1OGGA

Chitinase b from serratia marcescens mutant d142n in complex with inhibitor allosamidin
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDINWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the D142N Mutant of the Family 18 Chitinase Chib from Serratia Marcescens and its Complex with Allosamidin
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2003-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1oggA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1oggA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1oggA01
4AY1A 1VEOA 3AHZA 5E0CA 2WAGA 3SURA 1J0IA 3AIUA 2IUZA 1E6SM 1TCMA 2DIJA 5A6SA 1UG6A 1W9UA 1E6RA 3F4VA 4JCMA 5IHSA 2VX4A 4MJ2A 1XH0A 3ZT6A 4PMUA 4AD5A 5D8WA 1EDQA 2WWDA 1JYWA 4R27A 3EDKA 3N15A 1ZBWA 1NWTA 5LA2A 4P7RA 2GK1B 1FH8A 3N18A 3QHOA 4HMEA 2IXUA 4B15A 1X1NA 2NT0A 1W9DM 1QI2A 5E70A 2PWDA 3PTQA 1W1YA 3ZR6A 1UR0A 2XHYA 1LWHA 3UR7A 3SUUA 2GUYA 1BYBA 4P8WA 5M5DA 4MDOA 4QCEA 2D22A 3LPPA 4M56A 4F8XA 4WF7A 2A3EA 3MKKA 1XD1A 1DTUA 2FHFA 4H7VA 2VNCA 3VILA 4W7UA 4V27A 1J01A 1B1YA 3VGEA 5CGTA 2YIHA 2F61A 4Q22A 2V3DA 3DYOA 2JF6A 1E4NA 1V3KA 2XVGA 1OINA 3MSGA 2X8RA 1V0KA 4XX6A 5A3HA 2J8GA 1JYXA 4FLSA 1FP8A 1WZLA 1GORA 2XG9A 3U5YA 2WVVB 3WH9A 3WDJA 1FHDA 5FOOA 2EO7A 1HJXA 5EFDA 1WNOA 1B30A 1DWGM 3AXIA 2WKGA 4JFSA 2PBGA 4AZIA 4UQCA 5ABFB 3VIOA 3WDPP 4MB4A 2WCSA 4PUDA 4Z2HA 1KGXA 4Y7EA 3GH5A 4XZBA 3WY1A 1LJYA 5A8PA 2V38A 2WMGA 4LYPA 2NW0A 1B3WA 5D8ZA 3WQVA 3BAWA 2D49A 5ECUA 3AI0A 4GXPA 3AMGA 3MMUA 4HPHA 4H8HA 2V5DA 2ZXAA 3K4DA 4YN5A 2VQUA 1CWYA 1EOMA 3BCFA 2E8YA 3EMZA 3W6LA 4U3CA 2EPKX 1E6XM 2J78A 1TFVA 2NT1A 5BXSA 4AC1X 2WNWA 2DT2A 1JD9A 5CSYA 3POHA 5CPSA 1OBAA 2FH6A 3W81A 4AZHA 1WAWA 4WK9A 1GHRA 5CLTA 3VGFA 2YLAA 3CBWA 1XH2A 4BF7A 4CU8A 4WSKA 1KBKA 8A3HA 2XPKA 3NIYA 1E0XA 2ZX8A 7A3HA 1CNVA 2D1ZA 1BLIA 1WZAA 3UG4A 1CPUA 4IUGA 3T08A 3AS3A 5CGMA 1KWGA 4MDPA 3SCQA 4J3XA 4OIFA 2G41A 4AWEA 2BHUA 1B0IA 2GSJA 3MSDA 3RM9A 1BF2A 2RTSA 1C91A 1KQYA 2ZUSA 4ATWA 4D6CA 1TG7A 3PZGA 1KQZA 3S2CA 1IV8A 3MO4A 1EIBA 1RPKA 4J3VA 2BHYA 3ZM8A 1ZJBA 5JBEA 4UFMA 2MANA 2E9MA 1ITXA 1JZ4A 4W87A 3FN9A 1VIWA 2DH2A 3IANA 3GXMA 3OIHA 3GBDA 3II1A 3ALFA 2J62A 5CJ5A 1CXEA 2ZUUA 4BQ5A 1V6WA 1GJUA 3N11A 4AZCB 4P7NA 2WLYA 3G6LA 4EANA 4OBRA 4HPGA 1UH2A 2DDXA 2ZXDA 3GBEA 3VU2A 2D0GA 5A8QA 3K8MA 3WQ6A 3TTSA 5CZKA 4ATDA 3RIKA 3NSXA 1X6LA 3FHAA 5FD0A 2WMKA 1NP2A 1EA9C 2WC7A 1EGZA 3VMPA 2OLHA 3TTYA 4P8XA 4MAVA 1OT1A 2EJ1A 4UOZA 4UZUA 1R86A 4AISA 4B3LA 2OSXA 1UH3A 2RGLA 3VD4A 1CIUA 4J3UA 2A3CA 1U33A 3W4RA 2VC9A 2WXDM 3OLEA 1DWAM 5JBFA 4K68A 2J25A 3A4XA 1CGUA 5A2CA 1E6ZA 2C7FA 1ISWA 1EHAA 2CHOA 4S3KA 3LPFA 4AZBA 3BLPX 4GQQA 4W85A 1LL7A 1QI5A 1E9LA 3F5JA 5BROA 3A47A 3U5UA 5GQBA 2ZUNA 3CH9A 1ISXA 2E9LA 3AIQA 2Z1KA 3ZOAA 1IZKA 2J7FA 4FK9A 1G94A 4GI6A 2G3MA 1XGZA 4Z2JA 5I79A 4ACYA 4OJYA 4UFJA 3I3EA 4UFLA 4YHGA 1RH9A 2GJRA 4M24A 4C7DA 4NZCA 4UQDA 5I0DA 4UFKA 1HNYA 1E55A 1LLOA 2PF0A 1LL6A 1WP6A 2ZUTA 5KZ6A 5DO8A 5D9NA 1CECA 3AZTA 1SR0A 1NWSA 5CLWA 3RO8A 3AS1A 2O9PA 1PIFA 2YA2A 1JDDA 2CBUA 4UQAA 1GOIA 2Y24A 4RL3A 1G5AA 2VR4A 1V0NA 1HN1A 1SMDA 1J0JA 1HJWA 1BYCA 2ZICA 4PSPA 2VRJA 3WH7A 1JZ3A 2CPUA 1YHTA 1UR9A 1TVNA 2W63A 4F9JA 1VEPA 3RJYA 5KEZA 1LWJA 1LG1A 4A3HA 3CUFA 1XC6A 2VX5A 1KGWA 1M7XA 4XV0A 5TD4A 3AISA 3M7SA 2XVKA 2ZX9A 3QHNA 5A8MA 3CPUA 2OWCA 1KB3A 3VGHA 4W5ZA 3L4ZA 2G3NA 5BYWA 3BSHA 4HU8A 3W26A 5A6AA 1AQMA 1B3XA 4NSBA 3CUIA 4MB1A 2GJXA 2DSWA 5IXEA 1QHPA 5IFPA 3WF4A 2E8ZA 1DEDA 5I24A 4HZ7A 3PZNA 4TX6A 3VO0A 1KCKA 1VFFA 3AIBA 3GXIA 2BS9A 4GI8A 1VRXA 2YBUA 3PZUA 3WQ4A 1C92A 1KR0A 1HJVA 4UFIA 2WC3A 3OB8A 4HP5A 2EEXA 4ACZB 2DPEA 4NF7A 2CKRA 3WH5A 1ZB5A 4UOJA 4TVCA 2BY1A 2VL4A 4TUFA 3W27A 4W93A 3OZOA 4CGTA 4AD3A 1VFUA 1J0HA 2F8QA 3JUGA 1UZ4A 4NRRA 3VM7A 1CXFA 1F4HA 4H2CA 3AZSA 5C8BB 1WDSA 3L4TA 1QHZA 1AMYA 4CN4A 3CUJA 1G9HA 4UQBA 3WDIA 3IJ9A 5A1AA 3NYDA 3VIKA 1BSIA 3MV11 3G6MA 1MFUA 5DT7A 3CZJA 4CU6A 1VBRA 3MS8A 2UY2A 1GW1A 5LA0A 2YL9A 4AD4A 2WVSA 4YHEA 2G3IA 4D6HA 2PWEA 3WQ8A 3EMCA 1JFXA 1S46A 1CYGA 4M1RA 1GQKA 2XIBA 3MV01 3VD9A 3DECA 3T0AA 5DT5A 3MU7A 1E70M 3SCUA 3THCA 3I3BA 3M6DA 3W28A 1C3FA 3BAKA 3VDHA 3B9EA 2DH3A 1V02A 3WD0A 1QOXA 5A69A 2YL8A 1HL9A 4GQRA 4L4OA 4AD1A 1JGIA 3BLKA 2EPNA 3VX1A 4U3AA 1GOKA 1K9EA 1ZBVA 4W7VA 4AEFA 1FA2A 3T2OA 4JFVA 4H8VA 3VTRA 1VJSA 3IK2A 4TVUA 1A47A 3U7VA 4CU7A 1E6NA 2WLZA 3AROA 3ARTA 1WDRA 3WNMA 1I1XA 3CZEA 1CDGA 2CETA 3WNNA 3U57A 4CVWA 1Y7VA 1VENA 5HOSA 3OZPA 2VRQA 1PX8A 2OYMA 3WDQA 1JI1A 4QP0A 3PZ9A 2VI0A 3ZSTA 1Q6FA 1WZMA 4OZOA 3A6OA 1RP9A 4HA1A 1MW3A 3ARWA 3WN6A 4LYRA 1E0VA 4KGLA 4MNJA 3PTMA 3FNDA 5BRPA 3UERA 2WVVA 1UWQA 4CD7A 2DSUA 4JFTA 1JFHA 4W86A 2J7BA 2ZUVA 2D3LA 2J7GA 3APGA 1QW8A 2W91A 1H2JA 4JKKA 2RGMA 1JIBA 1ECEA 4D6DA 3MANA 3VD3A 4DWSA 3GZAA 1J0YA 3MUIA 2YDQA 4KMQA 4P8UA 2BY2A 1QW9A 1XH1A 2QF8A 3WL1A 2WVTA 4IM4A 1VEMA 1BG4A 4D6IA 1TUXA 5A95A 4W8AA 1MQQA 2QPUA 1W1TA 1JL8A 2J47A 4U5KA 1MW0A 3F5LA 3AMDA 1HP5A 1W2PA 3AFBA 1JZ7A 2XFRA 4OOUA 2DSVA 3VIFA 1MQPA 2DIEA 3WD3A 3D3AA 3TP4A 1JDAA 4TTGA 1HKKA 1VB9A 1LG2A 1ZS2A 1L8NA 2O9RA 5I78A 2D24A 3VVGA 1W2VA 2XM1A 3QHMA 3VGDA 4M82A 1QBAA 1ZL1A 3M07A 1HT6A 3W82A 2ZUMA 4MJ4A 1XYFA 1GZJA 2BY0A 3O2LA 4XB3A 3VUPA 1UKQA 1DWIM 4D6GA 2XVLA 4UFHA 2J7HA 2WMJA 3O6AA 5I2UA 4CN6A 2X1IA 4JKMA 3K1DA 4JZ5A 3L4YA 5EMYA 1QNQA 1HKMA 3GH7A 3RILA 5CPQA 1TA3B 4W5UA 1WKYA 4U33A 3IJ7A 2WHMA 2BXYA 3A4WA 1UD4A 5CQ1A 4ZE5A 1PAMA 1UD6A 2VCCA 1GUVA 5DF0A 3MMDA 2D0FA 2XGIA 1QNRA 5CSUA 4OKDA 4D6FA 1AVAA 3W6MA 3CHFA 3ZMRA 3GNOA 1ODZA 1PPIA 3WDRA 3WUBA 3W0KA 1JAEA 1H09A 1W32A 1ISVA 2WMHA 1PEZA 2W62A 3CGTA 4QLJA 3B9DA 2V5CA 4CCEA 1E4LA 2VVNA 3VPLA 1NQ6A 2PWHA 5ABGA 2J8FA 4B3KA 2OYKA 2Y8KA 4MB5A 3VOCA 1HJSA 4IPLA 6A3HA 5A6MA 2W5FA 4E8DA 1MXDA 1UR8A 2CYGA 3W53A 2BNJA 3ARPA 2CBIA 3CMJA 1FFRA 2BXZA 4X0NA 2CXGA 1OT2A 4DUWA 5E6ZA 3OBAA 1OB0A 2ZX6A 4PYSA 5BWFA 1J10A 3PZOA 2WB5A 1CGTA 3BAYA 3CIVA 2UWFA 4D72A 3WNOA 1OIFA 4JAWA 1E3ZA 2VRKA 3IAQA 3WMCA 1JXKA 1V6VA 3AYRA 3WBAA 2J7CA 2WZHA 1M53A 4NRSA 1O6IA 4L4PA 4KRUA 3L4UA 1CXKA 4D6JA 3SCOA 1UWIA 3VKKA 4GZEA 3NDYA 3OLDA 5D9MA 1UKTA 3MUY1 3ARUA 2WCGA 1KCLA 1K9FA 3ARQA 4MAZA 2J7DA 3D5HA 1V3HA 3CZ8A 4FF5A 4N42A 2D20A 2XSAA 1TMQA 2CEQA 2BY3A 1XSJA 2UY4A 1EQCA 3WF2A 4EE9A 4DUVA 3FY1A 1JYNA 3W38A 5C71A 3PN8A 2JEQA 1ZU8A 1BPLB 3AMLA 1UOKA 4LX4A 3U7BA 2VZTA 4J3WA 4U31A 1I1WA 4P7OA 2WANA 1JF6A 2XYLA 4F9DA 2WKLA 4BQ2A 4M81A 2CNCA 2PBOA 2CKSA 2VCAA 1JZ8A 1GPFA 3CHCA 1K9DA 1OGBA 3VDBA 2JALA 1QI4A 3T09A 1CGYA 1PBGA 1UA3A 1BTCA 4IISA 4DWSD 3ZT7A 4FLOA 2BVYA 1OD8A 4WKHA 1K6AA 3IJ8A 4A3YA 2PB1A 2AAAA 1C8QA 1BGGA 1UH4A 6CGTA 5FKYA 1XCXA 9CGTA 1W1VA 4MNLA 4U2ZA 3PBGA 2PWFA 4M80A 3WMSA 2VX7A 3VIMA 1H1NA 3WD4A 4JHOA 4E8CA 4LGXA 1XRVA 3S6TA 1V3IA 3SIMA 4AIEA 1V6YA 3LPGA 3EDEA 1JI2A 5HXMA 1TR1A 2VVSA 1B2YA 1W9BM 1RP8A 3PZMA 2WHKA 4PBGA 3OGSA 2BFGA 3PZVA 4LQ1A 3OGVA 4DWSC 1EOKA 1ITCA 3AHTA 3MUZ1 1VFMA 1B9ZA 3VMOA 4GPNA 5BRQA 1VFOA 5HPCA 2QHAA 1O7AA 5I3DA 3BXWA 3VIJA 5CPTA 4P8VA 4PMRA 2E40A 1JD7A 3WUGA 5D9OA 2PWGA 4OBSA 1CXIA 1V0LA 4TOQA 4RE4A 1BYDA 1NOUA 2F2HA 2XSBA 1CTNA 3VM5A 4WKAA 3A4AA 3GH4A 3TTOA 3RM4A 2CBJA 4PTWA 1UYQA 1HP4A 3AIVA 3VINA 3B9AA 1FH9A 5JH8A 4AIUA 3EYPA 3WFZA 3AHXA 1BYAA 2WW5A 4H41A 1FFQA 2J79A 1W9VA 2TAAA 1SMAA 3IAPA 1OD0A 4QLKA 5I23A 5IFTA 2WBKA 4PMZA 1RD6A 3DHPA 1EDGA 2JEPA 4LPCA 1V6XA 4J3TA 2PI6A 2XTKA 1NP0A 4PRWA 1HL8A 1ISZA 1UQYA 3AS2A 3TOPA 2AOSA 1JXJA 1QNSA 2X0HA 2Z1SA 1GNXA 2ZX5A 3CZKA 4EAMA 2Q8XA 1E5JA 5FIPA 2EPLX 4CCDA 3BMVA 3W25A 7CGTA 4Z2IA 1GOQA 2XUCA 2WZIA 2DT1A 2FGZA 4MTVA 1V08A 3LPOA 3OG2A 1W9XA 2QMKA 1MVYA 1C8YA 1GHSA 1WDPA 1EO7A 3PHAA 4MADA 4W88A 2VMFA 3ZJKA 1UUQA 1NOWA 1E73M 3VGGA 1TVPA 3GYCA 2WMIA 5DMYA 1G1YA 2WZEA 5BCAA 3ARXA 1QBBA 1R7OA 4PCTA 3T0DA 1Q6EA 1XD0A 1AIWA 4BZYA 1K9TA 4A4AA 2A3BA 2VT0A 1V03A 5DFAA 1H49A 1H41A 1UR4A 2J4GA 3RCNA 5IDIA 3AMKA 2VZVA 1HJUA 4MB3A 1XSIA 4W84A 2EBNA 4AEEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3XIM A;  1WNO A;  2Y2M A;  2EPH A;  5DN1 A;  1F6Y A;  1DWG M;  2PBG A;  2GOK A;  2OEK A;  4US5 A;  2XP3 A;  4D8A A;  4MB4 A;  3O0F A;  1A5M C;  4AB4 A;  2Q09 A;  4Z2H A;  4J3Z A;  4Y7E A;  3GH5 A;  3WY1 A;  2Y2H A;  2IKH A;  4J35 A;  4FX8 A;  4LYP A;  5H6H A;  3DER A;  2PC4 A;  5D8Z A;  1TZZ A;  1A4M A;  1ME9 A;  3IK4 A;  2KAU C;  3AMG A;  3M0J A;  3C61 A;  4HPH A;  3SRF A;  2ZXA A;  3EWU A;  2NQ5 A;  2VQU A;  4KFN A;  4A22 A;  3EB2 A;  2E8Y A;  3EMZ A;  2OQY A;  2J78 A;  1TFV A;  4KET A;  4I6V A;  5CPS A;  3CAQ A;  4E4F A;  2FH6 A;  1WAW A;  5KET A;  1H7X A;  1OFB A;  1UC5 A;  4RE0 A;  3JU2 A;  1SZG A;  1YNQ A;  1RQE A;  2F38 A;  3MSY A;  1FKK A;  1DL3 A;  4G2P A;  5CZJ A;  2ZX8 A;  7A3H A;  1CNV A;  2D1Z A;  4NQ1 A;  3RGT A;  4FAM A;  4DF0 A;  3BUR A;  4IUG A;  5CGM A;  3E38 A;  3CIW A;  2DUZ A;  3SCQ A;  2IMR A;  4CLM A;  3RIT A;  5EU9 A;  4AWE A;  1VYS X;  4MZY A;  2GSJ A;  4U84 A;  3MSD A;  3BAR A;  1L6Y A;  5DRI A;  4ATW A;  2WM1 A;  3UA3 A;  1KQZ A;  3S2C A;  3MO4 A;  5C0Q A;  2P1F A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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