4NZCA

Crystal structure of chitinase d from serratia proteamaculans at 1.45 angstrom resolution
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
398
structure length
397
Chain Sequence
AHAASYLSVGYFNGGGDVTAGPGGDINKLDVTQITHLNYSFGLIYNDEKQETNPALKDPSRLHQIYLSPKVADLQLLPVLRKQNPELKVLLSVGGWGARGFSGAAATAESRAVFIRSVQQVIKQYHLDGIDLDWEYPVNGAWGLVESQPADRANFTLLLAELHKALDKGKLLTIAVGANVKSPQEWVDVKGIAPYLDYINLMTYDMAYGTQYFNSNLYDSKQWPTVAAADRYSANFVVDNYLAAGLKPAQLNLGIGFYGRVPKRATEPGIDWDKADAAKNPVTQPYFTARETAVFKAMGLDLTKDSYFKYNDIVSKLLNDPQRRFTAHWDSDAQVPYLTMKSAEGKPLFAISYENPRSVALKADYIKSKGLGGAMFWEYGADDNNRLAHQLAESLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Glycoside hydrolase family 18
publication title Structure of chitinase D from Serratia proteamaculans reveals the structural basis of its dual action of hydrolysis and transglycosylation
pubmed rcsb
source organism Serratia proteamaculans
total genus 128
structure length 397
sequence length 398
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4nzcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4nzcA01
3ARZA 4AD4A 1Y7VA 2XSAA 3AMLA 3N15A 2WSKA 8CGTA 2ZXAA 5LYRA 1V02A 3KE0A 1MW2A 3NSXA 4C7GA 3AZTA 1OSEA 4MJ4A 7A3HA 4FK9A 3VM5A 2FGLA 1UH2A 2JIWA 3L4UA 5D9OA 3N12A 4J3UA 1DP0A 1OBAA 1W2VA 3CUJA 3CMJA 4GI9A 4MDOA 3CO4A 1V3KA 4ZENA 3AZRA 2WYSA 3OLGA 4W86A 2FHCA 4AD0A 1GCYA 1OCQA 1V6VA 1JZ6A 1VFFA 1VIWA 1QNQA 2BHYA 2D24A 3VIJA 1GJUA 1ZS2A 3ARWA 1G5AA 3VIFA 2VZUA 5LA2A 4RE4A 1W32A 5GNZA 3OGVA 3VOCA 4CVUA 5CQ1A 4BQ3A 1BYBA 3CZJA 4JIEA 4P8VA 1GOQA 4UFLA 4CD4A 4JFTA 1N82A 5FKYA 5KEZA 1V0MA 1OIFA 1H09A 1QHZA 2QV4A 1JI2A 1EQPA 3AICA 2UY2A 3WDHA 3WF4A 1V3IA 1JGIA 3M07A 5GQBA 2GUYA 3MANA 4A3YA 4W5ZA 4WIWA 5A8OA 1KCLA 2CBJA 1UD4A 1E4MM 2VX4A 4MJ2A 5I24A 1HX0A 2EO7A 1JF5A 4CN4A 1MQPA 4NF7A 1JF6A 1LWJA 1ZJBA 1EDTA 5E9AA 1OM0A 3W38A 4M82A 5D4YA 4ATDA 3VDCA 1OWQA 4MNJA 1GOWA 1HVQA 4U5IA 2WW5A 3VGGA 2VZSA 4PSRA 1HL9A 1PIFA 1MVYA 3BLPX 5A3HA 3W6LA 5D9NA 1BF2A 2WLZA 3W81A 4AISA 1EIBA 2VQUA 3ZOAA 3TA9A 2PWGA 3VD5A 3PZUA 1OGBA 1UR8A 3A6OA 1UWTA 2GJPA 4F9DA 2WVVB 4A3HA 1W3JA 5BXRA 1E6NA 3OLIA 3L4XA 5M3WA 2XUCA 3CHCA 1WO2A 2WMHA 3AIWA 3WQWA 3AYSA 2AAAA 2WBKA 2J7DA 3WDJA 3ZT5A 3BLKA 2VJXA 2CYGA 3T0BA 1QNOA 1MQQA 2W91A 2CKRA 1ISXA 3WNMA 3CH9A 3EMQA 3VNYA 3AIVA 2QPSA 3WH6A 4MTVA 1XRVA 1OB0A 3UEQA 4DWSB 3WQ8A 4U31A 2GJXB 5I23A 4J27A 3CBWA 4URIA 1H4PA 1HJWA 3QOMA 4MB3A 4D6EA 1E6RA 1C90A 4HMCA 3ARVA 4HZ8A 3EBVA 5ECUA 2J7GA 1XH2A 4P8WA 2J7CA 3A4WA 3GTNA 2GDVA 4GI8A 1HKJA 4P8UA 1EH9A 3SCNA 3VD9A 1ZBVA 1C8XA 1QOXA 3FY1A 5CPTA 5A6AA 1WNOA 2PBGA 1GUVA 4M24A 4TXEA 4YHEA 1U2YA 3FAWA 4MB4A 2VMFA 1JZ8A 2DEPA 4GXPA 4HA4A 4HA3A 4QDMA 1JZ4A 4OBSA 1CZ1A 1GORA 4P7RA 2DT0A 1WDSA 5E6ZA 3GH7A 1TR1A 2XIBA 4ATLA 2D0HA 1V03A 1WP6A 3AXHA 3K8LA 4X0VA 3AOFA 3JUGA 2VVSA 1MW0A 2EPNA 5E0CA 3RM8A 5BROA 3ARQA 1QI3A 2WCGA 5EBAA 1MWOA 1JZ3A 2FHBA 4UFHA 5HBFA 1JDCA 4D6FA 3AMKA 1B30A 4P8XA 1FH8A 1X6NA 2CHOA 1MFVA 3S2CA 1LLOA 1A47A 4HPHA 1MQRA 3AZSA 1CGVA 1CXFA 1HN1A 2E0PA 2WCSA 1MW3A 1UWRA 4RL3A 2PB1A 4PMQA 3AHZA 4PMZA 1AQMA 2W92A 1LG2A 2VUYA 5CPQA 1CYGA 3BAJA 2WC3A 2DSUA 5D8ZA 4WSKA 5GNYA 4EK7A 1NOFA 2VX6A 3GM8A 2D23A 2HISA 1PZ2A 2YL6A 4PMOA 2YLAA 4KGLA 5CLWA 2EPLX 3DC0A 1TVNA 4D71A 1NWUA 3CZEA 3GNPA 3VM7A 3NJ3A 3U5UA 4X0NA 5CLTA 1E6QM 1E5JA 2V3DA 2EPKX 1TFVA 4J3SA 4KWUA 4UCFA 3ZR6A 1VRXA 5DF0A 3ZJ8A 3L2LA 3SEPA 3AQUA 3ARUA 3VIKA 1ISZA 4CU7A 3NDZA 1V6UA 3BH4A 3PHAA 3L4WA 1KCKA 2X0YA 2V3GA 7TAAA 1GQLA 1HF6A 1Z32X 5HDRA 2WMKA 5EB8A 1HKMA 2J25A 4PUDA 4AZ5A 4IISA 1JAEA 2YL8A 1J0IA 3LPOA 3RJYA 3I3DA 4F66A 2CBVA 1PPIA 5FL1A 4H7VA 1J18A 3F5LA 1WKYA 3WN6A 1I1XA 4AZHA 1FHDA 6CGTA 4MNKA 3GBEA 3IJ7A 4OZOA 4TX6A 4MADA 2JEPA 1R85A 2A3EA 1CXEA 2W5FA 3WD0A 2E4TA 1UD5A 2J7BA 2ZUNA 3U5YA 1SMDA 4OOUA 1GPFA 3TTYA 1BYCA 2IXUA 4E8CA 4PMYA 3PZOA 2PI6A 3SUUA 4WKFA 4FLOA 4W88A 1TCMA 2D1ZA 2G3JA 5A8NA 4CN1A 2J8GA 2ZX6A 3WSUA 1UR0A 1U33A 3GXFA 4QFUA 4DWSD 1ZB5A 1VENA 1J9YA 5ABEA 1NARA 3WFLA 4PBGA 5IFTA 1HJQA 4LPCA 4QLLA 2J4GA 3UR7A 4N0RA 4L4PA 4JFUA 3T09A 5A6JA 4CD6A 4UOZA 2WVTA 1UR4A 1B1YA 1OT2A 3ZSTA 1DWJM 1SFSA 3SUTA 3WUBA 5D9MA 1GOKA 1W1VA 2VCAA 1DWHM 4AC1X 3KWXA 1HXJA 4TUFA 4TOQA 3GBDA 1XSKA 4UZUA 1K9TA 1D3CA 3PZMA 3UCQA 4W7VA 3AS0A 4OOZA 4WKAA 2NT0A 3EDFA 3BAYA 3BGAA 3W26A 3GNRA 1CXKA 5CSYA 2BS9A 1KBKA 4NI3A 2ZWZA 3WD3A 3IK2A 2IUZA 2ZUWA 1JD7A 2G41A 2A3AA 3O9NA 1UWUA 1CGTA 1B3YA 4UOQA 4C7DA 4ACZB 1WAWA 3F4VA 2NW0A 4DM1A 3WDPP 5LA0A 3WL0A 1HJSA 1XGZA 1QVBA 4MPKA 1E15A 2VCBA 1NWTA 3RMEA 1JYNA 4AZBA 2TAAA 1BFNA 2UY5A 3WH7A 2UWFA 1JDAA 2OYLA 3HU7A 1GVYA 4BQ2A 2XTKA 5A8PA 2E9BA 3SCWA 4PUEA 2QHAA 4BS0A 1YQ2A 4EAMA 4E8DA 1CIUA 1W91A 1FH9A 1JI1A 2WM0A 4DWSC 3ARPA 3ARYA 4QP0A 4MAVA 1F4AA 1E6ZA 1VFUA 4J28A 1K9EA 3T0AA 1JL8A 3WH8A 3DYMA 3W29A 3PZIA 3VGDA 2CITA 3BCFA 2QMKA 3L4VA 1SYTA 4UQ9A 5LA1A 2ZX9A 4HP5A 5I6SA 4V27A 5A6MA 3II1A 1WPCA 5BYWA 3MUZ1 3GH4A 3W24A 1E6XM 4YPJA 4YHGA 4E4PA 3OIHA 2YBTA 2MANA 2C0HA 3QHNA 1V3HA 1V3JA 3AS1A 2WVUA 4GO9A 3VILA 1VJZA 5JBEA 3OZOA 1HJVA 2G8ZA 4U2YA 3L4YA 1QPKA 2G3IA 1ESWA 4AW7A 3O2LA 4KGJA 4LYRA 8A3HA 2Z1SA 4TVDA 4AEFA 3BAKA 4J3VA 3T2PA 3OLDA 4BA0A 4PMRA 1OT1A 3MUY1 3VDBA 3AFBA 1FFRA 2A3HA 2WK2A 2E8YA 1VFOA 3K1DA 4GIAA 1UKOA 4XZWA 5FCZA 3L4TA 2QLYA 1B0IA 1CENA 2VR5A 1AQHA 5I77A 4AZ7A 3K4AA 2PWHA 2BHUA 4HA1A 4MDPA 3AHYA 1BYDA 1H5VA 1UKQA 2ZX7A 3MMDA 4TTUA 1ZJAA 2WB5A 2CNCA 4J7RA 5BXSA 1GNXA 1YHTA 2W4XA 4HPGA 3GH5A 4Z2LA 5GPRA 1XV8A 2XFYA 3CLWA 5BRQA 3ALFA 4CVWA 2W63A 5CXPA 3BCDA 1DHKA 1DEDA 3MSGA 2CEQA 1OINA 4LXFA 3CGTA 4U2ZA 3UERA 4W85A 4MB1A 2PF0A 5C8BB 1JXJA 1IZJA 2XVPA 2Y4SA 2X09A 3OGRA 1G1YA 1J11A 3N17A 3THCA 1G0CA 3ZT7A 2QPUA 3W27A 3PTMA 1R7OA 3UG5A 3U57A 1UZ4A 3I3BA 1XHGA 3EDJA 1BVZA 4W7WA 2OLHA 1E56A 4U3CA 4WK9A 2BY3A 2V5CA 4IPNB 2RGMA 1UD2A 3MO4A 1UQYA 5CJ5A 4AEEA 5BCAA 4AD1A 1UR1A 4W5UA 3SURA 1C8QA 1BG4A 2GK1B 1W9UA 5E70A 1BGGA 2VR4A 1G94A 4UNIA 3AI0A 2DSKA 5M17A 2JIEA 4U33A 3CUGA 3SIMA 2X1IA 2FDMA 4PTVA 3ZIZA 2WVVA 3ECQA 2W62A 2ZOXA 3SCSA 5BXPA 2Y8KA 3IJ8A 3ARXA 2WSPA 1SMAA 2VZTA 5IHRA 2Y24A 4FLQA 2J75A 4AZCB 2DGAA 3VIIA 2JFEX 2ZICA 4M56A 1H41A 1PAMA 4AZ6A 1JYXA 3GNOA 4ML4A 1J12A 3SCPA 1UR9A 1CGWA 3TOPA 2WHLA 4XB3A 4B16A 1J01A 4JL1A 1J0KA 2PC8A 3ZQ9A 4DWSA 2ESCA 3S6TA 1JFXA 2GJXA 1LWHA 2CKSA 1E4LA 5AY7A 2GFTA 2OSXA 2WKGA 3VD4A 2WHKA 1AQ0A 2YLLA 3OZPA 4UQEA 1UHVA 4QCEA 3NUKA 2DIJA 1B9ZA 2CXGA 4CU8A 1V3MA 1BSIA 1MXGA 3NCOA 2XWEA 4J3TA 1X6LA 2O9TA 3VMOA 4AY1A 3IAPA 2E3ZA 2V5DA 1F4HA 1J0JA 1XSJA 2YBUA 3LPPA 3ZSSA 1XD0A 1ISVA 2GJRA 1NP0A 3DHPA 3IAQA 4J3XA 2YKKA 4DUWA 5CGTA 2PWEA 1QBBA 2J62A 3RDKA 2EQDA 2CESA 3W53A 4ZFMA 3AS2A 3BSGA 3WENA 1W1PA 3WH9A 4AIOA 1LL7A 2BFGA 2VNCA 1W9VA 2DPEA 3VINA 5DO8A 3RCNA 1NP2A 1KGUA 2XIIA 2XJ7A 2OYKA 3QR3A 3RPMA 3G6MA 2C8NA 2DQXA 4W8AA 3WQ6A 1JFHA 1H0GA 1EDQA 4HMEA 4OBRA 3CUHA 3PTKA 4AIUA 3VGHA 3WFZA 4PMXA 3THDA 3K8KA 5I3DA 1Q6DA 1VF8A 2GVYA 1PEZA 4PMNA 4W7UA 3MU7A 1GQJA 3MV11 5D8WA 4N42A 5DFAA 1Q6EA 1DWIM 2FHFA 5JIWA 1GVIA 1UD8A 2VRJA 4PCTA 2A3BA 3M7SA 1TZ7A 2DH3A 1CECA 2FH8A 1S46A 2DH2A 2XYLA 1TVPA 2ZXBA 4CUCA 3ALGA 1QI2A 3GZAA 1V6XA 3PZQA 1UOKA 5JBFA 4H8VA 2Z1KA 2VVNA 1XCXA 3OB8A 1WB0A 4DUXA 3AXIA 4TVUA 2DDXA 2G3MA 3FNDA 5I0DA 2UY3A 2BY0A 2WHMA 3EDDA 1US2A 2EXOA 2W67A 4B9ZA 1DWFM 2OYMA 5BRPA 3RILA 3CIVA 2OWXA 2BV9A 4KRTA 1GQIA 1EHNA 3TONA 1L0PA 4WF7A 1VFMA 2O9RA 5EFFA 2X0HA 3E1F1 4DUVA 2WMFA 2Q8XA 3AMDA 4F9JA 3HJEA 4HOWA 2W61A 4XZBA 1WZLA 1ZL1A 5FOOA 3OGSA 1UZ1A 2VRKA 2YDQA 3VVGA 1BAGA 1CGYA 3WNLA 1V08A 1E9LA 1LG1A 2G4FA 1E1FA 4H8HA 1UWSA 1LF1A 4Q22A 3WF2A 1BVNP 4DM2A 5GNXA 4R5EA 2VQTA 2XFRA 3VU2A 1CLVA 1PZ3A 2D0FA 2YA2A 4NRSA 1IV8A 2OWCA 3AIBA 1CBGA 3WMCA 2JEQA 5BWFA 1KR1A 1HT6A 4W8BA 4MB5A 1UQZA 5JUVA 5A6SA 4CD7A 3QOKA 1CXLA 1KXHA 4CCEA 5I2UA 3VIMA 3WDRA 2WZIA 3RO8A 4FF5A 1CGXA 1BTCA 5TD4A 3SCQA 1ECEA 3UETA 4JZ5A 2WC7A 4JFSA 3WNPA 4ZE5A 1XD1A 3A4AA 1K9FA 4B3KA 1JNDA 3WUGA 4HOZA 2D20A 5CSUA 5CGMA 4PYSA 3B8SA 4CN6A 2CCRA 1Q6GA 3ZMRA 2ZUSA 3WELA 4V28A 3FW6A 3ZM8A 6TAAA 2ZX8A 2Y2WA 1MW1A 3CPUA 4JCMA 3L4ZA 5AYBA 1B3ZA 3MUAA 2V38A 4PEEA 4V2XA 4UFIA 1E3ZA 2E40A 3OBAA 3SCUA 3VGEA 3VX1A 4FLRA 4CKQA 2J74A 3O6AA 4X9YA 1E3XA 4F8XA 1GOMA 3AROA 3DYOA 3T2OA 5I79A 2VCCA 3TP4A 4CU6A 3MS8A 4EE9A 3T0DA 2BHZA 1QI0A 2YL9A 4D6DA 1FP9A 1VEMA 5AYIA 3NSMA 3ZO9A 2DT1A 3QGVA 4P7QA 2XFFA 4ZEPA 4ACZA 4IPLA 3J7HA 1WZKA 4H2CA 4ATWA 3ARRA 4IM4A 5JIPA 1J0ZA 3BC9A 3ZT6A 1J0YA 1I75A 1EQCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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