1OGGA

Chitinase b from serratia marcescens mutant d142n in complex with inhibitor allosamidin
Total Genus 164
50100150200250300350400450020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDINWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
publication title Structure of the D142N Mutant of the Family 18 Chitinase Chib from Serratia Marcescens and its Complex with Allosamidin
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2003-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1oggA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1oggA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1oggA01
4KGLA 1UZ1A 1QBAA 1I75A 3ZT7A 1PZ3A 1UD8A 4P7NA 1ZBVA 3WNMA 1PBGA 3CUFA 3SEPA 3VMPA 2XVLA 1G94A 2D3LA 4ZE4A 1QPKA 1OGGA 1JAKA 1K9EA 2WKGA 3VD3A 3AMCA 1OIMA 1UHVA 5A1AA 3MANA 5A6BA 1UD5A 1E15A 1KGWA 3IJ7A 3ZMRA 3TTQA 4PN2A 4HPHA 1TZ7A 3BCFA 4XZBA 3WQWA 2V3FA 2XSAA 4Z2IA 1FHDA 4P7OA 1CXFA 3GXFA 2E9LA 3ZSTA 4PTVA 3MMUA 2F2HA 5FL0A 4TTUA 3SUUA 2J7BA 1KQYA 4FLOA 5M17A 1TCMA 4IPLA 2ZUNA 3HMCA 1BGAA 1J0ZA 3AFBA 1UG6A 5DT7A 3SCUA 2GJRA 3WN6A 1KXQA 2BS9A 4FLQA 2B31A 1W2PA 2CNCA 4BF7A 1XCWA 2GJXB 3FN9A 3OLIA 4LYPA 3WIJA 1W1PA 4NI3A 3CMJA 4ACZB 2J77A 5GPRA 1JZ2A 2BHUA 2YL8A 1EDGA 4TVDA 1US2A 1KCKA 2VL4A 5DF0A 2MANA 1KWGA 2YA2A 5FL1A 2EPLX 2FH8A 2XIIA 4XUYA 1ODZA 4GPNA 3ARRA 1V0KA 1ED7A 3W24A 3WDHA 1B3YA 2ZUUA 2GDUA 4BQ4A 5BRPA 2DSKA 4Z2KA 2D1ZA 2WC4A 3IJ9A 1DTUA 3GBEA 1FFRA 3AZRA 4MAVA 1HJWA 1V3IA 5I6SA 1BVZA 3F5JA 1QHOA 1BSIA 7CGTA 3WL1A 1JXKA 2D0HA 1UD6A 1W9DM 3QR3A 1TR1A 1PEZA 5I3DA 1AIWA 4L4PA 3WQ4A 3GDBA 3ARSA 4U3CA 2G3IA 3THDA 2J7DA 1J10A 1FP9A 3S2CA 3TP4A 4CVUA 1GW1A 4TUFA 1R7OA 4TVCA 5I0DA 3K8LA 1VFOA 4PUEA 2OSWA 1DWHM 2VO5A 3EDFA 2C0HA 1H0GA 3GZAA 1GVIA 3FXYA 1EQCA 1FH8A 3BAXA 5GQBA 3GTNA 3VGDA 1Q6CA 3K1DA 3AHZA 3WELA 4W88A 3AJ7A 1SFSA 1E4LA 4HOWA 3BC9A 2ZX8A 3WH6A 1TG7A 5BXSA 1GQJA 4DWSC 4M80A 4JL2A 1NOFA 5KEZA 1GJUA 5E0CA 1CYGA 3CHCA 4F79A 2VCAA 2RGMA 1GQIA 1ITCA 2C8NA 3ECQA 2BV9A 1MQQA 3WBEA 3DYOA 4IPNB 4UQDA 1J0IA 4AWEA 2E4TA 4UOJA 1GUVA 3EDDA 2PWEA 2YA0A 1GOOA 1CEOA 3W0KA 4MNLA 5BWFA 2YBTA 3WUEA 2D23A 3W6LA 4Y7EA 3AHTA 2WZIA 2DDXA 1CLXA 4GXPA 1OM0A 5A8QA 1B3WA 2GFTA 4HP5A 1BG4A 4ATDA 3GXDA 1NH6A 3WSUA 1W9XA 4GO8A 4U5IA 1VBUA 3W29A 1GJWA 3F5LA 1U33A 3GM8A 1NARA 3KEHA 4EK7A 1LL4A 2WZHA 3FAXA 3TTYA 3VM7A 1J01A 4GI8A 1CBGA 6CGTA 5GNZA 2CBUA 1E0VA 1KCLA 3W25A 1BG9A 1LJYA 3UETA 2WLYA 3PZQA 1CXHA 4RL3A 1WCGA 5JBDA 3VO0A 2VOTA 4PMUA 3U5YA 3AQUA 2ZUSA 2QMJA 3MUZ1 4FLSA 5CGTA 3CUJA 4U2YA 1W1TA 3ZJ8A 1Q6GA 2J79A 2Y24A 3VKKA 1GORA 5HDRA 3G6LA 3PN8A 3B9DA 1UH2A 2V3GA 3WQVA 1H5VA 1MXGA 4MPKA 2O9OA 3D5HA 5BROA 1WP6A 3VPLA 3TONA 1GZJA 5CPTA 2VX5A 2W67A 1CWYA 4GKLA 1OCQA 4GZJA 2PF0A 4HA4A 7A3HA 1G5AA 1K6AA 4YPJA 3QOKA 1GCYA 2WB5A 2XFFA 3WQ6A 2YIHA 1GONA 4GI6A 4OBRA 4EKJA 3LMYA 1KFWA 4UQEA 1B0IA 1W91A 3T08A 4JCMA 5C71A 1XHGA 5M03A 3M7SA 1UR0A 4H8UA 1WE5A 1W32A 3AMLA 4PCSA 1C91A 4PMOA 4D1JA 4LYRA 4CU7A 4XX6A 3JUGA 3IAQA 4U3AA 1I1XA 2FH6A 3GBDA 2VZOA 3L2LA 3T2PA 4OJYA 3WDJA 1V0MA 3PZVA 2VNCA 1J0HA 4DUXA 2XVPA 1GQKA 4AISA 1SMAA 1PX4A 2YOCA 6A3HA 2DIEA 3VD4A 2WHJA 3VIOA 2VZTA 1PIGA 4MJ4A 3K4DA 2J7GA 2VR5A 1E0XA 2WBKA 1WDRA 4KWUA 1E72M 2UY2A 3CZ8A 1Q6EA 1E40A 4GZIA 3SCWA 4HA1A 2OWCA 1VFMA 2ZXBA 4E2OA 5AC4A 2WLZA 1WDPA 3WNOA 1BQCA 2CETA 4C7FA 4JFTA 2D0GA 2DT0A 1O6IA 1X6LA 1V6VA 5JUVA 3GNPA 2NT1A 1EIBA 4PMYA 4CD7A 4JFVA 3W28A 4OKDA 1W3HA 1SMDA 2GSJA 2EJ1A 2E40A 2G8ZA 2XWEA 3K8MA 4F9DA 3OB8A 3BSHA 1D2KA 3BCDA 4D6IA 1ZU8A 5JBFA 4AD5A 3WH7A 2WANA 3WUBA 1QVBA 3ZSSA 4D6DA 1UH4A 3A3HA 2X8RA 1C3FA 4BA0A 1C7TA 2DQXA 1CXIA 4W5UA 1MXDA 1OT2A 5FKYA 1E1EA 1MW1A 1JD7A 3IJ8A 2DT1A 2CBJA 5A6LA 1JF5A 1R7AA 1HX0A 4S3KA 4MADA 2X05A 2PB1A 3F4VA 3MSGA 4TX8A 2ESCA 1BLIA 5A94A 4H8HA 3SUWA 1QBBA 3SCOA 1QNQA 1ZBWA 1W3JA 3WFZA 2VZUA 2A3BA 1UKQA 2CITA 4AZHA 5F7UA 2BY3A 2ZXDA 3RIKA 2CHNA 3L4YA 3ALFA 1ISXA 3ARTA 3W53A 1C92A 3ARVA 1V03A 4BS0A 3UG5A 1GOMA 3ARYA 3MUY1 1WZLA 5JBEA 1V6YA 5ABHA 5CQ1A 2VVSA 3OZOA 4MNMA 3WQ5A 3SIMA 3VIKA 2J74A 1CNVA 2W61A 2VCBA 5BXRA 1UKSA 3CZKA 2VRKA 3B9EA 1C7SA 2UY3A 3OZPA 5D4YA 2OYKA 5BXTA 1WNOA 4J3UA 2X1IA 1IT0A 1UKTA 3GNOA 3MV01 4PEEA 2W66A 2OYMA 2AMGA 2VURA 3I3DA 4EAMA 2CERA 3W27A 3ZQ9A 2O9RA 3NYDA 3AMGA 3GH7A 2J8FA 1G1YA 4AD2A 1VFUA 2WVUA 4WSJA 1V3JA 4JHZA 4F9JA 5C70A 3T2QA 1HKJA 2WXDM 2WW5A 5IHRA 3FW6A 4GO9A 4Z2JA 2FGZA 3T0BA 1P6WA 3PZ9A 3QHMA 1RD6A 1E6ZA 3W82A 1WAWA 4JFUA 4PMXA 5D8WA 2V38A 4AEFA 1CGTA 1EDTA 4FF5A 3LPFA 4PUDA 1DWIM 4L4OA 3VGHA 1OBAA 3KL5A 1AQMA 3T09A 4M1RA 1K9FA 4CVWA 2XVKA 3WDIA 1XGZA 2XFRA 1Q6DA 3WNKA 2IXUA 3ZT5A 5EBAA 1V3LA 1NWRA 1Y7VA 1QI2A 4LGXA 3OLDA 5JIWA 2ZUTA 4DWSB 1DWJM 3WD4A 3WBAA 2WC3A 3EMZA 4WKHA 1R86A 4J27A 1V0LA 1KQZA 1H4PA 2CKRA 3WMBA 5DEZA 3AHVA 4Z2GA 4GINA 3AROA 1JZ3A 4WLCA 3ZIZA 1JI2A 5M3WA 1ECEA 4JKMA 3VGFA 4D1IA 3WFLA 2PWGA 3NSNA 1GHRA 2BNJA 1MYRA 2XGBA 3N9KA 3BAKA 1EOKA 1NQ6A 1KR1A 2WMKA 5CG0A 3BLPX 2PBGA 3AIUA 1HIZA 2ZX9A 3TTSA 3N17A 1E43A 2FDMA 1BYAA 1JF6A 2VCCA 4AD1A 1R87A 2QPUA 4KRTA 1E4NA 1UYQA 3PHAA 3AXIA 1JFHA 3ZJ7A 1GQLA 4D6GA 1ISWA 4GZEA 4AY1A 2UY5A 1GNXA 3ZR5A 1CXEA 4EANA 2JIWA 4P7LA 1QHZA 1OIFA 1QNSA 4HU8A 2XJ7A 1UWTA 1XH2A 4H2CA 4AC1X 2WVTA 2G3JA 3PTMA 2Y5EA 3AXXA 1ZL1A 4JKKA 4PMRA 4Q7NA 4E8CA 2RGLA 4B3KA 3J7HA 1W9UA 2O92A 4MNKA 2WK2A 4A3HA 3VU2A 4OIFA 1EOMA 3PZIA 3VNYA 2WMIA 1VF8A 3WF3A 1BYBA 4UR9A 2AOSA 1EDQA 3MO4A 3U7VA 3WH9A 5EFFA 1V3MA 3GH5A 4P7QA 1W9VA 3AYSA 3KZSA 2QHAA 5I78A 4N0RA 2WMGA 2W92A 2YL9A 1BFNA 2J7FA 5A3HA 1TFVA 4AZIA 4UCFA 3O9NA 1E5JA 3CBWA 5ABFA 4HPGA 1ISZA 3AICA 3VTRA 1Z32X 3APGA 2CCRA 2D20A 1H09A 5E09A 4CD6A 1ZJAA 3WEMA 4GQRA 4NRRA 3VIFA 1E56A 2A3HA 2WMIB 4R5EA 2WAGA 1WB0A 4QLKA 4W7VA 5HPCA 1CIUA 4QLJA 1DWFM 4PTMA 5A8NA 2VVNA 1PIFA 3VDHA 1MFVA 2G3MA 5A95A 2A3EA 2JF6A 1RPKA 1JYWA 1M53A 1JI1A 5A8MA 2EBNA 3VGEA 3WL0A 3DHPA 4CUCA 3E1F1 1VAHA 1V6UA 2EXOA 5ABFB 1JYXA 1V08A 1UWQA 3GXIA 4NRSA 2VQTA 5D9NA 1B2YA 1OGBA 4D71A 4CN1A 4IISA 4H7VA 3UG4A 1W9PA 2WCGA 1AQ0A 3EDKA 5A8OA 1TUXA 1OSEA 5A2AA 1TA3A 4DM2A 3WMCA 4OBSA 1TVNA 4D6CA 5A6BD 3CH9A 3NUKA 2V3EA 3DYMA 3EMCA 3RDKA 3LPGA 2J7CA 2YDRA 5C8BB 1GOIA 1V0NA 1KXTA 5E0FA 3OBAA 2WM0A 2XVGA 4AZ7A 1JZ6A 2WKLA 1E9LA 5EMYA 3AISA 3VX0A 3POHA 3M46A 1GPFA 4TVUA 1HXJA 5HXMA 3DC0A 2J8GA 1JFXA 1MW2A 3NJ3A 5CPQA 2HVMA 1E3ZA 1C8QA 2E9MA 4J3WA 2VI0A 1BHGA 2WWCA 1LL7A 2BXYA 4KH2A 2PBOA 2DH2A 3I3EA 1ISYA 1V02E 4B15A 3CPUA 1UD3A 3SCPA 1OINA 1XYFA 2VT0A 4M8UA 1B9ZA 1RP8A 1NM9A 4LXFA 3M6DA 3ZJ6A 3W38A 1X1NA 3CTTA 3HU7A 2QF8A 3VIHA 1M01A 3GXMA 1XH0A 3CLWA 4QCFA 1N82A 3A4WA 4UOZA 3MV11 2D22A 3WD0A 1HJUA 4WJXA 3MSDA 5DT5A 4CD5A 1VIWA 1CGVA 2JEPA 2BVTA 1XC6A 1UWIA 3IAPA 2V5DA 5JH8A 1JAEA 2QLYA 4WF7A 5CSUA 1E5NA 4D72A 4J3XA 2VRQA 2VC9A 2XYLA 4N42A 4BQ5A 4J3TA 1JNEA 2GDVA 1O7AA 5IXEA 2ZUVA 1KGUA 4UFJA 1UWRA 4WKAA 2ZE0A 3SCNA 2WBGA 4UTFA 1QI4A 3MMDA 3KE0A 4CN6A 4LPCA 4H04A 2VX7A 5BYWA 4A3YA 3AS2A 5AYIA 1UR9A 1HKIA 3OIHA 3U7BA 2BHZA 1EH9A 2VZVA 4J28A 3AMDA 4MB4A 3NSXA 2OWWA 3RO8A 3PZMA 3UESA 2Y2WA 3ZO9A 4P8XA 4URIA 2VQUA 2WMHA 1DWAM 1NWUA 3VDBA 4PMNA 1UWSA 5CSYA 1UR2A 4MAZA 2TAAA 2ZX7A 3K8KA 4JHOA 2XM2A 3FY1A 4P8UA 1PPIA 1E4IA 1HN1A 1CTNA 4ZXLA 5BCAA 2CESA 4W84A 1BVNP 1HT6A 2G3NA 2CIPA 2JE8A 3PTQA 2EO7A 4PSRA 3WF1A 5A8PA 4NF7A 4HZ6A 1WDSA 4TXEA 2PC8A 1JGIA 2Y4SA 4QP0A 4LX4A 4W8AA 1VEMA 1UA7A 2JFEX 3SCVA 3VILA 1DHKA 3U5UA 2OYLA 3ZJKA 3CUGA 3VM5A 2AAAA 5CLWA 3T0DA 3UCQA 2WC7A 3EMQA 4DUVA 2JIEA 1JL8A 1QNOA 1RP9A 1TVPA 1QI0A 3DYPA 1KR0A 1OB0A 2DPEA 1BYCA 4A4AA 4F8XA 4HMDA 5I24A 1HF6A 3WY1A 2YA1A 3O6AA 2X0YA 1UD4A 1CXLA 3K4AA 1HJQA 1QI5A 2O9PA 1E6NA 1FH7A 3WQ8A 1V02A 3CUHA 1WO2A 4MB1A 1CGXA 1UQYA 1ITXA 1E0WA 2WCSA 4CCDA 2YDSA 4PRWA 4UZUA 3AOFA 3RMEA 1LL6A 1G01A 2WSKA 3PZUA 4AZBA 1NWTA 3CZLA 2W91A 1ESWA 5TD4A 4QAWA 2XPKA 5IFTA 3SUSA 3RJYA 1UZ4A 4M29A 4HA3A 3WNNA 3WNLA 1G0CA 5AY7A 3WD3A 3WF2A 1Q4NX 4PMQA 3UR7A 5D8ZA 1UKPA 3VDCA 1JDDA 3BSGA 1AVAA 4NZCA 3AIVA 3CZJA 4HMEA 1VB9A 4U5KA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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