3WD0A

Serratia marcescens chitinase b, tetragonal form
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
total genus 165
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd0A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd0A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd0A01
1XD0A 2EQDA 3ARWA 2O9OA 1TA3B 2CKRA 4PMYA 1HJVA 4KWUA 3POHA 3HN3A 3ARVA 1AQHA 2CBUA 2EPKX 4YN5A 1CENA 1EHAA 5E09A 3J7HA 4LYPA 1NP0A 1OM0A 2JIEA 2YL8A 4B9YA 3HU7A 1TZ7A 4CU8A 5E9AA 4JFSA 1OT1A 5BRPA 1DWFM 1HP5A 4CN4A 4JFUA 3ARXA 4QLLA 1UWIA 3UESA 1Q6DA 2Y8KA 1BYBA 3WNOA 2XIIA 2PWEA 4U5KA 1W3HA 3SCTA 3W4RA 1WCGA 3VMOA 3IANA 4HMCA 2VT0A 4FF5A 2A3AA 1DWAM 1X6NA 4HMEA 4XV0A 1ISXA 5CQ1A 1V3IA 2VCBA 3VM7A 1EOKA 2YDRA 1TFVA 3NDYA 1WDPA 3UG3A 1DP0A 3WUFA 3AICA 3KL0A 3WDRA 1WZLA 4JHZA 1M01A 2J25A 3PTQA 1FFQA 4AD5A 1QOXA 3VMPA 2J8GA 3QHOA 5A1AA 3RO8A 3A47A 1JXKA 4P8UA 1KB3A 1ITCA 1H1NA 3WSUA 3RJXA 4GZIA 3ZIZA 3VGFA 2YA1A 5C71A 2XM2A 2BY2A 1JZ5A 1XCWA 4W8LA 2VCCA 5A8MA 3FAWA 4UQ9A 1RP9A 4W5ZA 3L2LA 2WHLA 2O9TA 4UFKA 4F79A 1E0VA 1KXTA 1UWQA 3CMGA 5CSUA 5E6YA 3VX1A 4GZEA 3WL0A 1NOUA 3OBAA 4LXFA 1O7AA 3RMEA 3MUY1 2XVLA 1M03A 3PZMA 3GNOA 1XSKA 1J10A 1G01A 3UR7A 2YLLA 4Z2JA 3VOCA 3VVGA 4F8XA 4RL3A 2E4TA 4Y7EA 4PMDA 1CGWA 1VEMA 2WVVA 2WCGA 5D9OA 3PZTA 4MJ4A 4FK9A 4PMOA 3ZO9A 3RM9A 4KRUA 2DSVA 1F4AA 1GQKA 1ZS2A 3FHAA 5KEZA 1QI2A 3AMLA 1JZ8A 4GXPA 2J47A 3GDBA 1C91A 2X2YA 1JF6A 5CPQA 3VPLA 5CG0A 4P8VA 3RM4A 2ZIDA 3AIWA 5LA1A 1DTUA 1FH8A 1OIFA 4HA3A 1HXJA 3D5HA 4WLCA 5AC5A 1SMAA 5BROA 3VTRA 1UR0A 4AWEA 2OWXA 2GJPA 2XTKA 2PB1A 1KR1A 1K9EA 4WKFA 1R86A 3OGSA 2TAAA 5D9PA 3THCA 3VIJA 2YIHA 4TX8A 1MQRA 4W89A 1VIWA 2NT1A 1KQZA 2XVPA 4AY1A 3UERA 1EOMA 4W7UA 2GDVA 2A3HA 3QHNA 2ZUUA 4PCTA 3ARUA 4W8BA 2VR4A 4AISA 3EMZA 4N0RA 1IV8A 4PBGA 1WDQA 1JZ3A 1UWSA 3VNYA 5DMYA 4U5IA 1LWHA 1MW2A 5M5DA 1UR2A 7CGTA 1CLXA 1H0GA 2XYLA 1NH6A 1UR4A 2ZUTA 1E6QM 1E4LA 1VEPA 2E9BA 1L8NA 4FLSA 4MB5A 3AXIA 1V3MA 2JEQA 2J62A 4ACZA 1ODZA 1UHVA 1R8LA 3THDA 1H5VA 2GK1B 4FMVA 3FW6A 1BYAA 3CPUA 3T08A 1F4HA 2V5DA 2WXDM 2WM0A 3MO4A 1UH3A 3GTNA 3I3DA 2XFYA 3FY1A 3VINA 4FLOA 1VFOA 5D8ZA 3DYPA 4U33A 3TTOA 4KGLA 1GOQA 1VEOA 2OSWA 5E0FA 4RE4A 3EDEA 2CNCA 3PZ9A 2WVUA 5I5RA 1WO2A 3AOFA 3N1AA 3SUTA 3WH8A 1X6LA 2JF6A 1QHZA 2EXOA 3AISA 2Q8XA 2VX4A 3UEQA 1JDDA 4X9YA 1XCXA 3WF3A 2GSJA 2E3ZA 3WDJA 5D4YA 1QI0A 4L4PA 4UOQA 3T09A 4CCEA 1AIWA 4AZHA 4PTWA 2PWDA 4M24A 1JAEA 3A4AA 1UG6A 3WN6A 4HA4A 2PWFA 2VCAA 5BYWA 2UY4A 3PZUA 3SEPA 3LMYA 2ZUNA 2CXGA 1S46A 1R7OA 4PMRA 2CITA 4UFIA 4W85A 4H04A 3OLDA 4PRWA 4QLKA 1BFNA 1YQ2A 4AEEA 5CSYA 2O9PA 4Z2LA 4MPKA 3ZQ9A 1TA3A 3QOMA 1MYRA 3ALGA 1H11A 2YA2A 4MJ2A 3WNLA 1WB0A 4AC1X 2WSPA 4M80A 3VIIA 2PI6A 3FAXA 5HOSA 3VD5A 1HJWA 2XJ7A 1UKOA 2J7EA 2FDMA 4ZFMA 3A4XA 1RPKA 5IFTA 1E0XA 1KXQA 2WMFA 4ATLA 1SFSA 1Q4NX 1JYWA 2DT0A 1E72M 2OYMA 5F7UA 4BQ5A 5A6AA 3VKKA 2G4FA 4UOJA 2CIPA 4J3UA 3ALFA 3FXYA 2J7FA 3L4UA 1JG9A 3T0AA 1W1PA 4W7VA 2CCRA 3L4TA 2W61A 1EA9C 5I24A 1CBGA 1E1EA 2Z1SA 1CGYA 2VTFA 3AROA 2UY3A 2VZSA 3K1DA 4LX4A 5A8NA 2DIJA 3AS1A 4W88A 3B8SA 2V5CA 3E1F1 1RP8A 1NM9A 5A94A 5EFDA 2DSKA 4PTXA 2YDSA 1AVAA 5I2UA 1JNDA 1JZ4A 4ATDA 2D0FA 3ZR6A 9CGTA 4GO9A 4NI3A 1D7FA 2ZWYA 5GNYA 5EMYA 7A3HA 3ARZA 4PSRA 4JHOA 2F8QA 1H09A 1MVYA 4D6EA 2CYGA 1B31A 1ZJAA 5D9MA 1U30A 3WMBA 5BCAA 2GUYA 3WF4A 2W66A 5IDIA 2WZEA 2UWFA 1JD9A 4Z2KA 2YDQA 4YPJA 2XVGA 1FP9A 3GBEA 1WZAA 4XUYA 5I3DA 4LQ1A 1MWOA 4IUGA 3BAYA 3WKZA 5C8BB 4E2OA 2B31A 4MB3A 3UG5A 2V3DA 2XIBA 4KMQA 5FL1A 3DYOA 3VX0A 3AMCA 3WF0A 4BF7A 4JFVA 2D0GA 1FFRA 3AIUA 4ML4A 1UR8A 2J7DA 2WZIA 4PMXA 4JFWA 4ZE4A 2EPOA 3APGA 4MNMA 4CUCA 1J11A 1E3ZA 1JI2A 1ZBVA 1E43A 1ZBKA 1KGXA 3AHYA 3T0BA 2VI0A 5A6MA 2D20A 1GPFA 1UZ4A 3CTTA 1AMYA 4CCDA 2D3LA 3ZT6A 1V03A 4DWSB 2BY1A 5D9NA 4PUDA 2WSKA 1UQZA 3A3HA 3SUSA 4PMZA 4YHEA 2GFTA 2YKKA 3N18A 1KCKA 4H7VA 1ZJBA 2XPKA 2YLAA 1P6WA 1BG9A 4U2ZA 3VIMA 3WD4A 1C8QA 3U7BA 3W25A 1UD8A 2G3JA 4MB4A 5A6BD 1CZ1A 2VQUA 5CZKA 2E9MA 4AYSA 1ISZA 4U3CA 3AQUA 4JAWA 1A3HA 1C3FA 5DO8A 3BCFA 2JALA 1W9DM 3POCA 3AHVA 2UY5A 1H49A 2GK1A 2DPEA 3N04A 1W9XA 1UWRA 4BQ3A 1LWJA 1XH2A 3W27A 4AD2A 3CHEA 1CXEA 1E6SM 2RTSA 2DGAA 3WNNA 4QAWA 4WIWA 2PBOA 4JKLA 3AIEA 3SCOA 1EO5A 1BYCA 3EYPA 1HL9A 5KZ6A 4DWSC 1FP8A 4E8DA 5ABHA 2FHBA 2EO7A 4MDOA 1CWYA 2WVSA 4QDMA 3SURA 4DWSD 2AAAA 3F5LA 2X8RA 1QNPA 1XV8A 4KGJA 3RIKA 2ZX8A 4OZOA 5BXRA 1FH9A 1G0CA 4CU7A 1J9YA 1BTCA 3QHMA 5HXMA 2XUCA 5BXPA 1JYXA 3GH5A 2QMJA 3MANA 4URIA 2J74A 1V08A 1ISWA 4F9JA 2G8ZA 2YBUA 1DWJM 2E8ZA 3EBVA 1GUVA 1VENA 4EAMA 3BCDA 4GZJA 3VGDA 1JIBA 1ODUA 1Y7VA 5I6SA 4CD4A 5TD4A 1WP6A 3CBWA 4BS0A 2VZOA 2O92A 2HISA 2DSWA 3WNKA 4H41A 2J75A 3ECQA 3AIQA 5A8QA 1K9FA 3CZ8A 2QF8A 1VAHA 1W2VA 2DT1A 3AMGA 3SCSA 1CIUA 3CZGA 1B30A 1PPIA 3BAWA 4MADA 1PJ9A 1LG2A 1J12A 1UD5A 1OIMA 4KRTA 2QLYA 4OOZA 2DH3A 4J7RA 2WKGA 3WQVA 1E40A 1KFWA 1OGSA 1WKYA 2PWHA 4PMUA 1KBKA 3F5JA 5BXSA 4J3SA 1M53A 2VRKA 3ZSSA 2XM1A 4LYQA 1MFVA 3KL3A 1DWHM 4Q7NA 5AC4A 5LA0A 3NSMA 2XSBA 3W0KA 5A69A 5A2BA 2DSZA 4M1RA 4UCFA 2IXUA 3BMWA 3OGVA 4D6IA 1BF2A 4B9ZA 1UR9A 1G9HA 1UA7A 3NSNA 3DYMA 1CNVA 3WD0A 3W82A 4P8WA 4A3YA 2J7GA 4WKHA 4JKMA 4IM4A 4UFJA 5DT7A 1B3YA 4C7FA 1E5NA 4OJYA 4TVDA 2J78A 4OKDA 3MUAA 2OWWA 2J4GA 1KQYA 5E0CA 4JCLA 1NP2A 1B3WA 4P7QA 1E4NA 4MDPA 3SCNA 3KWXA 4TXEA 2VQTA 2BVYA 4Z2HA 3EDKA 4Z2GA 3WQ6A 2X09A 3WH5A 3B9AA 1CGXA 4TOQA 1W1TA 3OIHA 1EDQA 1UKTA 4V27A 2Y8VA 4XX6A 1XH1A 2D23A 3GZAA 4OBSA 3N13A 2VR5A 5A6BA 2FHFA 3L4YA 2JE8A 1PZ2A 1KXVA 1PAMA 3NSXA 2VVSA 2W63A 3AIVA 3PZIA 4B15A 1GOKA 1I1XA 2IXVA 2CPUA 4M82A 5IHSA 3U7VA 5I0DA 4IISA 2E8YA 4JFTA 4HU0A 3WNPA 4M8UA 4MTVA 4P7OA 1XRVA 2QPSA 1C8XA 1GZJA 1KGUA 3OLGA 4NRSA 3WMCA 2VX6A 1LF1A 4WSJA 3T2QA 3M07A 2Z1KA 1LL7A 3WDQA 3ZJ8A 3BAIA 1LJYA 3VGGA 3OZPA 3L4WA 4J3WA 2FGZA 3VNZA 4GKLA 1U2YA 1JL8A 3NIYA 2YL9A 3F4VA 1BLIA 4HMDA 2A3BA 2XWDA 3LPPA 1QNQA 1W9BM 4DWSA 1CGVA 2WHKA 1MQQA 2EPMX 1XGZA 4CVWA 5CXPA 4DUXA 1R87A 1BGGA 4W7WA 2Y2WA 1FA2A 2D24A 4UQCA 4AIOA 3ZJ7A 4ACYA 2WLYA 2XSAA 3VIHA 5JIPA 1K9DA 5AYBA 3A6OA 2V38A 3BLPX 4UZSA 4D6FA 1E4MM 4ZENA 2D3NA 3IJ8A 2ZUMA 3IK2A 5LA2A 1W9UA 2FGLA 3GXIA 2BV9A 1OGGA 1HVXA 1M7XA 2X0YA 4F9DA 2WK2A 3S2CA 5CPSA 3M6DA 5ABFB 3WL1A 3RCNA 4UNIA 3M46A 4HU8A 4N42A 2RGLA 3KZSA 4HPGA 5JIWA 3WEMA 3G6LA 1W2PA 3AIRA 3BLKA 1QW8A 2ZX7A 1A47A 1CXKA 4IPNB 3W37A 3JUGA 2WZHA 2C0HA 3MSDA 1PBGA 1KR0A 1TUXA 1X1NA 2WC4A 3T2PA 2GJRA 3CHDA 4WK9A 3VIOA 3EDFA 4GQRA 2VL4A 2XVNA 5DEZA 3S6TA 3RJYA 4R5EA 4H8UA 4PSPA 3CUHA 1MW1A 3L4XA 2OYLA 3WUBA 3BC9A 1UWUA 1HJUA 2G41A 1HT6A 1ZU8A 2YA0A 5A2AA 4U2YA 2CESA 3AHTA 1HL8A 1PEZA 3AYSA 1G1YA 5GQBA 5CJ5A 3W24A 3UCQA 3TTYA 5CLWA 2QHAA 1BSIA 1UH2A 1J0IA 3CGTA 3VIKA 4C7DA 3OGRA 4HA1A 1PX8A 1JZ2A 4D6CA 3FHQA 3WY1A 3VIGA 3I3BA 1EDGA 5JBEA 4QCEA 5FCZA 2FH6A 2VJXA 1UYQA 1GVYA 1AQ0A 3MKKA 1V6UA 1WE5A 1JGIA 1W9PA 4PMNA 1L0PA 3IJ7A 1CXIA 4RE3A 2PF0A 3WF1A 3N12A 4OOUA 2VNCA 1B0IA 4CD6A 1W1VA 1EDTA 1H0IA 4BQ2A 4CGTA 4TVUA 1UKQA 1BYDA 1GQIA 4AZ7A 1UD4A 1XHGA 1MW3A 1UOKA 5GPRA 4PTMA 4AD3A 3SCRA 4EE9A 1WAWA 3WD2A 4AZ6A 1PIGA 3CUJA 5HPCA 1K6AA 3N15A 4UFLA 5A6KA 1ESWA 1ED7A 2WWCA 3KE0A 2BVDA 2VZTA 1GOMA 1KBBA 3TONA 2BFGA 1TVNA 4B3KA 2YBTA 4HOZA 1D2KA 2J8FA 3SUWA 3TP4A 3VILA 4YHGA 3WD1A 2VOTA 1GHSA 3PN8A 1XH0A 4MAVA 3WQ5A 5I79A 3MMUA 1CECA 1MXDA 1HX0A 3CZEA 1BPLB 1CXFA 3ARTA 3AHXA 3VDHA 4BZYA 4TVCA 4H8VA 3WDIA 5BWFA 2QMKA 5DFAA 3WUEA 3A4WA 2FHCA 3PZQA 4AZCB 5JH8A 2VZVA 3I3EA 5A6SA 1W91A 4NSBA 4JKKA 3WFZA 1V0MA 1CPUA 1G94A 2BHZA 4HOWA 1B90A 2WNWA 1OBAA 5AY7A 2Y24A 4ATWA 1HKKA 1HKIA 3AYRA 2X05A 4V28A 3RDKA 3TTQA 4TTUA 1AQMA 4MNKA 2J77A 5LYRA 3WQ4A 3T0DA 1LQ0A 2IUZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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