1H0IA

Complex of a chitinase with the natural product cyclopentapeptide argifin from gliocladium
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title High Resolution Inhibited Complexes of a Chitinase with Natural Product Cyclopentapeptides - Peptide Mimicry of a Carbohydrate Substrate
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1h0iA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1h0iA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h0iA01
2OSWA 5IFPA 1E1EA 4DWSA 1G94A 1NP0A 4RL3A 2VR5A 3NYDA 5BRQA 4LYPA 3A6OA 4PMVA 4W5ZA 1VFFA 1LWJA 2J47A 1P6WA 5CLTA 2ZXQA 1GJUA 1HVQA 2PB1A 4X9YA 1IZKA 3RM4A 3DHPA 1SYTA 2O9RA 3GNPA 3NDYA 1K9TA 4IUGA 1KXHA 2WC7A 1UWTA 3W53A 1FOBA 4N42A 4F9JA 4WLCA 3W6LA 3WH7A 3RM9A 2EJ1A 2IUZA 2VX4A 4V2XA 1XSJA 2VZOA 3A4XA 3THDA 3CZGA 2PBGA 3ARXA 5KEZA 5DT5A 4PTMA 3VIKA 5JH8A 1CLVA 3UETA 3VGFA 2GK1A 3PZVA 1HKJA 1NOUA 5BYWA 3NUKA 5A6AA 3NCOA 4H8VA 3CUJA 5E9AA 4N0RA 2X2YA 1W3KA 3A4WA 2ZUSA 2CETA 3OBAA 1QI3A 5E0CA 1ZJAA 1C93A 1UKQA 1V3JA 2F8QA 1XGZA 5A6MA 2BVTA 1UG6A 2VX5A 4U33A 5AYBA 1QI0A 3AQUA 4PTWA 1HL9A 3WFLA 4AEEA 2VUYA 4LX4A 1ZBKA 2VX6A 3UERA 3GXDA 4BZYA 1VFOA 2A3AA 2J77A 5I79A 3WDPP 4JFWA 3VD5A 2WMKA 5A6KA 1R85A 2CEQA 2VTFA 3QR3A 1HIZA 2VCBA 4PMZA 3ZO9A 3W6MA 3UCQA 3RJYA 3I3EA 5F7UA 4PUDA 3U7VA 1M53A 1MW0A 3UESA 1GQIA 4J3UA 1CZ1A 4GQRA 4AD1A 3AHZA 1EO5A 2Y8VA 5BXPA 3BGAA 4LYQA 2O9TA 1UR1A 2V3DA 2WBGA 3WDQA 3ARTA 5IHSA 3PHAA 5D8ZA 3WN6A 4QCEA 4KGLA 4CD6A 1Q6CA 1VEPA 5E6YA 1JXKA 4P8WA 3WF4A 4P8VA 4CD8A 4J3XA 1M04A 3CZKA 3ZIZA 4A3HA 2EBNA 1JZ2A 4C7GA 4CCDA 2ZX5A 3L4WA 1F4AA 3GXFA 4TVUA 2E9MA 3SCTA 1UD5A 4TX8A 3WD1A 4JFVA 4NSBA 2FGZA 4MAVA 2JEQA 4CU8A 4Q7NA 4ZXLA 3ZJ6A 1BLIA 1QPKA 4NI3A 1CNVA 2G4FA 3AHVA 2GJRA 3QHNA 2W4XA 4M8UA 3SCUA 4BQ4A 2W91A 5C8BB 3AXIA 4CD7A 2XTKA 1JF6A 2DIEA 2FH8A 4D6CA 1GQKA 1HKMA 1L0PA 1J9YA 1TG7A 2WANA 4BF7A 5EBAA 1VENA 1GVYA 2Z1KA 3CTTA 4AXNA 2WHKA 2ZUNA 5E09A 3VIPA 5CPTA 1TE1A 1EOKA 2XHYA 5KZ6A 3AICA 3WNPA 1UA7A 3K1DA 4MPKA 4JFSA 1R86A 1B3VA 3ARUA 1Z32X 1U30A 4E8DA 2XVNA 1JDCA 3RMEA 3GZAA 4U5IA 3VIOA 5A8OA 3D5HA 2EPMX 5D9NA 4K68A 4UNIA 1V08A 4OUEA 2JE8A 2J7FA 1LL4A 3K8KA 4S3JA 3GNOA 1NOWA 3EYPA 3VD7A 4RE3A 3GXMA 3EMCA 2DPEA 1BFNA 3PZIA 4H8UA 4AISA 1OBAA 3VGHA 4XB3A 1WZAA 4CCCA 3U57A 2UY4A 4H41A 3VM5A 4W7UA 1GHSA 1NH6A 5ABFA 5A2BA 2NT0A 1OSEA 3CIVA 1OD8A 1W1PA 1HP5A 1HP4A 2W66A 2GSJA 2DH3A 5M5DA 3VMOA 2WMJA 1FH7A 1UKOA 3VDAA 2OLHA 1E6ZA 3AHXA 1JG9A 1XCWA 1CDGA 5AYIA 2YL8A 1FFRA 4UQEA 2V38A 4HP5A 4MNMA 3AIRA 3UG5A 2ZXDA 4Z2KA 1EQCA 3OZPA 5AY7A 1QNPA 1W9UA 3VUPA 3MV11 1KXTA 1PZ3A 3WEZA 1J0IA 1S46A 4H04A 4A3YA 4Z2LA 1G0CA 2WHLA 2VRQA 5GPRA 1PIGA 1UKSA 7CGTA 1KGXA 1E0VA 3TP4A 3OGSA 3VGBA 1UR4A 4PRWA 1VJSA 1E55A 1I1XA 2XWEA 1HN1A 1ZBVA 5DO8A 4AY1A 3CUGA 4LGXA 2JEPA 2QPUA 3BSGA 4TOQA 3RM8A 2UY2A 5E6ZA 2OWXA 1E6XM 4P7QA 2D0HA 4U5KA 1EDGA 1H11A 2CYGA 1QNSA 4LPCA 2DDXA 4TTUA 2WC3A 1V3LA 2EXOA 4GI8A 1FA2A 1KWKA 2CESA 1JD7A 4ATDA 2JALA 1M03A 3WUFA 3U5UA 1V02E 4OJYA 2QMKA 4M81A 4D6IA 4W84A 1SR0A 4V27A 3BLKA 3MU7A 2ZX9A 4W87A 2PC8A 4AYSA 3O9NA 4MNLA 2G3JA 2CXGA 2OYKA 4W5UA 1ITXA 1E6NA 1Q6GA 3T09A 5CGTA 3O6AA 5D9OA 3SURA 2CHNA 4FLOA 3CUHA 4HA4A 1UH2A 1XH1A 3HMCA 4WKHA 1V0MA 4PMNA 1LG1A 1TR1A 4P7NA 1HJXA 3U5YA 1HJVA 3KEHA 2DSKA 2YLLA 4HPHA 4D1IA 5A8QA 3WD4A 1ZJBA 4KRUA 5LYRA 3B9EA 2O9PA 1CECA 3EDJA 4HU8A 5EFDA 3VDHA 5CG0A 3CH9A 3B9AA 1BAGA 1DHKA 1KFWA 3AFBA 6TAAA 1JFXA 2VJXA 1W9DM 4IPNB 1ZS2A 3HU7A 4GPNA 1H4PA 3AIBA 4LQ1A 1GW1A 1RD6A 1E4LA 5GNZA 3FAWA 1H41A 4XZBA 4UTFA 2VVNA 2WCSA 2WWCA 4PBGA 3NDZA 2BS9A 1JZ7A 4S3KA 1V3MA 3T0AA 4E8CA 2WHMA 3AMCA 3RDKA 3UR7A 3N17A 1XRVA 3WF0A 1JAEA 1WDPA 4UR9A 2Q8XA 4AZIA 3SCOA 3WNKA 1HJUA 1HNYA 1KB3A 2J62A 3WSUA 1PZ2A 2VCCA 1PX3A 4KMQA 5I2UA 4CVUA 3AOFA 3BCDA 1QW9A 4W8AA 4HZ7A 2YJQA 3VILA 4QDMA 4D6EA 4UQDA 2DGAA 2WZEA 4X0NA 2EPKX 3ZSSA 2E3ZA 1CGWA 4AD5A 1E6PA 1O7AA 3TONA 3BH4A 4FLRA 1J12A 3NSMA 4AIUA 3S6TA 3TOPA 5IHRA 3HJEA 2MANA 1C8QA 1OIMA 1MQQA 3DC0A 4JHOA 1DP0A 5CJ5A 2XIIA 3E1F1 4MB3A 2CBUA 5CSYA 1Q6DA 3A3HA 3CGTA 1R7OA 1TA3A 3NIYA 2CNCA 1ISYA 1KWGA 2RGMA 4UFHA 2C7FA 1LWHA 4J3TA 3WQ5A 2YDRA 3CMGA 3ZMRA 3LPOA 5BRPA 1ESWA 4FLSA 2BY1A 3MSDA 4JFTA 2ZX7A 1HJQA 2E0PA 3VKKA 1JI1A 1MYRA 3IK2A 2GJXB 1TZ7A 4HOXA 1VAHA 3AXHA 3BAWA 2CITA 5FCZA 3AZSA 2PWHA 4W89A 1AQHA 3AZRA 1QHPA 4MNJA 5I23A 3UEQA 4DWSC 3UR8A 3AIVA 3EMQA 1C7TA 4B9YA 4TVDA 1GHRA 1OGBA 1DWJM 4C7DA 3FN9A 4DWSD 1W9PA 4GO9A 4ACYA 4UFKA 1NOFA 3VD4A 2VL4A 2VVSA 1UR2A 1V02A 1X1NA 1JIBA 4AZ7A 4Z2GA 3RPMA 4YN5A 3VDBA 1BYCA 1XH2A 4P8UA 1CGVA 2W63A 1XD1A 2JFEX 2W62A 1DWHM 2V3EA 2IXUA 1LLOA 4B3LA 3PZTA 3FAXA 1B1YA 2XUCA 2WM0A 4GQQA 3SCQA 3VPLA 2F61A 5EMYA 3L4XA 1OT2A 2CBIA 1E56A 2V5CA 2WCAA 2XFYA 5A6SA 1R87A 1MXGA 3WBEA 4P8XA 1XH0A 3M6DA 1IV8A 2WMIB 4NRSA 1D7FA 3VMNA 1MXDA 4D72A 3K4DA 3AMLA 1JYWA 4DUVA 3WMCA 3N1AA 1UD3A 1FH9A 3LPPA 3POCA 2CKRA 1KCLA 1C8XA 4CUCA 4AIEA 2XVGA 2X8RA 1TVPA 4ZENA 1C3FA 3G6MA 1UA3A 4UOZA 4QLLA 4EAMA 1TVNA 1FP8A 2WHJA 1KBBA 1QBBA 3VTRA 3AMGA 3CZ8A 4JCLA 4URIA 1VBRA 5C70A 3PZGA 1B3ZA 1E43A 1EOMA 5CPSA 5ABHA 2X0YA 3ZJ8A 1V6UA 4MJ4A 3IANA 4UOQA 1JDAA 4D6JA 1VIWA 1WDQA 4EANA 1ZBWA 4GO8A 2FHFA 3VIHA 5A2AA 3SIMA 2ZUVA 1UKPA 2WXDM 3WMBA 3PZNA 3ARPA 3F5JA 1V0NA 3MMDA 4Z2IA 3EDEA 3WUGA 5I77A 1WO2A 4GXPA 1MFUA 5HDRA 3SCVA 1XC6A 2W5FA 5A6BA 3LPGA 3ALGA 4PMDA 2WNWA 1JAKA 3FHAA 3THCA 1H5VA 5CPQA 1C92A 4D1JA 1EH9A 1EXPA 1UUQA 2YOCA 2D2OA 4XUYA 5LA1A 2BHUA 1OT1A 4PCSA 2YA2A 1B3WA 3QHMA 1BGGA 1XYZA 2XGBA 3EMZA 1BVNP 5ABEA 5ECUA 4B15A 3T0DA 3IAQA 3L4ZA 3VX0A 5JBFA 1QI2A 1B3YA 3ALFA 1BG9A 3TTYA 2E4TA 4TUFA 3VM7A 2JF7A 3A47A 1CYGA 2QLYA 3WDIA 1SFSA 1TFVA 2W61A 4NZCA 4HMCA 2YDQA 4MDOA 2NSXA 4M24A 4CN6A 3MANA 4Q22A 1EQPA 4CD5A 5JIPA 5AC4A 3BSHA 3F5KA 1ISWA 4Z2JA 3AIWA 5HPOA 5M03A 3N15A 3DECA 2J7CA 4UOJA 8CGTA 1TUXA 4TXEA 1WAWA 1KR0A 3KL0A 3PZOA 2BY3A 3VX1A 2B31A 1LF1A 2X09A 3VGDA 2A3EA 1GQLA 1US3A 3NJ3A 3ARZA 4MJ2A 1E72M 2BNJA 4CU6A 1WZMA 3WDRA 1V6WA 2UWFA 5A8NA 1NWUA 2WPGA 1OB0A 5GNXA 3ZT6A 3WD2A 1MW1A 1VFUA 4UQ9A 3NSNA 4MTVA 4QP0A 4XX6A 2BXYA 3GTNA 1NWTA 4XZWA 2D20A 4NRRA 2CCRA 4PEEA 4F8XA 1NQ6A 3G6LA 2E40A 4HTYA 1YHTA 2A3HA 3OLIA 1F4HA 1VF8A 2WWDA 3UG4A 2NW0A 5HNNA 5JBDA 1JZ6A 1W32A 2E8ZA 4GZIA 1TCMA 3OLGA 2IXVA 1QI5A 1E0WA 2YLAA 1UR0A 2BXZA 2GJPA 3CLWA 2C8NA 1NARA 2CERA 2BHYA 1E3ZA 2XM1A 1DWGM 1E5JA 1UWQA 1EHNA 3N18A 1OINA 4CCEA 3WQ8A 3S2CA 2WLYA 1PEZA 2XFFA 3PTKA 4GZEA 3WEOA 1QOXA 4CN4A 1R8LA 1FP9A 1H49A 4BCEA 2O92A 2VMFA 5JUVA 2G3IA 2OYMA 4W86A 1U2YA 1QNOA 1V3HA 1G9HA 4PTXA 4OKDA 3OGRA 2DSVA 2O9OA 2FGLA 4L4OA 4ACZB 1DEDA 3CZJA 3W4RA 3WENA 2J8FA 1OCQA 1UD4A 1NWSA 4CVWA 1E6RA 4M56A 1Q6FA 1Y7VA 1UD2A 2VZTA 5FIPA 1SMAA 1WP6A 1V3KA 4EK7A 1V6VA 2DT1A 4W88A 4ACZA 3WQ6A 6CGTA 3SUTA 2ZWYA 1EDTA 2WC4A 1PPIA 1AVAA 1JZ4A 2G3MA 1UWUA 1AQMA 1KXVA 1WE5A 5ABGA 5HOSA 4P7OA 1BTCA 1DWIM 3AMDA 3SCSA 1KQYA 3SCRA 3CHDA 1HL8A 2ZUMA 2BHZA 1CTNA 2EEXA 1WPCA 1KQZA 2UY5A 4AD4A 1VB9A 1BYAA 1JNDA 5A2CA 2X1IA 1K6AA 3BAYA 1E3XA 2OWWA 4U3CA 1CXEA 1IZJA 1BPLB 1UD8A 4JKMA 1CXKA 2CBVA 3CZEA 4QFUA 4UCFA 1GPFA 3ZJ7A 3VINA 4HZ8A 4GINA 1UQZA 3WFZA 2BV9A 4MAZA 4F79A 3UG3A 3T08A 5GNYA 1XV8A 4E2OA 3VMPA 1OIFA 3WF2A 2WSPA 1D3CA 4AIOA 1KCKA 4EE9A 4BS0A 5CXPA 1ODUA 1HKIA 2DT3A 1ISZA 3QGVA 4PSRA 4D6GA 4GZJA 3FY1A 1MQRA 1GZJA 3B8SA 1ECEA 1WKYA 1VEOA 4JL2A 2ZUWA 1HJSA 4BQ5A 3ARSA 4W7WA 5E0FA 1WDRA 2XSBA 1XYFA 3AIUA 2XFRA 2D49A 1NP2A 3CO4A 2EPOA 1I1WA 2XPKA 1UH4A 2DH2A 1UD6A 4TX6A 1OM0A 1CBGA 3PTQA 5A94A 1VEMA 1QNRA 1A3HA 4MB5A 3ZJKA 5A8PA 3MMWA 1JZ5A 3VIJA 1X6LA 1FFQA 3WQVA 3VIFA 3MKKA 3AZTA 3GH5A 4AZHA 3CHEA 1AIWA 1E1FA 3DYMA 4TTGA 1V3IA 1SMDA 2ZUTA 4RE2A 5FL0A 1JDDA 4PUEA 3ARVA 1B2YA 2E9LA 2FHCA 1JGIA 4GI9A 3WDHA 3WDJA 3DYPA 2CPUA 4AZ6A 2CBJA 5E70A 1E70M 2X05A 5C71A 2DSZA 1GJWA 3T2OA 1G1YA 2E8YA 3WNLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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 1GZJ A;  3B8S A;  1ECE A;  1WKY A;  1VEO A;  4JL2 A;  2ZUW A;  1F40 A;  1HJS A;  3B7X A;  1FKF A;  4BQ5 A;  3ARS A;  4W7W A;  5E0F A;  1WDR A;  2XSB A;  1XYF A;  3AIU A;  2XFR A;  2D49 A;  1NP2 A;  3CO4 A;  2EPO A;  1I1W A;  2XPK A;  1UH4 A;  2DH2 A;  1UD6 A;  3OOB A;  4TX6 A;  1OM0 A;  1CBG A;  3PTQ A;  5A94 A;  1VEM A;  1QNR A;  4LAY A;  1A3H A;  5HKG A;  4MB5 A;  2PV1 A;  4J4O A;  3ZJK A;  5A8P A;  3MMW A;  1JZ5 A;  3VIJ A;  1X6L A;  1FFQ A;  3WQV A;  3VIF A;  3MKK A;  4DRP A;  3AZT A;  3GH5 A;  4AZH A;  3CHE A;  1AIW A;  1E1F A;  3DYM A;  4TTG A;  1V3I A;  1SMD A;  2ZUT A;  4RE2 A;  5FL0 A;  1JDD A;  4PUE A;  3ARV A;  1B2Y A;  2E9L A;  2FHC A;  1JGI A;  4GI9 A;  3WDH A;  4ITZ A;  3WDJ A;  3DYP A;  2CPU A;  4AZ6 A;  2CBJ A;  5E70 A;  1KT0 A;  1E70 M;  2X05 A;  5C71 A;  1ROU A;  3NI6 A;  2DSZ A;  3KZ7 A;  1GJW A;  3T2O A;  1G1Y A;  2E8Y A;  3UI4 A;  3WNL A;  1U79 A;  2QMJ A;  2WAG A;  3MUI A;  3OZO A;  5HTG A;  1UWR A;  3FND A;  2YL6 A;  1H2J A;  1BF2 A;  3KZS A;  4AMC A;  3B9D A;  2WMF A;  4Y7E A;  2J7H A;  3QHO A;  2J7B A;  1UOK A;  4J3W A;  3RFW A;  3I3B A;  1V6Y A;  4OBS A;  3BAJ A;  4J3S A;  3A4A A;  1GQJ A;  3GXI A;  3EBV A;  2DSU A;  3T2Q A;  1QHO A;  4B9Z A;  1PJ9 A;  1BYB A;  5CSU A;  4DM2 A;  3OLD A;  4NF7 A;  3MV0 1;  3PRB A;  2RGL A;  2F2H A;  1HXJ A;  3L4V A;  2QHA A;  5HW8 A;  4ZPT R;  1E4I A;  1M7X A;  1V03 A;  3MSG A;  3PBG A;  1YQ2 A;  3OG2 A;  2WSK A;  2KI3 A;  4A4A A;  4AEF A;  2ITK A;  3LPF A;  3CHC A;  3OB8 A;  4XV0 A;  5D8W A;  2D24 A;  2ZX8 A;  2OWC A;  4W85 A;  3ZT7 A;  3GNR A;  5IDI A;  1A47 A;  1E4N A;  4MB4 A;  4WSJ A;  3SUW A;  1CPU A;  4J27 A;  3GBE A;  4UFI A;  3KL3 A;  2XVL A;  4LXF A;  2A3C A;  1ED7 A;  1PAM A;  2VQU A;  1GOO A;  1K9D A;  4OIF A;  1E4M M;  3KWX A;  2WLZ A;  1B3X A;  2VQT A;  2YBU A;  2DG3 A;  4OOU A;  1V0L A;  1RP9 A;  4PMO A;  3AJ7 A;  3HN3 A;  4IQ2 A;  4ZFM A;  3FXY A;  1RPK A;  1DWA M;  1GOM A;  4F66 A;  1KGW A;  2QPS A;  4JKK A;  5AC5 A;  1DTU A;  4BQ2 A;  1D2K A;  1CXI A;  2OYL A;  3CUF A;  3VIM A;  2GFT A;  2WKG A;  3ZQ9 A; 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