4WKAA

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain at 0.95 a resolution
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitotriosidase-1
publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 132
structure length 369
sequence length 369
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wkaA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wkaA01
3FN9A 5BXTA 1D2KA 1WZLA 4P7QA 4HU8A 3WQ8A 3M6DA 4EAMA 1HF6A 1V0KA 4U33A 4UZSA 1CGTA 1K9TA 1FHLA 1JF5A 2VZTA 3B9AA 2GDUA 1LF1A 3WH6A 4HMEA 2DEPA 1HJUA 2D22A 1W9PA 4W87A 2J7CA 1A47A 1UH2A 2HISA 2UY5A 3WEOA 1UOKA 3B9DA 2WB5A 5ABEA 4PTVA 1ZJBA 1V03A 1W91A 1JNDA 1ITCA 1JF6A 1E4NA 4V2XA 1E55A 4U2ZA 2UY4A 5M5DA 1KXHA 3ARWA 3ZJ6A 2V5CA 3O9NA 2Y24A 3UG5A 5AC5A 5EFDA 2NT1A 4M56A 1WP6A 2CKRA 2CPUA 2WVSA 3CHDA 3CPUA 3WNKA 1UWSA 4JKKA 2XGBA 1OCQA 3O2LA 2CXGA 2VVSA 1IT0A 3WL1A 1CXFA 2XTKA 4B9YA 2XFYA 4X9YA 1H3GA 2ZX9A 4J27A 1QI3A 3BSGA 1KWGA 3ZIZA 1V3MA 4PRWA 1IZKA 4AZ6A 4UCFA 1XSKA 3AIRA 1C7TA 3DYOA 4OBSA 3BAWA 1CIUA 4UQDA 4B3KA 4WKAA 1C93A 2ZUUA 1KFWA 1UD2A 3ARSA 4D71A 2WHKA 1OINA 1JD7A 5F7UA 1B31A 4LXFA 4QLJA 2V3EA 3K8LA 4AZHA 2WMGA 4AZIA 4PCSA 2DSUA 3AHVA 1V6YA 2VZVA 4BF7A 1LG2A 2X09A 2WLYA 1KGUA 2XM2A 4JCLA 4MJ2A 2VOTA 4HZ6A 3W6LA 5KZ6A 3W26A 5IXEA 3AROA 2ZUSA 5ABGA 4J28A 3BCFA 4BQ5A 2JALA 1EDGA 3PZIA 1QI0A 3AXHA 4ACZA 2G41A 2FDMA 1V3KA 1CBGA 1CXIA 1VRXA 2QV4A 1MQRA 3J7HA 4U5KA 4AY1A 5A6KA 3VIJA 2JE8A 3T2PA 4DM2A 1SR0A 1B2YA 3WQWA 4AZCB 2WXDM 4KGLA 3SCVA 4LYQA 3AMDA 2XUCA 4OBRA 4E8CA 5FOOA 4MTVA 3WNNA 1Q6DA 2CETA 3RO8A 1FOBA 4AD4A 4CD8A 1W2VA 1UR0A 1UD3A 1UKSA 2BY1A 2CCRA 1U30A 1TCMA 3VO0A 1NWTA 1YHTA 4M24A 2WBKA 4HU0A 1CTNA 4N0RA 1CXKA 4TXEA 1WDSA 4EKJA 1G1YA 3TOPA 1UZ1A 3OLIA 3EBVA 3T08A 4LX4A 4W93A 3VD7A 2BY2A 3BC9A 4HMDA 1J10A 2OSYA 3WQ4A 3TTYA 3ALGA 1P6WA 3BAXA 1F4AA 3N12A 5HPOA 1WDRA 1QBAA 4UOJA 5BXPA 3SUSA 3WNPA 1GNXA 1V6UA 2WKLA 1Q6CA 1HJXA 3VGFA 1TVPA 4U3CA 3VIFA 4HZ7A 4D6FA 3L4TA 4KH2A 2ZXAA 1PZ3A 4DM1A 4QDMA 3LPFA 2UY3A 3L2MA 4W89A 3TTOA 3W28A 1AMYA 1GQIA 2PB1A 3NSMA 4MB4A 3BSHA 3AIEA 4K68A 5E6YA 3QGVA 2WCSA 2DH2A 1W1YA 3GBDA 5D8WA 4KMQA 5LA2A 4AD1A 2YDQA 4U5IA 3WDPP 4GQRA 5IFPA 1SFSA 1QW8A 4AC1X 1KBBA 5BRQA 4JZ5A 3NSXA 3WQ6A 1XD0A 3AZSA 4B15A 3LPOA 1VJZA 1EO7A 1H41A 2PWHA 3AI0A 5I0DA 3N15A 1H5VA 3WFZA 1VBUA 5ECUA 4UZUA 3AOFA 3ZOAA 4XZBA 1G5AA 3CBWA 5IHRA 2FH6A 2ZX6A 1BHGA 2X2YA 2WZIA 3GM8A 3N13A 2VJXA 1I75A 2XVPA 2OWXA 3TONA 4CD6A 4LYPA 5EBAA 1V02E 4JKMA 4AD3A 3AMCA 3PZNA 1R85A 4HPGA 1HJWA 2YDSA 5BXSA 4GPNA 2O9PA 2WVUA 1EA9C 2YA0A 3IJ7A 4Q7NA 4PBGA 2F61A 3IJ8A 1OSEA 3BAJA 2WCAA 3APGA 4TX8A 1GOMA 3BCDA 1H11A 2AOSA 4M8UA 4KRUA 4TUFA 1NWUA 1JI2A 2GK1B 1QHZA 3VNZA 3CHCA 3BAIA 3CUGA 5DF0A 3UEQA 1AQHA 4MNMA 3RM9A 4OIFA 3VU2A 1R7OA 2FH8A 2JIWA 4AEEA 1Q4NX 2C8NA 5M03A 3UR7A 1WPCA 4JHZA 4HP5A 5CSYA 1F4HA 3CHFA 5BXRA 1LL6A 2XIIA 3GZAA 2XJ7A 1ZBCA 3PZGA 4B16A 1E15A 4GO8A 2B31A 2VURA 3CO4A 3PZTA 4LPCA 3AYSA 1CGXA 3A4AA 3VDAA 1E6RA 3OGSA 1NARA 3WH8A 2WK2A 3ARQA 5D9NA 2YJQA 2G4FA 1EHAA 4C7FA 1G0CA 3PZOA 1BG4A 6TAAA 3MSDA 2FGLA 1FP9A 2BHUA 1J11A 3VIPA 3GXIA 3MANA 2EPMX 2V3GA 1PX3A 4J3TA 3T0DA 4L4PA 4PMDA 1OGGA 2X1IA 5ABFA 3O6AA 2D20A 3OLGA 2OYKA 2WHJA 2QMJA 3HN3A 2VZUA 5M3WA 4RE2A 1JDDA 4UOQA 5A2CA 3WUEA 1PPIA 3VUPA 5C70A 5JBDA 1WE5A 4PUDA 2D0HA 3GH4A 2CYGA 4UQEA 1JFHA 3WUBA 2ZXDA 3W4RA 2D3NA 5CPSA 4AWEA 1B3ZA 1VFOA 2J8FA 2ZUWA 5I23A 1UWQA 3NJ3A 3SCSA 1X6LA 4ATLA 1CECA 1MW3A 1GOQA 2VQUA 3F5JA 3QHMA 3PZUA 4MAZA 2O9TA 5JBEA 4QCEA 3W53A 1J01A 3VGEA 1CWYA 1H2JA 4CGTA 1TVNA 1VF8A 2GJXA 4D6GA 3HJEA 1WZMA 2GFTA 3PZMA 7TAAA 1TUXA 4ZENA 1UWIA 4UQAA 1XYFA 1GQKA 2VRJA 1XCWA 4P7RA 4H41A 2VUYA 3ZR6A 5IHSA 1A3HA 1M7XA 5D4YA 4F9DA 1AVAA 1ZB5A 1MFUA 4E2OA 2OYLA 1J18A 1LG1A 2IXUA 1US3A 2D24A 4S3KA 2WC7A 3LPGA 3FXYA 5JIPA 4UQ9A 1JYNA 3WNMA 2WZHA 2CEQA 4TOQA 3AMKA 4DWSD 5A6BD 3UR8A 1W9VA 1HNYA 4MPKA 2BFGA 2J7GA 3BMVA 3PBGA 4W7VA 3MMDA 4D6EA 3RCNA 3ZSTA 3HMCA 5AYBA 1E3XA 3WL0A 1HIZA 1O6IA 3CIVA 3M46A 3EDDA 1K9FA 2OYMA 1CGVA 1UKOA 3GYCA 1XCXA 1KR1A 6A3HA 2J78A 3GXFA 5KEZA 1MXGA 3WH5A 1QBBA 1FP8A 2YOCA 1JAEA 4H8VA 1HP4A 1CPUA 3SCPA 4KWUA 1CGUA 4UR9A 2DH3A 3WF2A 1GOWA 2VI0A 5A1AA 1J12A 2ZWYA 3CUHA 4WF7A 1WZKA 1JZ5A 1GOKA 1TR1A 2BY0A 4WKFA 1LJYA 5E9AA 1ZS2A 4UFIA 2A3BA 3KL3A 2WHLA 4DWSA 3CMGA 3WQVA 5A6BA 4TX6A 3KEHA 1I1XA 2HVMA 4P7OA 1QNPA 1HVQA 5DT7A 3KWXA 5HOSA 2XPKA 4PTMA 2XVLA 1DWHM 1B3WA 3WDQA 4FLQA 2CNCA 3OZPA 2DSWA 3SCUA 1E1EA 1CGWA 2A3AA 2WLZA 3ARUA 3K4AA 1WB0A 1WNOA 1VBRA 5GNYA 3AXXA 1UR4A 3ARVA 4TVCA 4W8BA 4BQ2A 3T2QA 3HU7A 2FGZA 2DSKA 3ZR5A 1U2YA 5E6ZA 4D6CA 4DUWA 1NH6A 5HPCA 4B3LA 2UY2A 4W7WA 3CZLA 3AIUA 3LMYA 1EDQA 3AIVA 1GOOA 1E6SM 2JF6A 3ZJ8A 4BQ3A 4HTYA 2YA2A 4Z2JA 1X1NA 1ISYA 4D1IA 1ISWA 2D23A 2GJRA 2DSVA 3EMZA 8CGTA 4HA1A 2WMFA 3VDBA 4BA0A 4AIUA 1VAHA 2RGLA 2CITA 1UD6A 4V28A 2ZICA 3BLPX 3GXMA 4HPHA 1GORA 2OSWA 3CUJA 2JIEA 1UWTA 1ISZA 2VVNA 1QI2A 4BCEA 3CLWA 2J47A 3IK2A 2E9MA 3A47A 4LQ1A 4IPNB 5BWFA 3IAQA 2OWCA 1TA3A 1W9BM 2A3HA 1E40A 3SUWA 2V3DA 3DYMA 2Z1KA 4C7DA 1JDCA 2XHYA 1XSIA 3PTKA 4W7UA 5A8OA 3RM4A 1Q6EA 4GI9A 1OM0A 1HKIA 3VDCA 2CERA 1NWSA 1Q6FA 3PTMA 1VJSA 3ARXA 1GJWA 2DT0A 1H09A 1K9EA 3WD2A 1UD4A 3NYDA 1KQZA 4UFHA 1KGXA 2J4GA 1JDAA 3QR3A 3E1F1 3VPLA 2J75A 2Y5EA 1PX8A 3WDIA 1EDTA 1BF2A 2WANA 2XM1A 5BCAA 1J0HA 4OKDA 3EMQA 2WVVB 2RGMA 5AC4A 2F2HA 4MDOA 3NDZA 5A6SA 5GNXA 2CBIA 4KRTA 3U7VA 4JFVA 3CGTA 3AFBA 1B1YA 1V3JA 5CJ5A 2NSXA 1FH9A 3AQUA 1J0IA 3W27A 4PMVA 3AHXA 2YBUA 1PJ9A 2Y8KA 2WMKA 2GDVA 5A8PA 2IUZA 4URIA 3FHAA 2VCAA 1AQ0A 2J77A 3FHQA 3KL0A 2BHZA 4PMZA 1EQPA 4NZCA 5A6LA 4KGJA 2W4XA 3T2OA 1BG9A 2W91A 2XGIA 4ZE5A 1V0MA 3W38A 4PYSA 1GHSA 1V3LA 1JYWA 1EIBA 4W86A 5A8MA 2DSZA 1UD5A 5E0FA 4W8LA 1J0KA 5EFFA 3AZRA 2ZX8A 1B9ZA 1C8YA 1VEOA 2A3CA 3NDYA 2E8ZA 1BFNA 3VD5A 3CMJA 2J8GA 5ABFB 2VR5A 1UQZA 4J3XA 5CXPA 2Y2WA 2G8ZA 1JXJA 3POCA 1QNSA 1V3HA 5E09A 5JIWA 4C7GA 1UKPA 4Z2GA 3ZT7A 1V6XA 3VILA 7A3HA 4Z2KA 2QPSA 3ZMRA 3ZT5A 3OZOA 2JEQA 1OD8A 1EQCA 4UFKA 2D0FA 2WMIB 4AZ5A 6CGTA 1K9DA 1TE1A 4J7RA 3WUGA 3VKKA 1E73M 1DWAM 4CN4A 1PIFA 2XG9A 4PMQA 2VT0A 2CIPA 4PMNA 1ZL1A 1VFFA 1M04A 1KGWA 5A3HA 5FL0A 1RD6A 1W3HA 4GO9A 4XV0A 4HOXA 1LL4A 2OLHA 2Q8XA 1HJQA 1BVZA 3SUTA 4CN6A 2CBVA 4WKHA 4GIAA 2EPLX 1JIBA 1NM9A 1JD9A 2AMGA 5CZKA 2EO7A 4RL3A 4R5EA 3AJ7A 3QHNA 4FMVA 3VOCA 1E43A 3ARTA 4MNKA 2W92A 2E0PA 1XH0A 1WDQA 1JL8A 5DO8A 4H04A 2VL4A 4V27A 1DTUA 1FA2A 3L2LA 3MUIA 2BNJA 1KB3A 4AISA 5FD0A 3WDHA 1GJUA 1ODUA 3ZJKA 4OJYA 4QLKA 3TTQA 3CZJA 1W3KA 2E9BA 1ODZA 4WSKA 2VX7A 3PZ9A 1VIWA 2YBTA 4D72A 4Y7EA 4U2YA 1OIFA 2J7HA 3DHPA 4HOWA 4PSRA 1CLXA 3VVGA 4M29A 3WBAA 2D1ZA 4F9JA 3CZGA 4UQBA 3WSUA 2WWDA 3L4VA 3T0AA 4P8WA 1XRVA 1PX4A 1HX0A 3GNPA 4P8UA 2IXVA 5JH8A 3M7SA 3UG3A 2EPOA 1CGYA 2E40A 5I6SA 1V6WA 2WHMA 2WYSA 3VGHA 3AIBA 1MWOA 3WDJA 4OUEA 3N04A 2WM0A 2BS9A 3II1A 1JZ2A 1MW0A 4H7VA 1GUVA 1QOXA 3D5HA 3GDBA 3F4VA 1CEOA 1VEPA 3VD9A 1H0IA 5BYWA 3VMPA 3T09A 2ZOXA 1NOUA 4J3SA 5C8BB 1K6AA 2VCCA 2OWWA 1G94A 4OOZA 3BH4A 4JKLA 5EMYA 3UETA 1NQ6A 3RJXA 1E9LA 5CPTA 4ATDA 4F8XA 3OGRA 4PTXA 3W25A 4EK7A 1OT1A 1B30A 5BRPA 3WKZA 1XV8A 4M80A 1C8XA 2DDXA 2VTFA 4AZ7A 1BYDA 2YL6A 3GBEA 3PTQA 4PSPA 3U7BA 5A6JA 3EDFA 4CUCA 2FHFA 3TTSA 3QOMA 4CD4A 1OB0A 1PBGA 4F66A 3D3AA 1QI5A 1UZ4A 1WDPA 3ARYA 5I77A 3WNOA 4QP0A 1DHKA 1GVIA 1UA3A 2WMJA 2G3JA 4ACYA 2WC3A 3WH9A 1GCYA 4MADA 4DUXA 1JZ4A 2VZSA 1TG7A 1NP0A 3DHUA 2PWGA 4J3UA 3DC0A 3AHZA 4AEFA 1E5JA 3WUFA 3VIHA 4AXNA 3WELA 3K1DA 1QVBA 1OIMA 5DEZA 1QPKA 3SEPA 4CN1A 2J62A 1TFVA 1HL9A 3DECA 1DWIM 3NIYA 1GQJA 4PUEA 2YLLA 2CHNA 1WZAA 1XH1A 1XYZA 2WBGA 4BQ4A 3SCWA 1KCLA 4MDPA 4QAWA 3SCRA 7CGTA 3MV11 4WJXA 1GW1A 1VB9A 4PN2A 2G3NA 1D7FA 1LWHA 2D0GA 2NT0A 3KE0A 4AD0A 4MAVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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