1H0IA

Complex of a chitinase with the natural product cyclopentapeptide argifin from gliocladium
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title High Resolution Inhibited Complexes of a Chitinase with Natural Product Cyclopentapeptides - Peptide Mimicry of a Carbohydrate Substrate
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1h0iA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1h0iA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h0iA01
1C92A 1J0YA 3SUUA 2C7FA 4A4AA 3W28A 3PZVA 3ZIZA 3MV11 1J9YA 4HMCA 4PMNA 3WELA 4LYRA 1LWJA 4QP0A 2BHYA 2ZWZA 4W5ZA 1ZS2A 1E5JA 4JFWA 4PRWA 4AZIA 1E43A 2ZUSA 3CIVA 3UETA 3VIGA 3MO4A 1QBBA 3L2MA 3MUAA 3UEQA 2W62A 4TVCA 1KWKA 3AHVA 3AI0A 2ZICA 4CGTA 2EPNA 4XX6A 5C8BB 5CLTA 3VM7A 1K9FA 2Y4SA 4JIEA 3WEMA 3CUIA 1CPUA 5E0CA 4PMXA 4M56A 4AZGA 3BAKA 2ZXQA 4AZ7A 3MS8A 2D0HA 2CYGA 3QHNA 3I3BA 7TAAA 2VX6A 1LL6A 2D0FA 3LPOA 4P8XA 1US2A 2YA0A 3II1A 3WUGA 3AJ7A 1CGXA 1NWTA 3VDAA 3VD4A 4OZOA 1WP6A 1JXKA 1H4PA 4DWSA 1DWFM 3HU7A 1GJWA 5FL1A 2OWCA 3ZO9A 2D22A 1UD3A 2VRJA 3TTOA 4PMYA 5CZKA 4D6FA 2DT0A 2ZIDA 5DF0A 1XSKA 4U31A 3BH4A 3ECQA 3SUTA 1PAMA 5A8MA 1J11A 4UNIA 3WUEA 4N42A 4UFMA 4V2XA 3VNYA 1RP8A 1HJWA 3THDA 4ATDA 1XCWA 1JNEA 3A6OA 4PCSA 3PZOA 1U2YA 3WMSA 3NSMA 4QCEA 3ZR6A 3OBAA 5M17A 3CMJA 1PZ2A 2PI6A 4UR9A 3MKKA 4J3XA 5A6BD 5E0FA 4PBGA 2CCRA 1CGYA 2Z1SA 1HNYA 1MVYA 1A47A 3TOPA 1SR0A 4J27A 3GZAA 1VB9A 3MSGA 4JHOA 3L4VA 5CPSA 4WSKA 2CESA 3MMUA 4W93A 2JEQA 3MMWA 1G9HA 2BVDA 4PN2A 2OLHA 4D72A 3NDYA 1VAHA 4JL2A 2CEQA 2YL8A 4MPKA 4CU6A 2HISA 4CU8A 3GYCA 1FFQA 1E0WA 1D2KA 4ATWA 2G3IA 1HF6A 4W5UA 4HA1A 3KE0A 1XC6A 1BGGA 1V3LA 3CHDA 2XVNA 1HJXA 3WNOA 1VFMA 2WLYA 3ARSA 4QAWA 2JE8A 5TD4A 1EO7A 1EDTA 4PTMA 3EMZA 4B9YA 1QW9A 2PWEA 5AC4A 2J78A 3BGAA 3VDCA 1VIWA 1UR2A 2WCAA 4TUFA 3EMCA 1E4MM 1NARA 3ZM8A 1HT6A 2JIWA 4GI6A 1CXEA 1AMYA 3EMQA 4KWUA 4DUWA 1TUXA 3AIUA 1BTCA 1E15A 4BF7A 3NJ3A 1JI2A 2GJRA 1VBUA 1KGUA 4JCMA 4B3LA 3WDHA 2E4TA 4Z2LA 1EHAA 1M01A 4PUDA 3N11A 3VIFA 2DPEA 1EA9C 2AAAA 1K6AA 3U7BA 2JIEA 3ARPA 4AEFA 5IHRA 1H2JA 1CIUA 2PC8A 3AROA 2VCBA 4JFUA 3K4DA 5A3HA 2A3CA 4PMOA 4CD6A 3SIMA 4HZ8A 1C7SA 1M04A 5A6KA 2WC7A 5HOSA 4URIA 2CBUA 1ODZA 2WMIB 3EDJA 4E4PA 1JF5A 1V0NA 3ARWA 1HKMA 4AD0A 3EDEA 3ALFA 1JDAA 1ISWA 1SYTA 4LGXA 2VC9A 3CLWA 1KXTA 4U2ZA 3B8SA 3ZSTA 3AXIA 3B9DA 2VZOA 2WM0A 4W8AA 1OINA 3W37A 4J3UA 1E1FA 1MQQA 1B9ZA 1FHLA 1EQCA 2X0YA 1MFVA 3K8LA 2WMFA 1US3A 1W9DM 1V3MA 3CHCA 3FXYA 1C93A 1XRVA 1PIFA 2ZXBA 4EE9A 1HL9A 4NF7A 1JI1A 2YLAA 1ODUA 2EPKX 3VIOA 1KXVA 3VIIA 1G0CA 4PYSA 4ZXLA 2GK1B 4PCTA 4PMUA 2ESCA 1MXDA 5GPRA 5JH8A 2VVNA 5ABGA 1E4IA 4C7FA 1ZBCA 3BLKA 2DIJA 5A6JA 3FY1A 3DC0A 4BQ4A 5EBAA 4ZE5A 2DSKA 3VD3A 2UY2A 1EO5A 3AZRA 2D3LA 4Z2GA 3DHUA 2G4FA 1CLVA 2X05A 5DO8A 4AZ5A 4QCFA 2YJQA 3QOMA 4W86A 1GHRA 4S3JA 8CGTA 1MWOA 4PTWA 1JZ7A 2V3FA 3N13A 1W1YA 4AD3A 1V6WA 2UY5A 5C71A 1AQHA 2JF7A 3HJEA 4TX6A 1OWQA 4MB4A 3SCOA 2J25A 3TONA 5JIWA 1ZJBA 3W29A 1W1VA 1IT0A 1KGWA 2YA2A 4D6IA 4HOZA 2D49A 4WKHA 3GXMA 2VURA 1HJUA 4AIUA 3CMGA 4KMQA 1UR1A 5FL0A 1E9LA 1CGTA 3N17A 3POCA 4W87A 3WH9A 1E6RA 1CWYA 1MYRA 3MANA 2G3JA 3W53A 3O9NA 2CBIA 4F9DA 4ZE4A 1XD1A 4TVDA 2WXDM 1FH8A 1FP8A 3VX0A 1GVIA 4CCEA 4HPHA 4UQBA 3BXWA 2VL4A 2FHCA 2J7HA 2VO5A 5A6SA 1LWHA 1JF6A 1V3IA 3VKKA 1B3VA 5A6LA 1UWUA 1JYWA 2VCAA 1GOQA 1WZKA 3AYRA 4BQ2A 3CZJA 1CXHA 1R8LA 5FOOA 2F2HA 1Q6EA 3AOFA 1XH0A 1UZ4A 1KR1A 3OZPA 3AHTA 1GJUA 4M24A 3DHPA 3SCQA 1B90A 2E9BA 4NZCA 2UY4A 3GTNA 3CZLA 5A8NA 2EPMX 2QPSA 4BCEA 2CKRA 3RCNA 3HMCA 4JHZA 1ZU8A 4W8LA 2E3ZA 4UQ9A 4YN5A 1MQPA 4F66A 1JFXA 1I75A 3S6TA 1M53A 4LQ1A 1CXFA 2BFGA 4RE2A 3PZTA 4OKDA 5HPCA 5KZ6A 2AMGA 1V08A 1BGAA 3L4UA 3L4YA 1GW1A 4UFIA 1BHGA 3MUZ1 3SCRA 4QFUA 2JALA 1JXJA 1ISVA 3PTKA 2QF8A 1OD0A 1W3HA 3OLEA 1H0IA 3WSUA 2CITA 3WD2A 5A2BA 1V6UA 2D1ZA 1KQYA 3CUFA 1BG4A 3AZSA 1X6NA 5KEZA 3EYPA 3VMPA 5JIPA 2V3GA 4GZEA 1NWSA 1B2YA 4ACZA 3VUPA 1EH9A 1WZAA 1LL4A 1HXJA 3LPPA 1OIFA 3PN8A 1H5VA 1M7XA 3AISA 1XSJA 3W4RA 5IFPA 1CNVA 1UKOA 2VZSA 1V03A 3TA9A 3QR3A 2WHLA 1JDCA 4DWSB 1PEZA 2TAAA 2XVPA 4AISA 4CCCA 3VOCA 4MB3A 3WEOA 3GNOA 5BXTA 1GOOA 5ABEA 1ZB5A 3BCFA 1LG1A 2WC3A 4GQRA 2ZX8A 4M8UA 1E70M 5A8PA 2J75A 4NRSA 5GNYA 3FN9A 3GXDA 4AYSA 2VR5A 4GZJA 4LPCA 1F4AA 3O6AA 3WL1A 1GQKA 3WBAA 2WVSA 2JEPA 1AQMA 3VIMA 4R5EA 4H8UA 4P8UA 1BYBA 4FMVA 5DFAA 1R85A 3WQ8A 1KCLA 1SMDA 2CERA 3I3DA 1VJSA 1H49A 3ARQA 3WDIA 4MTVA 1CXIA 2ZWYA 2BHZA 4AD1A 2O9TA 4PMVA 1WZLA 2OSWA 3W81A 4FF5A 1V6YA 3NIYA 4J28A 4DWSC 4ZEPA 2J8FA 4UQEA 1A3HA 1XYFA 1QI0A 1KXHA 1UKTA 4EKJA 5I24A 4CD4A 4EAMA 2ZXAA 1V02E 4F9JA 4OUEA 1AVAA 2MANA 1BVNP 1V6VA 9CGTA 3GH7A 1E6PA 3IJ7A 1N82A 4CN4A 2WZEA 2QMKA 1JIBA 2ZXDA 1G1YA 5IXEA 3OIHA 1QNQA 2VRQA 3BMWA 3CUHA 3VNZA 3SCTA 4E8DA 1H0GA 1UH2A 2Y8KA 1V0MA 2CHOA 3VIHA 3WF2A 1HVXA 1OCQA 4CN1A 1DEDA 1GVYA 4F8XA 1BSIA 2PBOA 4KRTA 1R7OA 2YBUA 3UESA 2VNCA 1KXQA 1XH1A 3D3AA 3ARYA 1WNOA 2YDSA 4TOQA 5DT5A 3WQ4A 1NWRA 1ZJAA 2A3AA 1TG7A 3RILA 3BAYA 1VEPA 4H8VA 3AIRA 6TAAA 4AZBA 1E72M 3AIVA 4CD5A 1EDGA 1ZBKA 4AZ6A 5CJ5A 1C8QA 1D3CA 4UOQA 2GDUA 3T2PA 2GFTA 4GO9A 1EOKA 4P7OA 4YHGA 1NP0A 5E09A 5BYWA 1C8XA 2VJXA 1C91A 1C7TA 1FOBA 4MAVA 3WF3A 3CZEA 1G01A 2XIIA 2O92A 3W6MA 2BY0A 1KQZA 5CG0A 1Q4NX 3VIKA 3D5HA 1UG6A 4U3CA 2W92A 1KR0A 4A3YA 5BCAA 3RIKA 2VOTA 2GJPA 7CGTA 2UWFA 1CGWA 4M82A 3ARRA 4JZ5A 2UY3A 3PZMA 2G41A 1TA3A 1GPFA 2J7CA 1NP2A 4EANA 1QBAA 5LA1A 1MQRA 4X0VA 5AYBA 4BQ5A 1W3LA 1QOXA 3VDBA 2W5FA 1VFOA 5FIPA 3U5YA 1GOIA 1W9PA 5DT7A 3BAWA 2WZHA 4L4OA 3CTTA 1E6XM 1E73M 3GNPA 4H2CA 3AFBA 2EPLX 1NWUA 1CXLA 1F4HA 2J8GA 2XVGA 3N04A 5EB8A 1VF8A 1E40A 4D6JA 1J0ZA 2DT3A 3SCNA 4OBRA 3VGEA 3WMBA 4DM2A 2WBGA 4UQCA 1HVQA 2E9MA 1UWRA 3EDFA 4MB1A 1ED7A 1E3ZA 3WUBA 3KWXA 2CKSA 3OLIA 3L4XA 3VGFA 2VMFA 1JZ3A 5HXMA 1O6IA 4WK9A 3PBGA 4JKLA 4HMDA 1UH4A 4D71A 2VZTA 3AHXA 4FK9A 2XM2A 4HTYA 4D1JA 4ML4A 4AIEA 3AZTA 4X0NA 3OG2A 1BVZA 2FGLA 3M07A 3MUY1 4M80A 1W9XA 4OBSA 1H09A 1X6LA 5D9MA 4UQDA 1WDRA 4IM4A 2DSUA 1E6SM 2VX5A 4D6GA 5HPOA 3SUSA 1UA7A 2PBGA 1VEMA 3VGDA 1GONA 4CD7A 2XTKA 1MW2A 1QNPA 2WHKA 3F5JA 1CECA 1W2PA 1AIWA 3ARUA 2FHBA 4MDOA 1RP9A 3GH5A 2VRKA 2J62A 1PBGA 1VRXA 3BAJA 2CETA 2PF0A 3CUGA 3N1AA 4UFKA 1BG9A 3ZOAA 4D6EA 1QI4A 3W26A 1H1NA 3AICA 3CBWA 3RJXA 1E4NA 4E2OA 3CUJA 3W38A 1LG2A 2IUZA 5M5DA 4GZIA 2X8RA 5IHSA 1GQIA 1GOMA 3WNPA 1JG9A 1QI3A 2XPKA 4CUCA 2VVSA 4W88A 8A3HA 5I2UA 2OWXA 3L4WA 1R87A 5I23A 2DT1A 1WB0A 2EBNA 2VQUA 5F7UA 1UKQA 2DDXA 5A95A 4QLKA 1WAWA 4Z2JA 1EQPA 4IUGA 2Y2WA 5A2AA 5I5RA 2YL5A 3ZMRA 2HVMA 2WB5A 1PZ3A 3T0DA 3SUVA 2WVVA 3PZQA 1C3FA 2EJ1A 1XCXA 2E9LA 3WKZA 1P6WA 1WDQA 1UR0A 1L0PA 2D3NA 1ZBVA 2CXGA 2DGAA 1HX0A 4DWSD 4NI3A 2NW0A 4MB5A 3UERA 2YDQA 1C8YA 4J3SA 1JZ5A 3PZGA 5HNNA 3WF4A 5CQ1A 3PZUA 4GKLA 3BMVA 3WF0A 2E8ZA 5JBFA 4L4PA 3WDRA 1V02A 4W84A 3VIPA 3ARZA 2PWDA 2V3EA 5ABFA 4FLSA 3OGRA 1GHSA 3E1F1 1W91A 2QV4A 1OB0A 1NH6A 2NT1A 4Q7NA 4E8CA 3MUIA 3WH5A 1GQLA 2WSPA 4F79A 2OSYA 4U5KA 4JAWA 5I6SA 1UYQA 1G5AA 1TMQA 3OB8A 3F5LA 4ACZB 5JBEA 3GNRA 1ITCA 4NRRA 1UD5A 5CSUA 2RGLA 4KH2A 3RJYA 3UG4A 4CCDA 4CN6A 5HBFA 2J7EA 3AS1A 1HJQA 2GSJA 3UG3A 2Z1KA 4HA3A 4HU0A 2PWFA 1LJYA 4UTFA 1EIBA 4JFVA 1XV8A 1J0KA 3GH4A 3ZR5A 3KL0A 1UOKA 2DQXA 2VCCA 1CYGA 2J7BA 5D9OA 4J7RA 3CZKA 2BS9A 1QI2A 1WZMA 4YHEA 1CTNA 3FAXA 1JD7A 4H04A 1VFFA 1UA3A 2GJXB 4IPNB 1FP9A 2YA1A 3DYPA 2J7GA 1J12A 1JD9A 5GNXA 2J4GA 1OBAA 3ALGA 3LPFA 1BYCA 4UZSA 2XHYA 2E0PA 1KGXA 2ZUWA 2XFYA 2G8ZA 3RPMA 3DYMA 2CHNA 3ZSSA 4H41A 3ZJ8A 3VDHA 4Z2IA 4UQAA 1E5NA 3RM8A 2YBTA 5LYRA 2WANA 4XZBA 4ATLA 4JFTA 2XFFA 2WCSA 3SURA 4JFSA 4C7GA 3VO0A 1R86A 5D8WA 2QMJA 3WD3A 1C90A 1W32A 3ZJKA 1FFRA 1QW8A 3IJ8A 2WMKA 2OYMA 4R27A 1W1PA 1CLXA 3WENA 3AIQA 3LMYA 4CD8A 1UD6A 1U33A 3PHAA 4PSPA 1E3XA 3CO4A 2BY1A 2A3EA 1PX3A 3NUKA 3AHYA 3PZNA 3O2LA 3VD5A 2CPUA 1HKJA 2X1IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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