB3A 2A3CA 1KGWA 2J47A 1TE1A 5BXRA 1UOKA 1E55A 1XYZA 1CTNA 3VINA 4MADA 3OGRA 2X2YA 1WZLA 1BYBA 2O9RA 5CGMA 1BVZA 5D9NA 1UH2A 1B90A 1XCWA 2JEQA 1E15A 1MW1A 1CPUA 1MVYA 1V03A 2WCAA 3DYMA 1ISYA 1V0LA 3K8MA 2DIJA 2JE8A 1B3WA 4B16A 3M46A 3EDEA 3T2OA 4B9YA 4WKFA 5BYWA 5FKYA 2O9TA 1B3YA 2XVKA 3AIUA 5CPTA 1KQZA 3ARZA 2DH3A 3CUGA 3VIMA 3AMKA 4OZOA 2VCAA 4V2XA 1ZBKA 3CUHA 3BCFA 4TXEA 1V6YA 1V3KA 2YL6A 2ZUMA 1W9XA 2WMGA 3GTNA 4P7OA 4W85A 3PTQA 3W4RA 1R85A 4PBGA 2EEXA 2WANA 4QP0A 3B9DA 3VGHA 3VD5A 3WH5A 4TX8A 2CHOA 3TA9A 4AZIA 3GYCA 2FH8A 4OUEA 4HZ6A 3S2CA 2GDUA 4UOZA 4HPGA 3B8SA 2FDMA 3RDKA 3WEMA 3CZEA 4IPLA 5BXTA 2IXUA 3LPOA 1UZ4A 3WQ6A 2YL8A 1GNXA 2ZXBA 3PZUA 5BCAA 4J3VA 1LQ0A 1MYRA 1GZJA 3CIVA 4QAWA 1J11A 3W29A 2QHAA 3N17A 6CGTA 2W91A 2GK1A 2G41A 3CHFA 3OIHA 1QHPA 1OIMA 1G9HA 1HKMA 4RE4A 1PPIA 2VCBA 3ZO9A 2ZUWA 1DWHM 4UQBA 1JZ5A 3W6LA 1B3ZA 5A6SA 3VX0A 4M56A 2HISA 5FL0A 3LMYA 3WKZA 4CUCA 3BC9A 2WMIA 3W24A 1UA3A 1QNRA 3QHOA 4KWUA 1KGUA 4PSRA 3PZTA 1V3HA 2E9MA 3FAWA 2ZUSA 1IZJA 2BVYA 3AS2A 4PMNA 5ABFB 4B15A 1VRXA 1C91A 1JNDA 4XV0A 2V5CA 4LX4A 1EDTA 2WC4A 4HA4A 2OYKA 2YLLA 2Z1KA 4PN2A 3WF3A 3WD4A 3SCQA 3GZAA 3OLIA 3GM8A 3WF0A 1X1NA 4TX6A 4P8WA 2CHNA 1UKTA 4GI9A 2EPKX 1GOMA 2VO5A 4TUFA 2VZOA 4ATLA 5I2UA 1VEOA 2GK1B 1GOIA 2WKGA 2VJXA 3ARSA 2WC3A 4JFTA 5EBAA 5A69A 3RM8A 5FL1A 3F5JA 3SCOA 1W9VA 2WVVA 4DUVA 1MQQA 1PJ9A 3ZM8A 1OBAA 2GUYA 2BVDA 3F4VA 3WDQA 1KXHA 3THCA 4CD4A 1SFSA 2CERA 2WZIA 4C7GA 2XM1A 2WMIB 1CXFA 3EMQA 4CCEA 5ABHA 3W0KA 3MKKA 3A47A 1UWTA 4GZIA 1JZ3A 2BY3A 4DWSA 2WCGA 1XCXA 1UR1A 4IM4A 3WENA 2J78A 3ARVA 3WF2A 2OYMA 4AEFA 1EHNA 2GSJA 2D0FA 3KZSA 2WMJA 3WH9A 3HJEA 4S3KA 3UG5A 4H04A 3VNYA 1W9DM 2W4XA 1HVXA 2FHFA 2VRQA 2JF7A 3CUFA 4AD4A 1UR4A 3O2LA 1WZKA 2DT3A 4GQRA 4RL3A 1J0IA 3OLEA 4W8AA 3E1F1 4QFUA 4F79A 1W1VA 4PTWA 1HJVA 1HT6A 3AIRA 1TFVA 4D6JA 3DC0A 2WVVB 4AYSA 3FHQA 2IUZA 2YJQA 1BFNA 4Q22A 3D5HA 2W92A 2VRKA 1CLXA 2FGLA 2YL5A 5EB8A 3UESA 4R27A 1K6AA 3AZRA 3VILA 1CBGA 1KXVA 2ZUTA 5CSUA 5A6KA 4DUXA 4FLQA 4DWSB 2UWFA 2ZUNA 1B9ZA 3VDCA 3UG4A 3WL0A 2G4FA 3BSHA 3TTSA 1V3MA 2FH6A 4AZCB 4GO8A 5HPCA 4U3AA 2VCCA 4MPKA 1B3XA 1BAGA 2WMHA 1WB0A 3BAIA 1RP8A 3WQ5A 1NOUA 3MSDA 1JZ2A 1TVNA 1TUXA 3IANA 4CD8A 5IDIA 1MW0A 5D4YA 4Z2IA 2J7HA 2XFRA 4D71A 3W25A 3CMGA 1L0PA 1YHTA 4OKDA 2IXVA 2D1ZA 4A3HA 5JBFA 1H41A 3RO8A 3EMCA 1XH2A 5IFPA 3BMVA 4PTXA 2E3ZA 1VB9A 3AYSA 1XD1A 4LYPA 2FHBA 4WKHA 4LYQA 1W3HA 2CBJA 1DHKA 3CGTA 4LXFA 4HU0A 4JZ5A 3VIHA 3W27A 4M81A 3A3HA 4PMXA 3RPMA 4LQ1A 4X9YA 1ZBWA 3W6MA 1J0JA 3ARXA 4J3WA 1HJSA 3MUIA 3RCNA 4FLSA 4M1RA 3WH7A 3WUBA 4H2CA 3EDDA 1V0NA 3ARPA 2W66A 2YL9A 4CN4A 1ZB5A 1NOWA 3VIJA 2DIEA 4MNJA 2BHYA 1JFHA 1CXEA 4ZENA 1E1EA 1VAHA 2D2OA 1IT0A 1V3IA 4JKMA 5E6ZA 3SCNA 3TONA 1EQPA 1CGXA 1EDQA 3AS3A 1NWRA 3QHMA 5AC5A 1VFFA 3VIKA 4HP5A 1EOMA 5TD4A 4UFLA 4MB3A 1GHRA 1UHVA 3AIWA 1RP9A 5EFDA 2Z1SA 2QPUA 2WXDM 4UR9A 3N12A 1R7AA 3ARWA 1S46A 2DSUA 3VNZA 5I23A 3SEPA 3CHDA 2WLZA 2J7FA 1JL8A 3UETA 1EOKA 1TA3B 1QW8A 4GZJA 1XSKA 1Q6DA 4MDPA 3GBDA 1O7AA 4IISA 4W7WA 2XYLA 3O9NA 4GZEA 1CEOA 1GQLA 4HA3A 3II1A 1LJYA 1UZ1A 1V3JA 1P6WA 5I24A 4WSJA 1HXJA 1UR2A 5LYRA 3AS1A 4UCFA 3ZMRA 3WEOA 1JNEA 2BV9A 3FW6A 1H49A 1W9PA 2TAAA 3K8KA 4GINA 3OG2A 4AMCA 3K46A 4DUWA 5LA1A 3VD3A 2Y4SA 4WJXA 1JIBA 1HX0A 4WK9A 2WNWA 4AZHA 5E6YA 4CCDA 1CLVA 4LGXA 3LPFA 3GXIA 4M8UA 1R86A 4AXNA 3SCWA 2WPGA 1CGYA 3AIEA 1ZJBA 4OOZA 1CWYA 1QNOA 5A8MA 3WNPA 1E4IA 1GJWA 3F5KA 1JYWA 4AZ6A 3AROA 1WZAA 3UCQA 3WUEA 5A6LA 3VOCA 3WD0A 1UG6A 1LWJA 1DWFM 1WDRA 2EQDA 1E4LA 3FNDA 2X05A 4P8UA 4JCLA 1Q6CA 1AQHA 3ARTA 2ZICA 4ATDA 3K8LA 2YA1A 5C8BB 4UQCA 4DM1A 4ZE4A 5E9AA 1SMAA 1PAMA 2CBUA 1MXDA 3RJYA 1QOXA 1Z32X 3VO0A 4D6FA 3BLPX 3SCUA 2ZUUA 3QOKA 5I79A 1RPKA 3M6DA 2OWWA 2GDVA 2JEPA 1BG4A 3AQUA 4QLLA 3BSGA 1D7FA 1EH9A 4DWSC 2WMKA 1HKJA 1UD8A 1M04A 4A4AA 4EKJA 5C71A 1D3CA 4BQ3A 3AXIA 3VGFA 3WDPP 5A8PA 5DMYA 3RMEA 1BYAA 2VZTA 2WSKA 3VUPA 4P8VA 2WM0A 1CENA 3AHZA 4NF7A 2UY4A 2D20A 1HP4A 1UKQA 2OSYA 3QGVA 4U2YA 1G0CA 2WVTA 3VIFA 1KXQA 2PWEA 3VTRA 4QCFA 4TTGA 5HOSA 4W87A 4PTMA 3AHYA 1B31A 4JKLA 2VZSA 2UY2A 1CNVA 4W7UA 4UZSA 1F4HA 4KGJA 4Z2KA 2HVMA 1GOOA 2VX6A 1NWSA 3PZGA 4AW7A 4E2OA 1DTUA 5CGTA 2G3NA 1KCKA 3WD1A 3W38A 2ZUVA 2BY1A 2ZWYA 2XVGA 4J27A 3WN6A 2WZEA 2ZXDA 2VNCA 4L4PA 4W93A 4EE9A 2MANA 1E4MM 4GI8A 1LWHA 3ZIZA 3L4ZA 3PBGA 1UWRA 2OYLA 2XPKA 4QDMA 1WNOA 3AHVA 2DT1A 3U7BA 3AISA 4F8XA 1ESWA 3WH8A 3RILA 4U31A 4N0RA 1XH1A 1LF1A 5E09A 2PBGA 4D72A 3WQ4A 4E8DA 2WCSA 2J7DA 1X6LA 4MJ4A 4M24A 3TP4A 3KWXA 4HZ7A 1K9DA 3W81A 3TTYA 3VX1A 3WNLA 1FFRA 3GNRA 2O92A 1UKPA 1BYDA 3NDZA 3AIBA 1R7OA 1UA7A 1M53A 4UQEA 5ABFA 1LLOA 5E0FA 3ALFA 2ZX9A 3GNPA 1U2YA 2XVNA 1UH3A 2V3DA 3AXXA 3N9KA 5A6BD 4KMQA 4JIEA 1BPLB 4AIOA 3VKKA 2PWFA 4Y7EA 3PZIA 2DQXA 2DSVA 1OB0A 2WLYA 1FH9A 1E6XM 3IJ9A 2XGIA 1UD3A 1CGUA 3AICA 1UYQA 1C3FA 3MV11 3GDBA 3CUJA 2XFYA 2BHUA 4TTUA 3WMSA 5IHRA 1NOFA 1GCYA 4WSKA 1VIWA 1DWIM 3WNKA 4JFWA 3CH9A 5I3DA 5D9OA 3FN9A 3OA5A 3CZKA 2WC7A 3UG3A 4U3CA 3BAKA 1W91A 5D9MA 2Y24A 3WQWA 3ZSTA 4TVCA 1EQCA 3WIJA 1UR0A 2C7FA 1VBRA 5AC4A 1QBBA 1WKYA 2J7EA 1H0GA 1GOWA 2PWDA 2WSPA 5JH8A 4OIFA 2DSKA 2VC9A 5GNXA 1B2YA 3K1DA 4AY1A 3FXYA 3OGVA 4MB5A 1GUVA 1GW1A 2ZX6A 5EMYA 5HXMA 4HTYA 4ACZA 4HMCA 2VRJA 1E6NA 4D6HA 1MW2A 1PX8A 4P7NA 7A3HA 2VX5A 1J9YA 4MAZA 1GOQA 4CU8A 4AZ5A 4FLRA 5AYBA 1CGVA 3SIMA 1AMYA 5A6JA 4NRSA 2AOSA 1KWKA 4TVDA 1QI2A 3VGGA 1E0VA 1K9EA 1OM0A 4H7VA 1UWSA 1LG1A 2AAAA 2J7BA 4PMRA 1QBAA 2XWDA 3FAXA 2XSAA 1NP0A 2NT0A 2YBTA 2DH2A 1C7TA 3SCRA 4MB1A 1KCLA 3KEHA 1KWGA 3ZOAA 4PMQA 1G5AA 4EK7A 1CZ1A 5EFFA 3WBEA 4F9JA 4V27A 4AZCA 3MSGA 4R5EA 4C7DA 1UH4A 4HU8A 1A3HA 3UERA 2EBNA 1OT1A 1OD8A 2YDRA 2RGMA 1E70M 2CEQA 4ACZB 3WFZA 1QHZA 5CPQA 4W8BA 4D6EA 1UWUA 5A1AA 1WDSA 2BXYA 3MO4A 4YHEA 1ZU8A 4Q7NA 3W37A 3WUGA 3EBVA 3L4UA 1V02A 4M80A 3L2LA 4AD5A 1J18A 2E8ZA 1JZ8A 3WMCA 4EAMA 3N18A 4KH2A 1EGZA 2VVSA 3MUY1 4AWEA 1CGTA 3KE0A 4Z2JA 3ARUA 5FOOA 4W89A 1VFUA 2VURA 1L8NA 1Q6GA 1J01A 2VR4A 5LA2A 3NIYA 3B9EA 3ARYA 2YBUA 1VEMA 1Q6EA 4PMZA 2E0PA 1US2A 4AD1A 3OLDA 2PBOA 4UZUA 4D6GA 2G3JA 2PF0A 1VFOA 2PB1A 3VMPA 1M7XA 3TTOA 3WNOA 3SCPA 3SUUA 2W62A 1QPKA 4W86A 4MNLA 4AC1X 1ISWA 1B30A 4HZ8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1H5V A;  4MTV A;  4QLK A;  4IUG A;  4UFJ A;  1GON A;  4MJ2 A;  4FLO A;  2E9B A;  3AI0 A;  3AMG A;  5M17 A;  1XV8 A;  3POC A;  2A3A A;  5A6M A;  5GQB A;  3B9A A;  3SUV A;  1RD6 A;  4NZC A;  4JCM A;  3N11 A;  1BVN P;  1UD5 A;  4P7L A;  3WNN A;  2EPL X;  4GQQ A;  4BA0 A;  4CD6 A;  4UQD A;  3K4D A;  4M82 A;  5ECU A;  4CD5 A;  5IXE A;  1OIN A;  1E5J A;  2X09 A;  1FHD A;  1OGB A;  2PI6 A;  2J62 A;  2J74 A;  3AIQ A;  1WO2 A;  1BTC A;  2D0G A;  1BLI A;  3EDJ A;  2W63 A;  1LL6 A;  1E71 M;  1QI0 A;  1H1N A;  1UQY A;  3SCS A;  3TTQ A;  1ITX A;  4AZB A;  3T2P A;  2F61 A;  1E6Z A;  2VVN A;  4CKQ A;  5JBE A;  4PMU A;  3ZSS A;  1ISV A;  2FHC A;  3PZQ A;  2GFT A;  2CCR A;  3T2Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2WMF A;  2HCV A;  2YDS A;  4QDW A;  2HNE A;  3APT A;  3DI1 A;  4PFM A;  3BPW A;  4KGL A;  4LCR A;  2PDK A;  4D6D A;  5BMX A;  4O2T A;  1ODZ A;  4CNS A;  4UNK A;  1F4A A;  2PA6 A;  3B4U A;  2CZD A;  1AG1 O;  2HE5 A;  1K03 A;  5D2W A;  3H54 A;  4FX6 M;  3TJ4 A;  4GFS A;  4M3P A;  2XTK A;  2JBM A;  3GUW A;  3VD4 A;  1RBL A;  1XI3 A;  5CBI A;  3TX9 A;  3W75 A;  2G3M A;  1JZ6 A;  1I6N A;  4A05 A;  3W7Q A;  3OVQ A;  3MYO A;  3I68 A;  2OCZ A;  3IAQ A;  5A8N A;  3QY8 A;  2VN1 A;  4LAX A;  3AMC A;  3GG1 A;  2E1D A;  5FJR A;  4CCC A;  1FKB A;  1H51 A;  3BG3 A;  4B2D A;  4GI4 A;  4LBU A;  7ENL A;  4E3T A;  1QK2 A;  3BLF A;  3G2G A;  2X0Y A;  3V4B A;  1D7I A;  1IYX A;  1JVN A;  1W56 A;  2BTM A;  4IQC A;  1EA9 C;  2XGZ A;  1OC6 A;  1BG9 A;  3IV3 A;  5LIK X;  3M0I A;  3KDO A;  1PL9 A;  2D0H A;  2ZZ6 A;  4JQ4 A;  3TNO A;  1R9X A;  1H5V A;  1BKS A;  4MTV A;  2FIQ A;  4UTL A;  3P62 A;  4UFJ A;  2QCM A;  4MJ2 A;  2E9B A;  3AI0 A;  3AMG A;  5F4X A;  3P80 A;  3POC A;  3M0Z A;  5A6M A;  3O1N A;  2WOQ A;  4AX6 A;  2PRL A;  4A8R A;  1TKK A;  3WNN A;  2WO5 A;  1TWS A;  3HQ1 A;  3CEU A;  3K4D A;  4IL0 A;  1TYG A;  1OIN A;  1E5J A;  4IQD A;  1XLB A;  1VCV A;  5DIV A;  3O05 A;  2J74 A;  1WO2 A;  1RQE A;  1ZCC A;  1IE7 C;  1PUD A;  2PGE A;  4LS2 A;  1LL6 A;  4FIR A;  1QI0 A;  4BR1 A;  4EX4 A;  2I14 A;  4AZB A;  4QQ3 A;  4CKQ A;  3E9A A;  5JBE A;  2PP1 A;  3D6N A;  3B0X A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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