4Q22A

Crystal structure of chitinase d from serratia proteamaculans in complex with n-acetyl glucosamine at 1.93 angstrom resolution
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
398
structure length
397
Chain Sequence
AHAASYLSVGYFNGGGDVTAGPGGDINKLDVTQITHLNYSFGLIYNDEKQETNPALKDPSRLHQIYLSPKVADLQLLPVLRKQNPELKVLLSVGGWGARGFSGAAATAESRAVFIRSVQQVIKQYHLDGIDLDWEYPVNGAWGLVESQPADRANFTLLLAELHKALDKGKLLTIAVGANVKSPQEWVDVKGIAPYLDYINLMTYDMAYGTQYFNSNLYDSKQWPTVAAADRYSANFVVDNYLAAGLKPAQLNLGIGFYGRVPKRATEPGIDWDKADAAKNPVTQPYFTARETAVFKAMGLDLTKDSYFKYNDIVSKLLNDPQRRFTAHWDSDAQVPYLTMKSAEGKPLFAISYENPRSVALKADYIKSKGLGGAMFWEYGADDNNRLAHQLAESLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Glycoside hydrolase family 18
publication title Crystal structure of Chitinase D from Serratia proteamaculans in complex with N-acetyl glucosamine at 1.93 Angstrom resolution
rcsb
source organism Serratia proteamaculans
total genus 128
structure length 397
sequence length 398
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4q22A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4q22A01
4JZ5A 3ARUA 4CU8A 1MW3A 3VGDA 3RO8A 4AEFA 2BY2A 5M3WA 3UEQA 1XH2A 4HA3A 1XC6A 1Q6DA 3EMQA 5D8ZA 5FL1A 3THCA 3IAPA 4CU6A 1JNDA 1LG2A 1WZLA 4DUVA 2WBGA 3VGGA 2Y4SA 2WWCA 2X09A 2QMJA 4PUEA 2F8QA 3OGVA 3PZQA 1BG4A 4R5EA 4LQ1A 1BGGA 1LWHA 2Q8XA 2X8RA 3THDA 4MTVA 1ISWA 2XYLA 1GOMA 3WD2A 1DTUA 2IUZA 1KFWA 1E43A 1CLXA 3AI0A 3ARWA 3W26A 1WKYA 1EDGA 3PZIA 3BAYA 1MQQA 1JYNA 4D1JA 2XSAA 1E5NA 2DDXA 4GPNA 2EPLX 3TA9A 2DGAA 1TR1A 1TMQA 3CO4A 3GZAA 1XD0A 1VEOA 4OKDA 5DMYA 4PTMA 5DEZA 5LA2A 3CGTA 3BLKA 2WC3A 3W82A 3WFLA 3N17A 2D2OA 3WNKA 2WKGA 4UOJA 3WQ4A 1E0VA 3UG5A 5C71A 1EHNA 3T08A 2GJXA 1CPUA 2X1IA 5ABEA 2WLYA 1WP6A 3KZSA 3BCFA 1KGWA 4JCLA 1MFVA 1UWRA 3EDJA 1WDPA 1FHDA 2XIIA 3CZEA 1YHTA 1UKSA 3LPFA 1V0NA 1FP8A 3RPMA 3CZKA 1LWJA 1HJVA 4JFUA 1BFNA 4KH2A 1ZJAA 2EO7A 1JI1A 1B3YA 3CHEA 5GPRA 1VEPA 1JYXA 1QI4A 2EPMX 4P7LA 3W37A 4AD2A 5A6KA 1JF6A 1K9DA 1S46A 2XG9A 4D6EA 4CGTA 2W67A 4AD5A 1HJWA 4JCMA 3MUIA 3VIHA 3WDHA 3RMEA 2PC8A 4AD1A 3T2PA 3L4ZA 1XHGA 3WD3A 4AZ7A 1KXHA 3AMKA 1EA9C 3SCQA 1QI0A 1BTCA 4PYSA 2CHOA 1H41A 4BA0A 4X0VA 4UOQA 3ARXA 4AIEA 1B3WA 4HP5A 4TVUA 1J9YA 4URIA 3RM4A 2ZIDA 3AS3A 1Q6FA 1WAWA 4XB3A 4PRWA 4TUFA 4QFUA 1VFOA 2VX4A 2EPOA 4QCFA 3AYSA 1HXJA 3QHMA 2VQTA 4AISA 1G9HA 1HNYA 1VRXA 3ZJ6A 2ZX9A 2A3CA 3FY1A 3A4AA 3FN9A 4H41A 1J10A 3UG3A 3VO0A 1R87A 2EEXA 4AW7A 4PMRA 4XZWA 1W3JA 2W5FA 2YA1A 4RE3A 1OT2A 4TVCA 2WLZA 2OWWA 4JAWA 2G3MA 3N12A 1UHVA 3CHDA 2WPGA 1X1NA 2UWFA 2EPNA 1QNQA 5IHSA 4TOQA 4PMNA 2BVTA 1QI2A 4RE4A 2F2HA 3WDQA 2WMHA 4QCEA 1L8NA 1ZU8A 3BSHA 3QOKA 1QNRA 2BY3A 2VCBA 3N11A 1RH9A 3T0DA 5M5DA 2XVLA 3D5HA 3OLIA 1CECA 4J28A 4TVDA 5JH8A 2CYGA 2NT0A 4R27A 3VGHA 4NZCA 3KL5A 4HPHA 1NARA 4AC1X 4D6IA 5A2BA 3MU7A 4W89A 5C70A 3UR7A 4TXEA 3NSMA 1MFUA 1BVZA 4AD3A 3T0AA 2E0PA 2GDUA 1TUXA 5ABHA 1GJWA 1XSKA 1F4HA 1J0KA 1QNPA 2VCCA 1W3HA 1CXLA 3UG4A 1KQZA 1PBGA 4PCSA 1ZBWA 2VRJA 4PMXA 1M53A 3PZOA 1J18A 3ZSTA 3M07A 3SCWA 2FH8A 4ACZB 1KR0A 3K8MA 4AEEA 2J7HA 1ZB5A 1GQKA 3OB8A 4E2OA 2D0HA 5CZKA 1KBBA 5AC4A 5JBDA 1JDCA 3HMCA 3RJYA 3W28A 2PWGA 4GI8A 4B16A 2PI6A 1G1YA 4MB5A 1UQYA 2DIJA 4JHZA 3AHTA 2XGBA 4GZIA 1DWAM 4AMCA 1PX4A 3NDYA 4W8AA 4ML4A 4P8WA 1RPKA 1E6RA 3AIRA 3D3AA 1E6QM 1JD9A 1FOBA 2CKRA 4W87A 4CD7A 3OZPA 5BXTA 1JGIA 2VRQA 3KL3A 3WF2A 5GNXA 1K9TA 1C8QA 1CENA 4F66A 3FW6A 1TZ7A 1HJXA 5AYBA 1IT0A 1MXGA 1UR0A 1OGBA 3RM8A 2GFTA 4AZCB 1E6XM 4GZJA 3CUFA 1BGAA 4F9JA 1MVYA 5A6BD 2C7FA 2JALA 1HIZA 3W6LA 4ACZA 1US2A 3WEMA 1GJUA 3AJ7A 4PN2A 5IFTA 4UQEA 2AAAA 5HPCA 3VMOA 2WHLA 5D8WA 1KXVA 2WMIB 4FLSA 2MANA 3N13A 5HOSA 1OB0A 2G4FA 4P7OA 2J7FA 3MV01 2WB5A 1WE5A 1GUVA 2PWDA 4EK7A 2D24A 1UD2A 1CIUA 4U31A 4Z2JA 3AS2A 4OOZA 5BCAA 2G3NA 4PTXA 4CCDA 1KWGA 1UQZA 2WHMA 5CLTA 4NI3A 4FMVA 1C90A 3SCTA 4IUGA 2J4GA 2YKKA 4J3WA 5A94A 1BYAA 3AIVA 3APGA 4CN6A 1QW8A 1UWTA 1HJSA 3MSDA 3VKKA 5A8NA 1K6AA 3VX0A 1OINA 4PTWA 4YHEA 3L4TA 4HPGA 3ZM8A 3ZJKA 1NOFA 3CUJA 5E09A 3VGBA 3MSGA 4D6DA 2V5DA 3MUY1 3ALGA 2V3DA 4TTUA 4ZXLA 3OBAA 1F4AA 4S3JA 4CD6A 1CDGA 3BCDA 1C7TA 1GW1A 4N0RA 2YLLA 1VIWA 1V3LA 3LPGA 4UOZA 1M7XA 2Y2WA 2VX6A 4HTYA 1NWSA 1GOWA 4BQ3A 5JIPA 1UG6A 2GJRA 1NOUA 6CGTA 3VIIA 2WMJA 1E15A 3GH7A 5CPSA 3RIKA 3SUUA 1BF2A 2CIPA 3WSUA 3CUHA 1W3KA 1ECEA 3WUBA 5EFFA 3AHXA 1E6NA 2GSJA 1RD6A 1V3MA 3KEHA 1UD4A 1UR1A 4ZEPA 5IHRA 2YBUA 4QAWA 4MPKA 4EE9A 1W2PA 2VZSA 4P7RA 3W38A 3AS0A 2CITA 1QNSA 2J25A 3QOMA 4EANA 2D0GA 2XVPA 1FFRA 1HVQA 5IFPA 1KXQA 1OCQA 4GINA 4W5UA 3TOPA 4C7DA 4Z2HA 5C8BB 1E6SM 1B3ZA 1PJ9A 3UETA 1DWFM 1BYDA 3II1A 2WKLA 2VOTA 3PZNA 5CSYA 4BS0A 2NSXA 3G6LA 1G01A 3GNPA 1CYGA 4C7GA 3GDBA 3CBWA 3GBDA 1SMDA 3TTQA 1H0IA 5DFAA 5LYRA 5A8QA 1KGXA 3SCPA 1O6IA 3SIMA 5EMYA 3WN6A 4WSJA 4DWSB 3LPPA 3CLWA 2HVMA 1WDSA 3W81A 5ABFB 1DP0A 3VPLA 4W7UA 1LQ0A 2G41A 4V27A 1E4NA 1E71M 1H3GA 2CKSA 3PTKA 1KBKA 4NF7A 3VNYA 2WBKA 4J27A 4UFKA 3SCUA 5AC5A 1BSIA 4JL2A 2JE8A 2YOCA 3MANA 2W4XA 1H09A 2J62A 5CQ1A 4TTGA 1JL8A 3MS8A 1VEMA 3ZT7A 1CGXA 1V02A 1J0HA 4HOWA 3NCOA 3AHYA 2XFFA 2XM2A 1CBGA 1EQCA 1HJQA 2ZE0A 3PZMA 3AMLA 3B8SA 7CGTA 4NRSA 4B15A 4LYPA 2DEPA 4GXPA 4CCCA 1QI5A 4JFVA 3WUFA 1KQYA 3CZLA 4DWSA 2AMGA 5ABFA 1E9LA 2D22A 2V3FA 4MAZA 3VM7A 2VJXA 3M46A 1E0XA 1FA2A 1N82A 4U5IA 1QPKA 3TONA 1JG9A 1UH3A 1UWQA 3WQ6A 2OSYA 2VURA 3WH9A 1I1XA 4W5ZA 4Q22A 2XTKA 2O9OA 2O92A 1FH8A 2J75A 3SEPA 3S2CA 3WH6A 1W9BM 1E1EA 4GI9A 1JFHA 2X2YA 4D1IA 3ECQA 4YHGA 3VIOA 1CXHA 1HJUA 2DT0A 3FAXA 4U2ZA 4MADA 4HOZA 2XGIA 4S3KA 3B9DA 3SUWA 4ZE4A 2A3BA 1LG1A 1W3LA 3CIVA 4H2CA 3A4XA 2E9MA 2JIEA 2J8FA 4IPNB 4PSRA 2G3JA 1AQHA 1JZ3A 3DYOA 2QMKA 4HA1A 2CESA 1E6PA 2FHFA 1E0WA 3FNDA 3UR8A 3WQVA 5I77A 4AZHA 2UY4A 2Y24A 7A3HA 4GZEA 1PAMA 2W92A 3BH4A 1H2JA 2JEPA 3O2LA 4BCEA 3IK2A 1X6LA 2D3NA 2ZUNA 2VR4A 1J0IA 3WBEA 1RP9A 3F5KA 3ALFA 1HVXA 3N18A 3VIPA 1H1NA 4AZIA 1DHKA 2WSKA 1ITXA 3FHAA 2J47A 4HZ8A 5F7UA 1CGTA 1XV8A 3WMBA 4AXNA 4P7NA 1U2YA 4M82A 4A3HA 3WNOA 1QHPA 1ISZA 1XSIA 2YA0A 1UWUA 2WCAA 1GORA 3WH7A 6TAAA 1W9UA 3M7SA 3OIHA 2BHZA 5JUVA 1OGGA 4BF7A 2W91A 2DT1A 4FLOA 4A3YA 1FP9A 2GJPA 2YDSA 1NWTA 3BAIA 2EPKX 1GPFA 2BS9A 3BAXA 2BXYA 3BXWA 5GQBA 1UD6A 1E56A 2JF7A 1NQ6A 3TP4A 1ODUA 2A3HA 4FK9A 2WK2A 4WKHA 3GH4A 4WF7A 2VT0A 2JFEX 1JDAA 2ZXQA 4GQRA 3QHNA 2WSPA 2CXGA 2V5CA 5BXSA 5E6YA 1D7FA 1UA3A 1Z32X 5BWFA 4CD5A 1WB0A 3W25A 3A47A 2Y8KA 3TTSA 5I0DA 1UKTA 1KR1A 3CZJA 3OLEA 2OYMA 2ZX5A 3WMCA 1EDTA 3N1AA 3BMWA 1H4PA 1V3KA 3IAQA 5HXMA 1SFSA 3PN8A 1GOOA 4ZE5A 2XFYA 1BLIA 3HJEA 4DM2A 3WD0A 1QI3A 5I3DA 4WKAA 2ZX8A 3SCSA 1WDQA 3WDIA 4JFTA 4YN5A 1EOMA 3EBVA 3I3EA 3AIWA 3AYRA 1B3XA 1B3VA 2YBTA 8CGTA 1W9XA 3VD4A 4GO9A 3W29A 1WO2A 1GVYA 1V3JA 3W53A 3MMUA 4UQDA 1EDQA 5FOOA 2YL5A 1KCKA 3CZGA 1WNOA 4QLJA 2CBVA 2E9LA 2CERA 4JKLA 4D6HA 5D9OA 1AQ0A 3WL0A 1OT1A 4Z2GA 3SUSA 4OBSA 3VTRA 1UZ1A 4DUXA 1MW1A 1UKQA 5AYIA 4M8UA 3ZIZA 3PZTA 3WL1A 3DECA 4LYRA 3BAKA 1CGVA 2CCRA 5BYWA 1B1YA 1FFQA 1Q4NX 1W32A 1DWHM 4JFWA 4OOUA 3RM9A 4W7VA 3VIKA 3CH9A 4H8HA 3CUGA 1YQ2A 4Q7NA 1ISXA 1W2VA 4P8XA 4XX6A 2XFRA 4GKLA 5CPQA 1PIGA 3WDRA 4HMCA 4AWEA 4UZSA 2E9BA 4MB4A 2OLHA 4J3TA 1B90A 3K4AA 3PZVA 5IXEA 2TAAA 2ESCA 2UY5A 3RDKA 1V6WA 2WZEA 4WK9A 1IZJA 1Q6GA 1QHZA 4MJ4A 3CMGA 1HN1A 2W62A 3K8LA 4F79A 1W1TA 5CGMA 1I75A 4PMVA 2OWXA 1XYFA 2VR5A 4UFMA 1VENA 3EDKA 3CMJA 1V03A 3IJ7A 1UD8A 2DT3A 3U57A 1E70M 5KEZA 2X0YA 1BPLB 1CXEA 3W6MA 4UFHA 2QLYA 4KGJA 2E8YA 2NW0A 1UUQA 3WY1A 4Z2IA 4PMZA 4MNKA 2XVGA 5A1AA 4MB1A 2F61A 1CEOA 2EQDA 2FHBA 2WZHA 1JZ2A 2J7GA 3E1F1 4J7RA 3U5YA 3ARQA 1VFMA 4P8UA 5FL0A 1GOIA 1DEDA 1KWKA 1JF5A 4ATLA 1EHAA 1NWUA 4GIAA 4B9YA 3L4UA 4D6GA 1NM9A 2CNCA 4JKKA 1JFXA 3NSXA 2V38A 1O7AA 2XSBA 1P6WA 3CZ8A 1EH9A 4JL1A 1GVIA 5A69A 4M1RA 1MQPA 1MYRA 2CBJA 2EBNA 3L2LA 3VIMA 1TVNA 1EGZA 1W9DM 1R7OA 1QOXA 1HX0A 1FH9A 1KB3A 2WWDA 3DHPA 1GOKA 5BRPA 2CHNA 4X0NA 5I2UA 1C92A 2BHYA 1VF8A 3AISA 4FLQA 2RGMA 3W27A 3T2QA 1OD8A 2XPKA 4EKJA 4AZCA 3NJ3A 3WD1A 1U33A 1UR4A 5A95A 4DM1A 2WMFA 1UR8A 2WVSA 3T0BA 1OM0A 1GQLA 5EBAA 5KZ6A 1WCGA 5EB8A 5IDIA 3I3DA 3MMDA 1JD7A 3EDFA 2WZIA 4BQ5A 2QPUA 2A3AA 2WMIA 3MMWA 4JFSA 1CGWA 2VO5A 1EXPA 1R85A 1LL4A 5D4YA 4PMQA 2BVDA 2JF6A 4WKFA 4UQAA 4L4PA 1KGUA 4BZYA 2D1ZA 4YPJA 2WCGA 1XGZA 3AZTA 4RE2A 3ZJ7A 1W1VA 4D6FA 4MDOA 3AZRA 1WPCA 4FLRA 2VZTA 1GHRA 4AD0A 4WLCA 3J7HA 1BQCA 2ZWYA 1TA3B 3U7BA 4CU7A 1HL9A 3IANA 5I5RA 1E4IA 5A6JA 2CEQA 4ZFMA 5I24A 1EQPA 2VTFA 2VVNA 1ISYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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