1E6PA

Chitinase b from serratia marcescens inactive mutant e144q
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWQYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights Into the Catalytic Mechanism of a Family 18 Exo-Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
total genus 166
structure length 497
sequence length 497
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1e6pA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1e6pA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e6pA01
1KBBA 2G4FA 2J8GA 3HMCA 4D1JA 2EPLX 3VILA 2JEQA 1JAKA 4WKFA 4MNMA 1V08A 1ODUA 4HMCA 4GZJA 4CD6A 3WF4A 4AD2A 2JF7A 1V3LA 5KZ6A 2VMFA 4M29A 4AXNA 1W91A 3UERA 3WDJA 1VAHA 1KXQA 2YL8A 4AEFA 3APGA 4P8WA 1CXFA 2QPUA 2WVVA 1E0WA 5TD4A 3W81A 1EDGA 1QBAA 1MXGA 3S6TA 5JH8A 3GBDA 4YN5A 1ZU8A 1R7OA 5E9AA 5M17A 4HA4A 1CGWA 4V2XA 4UZSA 3WNMA 2Y8VA 2J7HA 1UA3A 2ESCA 4PMVA 1JDCA 1E72M 1QNRA 3PZVA 1JF5A 3UCQA 3ALGA 1C7TA 1V3MA 3I3EA 1B3YA 3I3DA 3WH8A 3VMPA 4DM2A 1EO5A 4AZCA 3SURA 4E2OA 4WJXA 4QLJA 3AHVA 4ML4A 4PMRA 2E9BA 4EE9A 3L2LA 5A8OA 1HVQA 4KMQA 4AD0A 2UY3A 5A2AA 1JAEA 1QI5A 2XSAA 3AS0A 2VZTA 4KWUA 1EO7A 4D6FA 2DSUA 1DWGM 4M80A 3NYDA 3M46A 4IPNB 2VCCA 3AHYA 4HZ8A 1KR0A 3WNLA 2G3JA 4Z2LA 4P7QA 1E40A 2ZXBA 4D71A 3CTTA 3ZJ7A 3OA5A 5IHRA 3WD0A 3FN9A 1NARA 4KH2A 1PIFA 2CERA 4W7UA 2Z1SA 1WNOA 5CJ5A 2XWEA 2PWFA 3CZGA 3SUTA 3K1DA 3EDKA 2A3BA 3O6AA 5JBDA 1BQCA 3MO4A 3VX1A 3BC9A 1E71M 5EBAA 2WZEA 3II1A 5A8NA 2IXVA 2VJXA 3AHTA 3WDHA 2E9MA 1NWTA 4WKAA 2X0HA 1V3HA 1WPCA 1TE1A 3CMGA 1E6NA 3U5YA 2XJ7A 4WSKA 2XUCA 4D6GA 2XFRA 4AZ7A 4W5ZA 3OZPA 2PWGA 4GZIA 4CU8A 4MB5A 1U33A 4PMDA 1BTCA 3L4ZA 2DDXA 3DYOA 1YHTA 1CENA 1HJUA 2BFGA 4RL3A 1B3VA 2DEPA 2WMFA 1G1YA 3VD5A 2PBGA 3PZTA 1W9VA 3AMGA 4XX6A 2D22A 1H4PA 4IUGA 5EFFA 4XZWA 3ARUA 3ARSA 3CBWA 1E6SM 1UQZA 3W38A 4UQEA 4D6IA 3SCTA 2EJ1A 2TAAA 4UQAA 3VMNA 1DP0A 1GOQA 2ZIDA 4KRTA 4MJ2A 2ZUTA 1PIGA 1BF2A 3KL0A 1MVYA 3VVGA 3AIQA 5I79A 2GDUA 2YDSA 4TTUA 3RO8A 2FDMA 3WFZA 3SCQA 1JF6A 3DHPA 1PZ3A 5D9OA 2DIJA 1ISYA 3GH4A 3WH5A 2C7FA 2DPEA 6A3HA 3CMJA 1XSIA 1ISWA 1XH2A 5EMYA 2GJPA 2YKKA 2FHFA 4CN1A 4QFUA 3B8SA 1ITXA 5I5RA 2AAAA 2CYGA 3VDAA 3RPMA 3QHMA 3WUGA 4AEEA 4MDOA 4FK9A 3N11A 1GCYA 4MPKA 4XUYA 2CIPA 2WC7A 1DWAM 5BXTA 3MUY1 1HP5A 5ECUA 4AZIA 4Z2GA 2UWFA 1UUQA 3W0KA 3VD3A 3E1F1 2XVPA 3IJ9A 5GNZA 3L2MA 3AIVA 4GO8A 1E3XA 2QMJA 2XGBA 4MNKA 3TA9A 1BYBA 1D3CA 2VX5A 3BCFA 3POCA 4UQBA 4D6JA 3OZOA 4LX4A 1UWIA 1K6AA 2DSKA 4XV0A 4ZE5A 2WM0A 4R5EA 3KL3A 1JI2A 5ABFA 3ZR6A 3AYSA 1PBGA 4BQ2A 4PCSA 1HF6A 2FH8A 5CSYA 1Q6CA 2CBVA 3TTSA 5JIWA 1V6VA 2E8YA 3WBAA 4PEEA 3WH6A 1US2A 1C8XA 1J0IA 4LYPA 4HOZA 3CGTA 3ZR5A 1EA9C 4QDMA 5AY7A 1B3ZA 1Q6EA 4PMOA 4AZBA 4QCEA 3RM8A 5CG0A 1HJVA 3W6MA 3AMDA 3AOFA 1W9BM 4JHZA 3T0BA 5BRQA 3MANA 4PUDA 4PMNA 1CLVA 5CGMA 4AIEA 3CHFA 3VIMA 1BYAA 1CXKA 3VIJA 5HXMA 3L4UA 4W86A 1K9EA 3PBGA 4UQCA 2CITA 2CETA 3N04A 1KGWA 1V6WA 1B30A 4HZ7A 3SCUA 3WELA 2BY0A 3WL1A 4JL1A 1FOBA 4BS0A 4FLRA 2WB5A 2EO7A 2V3GA 2XIBA 4ZXOA 1LWJA 2VR5A 1H0IA 5EFDA 4GI8A 1MW0A 2AOSA 4AY1A 1J0KA 1O7AA 1MW1A 3MU7A 2XIIA 4JL2A 1QW8A 1UQYA 3UESA 3VIIA 2BNJA 2CBJA 1JGIA 1PX4A 3ARRA 2WSKA 1QW9A 1LL6A 2ZXAA 4RE4A 1M04A 2F8QA 4UOZA 3SUSA 2VRKA 1M03A 1OGGA 1B1YA 3GM8A 1E73M 1B0IA 3L4YA 4JCMA 3TTYA 5I24A 4JFUA 3GH5A 4CU7A 3W25A 4H04A 4AD1A 4ATWA 2G41A 1TFVA 3VDHA 1OT1A 3T0AA 1Q6DA 1MFVA 2YA0A 4OBRA 4CD4A 1ZB5A 1VFFA 1WE5A 3WENA 3K4AA 3FAWA 4DWSD 4MTVA 3ZT7A 3K8KA 4GKLA 1E5NA 2GJXB 2YBUA 2D1ZA 4QCFA 1A47A 1GW1A 4ZE4A 1B3WA 2Y4SA 1B3XA 4F9DA 1UWTA 2CHOA 5E0CA 4PTMA 1D2KA 3CHEA 1QNQA 3MUAA 1GJUA 3GYCA 3MV11 1H09A 1CXHA 3VOCA 1OD8A 3BGAA 2GFTA 1K9DA 1UR4A 3BXWA 3MUIA 3TOPA 1CNVA 3ECQA 1R87A 1W3LA 5LA1A 4W87A 3WDRA 5A94A 2BY3A 1PPIA 5CPSA 1VFMA 3AMLA 1QNSA 2V5CA 1GVYA 2WAGA 4GXPA 1E6PA 1B2YA 1WAWA 2JFEX 3ZT5A 2FGZA 5FCZA 1KCLA 1W32A 2DSZA 1VFUA 5A8MA 1EIBA 2VL4A 5AC4A 2XFFA 3UR7A 4DUVA 1JFXA 1V02E 3CPUA 1J01A 3VX0A 3VGGA 1XSKA 4D6CA 3EBVA 3WEZA 1E4NA 4FLQA 3SCNA 3OG2A 3NDZA 3OLEA 1XYZA 2PC8A 1UKQA 5A2BA 3VDBA 1CGUA 3ALFA 2WC3A 4MB4A 4TUFA 3SUUA 3SCRA 5A6KA 3T0DA 4M24A 4PSRA 4F79A 1UD8A 1JFHA 3KZSA 1EQPA 3M07A 1CXEA 4BQ5A 5JBEA 4Y7EA 3A4AA 2VURA 3WD2A 2J77A 2D24A 4GQRA 1KR1A 3FHQA 3HU7A 1WZLA 2BS9A 1BG9A 1UHVA 3WQ6A 4U5IA 1SR0A 1UKTA 4HP5A 1ZBCA 1JYVA 4U31A 3QHOA 4B9YA 1F4AA 4QLLA 4Z2IA 3O9NA 4B15A 1OM0A 2CHNA 4J27A 4PTWA 1UKPA 3ARWA 1Y7VA 2YLAA 4PTXA 3WSUA 4EK7A 2WMKA 1CXLA 5I3DA 3W29A 1HKJA 1DEDA 2XWDA 3LMYA 1BGAA 3VNYA 1WDQA 4Q7NA 1WO2A 2O9PA 5AYBA 2J8FA 2XPKA 4M82A 4OUEA 3VNZA 1FFRA 2BHUA 3VGFA 3K46A 4F66A 1J9YA 4AWEA 4NZCA 5ABFB 3RILA 1G9HA 1FHLA 2VT0A 1GOWA 5CLTA 1WZAA 3A3HA 3AISA 5EB8A 1EQCA 3PZUA 2VX4A 3A47A 2W63A 1J0HA 5HNNA 3D5HA 3CZKA 1WDSA 2PI6A 1MW2A 1OGBA 1GPFA 4P7NA 2QMKA 3BAKA 4TX8A 3EDEA 1VBRA 3GNRA 2E8ZA 2VNCA 2XYLA 1W3HA 4UFKA 3FHAA 1E70M 3W53A 3VINA 3ZT6A 3BMVA 4C7FA 4HZ6A 4UFHA 1GZJA 3WD4A 1ISXA 3T2OA 1IV8A 1UG6A 1E6ZA 2VOTA 3F5KA 4MNJA 5D8WA 2DIEA 2W62A 1I1WA 1AIWA 1VFOA 2W5FA 1GQJA 3VD7A 3HN3A 4P7LA 1XHGA 2OSYA 3ARYA 1NOUA 1TUXA 5M3WA 1MWOA 4UFLA 1NWUA 1WB0A 2VCBA 4CGTA 4J3WA 4S3KA 3THDA 1V03A 1HP4A 3J7HA 2O9OA 5I78A 4ACZB 3AXIA 5GPRA 2OYMA 5CXPA 2OLHA 2J62A 2W92A 3AZRA 1RPKA 1EGZA 1QVBA 4HMEA 4J3SA 1FP9A 4M81A 2W67A 2VQUA 1PZ2A 4JCLA 3W6LA 1OB0A 3MSDA 3WNNA 3ZSSA 4B9ZA 3AXXA 1TA3A 2J4GA 2VRQA 1C8QA 3PZIA 4GZEA 2DT2A 3K4DA 1TVPA 2OYKA 4AZHA 2YLLA 1MW3A 1NH6A 1HXJA 4TX6A 1JI1A 3BH4A 1KWKA 1V0KA 2UY2A 2G3MA 1B90A 2X09A 3T08A 2CBUA 2AMGA 3WY1A 3AS3A 2JF6A 1E6RA 4CD7A 4CVUA 1S46A 4ZEPA 2VCAA 4NRRA 3GBEA 4MB1A 1BVZA 1PX8A 3IAPA 4OOZA 3VGHA 5IFTA 3SEPA 2XGIA 3AZTA 4YPJA 2DT3A 2QV4A 4M8UA 3VD9A 4AMCA 1AQMA 4W88A 4CCCA 1E4IA 1H5VA 1ZS2A 3CZLA 5CQ1A 1KXHA 1G01A 1HJWA 1UKSA 4W93A 3GDBA 3LPGA 1XH0A 4C7GA 2WW5A 2JIWA 4UFMA 2GJRA 3OLIA 2OWCA 1ODZA 3VIKA 4JFVA 1JXKA 4UFJA 2NSXA 1OT2A 3BAJA 5E0FA 1Q6FA 5IDIA 3BAYA 3OGVA 3G6LA 1EXPA 3WD3A 1V0NA 1VEOA 3EDJA 3WMSA 3I3BA 2V3DA 1W9UA 5AC5A 3F5JA 2BHZA 3UG5A 2BVDA 2CCRA 4J28A 1UZ1A 2J47A 3KE0A 3AYRA 1KBKA 1H0GA 2ZUNA 4B16A 3ZM8A 5A8PA 1HKIA 2GJXA 2BVYA 1EDQA 1OCQA 4UZUA 1CGTA 1E4MM 3AIRA 1I75A 3F4VA 4GQQA 1TCMA 2ZX5A 3VD4A 1JZ3A 2QPSA 2E40A 3VGEA 1FH8A 1X1NA 3OGRA 4H7VA 4HPGA 1Q6GA 4AIOA 3WDIA 4LQ1A 1DWJM 2WLYA 3WQVA 1WZMA 1GOKA 4FF5A 3CO4A 4H8HA 3VKKA 1HN1A 1OIMA 2UY5A 4R27A 4KRUA 1E9LA 1UD2A 2OYLA 4GI6A 3B9AA 1E3ZA 2YDQA 1V02A 2X0YA 3AJ7A 1JZ8A 4A3YA 4GINA 4BCEA 2WMIB 2OSXA 4TOQA 3BSGA 1SYTA 3B9EA 1IZKA 2ZWYA 4CCEA 2VVSA 1J0YA 3N15A 1GOMA 1XCXA 1N82A 2D0FA 3EMZA 1UR2A 3WEMA 5CPQA 1A3HA 2Y2WA 3WQ5A 3AIEA 1QBBA 2CXGA 5FKYA 4PN2A 1CTNA 1MFUA 1NOFA 1HX0A 2YL9A 1VIWA 3VIHA 4D6EA 2ZX6A 2XFYA 2DQXA 1C92A 1JD7A 2FHBA 4BQ3A 3N13A 8CGTA 3MMWA 4ATLA 1VJZA 4PMQA 1ESWA 2XG9A 8A3HA 2VRJA 2YA2A 1XSJA 5IFPA 4DWSC 1NP2A 3WIJA 2J7FA 1JZ6A 3WN6A 2ZUWA 2OWXA 5M03A 2X8RA 3AHXA 2J7DA 4Z2JA 1JXJA 4N0RA 4X0VA 2JE8A 1J11A 2YIHA 3CHDA 3M6DA 1M53A 5DT7A 1QNOA 2G8ZA 1TR1A 2ZX9A 2J25A 3PZ9A 2VI0A 1QOXA 1V6UA 1JNDA 5FD0A 2V5DA 9CGTA 4DM1A 1BVNP 2C8NA 4PYSA 4P7RA 2C0HA 1TA3B 3NDYA 2GVYA 3PZQA 4HTYA 3GNOA 3ARQA 1HJXA 4LGXA 2WXDM 4AZGA 2VUYA 2WYSA 1AVAA 3VM5A 3SCSA 1XD0A 5CPTA 4MAVA 3WQ4A 1TG7A 4S3JA 3FNDA 3ARPA 1ITCA 4D1IA 2NT0A 2EPMX 4W84A 2EPOA 3BLPX 1R8LA 3O2LA 4WK9A 3VM7A 2D3LA 1K9TA 3VMOA 1NWSA 3WUBA 3GTNA 3NIYA 3BMWA 2XTKA 3MUZ1 4OIFA 1PX3A 1WCGA 1CPUA 4CD5A 4IISA 2VX7A 1E4LA 3EDDA 4J3TA 2A3EA 1CZ1A 2WHKA 1JYXA 4ACZA 3W37A 2JIEA 1BG4A 3WF1A 3L4WA 4DWSA 1BFNA 1LF1A 4PMXA 3M7SA 2ZUVA 2PBOA 5I77A 2A3AA 4W5UA 3MKKA 5C8BB 4NF7A 4FMVA 3VGDA 4PCTA 5KEZA 2D2OA 4AISA 3CZJA 2B31A 1CGVA 3U7VA 2ZICA 4UNIA 3U57A 1CDGA 1JYNA 3T2PA 3G6MA 4PBGA 5CZKA 3CZ8A 3BAXA 1RP9A 3PTQA 4EKJA 2A3HA 4ATDA 1UKOA 3RCNA 1DWHM 1AMYA 2DH2A 1W9XA 4UR9A 1X6NA 1FH9A 3WF3A 2GSJA 4PRWA 5IHSA 5I2UA 2W91A 3WH7A 3GXIA 4U2YA 1UH2A 4OKDA 1XCWA 2WNWA 1KB3A 1HKKA 2W4XA 2X2YA 3FXYA 3QHNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1WNO A;  4GCX A;  3PWG A;  4IBC A;  2G4J A;  3K1D A;  1E0T A;  1QR7 A;  3EDK A;  3L5L A;  2A3B A;  4JIQ A;  1FRB A;  3CU2 A;  2C18 A;  1IYX A;  3MO4 A;  1MNZ A;  2D2H A;  3CL7 A;  5A8N A;  2IXV A;  3CWH A;  3PK7 A;  3WDH A;  3ABQ A;  4QJ1 A;  2XUC A;  4F0S A;  5LHE A;  2XFR A;  1T40 A;  1ZNN A;  4FSA A;  5I02 A;  4CU8 A;  3C52 A;  1U33 A;  1H7N A;  1BTC A;  1XBZ A;  2FB3 A;  9RUB A;  4I9A A;  2WMF A;  2AL1 A;  4CEX C;  1VKF A;  3VD5 A;  4LCS A;  4XX6 A;  4ODQ A;  2VKZ G;  5EFF A;  1TJ1 A;  1A5M C;  1WA3 A;  1E6S M;  5G1Y A;  4D6I A;  4F0M A;  1TX0 A;  1EJW C;  1YE6 A;  4R7J A;  3PB0 A;  1KNW A;  1DP0 A;  1GOQ A;  3BUV A;  4G9P A;  4TMC A;  4KRT A;  1PIG A;  1BF2 A;  3P7Y A;  4Y9A A;  2FMN A;  4XSM A;  1JNS A;  3AIQ A;  1CX9 A;  2XD1 A;  1Q6R A;  3W7N A;  4CQ9 A;  4AVN A;  2DIJ A;  2POT A;  1XW8 A;  1DJZ A;  5EMM A;  3TFX A;  3OP2 A;  2ACR A;  4HT3 A;  3CMJ A;  5F2G A;  1RY8 A;  3LY0 A;  4QFU A;  3CQI A;  2B7P A;  1PHQ A;  2H3B A;  1TJ2 A;  3RPM A;  5U4N A;  3L23 A;  1G4E A;  3EXR A;  5C7H A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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