1GOIA

Crystal structure of the d140n mutant of chitinase b from serratia marcescens at 1.45 a resolution
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVNIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the D140N Mutant of Chitinase B from Serratia Marcescens at 1.45 A Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords CHITINASE B
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2001-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1goiA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1goiA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1goiA01
1JI2A 3VM7A 4FLQA 1X6LA 1JFHA 1VRXA 2CERA 2XFRA 4AZ6A 4DWSC 4OUEA 2E4TA 5KEZA 2RGLA 2WW5A 3MU7A 3WF3A 2PWGA 3THDA 1W3LA 1CXEA 3WD4A 3GTNA 3VGHA 1UKQA 1H4PA 1EDGA 4PMUA 1MYRA 1NOUA 5DT5A 4J3TA 1H1NA 4M81A 4WKAA 4LGXA 2W92A 4CD4A 1EHNA 1KGWA 1GONA 1HJWA 5BXPA 1JZ5A 4L4PA 2G4FA 1V6UA 3CZLA 1E5NA 2WHJA 5BCAA 3QGVA 5F7UA 1WDRA 5I2UA 3OLIA 1UH2A 1J10A 3KL3A 3U57A 4MB1A 3T2OA 2DIEA 1B3ZA 1C8YA 1UR1A 3GXIA 4BCEA 2V5CA 1HJQA 4HZ6A 1TFVA 2WVTA 2BHUA 1KXHA 4XUYA 4AZHA 3W6LA 1ODUA 1MFVA 5EFDA 2X8RA 5A8NA 3K46A 1E6PA 3L4XA 2JFEX 2EPLX 5A94A 4PUEA 2ZWZA 3VU2A 3ARQA 1V3IA 1B3XA 3U5YA 1XH0A 4HA4A 1Q4NX 3WUEA 1XV8A 3AIBA 4RL3A 1CBGA 2EBNA 2E9BA 4QDMA 2WXDM 2X0HA 1H49A 4NZCA 5IDIA 1VJSA 1RP8A 2F2HA 4BQ3A 2Z1KA 4B15A 1CEOA 3A3HA 3W24A 3A4XA 4PMOA 1KWGA 4PMVA 1UD3A 3K8MA 1TCMA 3WDIA 2J78A 1V3KA 1UD4A 1WO2A 1EO5A 1QHPA 3AIWA 3OZOA 4OKDA 1GQJA 2DGAA 3PZTA 3WH9A 2DH2A 4QAWA 4CUCA 4WF7A 4CD6A 1LWJA 3MSDA 2D49A 2WMIA 1HP4A 4WKHA 2QPSA 2GJXA 3NJ3A 1TVNA 3MMDA 1W9XA 3PTKA 3ALFA 3LPGA 4HMDA 3OG2A 1JDCA 4AY1A 2OYKA 1JZ4A 4CD7A 4GXPA 2OSWA 2VURA 1JL8A 4J28A 1VEOA 2QMJA 1CGUA 3VMPA 4D1JA 1NWSA 4X9YA 1D2KA 2XVGA 5E9AA 3W81A 5GNYA 1E0WA 2W62A 3BAKA 1E6RA 1UHVA 4M29A 1W9UA 4QFUA 3ZMRA 2VR4A 5AC5A 4Q22A 5A6AA 5CLWA 4K68A 2PWHA 2CXGA 5E0FA 1E43A 5C70A 4UFIA 3NSMA 2BNJA 4J3VA 2VZSA 1J18A 1UH3A 1KXQA 3F5LA 3ARZA 6A3HA 4OIFA 4OBSA 3FN9A 4OOUA 1NOWA 4PSRA 1B31A 1VF8A 4P7OA 5ECUA 2CNCA 4DWSD 1JF6A 4HTYA 3WDJA 3CZ8A 4AIOA 5ABFB 1WDQA 3MV01 4UQCA 4AZBA 2BY1A 4CKQA 3CZGA 4AMCA 1WAWA 2XVPA 5FIPA 4MNJA 1EDQA 1TA3A 4PCTA 5JUVA 4WJXA 1A47A 3RM9A 4F8XA 4UR9A 2GJPA 1OT2A 2DT1A 5JBFA 3WNPA 3RIKA 2WNWA 1OSEA 1H41A 4GI6A 2E8ZA 2IXVA 3UETA 1UZ1A 2VZVA 4JAWA 2WSKA 5I0DA 4DWSA 3AZSA 3II1A 2OSXA 1SYTA 3B9EA 1IT0A 4AZ5A 3ECQA 3VIPA 1XCXA 4PTWA 1JYVA 3AMCA 2WWDA 4L4OA 1G01A 3ZJ7A 4MNMA 3AXIA 5D9NA 3BXWA 1DWJM 1PAMA 4C7GA 2PC8A 3TA9A 4OJYA 3UG5A 1QPKA 4BQ2A 5TD4A 1GOQA 1R8LA 3K8KA 2VMFA 1JNEA 5HXMA 3VIMA 3L4UA 3PZVA 1DWHM 4D1IA 3EDKA 3WH8A 1MQPA 3SCVA 3MMWA 1BG4A 2WLYA 2FDMA 3W0KA 1PIFA 3FNDA 3AMDA 5I6SA 2ZXAA 4RE4A 4Z2IA 4HMEA 1FH9A 2EPOA 3MKKA 2DT0A 1KBKA 2WSPA 1JYNA 2O9RA 1UKTA 5HDRA 2V3FA 5BRPA 3L4WA 1D3CA 3AIUA 4W85A 1W91A 3WBAA 1B3YA 4M56A 4AXNA 3ZSSA 3VNYA 3K4AA 4FK9A 4YHEA 3AXHA 2VZTA 3DECA 2XIIA 1E0XA 2Y5EA 2EXOA 1H11A 4TTUA 2YA2A 1UYQA 4FMVA 1V6WA 2Q8XA 3FXYA 2V3GA 3IJ7A 3GZAA 1C8QA 4JFWA 1JAKA 3AHZA 3F4VA 4UQEA 5IHRA 2ZX8A 1SMAA 3VD7A 2GK1B 1J0KA 1W9VA 1EOMA 2OWXA 4GQRA 3RPMA 1QI4A 1GORA 4QP0A 1HNYA 3AIQA 2W61A 1FP9A 4AYSA 3T09A 2WBKA 2WAGA 4TVUA 4DUVA 4U5IA 2OYLA 5A2AA 2ZUMA 4A3HA 1C91A 3KL0A 2PWEA 2WM0A 1PX8A 3QR3A 4TX8A 3WQ5A 1JXKA 2FH6A 2D0HA 4MADA 1ZU8A 4N42A 2W67A 2CBVA 3L4ZA 3ARWA 3WMBA 2NT1A 3VIIA 3M46A 1E6ZA 1V3MA 5JBDA 3W26A 3W38A 1F4HA 5E6YA 5A6LA 1OCQA 2XPKA 1W1YA 1AMYA 2ZWYA 2D3LA 3L4TA 5CZKA 2DSUA 5IXEA 1BSIA 3HU7A 3BSGA 4TTGA 8CGTA 3WD3A 1GZJA 4BQ5A 5ABEA 1WZKA 1VFMA 3CZKA 3N11A 4PMNA 1V6VA 3MSGA 1LQ0A 1QBBA 3CPUA 3AROA 1TR1A 3NSXA 2J7DA 1UD5A 5D8ZA 3DHPA 2BVTA 4U33A 4JFSA 3VIJA 2JF7A 1NQ6A 5DFAA 2DT3A 4U3AA 1UR0A 3QOMA 4JL1A 1E72M 4QCEA 1OWQA 1BAGA 3S6TA 1W1PA 2CHOA 2UY5A 2DH3A 3AFBA 2VT0A 3ARYA 3E1F1 4AD1A 2YDSA 4D6GA 1G5AA 4AEFA 1B3VA 1UZ4A 3PZMA 5I3DA 3AS2A 4J3SA 1UR8A 2E8YA 2WVVB 3MMUA 3GBEA 1E3XA 3CMJA 1PX4A 4D6HA 1EA9C 4GINA 2ZXBA 4W87A 1JAEA 3VD9A 5EB8A 3ZM8A 4HA1A 2J8GA 1W9PA 1QI5A 3GBDA 3ZR5A 5D8WA 1KGXA 2O9PA 4DUWA 4JKKA 4U31A 3DHUA 3CH9A 1NP2A 3AMKA 2A3HA 3WUGA 3AICA 3A47A 4KGLA 4IUGA 2GDVA 5A8QA 2ZUNA 1SMDA 4YHGA 2QMKA 3VGEA 4AD4A 3CUIA 4W7UA 1TMQA 2VCAA 4UQDA 1E70M 1W9BM 1XH2A 4ACYA 2WVUA 3M7SA 2YA1A 1VB9A 2ZX5A 1PPIA 2ZE0A 3BH4A 5GNXA 4ATWA 4Z2KA 1JZ7A 1NM9A 4D6DA 3VVGA 1XRVA 2VZUA 2VVSA 4FLSA 1RD6A 2VO5A 4E4PA 4QLJA 4JCLA 1FH7A 1F4AA 1LF1A 3GH4A 2J25A 3ZJKA 2J8FA 3W27A 1JXJA 1EH9A 2XM1A 4MNLA 2W63A 1Q6EA 1U2YA 1Y7VA 1NOFA 4MNKA 4HU8A 5JIWA 1CXFA 2WK2A 4U5KA 2VVNA 1GOOA 4JKLA 4AZCB 1V3HA 3RM8A 1CGWA 3U5UA 4PSPA 1VFFA 4H8HA 3ZT6A 3JUGA 1W3JA 4ATDA 4UFHA 3CZJA 1CGYA 2WC3A 1BHGA 1QI2A 3AHVA 3U7BA 2OWCA 3VIGA 3EBVA 3PBGA 4PN2A 2YBUA 3NCOA 3CLWA 3SUVA 1EXPA 1GHRA 2X1IA 3RILA 1HJSA 4AIEA 3ARSA 1HKMA 2XVNA 3TTSA 3SEPA 4XZBA 3I3DA 5DEZA 2YDQA 4B9ZA 3DYOA 4W8AA 5BROA 3PN8A 2CKSA 1HN1A 2CITA 3WFZA 2VQUA 3I3EA 2W4XA 5A8OA 4AD3A 2VR5A 2CYGA 4CU8A 1NWTA 4TUFA 2ZUVA 2QHAA 2ZX9A 1LL6A 1PBGA 4Q7NA 5EMYA 4P7NA 1ZS2A 1MW1A 5CJ5A 1H2JA 4NI3A 3THCA 4XX6A 4ZE4A 1DP0A 3GH5A 3N17A 3WH5A 3PZGA 3PZNA 2PWFA 1GOWA 1H3GA 2RGMA 2G41A 3AJ7A 1V0KA 2F8QA 4BQ4A 2ZICA 3B9AA 3VILA 1TUXA 4CN1A 1ISYA 1E4MM 1NP0A 2NW0A 1W1VA 1HIZA 2X0YA 4TXEA 1GUVA 3NIYA 4HPGA 1HP5A 3WF2A 3CHCA 1G1YA 2DSVA 2WMGA 4IISA 2WKLA 3HN3A 1ZBVA 1K6AA 3DYPA 3WN6A 2Z1SA 3KWXA 2D20A 1LG2A 3VGFA 1UG6A 4YPJA 3T0DA 2YL9A 5IFTA 4HPHA 3WMCA 3WDPP 2Y24A 1B30A 2C0HA 3AS3A 3W6MA 4W86A 4CN4A 3VMNA 3WD1A 1DHKA 2FHFA 4RE3A 3OZPA 3W37A 4AD5A 3F5KA 1V03A 3WQ8A 4W8BA 5CPSA 4DUXA 4PMYA 3W82A 2JEPA 3VIOA 2DEPA 1ESWA 4W5UA 1JNDA 1OINA 3KZSA 1E4LA 1EGZA 4HMCA 1J12A 3NUKA 4PMXA 2XFFA 3HMCA 7CGTA 4CCEA 2J4GA 5CGTA 1ISZA 1L8NA 1FFRA 2VL4A 1VENA 5A2BA 3LPOA 1NWRA 4H8UA 1GQLA 2G8ZA 1VIWA 5DO8A 1DTUA 1VJZA 3WMSA 5A8MA 1WDSA 1QBAA 2PBGA 3SURA 3VO0A 3CUJA 3BAJA 4LQ1A 1M53A 3WQVA 3K1DA 4XV0A 1V02E 2VI0A 2BY2A 2J79A 3NDZA 3CGTA 4B9YA 5JBEA 3OGVA 4HZ8A 3SCRA 3IJ8A 4W89A 1ODZA 3W29A 1VFOA 1EO7A 1M04A 3VIFA 1E6XM 5I23A 1K9EA 3AHXA 1H0GA 1XGZA 4WSKA 2WMIB 3RJYA 5A6KA 4GIAA 3SIMA 1B2YA 2GJXB 2FGLA 4HOWA 2D2OA 3U7VA 1JDDA 1UD8A 1JI1A 1G94A 3DYMA 3VKKA 1JG9A 1RPKA 5A1AA 2XSAA 1JGIA 3RO8A 1ZL1A 2VX4A 3LPPA 3AZTA 1KCKA 1CNVA 4HU0A 4PEEA 3VD5A 3SCWA 3ZSTA 4R5EA 3RCNA 1LLOA 4X0VA 1GW1A 3SUWA 2XSBA 1DWGM 4M1RA 4UFLA 4D6CA 1CXIA 3PTMA 3FAXA 3A4AA 1V0NA 1MXDA 4QLKA 5HPCA 1V3JA 1V3LA 2BV9A 2DIJA 2YIHA 1CXKA 4GQQA 1ZBKA 1I1XA 3WD0A 3SCTA 1CPUA 1KR1A 1E55A 1P6WA 2VRQA 4JHZA 5LA1A 3A4WA 1OGBA 3GNRA 1EHAA 3SCPA 4GO8A 2VJXA 4PUDA 2MANA 4V28A 1KB3A 3IK2A 5CGMA 4DM2A 5CG0A 2A3BA 1IZKA 4WLCA 3WNLA 3D5HA 3MS8A 3IAQA 1BYAA 2GJRA 4D6JA 4F9DA 2PWDA 4U3CA 4NSBA 4BF7A 1FHDA 3ZT5A 5AC4A 3IANA 1V0LA 4HP5A 4NF7A 1XD0A 1HJUA 1DEDA 3T08A 3AYSA 1XSJA 3M6DA 3ZJ8A 3ZOAA 2CPUA 2YL6A 5BWFA 1CENA 4ML4A 2JE8A 4H41A 1IV8A 5GPRA 3EYPA 5FL0A 4AIUA 1QW8A 1TA3B 1CLXA 2BHYA 3SUTA 3AIVA 1US2A 3SCNA 1GHSA 1OD0A 2VZOA 1H0IA 1HKIA 1B90A 3NYDA 4FLOA 4PMDA 2QV4A 1FHLA 1ECEA 3IJ9A 4B3LA 4EANA 3AHTA 4W7VA 1CWYA 5CLTA 5I78A 3RM4A 4AD2A 4DWSB 2YBTA 3GM8A 1KWKA 3ZQ9A 5D9PA 3AZRA 1B9ZA 1JD7A 1VFUA 7TAAA 2DQXA 4MB3A 2WMFA 3BMVA 3CUGA 5FKYA 3ARVA 1CDGA 1GJWA 3PZ9A 4P8XA 1E73M 1JF5A 4FLRA 3WFLA 2WHKA 3BLKA 5CXPA 1PZ2A 3WF4A 3EDFA 1WB0A 1SFSA 3HJEA 1GQKA 2WCSA 3WDQA 1VEMA 1ZBWA 1J01A 2G3JA 1JFXA 1JZ6A 5AYIA 1H5VA 4P7QA 2VQTA 4GZIA 2WC7A 3VUPA 2X09A 5IFPA 2GSJA 2E9MA 4E8DA 2AMGA 2ESCA 4YN5A 2EPNA 1FH8A 3J7HA 3W25A 1U33A 2E40A 4CVWA 3L4VA 1WNOA 4GPNA 1LJYA 4PMRA 3AIRA 3ZR6A 5M17A 2V5DA 1QW9A 1CLVA 1GJUA 1UWSA 1UKSA 4DM1A 1H09A 2Y2WA 5I79A 4XZWA 1GPFA 1UR9A 5LA0A 2GDUA 1ED7A 2G3NA 1E6SM 4D6FA 1G9HA 3OLEA 1JDAA 3WY1A 3VGBA 1WZMA 1MFUA 2TAAA 1E3ZA 4W84A 1K9DA 3IAPA 3GNOA 3QHOA 1GOKA 1UQYA 4MAZA 4EKJA 2VC9A 1RH9A 1GVYA 3WF1A 4WKFA 1UKPA 4Z2JA 2XUCA 5BXTA 2VNCA 2J7FA 5IHSA 2BS9A 1W3KA 4LXFA 1DWAM 1XCWA 1EIBA 1QI3A 2XG9A 3N13A 2D0GA 4HZ7A 1CGTA 1KBBA 2GUYA 1V6XA 4AC1X 1CXHA 5M03A 3MUIA 3UCQA 5C71A 1XYFA 2CCRA 4KWUA 5ABHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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