4W5UA

Crystal structure of chitinase 40 from thermophilic bacteria streptomyces thermoviolaceus.
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
GTVKLGYFTEWGTYDRNFNVKNLDTSGTAAKITHINYAFGNVTGGKCAIGDSYADYDKAFTADQSVSGQADTWDQPLRGNFNQLRQLKAKYPHIKVLWSFGGWTWSGGFADAAKDPQGFAQSCYNLVHDPRWDGVFDGIDIDWEYPNACGLTCDSSGPDAFRNLMAALRSTFGDELVTAAVTADGTPGGKIEATDYAGAAQYVDWYNVMTYDFFGAWDAQGPTAPHSPLTSYDGIPKQGFTSADAIAAFKAQGVPADKLLLGIGFYGRGWTGVTQDAPGGTATGPAAGTWEQGIEDYKVLKNTCPVTGTVAGTAYAHCGSNLWSYDTPDTIASKMAWANDQGLRGAFAWDFSGDTADGELIAALSNGLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of chitinase 40 from thermothermophilic bacteria Streptomyces violaceus.
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces thermoviolaceus
molecule keywords Chitinase
total genus 130
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4w5uA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w5uA01
4MNJA 2YJQA 3WH5A 2G4FA 4X0VA 1QHZA 4M81A 2YIHA 5BWFA 3ECQA 4C7GA 4W84A 4UQAA 1G0CA 1MQQA 1K9EA 1KB3A 3QR3A 2V3FA 1E6RA 2BY3A 2XUCA 2WC4A 1JF5A 2CEQA 3AIEA 2ZOXA 3BC9A 4WK9A 1V0NA 1M04A 4AZHA 2YKKA 4TXEA 2XM2A 1TVNA 4IPNB 3TTOA 4AZ7A 1C7SA 1Q6CA 5AYBA 4C7DA 1GOQA 2GJPA 1EHAA 3AYRA 4D6GA 3FW6A 2Y8VA 3WNNA 2XWDA 1JIBA 2VURA 2YL6A 4CVUA 2J25A 1W9UA 2YBTA 5BCAA 4EK7A 2V5DA 1TA3A 3OB8A 2WMIA 4ACZA 4JCLA 2W5FA 2WHLA 3KL3A 2WCAA 4P7RA 1EGZA 1XC6A 2VRKA 3AMGA 1JZ3A 1JDCA 3GNRA 4D1JA 2JF7A 3E1F1 3MUZ1 4A4AA 2Z1SA 1HL9A 2JEPA 4D71A 1WAWA 3WQ4A 4TTGA 5EB8A 4JFVA 1ISYA 1US3A 2CBIA 1CZ1A 2J7GA 5LA1A 4AZ6A 2D2OA 2EPMX 3GZAA 5CG0A 5D9PA 5KEZA 3WNKA 4CCCA 1OGSA 2YL8A 3A47A 3M6DA 3RDKA 1UD6A 4NSBA 1J0ZA 3BAYA 3WNMA 2Z1KA 3IAQA 1E1FA 1X1NA 1BGAA 3BMVA 2DT3A 4L4OA 2YDQA 1HIZA 2OYLA 3CZKA 2WMHA 3UEQA 1EOMA 3ZJ7A 3CMGA 3IJ8A 3APGA 4MNKA 4JFUA 2ZX5A 1WKYA 2BS9A 5GPRA 5I23A 4J27A 1DP0A 1CXEA 1H0IA 3A6OA 4UOQA 1VF8A 1DWGM 1H5VA 2QHAA 2BY0A 3NSMA 4PRWA 3BCDA 4MNLA 1BVNP 3VVGA 4QDMA 1BQCA 4XUYA 2OWWA 2VRJA 3ZT6A 2FH8A 1BPLB 3EDKA 2DT1A 2WANA 4UCFA 1BG9A 3MU7A 1D2KA 1G9HA 3NSXA 3BGAA 4M29A 4QFUA 1ISWA 2XFYA 1KWKA 4E2OA 4UFKA 2WCSA 2F61A 5FD0A 4V28A 5ABGA 2CERA 2FHFA 2DEPA 3PZIA 1V3IA 3CLWA 1UWTA 4HP5A 1PX4A 3WUFA 4BQ3A 6A3HA 4CN1A 2CHNA 2CKSA 5A2CA 2OLHA 1B3ZA 3VILA 2VUYA 1E55A 4FLRA 3CHDA 2XGIA 4DM2A 1HJXA 5CQ1A 1QNOA 3UETA 3ZJ6A 3ZJ8A 2VX4A 5BROA 1OCQA 1MVYA 3L4WA 4D6IA 1W9VA 5CGMA 1JYXA 4BZYA 4ML4A 3O2LA 4W7WA 1RD6A 1V6YA 3AJ7A 2XHYA 4MADA 5JUVA 1KXQA 1TA3B 4ACZB 3SCQA 1US2A 2VL4A 4PN2A 3ZSSA 3VDAA 2VMFA 1J10A 1E4NA 5A6BD 3LPGA 5C70A 1X6NA 5A69A 3WEZA 4PSRA 4UFJA 1VAHA 3W4RA 1WO2A 1LL4A 2VZSA 1XYFA 5I0DA 3VMPA 5A8PA 3K1DA 4GI8A 1UD5A 4W5ZA 3SUVA 4W5UA 2MANA 4UFHA 1ECEA 2CBJA 3AIQA 4PTXA 4PCSA 4HZ8A 2FGLA 3W24A 2FH6A 1NWSA 2VCCA 1UKSA 1HJVA 4BF7A 1BYBA 1ZB5A 3SCVA 2WVVA 1ISXA 4JZ5A 3U5YA 1JZ7A 4PMXA 4N0RA 4UQBA 1KBBA 5CJ5A 1UKOA 3BAJA 2BHUA 4CU8A 4W7VA 2WLYA 1E0VA 3GXIA 3QHOA 5EBAA 3DYMA 3OGRA 4DWSA 3VGHA 1E70M 3WH9A 1LLOA 4AD5A 2HISA 4J3VA 1RPKA 1TG7A 2GK1A 4UFIA 2BHYA 1WDQA 3WL0A 5M5DA 2NSXA 2VO5A 4MAZA 4WKAA 3WEMA 2J75A 4AEEA 1IZJA 4PMRA 2ZXQA 3ARRA 3ZIZA 2HVMA 3WBEA 2ZX8A 3LPFA 1FP9A 3BMWA 3CMJA 5CLTA 4UOJA 1BF2A 1ITXA 5CPSA 5A2BA 1JD9A 3LMYA 1JXKA 2DSVA 2WPGA 3FAXA 4J3TA 5DFAA 4EAMA 5E6ZA 1FH8A 5A6JA 3WQ5A 1CGXA 4L4PA 3S2CA 2ZX7A 3LPOA 1QI0A 3GM8A 4CVWA 1LWHA 4AZ5A 2DT0A 1MYRA 3WSUA 1B1YA 4CKQA 5FCZA 1UD8A 1MWOA 2ZUSA 3M46A 2YA1A 1DHKA 4FLSA 5HDRA 3GXDA 4JKKA 4BQ2A 3W27A 1B31A 3B8SA 3L4ZA 4S3KA 1XCXA 3UCQA 2CYGA 1JD7A 2X0YA 3GBDA 4QCFA 3DYPA 1FP8A 1HXJA 3CO4A 2FHBA 4CCDA 3RM4A 1XRVA 1W3KA 2XJ7A 3EDEA 2Y5EA 1HJSA 1ZU8A 2XG9A 1XYZA 4WIWA 5FIPA 2XPKA 5A6SA 1JZ6A 4AZCA 1C91A 3TONA 1UR0A 2W63A 1C93A 3VD3A 3D5HA 2FGZA 4OKDA 4FF5A 4OIFA 5AY7A 4J3XA 5IFPA 1CXLA 1E6SM 3VNYA 4KGLA 1B0IA 1PIGA 1KFWA 1E6NA 1CLXA 1KCLA 3W53A 3IANA 3ZSTA 3GNOA 4DWSD 4QP0A 3AXHA 3VD4A 3WUGA 2CCRA 3MUAA 3DHUA 2GUYA 1E40A 3AMDA 3VIGA 1H0GA 3GNPA 1MQRA 4LQ1A 3MMWA 4V27A 3MS8A 1VEOA 1XV8A 4Y7EA 2J77A 4OOUA 2OWXA 2E4TA 1E6PA 4P7OA 1SR0A 2AMGA 3WFLA 4GO8A 1JYNA 1R85A 3KE0A 4HMDA 3WIJA 1OGGA 1F4AA 3BXWA 1ODUA 4MPKA 4PUDA 4AIEA 1JZ8A 5E0CA 1NQ6A 3W25A 5A2AA 1GOOA 2DSKA 4ATDA 3AS1A 2ZWZA 3ARPA 4PMNA 1VFUA 2OYKA 1LF1A 4TX6A 1UH3A 1WZAA 2GK1B 4AD3A 5JBDA 4JFSA 1JZ5A 1KGUA 3JUGA 4QAWA 1OD8A 2VZTA 2WVUA 2ZWYA 2JE8A 5D9NA 3GH4A 1EXPA 3PZTA 2Y8KA 2ZE0A 2WHKA 4GINA 2VNCA 3AMKA 4URIA 4HTYA 3VOCA 2D24A 2OSWA 3ARXA 2X1IA 3PZMA 4N42A 3ZMRA 4PTMA 1F4HA 3BAIA 4AD2A 1CIUA 2X8RA 3A4XA 4IUGA 5KZ6A 3GDBA 3DHPA 3CZEA 1GHSA 2NT0A 1GJWA 5GQBA 1TVPA 1OIFA 1NOWA 2D20A 1DWIM 3F5JA 1DWFM 1OSEA 5AC5A 1O7AA 2UWFA 1CYGA 1B3WA 1JYVA 1PPIA 4D72A 3VNZA 4Z2KA 1C92A 2WW5A 1BFNA 5ABEA 3FAWA 2GJXA 4W8LA 2D23A 3AIBA 1CBGA 1AQMA 2BXZA 3U5UA 4WSJA 2IXVA 3WNLA 4PBGA 2X05A 1GQIA 1E6ZA 4KMQA 4MDPA 4AZCB 3SCUA 1QI2A 2WMFA 5LA0A 2ZUTA 1C8XA 1MFUA 2WMKA 4LYPA 5D8ZA 2J7EA 2UY3A 1B2YA 4U5KA 1PJ9A 4UFMA 4A3YA 4QLJA 4X0NA 4WKHA 1CXHA 4UQ9A 2J74A 4GZIA 3W37A 2ESCA 4NI3A 2BHZA 1HF6A 2V38A 1DTUA 4MB1A 4P7LA 4AIUA 1E4IA 4FK9A 1AQ0A 2WSPA 4CN6A 4PMQA 2CKRA 4W86A 3PZUA 3WH8A 1UD2A 2BVTA 3NYDA 2IUZA 3N13A 4W88A 2VQTA 1B3YA 3SCNA 3WD4A 3AYSA 3VIOA 4W93A 4ATWA 5DF0A 1ZJAA 1VEMA 3ZJKA 4M56A 2PWGA 2WNWA 2WM0A 1QOXA 1LL6A 4GI6A 4OOZA 3KEHA 1DWJM 3UERA 2D0GA 1TFVA 1W3JA 5ABFA 3TP4A 2J8FA 1W2VA 4HZ7A 1CENA 1BLIA 5I24A 5E0FA 2BFGA 2E40A 3VD9A 4J7RA 2VRQA 1MQPA 1FA2A 5HPCA 3CUGA 4H7VA 1VJZA 3VGEA 1BG4A 1W91A 3KZSA 3AHVA 4FLOA 2V3EA 4R5EA 1U30A 3K4DA 1I75A 1FFRA 4HOZA 3MSGA 5D9OA 1HKMA 2PWEA 2XVNA 4F8XA 1PIFA 3F4VA 4UFLA 3L4VA 1GQKA 4U5IA 5BRQA 2VVSA 1WZMA 2O92A 3OLIA 1GPFA 1HJWA 3NJ3A 3FNDA 2WAGA 1XSJA 4TX8A 3VDCA 1AMYA 1EDGA 4JAWA 4HZ6A 4ATLA 5A94A 3RMEA 4HMCA 4P8XA 3SUUA 3WMSA 4D6DA 3AXXA 1L8NA 1GZJA 2VCBA 3KWXA 3MUY1 2WYSA 1EHNA 3POCA 4AEFA 2J7CA 1H49A 1W1PA 2WB5A 1LG2A 1HX0A 1V3HA 2GJXB 2EPNA 1Q6EA 1R86A 4MJ2A 2J7HA 3AHXA 1FHDA 3VIKA 1BAGA 3M7SA 1WDPA 2XYLA 3CHCA 3HU7A 3BAKA 3UG3A 3N9KA 1O6IA 2EPLX 1J0IA 3EDJA 5A6BA 4W8AA 1M53A 4E4PA 2OSXA 3AIWA 3WENA 5TD4A 3AS0A 1GQJA 2VOTA 4GXPA 4BQ4A 5BXPA 1WE5A 5A1AA 3WF2A 1CGVA 1XSKA 4J3UA 5E70A 1QBBA 4LYQA 3RJYA 5F7UA 1W32A 3T08A 1C90A 4WLCA 1QI5A 5M17A 1C8QA 2VCAA 4Z2IA 1WZLA 2BXYA 4J3SA 3TTQA 5JBFA 1HKIA 2J47A 5DT5A 1XD0A 4A3HA 1FH7A 2D0FA 1D3CA 1FHLA 2PWDA 4PMYA 4F66A 2WLZA 5DT7A 1JZ4A 2WBGA 3SEPA 1UD3A 2JALA 2W4XA 1R7OA 2UY2A 5ABFB 3PZ9A 4W89A 1C7TA 5JBEA 4S3JA 3NDYA 4XZWA 1MW2A 3IJ7A 2XM1A 4GZEA 2GDVA 3ZT5A 2CNCA 1AVAA 2DT2A 3SCSA 5FOOA 1VFFA 4PMVA 1JAEA 5IHRA 1EO7A 4W7UA 4Z2HA 4JHZA 1V08A 1S46A 3CUFA 3T0AA 3WBAA 3NSNA 4LYRA 2WKGA 4CU7A 1CXFA 3VMNA 1UZ1A 2DH3A 2ZXBA 3QHMA 3WDHA 4UZUA 3CGTA 3K46A 3WDPP 3U7BA 3EDDA 1WDSA 1OT2A 5A3HA 2WC3A 2Y4SA 2V3GA 3W0KA 3HN3A 5CSUA 2D22A 1QW9A 1UR1A 5A6MA 2WMIB 3OLDA 3AHZA 3W38A 1GCYA 3T09A 3L4YA 4CU6A 1ZBVA 3K8MA 3DYOA 1H4PA 5E6YA 2G3JA 2EPOA 3AMCA 1W1TA 1V3KA 5I79A 2JFEX 2VR4A 2YL9A 1UG6A 2XGBA 5BYWA 1W9XA 3N11A 1L0PA 3EDFA 3THDA 1GONA 2E9LA 2PBOA 3GH7A 1JI1A 4JFWA 2TAAA 1W9DM 1V02A 3CUHA 3AHYA 1OBAA 5FL0A 3WDIA 3TOPA 4BS0A 3UR8A 4D6FA 1OWQA 1E6QM 3UESA 3B9AA 1HVQA 4GO9A 1BYCA 2CBUA 3CTTA 2J4GA 4TVUA 1V02E 3WUEA 4W85A 1PX8A 2YA0A 1J12A 3WQWA 2DSUA 8CGTA 1SYTA 1I1XA 3W29A 3WF3A 4XV0A 4B16A 1V6XA 2ZXDA 5HXMA 4MB3A 1C3FA 5E9AA 3PTMA 1HN1A 2XIBA 1HJUA 5A6KA 5HBFA 3OGSA 2PF0A 4H8VA 1JAKA 1JZ2A 1LQ0A 3AQUA 3ARVA 1OD0A 1W9BM 1JNEA 3G6LA 1P6WA 3SCWA 4DM1A 1OT1A 3RO8A 4NZCA 1UR8A 3SCRA 2J62A 2WSKA 1IT0A 1NM9A 1KWGA 3ARQA 1R8LA 4MAVA 3MO4A 1NH6A 3WMCA 3W28A 3BLKA 3PBGA 4DUVA 3L2MA 4EANA 3CHFA 3WD1A 1H3GA 1D7FA 5BXTA 3AICA 3AS3A 3CZLA 2BVDA 2XSAA 3II1A 4P8UA 1J11A 4B9ZA 9CGTA 1TR1A 3FHQA 4P7NA 2O9OA 4EE9A 2WHJA 4BQ5A 4MJ4A 1H09A 3AISA 1QI3A 5FKYA 3WFZA 1W1VA 3GYCA 4RL3A 4B3LA 1E5NA 2J7FA 3ZQ9A 3ALGA 4AISA 1G94A 2WCGA 4D6EA 4C7FA 4Z2LA 5CGTA 3QGVA 1V6WA 2NW0A 1TCMA 1UKQA 3J7HA 2GJRA 3WUBA 2QMJA 1M01A 3FXYA 1QVBA 3FN9A 1E1EA 3WMBA 4BA0A 2WMJA 4AMCA 4OJYA 2YA2A 2XVGA 2X2YA 1JYWA 1XSIA 3EYPA 3WKZA 3TTYA 4JKLA 1Q6GA 3T2QA 2A3EA 4R27A 1E5JA 4V2XA 3WY1A 3GXMA 3B9EA 1CGWA 2PC8A 2JF6A 1CXKA 2AAAA 1HJQA 1J0JA 1TUXA 1CNVA 1EIBA 1JXJA 1GOWA 1E73M 3AS2A 2DDXA 3RM9A 1XGZA 4FLQA 5CXPA 3N1AA 4U31A 1E3XA 1CXIA 1W9PA 2WVVB 4ZENA 4M80A 3UR7A 5ABHA 3VKKA 4GQQA 5M03A 3L2LA 3IJ9A 1FOBA 2VJXA 1GOIA 1BHGA 4PMZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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