4Q22A

Crystal structure of chitinase d from serratia proteamaculans in complex with n-acetyl glucosamine at 1.93 angstrom resolution
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
398
structure length
397
Chain Sequence
AHAASYLSVGYFNGGGDVTAGPGGDINKLDVTQITHLNYSFGLIYNDEKQETNPALKDPSRLHQIYLSPKVADLQLLPVLRKQNPELKVLLSVGGWGARGFSGAAATAESRAVFIRSVQQVIKQYHLDGIDLDWEYPVNGAWGLVESQPADRANFTLLLAELHKALDKGKLLTIAVGANVKSPQEWVDVKGIAPYLDYINLMTYDMAYGTQYFNSNLYDSKQWPTVAAADRYSANFVVDNYLAAGLKPAQLNLGIGFYGRVPKRATEPGIDWDKADAAKNPVTQPYFTARETAVFKAMGLDLTKDSYFKYNDIVSKLLNDPQRRFTAHWDSDAQVPYLTMKSAEGKPLFAISYENPRSVALKADYIKSKGLGGAMFWEYGADDNNRLAHQLAESLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Chitinase D from Serratia proteamaculans in complex with N-acetyl glucosamine at 1.93 Angstrom resolution
rcsb
molecule keywords Glycoside hydrolase family 18
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia proteamaculans
total genus 128
structure length 397
sequence length 398
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4q22A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4q22A01
3ARYA 3WD3A 3NUKA 4UOQA 4WKHA 3GBEA 2WMHA 5D9PA 4MJ4A 5A2AA 3SCUA 2QMKA 3CHEA 4KGJA 2YIHA 3ZT7A 1CGVA 4LGXA 3MUZ1 3SCPA 4OZOA 4WSJA 4IM4A 1KXQA 3N9KA 4PMXA 3WENA 3GZAA 4W7WA 5CPQA 1CENA 1BYBA 1GOMA 4J3UA 3DYOA 1UWTA 3DYPA 4UFJA 4HP5A 1EO7A 3WD1A 4XUYA 5D8WA 4W93A 2JIEA 4PTWA 3QGVA 4L4OA 3T2QA 8A3HA 5BXRA 2EPKX 3SUWA 3VNZA 1R86A 1GNXA 1BPLB 5CSYA 5FOOA 3CUHA 1FP8A 4AEFA 4DWSD 4J3VA 5A94A 1QW8A 5ECUA 2VMFA 5ABEA 1E55A 4TTUA 2UY4A 2C8NA 1W3HA 3AHYA 2WMKA 1PZ2A 4QP0A 3NDZA 3GXIA 4PEEA 3VX0A 2W4XA 5CPSA 1S46A 4DWSA 1JYNA 4PMQA 1ISYA 1P6WA 2GJRA 2ZE0A 2BY3A 3F5KA 4CVUA 5CQ1A 2XG9A 1VFFA 1B0IA 4WF7A 4CU8A 2OLHA 4W7UA 3M46A 2DT3A 3PN8A 4EKJA 1NOFA 2IXVA 1O6IA 3ZSTA 1HKKA 3RJYA 4H8HA 2PB1A 3N13A 3AHVA 2CIPA 5FL0A 3LPGA 1JYVA 2WVTA 2OYKA 4D6IA 2WMJA 4LYQA 4AC1X 5CZKA 2YL9A 1QBAA 5EB8A 1E43A 2WBGA 3O2LA 4UR9A 1CXIA 4WIWA 1QNSA 3OZPA 3RIKA 2JIWA 3WDIA 3ZO9A 2GK1B 2WANA 1FOBA 4MDPA 4FMVA 3L4WA 2BXZA 4U2ZA 1WO2A 1TUXA 4XZBA 2WSKA 1MVYA 3MV01 3WEOA 2Y2WA 4OOZA 1DHKA 1GQKA 4H8UA 5BCAA 3TTYA 3VDBA 1TCMA 3MU7A 3NJ3A 3DYMA 4AY1A 4AD0A 3W53A 1UD3A 2FHBA 3AJ7A 5A6BD 1GW1A 5IDIA 1WCGA 3CUFA 3TTSA 1JIBA 2ZX6A 1CZ1A 2G4FA 2Z1KA 4GI8A 4JFTA 3I3DA 2GSJA 3B9EA 1AVAA 2G41A 3VD4A 3VPLA 2WPGA 5BROA 5C70A 1GUVA 3G6LA 3UR8A 2JEPA 3D3AA 1JZ6A 4JCLA 3ARWA 3CH9A 3CGTA 4ZE5A 1EO5A 1W9UA 3CUIA 3RJXA 3WUEA 2O9PA 4L4PA 4JL2A 3AYSA 2CBIA 2BHUA 2D0HA 2OYMA 2PF0A 4PUDA 3PZNA 3L2MA 2UY3A 3OZOA 1C8XA 2GJXA 3VIIA 2C0HA 3O9NA 3GBDA 1G0CA 2VZOA 3WBAA 4J28A 5I78A 3WEZA 2VRQA 1W32A 5E9AA 1UWSA 5AC4A 1PIGA 3EDJA 2Y5EA 2V3EA 2ZXBA 2E4TA 4KRUA 5ABGA 2CPUA 1D3CA 1K9TA 1FFRA 1E1FA 3ZJKA 1MXGA 2D1ZA 4U31A 4D1JA 2YBTA 1CYGA 2G3JA 4W84A 4HOZA 5I6SA 1EOKA 2V3GA 2V3DA 1VEPA 3N04A 1X6LA 3VM7A 2VZUA 2OSYA 5KZ6A 1KQZA 1TMQA 1Z32X 3TP4A 1E72M 5D9MA 5KEZA 3CLWA 2DQXA 1R85A 1V0MA 3RDKA 1SMAA 3WUGA 1NOWA 2ZX8A 2XYLA 1GPFA 2E8YA 3BH4A 1OWQA 5M03A 1A47A 4UFIA 3MKKA 1UD4A 4F66A 1XGZA 3AMKA 1UWQA 1V6XA 3SCVA 4OJYA 3WH8A 3MMUA 2VNCA 3ARTA 2W66A 4D6CA 2BS9A 3GXMA 6A3HA 1ZBCA 3KWXA 4PMRA 5BYWA 1TR1A 1HKJA 3SCQA 3VD5A 3AIUA 2D24A 4Z2IA 4S3JA 2VR5A 4MAZA 4AZCB 2OWXA 4N0RA 4AIOA 3VDCA 4XV0A 1HT6A 1WDRA 2CXGA 1CWYA 4BA0A 3AISA 1J0JA 3AQUA 1JZ2A 1ZJBA 2PWEA 1FA2A 1XSJA 2DSKA 3VMOA 4RE3A 4P7NA 5DMYA 5A8PA 4XX6A 2A3CA 2DT1A 5E6YA 3WH7A 4OKDA 3WF3A 4X0NA 2OSXA 2Y4SA 4F9JA 2YKKA 3AI0A 1Q6CA 1VBRA 3BAKA 2G8ZA 5JIWA 2F2HA 3WH9A 1ZBWA 3ARSA 4CD7A 2V5CA 4UQCA 3EMQA 4CCDA 4ML4A 4E8DA 1JL8A 4M24A 4GKLA 3AICA 4UQEA 3WSUA 1WNOA 1HJXA 1QNPA 4EE9A 1W3JA 1OINA 1QPKA 4MJ2A 4TVCA 4JFVA 4RL3A 1KGXA 1XH1A 4AIEA 1XV8A 3VIJA 3CZ8A 3IJ9A 3F4VA 3WNKA 1OSEA 1GJUA 1E4MM 3VGGA 4FF5A 4KWUA 5CPTA 2YLAA 2BY2A 4M1RA 4NSBA 2VCCA 2X2YA 1VF8A 1XC6A 3MO4A 3GNPA 2J77A 4HZ8A 5JBEA 1PX8A 1GCYA 3AMDA 1EH9A 4IPLA 1V02A 4R5EA 5I5RA 3T2OA 4ATLA 2ZWYA 2D20A 1JFHA 1LL6A 3VINA 2J7BA 3VGFA 4PRWA 1W1YA 2YA1A 3RPMA 4J27A 2D0GA 5LA2A 1QNRA 2DT2A 2J7DA 3HU7A 5FL1A 4MADA 5I2UA 2AAAA 2J8FA 2OWWA 4U2YA 4A3YA 4HZ6A 1GQIA 2NT0A 3KL5A 4W85A 3D5HA 3SCRA 1ITCA 2VRKA 1HJVA 1E0XA 5DF0A 1A3HA 4WLCA 1QI0A 4AXNA 4CD6A 3TTQA 4UZUA 5FD0A 3CMGA 1EIBA 1V0KA 4PN2A 1H2JA 1B9ZA 2BVTA 1LG1A 4V27A 5M17A 2ZUSA 1CXKA 1LF1A 3QR3A 1MFUA 4W8BA 5LA0A 4ATDA 2YL6A 1CECA 4PCTA 4NF7A 2OYLA 4PTMA 2QF8A 3W25A 4GI6A 3WELA 3UEQA 2PI6A 1PZ3A 3QOMA 2FHFA 4D6HA 2WM0A 3W24A 2J8GA 3AYRA 2YL8A 4UQAA 1KR0A 3WF0A 1O7AA 1JI1A 1J0HA 3EDDA 2W63A 3LPFA 1G9HA 4UFMA 1F4HA 2VX6A 4H2CA 4CD4A 4MNKA 3TONA 1V0NA 2O92A 2NT1A 3PHAA 2EJ1A 2BVDA 1W2PA 2NSXA 1UR8A 4GQRA 3W28A 1WDQA 3NDYA 2GDUA 3AXHA 1OIFA 3BSHA 3GXFA 3ARQA 5EFFA 1W2VA 5GNXA 3AMLA 3APGA 1EDQA 1C8YA 4HOXA 2QLYA 4UFHA 3SCTA 3B9DA 4CCEA 4R27A 3ZT6A 1F4AA 2VQUA 3K8MA 4MNMA 2G3MA 3K8LA 3K46A 1PEZA 3RM4A 4C7DA 3WN6A 1LJYA 1CGUA 2JF7A 5CLTA 3ECQA 1I75A 3N1AA 2E9LA 2VVNA 2XGBA 2YDQA 4AMCA 2GFTA 3WNPA 1HJSA 5E0FA 1JGIA 3A3HA 4TXEA 3AIWA 1PAMA 3VIMA 1EHNA 3WMSA 3N12A 3OB8A 3SIMA 1GHSA 3HMCA 1QHZA 2Y24A 3AXXA 1CPUA 2PBGA 2ZXQA 3AIEA 2CESA 2A3AA 3NCOA 2WVUA 1UHVA 3SCSA 1CXEA 1UKOA 1E9LA 2WMIA 3ZM8A 3WKZA 1C90A 4Q7NA 4JIEA 2BY0A 2HISA 3BAWA 3POCA 1U30A 4FLRA 2EPMX 4Z2LA 4AWEA 5JBFA 1BTCA 4HMDA 4RE2A 1XH2A 3VKKA 1JAKA 2E3ZA 2X8RA 1JD9A 2XM2A 3BCFA 4PMNA 1C91A 3POHA 1MQRA 3M7SA 1KXHA 4P8WA 3BAYA 4PBGA 4F8XA 4P8XA 5A3HA 3K4AA 1MW0A 1FHLA 1C8QA 5FIPA 2JALA 4JHOA 3I3EA 4XB3A 3AS3A 2GDVA 3GTNA 5LA1A 3ZT5A 4U3CA 3WF1A 4FLOA 5DFAA 1VAHA 4J3SA 2ZUWA 1E6NA 2VZSA 2JEQA 4OUEA 4U5IA 4TX8A 1LL4A 1KXTA 3W4RA 1G94A 1V3HA 2GJPA 2V3FA 5I0DA 4B9ZA 3II1A 5M5DA 4MTVA 4AZBA 2ZX5A 1FH9A 3CPUA 4ZENA 1EHAA 1PBGA 4ZFMA 6CGTA 4LYPA 1D7FA 4J3WA 2BNJA 2D2OA 3IJ7A 3M07A 1KWKA 2Y8VA 2VRJA 2YDRA 1MXDA 5HDRA 1GHRA 2AOSA 3W26A 1H3GA 2XUCA 5BXPA 1MW1A 3QHMA 1GOKA 2VZTA 2WLZA 1G01A 5EBAA 4IPNB 1HJQA 1GOWA 3W37A 1W91A 1GOIA 1VEMA 3THDA 3IK2A 1JZ7A 3GNOA 2A3BA 5BXTA 2PWFA 3EBVA 3N18A 5EMYA 3VIHA 2ZOXA 4HZ7A 3BMVA 2QHAA 1V08A 4MPKA 3OGVA 2WWDA 4HA4A 4HPGA 2WK2A 3DC0A 4ATWA 3ARVA 4M81A 1ZL1A 5I77A 2WMGA 4WKFA 2WAGA 4P7QA 4CU7A 1KR1A 1JZ5A 3PTKA 4OOUA 5ABFB 2J74A 4C7FA 3AZTA 1BYCA 3UG5A 1CEOA 1FH7A 1L0PA 2ZWZA 1R8LA 2VX5A 2DGAA 2J75A 1KGUA 3T08A 1E73M 1UKSA 3VD9A 1NM9A 1MQPA 3GNRA 4OIFA 4HA1A 4ZEPA 3BLKA 4TX6A 4LXFA 3CBWA 1CBGA 4Z2HA 1VFMA 4FLQA 2X1IA 1BGAA 2WVVA 1CGWA 3O6AA 4URIA 1BVZA 5I3DA 3PZMA 4AW7A 3AIVA 3VM5A 1KXVA 4J7RA 3WDPP 2VC9A 1UYQA 1CIUA 2E9BA 1B3VA 1JI2A 1EA9C 5BXSA 4DUVA 1JZ4A 3UESA 4YHGA 3FAWA 1MW2A 3AHZA 2NW0A 1SFSA 5A2BA 3WQVA 2YL5A 1JDAA 3MSDA 4JKKA 3SCNA 3PZ9A 5AC5A 2XGIA 2QV4A 1WB0A 2ZUVA 1OGSA 1H0GA 3WQ6A 3G6MA 4PMUA 4HA3A 3QHOA 1UUQA 1TE1A 1H11A 4PCSA 1C92A 2J7FA 3BMWA 1MWOA 4TUFA 2CYGA 3GH4A 3IANA 1B90A 3W38A 2O9OA 2FGLA 1CNVA 3PTMA 2ZUNA 2XWDA 2VCBA 1BG9A 5HBFA 3NIYA 5GNZA 5M3WA 1QI4A 2WVSA 3FHAA 3U57A 3CHDA 1HJWA 5A6SA 3MSGA 4UOZA 4XZWA 1ZB5A 1QHOA 2W61A 3KEHA 1CLXA 4H8VA 2CHNA 2DT0A 1OIMA 1DTUA 4WK9A 4MB3A 2VURA 4UFKA 1XSIA 2DSVA 3GH5A 2CERA 1E6SM 8CGTA 1E71M 3FHQA 1TA3B 1RH9A 4D6EA 1BYAA 3WNLA 1ESWA 1EDGA 3S2CA 7CGTA 2WZHA 1Q6GA 3CHCA 4WJXA 1I1XA 3AS1A 4CD5A 1CDGA 4P7RA 3WFZA 1HP4A 1J11A 3L4ZA 1ISXA 1BYDA 2WW5A 1UQZA 1IZKA 4P7LA 2MANA 2J7GA 1HX0A 4RE4A 2XFYA 1WP6A 1SR0A 5I79A 1CGTA 1R7OA 4CCCA 1VB9A 3N15A 5FCZA 1H09A 3E1F1 4P8VA 4M80A 2PWHA 4PMOA 1TVNA 3CMJA 2EPNA 3AFBA 4AZ7A 2G3NA 1JYWA 1UR4A 1B3WA 4YN5A 1XD1A 3WDQA 3ARXA 3SUSA 4YPJA 4B15A 1B31A 3BSGA 3CO4A 4AEEA 2A3HA 1N82A 5GQBA 4EANA 4PMVA 2VTFA 2WHMA 2VZVA 3AIBA 2VX7A 5A1AA 1B3ZA 1E6ZA 1EQPA 3F5JA 2VT0A 4FLSA 3CZEA 4F9DA 1VJSA 1C3FA 1RD6A 3K8KA 4CVWA 4GZEA 1HKMA 1ZS2A 2A3EA 1JD7A 3GDBA 1DWFM 3EYPA 4PTXA 1ISWA 1SMDA 4PMYA 3VD3A 3L4VA 6TAAA 2Z1SA 3SUUA 3VO0A 3ZJ6A 1AMYA 1XSKA 2ZUUA 2EO7A 2VR4A 2EBNA 1VIWA 3T09A 2WHLA 4QAWA 2J25A 4D1IA 1OB0A 3GM8A 4BQ2A 4U33A 4Q22A 1E4NA 4KGLA 1E6QM 1V6YA 3OA5A 4GIAA 1K9FA 3UG4A 4E8CA 3RO8A 2WLYA 2XVGA 1WZLA 3UR7A 3VNYA 1QW9A 1UWRA 3DHPA 5JIPA 1US2A 1ZJAA 2WWCA 3S6TA 4ACZB 1E3XA 2XHYA 1MYRA 4W8LA 5IFTA 4EAMA 4M82A 5CG0A 1JG9A 2YA2A 5AYIA 4F79A 4UFLA 1C7SA 2FGZA 3CZGA 2GK1A 3WQWA 1ZBKA 2W5FA 2BV9A 4JAWA 2X0HA 5LYRA 2BXYA 3OGRA 3AMCA 1JNDA 4AZ5A 4X9YA 3UCQA 3WIJA 1ECEA 1FFQA 1UD6A 2YJQA 1K6AA 1UR2A 3EDKA 1V3LA 1AQ0A 1NWSA 1MFVA 4UTFA 2PBOA 1ISZA 2OSWA 3DHUA 4GQQA 3K1DA 3BAIA 1UD5A 2FH8A 3WFLA 4Z2KA 4WSKA 2X05A 3LPOA 2PWDA 4W8AA 4DWSB 4BQ5A 1RP9A 4HMCA 3WUBA 4LX4A 5E70A 1QOXA 1BQCA 4LYRA 1R87A 2XSBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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