4R5EA

Crystal structure of family gh18 chitinase from cycas revoluta a complex with allosamidin
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
344
structure length
343
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGGGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYEYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDPSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase A
publication title Crystal structures and inhibitor binding properties of plant class V chitinases: the cycad enzyme exhibits unique structural and functional features.
pubmed doi rcsb
source organism Cycas revoluta
total genus 120
structure length 343
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4r5eA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4r5eA01
3W26A 2FHFA 2VTFA 4UOJA 2WSKA 5DO8A 2PWEA 3THDA 2VX4A 5A8QA 1ITXA 1AVAA 4BZYA 3VD9A 3WDHA 1TE1A 1VFOA 1KWGA 1QNPA 3PZVA 7A3HA 2RGMA 1BYBA 4IM4A 1J12A 1L0PA 1NOFA 4AZCA 1GORA 1OM0A 2DH3A 3BAWA 4H7VA 3SCNA 5CLWA 2VCCA 3NSNA 5CPTA 2Y8VA 4TUFA 3N11A 1B3YA 2EPNA 3CTTA 2FDMA 2WLYA 4PUEA 4MB3A 4D6HA 1B3VA 5ABHA 5A94A 1ISXA 3WIJA 3N17A 1BSIA 4JIEA 1V3LA 2D0GA 1WDPA 2UWFA 3QHOA 1KGXA 3LPOA 2OWWA 2ZXBA 2ZUSA 4WJXA 3I3BA 2AAAA 4WSJA 3WDJA 4U5IA 2W63A 3WMSA 1DWIM 4CU6A 3G6LA 4D72A 4W89A 3O6AA 4D6JA 1TA3A 3W53A 2JEQA 1E6QM 2XGIA 3QOKA 1UWQA 2GFTA 1ISVA 1E9LA 1R8LA 1MVYA 3WH6A 4M56A 1ZL1A 3WD1A 4W87A 1HXJA 3WQ8A 2WKGA 3NUKA 1HN1A 1TVPA 4JZ5A 2ZE0A 3TONA 2ZXQA 1BPLB 4Z2KA 1CECA 1E3XA 2YA1A 3CMGA 4AD0A 5E9AA 1UKOA 3F4VA 1Q6DA 1XYZA 4QDMA 1UOKA 1UWRA 5BXPA 3VILA 1EH9A 2FHBA 1C7SA 5HOSA 3T0DA 4MNMA 3ZJKA 2VVSA 1V02E 1ZBKA 4W8AA 3WL1A 2G3NA 1X6NA 1SMAA 3N9KA 4AZGA 3SIMA 4CD6A 3F5KA 1B31A 3SEPA 3AMLA 4CKQA 5M5DA 5E70A 1W9UA 2OLHA 2VI0A 1O7AA 1RP8A 2WHMA 3VUPA 4R27A 1LJYA 1UKTA 3AMCA 3BXWA 1UA3A 2WMJA 2XGBA 2XVPA 5CSYA 4RE2A 4CCEA 3OG2A 3WEOA 4MDPA 1PX3A 3VIJA 1O6IA 3NCOA 1MQPA 1JYWA 4CU7A 1VJZA 1VEPA 2WXDM 5A2AA 2WZHA 2J7CA 3B8SA 2WHKA 1TR1A 3QHMA 3BLKA 4AZCB 2WW5A 1BVZA 4HZ8A 5M3WA 2V5DA 3CIVA 7TAAA 3WF0A 4DUVA 5JBFA 4QAWA 3T08A 2G41A 2VVNA 2XSAA 3OIHA 3K8KA 2YJQA 3VD7A 2D1ZA 3WDPP 4IPLA 3EDKA 2ZXDA 2Y4SA 3CZJA 4C7DA 2YA0A 4OBSA 1GPFA 3VINA 3CPUA 3FXYA 1V0LA 1IT0A 4PMUA 4EKJA 4B9ZA 3PZQA 1US3A 1OGGA 5HPCA 1F4AA 1C8QA 1ZJAA 1E55A 1C8XA 1NARA 2VX7A 3POCA 1HVXA 1QNRA 1LG2A 2CNCA 1WE5A 4AZ6A 5GNXA 4GI9A 1WP6A 1W9XA 3A3HA 5BXRA 2F2HA 4AIUA 1CGYA 4PMQA 3NDYA 3WSUA 3ARWA 5A69A 2VZOA 4UCFA 3VD4A 4AISA 3GDBA 1TA3B 1W9DM 2WMIA 1MW1A 3CZEA 2CPUA 1Q6FA 5I3DA 1W1VA 4WSKA 2JF6A 3II1A 3BAJA 1KB3A 1EXPA 1K6AA 3WD4A 1XYFA 3PZGA 2ZX5A 1GQLA 3ZT5A 3WFLA 4BQ2A 3VIFA 1J18A 4D71A 3BH4A 3DC0A 3FHAA 4L4PA 4JFVA 3ARPA 4CD5A 3NSXA 2V3DA 3WF1A 2WVUA 1V0MA 5EFDA 3MANA 4LXFA 1B30A 3GH4A 3MU7A 1UWTA 3IAQA 4J3WA 5IFTA 3VMOA 1TZ7A 3WDRA 3WY1A 2YL9A 4F9JA 5HDRA 2NT0A 3N18A 1MYRA 1P6WA 2XWDA 1C91A 3W0KA 1BGGA 3D5HA 3PZMA 1I75A 4DM1A 4ATWA 3PZTA 1V02A 5FKYA 1NWTA 5CLTA 1XC6A 2XTKA 2JE8A 2UY3A 2ZUVA 1CZ1A 4K68A 3BGAA 4D6EA 1C90A 3WDIA 3CHFA 3N12A 3JUGA 4HP5A 5GPRA 1W1PA 1UD6A 4HPGA 2F61A 1KR1A 2WVSA 2EPLX 3ARQA 1VIWA 2NT1A 3VKKA 4KGLA 2VL4A 2HVMA 1WZKA 2E9MA 3WEMA 4ZE4A 4FMVA 2DT3A 2X05A 2EPMX 3OLEA 1RP9A 6TAAA 1JFXA 1H49A 1M03A 1N82A 4UQBA 3POHA 1JNEA 3K8MA 3BAKA 1E40A 3DECA 1H11A 1XGZA 4YHEA 1E6XM 2WMKA 1MFUA 1NOWA 1UD5A 4XV0A 3WH9A 5ABFA 2DQXA 1GVIA 4KRTA 1OCQA 2W4XA 5BROA 3VIPA 3WNLA 2AOSA 1J0IA 1VENA 1C8YA 2C0HA 1H2JA 2WCSA 3U57A 1MQRA 2BY3A 2CITA 1MWOA 3VGEA 2WMIB 2CHNA 1BG4A 3TTSA 4P8WA 2ZOXA 4XB3A 3VD3A 2WKLA 2EO7A 4V28A 2W92A 1XH1A 1CDGA 1V6VA 3PTQA 3EMCA 2YA2A 3WDQA 2ZUWA 4W84A 2C8NA 3VVGA 1H3GA 4MADA 3RM8A 4AZHA 4M80A 3M46A 2QLYA 2O9PA 2NW0A 1JF5A 3AHZA 5CZKA 6CGTA 3WH7A 1JF6A 4HZ7A 4UQAA 3VM7A 1UH3A 5A1AA 3AIVA 3MSGA 1W32A 5D8ZA 4H8UA 1HL9A 1JDCA 2BY1A 4Y7EA 3L4XA 1GJWA 3WBAA 1PX4A 5BXTA 4JHOA 4W8BA 2FHCA 1EOKA 4OOZA 1ZBVA 4PN2A 3AMDA 4RL3A 3WH5A 5GQBA 1FHLA 3WD0A 2EQDA 1E6ZA 2J75A 5IXEA 3W4RA 4HZ6A 4JFSA 2GVYA 1OT2A 2GDVA 2TAAA 1VFFA 2BFGA 2DIEA 4XUYA 2X0YA 3IANA 5ABGA 1QNOA 1UWIA 1Q6EA 2QMKA 2DPEA 1JD9A 5DEZA 3VO0A 4PRWA 1CGXA 4DWSC 3E1F1 2DIJA 3SCTA 1WPCA 8CGTA 2VNCA 3G6MA 3MUIA 3AZRA 1GQKA 3QOMA 4PMZA 4OOUA 1HVQA 4AC1X 1TG7A 3WD2A 1OGSA 1E70M 2VR5A 3GNOA 3WFZA 3CGTA 4AW7A 2DSVA 5BRQA 2X09A 3AHVA 2QMJA 2PBOA 4PMVA 1K9EA 1WO2A 4RE4A 1B90A 1V3IA 1E5JA 1JIBA 1EIBA 1HNYA 3GH5A 1B2YA 2QV4A 2V3EA 3VGDA 4QCFA 2DH2A 1W3JA 5FL0A 1E0XA 4QCEA 1HJQA 3NDZA 1BG9A 3GBDA 2VO5A 1UD3A 2CBIA 2G3JA 5ABFB 1G9HA 2IXUA 5I5RA 2JEPA 2D20A 3RDKA 2CESA 3W82A 5A6AA 1CNVA 1V08A 4WKFA 2J47A 2BHUA 4J28A 3F5JA 1DEDA 2ZXAA 3A4AA 5TD4A 4CGTA 1A47A 4CVUA 1OIFA 4JFTA 3BMVA 5FD0A 1GHRA 4W7UA 2A3AA 1JAKA 1E6RA 2D22A 1XV8A 3CZLA 2VQUA 1MXDA 1WDRA 4YPJA 3WNPA 3PZOA 2OYMA 5C8BB 3AS3A 3FNDA 3SCSA 5C71A 3AXXA 3MUZ1 2WPGA 1CPUA 1WNOA 1ECEA 4W88A 3UCQA 2XVLA 2O9TA 4GQRA 1KFWA 1FOBA 1H09A 1LLOA 8A3HA 1J0ZA 2XFYA 3ZMRA 3GNPA 4FLSA 4GZJA 4PMYA 1BQCA 2GJRA 4YHGA 3ZSTA 5CG0A 3TTOA 3NJ3A 4NF7A 2GUYA 5AYIA 1SFSA 3FHQA 1VAHA 4A3YA 2DT1A 4GO8A 2W61A 5F7UA 4PMDA 2BVYA 4JFWA 3AHTA 4U3CA 2Y2WA 1E4IA 4TTUA 1FH7A 1OIMA 2WC3A 4W85A 4FLRA 4AD4A 1Q6GA 2DT0A 1KQZA 3O9NA 3BMWA 5D9NA 2VZSA 3UESA 3ARZA 2XJ7A 1VEOA 4W7VA 1CXFA 1BF2A 2CBJA 1GQJA 3BCDA 4Z2HA 1CGUA 5CJ5A 2A3HA 4ACYA 2HISA 3B9DA 4EK7A 5A2BA 1LQ0A 4Z2IA 3QGVA 3GBEA 4AZ7A 4CN6A 1DWJM 1KBBA 2PC8A 1QHOA 3N04A 3NYDA 2Y8KA 2CIPA 4J3TA 4U33A 3ZIZA 5HPOA 1WDSA 1ODUA 2YL5A 3BAYA 4TVUA 4MB4A 2DEPA 4WIWA 1YQ2A 4UOZA 3IJ9A 4QLKA 2X1IA 1QHZA 1V3JA 3AJ7A 4JCMA 1JI1A 3VTRA 1AMYA 1U2YA 5GNZA 5EB8A 1TUXA 3UG4A 3L2MA 4MDOA 3KL5A 3ALGA 3WQ5A 4W5ZA 1GOQA 4JKLA 4FLOA 4E2OA 3M7SA 4UFMA 1CLVA 1J11A 1UH4A 4CD8A 2Y5EA 4TX6A 3W6MA 2VMFA 4W5UA 4BS0A 4N0RA 2Z1KA 3I3DA 1QNQA 3VDCA 5CGMA 1E15A 2Z1SA 4UFLA 3BSHA 4B3LA 2G3IA 2YLAA 1XCWA 5IHSA 3VIMA 2CXGA 1E6NA 3LMYA 1GVYA 3PHAA 1UKSA 1ZBCA 1UZ1A 2VRJA 2J7BA 3KZSA 3N13A 3RJYA 1CLXA 3WUBA 4PTWA 1UR0A 1KGUA 3AIQA 5I0DA 1H5VA 1R7OA 4D1JA 2WC7A 1ZJBA 1GJUA 1XSJA 4AD5A 2ZUUA 1B9ZA 1GW1A 4AMCA 5IFPA 1SMDA 4Z2JA 3SUSA 5A6MA 5A3HA 3WQ4A 1CIUA 1Q6CA 3FY1A 1HT6A 5GNYA 3UG3A 3T09A 1I1XA 1UKQA 2A3CA 4GPNA 5A8PA 4S3KA 3WQVA 3D3AA 4GI8A 1EO7A 4QP0A 4UQDA 5CGTA 4B15A 1UKPA 2ZIDA 3UETA 2EPKX 2J7FA 2PI6A 2RGLA 2OYKA 1V3KA 2Q8XA 2FH8A 2O9OA 2WBKA 5JBDA 2D23A 1ODZA 1ISYA 2EBNA 1OD0A 3VGGA 1E72M 4RE3A 4GZIA 3K4DA 4F66A 4IISA 5FIPA 4CD7A 4P7NA 3PZ9A 1JZ4A 5BXSA 1VB9A 2IXVA 5DFAA 4CD4A 1IZKA 1J0JA 4MTVA 4HOZA 2J77A 1GZJA 4JFUA 1VRXA 3OZPA 4HPHA 3AS0A 1MW3A 3LPPA 3RO8A 1JYXA 3ALFA 4F9DA 3W27A 4TVCA 3OA5A 5CPSA 1ITCA 1QI2A 4PUDA 1E4MM 4AZIA 1ISZA 3AOFA 3A6OA 2J8GA 1VEMA 5EFFA 5DT7A 1UR1A 4H04A 2NSXA 3W28A 3ZM8A 2G4FA 3WNMA 2GJXA 4MB5A 1LWHA 4AIEA 2O9RA 3GXDA 1MW0A 1UYQA 1JZ5A 2WLZA 1CXHA 4DM2A 3L4WA 5JUVA 1JYVA 3WF3A 2DDXA 2BV9A 4E8CA 4M81A 1AQMA 4AEFA 5DMYA 2WB5A 3CUFA 3CMJA 4PCSA 3SCUA 1HP4A 3K1DA 5AYBA 1UG6A 1QI5A 2EEXA 3AI0A 1JXJA 4Q7NA 3AXHA 1JDAA 1NP2A 3OBAA 1W9VA 1KR0A 3TOPA 2E8YA 1EO5A 1I1WA 1WZMA 4OBRA 4W8LA 3BLPX 3RPMA 2CHOA 3AS2A 1E43A 4U3AA 4J27A 1M01A 1J0HA 4M1RA 4U5KA 3AIRA 1F4HA 3W38A 1GOIA 1HKKA 1JNDA 3RJXA 1AQHA 5CPQA 3VDHA 1HX0A 2XVGA 1LG1A 4KWUA 3ZO9A 3VIOA 4UZUA 3SUUA 3IJ7A 2XG9A 1OB0A 1WDQA 1CWYA 4FF5A 2D3LA 1GOKA 2BHYA 2F8QA 3L2LA 4GI6A 1EQPA 1UR9A 1PIGA 5AC5A 1JYNA 2WYSA 3CLWA 2DSUA 1KQYA 1NH6A 2WZIA 3AMGA 1V6YA 2XIIA 1BTCA 3FAXA 3PTMA 4LQ1A 2OSXA 4X0VA 2JIEA 4HMCA 2YDQA 5D9MA 3RILA 1D2KA 5FCZA 3MSDA 1IZJA 3AIBA 3L4ZA 1UHVA 2ZUTA 1Y7VA 4LPCA 2WVVA 4HOXA 2DSZA 4ML4A 4AIOA 1BLIA 3UR8A 2G8ZA 2BVDA 2ZUMA 4V27A 3ARRA 3UR7A 3CH9A 1H1NA 1HKMA 2VJXA 4BCEA 3VGHA 3VM5A 4P8XA 5BWFA 2VCBA 1XSIA 3M6DA 1E4LA 2GJXB 3VX1A 1OWQA 1E5NA 4GO9A 3VX0A 1BHGA 4HMDA 1PBGA 4JL2A 4JCLA 3HMCA 4LX4A 4HA3A 3MS8A 1FP9A 1HJWA 1BYDA 3GTNA 2O92A 1R86A 4R5EA 1WZAA 2BVTA 5CQ1A 1PAMA 2PWGA 1L8NA 1XHGA 1XH2A 3SCWA 1US2A 3MV01 3VGBA 2J8FA 2BS9A 3GXMA 1EDGA 2CKSA 2V38A 3WMCA 1JZ6A 1NOUA 1OBAA 2BXZA 3WQ6A 1QOXA 3OLGA 1B3XA 5KZ6A 1CTNA 2WK2A 1XH0A 2J79A 1QVBA 3OGVA 4TOQA 3ZT7A 2JALA 5A8NA 3T2QA 4JHZA 1R7AA 5I78A 2MANA 3K46A 4AYSA 3MO4A 2YIHA 2CBUA 2WMGA 1HKJA 3KL0A 1ESWA 1IV8A 3AFBA 3J7HA 2J62A 3T0BA 1BYAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4WKH A;  4X0N A;  1BGA A;  1PX8 A;  2CET A;  2WAG A;  4CN4 A;  1E56 A;  4D6D A;  4UZS A;  4GIA A;  3AYR A;  3WQW A;  3CUI A;  3NSM A;  4DWS D;  1LL6 A;  4PMX A;  2WCA A;  3KL3 A;  2ZWY A;  1KXQ A;  3VPL A;  4BA0 A;  5ABE A;  1MW2 A;  4UQ9 A;  1DWF M;  4JKM A;  1ZU8 A;  2VC9 A;  1OD8 A;  3WH8 A;  4J3X A;  3SCO A;  5E09 A;  1TCM A;  4PSR A;  3W25 A;  5LA1 A;  5DT5 A;  1V6X A;  1ZS2 A;  4HTY A;  3RM4 A;  2WC4 A;  1HKI A;  4PBG A;  2OSW A;  1UA7 A;  1FH8 A;  3AHY A;  3WNO A;  1QPK A;  3WL0 A;  4EE9 A;  1A3H A;  1JD7 A;  3CHD A;  3VU2 A;  3IAP A;  2E0P A;  4GQQ A;  1UUQ A;  4ZEN A;  1E73 M;  3VDB A;  4D6G A;  4HA1 A;  5E6Y A;  3W24 A;  3RCN A;  4ATL A;  1CGW A;  1VBU A;  4QFU A;  4NRR A;  4TTG A;  2IUZ A;  5A6S A;  3WEN A;  4MNJ A;  1E3Z A;  4H8V A;  2VUR A;  1W2V A;  4P8V A;  1B0I A;  1UD8 A;  3VGF A;  1XD0 A;  1KXH A;  4KH2 A;  1FP8 A;  1PZ3 A;  3QR3 A;  3ARU A;  3EDJ A;  2XUC A;  1R87 A;  3HN3 A;  3CO4 A;  4F79 A;  3M07 A;  3L4Y A;  2J7H A;  5BCA A;  3PTK A;  4QLL A;  4JL1 A;  4DUX A;  1W3L A;  3AXI A;  4PMR A;  1HL8 A;  2J7G A;  3ECQ A;  4IUG A;  4B9Y A;  1V6U A;  5A6K A;  4M29 A;  2E4T A;  1UD4 A;  1JZ2 A;  2VZV A;  4AEE A;  4M8U A;  1GOM A;  5I24 A;  3SCV A;  3WUF A;  4B3K A;  3FW6 A;  1EGZ A;  1LWJ A;  1EDQ A;  3F5L A;  2WM0 A;  4XZW A;  4XX6 A;  5JIP A;  2X0H A;  1DWG M;  3B9A A;  4D1I A;  3EDE A;  5A6B D;  2OYL A;  1WCG A;  5E0F A;  2JIW A;  1V3H A;  5IDI A;  4UFI A;  4PMN A;  2BY2 A;  2ZX9 A;  2VUY A;  1CXI A;  1WAW A;  4P7O A;  4PYS A;  5BYW A;  2XVN A;  3RM9 A;  1TMQ A;  3VOC A;  4Z2L A;  4MJ4 A;  4AZ5 A;  2PBG A;  3MUA A;  2DSK A;  2VX6 A;  2BNJ A;  4GZE A;  1C92 A;  4ACZ B;  1BVN P;  4C7F A;  4PTV A;  1QI3 A;  3DHP A;  3AIU A;  3THC A;  3VIG A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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