3WD3A

Serratia marcescens chitinase b complexed with azide inhibitor
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd3A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd3A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd3A01
3OGSA 3TONA 2XVLA 3GYCA 1FFRA 1KR1A 3POHA 3VU2A 3NUKA 1NWUA 1JG9A 1E9LA 2J62A 2VZVA 3A47A 4CN6A 3WH6A 4HOXA 4JCLA 4NRSA 3CIVA 1EHNA 4TUFA 1KXTA 4P7NA 4C7FA 2EJ1A 3PTMA 3RIKA 4HMEA 3ARYA 3CUIA 3RM8A 5AC5A 1MFUA 3EYPA 4QAWA 3VD4A 3U5YA 2W67A 4ZFMA 5ABHA 2QMKA 2XHYA 1UR0A 2B31A 4QFUA 1UHVA 3MUAA 3II1A 3SUSA 2OWXA 4GZEA 1VEPA 5CPTA 2BVYA 3AI0A 4BQ4A 2VVSA 5A6LA 1MQRA 1E1FA 1ISXA 3WNOA 1R7OA 2OYKA 1H0IA 3WQ6A 2D2OA 2WHJA 3LPOA 1WDQA 4L4PA 1DWFM 4UQAA 1HJXA 4AZCB 1SFSA 1L8NA 1Q6DA 3A4AA 3OZPA 2XGIA 3WQVA 1ZBCA 1U33A 2YIHA 2W66A 2XVPA 1OGGA 2QV4A 4IM4A 3VMNA 1LF1A 3S6TA 1R8LA 1J0KA 4N0RA 3N15A 3ARXA 3MANA 2PB1A 1N82A 1X6NA 1GUVA 1E0XA 2EPOA 5BROA 1ZL1A 4UFHA 4QCEA 4PTMA 1J0IA 3W28A 2XSAA 3IJ7A 4P8XA 3RJYA 2GDVA 3VIFA 4UR9A 1EO5A 2A3BA 4R27A 1WNOA 1UA7A 2WZIA 2PBOA 4D1JA 1PZ2A 3IK2A 1JDCA 1B90A 2W4XA 3TTYA 3CZGA 4HA1A 3UCQA 4AZGA 2ZIDA 2FHFA 5A69A 2DSUA 2WVUA 2NW0A 3EMZA 1BGGA 2D0FA 4Z2KA 2YJQA 2OWWA 3CBWA 1EXPA 3CH9A 5JIWA 5EFFA 4M1RA 3VGGA 4RE3A 5TD4A 3T08A 1IT0A 3VIHA 1DWJM 4GPNA 3W6MA 2EQDA 5I3DA 1VEOA 1KBKA 4AZBA 4CD7A 3ARTA 9CGTA 2A3EA 2G3MA 4WKHA 4GO9A 1JZ4A 2WVSA 4P7LA 4E8CA 3RM9A 1JYWA 2O9OA 3WIJA 2GVYA 1C7TA 1V3MA 3MMWA 1AVAA 1QNRA 1LWJA 5D9PA 3WF3A 1FOBA 2E4TA 1DWHM 1E70M 4GKLA 3L4VA 4MNLA 1BG4A 1VIWA 4DUXA 3N1AA 1D7FA 2A3HA 1XSIA 2BV9A 1MW2A 3WDPP 2WSPA 4MB3A 3AMCA 1GPFA 5FD0A 1JDDA 1GQIA 4MAZA 4W7WA 1BF2A 1XCXA 2QLYA 4URIA 4JZ5A 3TA9A 1UR4A 2J77A 1FP9A 3APGA 1W3KA 1NWRA 1UR8A 4CCDA 4GI9A 2YOCA 3DC0A 1BHGA 2XVGA 1SMDA 5CPQA 3VO0A 4K68A 3VM5A 4UZUA 1E55A 1CGVA 3AXXA 1DWIM 1VF8A 3VGBA 3UG5A 3TTSA 3O9NA 1E1EA 4F79A 1QW9A 2Y5EA 3AMKA 3ZJ8A 5HXMA 1QW8A 3ZSSA 1C8QA 2J8GA 1E3ZA 4AISA 2DSKA 2XPKA 1E6ZA 1V6VA 2JE8A 1ED7A 4PMDA 4W84A 5BRQA 3T0BA 1BPLB 2DT2A 4U2ZA 3ZOAA 3F5KA 2WSKA 4LGXA 2ZUNA 3MMUA 1RPKA 1UR9A 2VX5A 3VGEA 1J18A 1UWSA 2DSVA 2WHKA 4JCMA 3AMGA 1EIBA 1GOMA 3WF4A 2X1IA 1H2JA 3FAWA 4AZ6A 2XIIA 3WF2A 3MKKA 4AZIA 3WQ8A 3ECQA 4KH2A 1V3LA 4PMOA 3CZLA 1PX3A 4QCFA 2WZEA 3PTQA 1HJVA 1RD6A 1W3HA 5D8WA 4F9JA 2XSBA 1UWQA 5AC4A 4XZBA 1G01A 2JF6A 3I3EA 2RTSA 2VTFA 3B9AA 1VJSA 4FMVA 3PZ9A 3ZT5A 4LYQA 1E0VA 3LPPA 2DQXA 2WMHA 2YLLA 1ZBKA 4DWSA 1CXFA 3ARPA 3WMBA 2WKGA 4MDOA 3GXFA 1V0NA 3GH5A 1FP8A 1Z32X 5A8OA 1HXJA 2X05A 4LXFA 1YHTA 3KE0A 1G0CA 2Z1SA 3M07A 3WD0A 2CIPA 5A95A 3WUFA 7CGTA 3VMPA 1VFFA 1ZBVA 2VR4A 2VZSA 5D9OA 1BLIA 3QGVA 3ZT7A 1EQPA 1E6SM 2E8YA 3VNZA 4U3CA 4HU8A 1MQPA 4P8WA 1FH9A 3CZKA 1HKIA 2CITA 3E1F1 3ARUA 3AIUA 1H1NA 3FHAA 4LX4A 1XH0A 1UQYA 1NQ6A 4MTVA 5CXPA 2ZX9A 5JBFA 1NP2A 1PIGA 2QPUA 3WDHA 5A94A 2PWDA 2DT1A 2WC7A 4PN2A 2PWFA 4NZCA 2DDXA 1BSIA 3GH4A 3L4WA 2G3JA 2CERA 1ITCA 1NARA 3AYRA 3QHOA 3RMEA 3EMCA 3PHAA 1HL8A 4MB1A 1C93A 4CCEA 4W7UA 2EPLX 3O6AA 3MV01 5FOOA 2XWEA 5HNNA 1KGWA 3GNPA 2DPEA 1TR1A 2D1ZA 4H8UA 4NSBA 1W3JA 2O9PA 1CXEA 4X0VA 3WEMA 3CZJA 3DHPA 1ZB5A 4C7GA 2GJRA 3L4TA 1TZ7A 4IPNB 5KZ6A 3AZSA 2VCCA 2Z1KA 1QI4A 1H41A 1V03A 1KXHA 3VGFA 5GPRA 5FL0A 4JIEA 2XJ7A 4HOZA 3VX0A 4PSRA 2ZUUA 3K4DA 2VL4A 4PTVA 3NJ3A 3NSNA 3BMVA 1UD5A 4FLOA 5CGTA 4TXEA 3WEOA 3T2OA 3K8MA 1UKPA 3N18A 2VNCA 4YN5A 1K9EA 1CGWA 5GNXA 4JFUA 4JHOA 3VD9A 2Y24A 1J12A 1K6AA 3WQ5A 1JI1A 4UFIA 1KQZA 2W5FA 7A3HA 6A3HA 4E8DA 2WBGA 1MXDA 2XGBA 2WMFA 2WMKA 4QLJA 4EE9A 2BVTA 1TE1A 2QF8A 4GO8A 4D1IA 4EK7A 4DUWA 1JZ2A 5D8ZA 4TX6A 1DP0A 4QDMA 3AIBA 1E43A 3SCPA 3MU7A 4PMRA 4WLCA 3EDEA 5CGMA 1OWQA 2DEPA 1ESWA 2BHYA 2NT0A 3IJ8A 1V3HA 4JL1A 5DEZA 1HVXA 1H3GA 1MQQA 1W3LA 2WVVB 4M8UA 1JL8A 4M81A 1AIWA 4UFKA 3PBGA 2DH2A 2W63A 2DIEA 4AD5A 1R85A 5I77A 1QI3A 3W82A 1V0MA 1E4NA 1JZ5A 2W91A 1K9DA 5CJ5A 3QOMA 3UERA 4CD8A 1CGUA 4GINA 1HN1A 3GBDA 1E6NA 2VZOA 1E3XA 3L4UA 1US3A 2VCBA 5BXPA 5M03A 3AMDA 4B15A 1HKKA 3THDA 3MUIA 2J7EA 2VRJA 3MUZ1 1G9HA 2X8RA 4W8AA 1PZ3A 5CSUA 1J9YA 4C7DA 1XC6A 3GNOA 4PCTA 4EAMA 3FHQA 1AQMA 4UZSA 1ISYA 1CXLA 3G6LA 1B2YA 2XFRA 3NDYA 2XWDA 3A4WA 2XFFA 1TA3B 5CLTA 1HNYA 3OZOA 2BHZA 3MMDA 3BAXA 5A6MA 3ARSA 2IXUA 1MW1A 2E40A 4PTXA 1KGUA 3ZQ9A 3NDZA 4W85A 2FGZA 3AJ7A 3NSMA 4ZXOA 3HMCA 1E0WA 3WBAA 2GFTA 2BXZA 3PZVA 1E56A 1V0LA 2GK1B 2VI0A 8A3HA 3ZSTA 4DM1A 4JKMA 1FFQA 4UQEA 1UOKA 3F5JA 3S2CA 2WCSA 2PWHA 2GJXB 5ABGA 3MS8A 4DWSD 3GZAA 3VIGA 3N13A 2OSWA 3WEZA 1CXKA 5BXTA 2WZHA 3D5HA 1TCMA 1H49A 4CVUA 3OLDA 2BY1A 3CHEA 5A6JA 2A3AA 1ITXA 3SCOA 8CGTA 1TVNA 2YA1A 5IHSA 3A6OA 4TOQA 2IXVA 3EBVA 1B3VA 1CXIA 1CECA 4U33A 4W88A 3BAIA 4MNJA 7TAAA 2WMGA 4KRUA 1UH4A 4HPGA 4E2OA 3CUJA 1ZBWA 1WO2A 2YL8A 4OUEA 3WDJA 5A6AA 4PMUA 4GQQA 4Z2HA 5EFDA 3VX1A 4PUDA 2VMFA 1WE5A 3VTRA 3PZTA 2J8FA 2ZX7A 2E9BA 4AXNA 5CZKA 4CU7A 3VDCA 3AICA 4XV0A 5CQ1A 2XTKA 2GDUA 3VKKA 1X1NA 1OCQA 3DYMA 2CETA 3CUHA 2UY3A 5BWFA 4CGTA 1J01A 1HL9A 2FH8A 3B9EA 2V3FA 2MANA 1XH2A 4CU8A 3SCUA 4DWSC 5HPOA 3RM4A 2JALA 4E4PA 2VUYA 3WKZA 5E0FA 1JYVA 4Z2IA 4UCFA 4AZHA 2CCRA 1BGAA 3AHZA 3VIIA 2PWEA 4TVDA 4X0NA 3GXMA 4CVWA 2VVNA 4PYSA 1W2VA 4P8VA 1DEDA 3WUBA 4AZ5A 2DT3A 3AXHA 1W91A 2CEQA 1WP6A 1EDGA 3AIQA 1WPCA 1E15A 1PX8A 3NCOA 4BQ5A 1GOOA 2ZX8A 4JL2A 4TVUA 4U31A 3NYDA 4NF7A 1TVPA 4P7QA 1V3JA 1F4AA 2BY2A 1V02A 5IFTA 1TMQA 4W87A 3DECA 2VJXA 1GZJA 1LJYA 4ZE4A 3B9DA 5E0CA 1I1XA 4ACZA 5GNYA 1OSEA 1V08A 3T0DA 5A3HA 4AD3A 3KEHA 3MV11 3ZR6A 2D3NA 1SYTA 2J25A 2YBUA 1VRXA 1PPIA 5HDRA 1J0ZA 4B9ZA 3OGRA 3W81A 1XH1A 2JIEA 4AEEA 1KCKA 1JXJA 1Y7VA 3U7BA 4AD4A 3ALFA 2WMIB 4AWEA 3WFLA 4CKQA 3WENA 2G3NA 1ISZA 1B3ZA 1XD0A 1ZU8A 3K4AA 1BYBA 1CIUA 2YKKA 2YDSA 2J7HA 5D4YA 1XD1A 5FKYA 1QPKA 5FL1A 2BY3A 5E70A 2GK1A 3DYPA 2FHCA 1R86A 3AHVA 3VNYA 1G5AA 1B0IA 2PBGA 1S46A 4AD0A 2YL9A 2YDQA 2IUZA 3OA5A 5JBEA 4W8BA 2C8NA 1EH9A 1CYGA 2CBVA 4D72A 5IDIA 3AFBA 1LL7A 3ZR5A 3KZSA 5I79A 1E4MM 2VQUA 1HF6A 3K8LA 3UETA 4H7VA 4B16A 1W1VA 3GNRA 4AZCA 3ARVA 3W0KA 2WLZA 2XM1A 1UKTA 2J7DA 5E09A 4AY1A 3SCVA 1OGBA 1UUQA 2D24A 3I3DA 1PJ9A 3VIMA 4AIOA 1HVQA 4IPLA 2EEXA 4GIAA 1HJSA 4YPJA 4BQ3A 4JKKA 1ISWA 1M03A 3JUGA 4RL3A 4ZEPA 3VMOA 2V3EA 3EDKA 1B30A 1MVYA 3W27A 3SUWA 1EQCA 4W86A 3EDDA 1CEOA 1GVIA 3K8KA 1QNSA 4M24A 2Y8VA 1IV8A 1VFMA 5C8BB 4DUVA 1V02E 3WD4A 1CDGA 1WDSA 3SUTA 5CG0A 1G1YA 3ZIZA 5DO8A 5DFAA 4CCCA 2YL5A 3W25A 1CGXA 2VOTA 4GI8A 4Z2LA 1ODZA 5A6BD 1Q6GA 1ZJAA 4TTUA 4J3WA 2WM0A 4B3LA 4JAWA 2DGAA 2WWDA 2ZXQA 4CUCA 1UD3A 2VZUA 3HN3A 3VD7A 3BLPX 1BFNA 4L4OA 3OIHA 1W9PA 1JYNA 2XG9A 1JGIA 1C8XA 3W4RA 3SIMA 5I6SA 2WWCA 3CZEA 1EHAA 4IISA 4F8XA 2WAGA 1IZKA 1GQJA 1VJZA 3ZJ7A 4BCEA 1BG9A 4LQ1A 2Y8KA 4NI3A 1TG7A 2VT0A 1LL4A 2WYSA 4J3UA 2CYGA 4AMCA 3KWXA 3KL0A 3AXIA 4UNIA 5E6ZA 2E8ZA 1OB0A 2J74A 4OKDA 4WIWA 3VDBA 2V3GA 5CPSA 1W1PA 4ACYA 3ARQA 5A8NA 3UEQA 2YL6A 4D6FA 3OLGA 3CHFA 1XHGA 4V2XA 2AMGA 3BGAA 3SCNA 3AROA 1D3CA 4BQ2A 3SUVA 5E9AA 1V6UA 1XYFA 4UQCA 3WL1A 3FXYA 4W5ZA 2ZUVA 1M04A 5C70A 1A3HA 3EDFA 1XCWA 5D9MA 3ALGA 2VX4A 2XM2A 1JNDA 1CWYA 5A2CA 4TTGA 1OIMA 4WSKA 1FA2A 4JFVA 4P7OA 4BS0A 3AS1A 5A8MA 3W26A 3MSGA 4M82A 4MADA 3BCFA 1WZAA 5I23A 3WN6A 4W89A 4H41A 2V5DA 4KWUA 1BVZA 2TAAA 3BLKA 4PMYA 3GBEA 1QHZA 3IAQA 2YLAA 2Y2WA 4S3JA 2NT1A 3SCTA 1GORA 1LG2A 2EBNA 1RP9A 3SCRA 5IHRA 3VDHA 3VIJA 4AD2A 2C7FA 1UA3A 1JD9A 1JIBA 1FH8A 2EO7A 3WY1A 3N17A 1C7SA 4CD5A 4S3KA 4OBSA 4FLSA 3M6DA 3WSUA 3U57A 2BNJA 1MW3A 3MSDA 4PCSA 4ATDA 1E5JA 2F8QA 4OOUA 3AIEA 4U5IA 4UTFA 3GM8A 4PRWA 4D6EA 3D3AA 1W9BM 2WKLA 1NOUA 1GJWA 4RE4A 1B3WA 2V38A 2ZUWA 4JFWA 1E5NA 3QOKA 3WH9A 1UR1A 1VAHA 1W9DM 4BF7A 4KGJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2W4X A;  2OEM A;  3KCJ A;  2E28 A;  3TJ4 A;  3E0L A;  5C9Z A;  2NW0 A;  1BKF A;  3LOT A;  4C6O A;  4Z2K A;  4MM1 A;  2DZA A;  2PPO A;  4QDW A;  4C6I A;  4DO6 A;  3DC8 A;  5JIW A;  2PPN A;  1CW2 A;  3VGG A;  5CJM A;  3T8Q A;  1IT0 A;  3KAI A;  1DWJ M;  4GPN A;  3VIH A;  3IVT A;  3UPM A;  3QR1 A;  5I3D A;  4DUO A;  1VEO A;  4EWN D;  1TJR A;  3NVT A;  1R2T A;  3CL8 A;  3AUO A;  3AO0 A;  4FAP A;  2G97 A;  4CD7 A;  4O8R A;  4FF7 A;  1JQX A;  4XBK A;  1HKW A;  4ORM A;  4B92 A;  4FXJ A;  4UXD A;  3C2Y A;  4FNS A;  1AVA A;  5D9P A;  1E70 M;  2O4Q A;  3RFW A;  3N14 A;  3LU2 A;  3TC7 A;  1VIW A;  3FS2 A;  3BUV A;  2WSP A;  5LNV A;  2QLY A;  1O5K A;  1ALD A;  1THF D;  3BLF A;  3TA9 A;  1UR4 A;  1EC9 A;  1XBZ A;  5DEL A;  3JS3 A;  3DN5 A;  3GFY A;  6ENL A;  4GI9 A;  3DC0 A;  1SMD A;  3UJS A;  4QS6 A;  4O10 A;  3VM5 A;  1D8C A;  3THQ A;  4UZU A;  2POD A;  2KR7 A;  2NZL A;  4O1D A;  2Z1X A;  2OT0 A;  4GHR A;  3VGB A;  3UG5 A;  1YU0 A;  3VNJ A;  4JIH A;  2GGI A;  3QLL A;  3KTC A;  3UFY A;  2XH2 A;  3W7M A; 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 2PRM A;  1JCY A;  5M2F X;  2X40 A;  5GJP A;  3B03 A;  3QR0 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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