4W5UA

Crystal structure of chitinase 40 from thermophilic bacteria streptomyces thermoviolaceus.
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
GTVKLGYFTEWGTYDRNFNVKNLDTSGTAAKITHINYAFGNVTGGKCAIGDSYADYDKAFTADQSVSGQADTWDQPLRGNFNQLRQLKAKYPHIKVLWSFGGWTWSGGFADAAKDPQGFAQSCYNLVHDPRWDGVFDGIDIDWEYPNACGLTCDSSGPDAFRNLMAALRSTFGDELVTAAVTADGTPGGKIEATDYAGAAQYVDWYNVMTYDFFGAWDAQGPTAPHSPLTSYDGIPKQGFTSADAIAAFKAQGVPADKLLLGIGFYGRGWTGVTQDAPGGTATGPAAGTWEQGIEDYKVLKNTCPVTGTVAGTAYAHCGSNLWSYDTPDTIASKMAWANDQGLRGAFAWDFSGDTADGELIAALSNGLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase
publication title Crystal structure of chitinase 40 from thermothermophilic bacteria Streptomyces violaceus.
rcsb
source organism Streptomyces thermoviolaceus
total genus 130
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4w5uA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w5uA01
4EK7A 3BCFA 1C8YA 4MB3A 3WF4A 1G94A 4PRWA 3MV11 3WD4A 2J78A 1R7OA 3VU2A 1W9DM 1FH9A 1GJUA 2VO5A 2DSZA 3TTYA 5A69A 4CGTA 5I6SA 2A3AA 3GXIA 4QCFA 5EB8A 4MNMA 3WNNA 4URIA 5BXSA 4ATLA 2YL8A 2YKKA 5A94A 1Q6FA 5BXRA 3BMWA 4MNJA 4QFUA 1E0VA 4HMDA 4UQAA 5A6LA 5JBFA 1W2PA 3VIGA 1B0IA 1FP9A 2V3DA 3B9DA 1CGYA 3AMKA 1HN1A 4DM2A 1RP8A 4M8UA 1FP8A 1JZ4A 4WJXA 4C7DA 5I79A 4JFUA 1VJSA 1B3ZA 1JZ3A 1HNYA 1J0IA 1ZB5A 2J7CA 3A3HA 3ZJKA 4S3KA 1JNEA 3D3AA 1J9YA 1GOWA 3AIBA 1WDQA 2ZX9A 2VI0A 3AI0A 3CUJA 3PZTA 5I24A 3BAWA 1J0ZA 3SCSA 3SEPA 2CBVA 1V3IA 2WHLA 1PZ3A 4HZ7A 4ZFMA 3POCA 1U30A 4PSPA 1V0KA 3EYPA 1HJQA 1CLVA 4C7FA 3RM4A 1CGXA 3MMDA 2EQDA 3GBDA 3ZR6A 5D9OA 1XSIA 4CD8A 3PZUA 4XZWA 1K9EA 3MUY1 4K68A 2D2OA 3N15A 4TTGA 1WNOA 3VD7A 2HVMA 1UD5A 1C3FA 1H1NA 4HMCA 3W6LA 2VCCA 3VIHA 1OB0A 2OWXA 4U31A 2DT0A 3AS1A 5GQBA 2OWCA 2EEXA 5DMYA 1JI2A 2XIIA 5DT5A 3AIEA 1F4AA 1JFHA 2A3EA 1MQPA 2XPKA 1W3HA 2QMKA 1AVAA 3LPOA 3U5UA 3RJXA 4AD2A 2IXVA 1V08A 5HPCA 2W61A 1TMQA 1H09A 2D0GA 1UR4A 4TVUA 1GW1A 4QCEA 2BHUA 1H49A 1TA3A 1TCMA 4BQ5A 4R27A 4GI9A 4MTVA 1HP4A 1QHZA 1H3GA 1U33A 2WANA 2WYSA 5D9PA 3VM7A 1KGWA 2J7FA 3VGDA 1K6AA 3DYMA 1PIGA 5CLWA 3T2OA 2DSUA 2E0PA 2WVVA 3WMCA 2A3CA 1CDGA 1H5VA 1HF6A 1KXQA 3PZVA 5C70A 4CN4A 4NRRA 1EIBA 3PHAA 4AIUA 4RE3A 1ZJBA 3DECA 3AHTA 1E4IA 2D3LA 3VIJA 1PPIA 3OGRA 3SUSA 1XYFA 6TAAA 2XHYA 1HKIA 1QI4A 1KWKA 3HN3A 2WHJA 3II1A 3WNOA 1XH0A 4CU8A 1DWGM 2A3BA 4X0VA 2QPUA 2WC7A 3SCRA 5IFTA 3FAXA 1CGWA 1V3HA 4A3YA 1E4NA 3RPMA 1QNSA 2ZOXA 3AHXA 3QOMA 4LYPA 4OBRA 1I1WA 1AQHA 2BHZA 5IDIA 3M6DA 1DEDA 5A2BA 2VMFA 4CCCA 3T0AA 4DUVA 1CGVA 3BAIA 3VIPA 3PZQA 4ZE4A 2CXGA 1E6NA 2VC9A 2F61A 5A2CA 1FHDA 1JNDA 2UWFA 2WMIA 3GM8A 3WNMA 3AIWA 1R86A 2X09A 3U5YA 4HPHA 2D24A 3ARSA 3B8SA 2ZX7A 5JH8A 2W4XA 1VIWA 3N1AA 2XSAA 4W7WA 5DEZA 1H4PA 3WQWA 3RMEA 4D6GA 4GZIA 5D8WA 4D6CA 4Z2LA 4D6EA 3TA9A 4NRSA 1NOUA 2X1IA 2PWEA 4AZGA 1V6VA 1B9ZA 1MYRA 3BCDA 2JF6A 1BYAA 2CBJA 3TONA 3SCQA 1CXFA 1UR0A 1W9XA 1FH8A 1R7AA 2OWWA 3ARXA 1B3WA 2W66A 1XHGA 2BS9A 3AXHA 3VDBA 1WDRA 3MU7A 4QLLA 2PI6A 4Q7NA 1VFUA 5AYIA 1HVXA 5BRPA 1Q6GA 1HKMA 2ZICA 3VTRA 1KBBA 3POHA 2VCBA 3TP4A 1JAKA 5HBFA 4AIOA 2ZXAA 2OSYA 2E8YA 2YBUA 1BYCA 1NOFA 4CN6A 3VOCA 1WZKA 4KMQA 2VZUA 1VF8A 3DHUA 3W53A 4PMZA 3NUKA 4UZSA 2BY3A 3EDEA 3WH8A 1UKQA 3IJ9A 3MSDA 1US2A 4CN1A 2WWDA 3WH7A 3BSHA 3WD2A 1OCQA 2J7BA 4PMOA 2DEPA 3I3EA 3GYCA 3ZQ9A 3WKZA 3K8MA 3GH7A 5EFDA 1CEOA 1HIZA 2J74A 4WKFA 4UFHA 3T2QA 2E3ZA 4P7LA 2J7HA 3LPPA 2DSKA 1LL6A 1PX3A 4PN2A 4WKHA 3B9AA 3FXYA 3E1F1 2XFYA 3AQUA 3EBVA 1ZBKA 1XSJA 4CD7A 3VD4A 3VIKA 1J0JA 2QV4A 4JHOA 4FK9A 1RH9A 3M07A 2YOCA 3N17A 3BC9A 4AYSA 1DWIM 2PC8A 1MQQA 1C91A 4D71A 3ARRA 4AD0A 3W38A 1EDQA 1UKOA 1UR2A 3GH5A 4TVCA 1L0PA 3WD1A 3VNYA 4LYRA 3NSXA 3PN8A 2ZX5A 4AEEA 2YDSA 3CH9A 1UQZA 1JI1A 2C8NA 4J27A 1MW3A 3MUAA 3UERA 3OA5A 3SCPA 5A95A 2W5FA 4NF7A 1KFWA 2YL9A 3ALGA 3F5LA 5ABEA 1BHGA 3ZSSA 1HKJA 2WW5A 2UY3A 3WH5A 1K9DA 1V6WA 1BG4A 1V0NA 4PTWA 3SUVA 1C90A 3UESA 1D3CA 1UKSA 3RM9A 1QW8A 1FHLA 4AZ7A 1UWRA 3WEZA 5HXMA 3F4VA 2YL5A 1HL8A 2NW0A 2J77A 1GQIA 3FW6A 3KL3A 3WMSA 1HJXA 1KGXA 4U5KA 3CZGA 3SCOA 1UG6A 1UD8A 1G01A 1GOMA 1XD1A 3MKKA 5FKYA 1H11A 4P7NA 1MVYA 2BXZA 1JYXA 3ARZA 3WH6A 4P8VA 4J3WA 4D6FA 1W3KA 2Y4SA 4KRUA 4PMQA 2WCGA 1IZKA 1KXVA 3L4UA 1J12A 1WO2A 4H41A 4HZ6A 1XRVA 1EQPA 4P7OA 1NQ6A 3SCVA 4FLQA 3VMOA 2YJQA 5HNNA 5E70A 4QDMA 2XIBA 1CGUA 4AISA 3L4ZA 4KWUA 4UOQA 5HPOA 2E4TA 3MO4A 1XGZA 3BLKA 3ZO9A 1EDGA 1SMDA 4KH2A 3EMCA 3T0DA 2NSXA 3GH4A 1HJWA 2ZX8A 1CXHA 1G0CA 5M3WA 3WL1A 3VIOA 2ZUUA 2BY1A 5A8QA 1CENA 5BWFA 1QI5A 2GK1B 4GXPA 2DT3A 2BHYA 7TAAA 3UETA 3W37A 2WMJA 3IANA 4X9YA 2IXUA 5E09A 2BVTA 1WZMA 4UQ9A 3VMPA 1R85A 3KL0A 2CESA 4MJ4A 4E2OA 4P7RA 4M82A 4M81A 4B15A 4OZOA 2OLHA 1OINA 1GOQA 4PMVA 2YA2A 1MFVA 2G4FA 4PMYA 2VX5A 5JBDA 4FLSA 3WF2A 1HJVA 1UD6A 2VX7A 4GO9A 4WKAA 2WM0A 1DHKA 4U3CA 1QPKA 1GHRA 2E9MA 3FN9A 4LX4A 2GJXB 2YDRA 4V27A 3N04A 4E4PA 5BCAA 3ZJ7A 2FGZA 1O6IA 3MS8A 1C7TA 4F66A 2CITA 3WFLA 1G5AA 3ARYA 3OZOA 1JG9A 3WD0A 1LL7A 3ARPA 3J7HA 5I0DA 1B3YA 3UG4A 4LYQA 5GPRA 4HA3A 3ZT7A 2PWFA 1OT2A 3WQ5A 3L4WA 1QHOA 3UCQA 4YN5A 3L4TA 3ZMRA 4AMCA 1MW2A 1UWIA 2J7EA 1W9VA 3WUEA 3A6OA 4UQDA 5A1AA 2PWGA 1QNPA 1SR0A 1M03A 2EPMX 3T09A 3HMCA 4HMEA 1FOBA 3AROA 4NI3A 5FL0A 3RM8A 1PBGA 4D1IA 4DWSD 3ZM8A 1VFOA 2D20A 2VURA 2EPLX 1KCKA 2DH3A 4J3SA 2J25A 1NWTA 4JKKA 2JEPA 4GZEA 4AIEA 3BGAA 4MNLA 2G3MA 3CMGA 2OYLA 6A3HA 4OIFA 2G3IA 3GBEA 2WAGA 3ZJ6A 1V02E 3ZJ8A 4PYSA 1UR9A 1LQ0A 1TFVA 2GVYA 1JD7A 2XVKA 2EPOA 1WE5A 3OGSA 4JL1A 2F2HA 2Z1SA 2D22A 2VX4A 2VTFA 2XGIA 1KB3A 3BLPX 5KEZA 3CUHA 1JF5A 3EDDA 1GUVA 2EPKX 4MPKA 1OM0A 4CCEA 4AW7A 1B2YA 4EAMA 4AZCB 4OOZA 2XVNA 1Y7VA 1XH1A 2EPNA 3VGBA 2CHOA 3G6LA 3WDJA 2QLYA 3EMQA 4U2YA 2O9RA 4MAZA 5DFAA 3BAKA 1LLOA 3F5KA 3U7VA 2DT1A 1CNVA 1ECEA 3AFBA 5D9MA 2QPSA 1BTCA 1UZ1A 1ISZA 5F7UA 5I77A 1DWJM 3NIYA 2XJ7A 2FDMA 3UR8A 1NOWA 4HA4A 4IUGA 1UD2A 3UG3A 4WLCA 1UKPA 1W1YA 2V3GA 5A8PA 1OT1A 1CXEA 4Q22A 3CUFA 4JKMA 2WBGA 4KGJA 1WZLA 4DUWA 2WMFA 4MB4A 3IJ7A 3N9KA 3ARUA 3GXDA 1EHAA 4F79A 1WAWA 4MNKA 2AAAA 4QP0A 4WSJA 3GXMA 5GNYA 4EKJA 4UFLA 3CGTA 5A6AA 4UR9A 4UFMA 1BFNA 1ZS2A 3NSNA 2PBOA 1C8QA 5CZKA 3WQ8A 3GDBA 4AC1X 1CXIA 3FHAA 1I75A 5I3DA 4BZYA 4UQEA 5ABFA 3OIHA 5A8MA 3AZRA 2FHBA 2ESCA 1NH6A 1QHPA 2CKSA 1V3JA 2RGLA 1V6YA 3AZSA 3HU7A 1MXDA 3L4VA 1VJZA 1HXJA 4CKQA 5A6BD 4PSRA 4BQ3A 2ZUSA 1ZBVA 4ACYA 1PAMA 1Q6EA 2DSVA 5D9NA 4XUYA 3WSUA 1ISWA 4EANA 4D6JA 4CD5A 1W9BM 2XFRA 3AICA 3WBAA 2VRJA 1GVIA 2NT0A 2FGLA 1ISYA 5E6ZA 4FF5A 1I1XA 5AY7A 3VKKA 2BV9A 3WQ6A 3SUTA 1BGGA 1DWAM 3WDIA 1W1PA 2DPEA 2QMJA 3W26A 2FHFA 4HOXA 4D72A 1GCYA 1GPFA 2BNJA 2UY4A 2XM2A 4NZCA 3AS0A 3WDRA 1US3A 3KZSA 4AD4A 4W88A 1V3KA 3AYSA 3L2MA 1V0MA 2WHKA 4ACZA 4S3JA 2RGMA 3MUIA 4MB1A 3T2PA 5C8BB 2WBKA 4JL2A 1UOKA 1M53A 1EH9A 1UWSA 3N11A 3AYRA 4Z2JA 4PMDA 2ZWYA 2X0HA 3GTNA 3VDHA 4GPNA 3TOPA 3WY1A 1E5JA 2HISA 3WUBA 3OLIA 1KQZA 2WLZA 1KQYA 3K8LA 4AD5A 1VEMA 2JF7A 4JFSA 1XC6A 4QLKA 3OLEA 4CU7A 1M7XA 2WVSA 3CZKA 3F5JA 4ATDA 1UHVA 3VVGA 1Q6CA 2X2YA 1MW0A 1X6NA 1OIFA 1PJ9A 3ARTA 2D0HA 4PTXA 3AXXA 1TA3B 4YPJA 2VL4A 4RE4A 5ECUA 2ZUMA 1E3XA 3AJ7A 3CHDA 3A4XA 5CGTA 4XX6A 3VIIA 3VD9A 4A4AA 1NARA 4HPGA 2Q8XA 3AMDA 5I23A 1AQMA 4QAWA 4DWSA 1J0HA 2WVVB 1M01A 2CETA 3I3DA 2VX6A 2YDQA 2GJPA 2WMHA 1TR1A 4D6IA 1O7AA 2B31A 2VRQA 1ZU8A 1QNRA 5FD0A 1QI3A 2PB1A 4M80A 3ZOAA 1ZBCA 3MMUA 2UY5A 1UWQA 3VM5A 2W63A 5EBAA 2E9LA 4RL3A 2WCSA 3WN6A 3IAQA 3N12A 1CYGA 4M24A 3VD5A 1QNQA 2EXOA 3WBEA 4EE9A 2TAAA 1MWOA 4GINA 3ECQA 1XSKA 2WZIA 2ZX6A 2W62A 2VZOA 1E6QM 1J0KA 2QF8A 1OWQA 4CU6A 3CUGA 2JALA 4GI6A 1LF1A 5HDRA 4CVWA 5FL1A 2V5CA 1Q6DA 2OYMA 2Z1KA 2YL6A 1QBBA 2BXYA 1QOXA 1GZJA 2WMIB 1W1TA 4DWSC 1EO7A 1FH7A 2QHAA 1EXPA 2JEQA 1K9TA 3MMWA 5CPQA 3AIQA 1W9PA 1M04A 5IFPA 2WHMA 2WWCA 1E72M 1C92A 3O2LA 1JD9A 2D23A 4H04A 1NWSA 2YBTA 3W28A 1J10A 3CTTA 3CBWA 4FMVA 2ZXBA 4W5UA 1XCXA 1PEZA 2F8QA 4NSBA 2Y2WA 3W25A 4AZBA 4MB5A 1VBRA 3RDKA 3IJ8A 4GQQA 1K9FA 5JUVA 1VAHA 3WL0A 2CHNA 4ZXOA 1EOMA 4OOUA 3TTSA 1IZJA 1C93A 1UA3A 4PBGA 1TVPA 3BSGA 1GNXA 1ISVA 2XVLA 2GSJA 1VEPA 5TD4A 5LA2A 1Z32X 4U33A 3CHFA 4PCSA 2DIJA 3K4DA 2J75A 2OSWA 3VIFA 2JIEA 3WDPP 3SUUA 1GORA 3NJ3A 5M17A 2EO7A 4PCTA 5D4YA 3VILA 1OBAA 1IT0A 5A6BA 5JIPA 3APGA 3W0KA 1DWHM 4MDOA 2WK2A 1UZ4A 4TTUA 1XH2A 4M1RA 5LA1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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