1H0GA

Complex of a chitinase with the natural product cyclopentapeptide argadin from clonostachys
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title High Resolution Inhibited Complexes of a Chitinase with Natural Product Cyclopentapeptides - Peptide Mimicry of a Carbohydrate Substrate
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 170
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1h0gA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1h0gA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h0gA01
4PCSA 3WH9A 1R85A 3M7SA 4PUDA 2VZUA 3CHFA 2OSYA 4BCEA 1WO2A 5CZKA 1IT0A 1GNXA 4AIOA 1XV8A 4ZEPA 3PZMA 1R86A 2G3MA 4PTXA 4U33A 2QPSA 3VD3A 5HDRA 1YHTA 5I78A 1ZJAA 1KGUA 4W86A 3CMGA 4HPGA 3VIJA 1HJWA 4OKDA 1JZ2A 1V6WA 3A4WA 2ZXAA 4GO8A 3LPOA 2V3DA 1HF6A 2O9TA 4P8WA 1EDGA 1Q6DA 1KR1A 3PZVA 2ZX6A 1QNSA 3PZGA 2VURA 1J0IA 4HA3A 4E8DA 3AQUA 3SCSA 1GHSA 4L4OA 2RGMA 1MXDA 4BS0A 4M56A 1PAMA 1QI2A 3AS1A 4GI9A 4OUEA 1ISZA 1KGXA 2XVPA 2DIJA 5FL0A 1OBAA 4W5ZA 4Z2JA 4P7LA 1E3XA 4AD2A 4U5KA 3BLKA 1NOUA 3TONA 1E15A 4U2YA 4PEEA 4EE9A 3BSGA 3RMEA 2QV4A 1KQZA 3WNNA 1BYCA 3FAXA 4M82A 4CU7A 3AHYA 4F8XA 3BH4A 2XGBA 3KEHA 2ZOXA 1NQ6A 1L0PA 4F79A 1RD6A 4UFMA 1V3KA 1ZBWA 3GM8A 1FFRA 1LF1A 2EBNA 4F66A 1P6WA 2GK1A 1DWAM 1XH0A 2VT0A 3O6AA 1WDQA 2J7HA 4N42A 3VMNA 1V0NA 2J7GA 4NI3A 3WF4A 1JDAA 3FHQA 3CIVA 3T2OA 3CTTA 5A2AA 3RM9A 5ABGA 1J9YA 1LWHA 2D23A 3BCDA 3WQVA 1JD7A 2NSXA 4QCEA 2E8ZA 2BVYA 1GQKA 1KXHA 3W27A 3VX0A 4PYSA 3G6LA 1E70M 3DYOA 1BLIA 4E8CA 1CPUA 4CD6A 4MDPA 2EJ1A 1CTNA 1V6XA 1R7OA 2E3ZA 3AZRA 1PPIA 1CXIA 1J0JA 3WH8A 1E0WA 1VEMA 2VX4A 4CCEA 2RTSA 1UWIA 4JAWA 2ZX9A 3UETA 2RGLA 3CZEA 5E6ZA 3UCQA 4B16A 2VX5A 1WDSA 1LJYA 3GXDA 1JI2A 1OT1A 5AC4A 2QHAA 3AICA 3ZR6A 1W9DM 1HKMA 1XD0A 4K68A 3EDKA 2D24A 2O9RA 1W1VA 2WMJA 1JF6A 3WDJA 1W2VA 3MV01 3AMKA 1CXKA 5GQBA 5A3HA 1Q6FA 4D72A 1KXTA 1PBGA 2WHKA 4ZENA 5CPSA 1GQJA 3VNYA 4AD1A 1B2YA 1TE1A 2CHOA 4JHOA 1H11A 3F5LA 5BXSA 4HU0A 3GXMA 3AXHA 3RM8A 4ACZB 1H1NA 1GOMA 4PUEA 5A6KA 5LA0A 2ZUUA 4F9JA 1JIBA 1NP2A 2WZIA 4J27A 1ZB5A 2VR4A 3VIOA 1EA9C 4HMCA 5M3WA 3T0AA 1PIFA 1MQRA 3A4XA 5LA2A 1BHGA 1A3HA 2NT1A 5BROA 1JZ6A 4GZIA 3L4UA 4ZFMA 5HOSA 3A6OA 4WF7A 3ZM8A 4RE3A 3CO4A 1E9LA 1HL8A 2ZUWA 3MSGA 1V3IA 4TUFA 1JZ8A 3CBWA 2YL9A 2Y8KA 3W29A 3WQ4A 1J0ZA 5DFAA 3BAJA 2F61A 4TXEA 3CZJA 1CEOA 2DQXA 3ECQA 1HN1A 2WLZA 1BVNP 2XSAA 1YQ2A 1GHRA 5I77A 5HXMA 3W0KA 1UA7A 5D9MA 4LYPA 3MV11 1XCWA 4CU6A 1F4HA 2Y5EA 2DT1A 1E5JA 4GXPA 2WCGA 2A3HA 1UKPA 4HMDA 4M8UA 4C7FA 3APGA 4BQ5A 5HNNA 3K8MA 5BXTA 1JYWA 4D6GA 1UH3A 2AMGA 3ARYA 1JD9A 3WUFA 5IFTA 3QHOA 4HA1A 1OCQA 3W37A 3L4ZA 2WC3A 3VGGA 3GH5A 3LPPA 4KMQA 4OOZA 1HNYA 2YLAA 2CHNA 3T09A 1HP4A 1FP8A 2WVVB 4DWSB 1KFWA 4PTVA 1XC6A 3IJ7A 4AZBA 2J47A 4GZEA 1CECA 3AMLA 3I3EA 1JAEA 1EXPA 5ABFB 2F8QA 4M81A 1OINA 3POHA 4B3LA 4D6DA 5IXEA 2ZUTA 1KBBA 3GBDA 3VM7A 2YJQA 3VD7A 5I79A 4UOJA 4WSKA 5I3DA 1B0IA 1M03A 3NCOA 4JFUA 4GI6A 2WM0A 4CCCA 1MW3A 3AJ7A 1SMDA 3AIWA 1E3ZA 2CBIA 1JXJA 4AD0A 1ZL1A 3CH9A 3EYPA 1PX8A 1VFMA 3NIYA 3VIKA 2WC4A 3K4DA 2CKSA 1W1TA 4BF7A 7CGTA 4TVUA 2WXDM 2CERA 1UH4A 3CUHA 5JBEA 3CZGA 4CKQA 1JFHA 1WCGA 4A3HA 2UY5A 4PSRA 1C8QA 3ZJ8A 4JL1A 2XFRA 1UD2A 3AHVA 4AEEA 4NRSA 3DYPA 3PZ9A 1FH8A 6TAAA 4UFHA 1ESWA 2PWEA 3NSXA 1EHNA 1MW2A 3BGAA 2XVKA 2GFTA 1TVPA 4IPLA 3WF3A 4J7RA 1MQQA 3L4VA 1BVZA 3ARXA 3AIBA 3L4WA 3AZSA 3VGHA 3VGFA 1QBAA 3CPUA 2XPKA 1W9VA 3AROA 2ZUSA 1XH2A 2DEPA 1U2YA 3MMUA 1B3WA 1UKOA 3A4AA 2ZWZA 4W7UA 4P7RA 3PTMA 1JG9A 5HBFA 2ZX5A 2GUYA 2FH6A 5AC5A 1E56A 1E5NA 1PX3A 1RH9A 4AZ6A 2VI0A 2V5DA 2WKLA 2G3IA 3AIEA 4AW7A 2CYGA 2HVMA 1GORA 1CGTA 3F4VA 4XUYA 1V0LA 3ZR5A 5CGTA 1ISYA 5BRPA 5D9PA 1UR1A 1GVYA 2E9LA 4ML4A 1ITXA 4QAWA 2WPGA 3MUIA 1US3A 2E0PA 1JF5A 3WFLA 4PMVA 1TA3B 1UD8A 1ECEA 5I6SA 4S3KA 4UTFA 2X09A 2ZUNA 5E0CA 3K8KA 3CUIA 1WZLA 4QP0A 5FKYA 5AYBA 3FAWA 5A2CA 4J3XA 1VJSA 2TAAA 2EPNA 4D6CA 1HKKA 3CHEA 2WVUA 2J77A 3PZNA 3KE0A 3GNOA 2E8YA 3VMPA 1FH9A 2XVLA 4PMNA 4WK9A 3W81A 1QHZA 5E09A 1LG2A 1V08A 3SCNA 2IUZA 1VENA 1V3MA 1CXFA 1J0YA 1H3GA 1X6NA 1V6VA 4PMOA 4Y7EA 4YHEA 4QDMA 3GNRA 1UR9A 1KCKA 1LL6A 3B9DA 5CPQA 1DWIM 5EFFA 2BVTA 5DT7A 2E9MA 4B9ZA 4M29A 3WEOA 2OYLA 2JEPA 3L4XA 1Q6GA 5BWFA 2WWDA 4TVDA 5GNYA 1Q4NX 2VVSA 5BYWA 3DHPA 5HPOA 2GJXB 4YN5A 4L4PA 1TMQA 3W82A 1J12A 1WPCA 1NWUA 1R7AA 4Q22A 4U5IA 3PZUA 2Y8VA 3ZO9A 1DWJM 2WWCA 1RPKA 1K6AA 4AISA 1VFOA 1JYXA 2XGIA 4P7NA 4CCDA 4C7GA 1OWQA 4Q7NA 2VQUA 4J3TA 2J62A 1M04A 4QLLA 2XYLA 2GVYA 4WIWA 4HP5A 2FGZA 2YIHA 3KL5A 1CGVA 1H09A 3M6DA 5D4YA 1NM9A 2WMKA 3B9EA 3WL1A 1W9PA 1WB0A 2WC7A 2PWFA 4MNJA 1PX4A 3ZOAA 2JIEA 5JIPA 4W5UA 4KGLA 2OWXA 3BLPX 1E1EA 1UWTA 1OSEA 1JAKA 1HVQA 1ZU8A 4CU8A 1H0GA 3W26A 4IUGA 3WBEA 4D71A 1NP0A 1CDGA 2NT0A 2BY2A 2JEQA 3UG3A 3WENA 3POCA 2VUYA 4PN2A 4UNIA 3WEMA 4ATDA 1WNOA 3ZMRA 2NW0A 5E70A 2BY1A 4PCTA 1QNPA 4KWUA 5EBAA 3BAKA 1BYBA 3L2MA 4JFTA 4NF7A 3VOCA 4MB3A 4H2CA 4JFWA 2DT3A 1JDDA 4AD4A 5I2UA 2X1IA 4AMCA 5JBDA 2OSWA 4W84A 2AOSA 4GIAA 4AZCB 2WBGA 1OB0A 1IZJA 4AIUA 1D3CA 3M46A 3ZJKA 1B3VA 3NDZA 1V3JA 1BYAA 3JUGA 4JCMA 3GDBA 1H5VA 5I0DA 2DIEA 4HTYA 4PSPA 2CBVA 2DSKA 2EPKX 4PMUA 3T2PA 5AYIA 1QW8A 5E9AA 2D3LA 1BGAA 4AIEA 2UY3A 1BYDA 4PTMA 4QCFA 4BQ2A 3WBAA 3UG4A 3SUUA 2WK2A 2X8RA 2XHYA 5A6BD 4GQRA 1UYQA 2D49A 3MUZ1 1FHDA 4NSBA 5CGMA 4KRUA 1HXJA 2J7CA 3RJYA 1K9TA 1J11A 5FOOA 7A3HA 1OIMA 2BXYA 5DMYA 3VM5A 1KBKA 5C8BB 1QW9A 1E6PA 2YLLA 1W1YA 2GDVA 2BHUA 2WZHA 2YDRA 5EFDA 1QNOA 1VEPA 4UQAA 1XSJA 4M80A 1NH6A 1E6QM 3WN6A 3I3DA 3UEQA 1VEOA 4BA0A 3PZIA 2GDUA 3W6LA 1V02E 2WHJA 2VX7A 3MS8A 3HU7A 2E40A 5DO8A 1E0VA 3BAIA 5JH8A 2WBKA 4LQ1A 1OGBA 3DECA 1DEDA 1US2A 1KXQA 1UOKA 2ZE0A 4LGXA 3K8LA 3M07A 1GVIA 3MMWA 1QBBA 4UZSA 1R87A 1GPFA 2G41A 4P8VA 2C0HA 3IANA 1X6LA 1A47A 2MANA 2CCRA 3AZTA 3WD1A 3WF2A 5IHSA 1O6IA 1MFVA 4ACYA 4LX4A 3N18A 1EGZA 2G3NA 1HL9A 1O7AA 3WUEA 1TZ7A 3CZ8A 1JNDA 2BXZA 1GQIA 4HZ6A 3WQ8A 1UZ1A 3MSDA 1F4AA 1SR0A 3LMYA 1C92A 1K9FA 1EIBA 1MWOA 4W7WA 1UA3A 4N0RA 4TX8A 4JKMA 2W62A 3WDQA 2DSVA 2EXOA 3IJ9A 2XJ7A 3ZIZA 1C8YA 3VIPA 1B90A 4HMEA 3ALFA 3WKZA 1UQYA 1G0CA 1KXVA 1TFVA 2QMJA 4CVUA 5CJ5A 1XHGA 3VDAA 3OLDA 1B1YA 1D7FA 1W9XA 5ABFA 4H8HA 1UHVA 2Y2WA 3CHCA 2C8NA 2YDSA 1X1NA 1BSIA 3BXWA 1W3JA 2BHZA 3L4YA 3SUTA 2WCSA 3SCPA 1EHAA 1MFUA 1B3XA 1Q6EA 2GK1B 2VC9A 3THDA 4IM4A 3T0DA 3AISA 3WF1A 2OLHA 1KB3A 1WZAA 3LPGA 1VF8A 1HJSA 2YA1A 1V3HA 4URIA 5ABHA 2PWGA 1LQ0A 1OGSA 3VKKA 3VINA 4MPKA 3WL0A 4BQ4A 5D9OA 4CVWA 2YOCA 1PZ3A 2X05A 3NDYA 5CLTA 5JBFA 4H04A 1HJVA 1JYNA 3AIUA 2JE8A 4E2OA 5M03A 1GOKA 3FY1A 3K4AA 3GTNA 4U31A 4D6EA 2EPLX 1E6RA 4CGTA 3ZT6A 2D20A 3WUBA 3AIQA 3OBAA 1LWJA 3AHXA 1PZ2A 4KRTA 2J8GA 5FCZA 2X2YA 4UOZA 3VD5A 1VB9A 3OG2A 4TOQA 1EO7A 3BAYA 4J28A 1V03A 4ZE5A 2VOTA 2W5FA 1QI0A 1C8XA 1JFXA 3L4TA 2VZSA 1MW1A 1W1PA 4UQDA 1WDPA 4BQ3A 3VDHA 3GXIA 3PZOA 4D1IA 1E43A 1WZMA 3VGEA 3OLGA 2JIWA 5D8WA 2BVDA 5IFPA 1PEZA 3WF0A 3PHAA 1LL4A 1SYTA 4FLRA 5LA1A 1NWSA 1VIWA 3SEPA 3EDEA 1WZKA 3W53A 3CHDA 2WCAA 2WSPA 3RJXA 1U33A 5FD0A 1W2PA 3GBEA 5DT5A 2WKGA 3RILA 3GXFA 1HJQA 4ZE4A 2WW5A 3WNOA 1M01A 3FHAA 4W8LA 1V3LA 3WSUA 1ODUA 3DHUA 3J7HA 2OYMA 3NSMA 4PMXA 1J0KA 2X0YA 4MAVA 3WQ6A 2V5CA 1OM0A 1UD5A 3EDDA 1KWGA 1OIFA 3QGVA 4S3JA 1FHLA 2W4XA 1BF2A 3W25A 8CGTA 1TUXA 1DHKA 1H0IA 1AQ0A 1R8LA 2WMIA 1GOIA 4M1RA 1E6SM 3SCQA 3ZT7A 1QPKA 1WP6A 1UD4A 1AVAA 1QVBA 1ED7A 4XZWA 4DM1A 1JZ4A 1LL7A 1CBGA 2XWDA 3SCRA 2JF7A 4FMVA 2WMFA 1N82A 4D6JA 3AYSA 2CIPA 1QHOA 2XG9A 4HOWA 2CBUA 1QI4A 1C91A 2A3EA 2XIBA 1PJ9A 3OA5A 2XWEA 4R27A 2CEQA 3ZJ6A 3BC9A 4JCLA 1JI1A 3VTRA 3WNKA 1E55A 5A2BA 4GQQA 1G9HA 4KH2A 3OZPA 2C7FA 2DH3A 3VNZA 1GUVA 1W3HA 3VIIA 3VU2A 1XH1A 2QLYA 3TP4A 5A8NA 3ARZA 2Y4SA 1H2JA 3ARUA 3WQWA 1CXEA 1JL8A 1UWRA 3WDPP 1TCMA 1JNEA 1UZ4A 2OYKA 2CNCA 5EB8A 4QFUA 5A8MA 3VMOA 1MYRA 3WH5A 1JZ5A 1BG9A 1H4PA 2PWHA 3HMCA 3AI0A 3EDFA 4AZIA 1GQLA 2WHLA 2DDXA 2ZX8A 4LYRA 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 4H8V A;  4V28 A;  3QHN A;  3EMC A;  3VIL A;  3N04 A;  1KR0 A;  3UER A;  2OSX A;  3D5H A;  1BGG A;  3HJE A;  5TD4 A;  2WYS A;  5GNX A;  3BAX A;  5E0F A;  4KGJ A;  1XSI A;  4FLO A;  1J0H A;  2D0G A;  5IDI A;  3VGD A;  3MKK A;  1BQC A;  4PMD A;  3CLW A;  4B15 A;  3NUK A;  2WAG A;  1FOB A;  2YA0 A;  5KEZ A;  4D1J A;  3TA9 A;  2J7E A;  2J7F A;  4R5E A;  4EK7 A;  3RO8 A;  2VNC A;  4W88 A;  2CKR A;  4X9Y A;  4X0N A;  3VPL A;  4JZ5 A;  2ZXB A;  7TAA A;  2XFF A;  1AMY A;  3S2C A;  5I24 A;  4CD7 A;  1HKI A;  3ARV A;  4HPH A;  3ARS A;  2W66 A;  3BMV A;  5KZ6 A;  3VO0 A;  3K46 A;  2JF6 A;  1U30 A;  4IPN B;  3BCF A;  3FN9 A;  4QLJ A;  4A4A A;  3SUR A;  3AYR A;  4HZ7 A;  1W32 A;  2F2H A;  2BY3 A;  4MAZ A;  5CSU A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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