1E6ZA

Chitinase b from serratia marcescens wildtype in complex with catalytic intermediate
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights Into the Catalytic Mechanism of a Family 18 Exo-Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
molecule keywords CHITINASE B
total genus 165
structure length 497
sequence length 497
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2000-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1e6zA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1e6zA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e6zA01
1LG2A 1VJZA 3WNLA 2XYLA 1GQJA 1DEDA 4TTGA 1QNQA 4UQAA 1C3FA 1CXFA 5BCAA 4W84A 1PAMA 3PZIA 3CH9A 1ZBWA 4H04A 5HPOA 2BVYA 4HZ7A 3GYCA 1J01A 1AIWA 3N9KA 1FA2A 5CXPA 5JBDA 3CZKA 1QNRA 4U33A 2W67A 2F2HA 3MSDA 1ZS2A 4HPGA 1PX4A 3KL0A 4AZCA 3CTTA 2EPOA 2YOCA 2J79A 2XFRA 2CNCA 5ECUA 2XHYA 2XM2A 2VNCA 1HVXA 3GZAA 1BTCA 1QI5A 4U2ZA 2YBTA 3CPUA 3QOMA 1UQZA 4GZEA 3VIPA 1VEOA 5AYIA 1BYDA 1MYRA 5F7UA 1D3CA 3BC9A 5FKYA 1G1YA 3BAJA 3ARRA 3ZJ6A 1UKPA 2IUZA 1VB9A 1UUQA 4D72A 3IAQA 5CPTA 1IT0A 3IANA 3AMCA 3A47A 4A3HA 3VDHA 1JNEA 4CD6A 2Q8XA 3AZRA 4GZJA 2WSPA 1O7AA 3JUGA 4CD7A 1UKOA 3E1F1 4KMQA 3SUVA 4V2XA 3K1DA 1W3HA 3KL3A 3IJ7A 4GXPA 1XSJA 1EGZA 2OWXA 2BXYA 5D9MA 5HNNA 1JZ8A 1DWFM 3B9AA 4CN6A 2VZTA 4MPKA 8CGTA 5M03A 2VI0A 1GQLA 4BZYA 1V6UA 3PZOA 1V0MA 2J4GA 4WJXA 4TTUA 2PWHA 3EDKA 4W5ZA 5BYWA 2YDRA 1BPLB 3L2LA 3ALFA 1UD2A 3ZR6A 1KQYA 1UWQA 1BSIA 1ZBVA 1U30A 2WBGA 4JFVA 4AISA 3SUWA 4X0VA 4DUWA 5C71A 1E1FA 1UZ1A 1SYTA 1HKMA 1UA3A 1C91A 1NWRA 1UYQA 2WWDA 3T09A 3WMCA 1XV8A 3ZJ7A 2YDQA 2VQUA 5D9PA 4UFMA 2PWEA 3DYMA 1LJYA 1ZL1A 3T2OA 4J28A 1GPFA 4BQ5A 3PZQA 1PZ3A 4CUCA 1ECEA 1XCWA 4UQCA 1GJWA 3GH4A 1GOWA 3EBVA 2WHKA 2C7FA 4WLCA 4WIWA 2E9BA 1K6AA 1V02A 3QGVA 1QNPA 2J7DA 2WMJA 3WQWA 2GDVA 1B31A 2ZUVA 2XVPA 1SFSA 2Y4SA 3VOCA 3VD7A 3ARSA 1QI0A 1G01A 2C8NA 3N15A 4M80A 4EK7A 5IDIA 1C7SA 3AIRA 3VD9A 3BSGA 2X1IA 1E6QM 2EEXA 3HN3A 2D2OA 2VX5A 3FHQA 1E4IA 2XVNA 3VX0A 4HA3A 1NM9A 3ALGA 4JAWA 2PWDA 1AQMA 1DWAM 1WZLA 2EO7A 3AHVA 5IFPA 1EDTA 1WZMA 5AC4A 1JAEA 1IZJA 8A3HA 4KWUA 2EBNA 4QP0A 2FHFA 1KXTA 4JCMA 1XC6A 3M46A 3WF1A 1ESWA 1B3XA 1J11A 2WBKA 1TZ7A 3EDFA 2JEPA 3ZT6A 2WAGA 2QMJA 3WMBA 2A3BA 4PMQA 1J9YA 2ZX5A 4UOJA 3AS2A 4LXFA 3SCSA 2G4FA 1VFUA 3A4XA 1UH3A 1GHSA 2ZUMA 1EOKA 2V3GA 1QI4A 4MJ2A 1BYCA 3SCUA 3BGAA 3SEPA 3NDYA 3T08A 1PEZA 2G3IA 1XD1A 1HJUA 2J25A 3PHAA 3PZTA 3AXHA 3PTKA 1EDGA 4KH2A 1JD7A 1E1EA 3PBGA 5JBEA 2Y24A 3SIMA 2O9OA 1XYFA 3AMDA 4GI9A 4N0RA 4MAVA 3MUAA 2YL5A 1JZ7A 5BXSA 5CSUA 2J7HA 1M01A 2QMKA 3KE0A 1ZU8A 2VRKA 1IZKA 2WW5A 1GOKA 3WNNA 1MXGA 3FW6A 2VT0A 3WIJA 2YA0A 3VIKA 4OUEA 3BLPX 2VCAA 1HIZA 1GW1A 1VBUA 4GIAA 3K46A 2ZIDA 4E2OA 3OA5A 1E43A 2J8GA 2ZX6A 3UETA 4JFSA 3AZSA 1V02E 2Y5EA 4QCEA 2NT1A 5LA0A 4M81A 3SURA 5A2BA 3SCPA 1NOWA 3NIYA 3VU2A 1CXLA 5CQ1A 5JIPA 3EMZA 3QHOA 4NRSA 4JHZA 4W85A 5E0FA 1MW3A 2GUYA 3ARUA 1AQHA 4JKKA 7A3HA 3T2QA 4AZCB 1X1NA 1V3IA 1V3MA 1VF8A 4P8VA 4S3KA 1WDPA 4AC1X 3AHZA 1LF1A 3U5UA 1W9BM 2BFGA 1MFVA 2E9LA 3B8SA 3RJXA 2RTSA 5BXPA 3M07A 1R87A 1F4HA 3AOFA 4P7LA 3TOPA 4UCFA 1W3JA 4D1JA 2WYSA 1GVYA 4A3YA 2BVDA 4CCEA 2CYGA 1MQRA 2FH6A 2W62A 1VFOA 2RGMA 1OIMA 1R85A 2Y2WA 4M24A 2CBUA 3WDQA 4WSKA 1DWJM 4B9YA 3MV11 1E6ZA 2JF7A 1MVYA 1Q4NX 2BV9A 1JDDA 3B9DA 5ABEA 3LPPA 2DSZA 2CESA 4BQ3A 3SCNA 1CGTA 3DC0A 1Q6EA 3CIVA 5HOSA 2PWFA 1J0KA 4KRTA 2EPLX 3WH8A 6TAAA 2XFFA 3A4AA 3L4VA 4D1IA 4WKHA 4XX6A 1JNDA 2ZUSA 2VL4A 3HMCA 1VENA 4Y7EA 3VIFA 4W88A 3VDBA 1JGIA 2A3EA 1ZB5A 2JIEA 3SCRA 4DM2A 4RL3A 3W6LA 4M29A 4AZ6A 1WNOA 1W9UA 1C8XA 4XV0A 1PX8A 2DH2A 2YBUA 4DWSD 3CHEA 1ZBCA 4J7RA 3SCWA 3U7BA 2EPMX 4MDOA 3KZSA 2AOSA 1CXHA 1R7OA 2JE8A 3F5JA 3KEHA 1KBKA 2OYLA 3VIIA 3NDZA 4ZENA 2WZIA 3U5YA 5AYBA 3WD0A 3VGHA 4Z2IA 2PB1A 2WC7A 5EB8A 5CPSA 3ZMRA 3WD3A 1FFQA 1LWJA 4ACZA 4XUYA 4UFHA 3WQ6A 3AROA 1LLOA 3CMJA 4AMCA 2W92A 1GHRA 5D8WA 3MANA 3ZQ9A 5IXEA 2CBIA 2QPSA 4XZWA 4W8BA 4LYQA 1QHZA 1S46A 4PMOA 3VUPA 1OGBA 2GK1A 1UR0A 4R5EA 2VO5A 3POHA 3VM5A 3F4VA 4UQDA 4MJ4A 1OD0A 1UKQA 3S6TA 3WF2A 1CXIA 1WKYA 3GXIA 2X2YA 5EMYA 5IHSA 2V3DA 1QPKA 4CD5A 3WDIA 1TVNA 1M04A 2VRJA 1W1VA 4PMUA 2FGZA 1V3LA 3UG5A 2DDXA 1JF6A 4MNJA 3W27A 1G5AA 2VVNA 1BGGA 3A6OA 4V28A 1ISXA 2VCCA 4CGTA 4IM4A 1KR1A 2VC9A 1V0KA 1ZJAA 1B9ZA 2DIJA 4HOXA 2EPKX 2FH8A 3AIEA 3L4WA 2FGLA 1TMQA 4CKQA 3ARYA 3DYPA 2ZUNA 5BRQA 3SCQA 3GTNA 1NWSA 3GNPA 4GKLA 1B0IA 4FF5A 3AFBA 5D9OA 2WMKA 2UY3A 4JFUA 1XYZA 2XJ7A 3OLIA 5KZ6A 3VGDA 4MB1A 4ZXOA 4HMCA 4HA4A 2CITA 4QLJA 5D4YA 3WDPP 6CGTA 1BFNA 3W6MA 2ZWZA 3CZ8A 3POCA 3CUHA 4P8UA 3UR8A 3ARPA 4JL2A 1UWIA 2EJ1A 3NSMA 5E6YA 3VO0A 3K4AA 4WSJA 3ZR5A 3T2PA 3THCA 4E8CA 3UCQA 5D8ZA 1FH7A 2CPUA 1CEOA 1BYAA 2WHMA 1WO2A 4M82A 4U3CA 1J0JA 3VPLA 5A6JA 2ESCA 3B9EA 2YL8A 4LYRA 2NW0A 1V0LA 4U31A 1B3VA 4PMYA 3I3EA 3AMKA 1UG6A 1UZ4A 5JIWA 4PN2A 1VFFA 2VOTA 3I3DA 4PUDA 4U5KA 4U3AA 4UQ9A 1CYGA 1B1YA 2X0YA 3NUKA 3WF3A 4W8AA 1W9PA 4FMVA 2J62A 1E71M 3DHPA 1KCLA 3VGFA 5BXRA 1PJ9A 3K8LA 2NSXA 5CZKA 3PZNA 2QF8A 1W3LA 3VGEA 3WENA 4AD1A 4IUGA 1H49A 1ISYA 4URIA 3EDDA 1HL9A 4H8UA 3ARXA 2ZX7A 4FLOA 3SCVA 4CCDA 3AS3A 2X05A 2F61A 5HPCA 4PSPA 4PEEA 5CPQA 1FP8A 5FOOA 1TA3B 3GNRA 1Z32X 3SCTA 4TUFA 1EHAA 3WEZA 1EH9A 2ZE0A 2VX4A 1LL4A 2VQTA 3BAYA 4P7QA 3ARWA 2EXOA 1V3HA 4P7RA 4AZGA 2YKKA 3A3HA 3FAXA 1NP0A 3GH5A 1E56A 2B31A 3EDJA 4OJYA 3MU7A 2BY2A 3ZSTA 4ML4A 1OGSA 4M1RA 4Z2JA 5A2CA 2CHNA 3TTYA 2WZEA 1W9VA 1TR1A 2OSXA 5E9AA 4E8DA 5I2UA 4MDPA 1OB0A 3WNPA 2V3FA 3O6AA 2BXZA 3ZM8A 5A1AA 1E0WA 2XVKA 1VBRA 2CETA 4MB4A 3WF4A 5A2AA 1EA9C 1E6RA 3AXXA 2QLYA 3AHTA 2CKSA 4AY1A 4GPNA 3WQ4A 2PWGA 3N18A 4H8VA 1MFUA 1BAGA 1V03A 4OBSA 5AY7A 2HVMA 5A8MA 1GQKA 1M53A 3AYRA 3G6MA 1WAWA 2OLHA 1H4PA 4ATLA 2VZOA 2VURA 3A4WA 2DSKA 5FL0A 2J77A 3M7SA 2IXUA 3PZUA 1J18A 1GONA 4CVUA 4DM1A 3MUZ1 4ACZB 3RM9A 2YA2A 1WZKA 2ZXQA 3W82A 3AQUA 2JF6A 4W93A 3NCOA 1K9TA 1N82A 1SMDA 1IV8A 5A94A 1AVAA 1EO5A 2D24A 3W38A 1GCYA 2GK1B 4MNLA 4UFJA 3EDEA 2YLAA 2ZICA 1JDAA 4PMVA 4MADA 4HP5A 4FLSA 3LPOA 1SR0A 5LA2A 2UWFA 1P6WA 4UZSA 5CJ5A 1WZAA 4QFUA 2DSVA 4AIUA 3VGGA 2JFEX 4ACYA 2DH3A 3BXWA 3BCDA 5GNYA 5HXMA 1OD8A 5DFAA 1UOKA 4W7WA 1MW1A 2D0GA 3TTQA 2WZHA 1QHOA 2ZX9A 4PMRA 5A8NA 3VD3A 1HNYA 1UWTA 1HP5A 2YIHA 4OKDA 3VMNA 3WNOA 3MMDA 1OT1A 4D6GA 2D0HA 1UA7A 3W25A 3T0AA 4UR9A 2E4TA 3QOKA 3FY1A 4BA0A 1XH0A 2WNWA 3KWXA 4H2CA 3J7HA 4JHOA 5A6KA 5A6SA 3WF0A 1JXKA 3W4RA 4GZIA 2V5DA 1KFWA 1QI3A 1B3WA 4BQ2A 4UQEA 1XRVA 1WDRA 3VD4A 4U2YA 2PC8A 3OGVA 1E9LA 3GM8A 1KGUA 3FN9A 4TVUA 1TE1A 4PMXA 4S3JA 2Y8KA 1QBBA 1Q6DA 1I1XA 4J3VA 2A3CA 2WCAA 4UOZA 4WKAA 7TAAA 2XG9A 1UR4A 5M17A 1J12A 3N13A 4L4OA 4V27A 1CLVA 2G41A 2E8YA 4CVWA 1L0PA 2W63A 3W24A 1CXEA 2PBGA 4BCEA 3CBWA 3OLGA 4AEEA 4KGLA 3S2CA 3OIHA 1FP9A 3WH9A 4W7VA 5BRPA 1HT6A 3NYDA 2VZUA 1CENA 2WVUA 3OLDA 4WK9A 1HJWA 1E5JA 1C8YA 2W4XA 4JFWA 5EFDA 4CU6A 1CGUA 4UFLA 1FHDA 4PBGA 2BHUA 5AC5A 4PMNA 5LYRA 2QV4A 2GJXA 4DWSC 1UD5A 1FH9A 2ZUUA 4FLQA 1D2KA 3U7VA 2J78A 1PZ2A 4W89A 4AXNA 1VAHA 1MQQA 3WUEA 4HOWA 1E3ZA 1JYWA 2C0HA 3RJYA 1PIGA 3L4ZA 4PYSA 1NH6A 1BG4A 3VNYA 3WH5A 3AIWA 2G3MA 4UOQA 2ZXAA 1JYNA 3ZO9A 3L4UA 1YHTA 4TX8A 4F8XA 3VILA 1B3ZA 3AJ7A 1TA3A 1FOBA 1QW8A 4MNMA 2O9PA 2WXDM 4X0NA 5A6AA 4ATWA 3WY1A 1OINA 1UD4A 4JCLA 2Y8VA 2VVSA 5IHRA 5I24A 3U57A 4P8XA 2WMFA 5DO8A 3LMYA 1E40A 2DSWA 1JL8A 3TTOA 1HXJA 2D3LA 3T0BA 4TX6A 1TFVA 4M8UA 4NI3A 3LPFA 4HZ8A 4CD8A 4D6IA 5TD4A 1EO7A 1PIFA 1UR2A 3AHXA 3BAXA 4F9DA 5A69A 1E72M 3AXIA 1QW9A 3SCOA 3O9NA 3GXMA 3IK2A 4TVDA 3L4YA 1NP2A 3QR3A 1AMYA 3W28A 2WVSA 1OM0A 1JZ4A 3D5HA 1UHVA 3OBAA 2WCSA 4AWEA 3FAWA 1OT2A 4CCCA 3OLEA 1M03A 3BH4A 2D3NA 4B15A 1E15A 3ARQA 4ZE4A 1ED7A 3BAIA 3VIHA 1CDGA 5JUVA 4C7DA 2BHYA 3OGRA 1KQZA 1GNXA 1JG9A 3D3AA 2XFYA 1EOMA 5EBAA 5BXTA 5CLWA 1NOFA 2XTKA 3GBDA 1XCXA 1HJQA 4QAWA 3N04A 1ITXA 2VR4A 4B3LA 2OYMA 4OIFA 1WB0A 2DPEA 3CHFA 2J7EA 3IJ9A 4IPNB 3WNKA 4AZ7A 1W2PA 3WDHA 3CZGA 5FIPA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2VRQ A;  4PUE A;  1XGZ A;  1E4L A;  1W9X A;  4ATD A;  2DSU A;  1MXD A;  4W86 A;  4Q22 A;  1C7T A;  1CLX A;  2XVL A;  1GOR A;  3SUS A;  1Y7V A;  3K8K A;  1GOM A;  1US3 A;  3MSG A;  1YQ2 A;  4MB3 A;  1DWG M;  4GIN A;  2WVV B;  2G8Z A;  1SMA A;  4W5U A;  1BVZ A;  1JFH A;  3UR7 A;  2XPK A;  3L4T A;  3WEO A;  2O9R A;  3TA9 A;  2YDS A;  5C8B B;  4AD5 A;  1V6X A;  2WHL A;  2J47 A;  3AS0 A;  5CGT A;  4H7V A;  1O6I A;  5C70 A;  1UWR A;  5E6Z A;  3VX1 A;  3M6D A;  2BVT A;  4LX4 A;  1EIB A;  1WCG A;  4JIE A;  4JKL A;  4D6E A;  1E6N A;  2V5C A;  3EMQ A;  1CGY A;  3CUF A;  1KWG A;  3WD2 A;  2ZOX A;  4GI8 A;  3RM4 A;  1UR8 A;  1JZ3 A;  4Z2G A;  3WN6 A;  3WQ5 A;  3AML A;  4OZO A;  2QPU A;  2VJX A;  1JD9 A;  1H0I A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1LTD A;  3IIP A;  1HL2 A;  1BPL B;  2YDR A;  5BYW A;  1P7T A;  3ALF A;  1UD2 A;  4I7W A;  5K7J A;  3TQ0 A;  2GQA A;  2WBG A;  3WBW A;  4IBK A;  4DUW A;  1E1F A;  1UZ1 A;  1XLK A;  4A05 A;  1HKM A;  5LXX A;  1ICQ A;  5FF3 A;  1C91 A;  4MKV A;  2ZA3 A;  4XZ9 A;  3T09 A;  2Y2J A;  3ZJ7 A;  4Z1C A;  2YDQ A;  2VQU A;  2IKI A;  5MF5 A;  3EB2 A;  1LJY A;  2LGO A;  2Q8L A;  1VH7 A;  1XLA A;  5D30 A;  3BLO A;  4Z08 A;  3UPM A;  3IJD A;  5AZ1 A;  3TSB A;  2Y1H A;  4O1E A;  4WIW A;  2IF4 A;  4NJH A;  2WMJ A;  2G4J A;  1YDO A;  2GDV A;  1B31 A;  2XVP A;  3VD7 A;  2FIQ A;  4C1K A;  4LAV A;  1QI0 A;  3ANV A;  2FVK A;  3E0F A;  3N15 A;  2WZT A;  4ZB2 A;  1OYC A;  3HUR A;  3TLQ A;  2I5Q A;  1C7S A;  3BSG A;  2X1I A;  2Z29 A;  5BPV A;  3MO7 A;  1A7X A;  2D2O A;  1LOS A;  1K7F A;  4Q8M A;  3PAO A;  4HA3 A;  4HU3 A;  1NM9 A;  2G50 A;  3ALG A;  2QAF A;  4LY4 A;  4Y9P A;  4LUT B;  2PTZ A;  5I3F A;  2DP3 A;  4G56 A;  3TA6 A;  1WZL A;  4GQG A;  3GPK A;  4QP0 A;  7TIM A;  1XC6 A;  2AL2 A;  3KTX A;  1ZEN A;  1J5S A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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