4WKFA

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain in complex with chitobiose (2.5mm) at 1.10 a resolution
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Chitotriosidase-1
total genus 128
structure length 368
sequence length 368
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wkfA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wkfA01
1HT6A 1UUQA 1KXVA 2WB5A 2WYSA 1E5JA 4UFMA 4FLSA 3OLIA 4P7LA 3L4TA 1RP8A 4ZENA 2VL4A 4J3WA 4N0RA 1GVIA 2QPUA 3BMVA 1XH1A 1UD2A 3BAIA 1C90A 2XFFA 4AZGA 2VNCA 3KL5A 2WZHA 1MFVA 1OWQA 2UY5A 3CUHA 2ZX9A 3F5KA 3AHYA 4KGJA 1QHOA 3AXXA 5ABFB 1E4IA 2BHZA 3WQWA 2FDMA 1XHGA 1E72M 1OIFA 1PBGA 4Z2IA 2ZUVA 1PX3A 1LF1A 1M7XA 1QI0A 2A3BA 2FH6A 4ZE4A 1JNDA 4FF5A 4HTYA 3SIMA 3VMNA 3SUWA 5GPRA 4PTVA 1W9BM 3VPLA 3BC9A 1CZ1A 3PTQA 2ZX5A 1CGXA 3ZQ9A 2DSZA 4W7VA 1HP4A 3MUY1 1KGWA 3OA5A 3B9EA 4D6EA 2WSPA 3SCPA 3SUVA 2JEPA 3TTQA 3WNMA 5BXSA 3ARTA 4CVWA 2D0GA 2PC8A 1QPKA 2BXZA 3IAPA 2ZICA 3AFBA 4C7DA 2OYKA 3IAQA 3VUPA 4QLJA 2YKKA 3MSGA 1TFVA 1A3HA 3M6DA 3WEOA 1D7FA 1UR9A 1XCWA 3PZIA 1CBGA 1NM9A 3WNOA 1W9XA 1W2VA 5FL1A 3ARZA 2AMGA 3VIPA 3VO0A 3WD2A 4PTXA 3NSXA 1FFQA 3BMWA 3TOPA 2XFYA 3VIGA 1E5NA 3SCWA 1X1NA 1VEMA 3IJ9A 4EKJA 1HKMA 4AZ6A 3PZMA 1XCXA 1DWHM 2E9BA 1C8QA 4TUFA 4U5IA 3T08A 1G1YA 2V3DA 4JL2A 2NSXA 4H8UA 5C71A 1M53A 1WP6A 2WMHA 2XSAA 1FHLA 1JNEA 4YPJA 5M03A 3WIJA 4P8VA 3CMGA 3WF4A 5BYWA 1HJVA 1JI1A 5GQBA 4UFJA 1ITCA 4PUEA 3SUTA 1UWTA 1E6RA 3QR3A 2UY2A 4YN5A 2XSBA 2Y5EA 1PAMA 2YDQA 1JAKA 1DEDA 1B3WA 3A6OA 2VT0A 2Z1SA 1UG6A 2D0FA 4J3UA 4Z2JA 5I23A 1M01A 1Q6DA 3GZAA 3RJXA 4AWEA 1BLIA 1TMQA 4JCMA 3VIIA 4OBSA 1QHPA 2OYMA 1G94A 4HPGA 1KB3A 3VGEA 2ZUUA 1HX0A 3NDZA 4UNIA 3AIQA 1E0XA 3WUFA 3WQ8A 4KRTA 1OGBA 3MU7A 3BGAA 1XC6A 5E6ZA 2B31A 1D3CA 1DP0A 1H2JA 1LLOA 3ZJ7A 2ZUTA 2E8YA 4HA3A 1J0JA 2Y8VA 1JI2A 1K9FA 3SUSA 4X0NA 1GPFA 4RE3A 4H04A 4A3YA 4MB5A 1GOMA 1BYCA 4MPKA 4UFLA 1B0IA 4PMXA 4UOQA 3CZGA 2O9RA 2XTKA 1UR8A 2W5FA 2W91A 4P8WA 1KCLA 3VDCA 2EPOA 5HOSA 1G01A 2ZIDA 2DT3A 3WL0A 1M03A 1YQ2A 1US2A 2W63A 1OGSA 2J78A 4PBGA 3I3DA 3U7VA 1B30A 3VILA 2WWDA 2QV4A 5AC4A 3VDBA 3SEPA 1WZMA 1JYVA 5I24A 2JF6A 4KMQA 1V3HA 3CUJA 4OUEA 5D9MA 3EDEA 2WMJA 1E6QM 4D1IA 3PZ9A 1V0MA 2VZUA 4GO8A 5D4YA 1JG9A 1QHZA 1RP9A 1EO5A 3LPFA 2NW0A 3FAXA 1D2KA 4HOXA 5A8MA 2GJXB 3OZOA 4DWSD 2VX5A 4Q22A 5A8QA 4JZ5A 4B15A 1Q6EA 1UQYA 2OSWA 1JYNA 7CGTA 1DWJM 3VM5A 1H0GA 3VMPA 1K9EA 1Q6FA 1PX8A 3LMYA 3THDA 1FH8A 5FKYA 3EDFA 3TTYA 1GVYA 4AIEA 2Y2WA 2VURA 3AIBA 3PBGA 2J4GA 3L4VA 1XSJA 1WDRA 1U2YA 2J75A 5A2AA 2WMFA 3FAWA 3J7HA 2VCCA 2J79A 2WBGA 3S2CA 4R27A 3GM8A 4A3HA 1VBRA 1UH4A 1JAEA 3CH9A 3OGRA 1WNOA 1O7AA 4GIAA 4W8BA 1HF6A 4BQ5A 3WBAA 2EO7A 4WLCA 3RIKA 5D9PA 3QHNA 3ZT7A 1HL9A 3AHXA 1GQJA 4HPHA 3NJ3A 4CD6A 4M29A 4MAVA 1IZJA 4A4AA 5JH8A 1CWYA 4JKMA 5E0CA 3VVGA 2CERA 3BSGA 3CTTA 2PI6A 1PEZA 3OG2A 5CGTA 2C8NA 3MUZ1 3CUIA 3BAWA 3BLPX 1OINA 4NRRA 1J0KA 3EMCA 3N15A 3QHMA 1W2PA 4OKDA 4X9YA 1UOKA 1EQPA 3BAJA 4IUGA 2J7HA 4JFWA 3GNOA 1JGIA 3AXIA 3W29A 3AMCA 5EB8A 5EBAA 3HMCA 3W81A 5E6YA 2D3LA 3AYSA 2WZEA 1B31A 3VTRA 2DT2A 5ABHA 1JFXA 2XPKA 3BXWA 2YLAA 1V3IA 2O9TA 3T2OA 1SR0A 1N82A 1CIUA 2ZOXA 2YA0A 3A47A 1V03A 2CKRA 4GPNA 4W87A 2DSKA 3MV01 1CXFA 4JFTA 1DWFM 4PSRA 3ECQA 4HOZA 1F4AA 4GQQA 4EK7A 1U30A 2Z1KA 4EANA 1UKOA 2ZX8A 3CMJA 1B3XA 4MADA 2EQDA 1V08A 3UG4A 2XWEA 1H09A 3N04A 3VIHA 3VX1A 4E8DA 3SCRA 4AEFA 1DWAM 1NOWA 3S6TA 1KCKA 2EXOA 2GUYA 4GQRA 2TAAA 4HP5A 5E9AA 1VBUA 4C7GA 1W1PA 2J47A 2Q8XA 3DHUA 4U31A 1FH9A 4DUVA 2VR5A 1GQKA 4ACZA 2A3HA 1HXJA 3WMSA 3WDRA 4F9JA 1BPLB 2V38A 5JUVA 1H11A 1ZBVA 5FOOA 2DH3A 3WL1A 2XG9A 2DT0A 4NZCA 1LL7A 4DWSA 2AAAA 3AMLA 4QLKA 2RGMA 4UQEA 4H8VA 2GK1A 3IJ8A 3VNZA 1RPKA 3QOKA 4PMNA 3A3HA 1M04A 3CZEA 1J11A 2YA1A 4CU6A 2CESA 4HOWA 3MV11 3WDQA 3WNPA 4TTUA 4PMRA 5BWFA 2OWCA 2WSKA 4H2CA 1G0CA 1HVQA 4WIWA 2CCRA 3BAYA 1AVAA 4ZE5A 1J18A 2WW5A 2XVLA 4W8LA 3ARWA 3W24A 2BY2A 1TVPA 4ZFMA 5A95A 6CGTA 3IJ7A 2C0HA 1V6WA 2A3CA 5EFFA 5I77A 3RDKA 3CHDA 1GHSA 5F7UA 4UR9A 4DWSB 4WKFA 2XUCA 1ZBCA 4MNMA 5I78A 2PB1A 5IHRA 3MUAA 1UWQA 4PMZA 3UERA 1NP2A 3VD4A 2Y8KA 2J62A 4PMOA 3SCOA 4GI8A 1EA9C 5ABEA 1XGZA 3WY1A 1H3GA 2BNJA 1Y7VA 3EYPA 4MNJA 4DWSC 3VGHA 2EJ1A 2EBNA 2WCSA 1TA3A 2WANA 2MANA 1B90A 1NOUA 4MB1A 2W62A 3UG5A 3VNYA 4D6DA 5A2CA 5BRPA 4ATLA 1SMDA 3W4RA 3WNNA 3PZGA 3VDHA 1BTCA 1MQRA 1R87A 1C3FA 4AC1X 3ZT6A 3FNDA 2Y24A 1WE5A 4UQBA 4QDMA 1C7SA 3WENA 1BQCA 3WF2A 1CYGA 3MS8A 3VGDA 2YIHA 1G5AA 2WMKA 2D1ZA 1VJSA 2J8FA 1NQ6A 1KFWA 1W9VA 1HJQA 4UOJA 2XVKA 1WKYA 1TR1A 3T0AA 3B9AA 2WNWA 3WDJA 5M3WA 1MXGA 3U5UA 3L2LA 1C93A 2UY4A 2ZX6A 3ZJ6A 5DFAA 5DMYA 2VZOA 2WPGA 4JFSA 1XYFA 1E3ZA 4S3KA 4WK9A 3VIOA 3N11A 1FFRA 2C7FA 1C8YA 2F2HA 2W66A 2J7BA 2YA2A 1UD5A 1OT1A 4OOUA 3MANA 5IDIA 4AY1A 3D3AA 2E0PA 1B3YA 4P7QA 3WUEA 2CETA 2ZXQA 1OCQA 3WH5A 1CGTA 4W89A 1UR2A 5KEZA 2HVMA 4AEEA 3MO4A 3HU7A 5DT7A 2VCBA 1E6ZA 3ZIZA 1Q6CA 3UEQA 5I5RA 4ML4A 1VIWA 4D1JA 1GW1A 1Z32X 1WDSA 1UZ1A 5DF0A 3KE0A 1VFUA 1WZKA 2CITA 4XZWA 1NWSA 2CEQA 2GSJA 3ZSTA 1BHGA 3OLEA 3FN9A 4U33A 1EOMA 1E1EA 1QNPA 1W9UA 3T2PA 2GFTA 1E1FA 5GNYA 1FHDA 3CUGA 1UR0A 1MW0A 1MW3A 1LWHA 5CG0A 2IXVA 3PTMA 5IFPA 3T0BA 3K8MA 2J25A 1EDQA 2DGAA 1R7OA 1VRXA 2WKGA 3VINA 4FMVA 1CPUA 1GOIA 3GBDA 2CXGA 4PUDA 5HBFA 1E4MM 1WCGA 3DYMA 1U33A 4QP0A 2X0YA 2D24A 1V6XA 3POCA 3L4ZA 1NWTA 3APGA 1JXKA 4PMQA 4DUWA 1ISYA 2YL8A 1QI5A 4J3XA 3IK2A 2XM2A 2O92A 3RM9A 1JFHA 4CD4A 3CO4A 3AIRA 1GOQA 1J12A 2ZWYA 2EPKX 1BYDA 3N18A 1VJZA 2J74A 1CGYA 1V02A 3F4VA 1UYQA 2BVTA 3W6LA 2VJXA 5FIPA 3AOFA 4P7NA 3GXFA 4JKKA 2EPLX 3UR8A 3WBEA 1JDDA 2WHJA 1FOBA 3CUFA 1BAGA 3VU2A 4AZBA 1CXKA 3AHVA 5A6MA 4PEEA 1GHRA 3DYOA 3K4DA 1UA7A 1EH9A 4JHZA 1W3HA 4CN6A 1NWUA 3DHPA 5EFDA 2VZSA 1WB0A 1UD6A 2DPEA 4NSBA 4UQCA 3DYPA 4GZEA 1ISWA 2WC7A 2CBJA 3SCSA 2YL9A 4CCDA 4AIUA 5E70A 1H49A 4BZYA 1KQZA 1GNXA 1NARA 3CHEA 1GQIA 4FLQA 3MMWA 1HVXA 1EDGA 1GONA 3N9KA 3WEMA 1J0YA 3FHQA 4HZ7A 1XH2A 3WN6A 3O6AA 4V2XA 4CCEA 4MAZA 3CPUA 4HMEA 1LG1A 4CUCA 3TONA 3OB8A 3O2LA 1B3VA 3LPGA 1E9LA 3VGFA 5HNNA 1ZJAA 3ZR5A 4D6JA 4D72A 1XSIA 2DT1A 4UCFA 4Z2LA 4UFIA 2FGLA 3KZSA 4P7OA 2E40A 1SFSA 3F5LA 1QBBA 4UFHA 3WD1A 5A2BA 4AD2A 1WDQA 4Z2GA 2X8RA 3ARRA 2F61A 1UKQA 3TTSA 3QOMA 3M46A 3WH7A 2YL6A 4W7UA 4BQ3A 1PIGA 2VQUA 1XSKA 1RH9A 3G6LA 1VAHA 5A1AA 4MB4A 2WVVA 4D6IA 4RE4A 2VUYA 2BS9A 2J7FA 2G3MA 4AD1A 1JYWA 1QNSA 5EMYA 5DEZA 4UZSA 4U2YA 1SYTA 2XGIA 3VIFA 1GZJA 3TP4A 2ZE0A 1EGZA 3AXHA 3ALGA 1XYZA 2GJRA 2E9MA 4M81A 3UG3A 3DECA 3I3EA 3KL0A 3WELA 2YL5A 3N12A 3ZM8A 1ISXA 1WPCA 5FD0A 4GKLA 1QW8A 1J0HA 1E56A 5A3HA 1CXEA 2ZUWA 3L4XA 4L4PA 5FL0A 3WQ5A 4D71A 2NT1A 5AY7A 1CENA 1KXTA 3ARYA 3EDKA 3O9NA 2X1IA 1BFNA 3AMKA 4MDOA 3AS2A 3ARXA 3UCQA 2E8ZA 1R8LA 1W32A 2CBVA 4P8XA 2OSYA 3ZO9A 3ZJKA 4XB3A 3SCTA 1Q4NX 1EHAA 4W5UA 4PMVA 2CBUA 4QAWA 2QHAA 4J3TA 3SURA 2XVNA 1NWRA 4WKHA 4PMDA 1FP8A 5CJ5A 5AYBA 4J7RA 3ARPA 2ZWZA 3AS0A 2G4FA 4ATDA 3CHFA 2JFEX 3K8KA 1QNOA 1ZL1A 4YHEA 1J10A 3CZLA 1VEOA 3MMDA 4AYSA 2DIJA 2BVDA 1UWIA 2G3JA 4CD7A 4UQ9A 2VRJA 2AOSA 1ZS2A 2YLLA 1TG7A 3GNPA 3EDDA 4BQ2A 1J9YA 5BRQA 3QHOA 7A3HA 5HXMA 1GJUA 1JZ6A 5CXPA 3OIHA 4U3CA 1W1TA 3BCFA 1BVNP 4W93A 4HZ6A 3NDYA 4JAWA 1OIMA 4QLLA 2WMIA 3AS1A 1WDPA 1UR4A 3W28A 4WSKA 4AMCA 3VIMA 4U2ZA 3WFZA 1OT2A 1JXJA 1UH3A 3AYRA 3WUBA 1GUVA 3FY1A 3WEZA 4IM4A 3WFLA 1A47A 3MUIA 3A4XA 4MNLA 3N17A 5A69A 3VD9A 3POHA 4QFUA 2VO5A 5TD4A 4UZUA 1ZBWA 5HDRA 4ZXLA 1V3MA 3OGVA 1E3XA 1AQ0A 1V0KA 4P7RA 3WD4A 4TX8A 2FH8A 3NSMA 4CKQA 5CZKA 1E6SM 3GTNA 4RL3A 3M07A 4HMDA 4UOZA 2ZUMA 1XV8A 2Y4SA 2WXDM 2GJPA 4GI6A 3VKKA 4D6CA 5A6KA 5M17A 1V3LA 1IZKA 4B9ZA 1IV8A 2WWCA 2VRQA 2CNCA 1MQQA 2DSVA 2WC3A 4CN1A 4PN2A 3WMBA 1ISZA 2D22A 3CZ8A 2WAGA 2WM0A 4MDPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HT6 A;  3F4C A;  3OLI A;  4X63 A;  3KVK A;  3LER A;  3L4T A;  3HBL A;  4N0R A;  3O5L A;  1AH3 A;  2HK1 A;  4NT0 A;  1NU5 A;  4YVV A;  2YXO A;  1OZQ A;  3FJ4 A;  4ZVJ A;  3W1P A;  2QCC A;  1XRF A;  4N4P A;  2BHZ A;  1U79 A;  3L0N A;  3S9I A;  1XLG A;  3TQ0 A;  2QUL A;  4WSH A;  2D73 A;  2A3B A;  1N1A A;  5HAT A;  5EYW A;  4FF5 A;  3SIM A;  4HTY A;  3VMN A;  3SUW A;  4MSS A;  4QT2 A;  3N4A A;  4PTV A;  3P0X A;  1CZ1 A;  2HVO A;  5CPN A;  3PTQ A;  2ZX5 A;  2FTP A;  1CGX A;  2WOQ A;  3EY6 A;  3G24 A;  4PZV A;  3PR9 A;  4FXS A;  3ZQ9 A;  1Z41 A;  3PFR A;  4NAE A;  4JX6 A;  4Q4Q A;  1KGW A;  1F07 A;  4DLF A;  2WSP A;  3SCP A;  2JEP A;  3RR1 A;  3ART A;  1L6W A;  3FV9 A;  1K70 A;  4EXQ A;  2OQH A;  1XLJ A;  4JQ4 A;  4W9P A;  5FF3 A;  3IAQ A;  1O5Q A;  4QLJ A;  1Z69 A;  2I5G A;  3VUP A;  4LC8 A;  1XCW A;  5D2W A;  1WXY A;  1NM9 A;  1O1H A;  2XN0 A;  1ZZM A;  2H9A A;  2AMG A;  4FNU A;  1XL9 A;  2FMO A;  4CQA A;  3NSX A;  5D33 A;  3EAU A;  3VIG A;  3Q67 A;  3I65 A;  5CEW A;  4UTW C;  1HKM A;  3CB3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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