1E6ZA

Chitinase b from serratia marcescens wildtype in complex with catalytic intermediate
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights Into the Catalytic Mechanism of a Family 18 Exo-Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
total genus 165
structure length 497
sequence length 497
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2000-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1e6zA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1e6zA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e6zA01
1H2JA 2VURA 1NH6A 2ZE0A 1PX8A 1VBRA 2PB1A 3IAQA 2CEQA 1CTNA 3ARTA 2XWDA 3OG2A 2VVNA 1C3FA 1JYWA 5A8OA 1M7XA 3BCDA 1DWHM 3VIIA 3W81A 7A3HA 4GINA 4ZE4A 2J25A 1BGGA 3KL5A 1QW9A 1KGUA 4OJYA 2YL8A 2E9LA 7TAAA 4J3XA 3W25A 3FHQA 2ZXAA 1HKJA 1PBGA 4ACZA 3QHNA 2DSVA 5ABFB 1J9YA 4PMDA 1HNYA 4P7NA 5DO8A 2WBKA 4EANA 2XWEA 5EBAA 3KE0A 1C8QA 3VX1A 1HXJA 1KXQA 4PMVA 1ITXA 4HP5A 4LYPA 4HU0A 1ZB5A 3SUWA 3F5LA 4AZ5A 3WDHA 4WJXA 3AIVA 1ISZA 3F5JA 5EB8A 5ABHA 1W9BM 1HJSA 2J75A 5CQ1A 1BVNP 3VDAA 2VX4A 4J3WA 3WEOA 1LLOA 5JIWA 1FP8A 4FLRA 3JUGA 2BHUA 1O7AA 2XUCA 1OINA 2X1IA 2XHYA 3WH6A 4OUEA 1V02E 2XGIA 1EQCA 1E1FA 5HPCA 4MNMA 4M56A 4H8VA 4ACZB 2W91A 4JFVA 1BAGA 4GIAA 2WLZA 1V6UA 3RM4A 1JDAA 3AOFA 4H7VA 1LQ0A 3THDA 4AC1X 3CGTA 4HA3A 3EDFA 3WDPP 2WMFA 3CMJA 4Y7EA 2GJRA 2GVYA 2EPMX 5D9NA 3CZJA 1R7AA 3ARRA 3GYCA 4W87A 1QI5A 3GZAA 3WY1A 3WDQA 4QLKA 4MJ2A 1MW3A 4EE9A 3GBEA 3IJ7A 4BF7A 2DSUA 2XIBA 3CZLA 4W7VA 3M7SA 1K9DA 2ZOXA 2VX6A 4AD0A 3WFLA 2WVVB 1J0ZA 2VQTA 3ARPA 4P7RA 2WZHA 1B0IA 4GZJA 1BGAA 1V0LA 1KB3A 3APGA 3WF0A 1UG6A 1K9EA 5KZ6A 3WF2A 1W3JA 1XSIA 4UQDA 3KL0A 3O9NA 4TX6A 3PZOA 2VNCA 3PZQA 3EMQA 4JFWA 4M80A 4DUXA 1WDRA 4JL2A 1V0NA 5D8ZA 1MQPA 2IXUA 3CIVA 5GQBA 3PZVA 1MQRA 4YN5A 2JEQA 2A3HA 1E6NA 2D0GA 2J7BA 3WL0A 5BWFA 1H1NA 1BYBA 5I77A 3VNYA 1KBKA 1UH2A 2JFEX 3PZ9A 5FL0A 4KH2A 6CGTA 1SYTA 1I75A 2EO7A 1CZ1A 1XSJA 4MTVA 1HJXA 5EFFA 1J0KA 1VIWA 3ZJ8A 4EKJA 3D3AA 4HZ8A 2EBNA 2X09A 5I6SA 4QCFA 3F5KA 1FOBA 1CGXA 1HJQA 1UA7A 1DTUA 5HNNA 4UOJA 3CZ8A 5E0FA 1W3HA 5HDRA 1FFQA 3ARSA 1B3VA 3W27A 1B90A 1V3MA 1QI2A 4KRTA 1GQIA 3RDKA 2QV4A 1NWRA 3CBWA 1H49A 3N04A 3MSDA 1UR2A 3VMNA 3PZUA 1CBGA 3WSUA 4X0VA 4HOZA 1WPCA 3CZKA 2EQDA 3WD4A 1BF2A 2RGMA 1NARA 3ZIZA 4AIUA 1HVXA 2EXOA 3I3DA 4P7OA 3AYRA 2V3GA 3AS0A 1B9ZA 4TVUA 2D24A 4N42A 1DWGM 4J3VA 1IV8A 1PAMA 1N82A 2J62A 5CPSA 1GJUA 2CNCA 3QOKA 4NF7A 1GOWA 1GOIA 3W24A 4TUFA 4AZIA 5FOOA 4AEFA 1MWOA 2DPEA 3CUFA 5DT5A 3PTQA 4LGXA 1HVQA 3U7BA 3CMGA 5FKYA 3TTQA 5I5RA 3GM8A 1CWYA 4WSKA 2OSWA 1CXLA 1CGTA 3BAJA 5A3HA 5C70A 3N18A 3WQVA 5I3DA 4Q22A 3ZJ6A 3DECA 4GQRA 4C7DA 2YL5A 2IUZA 4D6EA 4P7LA 1FH7A 3OGRA 3WFZA 1P6WA 4CD4A 4AZ6A 2V5CA 4MB3A 3CHCA 1E56A 1XGZA 1QNSA 2Y24A 2E9BA 5BXTA 4DUVA 2J7FA 4X9YA 1UH3A 3AMLA 3SCUA 1TG7A 3ZMRA 4KMQA 3MSGA 2VZSA 3O6AA 2CBVA 3ECQA 4ZXOA 4CN1A 1V08A 2C7FA 4JFUA 1GOMA 1EO5A 2PI6A 1NOFA 4PBGA 2O9PA 1OCQA 2PF0A 2VQUA 3MANA 4UFJA 2RTSA 3OLGA 2VZTA 4B3LA 1MW2A 3ZR5A 4UQCA 3ZM8A 3I3BA 1V3HA 1OT2A 4ZXLA 3RIKA 4AZCA 2D22A 3DC0A 1WO2A 3THCA 1XH1A 1CXKA 1GVIA 3T09A 1RD6A 1JXKA 4TX8A 3SUSA 5BXSA 4AEEA 2G3MA 1HL8A 1KR1A 4XX6A 3UCQA 3WQ8A 1HP4A 3AHTA 3MUY1 3EYPA 3WUFA 4AD2A 3CLWA 3MU7A 1CLXA 3SCSA 2UWFA 2O92A 4JKLA 3CH9A 1ECEA 1XH2A 1GHRA 2XFFA 4CN4A 3A3HA 3UR7A 4GKLA 4WF7A 1E1EA 1J11A 3PTMA 5CGMA 1HJUA 5CXPA 1E73M 3FXYA 2QPUA 2JIWA 2XSAA 2D20A 5EMYA 1NOUA 4XV0A 1UR1A 4D6HA 1E6PA 1BYDA 1KCLA 2CESA 3VO0A 3VMOA 4H2CA 5AYIA 1W3LA 4AZCB 2DT0A 2ZUNA 3LPOA 1CGYA 3ZT7A 1XYZA 2V3EA 3VD7A 4CD8A 2J78A 3BAXA 5A95A 2E9MA 2WNWA 1UZ1A 5I0DA 5CSUA 1HX0A 3NUKA 1BG4A 1CYGA 4CVWA 3G6LA 3WQWA 3BAWA 1EGZA 2W66A 3FW6A 3II1A 1LG1A 3VNZA 3ZSSA 1HN1A 4H41A 4MNKA 4ATWA 5DF0A 3BSGA 2W92A 5HXMA 2ZXDA 2E3ZA 2XVLA 4F79A 4GI9A 4PYSA 1LL6A 4AYSA 1VAHA 3AZSA 3HMCA 2WB5A 3NSNA 3SCTA 2XVGA 3NSXA 4JAWA 1UR0A 1BYAA 4U5IA 4U2ZA 4W85A 3W0KA 2WSPA 2ZWZA 3MUZ1 3AIBA 4NI3A 3POCA 1E6XM 4Z2GA 1GQJA 5IHSA 3ARXA 4KGLA 1SMDA 4CU7A 3RO8A 2ZXBA 3CPUA 2BY1A 5LA2A 5A6SA 1Q6CA 3KL3A 5E70A 4WSJA 2EPNA 4B16A 3K46A 4AZBA 1JZ6A 2J7HA 1QI0A 3IJ8A 4U5KA 3VIOA 4GPNA 2ZICA 2EJ1A 3RM9A 1VJSA 1W2PA 1W9XA 3W6MA 3A4XA 1AMYA 4JFSA 5BXRA 3ARUA 1FA2A 3WNKA 3G6MA 3BAYA 1C7SA 3CUHA 1HKKA 1E3XA 5TD4A 3WF1A 1UWIA 1IT0A 1E40A 4XZWA 4URIA 4JKMA 3HN3A 1SR0A 4AY1A 5DEZA 4PMNA 1GOKA 3WH9A 3IK2A 4HA1A 4FLSA 1NM9A 4BQ3A 4PMXA 1HF6A 1UR8A 2MANA 2WMIB 4D6IA 2FHFA 2X05A 1CENA 5LYRA 1NWUA 1SFSA 3W53A 1G0CA 3J7HA 3VGDA 1WZMA 3OZOA 1CNVA 1GHSA 1UH4A 4WKAA 2PBGA 3MV11 4A4AA 3UG5A 4W86A 8A3HA 4J7RA 3RJXA 3VGFA 5FIPA 3PBGA 3LMYA 3VGHA 2YJQA 3N1AA 4MPKA 1XCXA 4DM1A 2VTFA 3RMEA 1KFWA 1GOOA 1JZ8A 1EXPA 5A6AA 3WQ4A 4UZSA 3BGAA 3A6OA 4R27A 1RP8A 4JZ5A 4W8AA 1VJZA 2WXDM 2E0PA 1TR1A 4TTUA 1OIMA 4LYRA 1OM0A 1HL9A 1OSEA 1UOKA 1MW0A 2XG9A 5LA1A 2BY3A 1GZJA 5AY7A 4OKDA 3ARQA 4AWEA 1GQKA 4S3JA 2GDUA 2XVKA 1UWQA 5CGTA 2BVDA 1ZBVA 1TVNA 1Y7VA 3UG4A 1B3WA 3BLKA 2ZX7A 1WB0A 2ZWYA 5C8BB 3W38A 2OWXA 5DFAA 4AD5A 2PWHA 1H4PA 1HKIA 1VEPA 1YHTA 4W88A 1GONA 3AS1A 1GOQA 3K1DA 4PUDA 1UKQA 1H41A 4ATLA 3A47A 1JZ7A 3VD3A 3WEMA 1W1TA 5BXPA 1Q4NX 2EPKX 1U30A 1QPKA 2WZIA 5I2UA 5CG0A 1QNRA 1EA9C 1ODZA 3SEPA 4HMEA 1E43A 1DWFM 1WE5A 4DWSD 4DM2A 4BCEA 1A3HA 3CHDA 3OGSA 4CCDA 3NJ3A 1JZ3A 3KWXA 1G9HA 3UR8A 1JNDA 4V2XA 2FGLA 2NT1A 5BYWA 1BHGA 4R5EA 3AHVA 3GXDA 3PZGA 2Y5EA 1FHDA 1WDPA 3VM5A 2WHMA 2YKKA 2UY3A 2GK1A 4PTXA 4DWSB 2FDMA 1JZ2A 1Q6FA 1HJWA 3VTRA 2CIPA 2WVVA 3VGEA 2C0HA 1UKOA 3MMUA 5AC4A 4UZUA 3L4TA 1DWJM 4LPCA 2Y8VA 3SCWA 4XUYA 3GNPA 4OIFA 1W32A 3MV01 4CN6A 1X6LA 3CUGA 3WL1A 1DWIM 1V6VA 3LPGA 5IHRA 1NWTA 4D1JA 3U57A 3IJ9A 2W4XA 4WIWA 3AMDA 1JYNA 3VGBA 4L4OA 3WUEA 4M82A 2J8GA 2ZIDA 1PZ3A 2VCCA 3TP4A 1XCWA 2GK1B 2VVSA 2Z1KA 3AZTA 4C7GA 5F7UA 1J12A 4EK7A 3VX0A 1JG9A 3WIJA 3BC9A 1B30A 1OB0A 5IFTA 1Q6EA 3VIHA 3AROA 3ZO9A 1H11A 2O9OA 4ZEPA 1EHNA 2PWGA 2J74A 1FH9A 1PJ9A 3ZJKA 1KXVA 2D2OA 2AMGA 3TTOA 1ISWA 1QBAA 5GNXA 4JL1A 5IDIA 1E15A 1EH9A 2WPGA 2D0FA 1JF5A 1G1YA 4M24A 1E6QM 2BVYA 3NSMA 2QF8A 4MADA 4AIEA 2J8FA 3BAKA 1V02A 3GXFA 4MB5A 2WYSA 3POHA 4Z2KA 4GI6A 5A2BA 1UKSA 1MFVA 3U5UA 1WZAA 5M5DA 2WAGA 4RL3A 1XD0A 2QHAA 5D9PA 1OT1A 3BLPX 1DWAM 3PZNA 4YPJA 3VIPA 2WANA 4EAMA 2AAAA 3SCPA 3S6TA 3DHUA 1UKPA 2VC9A 1D2KA 4IISA 3VD5A 1V3IA 4UR9A 2CKRA 2ZX8A 2WWCA 4CU6A 1GW1A 4CCCA 3W4RA 2J7DA 1CECA 1NOWA 4QDMA 4D6CA 2A3AA 1KXTA 4Z2HA 5GPRA 3AS3A 1KBBA 2YL6A 4WK9A 2VR4A 2DH2A 3UERA 1M01A 1TCMA 1W91A 3ALGA 4GZIA 2XPKA 4LX4A 1V6YA 4CVUA 3VD9A 1ZJAA 1TMQA 3F4VA 2UY5A 1E9LA 1ED7A 3OA5A 1LF1A 4HPHA 1BSIA 7CGTA 1WP6A 1BTCA 3GXMA 3N12A 2VRJA 1BVZA 3FY1A 4AMCA 1G01A 5BRQA 3HU7A 2ZX5A 2F8QA 3AXXA 5A69A 3GXIA 1C91A 2WHKA 1EO7A 4W7WA 2Q8XA 3MO4A 4QAWA 4BQ5A 4GI8A 4PTMA 1FP9A 1KWGA 1NWSA 2GFTA 2WMKA 4HU8A 1QNOA 4MNJA 3LPFA 4KWUA 3WMCA 4PMOA 3WENA 3TA9A 2BXYA 3WNOA 2J79A 1VEOA 2A3EA 4CGTA 2D3NA 4TTGA 2QMJA 2JIEA 3BSHA 3WMSA 5JIPA 3AI0A 4M29A 2VMFA 2CBUA 4BA0A 1I1XA 5A8MA 3T2QA 3WBEA 4J27A 1W1PA 1UZ4A 1YQ2A 5M3WA 2OSXA 3EBVA 4CCEA 4JKKA 2A3CA 4UQ9A 3WBAA 3L4YA 2YA1A 1ZBWA 4V28A 1QHPA 1LL4A 2J47A 1V0KA 4LQ1A 1E6ZA 1UD4A 4QLLA 1QBBA 2X8RA 2G3NA 1IZJA 3CHFA 1NP2A 1WDSA 5FCZA 4PTVA 4GXPA 5HBFA 1W3KA 2ZX9A 1ZL1A 3ARZA 2UY2A 3PHAA 5ABEA 2WW5A 4F9JA 3ARVA 2ZUSA 5CLTA 1GNXA 4YHEA 2CXGA 2GJXB 4XB3A 1GVYA 4IPNB 1PPIA 4B3KA 2Z1SA 3NCOA 1E3ZA 4W93A 3CZGA 3WN6A 5M03A 4GO9A 3PZIA 1AQMA 1ZJBA 2EPLX 4F66A 2X0HA 2AOSA 1G5AA 2FHBA 1CGUA 2O9TA 1K6AA 2W5FA 3N9KA 4E2OA 4UFKA 2CHNA 1H3GA 1OD0A 1PIGA 1US3A 1EDQA 5CSYA 2YDSA 1QHZA 2G41A 1JGIA 3OLEA 2YLLA 1BFNA 2WBGA 5A8PA 3BXWA 2WC4A 4UNIA 2JE8A 2VCBA 4HOXA 4PSPA 4V27A 3S2CA 1VENA 2WK2A 5D9OA 1UWUA 2J7EA 4D72A 3BMWA 2DT1A 3B8SA 4WKHA 9CGTA 2WCSA 3VGGA 4GZEA 2VCAA 4NZCA 5I24A 4CU8A 1TVPA 2CYGA 4PMQA 3VIFA 1K9FA 3VM7A 1EIBA 1L8NA 1XYFA 2IXVA 2NSXA 1J0JA 5E0CA 1HP5A 1QNQA 2VL4A 4P8VA 3AYSA 1B1YA 1MFUA 3QGVA 3AFBA 1V6XA 3UESA 4OZOA 3PZTA 3MS8A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1LM1 A;  4HA3 A;  4PFH A;  3EDF A;  3ANU A;  4W9T A;  2XH0 A;  3WDP P;  1CB7 B;  2AMX A;  5C7V A;  3CZJ A;  4IPX A;  1R7A A;  4QSF A;  4W87 A;  3N3M A;  3WDQ A;  4HYV A;  1EPX A;  4EE9 A;  3JVA A;  1YXY A;  4ZPV R;  4BF7 A;  3CV1 A;  5FEP A;  3W1M A;  1FQ0 A;  5E5C A;  4OJ6 A;  4AD0 A;  2WVV B;  2G97 A;  6XIA A;  3W73 A;  2NV1 A;  1O5R A;  5AHL A;  4P7R A;  2XP9 A;  1B0I A;  4LNC A;  1EJT C;  3APG A;  3UI6 A;  3WF0 A;  1UG6 A;  1XUU A;  4C65 A;  1K9E A;  4X3Z A;  2Z24 A;  3WF2 A;  1Z48 A;  1SGJ A;  3O9N A;  2FVM A;  3GDR A;  3PZO A;  4L61 A;  2E6F A;  1TRI A;  4DUX A;  4M80 A;  1WDR A;  2V8Z A;  4JL2 A;  4XAZ A;  3M9Y A;  3RND A;  1K4G A;  5BU9 A;  1MQP A;  4C6L A;  2HXU A;  3CIV A;  3W7J A;  5GQB A;  1MQR A;  2G96 A;  4YN5 A;  1GKR A;  2A3H A;  4A8N A;  2D0G A;  2J7B A;  4JFM A;  2OU4 A;  3RLV A;  3FA3 A;  3VNY A;  1KBK A;  1VCG A;  5H91 A;  1QU4 A;  1V5X A;  4KH2 A;  1I75 A;  3UVA A;  4MTV A;  1HJX A;  3W7G A;  4IHC A;  3SO7 A;  2X09 A;  3QLL A;  5I6S A;  3PC0 A;  3TXZ A;  5FES A;  2FZM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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