4WKFA

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain in complex with chitobiose (2.5mm) at 1.10 a resolution
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitotriosidase-1
publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 128
structure length 368
sequence length 368
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wkfA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wkfA01
1VFFA 4PUEA 3AZTA 1C8XA 1WO2A 3OG2A 4TVCA 1C90A 1ESWA 1NQ6A 2F61A 3OBAA 1HJXA 3WDJA 4UNIA 1R87A 1BTCA 2D1ZA 5A6JA 3F4VA 4WIWA 1HJQA 2NT1A 3GXMA 4W8AA 5KEZA 3AMCA 3E1F1 4XB3A 2VX5A 4ZE5A 4TTGA 5GNYA 1FP8A 7A3HA 2D23A 5IFPA 4W5ZA 2XFRA 1UA7A 1KGWA 3AXIA 1W3KA 1CGVA 4NZCA 1JAEA 2WPGA 1R7AA 4DM1A 1K9TA 2J77A 2QLYA 5D9PA 4V27A 1GW1A 2YL6A 3RO8A 1JZ8A 1GONA 1M01A 3T0DA 1E9LA 3GH4A 1CXIA 1J0YA 2A3BA 1D7FA 1UD8A 2DSUA 5FD0A 5GNXA 1V6VA 3CMJA 2QMKA 1QNPA 1J0KA 3MKKA 2YIHA 3AI0A 3AYRA 2BY0A 3BLKA 1R7OA 1CPUA 2G3NA 1G0CA 3WNNA 1WZMA 2WVVB 4AD3A 3ARTA 5BXPA 2QPSA 1FFQA 3AHZA 1LQ0A 5CSUA 1A47A 1B3XA 2WHKA 4PCTA 1V0LA 3KWXA 1XH2A 4GKLA 4DWSB 2WAGA 3WSUA 3F5KA 1UUQA 4WSKA 3T2QA 3GXDA 4BF7A 1R85A 1YQ2A 4ZXOA 3GTNA 1EO7A 2Y2WA 3MMDA 1CGTA 1BGAA 1WZLA 4LYRA 1ISZA 2CBIA 5HOSA 5HXMA 1EH9A 1EGZA 1H0IA 1XRVA 3T2PA 3WNKA 1UH2A 3CZ8A 2DGAA 5E9AA 4UR9A 1HP4A 4W93A 4PMVA 1NP0A 3BAKA 5EMYA 4KGJA 1OIFA 1UZ1A 2Q8XA 2Z1KA 3OGSA 1QNQA 1PX8A 3EDDA 2ZICA 4CU7A 1JZ4A 4U2ZA 5ABFA 1MQRA 2XYLA 2D24A 3EDEA 4D1IA 1QI2A 4PBGA 5IXEA 1MW0A 3MSDA 2WB5A 3NSMA 4W88A 4E8CA 1ZBWA 3FY1A 3WNLA 1FHDA 1FH7A 4UZUA 2FGLA 3PZGA 3VGHA 3CMGA 5IHSA 5A8PA 4W85A 3M7SA 3WUFA 2OWCA 3A4XA 2VQTA 5JBDA 3ZT5A 2Y4SA 1OM0A 4MNKA 1ITCA 4HU0A 4IM4A 4N0RA 7TAAA 1LJYA 2O9RA 4BZYA 2WSPA 1E72M 5M3WA 1XSJA 1OB0A 4DUWA 4ML4A 1VEMA 1K6AA 4JKLA 2BXZA 4L4PA 1CLXA 1O6IA 2WKLA 2DT0A 1VENA 1BYAA 1TA3B 3TOPA 5GNZA 1KQYA 2OYKA 1FH8A 4HMEA 1JXJA 5DO8A 1V3JA 1V6YA 3A3HA 4GPNA 3RDKA 1V0MA 3SUSA 3POCA 1ZS2A 2YBUA 3CBWA 5I77A 4OBRA 4V2XA 5A6BA 1GOOA 3VGDA 1LL7A 2EBNA 2JIEA 1D2KA 4CCEA 2B31A 4A4AA 2WVVA 2WNWA 4E4PA 5AY7A 4F79A 3IAPA 3GBDA 3L4ZA 1HF6A 1BQCA 1QW9A 2BVTA 4WLCA 3WN6A 4CKQA 3FXYA 3VGFA 3K8LA 3II1A 1H0GA 4P7RA 3F5LA 4AD0A 1H49A 3B9EA 1JD9A 1B90A 3W28A 3QOKA 3O2LA 3NCOA 1L0PA 1K9EA 4JHOA 1W2PA 5C70A 3EDFA 4J3XA 1E1EA 1UOKA 4UOZA 2D20A 3ARZA 4P7OA 4TTUA 2V3GA 3CUIA 4GZJA 1LL4A 2IXUA 4J3TA 4W5UA 1UHVA 3DYPA 4AZBA 1EOKA 3SUUA 3AXHA 4D6HA 1IZJA 1LLOA 2J47A 2JF6A 1HIZA 2WVTA 1UKOA 3WDRA 1PEZA 2W4XA 4BQ5A 3N1AA 1BF2A 1B3WA 3WD4A 4C7DA 4AIEA 2PBOA 4BS0A 3SEPA 1J11A 3PZMA 3BAIA 3BCFA 3KL3A 3OGRA 3HMCA 4PUDA 3PZNA 3AZSA 4JL2A 1W9DM 2E0PA 2WMKA 3G6MA 3IAQA 5I6SA 3BAXA 3RM4A 5LA0A 1W9PA 2ZX9A 3KL0A 3FAXA 4JFUA 2WMFA 1C92A 4TUFA 1GOIA 4PMUA 1BG4A 2VQUA 3VNYA 4FMVA 5CPQA 5CQ1A 5CSYA 3UEQA 4XV0A 3VIOA 1TA3A 2UY4A 2EEXA 3PZUA 1Q6GA 4PMXA 1MW2A 2QF8A 2DSWA 1BSIA 1CNVA 1E0VA 1VJZA 1RH9A 1GQLA 2BNJA 2O92A 4H8VA 4D6JA 2UWFA 1ZB5A 1TR1A 3IJ8A 2PC8A 4M82A 1CTNA 2WVUA 1P6WA 4D72A 2EJ1A 2UY5A 1CECA 5CG0A 1PIGA 2VR4A 2EPMX 1UH4A 3VMOA 4CD7A 3AYSA 6A3HA 4AZ7A 3FW6A 1DHKA 3JUGA 2JE8A 1UWSA 4CN6A 2VCCA 4A3HA 1QNRA 2G41A 5E09A 1G1YA 1OCQA 1XD1A 4GXPA 3TTYA 2XSAA 2CERA 4J3UA 1M03A 3SCPA 4PMRA 1B1YA 1UR1A 3GBEA 1QNOA 4HMCA 3OLEA 2YBTA 2FHFA 4ZFMA 1C7TA 5A8OA 4PTWA 4Q22A 3VTRA 1QHPA 4JIEA 3TONA 4NRSA 3W25A 3WFLA 2WMHA 4U2YA 1W1PA 5A2BA 3K1DA 1E55A 3WD1A 1HL8A 3OIHA 3CIVA 3AQUA 4UQBA 5D9OA 3AIBA 5A8MA 1E40A 1UD5A 3NDZA 2V3FA 1ISVA 4AZCB 1HP5A 2ZUNA 4HZ6A 4TVUA 4YPJA 2OSWA 1J18A 5BCAA 1QNSA 1OT1A 3MUAA 1S46A 5I24A 3W38A 5CGMA 4HMDA 4IPNB 5DT5A 2CETA 2GDUA 2J25A 5BWFA 3PTQA 3WMSA 2DSZA 1JYWA 1X6NA 1KBBA 2W62A 2GJXB 5LYRA 3WQ4A 3QHMA 3PZ9A 5BXRA 3BSGA 3GH7A 4W7UA 3WQ5A 2XGIA 1WCGA 1JYNA 2PWEA 3RILA 1QHZA 2JEPA 3NSXA 3ZR6A 4WF7A 2W91A 3MO4A 1VBUA 1ISWA 1US2A 3AFBA 2AOSA 4MNJA 4TOQA 1FFRA 4IPLA 4ATLA 2WCAA 1E4IA 2E8YA 3WEMA 2NT0A 2J7EA 1V6UA 2VZSA 4XX6A 3L4TA 2XFFA 3N9KA 3UERA 2A3HA 4DUVA 4AZHA 5BRPA 4BA0A 3BCDA 3CLWA 1HJUA 3VD5A 2GJPA 3I3DA 5EBAA 2D3NA 5GPRA 2YA2A 1G01A 3ZJ8A 4ZE4A 3SUTA 4J3SA 2NW0A 3PZVA 3WNMA 2EPNA 2X0YA 4CD6A 2YA0A 1B0IA 4RE4A 1CIUA 3CZKA 1EDQA 2WBKA 2FGZA 1CXEA 1XYFA 4JZ5A 1TVPA 1BYDA 1Q4NX 4DWSC 1CGWA 5JUVA 5A8QA 2VL4A 3AICA 1BG9A 3VO0A 5CJ5A 4P8XA 1MW1A 3RM8A 4Y7EA 1HJWA 2MANA 4QLKA 1IT0A 1E43A 2X1IA 2WVSA 3RIKA 1V3MA 4H04A 2PWGA 1E6QM 5A6BD 5FL0A 4W7WA 1KCLA 1KGUA 1XSKA 4J3WA 3MV01 2XTKA 4AIUA 2DEPA 3AIEA 4LQ1A 1MWOA 1WB0A 2TAAA 4M24A 4P7NA 5JBEA 4UFIA 1BLIA 2CHNA 3AMKA 3HJEA 3PHAA 4PMQA 3EMZA 2ZOXA 1US3A 5A2AA 3MSGA 3ARXA 3QHOA 4U5IA 4EE9A 2FHBA 1HXJA 3WENA 1MQQA 3TTQA 1G94A 4CCCA 5BXTA 3MMWA 1J12A 4UQEA 2GJRA 1VRXA 4ZENA 1JZ6A 4FK9A 1WE5A 1NWSA 1BAGA 5EFFA 3ARQA 4KH2A 1W3HA 3W6MA 4RE3A 3L2LA 3L4VA 3NSNA 3EDJA 3J7HA 2XHYA 2WHJA 4QLLA 1C7SA 1KFWA 2PWHA 3AHYA 3WY1A 2C7FA 1HT6A 4GO9A 3L4YA 1UZ4A 2BHYA 2ZIDA 4R27A 4F9DA 1DWHM 2GK1A 2J62A 1C8QA 4W87A 3VDBA 1W91A 2WC3A 2EPLX 4AD1A 4ACZA 2DH2A 2WK2A 2XJ7A 3A4WA 2WMGA 3M07A 2XIBA 4UOJA 1GCYA 2CCRA 3DHPA 4J28A 2ZE0A 4MB3A 3SCTA 1TZ7A 1I1XA 1KB3A 2WLYA 2BFGA 3WF1A 4D6IA 4XZWA 1VEOA 3WQ8A 5BXSA 4TXEA 5A94A 1DTUA 2BY3A 3T0AA 1SMAA 2PF0A 2QPUA 4HPGA 3ARYA 3N04A 3RMEA 1E6SM 3CO4A 3WQVA 1AQMA 3BAYA 2AMGA 4FLQA 5HPCA 5GQBA 4R5EA 3ALFA 4PMZA 3WEOA 3VIHA 1HX0A 5HPOA 1PX3A 4ACYA 3KL5A 3W27A 2PI6A 2AAAA 1H1NA 1ZU8A 4BCEA 2VC9A 4UQ9A 2VCAA 3AIUA 1JDDA 3N17A 1GOKA 1LL6A 2XUCA 3VIFA 1J0JA 4H41A 2DSVA 3D5HA 3OLIA 2VOTA 4B3KA 1VAHA 4C7FA 4WJXA 3D3AA 2CKRA 4QCEA 5A8NA 2E9LA 5JIWA 2VZVA 1EQPA 2E9MA 2CYGA 4M29A 3UG3A 4EAMA 1UD2A 3VIPA 4UFLA 4JAWA 4Z2JA 3CHCA 5D9NA 2YKKA 2BVDA 2D0FA 3WH8A 1E0WA 3BGAA 2A3CA 3WNPA 2VI0A 2EPOA 1R86A 3WF3A 1EHNA 1JD7A 3CTTA 2ZWYA 1NOWA 1UD3A 1JGIA 2Y5EA 3AJ7A 4ZEPA 2WC7A 1KR0A 1WDSA 1WZAA 3WDPP 4P8UA 2DQXA 4MJ4A 1JIBA 2BVYA 2VT0A 3VGEA 5I23A 2Z1SA 1W2VA 2WHMA 3ARPA 1NWTA 5M5DA 1UR2A 1DWFM 4E8DA 4UQAA 1GHRA 1OSEA 4GQRA 3AS1A 5AYIA 2D22A 4FF5A 4CU8A 2VMFA 4B3LA 3EMCA 1QI4A 1KXQA 3FN9A 1QVBA 1OGSA 1CXKA 3NDYA 1UG6A 8A3HA 1TG7A 1E4MM 3UR7A 1HNYA 3MS8A 5JH8A 4OBSA 4WKFA 4DWSA 2UY3A 1ZJBA 4AY1A 3WQWA 1GZJA 1UYQA 4DUXA 1LWJA 3IANA 2ZWZA 3BXWA 4ZXLA 4URIA 4P7QA 3LPGA 3VGBA 3MV11 2JEQA 1Q6EA 4JCMA 5I0DA 1E6RA 1B30A 3AISA 3L2MA 3VKKA 3AIWA 3KE0A 3OZPA 1XGZA 1LG2A 2VZOA 2VZTA 1JNEA 2W5FA 3GNRA 1HVXA 1VBRA 3ZMRA 4HA1A 1MW3A 2ZXAA 3FAWA 1VFMA 3EDKA 4PMDA 3W81A 5DFAA 5E6YA 1SYTA 1TFVA 2G8ZA 1GOMA 2J7GA 1QBAA 1UWIA 3WKZA 1OBAA 1U33A 3TA9A 4BQ4A 2XVKA 3VDHA 2BV9A 2E4TA 1VEPA 4MPKA 1UR4A 1AQ0A 3WDHA 3ZJKA 3VD4A 2FHCA 1GQJA 4Z2LA 3OZOA 3VD7A 1HJSA 1HKIA 2WCGA 4NSBA 1Q6FA 1LWHA 4YHGA 2ZUTA 2D2OA 3PZIA 5M17A 2V5DA 3W26A 4QAWA 3O6AA 4V28A 1FA2A 3NJ3A 4B9YA 4PMYA 1HKJA 4MB1A 3ECQA 4PYSA 2D0HA 5FKYA 1E4LA 3W4RA 3VDCA 1DWAM 3SCSA 4HZ7A 1BPLB 4D6DA 4AZ6A 4PTVA 1CGXA 4C7GA 4GI6A 1OGGA 2WWDA 4AISA 4AEEA 5M03A 2DT1A 5D4YA 2ZX8A 1NWUA 1V6WA 1MQPA 1WPCA 3CH9A 2EQDA 2XM1A 4CGTA 3VIGA 2JIWA 2ZXQA 1V02A 4HP5A 2YDSA 1ZBCA 3OB8A 3ZSSA 3TTOA 3GNOA 3B9AA 1CXFA 4AXNA 4OUEA 4J3VA 2EO7A 1NM9A 2CEQA 3GXIA 2XIIA 3VD3A 1KR1A 6TAAA 1E5JA 1KCKA 4AIOA 2O9TA 2DIEA 2WM0A 4UQCA 1M04A 3CZLA 4UFJA 1JFXA 1V3KA 2BHUA 4CN1A 5C8BB 3WH9A 4AWEA 1ZBKA 2CBJA 2QMJA 5A95A 3ARRA 1BVNP 3WL1A 5AC5A 1WNOA 1WDPA 1XC6A 1H2JA 3ARUA 4KGLA 3K4DA 2OLHA 5AC4A 1U2YA 2ZUWA 3VIIA 5DMYA 1JAKA 3K8MA 4L4OA 2BS9A 1UR8A 5A1AA 1QI5A 3M6DA 3IJ7A 3TP4A 3N15A 1TMQA 4CVUA 1JZ3A 3GM8A 1X6LA 1M7XA 2YL8A 2CPUA 2YL9A 3U5UA 5JBFA 2C0HA 1H3GA 1CWYA 4UCFA 3U57A 2W92A 4D6EA 3VX1A 4BQ2A 2FDMA 3VNZA 1EHAA 3U5YA 1KBKA 4MAZA 5E6ZA 1XH1A 1PZ3A 2ZUVA 3T0BA 5I5RA 3CHFA 1CEOA 1E70M 3WQ6A 4B15A 1BHGA 2IXVA 3EMQA 2WCSA 3OLGA 2RGLA 3MU7A 2XG9A 3BH4A 2CESA 5I78A 2IUZA 2J78A 1W3LA 4S3JA 2X2YA 3W37A 5A3HA 5EFDA 3DECA 2CHOA 5CXPA 4OKDA 2XGBA 4PTMA 2ZX6A 1GOQA 1CZ1A 4IUGA 5HNNA 3GZAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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