4S3JA

Crystal structure of the bacillus cereus spore cortex-lytic enzyme slel
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
431
structure length
429
Chain Sequence
FAIQIVTVRSGDSVYSLASKYGSTPDEIVKDNGLNPAETLVVGQALIVNTKGNNYYVQPGDSLYRISQTYNVPLASLAKVNNLSLKSILHVGQQLYVPKGTKRSVESIAYLQPSTIPIKESLVNATRAINPFLTYLAYFSFEAKRDGTLKEPTETAKIANIATQGQTIPMLVITNIENGNFSADLTSVILRDATIQNKFITNILQTAEKYGMRDIHFDFESVAPEDREAYNRFLRNVKIRLPSGYTLSTTLVPKTSSNQKFFEAHDYKAQGQIVDFVVIMTYDWGWQGGPPMAISPIGPVKEVLQYAKSQMPPQKIMMGQNLYGFDWKLPFKQGNPPAKAVSSVAAVALARKYNVPIRYDFTAQAPHFNYFDENGVQHEVWFEDARSIQSKFNLMKEQGIGGISYWKIGLPFPQNWRLLVENFTITKKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Cortical-lytic enzyme
publication title Structural and functional analysis of SleL, a peptidoglycan lysin involved in germination of Bacillus spores.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus cereus
total genus 148
structure length 429
sequence length 431
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-02-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4s3jA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4s3jA02
1QW9A 1DP0A 4DWSD 2ZUMA 4FLOA 3OB8A 2UY2A 1AQMA 2PWHA 4QAWA 1MYRA 1WCGA 1MW2A 1HXJA 3W24A 4P8UA 4Q7NA 1FHDA 3WFZA 3CHCA 3VD4A 1E6QM 4MADA 4A3HA 2G3NA 2FH6A 3IJ9A 2JF6A 3FN9A 1JFXA 5F7UA 1J0KA 1Q4NX 2WHMA 2Q8XA 2WLZA 2PC8A 3SEPA 5M03A 2DIEA 5BXPA 4ML4A 3B9AA 3BAWA 4UQ9A 4S3KA 4UNIA 4HZ6A 5IHSA 1UUQA 3CZLA 4GKLA 2BNJA 2OWXA 3N9KA 5E0FA 2W61A 4PMQA 2DSWA 1BTCA 2EXOA 2IXUA 4J27A 4UQDA 2BVYA 4ZEPA 4FLQA 1VEOA 2WXDM 3BLKA 4AIOA 3WUBA 1OCQA 4UFLA 3DHPA 1MXGA 3K8LA 4M1RA 4ZXLA 1QHPA 3SUWA 1JF5A 1CECA 4P7QA 1WB0A 4GIAA 4PMNA 4GXPA 1B3VA 3NSNA 4UOJA 1FH9A 1PAMA 1TZ7A 1E71M 4U3AA 4PMYA 4TVUA 1OIMA 1CGYA 2WB5A 1V3JA 1PX3A 3PN8A 2J7EA 1PEZA 4H8HA 1FP8A 3VIIA 4AEEA 4JL2A 1KXHA 5A6LA 2E40A 4R27A 1H11A 1OD8A 3FAWA 3FXYA 1H5VA 2XPKA 3AIWA 3VINA 5C8BB 3ZT5A 1H4PA 5LYRA 1V6UA 1J12A 3EDJA 1G9HA 4OZOA 3WH6A 3PZOA 1OWQA 4OKDA 4WKFA 2VRJA 1TA3A 1HVXA 1K9TA 5DEZA 1V03A 4V28A 2O9PA 1J0ZA 4KRUA 1TR1A 2HVMA 2RGLA 1XD0A 5IXEA 3O2LA 1VEPA 4DUWA 5JIPA 1BSIA 3ARQA 2WK2A 3HJEA 3N1AA 1X6LA 2WLYA 2VZTA 2E9LA 3VIFA 4J28A 1FOBA 5JH8A 2WPGA 1RD6A 1TMQA 4LGXA 4CU7A 4MTVA 2J62A 2V3FA 3AFBA 4Z2HA 3GH7A 4PMVA 1WZLA 3AS2A 3GBEA 1IZKA 3POHA 1US3A 4UFJA 3UEQA 1H2JA 2IXVA 7TAAA 2DH3A 3MV01 2WYSA 4YHEA 4D6DA 1V6YA 4AZ7A 1GOOA 1NP2A 3JUGA 2J8FA 3AMGA 4ATLA 5CGTA 1DWAM 1RP8A 2WNWA 2DT3A 1H09A 1EQCA 1JAKA 4F79A 3PZTA 2OYLA 3DYMA 2AMGA 4JHZA 4BS0A 1QNOA 2BXZA 3NDYA 2VOTA 5DMYA 4YHGA 1J11A 3KWXA 2VX4A 3UR8A 4AW7A 1O7AA 1DWJM 1W3HA 2J74A 5D9OA 3CO4A 2V3DA 1VJZA 4JKMA 1UR2A 3L4UA 5E6YA 3W29A 3VILA 1OSEA 2TAAA 4J3XA 1BVZA 3VGEA 4AZIA 4H04A 3AMLA 4MDOA 3AHVA 4U3CA 1JIBA 4IM4A 4P8XA 1UWUA 5A6SA 3OBAA 3M7SA 1ODUA 5AC4A 3ZJ6A 1QNSA 3TA9A 3GBDA 3VDCA 2VL4A 3ARWA 4PTWA 4UZUA 1QI4A 2Y24A 1VB9A 2GSJA 4KRTA 1UWRA 2PWEA 1B3YA 5I5RA 2GK1A 5BRPA 3MKKA 4EANA 2GJPA 4QLLA 3SCWA 2J8GA 2J78A 1EDGA 4LPCA 2XFFA 4KGJA 1W3JA 3MV11 3PZQA 2YBTA 2CBIA 1WDPA 1ZBVA 4NRRA 1SMAA 1YQ2A 1LQ0A 1E43A 4J3SA 3ZT6A 3CUGA 1TUXA 1ZBKA 4JZ5A 1E73M 5DT5A 3WUGA 2CKRA 1CXEA 3FY1A 2UY3A 1V02E 3F5JA 4W5UA 1B31A 1UOKA 4ZE5A 4PMOA 3J7HA 4M82A 3T2QA 4NRSA 2J79A 4M56A 4LX4A 1CNVA 2WMKA 2DDXA 5BWFA 1HJUA 3WBAA 3VMOA 2OSYA 1D2KA 5D9NA 1C7SA 4AD1A 1W9PA 3K8KA 1C8YA 2QF8A 4CN1A 1UD4A 4JKLA 1H41A 4HOWA 4UFKA 3G6MA 3LPPA 3ZIZA 3SCQA 1HF6A 2CKSA 1UD3A 4TX6A 5E6ZA 3RJXA 1V3KA 3AXHA 2YDSA 3L4ZA 2ZUVA 2OSWA 1C8QA 2D22A 3VGFA 2JIEA 4GO9A 2XSAA 1EIBA 2WVSA 3NSXA 3BCFA 3SCSA 3WFLA 1KR0A 3EBVA 1AQHA 3OLDA 4Z2IA 3PZNA 3ZT7A 1HKMA 2YLLA 5A8PA 1MW0A 5HPOA 1IT0A 3W25A 3UG3A 4W5ZA 1NOFA 3B9DA 2CERA 3KL0A 3NUKA 5CXPA 4HU8A 1HL9A 1V6XA 2G3JA 5LA0A 3RO8A 3MUIA 2XTKA 1E72M 3W0KA 1DWGM 4HOXA 1BYDA 2DIJA 1JZ3A 1B1YA 2DH2A 3TTSA 4XZBA 1OT1A 1VJSA 2WC7A 4JAWA 3VMNA 3MMUA 4D1JA 4OIFA 1CGXA 3K8MA 2FHBA 2AOSA 1UH2A 1XSKA 1PIGA 2DPEA 5FCZA 1J0JA 1FH8A 4FMVA 4CU6A 1MXDA 1M01A 2CBVA 5HDRA 3WL1A 2ZXAA 2NT1A 2G3MA 2BY1A 4AZ6A 1XCXA 4D6FA 4FF5A 5M3WA 1NQ6A 2PWFA 2V3GA 5CSUA 1OBAA 1VEMA 5BXRA 2YLAA 2WVUA 4KMQA 3ZJKA 4K68A 3EMQA 4TXEA 1K9EA 2X0HA 1UR4A 1JYVA 5FL0A 1CEOA 1W9DM 4BQ5A 4HPGA 1EDTA 3RDKA 3RCNA 2EPNA 4JIEA 4PMRA 1UZ4A 4MNKA 4CUCA 4AISA 2FDMA 4AEFA 2WHLA 1ISWA 3DC0A 2HISA 2WC4A 1DHKA 4NF7A 3VM7A 4TOQA 3FW6A 2YA1A 4RE3A 4AIUA 4QLKA 5ABHA 3EDKA 3OIHA 1HN1A 2WWDA 4WSJA 1J18A 1MW3A 2BFGA 1E4NA 2Y8VA 1JZ8A 2WMGA 4N0RA 1VRXA 4EAMA 3EYPA 1UKOA 4Z2KA 2ZWYA 4H41A 1CLXA 3VKKA 3W28A 3K4AA 4F9DA 4NZCA 3O9NA 2JIWA 1BAGA 1W9XA 4V2XA 1V6WA 1GOMA 3WNLA 4W85A 2BY0A 3WNKA 1CTNA 4U31A 4W7VA 5BXTA 3RM9A 4W7UA 1V0LA 1V0KA 3WNMA 1PPIA 1HL8A 2CCRA 1XYFA 3WF2A 4C7FA 1D3CA 2XIIA 1GJUA 1D7FA 4JFSA 2VNCA 3MUZ1 5CLWA 2F8QA 1ZL1A 1ITCA 1TVNA 4M24A 1E6SM 3WDIA 3CUFA 4CU8A 1MW1A 2BHZA 4X0NA 1IZJA 2CITA 4ZENA 2D3NA 3KE0A 2J7GA 4WKAA 5A8MA 4W84A 2VUYA 1G01A 1KBBA 3SCNA 1CXFA 1CXIA 3AMCA 4XUYA 4CN4A 1W91A 2CIPA 1EHAA 3HMCA 3N13A 5M17A 4H7VA 2ZIDA 3I3DA 3SCPA 2WC3A 2XVLA 4UFHA 1ZJBA 3GXIA 1JZ6A 1KQYA 4Q22A 5A1AA 1DWHM 4FK9A 5A6MA 1OM0A 1E0VA 1CPUA 1JFHA 1WKYA 4D6EA 3TOPA 3ARZA 1XH2A 3PHAA 4WF7A 1MQPA 4D6CA 1UKSA 1CBGA 1MVYA 4AD0A 2ZOXA 2YIHA 5A6JA 1ECEA 4HTYA 1VBUA 3SIMA 2A3BA 5CPQA 1JL8A 3WNOA 2VX6A 4AZGA 2Y5EA 3AHZA 3MMDA 2JF7A 3TONA 3IJ8A 2WMHA 5BCAA 2VMFA 2DSZA 2WKLA 1BYBA 1GORA 4PCSA 3NSMA 5EFFA 3WD2A 1W9UA 2EPMX 4H8VA 3T2OA 1I1XA 4UCFA 4PN2A 5EBAA 4IISA 1JZ5A 4E4PA 1E3ZA 3SCVA 2VI0A 1NWSA 4JFUA 3VU2A 1BG4A 1JF6A 3WMCA 3L4TA 1MFUA 2J7CA 1UR1A 1EO5A 2OWCA 3WEZA 4AY1A 5I77A 4TX8A 3W4RA 2FGLA 1GCYA 1HP5A 4ACZB 4WLCA 2CESA 3WN6A 2WW5A 2JEPA 1G94A 4GQQA 3THCA 2O9RA 4B9ZA 5AC5A 1H0IA 3OLGA 3CTTA 5I79A 5IFTA 1J0YA 5BXSA 5FOOA 2W66A 4V27A 4W8BA 4H2CA 3WQ6A 5I0DA 1PBGA 4HA3A 2EEXA 4X0VA 4GI8A 1VFFA 3W81A 4GZEA 4HP5A 1C92A 3L4YA 8CGTA 4KWUA 3ZMRA 4F8XA 1GNXA 1QI0A 2ZUTA 1UD8A 2G41A 2XM1A 1JG9A 1KBKA 3CHEA 1LL7A 1KXQA 2VZSA 1XSJA 1VENA 2J25A 4UR9A 2IUZA 1GQIA 3WDPP 2VURA 1JDDA 1WDSA 5CJ5A 1C3FA 4U2ZA 3DYPA 4AMCA 3SURA 1RH9A 2DT1A 4P7LA 3WF3A 2WAGA 1E15A 2GFTA 4R5EA 3S6TA 4AZHA 2XWEA 1C90A 6CGTA 2J4GA 3PZMA 4MJ4A 3DECA 3VIGA 3OG2A 2VCCA 2GUYA 4PEEA 4AZCB 3AIBA 1FP9A 1W9BM 1LWHA 3ZO9A 5KZ6A 1BF2A 1E9LA 2E8YA 3AXXA 4HMCA 4PYSA 1UD6A 5D8WA 3VVGA 5EMYA 1JI2A 3FAXA 3I3EA 2WVTA 4DM2A 4TVCA 2YKKA 2NSXA 1QW8A 4X9YA 4GZJA 3N15A 2OWWA 3NYDA 3FNDA 3BSHA 4FLSA 3EMZA 3M07A 2WCAA 3WBEA 3L4XA 3AIUA 3IJ7A 1S46A 1PZ3A 2BV9A 2E0PA 3BSGA 3W53A 2ZUWA 1K9FA 5D9PA 3WUFA 1V0MA 3SUSA 4C7DA 2WVVB 1W2PA 2VO5A 1K9DA 1V02A 4F66A 5JBFA 3AJ7A 4P7OA 1B0IA 2E4TA 4MDPA 1C93A 3PZIA 3TTQA 4QCFA 1U33A 2FH8A 3T0DA 3BXWA 3U7BA 1GOKA 4M80A 3WF0A 1W32A 1J9YA 4B3KA 2X2YA 2BHYA 1CIUA 2O9TA 3A47A 3WQ5A 1ISVA 2ZICA 4S3JA 2CNCA 1E6RA 3CLWA 3BMVA 4BCEA 1F4HA 1UG6A 3VUPA 3F5KA 1TG7A 2Z1KA 3GTNA 4PBGA 1P6WA 3VDHA 4UOZA 3T2PA 1XH1A 1Q6DA 3W26A 3IK2A 2V5DA 1E1FA 4TTUA 2WCSA 1E6XM 2QHAA 4XV0A 2BVDA 3W6LA 3WNPA 5D9MA 7A3HA 4B16A 1E40A 2WANA 3L2MA 3LMYA 3VDAA 2ZUNA 4MB3A 2A3AA 2CXGA 1ZBWA 1KXTA 3GXMA 1CGTA 3BAYA 3M6DA 5FIPA 3ZOAA 3WD3A 4OOZA 4J3WA 4UQAA 4Z2LA 5A2AA 4GI6A 4AYSA 4AXNA 5ECUA 3EDFA 4AWEA 4FLRA 1PX4A 4JFVA 3WNNA 1LG2A 4EK7A 4PSPA 1ISXA 1V0NA 2GDUA 2YDQA 2V5CA 2V38A 4GI9A 3SCUA 3VD9A 1LJYA 1E55A 3FHAA 3WDQA 3VTRA 3L4VA 1NM9A 2D1ZA 3O6AA 4HOZA 4LQ1A 2EQDA 1G1YA 2G4FA 2A3CA 1MFVA 3NJ3A 4HA1A 5EB8A 1HKJA 3QHOA 3HU7A 5M5DA 1R8LA 3WQWA 1EOMA 3AXIA 2D0HA 3A4AA 2V3EA 5JIWA 3WELA 1XYZA 2D0GA 3MSDA 4EKJA 3VNZA 4ATWA 1V08A 1FFQA 3AS3A 2VT0A 3AZTA 5I23A 3ZQ9A 3WF1A 3W82A 1KCKA 1UQYA 2UY4A 2VC9A 4PMDA 2W62A 3TTYA 2J77A 2WZHA 1UHVA 1W1VA 2XIBA 1E4MM 4U5IA 1EGZA 3UESA 4BA0A 3GYCA 4YN5A 1BHGA 3BAXA 2QPSA 4QDMA 3OA5A 2Y2WA 1HJXA 3B8SA 2PBOA 4ACZA 2J7BA 1UR9A 2JE8A 5A69A 1WAWA 4GQRA 2QLYA 2XVPA 2ZX5A 5HOSA 4U2YA 5E09A 1GHSA 3VIPA 1JGIA 3GM8A 3SCOA 4E2OA 1B9ZA 3APGA 1E3XA 3UETA 3RILA 4D6IA 5AYIA 3AIQA 3N18A 4EE9A 4AIEA 1XD1A 2F2HA 1US2A 2GJRA 3BCDA 1JZ4A 6TAAA 4MAVA 3AHXA 3MS8A 2YBUA 9CGTA 4UZSA 3NCOA 4NI3A 1VFMA 5ABFB 4LYPA 1HJQA 3AHTA 4AD4A 3WH5A 1W3KA 1KR1A 2EPOA 1HKIA 5AYBA 3WIJA 2VQUA 2XGIA 3W38A 2W5FA 4W87A 4BQ4A 1OGBA 1I75A 2VVSA 3ECQA 1PZ2A 3RMEA 2VR4A 4OBRA 2JEQA 2XSBA 1NWTA 3CH9A 1M53A 3AMDA 3GZAA 3EDDA 1CGUA 2W67A 2W92A 3F4VA 2J7FA 4AZ5A 2RGMA 3IAPA 3BAKA 3PTMA 1WP6A 2DEPA 1QI3A 5GNYA 2XUCA 5IDIA 4J7RA 1J0HA 3ARPA 4W8LA 3SUVA 1UKTA 3ZM8A 2XJ7A 3K4DA 1MWOA 3VD7A 1GZJA 3AIEA 2A3EA 3POCA 4IPNB 2CHOA 2WMJA 4AZCA 1E5NA 1OGGA 5A8QA 1K6AA 5CQ1A 2G3IA 3LPOA 3AROA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4TMB A;  3U7V A;  3G0U A;  2FTY A;  4XVD A;  1JCM P;  3VO0 A;  3VOC A;  1G7V A;  5D33 A;  4B5N A;  3DHD A;  4GGB A;  3QSR A;  3V35 A;  3BG9 A;  4FX6 M;  4P7R A;  5EML A;  1FX6 A;  1R2R A;  3G3D A;  2BS9 A;  2XN0 A;  1OFO A;  4JFW A;  3MO7 A;  1UWS A;  4IPL A;  4CQD A;  1CGW A;  3CZG A;  1FWD C;  5K4Z A;  1AW5 A;  4AVO A;  4DN1 A;  1L8N A;  4CD8 A;  2PDL A;  1GQL A;  3RM8 A;  1V79 A;  1SR9 A;  3VC6 A;  5I3D A;  5RUB A;  3U2E A;  3VIK A;  3E0W A;  3MHF A;  1KT1 A;  1H0G A;  5TF0 A;  1BKS A;  5AKQ A;  1SJB A;  2NV1 A;  2C7F A;  4OHQ A;  1JNE A;  2V2H A;  4A8I A;  1O94 A;  4LS1 A;  1VFL A;  3N2T A;  1N8I A;  2REQ A;  3TN4 A;  4O1F A;  3GZ3 A;  1H49 A;  4Q6X A;  4XAY A;  1TX2 A;  1YNY A;  1NVM A;  3WQC A;  1QNR A;  1RVK A;  3ZZ1 A;  1UUO A;  3M0K A;  1EWD A;  4OFC A;  4UFI A;  3ERP A;  2RDU A;  2XN1 A;  1QOP A;  4TV6 A;  1HUV A;  4BQ3 A;  1NOU A;  5I24 A;  1IE7 C;  3CHF A;  4YPJ A;  1BF6 A;  1M65 A;  2HBX A;  4QRO A;  3W84 A;  2D24 A;  3TOY A;  4J3T A;  1MQQ A;  1UPM B;  3VX0 A;  4DF0 A;  1E70 M;  2PU0 A;  4QNE A;  4S3E A;  1I0D A;  5K3V A;  2WMI A;  3ATZ A;  4WZH A;  1TCO C;  3DN5 A;  5TAO A;  1YRR A;  3QHN A;  2OYM A;  2CPU A;  1OD0 A;  1OYB A;  3IAN A;  2D0F A;  4US6 A;  1G5A A;  1YXD A;  3H22 A;  2NXG A;  2A6N A;  2F61 A;  3DGR A;  5I3G A;  3W7R A;  5HWC A;  1KA9 F;  2AQO A;  3BE7 A;  1UWT A;  2GQ8 A;  2CU0 A;  3QR3 A;  4UNK A;  1FFR A;  2Q6Z A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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