1H0IA

Complex of a chitinase with the natural product cyclopentapeptide argifin from gliocladium
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title High Resolution Inhibited Complexes of a Chitinase with Natural Product Cyclopentapeptides - Peptide Mimicry of a Carbohydrate Substrate
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1h0iA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1h0iA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h0iA01
4CCEA 2YBUA 2WXDM 1KQYA 1NWSA 3WQ8A 4A3YA 2XFYA 2PWEA 1QI3A 2J7GA 2XFRA 2BVYA 1NH6A 4UFLA 1KXVA 2XTKA 2VTFA 4B9YA 1TCMA 1X1NA 1GQKA 2WHKA 2PWFA 1H0IA 1W1VA 1OD0A 1HL9A 1U30A 3VGFA 3VIGA 4FLQA 1C90A 3CPUA 1JF6A 1P6WA 3MV11 3F5JA 1E3ZA 2X0HA 3T09A 1TG7A 2FH6A 4AW7A 3OZPA 1ZJBA 1GOMA 2IXVA 1BVNP 3W24A 2ZUSA 3F5LA 3D3AA 1XSKA 1BQCA 3A47A 2WKLA 3HMCA 1J0KA 2WVUA 3WL1A 4DUWA 1HL8A 4U5KA 2ZWYA 4AZCA 5IHSA 1UWIA 3RDKA 3ZT6A 2EPMX 4CN1A 2CBVA 1FP8A 4B3LA 1QI5A 4UQCA 4PMQA 2XWDA 1E5NA 3ZJ7A 3L2LA 2DPEA 4GO8A 4ATDA 3OGRA 3TTSA 1UWRA 5GQBA 3WEMA 4KGLA 7CGTA 2YBTA 4J3WA 1M7XA 4OBRA 4XZWA 2X2YA 5I78A 4Z2JA 1J11A 2Y24A 3ZJKA 4P8XA 3CUJA 4MAZA 1HF6A 4D72A 1CXHA 2NSXA 3B9EA 1X6LA 4AD2A 3O2LA 4F9JA 1ISZA 4W7WA 3F4VA 4JFVA 4D6JA 1XC6A 2D2OA 3N12A 4ZEPA 1XYFA 4F8XA 1JYXA 4MJ2A 1CGTA 4U33A 1R85A 1US2A 3WBEA 2WSKA 1OGSA 4UCFA 2A3BA 2F61A 4KRTA 4MNLA 2WKGA 1V0MA 1VBUA 4PBGA 3WMCA 2GDVA 5A8NA 3A6OA 5EBAA 3N9KA 1GHSA 4EAMA 5A1AA 3SCTA 4HOZA 1MFUA 5GNZA 3QHOA 1HJXA 4W7UA 4HOXA 1LG2A 1B0IA 3W37A 2G3JA 4M8UA 1R86A 1GOIA 4Q22A 1X6NA 2J47A 4CVUA 1HX0A 3UETA 1JZ8A 1XHGA 4EANA 1EO5A 1KBBA 2YLLA 2F2HA 2CNCA 4V28A 1ESWA 1NOFA 3CZGA 1OWQA 3AHVA 5EFFA 4CD5A 4QCEA 2XM1A 1HJUA 1K9FA 3BCDA 4NRRA 4PRWA 3G6MA 4P8VA 1UH4A 1UR0A 5FL1A 4AWEA 2FHFA 3JUGA 1ZBCA 1RD6A 3WQWA 1GW1A 1UWTA 3PZOA 2WBKA 3EDEA 3W25A 2BVTA 3LPPA 2CXGA 4PYSA 1H5VA 1RP8A 5D9NA 1MFVA 2G3MA 5F7UA 1E0VA 3EBVA 1PAMA 1EA9C 1JGIA 3THDA 2WWDA 3DHPA 3K8LA 4M80A 1BG4A 3T2QA 2EJ1A 1BYBA 4CVWA 3MSDA 3I3BA 3PTQA 3ARZA 3B8SA 3WUFA 3VDBA 4UOQA 1J01A 2EXOA 1L8NA 1C8YA 1XH2A 4OOUA 1KCKA 4PTWA 1GJWA 2O9PA 3RCNA 3FW6A 1UH3A 3VOCA 4TVUA 1OGBA 2GJRA 5A8PA 2VNCA 4H04A 3LPGA 1DWFM 4UFMA 3K4DA 1V6UA 4JKMA 2VVSA 1V02E 3T0DA 1XD0A 1UZ4A 2UY4A 5BROA 3WDPP 3I3DA 4FLRA 1H1NA 3CHFA 4IPNB 3MUAA 3WH8A 4KMQA 3DYMA 2FGZA 4PMYA 4TTGA 3RJYA 2DSVA 3O9NA 4X9YA 3DYOA 4W88A 2WZHA 4ZXLA 4AYSA 3K8KA 4CCCA 1V3HA 3CZKA 1O7AA 5I2UA 4XUYA 4Z2KA 4NRSA 1G5AA 1E9LA 3F5KA 3MS8A 5A6AA 1GORA 5FCZA 1UR8A 3WD1A 5CPQA 3T2OA 3CZJA 4KRUA 1H2JA 1AMYA 3QOKA 1VIWA 5IDIA 1JDAA 2DT1A 2DH3A 4AIOA 3RM8A 5I23A 1JFXA 2CBJA 2WC4A 2GVYA 1HVXA 5I24A 5C8BB 4PMXA 2WMIA 2WVTA 3OLIA 1V6WA 1MQPA 3NDZA 4ACZA 2MANA 1SR0A 1JYVA 4GZIA 2VC9A 1EH9A 4RL3A 3T0BA 5HPCA 2BHUA 2WZEA 3GYCA 3VIJA 3WMBA 1R7AA 4TVCA 2WVSA 1A3HA 5BXRA 1EQCA 1LQ0A 2VO5A 1ZBWA 5TD4A 2ZIDA 4L4PA 3CLWA 3PZQA 4HMEA 1EDTA 1JAKA 3OG2A 1KXQA 1I75A 4MJ4A 4PCSA 1JZ6A 4B16A 2WBGA 1QI2A 3L4VA 1AQ0A 1VFMA 4H8HA 3E1F1 4W87A 3ZIZA 3L4XA 2E0PA 1B3YA 3W82A 1CXLA 1KFWA 4MAVA 1JD7A 1BYAA 3QHMA 3OIHA 3CBWA 1PPIA 2VMFA 2VJXA 2CKRA 2WZIA 4WJXA 5HNNA 3CHCA 3UCQA 2BNJA 3THCA 2WMJA 2YLAA 5D8WA 3WFLA 2J62A 2WHMA 4D6CA 1JNDA 1JZ5A 4W85A 4AIEA 3W0KA 4W8BA 3WNNA 3ZT7A 4HOWA 3O6AA 4UQ9A 5JUVA 5KEZA 1TUXA 1UZ1A 2WMIB 3AIWA 3AHZA 3IJ9A 1QHZA 1UH2A 2PI6A 2VZUA 4LGXA 4ACZB 1Q6EA 1OD8A 1V6VA 1ISVA 1H41A 3QR3A 2C7FA 2WNWA 4Y7EA 1V3MA 1CECA 2DQXA 4H2CA 3AYRA 1W3HA 3VIIA 3CHDA 2VZTA 5M3WA 3BAKA 4MTVA 1GQIA 2W63A 3SUWA 5IHRA 5A6BA 4PMNA 1QPKA 2YJQA 2ZE0A 1W9PA 1J10A 1CGVA 5D8ZA 5DMYA 4CCDA 2OSXA 3UERA 1V08A 1VEOA 1WZMA 1B3WA 5DEZA 3QOMA 1TE1A 5CZKA 2WM0A 1W9DM 4HA4A 3ARVA 5A6LA 3DYPA 3MU7A 2C8NA 4XX6A 1VB9A 3N04A 2A3HA 2J79A 5I0DA 4AY1A 4N0RA 2DSKA 4A3HA 1KGUA 2VZVA 1GNXA 3ALFA 1UA3A 1ZU8A 3B9AA 1E6ZA 3GBEA 4M1RA 4W93A 5D9PA 2UY5A 1B3ZA 1GQJA 1VAHA 2J7FA 4U2YA 3PZ9A 3MV01 3L4ZA 3N18A 3NUKA 4BCEA 3AHTA 4M24A 5I3DA 4M81A 3VVGA 2ZICA 3TTYA 2DSZA 4W8AA 4TVDA 1J9YA 1XCXA 2OSYA 1MW0A 2AMGA 2W62A 2VX6A 4JCLA 1V3JA 4XZBA 2YDRA 1BF2A 4AEFA 3WY1A 2ZUWA 2YL9A 1QNPA 3WNMA 4GKLA 3W53A 3AS0A 1DHKA 4OUEA 4AD4A 3ZSSA 4HZ8A 4U31A 4ACYA 2ZXAA 1WO2A 4YN5A 4D6FA 2G3IA 5A2AA 2XG9A 4JIEA 2E8YA 1UYQA 5E70A 2DEPA 3K1DA 1MW1A 1UR4A 4UFHA 1B9ZA 2VL4A 1KCLA 3OZOA 1JI1A 4JZ5A 2NT1A 3M46A 3SIMA 4BQ5A 4JKLA 1FFRA 3ARRA 7TAAA 3S6TA 4AD1A 4GQRA 2YDQA 4J28A 1NWTA 4U3AA 2VOTA 4PMOA 2VRKA 2XSBA 1NP0A 3AMLA 1H11A 2VX5A 4OZOA 4LYQA 1BFNA 4MNKA 1JZ3A 3BC9A 2GJPA 4JHZA 4M82A 4KGJA 5LA1A 4PCTA 2WMGA 8CGTA 4UZUA 2V3EA 2ZX6A 3VDHA 2CBIA 4TXEA 3WQ4A 1GONA 4QCFA 2WANA 4WKFA 1FOBA 4CU7A 4ATWA 3IANA 2QPUA 1MXGA 1G0CA 1TMQA 4WKHA 4OBSA 2PC8A 2ZX7A 3VD9A 1W3JA 2UY2A 1AQHA 3CUIA 2BVDA 1KXHA 5DF0A 4AZIA 4TTUA 5ABHA 1XSJA 5FKYA 3GXIA 1H3GA 1R87A 1JZ7A 3NCOA 4B9ZA 3PZVA 2JF7A 2VI0A 4L4OA 4BS0A 2YA0A 2OWWA 5E6YA 3AQUA 2CETA 1B3XA 1QOXA 4JL2A 1WP6A 2VCAA 1I1XA 2X8RA 1EDGA 2TAAA 1CZ1A 1CLXA 3UG4A 3VD5A 5BRPA 3DC0A 3D5HA 4KWUA 3BLKA 3CZLA 1E70M 4LQ1A 2J25A 1V02A 3UR8A 4QDMA 4BQ3A 2Y8VA 3IJ7A 4UQDA 4UOZA 2DSUA 1NOUA 2QV4A 1CDGA 1JFHA 2WHJA 1CTNA 1B2YA 1W9VA 3ARSA 1WDSA 2IXUA 4D71A 3W28A 5FOOA 3SUUA 3VIMA 2J8GA 3PZGA 3WUGA 3WNOA 1OBAA 2DIJA 5A94A 1BHGA 1Q6GA 3ARQA 4CN4A 4HA3A 1J0IA 4OIFA 5D9MA 1BAGA 1C3FA 3WDJA 3GH4A 2WWCA 4DWSA 3ARTA 4P7QA 2W5FA 1BPLB 2VZOA 3TP4A 5A2CA 1VJZA 2ZUUA 3LPOA 3GNPA 1B1YA 1CGXA 3SCUA 2VR5A 3WD4A 3MO4A 2WMKA 2XVNA 1F4HA 3AISA 1G94A 4IUGA 3WIJA 3APGA 1HIZA 5FIPA 1FH9A 4ZXOA 2J7DA 3PN8A 4EK7A 1HT6A 2CPUA 1NOWA 4MB1A 2GK1A 7A3HA 1WZLA 4AXNA 1LL6A 2J7BA 1VFOA 1M04A 5CPSA 4GZEA 4TOQA 2JEQA 1QI4A 2WMFA 2ZX9A 3IAPA 4PMVA 1LL4A 1XH1A 1KR1A 3POHA 1NARA 1GVIA 1PBGA 1XYZA 2XIIA 1XCWA 4MDPA 4C7GA 5A3HA 1UWUA 3VMPA 4GI9A 3KE0A 1WCGA 1BYCA 2GJXB 1R7OA 1JZ4A 2WYSA 3VM7A 3VX0A 1H4PA 3BAYA 3N13A 1V0LA 3BAXA 3VIHA 2Y8KA 3VX1A 3SEPA 3N15A 3ZR5A 2FH8A 1VFUA 5I5RA 4DWSB 1EOMA 4Z2HA 1L0PA 5GNXA 1BVZA 2YDSA 2EBNA 1KBKA 5E0FA 1WNOA 1KR0A 3NDYA 4GQQA 4FLSA 1H09A 5BXTA 3ZJ8A 2V5DA 3FHAA 1TVNA 2XUCA 3QGVA 4M29A 3VMOA 5JBEA 3RM9A 4OKDA 2J74A 4N42A 2ZUMA 4ZENA 3WD0A 1S46A 4AZ6A 1JD9A 3RIKA 1WKYA 5HDRA 1VBRA 2Z1KA 3CMGA 1NQ6A 3WNKA 4AEEA 1E5JA 2Q8XA 3PZIA 3FXYA 2G3NA 2YL5A 4C7DA 2UWFA 2BV9A 3CO4A 5I6SA 2GK1B 3GXMA 1D2KA 3VDAA 5EMYA 1Q6CA 4JL1A 4DWSD 1KGWA 4WKAA 3WQ5A 5CPTA 5EFDA 2WC7A 3PTMA 2JE8A 3MMDA 6CGTA 4MPKA 2VT0A 2D0FA 2D3NA 4U3CA 2A3AA 4GI8A 4JFWA 1WDQA 1JYWA 1QHPA 2CBUA 1NWUA 3AXHA 4JCMA 2XGBA 2EPLX 3VIKA 1OSEA 1QW8A 2YL8A 1G1YA 3M7SA 3NSNA 4MB3A 1UWQA 1SYTA 2O9TA 3BGAA 2WLYA 4P7LA 1AIWA 4P7NA 5C70A 4LYRA 3WENA 3AS2A 1GCYA 1HKIA 3BAIA 5BWFA 1H0GA 4W89A 2E9LA 1ISWA 1WDRA 2XFFA 4W86A 1BGAA 4CU6A 2ZXQA 5A6KA 4DUVA 1OIFA 3N17A 4UFJA 4HP5A 1DP0A 3WH7A 3RJXA 1QBBA 4B3KA 3TA9A 1FHDA 3LPFA 3VNZA 3A3HA 5IFPA 5BXPA 1K6AA 2GUYA 4Q7NA 4URIA 2D22A 1E4MM 5I79A 1E0XA 3NSXA 1GOWA 3IJ8A 1YHTA 1GHRA 4W5ZA 2OWXA 2QLYA 3WBAA 2NW0A 2E4TA 4PN2A 4PUDA 4H41A 3OBAA 1KGXA 1TZ7A 3W27A 1E4IA 2PBGA 5HOSA 3WF2A 3AZSA 1DTUA 5CGTA 2BY0A 2FHBA 5I77A 1PZ2A 1E6QM 5GPRA 1UUQA 1RPKA 4HPHA 2OLHA 1TVPA 3BH4A 3WDQA 3L4YA 3PTKA 3PZNA 5JBFA 3I3EA 1RP9A 4F9DA 1XRVA 2JIWA 2VCBA 3AZTA 2O9OA 4JKKA 1LJYA 3VGEA 4HMCA 3EYPA 3CMJA 4KH2A 4J3XA 1B90A 1EDQA 1HXJA 2AAAA 3BAWA 3NIYA 2BHZA 1W9UA 3K46A 2QHAA 1HKJA 3CHEA 5D4YA 1W91A 2VQTA 2ZX8A 4HPGA 5JH8A 4YHGA 1WZAA 4CD8A 2X1IA 1GPFA 3AS3A 5A6JA 1DWHM 4LYPA 3SCVA 3ECQA 2WVVB 1GOKA 3AICA 2W91A 1HKMA 3EDJA 1SMAA 1JAEA 4IISA 4U2ZA 2ESCA 1E1EA 2VR4A 2EPKX 1JG9A 4PSPA 1OCQA 1XGZA 4JFSA 2QF8A 2Y2WA 2XVGA 2BFGA 4BZYA 3SCRA 1UKPA 2CIPA 2FHCA 5E6ZA 1K9TA 4MNMA 2W4XA 3RILA 4PTMA 4UTFA 1PX4A 2JFEX 3WD3A 2RTSA 4V2XA 3WEOA 4D6DA 4ZFMA 1OT2A 1Q6DA 5BRQA 2W67A 5ABFA 4TUFA 1FA2A 3ZT5A 2EEXA 5ECUA 2XIBA 1BSIA 3AXXA 3WQ6A 4D6EA 4UNIA 1B31A 4FK9A 1ITXA 2JIEA 1UD5A 5BCAA 5CLTA 3RM4A 2PWDA 4B15A 4OJYA 4X0NA 4PSRA 1E15A 1M53A 1W1PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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