1H0IA

Complex of a chitinase with the natural product cyclopentapeptide argifin from gliocladium
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title High Resolution Inhibited Complexes of a Chitinase with Natural Product Cyclopentapeptides - Peptide Mimicry of a Carbohydrate Substrate
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1h0iA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1h0iA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h0iA01
4DWSC 4CCCA 5FOOA 2PWEA 4UR9A 1W1PA 3WNNA 2WK2A 2G3MA 3EDKA 1F4HA 4K68A 2WMKA 1E6PA 1O6IA 3SUSA 1GOKA 2CNCA 4ATWA 3WUFA 3BLKA 3W82A 3ZJ8A 4FF5A 2D24A 2OYMA 2JFEX 3KE0A 5LA1A 1KFWA 1EIBA 3UETA 3VO0A 2JF6A 4CD6A 4D6JA 3PTQA 3U57A 4RL3A 4JKMA 1OB0A 4N0RA 1B90A 1BVNP 4W87A 4PMNA 1FH7A 1AQMA 2WMIB 1CXIA 1UH2A 1NP0A 3K4DA 1XH1A 1E3XA 1KXVA 4GO8A 4D6CA 2W61A 1WDRA 3CLWA 4Y7EA 2JIEA 1US2A 1FHDA 1E40A 3EMZA 3SCOA 2NW0A 3SCUA 2G3NA 1E6ZA 2CPUA 3WD2A 2E8ZA 3WUEA 7A3HA 4MNJA 1GJUA 1PX8A 3N11A 4Z2HA 2UY3A 3ARSA 4RE4A 1KR1A 4YPJA 3ALGA 4X0VA 4CU8A 2FHFA 1BTCA 3BMWA 1V0KA 1GNXA 1WDPA 1C91A 3WH9A 1G0CA 1P6WA 2VX6A 2WHJA 4GQRA 4AISA 1XGZA 1Y7VA 3CH9A 2VRQA 2ZWZA 5LA2A 3BH4A 1MW1A 1JG9A 3POCA 4W7UA 3UESA 1E55A 3CZ8A 2WYSA 2DQXA 4KH2A 3W6MA 1M53A 4BS0A 3WF2A 5A8QA 2VT0A 3WQ4A 1OIMA 4R5EA 2DSVA 4W5ZA 3W24A 3VIHA 1HKMA 3VIMA 1BSIA 4AWEA 3ZR5A 3SCVA 3GH5A 1UD6A 3EDJA 5A6SA 3SCSA 1J10A 2FGLA 4PMRA 3RJXA 1E15A 2XGIA 3KZSA 3WNKA 1V03A 2Y8KA 3OZOA 4DM2A 4ZE4A 2OSWA 3VX1A 1JZ6A 1ITCA 1VAHA 3QGVA 4BZYA 1LWJA 2WHKA 1MVYA 5BXRA 1ZL1A 5A6BD 4HTYA 2ZUSA 3ARUA 1W9DM 3ARRA 2VCBA 5EFFA 5DT7A 1GCYA 1BF2A 3BSHA 1HIZA 4AZGA 4WK9A 2WLYA 3WFZA 1HL8A 1GQLA 1ECEA 1FOBA 3QHMA 2Y4SA 2D1ZA 1EXPA 3DYMA 2DSKA 4WSKA 1JAEA 3AMLA 2EXOA 1W2PA 3FNDA 4CD4A 3SUVA 3WKZA 1UQZA 1WP6A 2XSAA 3VU2A 1V3MA 3CBWA 3BAXA 3NSNA 3CGTA 4CD5A 1G94A 4HA4A 2C7FA 4PTVA 2VRJA 4UQDA 2FH8A 4URIA 4QCFA 3NJ3A 3AXIA 4CU6A 2V3EA 3WDRA 2YL6A 5JBDA 4WF7A 2DEPA 3WSUA 1V3JA 1JXKA 1XV8A 2WVTA 3MS8A 1R85A 3WF0A 1PEZA 2OYKA 1UD4A 2IUZA 2ZUNA 5TD4A 1E43A 3W4RA 3L4ZA 4JCMA 3FY1A 2XVKA 1JZ8A 2ZUWA 1XD0A 4GINA 5GNZA 3LPFA 1EA9C 3CUHA 2QLYA 1E70M 2ZUVA 3EYPA 3IJ9A 1H41A 4AXNA 4UFIA 3GNRA 2DIJA 1GQJA 2YLAA 4AD0A 2XIBA 2VVNA 1EHAA 3AS3A 2GFTA 2J7BA 1ZB5A 3T2QA 1UD2A 4P7LA 3A3HA 1HN1A 1OT2A 3GH7A 4PUEA 3VD4A 5I79A 4GZIA 2WBGA 5DT5A 4JKKA 1LQ0A 2VJXA 2G41A 4MTVA 4BA0A 5HPOA 1EDQA 1CENA 4N42A 5HPCA 4JL2A 1CYGA 4CUCA 2GJRA 2VNCA 3AS2A 3ARZA 4U31A 3F5JA 1R87A 2XFYA 3AZTA 1D3CA 2X1IA 1GVYA 3AROA 2QHAA 1OWQA 5I78A 1W9PA 3TTYA 1HP4A 1ZBWA 1UR1A 3GZAA 4Z2LA 3KWXA 1B0IA 1JYXA 1J18A 3T2OA 2J8FA 5A95A 4AZ5A 1EOMA 3L4WA 1W2VA 2VR5A 4P7QA 1PZ3A 4JZ5A 5FL0A 4P7RA 5ABFB 5E0FA 1WNOA 2O92A 2VURA 4PYSA 1AMYA 2EJ1A 3QHNA 1IV8A 1HKKA 1FH8A 5GQBA 1XC6A 4QLJA 2UY5A 2BXYA 3ZO9A 4S3JA 2J25A 2Y2WA 4P8WA 1KR0A 1BHGA 1GQKA 1FFRA 1HXJA 3N12A 3W38A 2BXZA 3ALFA 4E8DA 3ZSTA 2VR4A 1CIUA 1LF1A 5JUVA 5M3WA 4HPGA 4BQ5A 1V6YA 3VGFA 4OKDA 4AEFA 5IXEA 4JAWA 2CCRA 2YDSA 2WPGA 4NRSA 4LYRA 1W3HA 3ARTA 1UWTA 4U2YA 3A47A 3L4UA 1TE1A 1J0YA 1KGXA 3K8MA 3IJ8A 4D6GA 1H2JA 4W93A 3ZT6A 1CECA 1JF5A 3RDKA 1UZ4A 4CGTA 1CLVA 1ED7A 4AD2A 1BYAA 3CZEA 1QNRA 2PBOA 3WIJA 1UKOA 3OB8A 1EHNA 3AZSA 5ABGA 1JZ7A 3GNPA 2PC8A 3W81A 3MO4A 2DGAA 2YA1A 4W5UA 2VMFA 2VRKA 2D22A 3N1AA 1XYFA 2XVNA 1UKTA 4PMDA 2ZE0A 4HPHA 5DMYA 3WDHA 1NWSA 1WDQA 2G8ZA 2VTFA 3BCFA 4CN4A 3SEPA 3CPUA 1BYCA 3L4VA 1UR8A 1MYRA 3AHXA 1JNEA 3VIIA 4UFMA 1UZ1A 5CPTA 2Q8XA 2J7DA 1E5NA 3HU7A 5A6KA 1GHRA 2X09A 1IZKA 4J27A 3GBDA 3PZIA 3WEOA 3FAXA 1QW9A 2UY2A 3GYCA 3NUKA 4DWSB 3WH5A 3SUTA 5IFPA 3CUJA 1CXEA 1Q6CA 2D0HA 1R8LA 2V38A 4JCLA 3BMVA 1WE5A 3VKKA 4M56A 3VIKA 5A2BA 1CPUA 3VM5A 4OJYA 1NWUA 2BY2A 4HA3A 4UZSA 3GDBA 3PZTA 4UZUA 2CERA 1PBGA 2VX7A 4MPKA 1VFUA 2XG9A 1PIGA 4YHGA 2F8QA 1E6XM 2D2OA 4U3AA 4M82A 1E6SM 1UH4A 1KQZA 5DEZA 1VIWA 3PBGA 1OINA 1PX4A 3VGGA 4MB3A 2YDQA 1CXHA 3IAQA 4AD5A 1V02A 2EO7A 1YQ2A 4WJXA 3WQVA 1Q6FA 4FLSA 1V02E 5D9OA 3A6OA 4LYPA 4D1JA 1NOUA 2IXUA 4PCSA 3BLPX 1E4MM 3AYRA 3WQ6A 1PZ2A 1ESWA 2Y24A 4JFWA 2E8YA 3VM7A 2A3HA 4J3VA 5AC5A 1G1YA 1ISYA 3AICA 1OD0A 2CKRA 2BNJA 2O9OA 1IT0A 5DF0A 2J8GA 1A47A 4LYQA 3QR3A 1J12A 4LGXA 2WW5A 3AXXA 3WDPP 6A3HA 3VD9A 1VRXA 2PI6A 1UWUA 3WELA 1Q6GA 2DSUA 1H5VA 1DWJM 2CIPA 4P8UA 4AZCB 4PBGA 3MMWA 1LL6A 2EPOA 2EPKX 4NRRA 2GUYA 3VDBA 2ZXBA 2E9LA 1UR2A 5ABEA 4MNMA 4HZ6A 3K1DA 3PN8A 1RP8A 1EO7A 2VX5A 1LLOA 5C70A 3B9AA 1JGIA 1JD9A 2PWDA 1H11A 1TVPA 3ZMRA 3I3DA 4PMVA 1S46A 3WDJA 5A6BA 5F7UA 4W7WA 3WF4A 1WAWA 2D20A 3FHAA 2ZX7A 5I2UA 2FH6A 3RCNA 3T09A 2XYLA 2YIHA 5AYIA 5BXPA 4RE2A 2WVVA 5LA0A 2WVSA 4HMDA 2VZSA 1UR0A 5BRQA 1F4AA 2O9RA 4PMYA 3N17A 3L2MA 1VBRA 2UY4A 1MW0A 3EBVA 1XSJA 2XVPA 3B9EA 3G6MA 1OCQA 1ZS2A 5A8NA 1ISXA 4ACYA 3GXMA 1E5JA 2W67A 3MSDA 3NSXA 2PWHA 5E9AA 4M80A 1C92A 5FKYA 1CGVA 1FH9A 5LYRA 1WZMA 3VOCA 3S6TA 1E56A 3UEQA 3ARPA 1B9ZA 3AIUA 2GDVA 5D4YA 3VINA 6CGTA 2WXDM 5FL1A 5I5RA 5AC4A 4E2OA 1Q6DA 1OM0A 3FAWA 3WD4A 1XYZA 4JFUA 4XZBA 5A94A 1K9TA 1UR4A 4D6HA 4UOZA 1JFXA 4J3XA 4J3SA 4U33A 1GONA 2DSZA 4KRUA 3WENA 4LXFA 1RD6A 3AS0A 5CZKA 2D49A 1W9XA 2CBIA 3EDDA 3N18A 5EB8A 1QNQA 3PZVA 2DH3A 2Z1KA 3WD1A 1QHZA 1M03A 3NYDA 1N82A 2X8RA 3SUUA 1QNOA 1C3FA 3W6LA 1EGZA 4WSJA 2WMGA 2VCCA 3AMDA 1DWGM 1VENA 2CITA 2YL9A 3AIBA 2F2HA 3FN9A 3APGA 4H8UA 5GNXA 2WCGA 1CDGA 1MQQA 2GSJA 4A3HA 4QP0A 4HOZA 3WH7A 1UKQA 4AIEA 2J62A 1VJZA 3N15A 4ZXLA 1JDDA 2J77A 3DECA 4JKLA 1CEOA 2OLHA 3OLDA 1UD3A 4NSBA 2WHLA 2OSYA 4BQ4A 2V5DA 3L4YA 3VX0A 3O6AA 3ARXA 4UFKA 1OGGA 3IANA 1Z32X 3KL5A 3OGSA 3SURA 2QPSA 4WKFA 3PZMA 1HJQA 1V3IA 2QMJA 2WB5A 4JFVA 3ARVA 4TOQA 3WMBA 5AY7A 5IDIA 1J9YA 1TR1A 1UQYA 5E09A 2XVLA 4IISA 2VOTA 4CVWA 2UWFA 3PZUA 5CG0A 5D9NA 4ML4A 1PPIA 4TVUA 3W28A 9CGTA 4UFLA 2QF8A 2WNWA 3DHUA 1TZ7A 2OYLA 2AMGA 1OBAA 1UR9A 1K9FA 4P7OA 1XSIA 2CBVA 3GNOA 4TTGA 1CGYA 3FHQA 3D3AA 3CUGA 1CWYA 4X9YA 2WMFA 4H8HA 4DUWA 3WQWA 1QBBA 1JYNA 2WCAA 1V6WA 3M6DA 1R7OA 3UG3A 3WH6A 4JHZA 1E6NA 2ZX9A 2X0YA 3J7HA 3EDEA 1GW1A 4V2XA 2WCSA 4HU8A 3WL1A 1SYTA 2W4XA 1OGBA 4F9DA 4HOWA 2XFFA 3TA9A 3M07A 1ZBKA 1OGSA 4TVCA 2BY1A 1VF8A 1KWGA 2BHZA 1HJXA 1MFVA 3TP4A 2OWCA 1CBGA 2XFRA 1KXQA 5CSYA 1V3LA 1E4NA 1HJWA 1E72M 7CGTA 5ECUA 3SIMA 4CU7A 4P7NA 4AMCA 3B9DA 2FHBA 1JZ3A 2PBGA 4CN6A 4F79A 5A69A 2WMHA 3OLEA 3VIOA 4H7VA 5JBFA 4FLOA 8CGTA 1XD1A 2HISA 4U5KA 2PB1A 5JH8A 1DWHM 4MNLA 3UR8A 3BXWA 2ZXQA 3VDCA 1DP0A 4HOXA 2DPEA 1TA3B 3LPOA 1BVZA 1MW2A 2CBJA 2WMIA 3PZOA 5FIPA 3W26A 4M81A 4ACZA 5ABHA 3SCNA 1XRVA 4PSPA 4AEEA 1U30A 5IHRA 3E1F1 1H0GA 1SR0A 1FP8A 3WBEA 3U7BA 4GO9A 2G4FA 3MMDA 1WO2A 4DM1A 1H4PA 2D0GA 4TXEA 3TTSA 1KBBA 1W3LA 3W53A 2ZX8A 4HU0A 1UA7A 3LPPA 2PWGA 3BSGA 1K9DA 4Q22A 2WHMA 2WC3A 2YA0A 3WL0A 2XPKA 4JL1A 3VGEA 1NQ6A 1C8XA 1I75A 4IM4A 4Z2IA 3OA5A 5HBFA 1BGAA 1RPKA 1NP2A 3VMNA 2CXGA 5GNYA 1QBAA 2VUYA 3W27A 1JZ2A 3WD3A 1BAGA 4PMQA 3MUZ1 3BCDA 2D3NA 1HX0A 3MV01 5A8OA 5CQ1A 3K46A 2ZX6A 3ARQA 1JZ4A 1KGWA 2W62A 1D2KA 2V3DA 1JXJA 5BRPA 1ZBCA 4V27A 3VNYA 4M24A 3SCTA 3W0KA 1UWSA 3FW6A 4M8UA 1JYVA 3VD7A 1SMDA 2PWFA 3KL0A 4AY1A 4WKAA 1JD7A 2X2YA 2JALA 4B9YA 3VDHA 2WBKA 1MQPA 4YN5A 4AD3A 2XM2A 3EMQA 1YHTA 2WWDA 1GPFA 4LQ1A 4UCFA 1JNDA 3CZLA 2GJXA 2IXVA 2RGLA 3RM8A 5GPRA 1E0VA 3OGRA 1PIFA 1ISWA 1CZ1A 2W91A 3TTOA 4DUVA 1WCGA 3OBAA 2XIIA 1X6NA 4Z2KA 4JFTA 2V3FA 4J28A 3CUIA 2E40A 5A8MA 1OSEA 5E70A 1MFUA 1BYBA 3TTQA 1UWIA 4TX8A 1QVBA 1UA3A 2J7EA 5DO8A 3RM9A 5BWFA 4FLQA 3UG4A 4PCTA 1B3ZA 3AZRA 5FD0A 5A2AA 1LG1A 1TMQA 1J01A 5I77A 1VBUA 2YL5A 2OWWA 3WEMA 1WZKA 3ECQA 2CEQA 2AAAA 3ZM8A 2CKSA 1O7AA 1OT1A 1WDSA 2BVDA 1XH2A 1PX3A 5HOSA 1LWHA 4PUDA 4MB1A 2WC4A 4NI3A 2BVYA 3WQ8A 1GOWA 2WSPA 1I1WA 5HXMA 4QCEA 2RGMA 1AQ0A 1FFQA 3FXYA 1GZJA 3QOMA 3VGBA 1WZLA 3VMOA 1X1NA 5CLWA 1KWKA 2FGZA 3GBEA 2A3AA 3IK2A 3T2PA 1NH6A 1EOKA 3WDIA 2BHUA 1ZJAA 1R7AA 4S3KA 1GQIA 1L8NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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