1OGGA

Chitinase b from serratia marcescens mutant d142n in complex with inhibitor allosamidin
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDINWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the D142N Mutant of the Family 18 Chitinase Chib from Serratia Marcescens and its Complex with Allosamidin
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2003-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1oggA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1oggA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1oggA01
4BCEA 4PTVA 1V03A 1UWRA 5CLWA 5A95A 1E15A 5A2AA 1LL6A 3U7BA 1E3ZA 3WQ8A 3QOMA 2X09A 1OT2A 1B3ZA 2DGAA 3WDHA 2OYMA 4PRWA 1JZ8A 4PBGA 2DIEA 2PB1A 3LPFA 2GSJA 1IZJA 3WD1A 1CXHA 1UWTA 3PZOA 1Z32X 1QI0A 4ZFMA 1RPKA 2XGBA 1BYDA 2XVKA 2VCCA 1DWAM 2Y24A 1MW2A 1W2PA 3AXHA 3D5HA 4MJ4A 3WF1A 2O9PA 2JALA 5BCAA 3MO4A 1NOFA 3CZEA 2F2HA 1W91A 3PBGA 3VX0A 2V5CA 3FW6A 6TAAA 1W1VA 5CPSA 4BA0A 3BAYA 3SCOA 5A3HA 3ZT6A 3MV11 2BVYA 2G4FA 1C92A 1MFVA 1H0IA 1EQCA 2PWGA 3ARXA 3BGAA 1CXEA 3AMCA 3NDYA 4NSBA 3BAWA 3L4WA 1V6VA 4CU7A 1JDDA 3VU2A 3NIYA 1KCKA 4WKAA 2RGLA 4MTVA 2X2YA 2A3AA 1ISYA 5JBEA 3NSMA 3WF2A 1B0IA 1JIBA 1U33A 3L4TA 2WCSA 5LA1A 1GOMA 2VMFA 2NSXA 3AZRA 4NRSA 1LG1A 2CHNA 4IPLA 4X9YA 1FH7A 4M24A 3SUVA 5D8WA 4Z2IA 1WKYA 2GJRA 1V6YA 1E1EA 3VGEA 1YQ2A 3AHXA 2QF8A 3BAJA 1NM9A 4JFUA 3CHFA 2W92A 2WHLA 3CZKA 4JFTA 2XIIA 4Q22A 2JIWA 4AZGA 1E5JA 1DP0A 1OIMA 2DT0A 1MXGA 3EDJA 5E0FA 4MB1A 4J27A 4HTYA 3AFBA 4OBRA 2XFRA 2WMIA 3SCVA 2D3LA 3CUIA 5BRQA 1EIBA 4D72A 3N11A 1UD6A 2G41A 3ZR5A 1CGWA 3CTTA 3VIMA 1Y7VA 1KB3A 2VI0A 4HMCA 2YJQA 1XD1A 1DEDA 4AD5A 5A94A 2VCBA 2E4TA 4HOZA 1TVPA 4RE2A 2WCGA 2WYSA 4PUEA 3EDKA 2WB5A 5CSYA 2X05A 2J77A 2BXYA 1QNPA 2DSWA 4AIUA 2BS9A 1HP4A 2GDUA 1H41A 3VM5A 3WUEA 1C8YA 4H7VA 4UQ9A 2EBNA 4U3CA 4ACZB 1BYBA 3OZPA 4F66A 2E9MA 3WUFA 5D9MA 1UD3A 3W38A 5EFDA 2MANA 1TG7A 5CSUA 4JAWA 4W85A 3N15A 3S2CA 3VILA 2BY1A 4JL1A 5E70A 2GVYA 1W9BM 2J7HA 3ECQA 1HL9A 4GI8A 3PTMA 1XD0A 4PMYA 4HA4A 3THDA 3AS0A 5AY7A 1AQ0A 3L4YA 1E4LA 1KGWA 2XTKA 1VB9A 4HOWA 4MADA 4UFKA 2QLYA 2WC3A 4OBSA 2OLHA 1WAWA 2QMJA 1H49A 3OGVA 3PZIA 1AVAA 5A69A 4DUWA 1ZB5A 3MSDA 3VD9A 2WLZA 1VJZA 4J3WA 1MW0A 1TE1A 3VDBA 3GBDA 3PZGA 2WBGA 5IHSA 5CZKA 2BVTA 3MUZ1 5BXPA 1UR2A 3VNYA 4A4AA 5A1AA 1G0CA 4ZEPA 1XSIA 3WNLA 3WH7A 2X8RA 1ISVA 1LG2A 1CZ1A 3OIHA 2AMGA 4ACZA 2CBVA 3MS8A 5HNNA 3OLDA 2HVMA 2GDVA 2FGZA 2UY2A 2WAGA 1ODUA 2WC4A 5CPQA 7TAAA 4CKQA 1QOXA 3W27A 4W89A 1HL8A 1UR1A 3AMDA 3PZTA 1B31A 4B16A 2XVPA 1G1YA 1SMAA 4MB3A 1HJQA 4MNMA 2E8YA 4JCLA 2FHCA 3BAIA 4L4PA 5AC4A 1E5NA 2WHMA 2JE8A 2CPUA 3WMSA 3PN8A 1NWSA 1EQPA 3IJ9A 3F5LA 3ALGA 3WD0A 1J0IA 4FLOA 1CWYA 3ARPA 5IFPA 1SFSA 3K4DA 2A3HA 4QLKA 5D4YA 1ZS2A 1MXDA 4W5ZA 1V08A 3VUPA 3W82A 1EDTA 1MQPA 3RO8A 1FHDA 3DYPA 2DH3A 1QI2A 2IUZA 3L4XA 2CEQA 3CZLA 5FL0A 5FOOA 1EDQA 4MPKA 5D9OA 2C0HA 3M7SA 2J79A 2DH2A 1JF5A 3AS3A 3FNDA 2WMHA 1HT6A 1JD9A 2VOTA 5I77A 1J18A 1V3JA 2J8FA 4QAWA 3EBVA 3I3BA 3WH8A 3PZMA 2ZX6A 3WDRA 4AEEA 3NSXA 3WNOA 2A3EA 1V3LA 4TX8A 4LYRA 3WUGA 1BSIA 3GXFA 1WNOA 1DWIM 4DUVA 4MB5A 4OOZA 5JH8A 1GQLA 1GOKA 5DEZA 1SYTA 2VJXA 1L0PA 1FH8A 4JL2A 4TVUA 5EBAA 3RM8A 1KGXA 2JF6A 2VVSA 2EXOA 2XM1A 3FHQA 3SUTA 1WDPA 1B3XA 1PIFA 4TVCA 1GPFA 1QHZA 2VUYA 1E71M 1FHLA 3IK2A 1RD6A 4TTUA 2XVGA 4PCSA 1WO2A 4AZBA 1HVQA 1VENA 4CCCA 2CBUA 1ZBWA 4GKLA 2XJ7A 1BG4A 1XH2A 1XC6A 1D2KA 4MDPA 4AEFA 1PZ3A 4U5KA 4LGXA 1UH4A 5M03A 4P8VA 1JG9A 2Y8KA 4CU6A 3HMCA 1GJUA 1DWFM 3UERA 3VOCA 2E40A 2VZVA 1QNRA 3POHA 2A3BA 4GXPA 4MAZA 1K9DA 1FA2A 1BVZA 3ARZA 1OD0A 2JEQA 2VR4A 3W6LA 1OCQA 5A8NA 4KRUA 1XGZA 1FOBA 1TVNA 4UOJA 5HOSA 3VM7A 1JL8A 2Y4SA 3POCA 3BLKA 4PMQA 4AIOA 4BQ2A 3NUKA 2RTSA 5BROA 5LYRA 3ARUA 2G3MA 2GUYA 2J4GA 3WUBA 3FHAA 1VEOA 2E3ZA 3QR3A 2QPSA 4PSPA 1UWSA 1D7FA 1I1XA 2ZXBA 1H3GA 2YL8A 3I3EA 1VBRA 1E0WA 1MVYA 3CGTA 4CD4A 3VD5A 4KH2A 4NRRA 3VPLA 1J0YA 3F5JA 2BVDA 4UQAA 4JKMA 2Q8XA 3VTRA 3CHEA 4UQEA 1GNXA 4A3YA 3KEHA 1J0HA 2Y2WA 1QI5A 4F9JA 1KWKA 1LWJA 4J28A 1BAGA 1LL4A 4NI3A 1PX4A 1ZBVA 3GYCA 4V2XA 5BWFA 4C7GA 1UD4A 3VGHA 2B31A 1BFNA 4IUGA 3VMPA 2X0YA 3N17A 4AIEA 2J7DA 1E4MM 4AZHA 4W8AA 2ZXDA 3FAWA 3W29A 1J9YA 4PTXA 4EANA 5EMYA 1Q6DA 1OM0A 1X1NA 3D3AA 3WQVA 1BGGA 1W9XA 1EXPA 1ISXA 1H1NA 2UWFA 9CGTA 3UR7A 4P7QA 4HP5A 3CHDA 4PMRA 4UFHA 5CPTA 1B30A 2RGMA 2QHAA 4GZEA 3SUUA 3WL0A 4DWSD 5E6ZA 2O9TA 3W26A 1C7TA 3AHVA 5HXMA 1E6PA 1EDGA 1EGZA 3TONA 2DSUA 3UESA 2PBGA 4W7VA 4UOZA 1EHNA 5LA0A 3FXYA 4AISA 2WMJA 3O6AA 3B8SA 1UA3A 1UUQA 1WCGA 4KMQA 4AYSA 4OJYA 3VGBA 3TTQA 2V38A 3RM4A 4PMXA 1OGGA 4TXEA 2YA1A 3TA9A 2BHYA 4U31A 4S3JA 4V28A 2XIBA 2QV4A 4QCEA 2PBOA 1SR0A 4P7RA 2TAAA 3VIFA 3BCDA 1TZ7A 1Q4NX 1XCWA 2OYKA 2VZOA 3L2LA 3VD7A 1B1YA 1J0KA 1GQIA 3ZQ9A 2PWHA 4UZUA 4B3LA 4W87A 1JZ6A 3SCTA 3AMKA 3QHOA 1JZ2A 4FLQA 1UHVA 4URIA 4X0VA 2VNCA 1WDRA 2F61A 1UR9A 4XUYA 1HVXA 3WF4A 4BQ3A 3AS1A 1R8LA 5HPCA 1KFWA 1GZJA 4PMZA 3AZSA 5FL1A 2Y8VA 3LPPA 1CYGA 1QPKA 4QDMA 4J3UA 2O9OA 1R7AA 3A3HA 1E6QM 2ZXQA 2WMIB 2WPGA 1GOIA 1UKQA 4W7WA 2YLAA 3SCNA 4P7LA 1E1FA 2OWXA 3K46A 4TX6A 2WKLA 2ZUVA 3ZIZA 1C8QA 1PZ2A 1W9DM 2C8NA 4J3VA 4MDOA 2ESCA 4YN5A 1CXKA 1CGXA 1GJWA 3GDBA 1FH9A 4UFIA 1GW1A 4OOUA 1OSEA 1RP8A 1KXQA 4LYPA 1CXFA 3TTYA 3FY1A 5E9AA 2YBUA 3WQ5A 3O9NA 3OBAA 4ZXOA 3MSGA 5A8PA 5E6YA 2VX4A 3EMQA 2D0HA 1C91A 1E40A 2GFTA 2YIHA 2X0HA 3VMNA 1ODZA 1WDSA 1V02A 1X6LA 4M81A 4JFSA 1E6RA 2D3NA 1PAMA 1V02E 5HDRA 2XWDA 4ZE5A 2V3FA 5A6BD 3PZQA 4GI9A 1HF6A 5LA2A 4P7NA 4GQRA 3UETA 4D6CA 1V3HA 5AC5A 1NWUA 3MV01 3GBEA 1B3VA 3RILA 2GJXB 4CD7A 1CPUA 3SIMA 1UH3A 4ATDA 1DWHM 3WBEA 4IISA 2W91A 1W3HA 1JAEA 2EQDA 3CZ8A 2VTFA 1CNVA 1PIGA 1J11A 4TVDA 3A4XA 2WM0A 2D22A 3LPGA 1UD2A 1K9TA 3K1DA 5I5RA 4B9YA 3GNPA 4HU8A 4JFWA 1GHSA 1M7XA 3OA5A 1Q6GA 1WPCA 2XUCA 1QBAA 5I0DA 1H2JA 3WH9A 1GVIA 3BMVA 2CBIA 4CCDA 3J7HA 4X0NA 4B3KA 4BQ5A 4PSRA 4WIWA 1J0JA 3AXIA 5ABFB 8CGTA 1JFHA 4CN6A 3N9KA 1OT1A 2WVSA 1MW1A 1WZMA 3VINA 1LWHA 1WE5A 4P7OA 4AZ5A 4Z2LA 1XSKA 3CPUA 1J10A 2OSXA 1UQYA 1EOKA 2D23A 5DF0A 1JZ4A 4WK9A 4OZOA 4CVWA 3ARQA 3AICA 1KQZA 1BGAA 3T2OA 5C70A 1UQZA 1PX8A 1ZU8A 2GJXA 4C7FA 3VDAA 2GJPA 4GO8A 2OSYA 3DHUA 3W28A 2WANA 3VDCA 4P8XA 1BQCA 2EPLX 2CERA 1JAKA 1E56A 4RE3A 4UQBA 2A3CA 2BXZA 2Z1SA 4BS0A 3WL1A 3U5YA 4FK9A 1KXVA 2YL6A 4OKDA 4ATLA 1C93A 2FHFA 3MUAA 3CLWA 4M82A 2PWDA 2CITA 5EFFA 3CUGA 4DWSC 2O9RA 3WH6A 4H8HA 4MB4A 2JEPA 4BZYA 5ABEA 5FCZA 3CUJA 4JKLA 1NH6A 1Q6CA 1CECA 3OGRA 3HJEA 1LJYA 4P8WA 3GTNA 1BG9A 3IAQA 2D20A 3VIKA 1NWTA 5A8MA 2DDXA 5ABFA 1XRVA 3II1A 4H41A 1GOWA 4ZXLA 2ZWZA 4W84A 3BAXA 4D71A 2E0PA 3DC0A 2WWDA 1ZBCA 4W8LA 1GONA 3AHZA 5DMYA 3WQWA 5I6SA 3UEQA 2VX6A 1NOUA 1ESWA 1UH2A 5BYWA 3K4AA 1UA7A 2W4XA 4HPGA 5DT7A 5M3WA 2XFYA 1BLIA 1VEPA 4PMOA 4IM4A 1XH1A 1E0VA 2OWWA 3WF3A 1GVYA 1OD8A 4W93A 1LF1A 1UG6A 1KQYA 4F79A 3CMGA 4WLCA 3VVGA 2DPEA 1UWQA 1U30A 2D0GA 1DWGM 2VR5A 2J25A 2BFGA 1MQRA 1QI4A 4MNJA 3WDIA 1JI1A 4GZIA 3GNOA 3RPMA 3PZNA 7A3HA 2J7BA 1JXKA 4UQCA 4UCFA 5A6MA 2X1IA 2OYLA 1W2VA 2EPMX 5JBDA 1DTUA 3WKZA 4JIEA 1OGSA 4MNKA 4K68A 4UOQA 2WZIA 4PCTA 1OBAA 1CLXA 1BYAA 2BHUA 4JHZA 2EJ1A 3UG3A 1NQ6A 3EDDA 1PJ9A 1VBUA 2UY5A 3LMYA 1UWIA 2ZX8A 4AMCA 1CXIA 3OZOA 1WB0A 4R27A 3PZUA 3WQ4A 1GQKA 2CETA 1E6XM 2VZSA 3LPOA 4GINA 2OSWA 1AMYA 3PHAA 2XSAA 1UKSA 1X6NA 1UKOA 2ZE0A 1E72M 5IDIA 1HKMA 2CBJA 2CKSA 2NT0A 5HBFA 3ZJ7A 3M6DA 1J12A 2CKRA 3TOPA 3MANA 1HNYA 3QGVA 5JIWA 2FH8A 5A2CA 3RMEA 4M29A 1MQQA 2FGLA 2AAAA 3QHNA 3RM9A 5M17A 3CHCA 1VEMA 4N42A 3ARYA 4E2OA 2EPKX 5GNXA 1GORA 1MWOA 2WBKA 1EO5A 3N12A 1J0ZA 4KGJA 1HJWA 1BTCA 3UG5A 4AW7A 4W5UA 3B9DA 1GOQA 4HA3A 2EPOA 1ED7A 3ZJKA 3IANA 1W9PA 4JKKA 4MJ2A 1JD7A 3CZJA 1UWUA 2D0FA 1KR0A 2F8QA 2WHJA 1UYQA 3B9AA 2WHKA 1JFXA 3N1AA 1JGIA 1M04A 1ZJAA 3CUFA 3PZVA 4A3HA 3SUSA 3W53A 1VJSA 1E0XA 1UOKA 1XYZA 1JZ3A 2BV9A 4J3XA 2J78A 5E0CA 4KWUA 4F9DA 5GPRA 3NSNA 1B90A 4AD2A 2V3EA 3WY1A 4QCFA 5CG0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3M46 A;  3TTO A;  3AIU A;  1UKT A;  3WSU A;  2ZUN A;  1E4N A;  4Y7E A;  2JIE A;  4AZI A;  4WKF A;  1QNQ A;  1PX3 A;  3PTK A;  2V3D A;  1ISW A;  1A3H A;  4CGT A;  2WXD M;  2W66 A;  4PTM A;  4WKH A;  4D6D A;  4EKJ A;  3AZT A;  2WMG A;  3CO4 A;  3WMC A;  1QNO A;  2BY2 A;  1JND A;  3U7V A;  4PYS A;  3MMD A;  2D1Z A;  3EMC A;  3BXW A;  3F5K A;  3WIJ A;  7CGT A;  3AI0 A;  2CNC A;  3QOK A;  2PF0 A;  3JUG A;  1GCY A;  1TA3 A;  3K8L A;  4R5E A;  1CBG A;  1EH9 A;  4E8D A;  4LYQ A;  4DM2 A;  5HPO A;  2ZUU A;  3ZJ6 A;  1ITC A;  3ARS A;  2GK1 A;  2XSB A;  1IT0 A;  4QP0 A;  3RJX A;  2ZUT A;  2YKK A;  3ZJ8 A;  4Q7N A;  1TCM A;  2Z1K A;  3GXM A;  1HIZ A;  4UR9 A;  3DHP A;  3WF0 A;  4J3S A;  1RP9 A;  1ITX A;  2DQX A;  2EEX A;  1CDG A;  5M5D A;  5CLT A;  2EO7 A;  1H11 A;  1JI2 A;  3AYR A;  3BSH A;  5TD4 A;  4AWE A;  3KL3 A;  1TFV A;  1DWJ M;  2W61 A;  4AZC B;  2W63 A;  4U3A A;  3WD4 A;  2VZT A;  2WK2 A;  4AY1 A;  2W62 A;  2ZX5 A;  3WNN A;  1W9V A;  1G5A A;  3MMW A;  2E9B A;  3E1F 1;  4GIA A;  2VRJ A;  3RCN A;  3WEN A;  2BHZ A;  3VIJ A;  3EDF A;  2J7C A;  1XHG A;  2PI6 A;  1W1Y A;  3ARW A;  1W9U A;  2WMF A;  2WC7 A;  4TUF A;  4WSK A;  4WJX A;  2BY3 A;  5JUV A;  3WD3 A;  1CGU A;  1G94 A;  1PEZ A;  2VZU A;  1RH9 A;  3SUR A;  4Z2K A;  4QLJ A;  2O92 A;  3ARR A;  2ZUS A;  3ARV A;  3T2P A;  1HX0 A;  3VKK A;  2NW0 A;  1CGT A;  1G01 A;  2XVN A;  4M56 A;  3SCR A;  3CH9 A;  1QI3 A;  2J7E A;  2ZUM A;  3WDQ A;  5DFA A;  1K9E A;  1H5V A;  4EK7 A;  5I79 A;  1JNE A;  3GH4 A;  1D3C A;  3RDK A;  2VCA A;  3VIG A;  1H4P A;  3CZG A;  3OLG A;  1W32 A;  2WNW A;  2DT2 A;  4AZC A;  1ISZ A;  1CEO A;  4HME A;  1QHP A;  1V6X A;  2PC8 A;  4FMV A;  5IFT A;  2CHO A;  5JBF A;  3VO0 A;  3N04 A;  1TUX A;  4AD0 A;  5F7U A;  5CXP A;  3L4Z A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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