4URIA

Crystal structure of chitinase-like agglutinin robpscra from robinia pseudoacacia
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
AIKGGYWYSGSGLAVSDINPSHFTHLFCAFADLDPNTNKLTISSSNAAAFSTFTQTVRAKNPSVKTLLSIGGGGGRALAAVFANMASQASRRKSFIDSSIQLARRNNFHGLDLDWEYPSSDIDKTNFASLIREWRAAVATESSTSGTPALLLSAAVGGSDQITPLKYYPGEAIANNLDWVNVMTYDLYTSDSYPTLTQPPAPLFYPRGIFSADEGITKWIQSGVPESKLALGLPFYGFKWRLSDPNNHGLFAPATQGLGAVKYKDIVNTGGQVEFDSTYVTNYRFKGTDWYGYDDTQSISAKVAYAKQRGLFGYFAWHIEQDSNWALSETASRAWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords CHITINASE-RELATED AGGLUTININ
publication title Structural Basis for Carbohydrate Binding Properties of a Plant Chitinase-Like Agglutinin with Conserved Catalytic Machinery.
pubmed doi rcsb
total genus 125
structure length 336
sequence length 336
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4uriA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4uriA01
2CESA 3QR3A 1E0XA 4TX8A 1MYRA 3OG2A 4RE2A 4IM4A 2VRQA 4IPLA 1HJSA 3VDHA 5ABFB 2VVNA 1MQPA 4B9YA 1UYQA 4MNJA 4KH2A 4AY1A 1VF8A 3ARTA 4W89A 4H8UA 3F5LA 4M82A 4AZCB 1C91A 4D6FA 4C7GA 3CUGA 5D8WA 1UR4A 4MAZA 1FA2A 1VRXA 4E4PA 5KZ6A 3L4XA 1L0PA 5HPCA 4HOWA 3WD4A 2X05A 3ECQA 1H4PA 3MS8A 1O6IA 3WDPP 3WNNA 3KL0A 4UQAA 4WF7A 3IJ8A 1JXJA 1HIZA 1KWKA 1B30A 5EBAA 1M53A 2G4FA 5I3DA 2IXUA 1W1VA 4LYPA 4RL3A 2ZX7A 5A6MA 3CUHA 1V3LA 1DWJM 1J0YA 1FHDA 2VX4A 1JL8A 1HT6A 2XVPA 4LXFA 1EGZA 1EOMA 1QNPA 2CBIA 1UH2A 2XM2A 4D6IA 3CPUA 4FLQA 1CXKA 1JI2A 1D7FA 5E0FA 2DSKA 5BXRA 2WAGA 4JFUA 4W85A 4OZOA 3SUVA 3ARSA 3AYSA 1C90A 1B0IA 1W9VA 1MQQA 2O9OA 1JG9A 5BXTA 2CBJA 3GBDA 3SCNA 1M03A 4GI6A 3AIEA 1JNDA 4HA4A 4PUDA 3WMSA 1ITCA 5BXSA 3ARQA 1JD9A 1VJZA 4ACZA 3CHCA 1V6YA 3APGA 1JZ7A 4GQRA 1VAHA 1UR1A 1MWOA 2WVTA 3ARPA 3PZGA 2G8ZA 2VOTA 3T2PA 1QVBA 1WE5A 2GJXA 4BF7A 4AXNA 3WD1A 4NSBA 3PTKA 3ZJKA 2BFGA 4M24A 4CGTA 2D1ZA 3OA5A 1LWJA 1VEPA 1QHOA 3OZOA 1RP9A 2WC3A 3LMYA 3M46A 4B9ZA 5I6SA 1UA3A 1JDDA 2YKKA 4TUFA 1HKKA 4JHZA 2EPMX 3EDEA 1OB0A 2OWXA 3WH9A 1FH8A 3AMGA 1V02A 3TTOA 3A47A 2WBKA 3D5HA 3VIOA 3AHVA 5A94A 1EQPA 1UD5A 3BMWA 3N04A 1NWSA 1KR1A 1GOQA 3WH6A 3GYCA 3SCVA 3ZSSA 4Z2GA 4CD5A 4GIAA 1GQKA 1UKQA 2JE8A 3AHTA 4CKQA 4MDPA 2VCAA 5I79A 2J25A 4WSJA 3AROA 2XVKA 3FHAA 2CEQA 2ZE0A 1DP0A 2CHNA 2QPUA 4KWUA 1G5AA 1OD8A 4ATLA 1PPIA 4WKHA 3CZJA 5AYBA 5D8ZA 3K8LA 9CGTA 4X0NA 3N9KA 1NOWA 3AZTA 1ODUA 1W9XA 1XC6A 3MUZ1 2WSPA 1QI3A 2JEPA 3TTYA 3CHDA 4KRTA 1OGGA 2Z1KA 5FOOA 2VUYA 2VR5A 5GQBA 4Z2JA 1PIFA 1EQCA 3BAJA 1UH3A 3W4RA 2OYLA 5LA2A 1GUVA 3WFLA 1CECA 5A69A 3PZTA 5ABGA 1FHLA 2FH6A 2VX6A 2FGZA 5I2UA 2WZIA 4H7VA 7TAAA 2ZXQA 3EDKA 3TTQA 3S6TA 4AD1A 1OM0A 2WKGA 1CGVA 5CSUA 2YJQA 3VIKA 1E6XM 4BQ4A 1R8LA 1CXFA 4JAWA 4V27A 1EO7A 2VJXA 3GXMA 1VENA 3AIBA 3UG4A 4WKFA 4C7FA 3KZSA 1XSIA 1CPUA 1E6RA 1UQYA 1H3GA 2WB5A 1QPKA 1JD7A 3TOPA 3ZJ6A 5A2CA 4D6HA 1QI5A 4XZWA 3MV01 3CUJA 3VDBA 1ODZA 2BY0A 3NIYA 5CPSA 2G41A 2D22A 5KEZA 3RCNA 1E5NA 3I3EA 1H49A 3WN6A 2BHUA 2GK1B 1IZKA 1TCMA 3W27A 1Q6EA 4F9DA 1JIBA 5JH8A 4U3CA 1W9PA 2X0HA 2JEQA 2X0YA 4JFVA 1D3CA 5IFPA 2VCCA 4PMOA 3VX1A 3VGEA 2YA1A 1EOKA 1EDQA 3WKZA 1TVPA 4URIA 2DT3A 3WQ6A 5D9PA 3UG3A 1R7OA 3CMJA 4MB4A 2G3NA 2ZUSA 4UZSA 2J77A 3CZGA 1WCGA 3PZ9A 5I24A 1B1YA 1UQZA 1ZBVA 4PTXA 1FP9A 4FLRA 3RDKA 3RMEA 2Q8XA 5E09A 5AC5A 2D23A 1WZAA 3QHOA 4GO9A 3MUIA 1VBUA 4ZE5A 3SEPA 1F4HA 3WSUA 3MUAA 4W7VA 3GNRA 4D6GA 3AFBA 2WWCA 1E40A 4J3SA 1VFFA 1X6NA 4GI8A 1QI0A 2CKSA 3F4VA 2B31A 2FDMA 4PUEA 1WDPA 2WMIB 4JKLA 3WNLA 1HF6A 1TMQA 1K9TA 4D6CA 4UFMA 2G3JA 2A3AA 2A3CA 3MSDA 1NH6A 2EQDA 1C8QA 1XSJA 1GQJA 5LYRA 5HPOA 3EMZA 1E71M 1DWIM 2F61A 2ZXAA 5CXPA 1A47A 3N13A 2PBOA 3AXIA 4L4OA 5BCAA 1J10A 2VZOA 3CGTA 1UR0A 4UQDA 2WMGA 5IFTA 4PMRA 4W88A 3WUFA 2O9RA 3CZ8A 1TUXA 1FP8A 4M1RA 3WH5A 1K9EA 1YHTA 1SMAA 3ARWA 1PEZA 3WEZA 3N1AA 3KE0A 1G01A 2EPLX 3WL0A 1CXEA 1GJWA 4HOZA 1HJVA 1ESWA 2HVMA 1GQIA 1QBAA 4X0VA 4D72A 4XX6A 1MFVA 1JI1A 3AIQA 4F66A 3KL5A 1EHNA 4TOQA 1R87A 1V6XA 4CVWA 1GOMA 3VD4A 4J3UA 1U33A 3VD3A 6TAAA 4MNKA 4D71A 1OCQA 4W84A 2DGAA 3CZEA 2VZUA 1NWRA 1TA3A 5A6BD 1E1EA 1CZ1A 2PF0A 1PAMA 3OLEA 1VFUA 2XWEA 5I23A 2BS9A 3GH5A 3AS0A 5A6AA 1C7TA 1XH0A 1AQ0A 2YOCA 4KRUA 5BROA 5A6SA 1ZBKA 2YL6A 4CD4A 3UCQA 5A6LA 1I1WA 2J7DA 1C8XA 4W8AA 2DPEA 3WNOA 3THDA 1OSEA 2EO7A 3OGVA 3WDIA 1C93A 3BSGA 5HBFA 2J7HA 5M03A 3ARXA 3BCFA 1GZJA 2Z1SA 3WH8A 3A4XA 1ZJAA 3L4WA 4N42A 4ACYA 3J7HA 5D9MA 2WSKA 5A1AA 1W3KA 3W26A 4DUXA 4ZXLA 1E56A 1KR0A 2CITA 4AIEA 3L4ZA 1ISYA 1HJWA 5IDIA 2MANA 5D9NA 3CHEA 4P8UA 2OSXA 2DH3A 2BHZA 2EXOA 2BVDA 3S2CA 4U3AA 3K1DA 4W8BA 5F7UA 1JYXA 1VFMA 2J78A 3U7VA 1XCWA 2FGLA 2J7FA 3EDJA 3EYPA 1H1NA 2O9PA 1LG2A 3VKKA 2BVYA 1KWGA 2CXGA 3WDJA 2X8RA 4UCFA 1RD6A 1E0WA 2GFTA 4PYSA 2WHKA 3QOKA 3WF4A 2Y24A 3ZO9A 1E4MM 4X9YA 1CGWA 3BLPX 2WZEA 4ACZB 1QNQA 4TVCA 1C3FA 3I3DA 3BXWA 2OSYA 1E6SM 2YL5A 2IXVA 1MW3A 1HN1A 2W67A 5FKYA 3WBAA 5JIPA 2G3IA 1CTNA 1HJUA 5CGTA 1FFQA 3A3HA 2QHAA 4M29A 1GONA 5E70A 2XWDA 1E4IA 2FHCA 4CU7A 1JZ8A 4CD7A 1X6LA 3VINA 4JKKA 4V2XA 4ML4A 4P8VA 2C7FA 1ZB5A 1U2YA 1W3HA 2YDRA 3JUGA 4HA3A 1DEDA 3FNDA 5A8QA 1M7XA 2XGIA 4AEFA 5D4YA 2RGMA 2XSAA 5CQ1A 1BSIA 1R85A 3FHQA 4UFLA 2AAAA 3MKKA 4UFJA 3L4YA 1BF2A 3GTNA 2V5CA 2BNJA 2CHOA 3SUWA 3WD2A 4EK7A 1W9UA 3LPFA 1V0NA 4LPCA 4B16A 1ZS2A 2VI0A 2PWEA 3M07A 3OGSA 5BWFA 3VVGA 1G94A 2J7CA 3BAXA 4A3HA 3OGRA 4MB5A 4S3KA 1EO5A 2WCGA 4PSRA 1LL6A 2AOSA 3SIMA 1W91A 2BV9A 2XVLA 1V3MA 1E1FA 2ZX5A 4PCSA 2ZUUA 3GZAA 1J18A 4YHEA 1U30A 3T2OA 1BFNA 2W91A 4GQQA 3FW6A 3BLKA 4NI3A 1BG4A 4WK9A 4NF7A 3NSNA 3OB8A 5CLWA 2XUCA 1CNVA 5JBEA 4MTVA 2CPUA 1KB3A 1WAWA 1XYZA 1OWQA 3GDBA 3VGBA 1B3VA 4MNLA 4B15A 5IXEA 1PX4A 1M01A 2XTKA 3UR7A 4DM1A 1WZLA 5HDRA 3AIWA 2YDSA 2ZXDA 3TP4A 1W9BM 4D6EA 5A2AA 4D1IA 1NOUA 2DIEA 1G0CA 4AIUA 3AMLA 3K8KA 3HU7A 4A4AA 5BYWA 5JBDA 5HOSA 3ZOAA 1B3WA 3RILA 3WDRA 4M8UA 4JFWA 5JIWA 2WNWA 1RH9A 5A8MA 2X1IA 1ECEA 3VD5A 3DYOA 2TAAA 3L2MA 1RPKA 3SCQA 3VNZA 4S3JA 3MANA 2E40A 4FK9A 2V3DA 1XCXA 3SCRA 1GPFA 2PWDA 1XSKA 5A3HA 5FIPA 3PHAA 2YLAA 3PTQA 1UD2A 3IAQA 3ARZA 2ZX6A 4UOQA 1LLOA 2WYSA 1JZ2A 2J62A 1V3JA 5DMYA 2BVTA 4PRWA 2J74A 3OIHA 6CGTA 3NSXA 2BXZA 3UESA 4LX4A 1DWHM 2D0FA 1HXJA 1GOIA 3VGFA 1SMDA 1V6VA 3PZOA 4R27A 3VM5A 3VPLA 3UERA 2BY1A 4E2OA 1UD3A 2WPGA 4PMZA 1XGZA 1DWAM 5FL1A 4J3VA 5DO8A 3U7BA 1QW9A 4Y7EA 2A3HA 4MNMA 2UWFA 4IUGA 4AD4A 1SFSA 1V0KA 3KL3A 3QGVA 4TVUA 5TD4A 1JDCA 2WC4A 4CU8A 2WMHA 3AS1A 3VIMA 4AWEA 3CLWA 4UNIA 6A3HA 3WQVA 1E6ZA 1V6WA 3PBGA 4HP5A 5GNXA 4AZ7A 1A3HA 1FH7A 1Q6FA 2JALA 1QNRA 1E43A 2V3GA 4U5IA 1CGYA 3ALGA 2ZUTA 2WVVA 5A8OA 2J4GA 1HKIA 4ZE4A 2J7BA 3CZLA 3SCPA 1CGXA 4UFKA 1HVQA 5CPQA 2XFYA 5A95A 3AHXA 5GNYA 4DM2A 3KWXA 1JFHA 1BG9A 4JFTA 2DT2A 3TONA 3OBAA 3AICA 3SUUA 3GXDA 2CERA 3PTMA 3VIFA 4BQ5A 4MB1A 5M3WA 1QHZA 4CN6A 1KQYA 4HZ6A 4P7NA 1JYNA 4D6DA 4PMNA 3ARVA 1Q6CA 1ISZA 1XYFA 3T09A 2WZHA 1GJUA 5CLTA 4M80A 5HNNA 2J75A 2QF8A 1CYGA 3WFZA 1YQ2A 2PBGA 3ZR5A 2AMGA 2OSWA 4N0RA 3M7SA 4QDMA 1RP8A 3IANA 4IISA 1TA3B 3EDDA 3VD9A 1UWQA 5D9OA 1W2PA 4K68A 2ZICA 3ARYA 4JFSA 1E4LA 1QNSA 4TTGA 1ZJBA 1JYWA 5GPRA 2J47A 3FAXA 4J3TA 3KEHA 1KXTA 4AISA 2W63A 4LGXA 5DT7A 3SUTA 1HNYA 1UD6A 4AC1X 3L4UA 2W66A 2WVSA 4P7RA 4Z2HA 3SCSA 3L4TA 3WELA 3VGDA 3POHA 1E5JA 1BYAA 4F79A 3L2LA 2PWHA 4MDOA 1B2YA 1US2A 1UWSA 3I3BA 2XJ7A 3GXIA 1SR0A 1CXLA 4JHOA 3O6AA 4W86A 4UTFA 4R5EA 4WSKA 5DF0A 2C8NA 2C0HA 2WMKA 3A4WA 2V38A 1V02E 3BMVA 1EIBA 4HTYA 2OWCA 4D1JA 2VC9A 2WKLA 3K4DA 4GZEA 4WLCA 1E3XA 3NUKA 1IT0A 2X2YA 4W87A 1HJQA 1HKJA 3VNYA 1UHVA 1LJYA 3B9EA 1UZ1A 2CNCA 4U31A 1K9DA 1WPCA 4ZENA 4F8XA 1GOOA 3SURA 2XM1A 4QCEA 4BQ2A 3W25A 4FLOA 3IAPA 3BCDA 1GHRA 3WDHA 4ATDA 2QLYA 1E4NA 3OLIA 2X09A 4CCDA 4MJ4A 1VJSA 4HOXA 1UR9A 1IV8A 1VB9A 2QMJA 2V3FA 3LPOA 3WL1A 1EDTA 1ISWA 2DSVA 3UEQA 4GXPA 8A3HA 2DQXA 1OBAA 2Y8VA 4DWSA 4UFIA 3EMQA 2G3MA 1UUQA 2ZIDA 3AIRA 1B3XA 2GDUA 4KGLA 3TA9A 1H11A 4CN1A 1V03A 3GNPA 2UY2A 2V3EA 3SUSA 3W0KA 2YA2A 3ALFA 4L4PA 2DH2A 1UKPA 3PZNA 4UR9A 2VRJA 3WF2A 5FD0A 3WD3A 3CUFA 2JF6A 4JCMA 4MPKA 1EH9A 1FOBA 3ZR6A 1CEOA 4UFHA 3WH7A 1NWTA 4TTUA 1KXVA 3VDAA 3VDCA 4BZYA 4P8WA 4AZHA 1PIGA 1EA9C 3WENA 2J7GA 3RJYA 1W1YA 1JGIA 1B31A 1OGBA 1E72M 1I1XA 3W38A 1X1NA 5CJ5A 2OYKA 2VRKA 2XHYA 3B9DA 2YL8A 2ZUNA 2D2OA 3HN3A 3FXYA 2D3NA 4ATWA 3CIVA 5E6ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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