1GOIA

Crystal structure of the d140n mutant of chitinase b from serratia marcescens at 1.45 a resolution
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVNIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the D140N Mutant of Chitinase B from Serratia Marcescens at 1.45 A Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2001-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1goiA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1goiA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1goiA01
2XM1A 1W2VA 2WWCA 3A4WA 1BAGA 3N15A 1KXHA 2BFGA 2YL6A 5E6ZA 1JF5A 1HKJA 3OZPA 2GFTA 5I23A 3CLWA 4MAZA 2W4XA 2EPKX 1ZBCA 5A8MA 3IANA 3BCDA 1S46A 3GH5A 3TTQA 3MS8A 3AIEA 1UQYA 1C7TA 1GQKA 1L0PA 1NWSA 5JBEA 2XIIA 5C71A 1EH9A 2XPKA 4PBGA 1H1NA 1H0GA 3W53A 1M01A 4F9JA 2XVNA 4MB4A 5E9AA 1OGSA 5I79A 3VDHA 2CKRA 3WNMA 2J8GA 2YA2A 1EOKA 1PIGA 2GVYA 3AS1A 1HKMA 3CZEA 2WW5A 2J62A 4J3WA 3WL0A 3NSMA 4BQ2A 3W81A 1JD7A 3MSDA 1UR2A 2QMKA 1QI5A 4B9ZA 4J3TA 2CBJA 1MXGA 1JI2A 4WKFA 3VMOA 5I3DA 2RTSA 4PMDA 4DWSC 1ED7A 4LXFA 3ZM8A 2XFRA 4TX8A 3AI0A 4HZ7A 3WUFA 4JKKA 1I75A 4MJ4A 4LGXA 4FK9A 1MFVA 2ZOXA 1IZKA 2GK1A 1CYGA 3G6LA 1JGIA 1TA3B 1UD3A 1E0WA 4CD7A 4W7WA 4ACZB 4C7GA 3BSHA 4PMZA 3FY1A 1E6SM 1VF8A 5HNNA 5ABHA 3AYSA 2EPLX 2WHLA 4M80A 1ZJBA 4CN6A 1KBKA 3CBWA 2BY3A 3DHUA 1ECEA 1QNPA 5AC5A 3B9AA 2G3JA 1JAEA 3ARUA 4Q22A 4IPLA 2D1ZA 1W3JA 2VZTA 2CBUA 1OBAA 3WL1A 1ZB5A 2CHNA 5FKYA 1B9ZA 3THDA 1FP9A 3RO8A 4IISA 2VCCA 5CG0A 3ARWA 3J7HA 3THCA 3OGVA 1TVNA 3T0AA 4AD4A 1GOWA 2ZXDA 4H8VA 1UR9A 2O9RA 3TTSA 4AEFA 1OGGA 2DT3A 4PMUA 5E70A 3WDJA 1GJUA 2V3DA 1GOKA 3WD3A 1E70M 4D6JA 4K68A 3F4VA 4LQ1A 1CGVA 4E8CA 4F9DA 4WF7A 1UWTA 3OLEA 1KCLA 1FH8A 1W91A 1WAWA 1RP9A 5E0CA 3GBEA 1JDCA 4Z2KA 3NUKA 4L4PA 2CYGA 1WKYA 1GZJA 2ZWZA 3WFZA 4AD2A 4WK9A 4UCFA 1H3GA 2GJPA 4QAWA 2HISA 3AYRA 2XVGA 2VX5A 3S2CA 3WFLA 4JHOA 4IUGA 1C93A 1O7AA 4AD1A 2E9MA 4W7VA 5IHRA 1P6WA 4U3CA 1CECA 3MUZ1 3W38A 1HKIA 3W28A 1EO7A 5BROA 1C8QA 1HN1A 1DWJM 1EXPA 3U7VA 3WUGA 3A4XA 1AVAA 1JZ8A 1C8XA 3BAJA 1UUQA 1QPKA 3MMWA 3OA5A 1HJWA 1W9VA 1MYRA 3PN8A 3W4RA 4N42A 4MB5A 1W3HA 1UHVA 3KL5A 1XV8A 3QR3A 1UWRA 3AMKA 4J7RA 2WNWA 1FH7A 1JZ2A 3KL0A 1M04A 3K8MA 2Q8XA 2WC3A 1UD2A 3PZUA 2ZUTA 5ABFB 4UFHA 5JBDA 4JFUA 2XG9A 1UOKA 1E73M 5ABEA 2DIJA 2J7BA 4GKLA 1E6XM 3UG5A 3O6AA 1JYWA 2VRQA 1E1EA 5E0FA 1R86A 4MNLA 1H49A 3QHOA 5A6MA 1WB0A 4PMVA 4PMRA 1ZJAA 2IXVA 4MDPA 1H11A 4OOZA 3M07A 3MU7A 4J3XA 2VCBA 3TONA 2A3HA 1QHZA 4YHGA 1WZKA 1LG1A 4D1IA 1RPKA 2WC7A 2PBGA 1CEOA 1V3KA 3UG3A 3OLDA 1BVNP 1AIWA 3AIVA 1J12A 5CPQA 1M03A 4BCEA 2VX4A 1GQJA 1E1FA 1EHNA 3D5HA 3I3EA 1XH2A 4Z2HA 1C91A 3NCOA 2YA1A 1VJSA 4NRRA 3CH9A 1EDTA 2CCRA 1K6AA 4A3YA 5CGMA 2PWFA 3WUEA 2Y5EA 4QFUA 1HT6A 2YDSA 3N1AA 1OCQA 1CWYA 3K8KA 4U5KA 4AMCA 2CBIA 4U5IA 1KQYA 2QMJA 4GQQA 1TE1A 2RGLA 4GO8A 1H41A 2VRJA 3T2OA 1WDPA 1AQMA 2VUYA 4HOXA 4W8LA 3FHAA 1E6QM 2PWHA 3ZSTA 2CBVA 2G4FA 4HZ8A 1UZ1A 1EQPA 4H04A 2J77A 1H09A 1VBRA 1NP0A 3CZKA 1XSIA 4PMOA 1JYNA 2VZOA 4OIFA 2DDXA 4LPCA 3UR8A 2DSWA 1V6YA 3IJ9A 1W3KA 2OSWA 4LYRA 3BGAA 3OB8A 1HJXA 2ZICA 1YQ2A 4HZ6A 3KEHA 1KCKA 4J3VA 3TOPA 3S6TA 4QLLA 2XIBA 3AS0A 2E0PA 4GZIA 3MV01 3T0DA 3ZMRA 3NDZA 3TTOA 3VGBA 1J9YA 1W3LA 3SURA 1HX0A 2VL4A 3T09A 2CESA 1HJSA 1G5AA 2X1IA 4MNMA 4D6EA 5LYRA 1E6RA 5A1AA 1LWHA 4NI3A 1H2JA 2VR4A 1ZBKA 3W6MA 1EQCA 4XZWA 1XD0A 3AXHA 1Q6CA 4HA1A 1YHTA 2OYKA 4LX4A 4W8BA 4J3SA 2WMIA 4NSBA 2VVNA 2XM2A 5BXTA 1GPFA 2ZUUA 3K46A 4MB1A 5AYBA 4IPNB 3AFBA 8CGTA 2V5DA 2CKSA 2ZUSA 3AXIA 1E6ZA 3VU2A 3F5LA 2WCSA 4ZE4A 3MV11 3M6DA 2WVTA 1K9TA 1UKQA 1EIBA 1QW8A 5GQBA 3WSUA 1V08A 1D3CA 1TA3A 1UA3A 1HIZA 1QHOA 3AMGA 1DHKA 1E55A 1GW1A 2XVPA 1AMYA 2UY2A 4MPKA 3WDRA 1JG9A 4TTUA 1K9FA 1E4LA 2PBOA 2WLZA 3ZT6A 3AHYA 5FIPA 4PRWA 1E15A 3RDKA 4FLSA 5A6SA 3EDFA 4TTGA 4OUEA 1UR8A 3POHA 5C8BB 1J0ZA 2J74A 3SIMA 1VFOA 3FNDA 3WD0A 3M7SA 2ZE0A 3UR7A 2EEXA 4YHEA 4P8WA 2E3ZA 2GSJA 3LPOA 4H8HA 3WQ6A 1DWAM 2XVLA 3NSXA 1BQCA 3VIGA 5KZ6A 3B9DA 3WBAA 1U30A 5IFPA 1B3XA 1QI0A 2W66A 2J78A 2CETA 3QGVA 2WZHA 1HNYA 3MMUA 3PZIA 2A3BA 1V02E 5A6BA 4TOQA 2JF6A 1HP4A 3WF2A 1JAKA 1A47A 4M8UA 2WCAA 1KXTA 3IJ8A 4P8VA 2J7GA 3CZJA 4M56A 1Q6GA 3OLIA 3CPUA 2VNCA 4S3JA 4DM2A 3T0BA 1CENA 1EDGA 4ZENA 1SMDA 1VFMA 2G3NA 2D2OA 3SCWA 3JUGA 3VIMA 4CCEA 5CZKA 1XYFA 2FH8A 4CN1A 1W9DM 2PB1A 1MW0A 4CD6A 4AC1X 4GXPA 5GNZA 1E9LA 4HTYA 1AQHA 1MQPA 2TAAA 2ZUWA 5HPCA 3SUUA 4HU8A 2YJQA 5CSYA 2YLLA 1C7SA 3HU7A 1X6NA 4Z2GA 1Z32X 4Z2IA 1V02A 3CUHA 1CXEA 1XHGA 1MXDA 1UZ4A 5BWFA 2BY0A 1LL7A 1MQRA 1XH1A 4XV0A 1PZ3A 4U2ZA 1J11A 1W2PA 4W7UA 2MANA 3GNRA 4XX6A 3RJXA 2YOCA 4CD4A 1UH3A 1V3MA 3AIQA 1KB3A 3VO0A 3WNOA 3W24A 3VIOA 2XUCA 4WSJA 4BZYA 3EMQA 5D8ZA 4D6IA 3EDDA 5DF0A 4BF7A 2J75A 1UH4A 3GXDA 2E9LA 3WH6A 2C8NA 3IK2A 4U31A 1XRVA 4AISA 1ITXA 5GNXA 4D72A 4CGTA 1GONA 3BSGA 2X8RA 2BNJA 4W5ZA 5D9MA 4AZCA 6A3HA 1QNRA 4JFSA 4JL1A 4AZIA 3AHVA 1NOWA 5BRQA 5HBFA 4EKJA 4CCDA 1Q4NX 3PZQA 2FH6A 1W1YA 3UERA 2XFFA 3TA9A 1C92A 5A2CA 1PIFA 2GJXB 3CO4A 5LA2A 4CN4A 1I1XA 3N18A 2XHYA 2F2HA 2VQTA 2F8QA 2D0FA 4Y7EA 3WNNA 2VZSA 3N11A 1TUXA 5FCZA 4KGJA 2Z1KA 5D9NA 3CIVA 3W0KA 1WE5A 3HMCA 3O9NA 4AD3A 3N12A 3L2LA 1J0HA 2VCAA 1NWUA 1BSIA 1HJQA 5CSUA 5JUVA 2WAGA 2W67A 4W5UA 3DYPA 7A3HA 4HOWA 5IFTA 4D1JA 4OZOA 3AZTA 4ZEPA 1H5VA 4BQ3A 3L4UA 5JBFA 3AXXA 1O6IA 1V0NA 5E6YA 2CERA 4AZ6A 2OWCA 4R5EA 3AISA 4WSKA 1GOOA 4IM4A 4CVUA 3RJYA 4N0RA 1VFUA 1GHSA 5BXRA 3BAKA 4TVUA 1JZ4A 1CDGA 2JEPA 1L8NA 1GHRA 4BQ5A 2J7FA 1X6LA 2XWDA 1TR1A 2XGIA 4KWUA 1BTCA 4YPJA 5CPSA 4DUWA 2FDMA 4OBSA 1C90A 2JFEX 3PZTA 1JXJA 3VX0A 3QOKA 3GBDA 1J0KA 1E4NA 4W87A 5CLTA 1UKTA 4KRTA 1QNOA 2WCGA 3F5JA 3SCOA 3T2PA 3PTKA 3VMNA 2XFYA 4W84A 5I2UA 4CUCA 4P8UA 3VIPA 1UD8A 1E4MM 3NSNA 2BHZA 1HXJA 4ZXOA 1Q6FA 3VMPA 1EA9C 2ZUMA 1F4HA 3BLPX 3UEQA 1WDRA 4A3HA 4PMYA 4JZ5A 1V0LA 3MUIA 1W1VA 5A6KA 1JZ5A 4PTXA 1LL6A 3AOFA 3ECQA 2QPSA 3BMWA 4QDMA 1KGXA 2Y4SA 1FFRA 2DH2A 1US2A 3OG2A 1KQZA 5BRPA 1NOFA 4J3UA 2GDUA 1JF6A 2D49A 2D24A 5D4YA 1C8YA 4FLOA 1XSKA 3L4WA 4AZBA 1XCXA 1XD1A 2GDVA 3RM9A 1ISZA 5EFDA 3PZ9A 3T08A 3ARQA 4KRUA 2BV9A 3PZMA 3AIRA 2J7CA 1Y7VA 2OLHA 1KGWA 4AYSA 3LPPA 3WBEA 1OGBA 1NWRA 3WNKA 4UQCA 3DECA 1CGTA 1NQ6A 2E4TA 1A3HA 4JKLA 2WZEA 3SCRA 3BC9A 2Y8VA 3L4VA 2EXOA 3BCFA 4J27A 2EJ1A 3F5KA 4GZJA 3VD4A 3O2LA 4OOUA 4ZFMA 1B2YA 5A69A 4F79A 2J7EA 1WDSA 4PSPA 2DIEA 1OM0A 2V5CA 2D23A 3AROA 3VIFA 1GQLA 4PUEA 3POCA 1ODUA 5EMYA 5IXEA 2DSKA 1ZS2A 1GOIA 4P7QA 3BAYA 4V27A 4AIUA 1W9XA 1UWQA 4KH2A 2G8ZA 4HP5A 4QLJA 5KEZA 2ZIDA 4DWSD 1E0XA 3VDAA 1PZ2A 1CXLA 3LMYA 2X2YA 3WH8A 4EK7A 1OD0A 3VGDA 3ZT7A 3AMLA 1E71M 3NDYA 3NJ3A 3VGGA 2D20A 3WY1A 2VC9A 2XTKA 2J7DA 3SCQA 4GIAA 4W8AA 2YDQA 2EO7A 4WKHA 2YL9A 1WO2A 3VD9A 3A6OA 2YL5A 5D8WA 5ECUA 4AD0A 1DEDA 4RE2A 1UH2A 2BXZA 1CGUA 1E0VA 5EBAA 3FAXA 4MNJA 2DPEA 4CVWA 2QLYA 3VVGA 5A2AA 1QI2A 2ZX5A 2AAAA 2A3AA 4PCSA 4D6GA 2JIWA 3AHTA 1F4AA 2CITA 3ARZA 2XVKA 4Z2JA 2FHFA 5HDRA 3EMZA 5JH8A 4GO9A 3AS3A 1CTNA 1VAHA 3UETA 5A3HA 1ISVA 1OSEA 1V6WA 5LA0A 5DT7A 5EB8A 3L4TA 4QLKA 4D6HA 1VENA 3PTQA 5AY7A 1GCYA 3D3AA 4OJYA 2GK1B 2ESCA 2VMFA 3VILA 1WZLA 3DYMA 2WC4A 2X0HA 1DWIM 2ZXAA 2WMGA 2Y24A 3FXYA 1E3XA 2E8ZA 1ISYA 4ATDA 1JD9A 2DT1A 2VR5A 1QI3A 3PZVA 1IZJA 3M46A 1VJZA 1WP6A 1V0KA 5HPOA 1PEZA 1FOBA 2J7HA 3GXFA 4FLRA 4P7NA 2XYLA 1EO5A 2FGZA 4KGLA 4WLCA 1B30A 4XB3A 1UD6A 3ARRA 2QHAA 2D3LA 2E40A 2JIEA 2WANA 4D6CA 1J18A 4M81A 1OIMA 1JNDA 5DMYA 5D9OA 5GPRA 4HMEA 1TZ7A 2QF8A 2IXUA 3ARVA 2BS9A 3MANA 3ZO9A 4MTVA 4H8UA 2YKKA 2VQUA 2BVYA 1M53A 2WKGA 3MMDA 3BLKA 3KE0A 1CNVA 5A94A 2V3FA 3OBAA 1GVIA 3AHZA 3MUAA 1TG7A 3HJEA 2W92A 1R7OA 1CXHA 3N9KA 3BAXA 3MSGA 4GINA 4H7VA 3W82A 3EDEA 1UWSA 2PWEA 3ZR6A 1FH9A 3U7BA 3SCVA 4OKDA 4FLQA 3AICA 3WMSA 4AW7A 2WBGA 1W32A 4U2YA 1DP0A 2UY4A 1R7AA 1FP8A 4TUFA 4B15A 4A4AA 3VINA 4CU8A 4F8XA 1OIFA 5I24A 4ACZA 8A3HA 3WH5A 3CUGA 1W9UA 2G3IA 1KR1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1CXI A;  3W27 A;  3ZQ9 A;  3N17 A;  3WIJ A;  3ARX A;  1CLX A;  2BVT A;  3WF3 A;  4W85 A;  3FAW A;  4XZB A;  3RIL A;  3SEP A;  1VBU A;  1JDD A;  4PUD A;  1IT0 A;  5I78 A;  3OLG A;  1PX8 A;  1GQI A;  4GPN A;  2B31 A;  4BS0 A;  4ZXL A;  3CMG A;  2WMH A;  2F61 A;  1V3L A;  5FD0 A;  3VOC A;  1JYX A;  3BXW A;  2VI0 A;  3KZS A;  3WEM A;  1HP5 A;  2WHJ A;  2O9P A;  1XSJ A;  1BPL B;  3AQU A;  5M3W A;  5BYW A;  2WZI A;  1E5J A;  2CEQ A;  3UES A;  6TAA A;  2W62 A;  3I3B A;  5M03 A;  1GOR A;  4UFM A;  3WD4 A;  1GJW A;  4PTM A;  4HPH A;  3CZL A;  4JHZ A;  1B1Y A;  1J0I A;  4PYS A;  1E5N A;  3RME A;  4JL2 A;  3CHC A;  3GNP A;  1DWH M;  3CUF A;  3MO4 A;  2V3G A;  1WZA A;  3CUI A;  2NT0 A;  1JZ3 A;  3VPL A;  1SR0 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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