5HBFA

Crystal structure of human full-length chitotriosidase (chit1)
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
452
structure length
424
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLQDTFCQGKADGLYPNPRERSSFYSCAAGRLFQQSCPTGLVFSNSCKCCTWNLVPRGSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitotriosidase-1
publication title X-Ray Crystal Structure of the Full Length Human Chitotriosidase (CHIT1) Reveals Features of Its Chitin Binding Domain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 137
structure length 424
sequence length 452
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-12-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
A PF01607 CBM_14 Chitin binding Peritrophin-A domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 5hbfA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5hbfA01
1M53A 3VGFA 3M7SA 2MANA 4D6HA 2D23A 4KRUA 3NDZA 4PN2A 4M24A 1H09A 2DEPA 3WQ8A 2XVNA 2DSVA 3W6MA 2AMGA 3RPMA 1CXHA 3QHMA 4ZEPA 3BAJA 4JCLA 4MADA 1V02A 3VILA 1UR9A 3L4XA 4W84A 1CXLA 4RE3A 3AHZA 3TTSA 4CD7A 1HL8A 4AZHA 1QNQA 2DH3A 4OBRA 4MPKA 1HKKA 4FLOA 2VJXA 4W7UA 2G4FA 2YDSA 1ITCA 1RD6A 4PUDA 1DEDA 1OCQA 1HKMA 3ECQA 2XTKA 3FN9A 3I3DA 3WD1A 1PX3A 3THCA 2FH8A 3T2QA 3IANA 4J27A 4JAWA 1L0PA 3E1F1 5GQBA 1VENA 4JFTA 1TFVA 2DT3A 3ZSSA 3AMKA 4DUWA 1NM9A 3EBVA 4U3AA 1ZL1A 1U33A 3MUY1 3IJ7A 3GYCA 3KL5A 2BY3A 3ARUA 2ZOXA 4XZWA 3ZJKA 5A6BD 5HPOA 1V3KA 4X0VA 3RIKA 4UTFA 1VB9A 2W62A 4WKAA 1W9BM 4HZ8A 1NWUA 1QI4A 2ZIDA 4M80A 2XFFA 4U5IA 3WDJA 1EOMA 4CGTA 4DWSB 4JZ5A 3W29A 5D8WA 5HNNA 1J01A 3MMUA 2J7GA 2V5DA 3QHOA 4AEEA 2WKLA 3VGBA 2CBUA 1K9FA 2EPLX 1I75A 2V3EA 1E43A 2VO5A 5A3HA 3TA9A 4V2XA 2YBUA 1HP5A 2EPKX 1DHKA 2GJXA 2Y8VA 3PN8A 4GQQA 4WSJA 1VJZA 2GFTA 1ZBVA 1EHAA 3EDEA 1SMAA 4E8DA 3MUIA 4WKHA 3AIQA 4ZXLA 3CUHA 3PZNA 5DF0A 1C90A 2YDRA 1LWJA 1EO7A 1GJWA 1LLOA 4HPHA 1E70M 2YOCA 3WH7A 1GOWA 5E0CA 3DC0A 2UY3A 1C7SA 2HVMA 1C8YA 4ML4A 1MFUA 4AD1A 2UY2A 3F4VA 1E5NA 4GI8A 1V3IA 4YHEA 1UWTA 3UESA 4MNKA 3KL3A 2W67A 3T08A 1CBGA 3HU7A 1JYWA 2VZSA 1MYRA 1WE5A 1DWJM 3CHEA 2VQTA 3ZR6A 2BY0A 2J47A 2XVKA 3PTMA 3AI0A 3CPUA 3WKZA 2F61A 2BY2A 1H0IA 1UD2A 4B16A 3SCNA 3CUJA 3CGTA 3W28A 1UZ4A 4U3CA 1E1EA 4CN1A 4A3HA 4PMDA 3AHVA 2BS9A 1HN1A 2J74A 3VNZA 1W32A 4TTGA 1BG9A 1G94A 1JDCA 2G3NA 1B2YA 2WHLA 1UH4A 4P8WA 3RJYA 4W5UA 4F79A 3EMCA 2X1IA 3AHTA 1I1WA 1E6RA 4UFLA 4HOXA 2FGLA 4HMEA 2BHZA 4WIWA 1U2YA 3SCSA 2O9TA 2WMGA 4H04A 4DWSD 4UOJA 3VDCA 4DM2A 1WDPA 3OGRA 3W26A 2WHJA 1JZ4A 3AOFA 2PI6A 3ZJ6A 3F5KA 2G8ZA 1PAMA 1A47A 4PTXA 2E40A 2FHCA 2VT0A 2EQDA 3G6LA 1TVPA 3BLKA 1EQPA 2B31A 1H41A 4F66A 1B0IA 3PZMA 3AMCA 4M29A 1UWUA 3ARRA 5CZKA 1JXKA 5DO8A 3ALFA 3SUTA 1KGUA 1G5AA 1LQ0A 1H3GA 4GZJA 2WXDM 4WLCA 4K68A 1KB3A 1WZLA 5A6KA 2A3HA 4CUCA 1B30A 5ABGA 2JALA 1C93A 2CIPA 5D8ZA 4XV0A 2WW5A 1HIZA 3ZIZA 1DWGM 3POHA 1UR2A 5BXTA 2IXVA 1OD8A 4F9JA 1NOUA 4S3JA 3F5LA 4CD5A 2WVSA 3CZEA 1WZMA 3S6TA 5CGMA 4EANA 3ZMRA 1VFOA 3WUGA 4HA1A 4RE2A 2WMIA 2XGBA 1UA3A 3WDIA 2FHBA 4AYSA 3TTOA 1PIGA 2G3MA 1C7TA 3GH7A 3AS2A 2WVVA 2X0YA 3WNPA 4UNIA 4J3VA 2C0HA 3CHCA 1H1NA 5HPCA 3WH5A 3RM9A 2VZVA 1ZJAA 3VMOA 1XYFA 4ATDA 3MU7A 3RCNA 1UYQA 2J62A 4Z2JA 2WKGA 1BHGA 3BAXA 1EO5A 1CEOA 1HP4A 3FAXA 3UR7A 3PZOA 3MO4A 3WMCA 4JL1A 2WPGA 5E6YA 4GI6A 4UCFA 3VDAA 4Z2HA 3QR3A 2Y5EA 2DSZA 5A6SA 1XSIA 1JZ5A 3B9AA 1Q6EA 5IXEA 1UH2A 3VIOA 4P7RA 3ZO9A 1XCXA 2JIWA 1O7AA 3N18A 2CKSA 1JIBA 3WD0A 1QI3A 4OIFA 3K4DA 3RMEA 4FLQA 3FNDA 3FY1A 2DIJA 4PBGA 1VF8A 3EDKA 2VURA 3UEQA 3PZIA 3KWXA 2V3FA 3WFZA 1JGIA 1VEMA 2RGMA 3U5UA 4GQRA 3KZSA 1K9DA 2PWHA 4PMXA 3O9NA 4IUGA 2WK2A 1UR0A 1PBGA 1UD4A 1FP9A 3VIFA 1UH3A 4ZFMA 1JYNA 2VUYA 1R8LA 2Y8KA 3VIGA 1BYAA 1AMYA 5GNXA 5TD4A 1TUXA 4D6GA 4C7FA 5KEZA 1DWHM 4NRSA 3I3BA 3N11A 3KE0A 3AJ7A 3VIIA 3VX0A 3N17A 4D1JA 2TAAA 3N9KA 3UCQA 4AZBA 1E4LA 3SUVA 5A6BA 4H8UA 3WNOA 1J9YA 2JF6A 2WMIB 1UD6A 1B1YA 3O2LA 3CZGA 5CQ1A 1WP6A 6TAAA 1TG7A 3NJ3A 2ZX6A 3APGA 4LQ1A 8A3HA 1BYBA 5M17A 1ESWA 2AAAA 1FH8A 1SR0A 1GQJA 3OBAA 4D6CA 4JIEA 2GJPA 1GCYA 4R5EA 3W24A 1ITXA 3O6AA 5DFAA 6A3HA 4PRWA 3RM4A 2CKRA 4GI9A 1FFRA 2VX6A 2ZUSA 1C92A 1VEPA 1ISYA 1CDGA 2CPUA 5C70A 3BXWA 1XH0A 5AC5A 3WDQA 3GXIA 2WZHA 3WY1A 4HMCA 2VVNA 3ARXA 4MJ4A 2XWEA 5ABHA 3K8MA 4AIOA 3WNMA 3VU2A 4BS0A 3D3AA 5E70A 5CPSA 2D1ZA 2YBTA 2W5FA 2DIEA 4W85A 3WNKA 1GVIA 1EDQA 3MUAA 2O9RA 2OWCA 3VO0A 3ZT7A 3M6DA 1ZU8A 4B9YA 4HZ6A 1EA9C 1DWFM 3ZJ7A 4OOUA 3VD9A 2EXOA 1R7AA 3K8LA 5LYRA 3WUEA 3PZTA 2WSPA 3LPFA 3VGDA 2ZUNA 3AICA 4UQDA 2J25A 1E9LA 4GPNA 3BSGA 1V6WA 4U5KA 3QGVA 3EMZA 4URIA 1GJUA 1UWRA 3IAPA 4W87A 1H2JA 3G6MA 1KBBA 3PTQA 3WFLA 4B15A 5FOOA 3UG5A 3VD7A 1K9EA 3WF3A 4AZCA 2PF0A 4P8UA 4NF7A 4U31A 2E9LA 4OUEA 3U5YA 3SURA 1OIMA 4CD8A 5C8BB 1TMQA 1CECA 1Q6CA 3PZVA 4P7LA 1BYDA 1JNDA 5AYBA 2CNCA 1PIFA 2E0PA 1BG4A 1MWOA 2ZICA 5A6LA 1W3HA 4DWSA 1KBKA 1E5JA 1HJVA 4GKLA 3IJ8A 4UQBA 4QP0A 1CXIA 1CPUA 3AISA 2ZWYA 4P7OA 4NZCA 1QPKA 1JFXA 1OGSA 4F9DA 4IM4A 1M03A 4E8CA 4P8XA 3W37A 2WCSA 2OYKA 1E6ZA 3GXFA 3WL1A 3UR8A 2XHYA 1PPIA 2UY5A 2CITA 4X0NA 5HOSA 2D24A 5BYWA 3BAWA 3CUFA 3K1DA 4MJ2A 3DYPA 1XHGA 3W81A 2EBNA 4TVUA 1HL9A 4Q7NA 4FLRA 3VIMA 1ISVA 3HJEA 3NUKA 3N1AA 4ATWA 7CGTA 2ZX8A 4DUVA 1ISXA 2WVUA 2ZE0A 4WSKA 6CGTA 2UY4A 4W93A 4CVWA 3NCOA 3FXYA 4M1RA 5BRPA 2WM0A 1CTNA 4HTYA 4TX6A 4MAZA 2VX7A 4UFJA 1JD9A 4W7VA 4NSBA 1J0ZA 1V6YA 5DT7A 1KWGA 3D5HA 1AQ0A 4GO8A 4BA0A 1NH6A 3UERA 3L4ZA 3QOMA 4IPLA 2JFEX 4QLKA 3M46A 4AZCB 1VAHA 2DDXA 1Q6DA 1V3JA 2WBKA 5CXPA 4KGLA 1NWTA 4AZ6A 3PZGA 1KWKA 2XM1A 3CIVA 1JG9A 1PJ9A 5JBDA 1UOKA 2YDQA 4CU6A 1QW9A 4J7RA 4HA4A 2BY1A 1LG2A 5HXMA 1FP8A 1XSJA 3N15A 5FKYA 3A4AA 2OSXA 4JKLA 4CD6A 1DP0A 3VD4A 3A6OA 3WDHA 1E55A 1B3YA 2Q8XA 5A1AA 3GNPA 4OOZA 4AMCA 2VMFA 3CO4A 1HJXA 3GH4A 4AD2A 2XGIA 3BC9A 1HKJA 3GZAA 2J7BA 2W63A 3VM7A 3BAIA 3WBEA 1E56A 3SCRA 1J0IA 2WCAA 2WWDA 4X9YA 4D72A 5I6SA 1VRXA 3W53A 2NW0A 3ARSA 2QMKA 5A2BA 4TVCA 1GZJA 2YLLA 2WSKA 2ZUUA 4JHOA 2ZXBA 4Z2KA 4AZ5A 1L8NA 1BFNA 3AIRA 3ZT6A 5ABFA 2QPSA 3U57A 1QW8A 2D0GA 2GK1A 5CSUA 2XVLA 3AYRA 3ARVA 4UZSA 5GNYA 3W6LA 3AIWA 1CWYA 1VBRA 4D6EA 2Z1SA 4JCMA 3HN3A 3N04A 1WO2A 2VOTA 1E6XM 3VX1A 1MW0A 5A6JA 1PX8A 3OGSA 4BZYA 2X0HA 3CZLA 4UQEA 1G0CA 1WZKA 2EPMX 1ZJBA 1BPLB 1R87A 4ATLA 1D2KA 1GNXA 1XSKA 1I1XA 4OKDA 2OSWA 4CN4A 2A3AA 3VIPA 2EJ1A 3GTNA 5JUVA 2WMHA 2PBGA 3WH8A 2DGAA 7TAAA 4OJYA 2YL9A 2GVYA 1HJSA 4JL2A 5I3DA 5A94A 1NARA 1E40A 4KWUA 2BVDA 1V0NA 4U33A 1WAWA 1CXEA 1EHNA 3CLWA 4Z2GA 3BMVA 4J3SA 5A69A 2WC3A 1XD0A 4HZ7A 4HU0A 3CBWA 5E09A 3WMSA 1EGZA 3OLDA 1E72M 2DH2A 3S2CA 4LX4A 2VNCA 4LYQA 3T09A 2YIHA 2BVYA 3CMGA 3TOPA 4PTMA 2CHNA 4N0RA 3CZJA 1MXDA 1C8QA 2VCCA 5CLTA 1DTUA 1IZKA 1LL4A 1C91A 3WH6A 3DYOA 4NI3A 3VMPA 1GOQA 4HU8A 1E4NA 1CLXA 1W3LA 4YN5A 4B9ZA 5ABFB 2ZUMA 1UWIA 3POCA 1AVAA 3WD4A 1K6AA 2GK1B 2ZUWA 1NWRA 2BXZA 3RILA 3GXMA 4EAMA 1H0GA 3A3HA 1JI2A 4Y7EA 5M5DA 1UQYA 2X05A 4PMOA 1BQCA 2WVTA 1B31A 1V3HA 1GHSA 1X6NA 1B3WA 1NQ6A 4Z2LA 2CERA 3DYMA 3ZT5A 3WIJA 2WC4A 1W2VA 4M8UA 1UHVA 2O9PA 2O92A 1R85A 2E9BA 3AZSA 4H2CA 4TTUA 5BXSA 4UOQA 5GPRA 1W1PA 1W3JA 1H11A 3OIHA 4OZOA 1W9PA 3NSNA 1NOFA 1B3ZA 2NSXA 3F5JA 1B3VA 3BAYA 4J3WA 2CBVA 2VVSA 1V03A 2QHAA 1E3XA 4MDOA 3LMYA 1EH9A 2X8RA 2EEXA 4CCDA 5DEZA 3TP4A 2FDMA 1VBUA 3AXHA 5A8QA 3GBDA 2NT1A 3VD5A 1TE1A 4CU7A 1WDSA 2E3ZA 3AZRA 4FK9A 2CCRA 4J3XA 1V0LA 3BH4A 1R86A 3WQ6A 2YJQA 2VX5A 1RP9A 3ARPA 4IISA 5FIPA 1CXKA 4QLLA 1KGXA 1W9UA 2W4XA 4ZENA 4MNLA 4PTVA 3NDYA 4AEFA 1MVYA 3KL0A 5M03A 1GUVA 2VCAA 3WDRA 2XJ7A 1KCLA 1BVNP 1HJQA 1EIBA 4Q22A 1MW3A 5CG0A 1OB0A 2PWGA 4CKQA 2WLZA 2FGZA 1W9VA 1H4PA 3OZPA 1BF2A 5A2CA 2F8QA 4W8LA 3ZJ8A 1NWSA 5FL1A 4HA3A 4H8HA 5A8PA 4LGXA 3ARYA 3AXIA 1MW1A 1WB0A 3AQUA 3AROA 2V38A 4ACZA 1ODZA 3UG3A 1W2PA 5A2AA 3GBEA 3FHQA 1E1FA 2WB5A 1QHZA 4LYPA 1WPCA 1Q6FA 4AD4A 4F8XA 2VZOA 1GPFA 2J7DA 2QLYA 5CPTA 3WENA 4C7DA 1J0JA 1KCKA 2WNWA 3B8SA 1ZBCA 2E4TA 1ODUA 1KQYA 1CGUA 4TOQA 3MV11 4QFUA 1V08A 3WMBA 4CVUA 5EFFA 3VM5A 1XCWA 1OGBA 1E71M 1KQZA 3CUGA 4ZE5A 3CHDA 1ISZA 3LPOA 5D9OA 5I79A 2C7FA 2DSWA 2RGLA 1CZ1A 2ZWZA 3GNOA 4KMQA 4D71A 4EKJA 1PEZA 2WMJA 3CMJA 4ZXOA 1F4AA 1V0MA 3VINA 1G9HA 4W7WA 1KR1A 1CGTA 2X2YA 1ZBWA 2BV9A 3IJ9A 1LJYA 4GZEA 5I5RA 1UKTA 3VDBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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