3WD3A

Serratia marcescens chitinase b complexed with azide inhibitor
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd3A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd3A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd3A01
3GBDA 1VEPA 1QNPA 1S46A 2EJ1A 4WLCA 3WF3A 3GH5A 3AROA 2ZE0A 2FHBA 4PMDA 1ZBVA 3U5UA 4JFSA 3CHDA 3FNDA 3PZTA 1Q6CA 1HJUA 1XH2A 3WUGA 3WH9A 3BH4A 4ZFMA 1JXKA 4MB4A 2GDVA 4AD3A 2J7DA 2WMFA 2ZWYA 3M7SA 1GHSA 3UR7A 3ARWA 1GZJA 1IZJA 1E55A 4NI3A 1UOKA 1PJ9A 1EO5A 2XGIA 2JIWA 5BCAA 3WEOA 1JAKA 4P8XA 1MWOA 3WMCA 4UFLA 3AS3A 3EMQA 1JZ4A 4DWSB 3VDBA 1V03A 3RM8A 1TZ7A 3ALFA 2QMKA 2W61A 4W93A 5ABGA 1HN1A 1YQ2A 1PX8A 1E3ZA 4JCMA 1GQJA 4GKLA 2BXZA 1MYRA 1H41A 1H11A 1QNRA 1Q4NX 4PTWA 3LPGA 5HPCA 1QNSA 5A6JA 3FHQA 2CCRA 1SFSA 4DM2A 3WNNA 3HMCA 3ZMRA 3AXXA 3BAWA 3KWXA 1LWJA 4UZSA 1UD4A 2VC9A 1CXHA 5IHRA 1W3HA 2VX5A 5A2CA 4CVUA 1FH7A 1HVXA 1J0YA 4CGTA 2O9OA 2DQXA 2ZUNA 5FCZA 4M80A 1RP8A 4DUXA 4F79A 3A4WA 1V3KA 5C8BB 4CD5A 3PZIA 3AFBA 4B9YA 2UY5A 3PZOA 1EH9A 4U2YA 3LPOA 3OGVA 1BHGA 2WCGA 2HISA 2ZIDA 1NWUA 1NWTA 5FKYA 1BGGA 5A6AA 1UR1A 1C93A 4CN6A 3ARTA 1LG1A 4WKFA 4W7WA 5I79A 4DWSA 4H8VA 5JIPA 4JL1A 1BG9A 1JZ3A 3WMSA 3MSDA 3WN6A 1JL8A 1KQYA 1WO2A 3F4VA 4P8UA 4V28A 5CZKA 3ECQA 1B31A 3CLWA 4B3KA 5E70A 5JBEA 3WFZA 1SMAA 1SR0A 2X1IA 5A95A 4FLOA 4PTMA 1QHPA 1V6XA 1XSKA 2J7FA 1VFUA 3N13A 1E4NA 2E9LA 3WELA 1QOXA 2XVPA 3RJYA 1MFVA 1G5AA 2VZOA 2O9TA 4U3CA 1AQ0A 2YLAA 2CETA 3VIKA 1HKJA 1WDQA 3W25A 4TVUA 2VR5A 5CG0A 4GZIA 3WNMA 4HMCA 2A3HA 3M46A 1W1YA 1GVYA 1US2A 1AMYA 1DWFM 1E6NA 1IT0A 1UWTA 2PWHA 2WPGA 3WNPA 5A8NA 3VDHA 1KQZA 1J0JA 1FA2A 1CGYA 2YA1A 2JEPA 1WP6A 2GFTA 2VRQA 2DT0A 4MADA 3GZAA 4B3LA 4N0RA 2D0FA 1CYGA 2FH8A 1PBGA 4CN4A 4L4PA 2XM2A 4F9DA 1UHVA 1V0NA 4GO9A 4UOQA 1C90A 1R8LA 3K4AA 3AXIA 2AMGA 2CPUA 3SCVA 4AZGA 3J7HA 4JFWA 3ARUA 5M03A 3EDFA 3GXMA 4WSJA 3RIKA 1HNYA 2DEPA 1W9UA 4OUEA 2EPNA 3AIEA 3CGTA 2DIJA 2WHKA 2WZEA 2VURA 4QLKA 3K46A 2J79A 2C0HA 1NOUA 3S6TA 3UG3A 1FOBA 3TTYA 1FH9A 3NSMA 1H5VA 1VRXA 4H41A 4AZ5A 4CD7A 3FXYA 1WNOA 2D20A 5TD4A 1ED7A 6TAAA 4D6IA 4D6JA 2UWFA 3ZJ7A 5A94A 4LGXA 5DFAA 1B30A 3A4XA 3RM4A 2FGZA 3EBVA 2OWWA 1JIBA 1B90A 2WHJA 3WQ4A 1E4MM 2G3NA 2DIEA 1DP0A 3NDZA 2XUCA 3VPLA 4BS0A 3GNOA 4W8BA 2IXUA 4HOWA 2ZWZA 2VNCA 4KRTA 3PZNA 4KGLA 4ZXLA 1VEOA 2F61A 2YL8A 1XH1A 3AIRA 2NW0A 3L4VA 4AD0A 2J62A 5A8OA 1V3MA 2D1ZA 5A6SA 1GORA 4NRSA 4C7DA 3ZJ8A 5LA2A 4M29A 5D9PA 1H2JA 1MQPA 1R86A 4CU8A 1XCWA 3SUWA 1VBRA 1UKPA 5A6BA 2VI0A 1J0HA 2V5CA 1PIGA 3QOKA 4Z2LA 1E40A 3VDAA 1JD7A 1OT2A 3VD5A 5ABHA 3OBAA 1B0IA 5AYIA 1ZB5A 4WKHA 3NSXA 1HJVA 1ZJAA 2W5FA 4UFKA 1JZ8A 2CBUA 3A47A 4KRUA 1E70M 1BYDA 1WDSA 2Q8XA 5LA1A 1XV8A 3ARXA 1Q6DA 3IAQA 2EXOA 1DTUA 1HP5A 2XVKA 4EANA 1KGWA 2QMJA 1ISYA 1JGIA 3CUJA 4P7LA 1B3YA 7TAAA 4U5KA 1UD3A 3NIYA 2ZOXA 1VJZA 1TVPA 4B16A 1NM9A 2Y24A 4TVCA 4LYPA 1HXJA 1V6WA 1KFWA 4PYSA 1DWJM 3TA9A 1OD0A 4U5IA 2D24A 1VENA 1J0ZA 3SCQA 1UWQA 4JFVA 2VCBA 2JEQA 1MQQA 2J7CA 3WF4A 3VNYA 1UWUA 5D4YA 3U5YA 1UH2A 4J3TA 1DWIM 4IUGA 4UFJA 3RPMA 1U30A 1UZ1A 1TR1A 1TG7A 3THDA 2BHYA 1GOKA 3VGHA 5IDIA 1DHKA 4S3KA 3ALGA 2BVYA 6CGTA 1K9FA 1XD1A 4A3HA 2G8ZA 1HJQA 2V3GA 1E1EA 2DT2A 2QPUA 3VVGA 1UG6A 1UKOA 3NSNA 4H04A 3WQ6A 3WQWA 1NP2A 2XFFA 2WYSA 3CZEA 4W87A 1C92A 3FAXA 1Y7VA 3DC0A 1UR4A 3AMDA 3OLGA 1JFXA 1GOOA 5HPOA 1EHAA 3N04A 3F5JA 2WCAA 4MDPA 1CXEA 1TMQA 5BRQA 4V27A 2GJRA 5I6SA 4C7FA 3WD2A 4J7RA 1FHDA 4X9YA 1EXPA 3G6LA 3CPUA 5I77A 1UR0A 3NUKA 2DSWA 1KR0A 3KE0A 1HKIA 5EB8A 4F8XA 1VF8A 2WWCA 3ZR6A 1KGUA 3IJ9A 3ZSTA 2YL5A 3ZJ6A 1UR8A 4Q22A 1U33A 4AMCA 4UOZA 1V6UA 3WH7A 5BROA 4D1JA 3GM8A 4W5ZA 2EEXA 1M53A 2J8FA 3CUGA 4XX6A 4D6HA 1OCQA 3AMLA 1MQRA 2W91A 4AC1X 1O6IA 5BXTA 1KGXA 3RILA 1BAGA 3ARPA 1UH4A 1UQYA 4CN1A 4DM1A 1W9VA 2ZXAA 1W2VA 5ECUA 3GBEA 4HZ6A 1XC6A 2DH2A 5CGMA 5BXRA 4XUYA 2JALA 3UG5A 4OKDA 3ARRA 1EA9C 4YHEA 3AQUA 5KEZA 5A6LA 5CGTA 5F7UA 3AMCA 1QW8A 1GVIA 1G01A 5E9AA 2CKRA 4JKMA 5GNYA 3AZTA 2JF7A 5CXPA 5CPSA 2DGAA 2BNJA 3E1F1 5CSUA 4N42A 4W88A 2VUYA 3AZRA 1C7SA 3BSHA 3WDQA 4OIFA 1E73M 4AZCB 3MU7A 1FFRA 4UQEA 3TTSA 2CESA 1V3IA 3VNZA 1KXVA 1ISZA 2PWDA 1EQCA 3PZGA 1UKQA 1CXIA 2V3DA 2PI6A 3M07A 4K68A 2OWXA 1E3XA 3MMUA 4UFIA 2A3BA 1W2PA 2CIPA 3ZO9A 2A3AA 1C7TA 5GPRA 2PF0A 2YDQA 4FF5A 3T2OA 1M01A 1E1FA 2CBVA 3UG4A 1GPFA 3ARSA 3MUZ1 3N17A 3U7VA 2Y2WA 1HVQA 4HP5A 1ISWA 1X6LA 2WVVB 2WNWA 2G41A 1TFVA 2VX4A 3TTOA 1ZBWA 1KB3A 3WH6A 1EGZA 4M82A 4GINA 4GI9A 3IAPA 3UCQA 5AYBA 5IFPA 1M04A 3AMGA 2XYLA 4MNKA 1JZ5A 4U3AA 4MDOA 2E8ZA 1W1PA 4Z2KA 4AD1A 5FOOA 2V38A 1FHLA 3OGSA 2WK2A 1WPCA 1K9EA 5LA0A 1JZ7A 1QHZA 1A3HA 1L8NA 1F4HA 3RO8A 1GONA 3MANA 1I75A 4AZCA 4JKKA 2VZVA 2X0HA 2E9BA 3N9KA 1J01A 2HVMA 3EYPA 1KXQA 1ODZA 1E5JA 4GXPA 4BCEA 1E0VA 1BVZA 3WH5A 1OBAA 1NARA 3OZOA 5CJ5A 2E9MA 3II1A 4ZXOA 3SIMA 4NZCA 4HOZA 2VL4A 1LL4A 1K9TA 4ZE5A 2WVVA 4CUCA 2EPKX 1B3XA 4JL2A 1BG4A 1E43A 3VD4A 2XVNA 2OSWA 1ITXA 1KBBA 2XFYA 3W81A 5A8MA 4Z2IA 3WNKA 4TTGA 4U2ZA 1G94A 4QAWA 1J0IA 1W3JA 1UWSA 2WC4A 2EBNA 1XD0A 4H8UA 2O9RA 3VMOA 3AIQA 3VOCA 3JUGA 3WUBA 1US3A 1BQCA 1IV8A 4H8HA 4A3YA 1QVBA 2WMGA 1L0PA 2W4XA 2J74A 4UQCA 1OWQA 3W6MA 3CZJA 1JZ6A 4ACYA 1DEDA 1WZAA 1OT1A 3VINA 3PTKA 2GJPA 3LPPA 1B3VA 3VO0A 3W4RA 2WC7A 1TCMA 1WZKA 2VX6A 1RH9A 5JBDA 3RJXA 3OIHA 1V3HA 4CCDA 3ARZA 3SUTA 4TUFA 4OBSA 3UR8A 4OOZA 3WUFA 1OM0A 3EMCA 1UD6A 1PZ2A 3SCPA 4JFTA 2ZX7A 4ZEPA 1CGWA 4D6GA 1CTNA 2VT0A 4YN5A 4PMVA 3CO4A 3MV01 3GNPA 2VVNA 1C8QA 1CBGA 2J78A 1CGVA 2FH6A 5E0FA 3I3DA 4D1IA 1NQ6A 3AS0A 1Z32X 4HU8A 1V3JA 1A47A 1H49A 1WZLA 3HN3A 3D3AA 1H1NA 5DT7A 4C7GA 2QPSA 3BSGA 1JF6A 3VX0A 4F66A 1DWAM 4GZEA 2ZUVA 1LWHA 3OB8A 5E09A 5A2BA 1M7XA 2V3EA 4AIEA 1W3KA 3WF2A 4D6EA 2J7HA 4EKJA 1CGTA 2ZICA 1EOMA 4ACZB 2WBKA 3IANA 3VIHA 4MTVA 1TUXA 1ESWA 4UQ9A 2ZX9A 3CHEA 4AIOA 3BGAA 3BLKA 7CGTA 3W27A 2AOSA 2WCSA 4GIAA 1E9LA 4QDMA 2RTSA 3WQVA 1LL6A 2J8GA 1EOKA 1O7AA 1ZBCA 4AD2A 1H09A 1Q6GA 4L4OA 1ISVA 4M8UA 4PMRA 2D0HA 3MKKA 3ARYA 3VIJA 4Y7EA 4AXNA 3CTTA 4AD4A 4E4PA 3VILA 1XRVA 2VX7A 1DWGM 4E8DA 1CXKA 5CQ1A 3CUFA 4IISA 1E71M 3KL0A 1NP0A 2Y8KA 4PTVA 4CD6A 1OIMA 2DT3A 1G0CA 4UFMA 3W26A 3SCRA 9CGTA 1H4PA 2QF8A 2X2YA 1E15A 1ISXA 2DSZA 1JZ2A 2IUZA 3WL0A 1OB0A 2E8YA 1GOQA 1QNOA 3CIVA 5BWFA 4X0VA 4ACZA 5ABEA 2WANA 1PEZA 2W63A 1QW9A 2XJ7A 1QBAA 3IK2A 3PTMA 4XB3A 3O2LA 1UKTA 1AIWA 3KZSA 2ZUTA 3N1AA 3S2CA 1UWIA 2Y4SA 1UD5A 1C3FA 2BVDA 4PUEA 1E0XA 3N12A 4CCCA 4P8VA 1XHGA 4DUWA 4HOXA 1GNXA 4LQ1A 4M81A 1E56A 1B3WA 4KH2A 3GXDA 3AZSA 3DHPA 1B9ZA 4KGJA 5A8QA 2PBOA 4GZJA 3IJ7A 4AZHA 3T0DA 1BTCA 2PBGA 4WIWA 4EE9A 2DSKA 3SEPA 2YDSA 1V6YA 2OSXA 2XIIA 1W9BM 3CHFA 2WMIB 2YA2A 2WWDA 4JCLA 1H3GA 4FLRA 3VGBA 2WSPA 1VJSA 4FMVA 3B9EA 1MW1A 2VRKA 3L2MA 2PWGA 1W3LA 4UQBA 3WDPP 1JI1A 3L4WA 3AS2A 3VKKA 2WW5A 5A6KA 4QFUA 5JBFA 1R7AA 3WBEA 1PAMA 4P7RA 1GOWA 1KCLA 4ATWA 1R87A 2PWEA 2VQUA 5AC5A 2Y5EA 2WKLA 1B2YA 4Z2HA 1BVNP 1NOWA 1TE1A 3N15A 1V3LA 1E6PA 2VZSA 1J12A 3PBGA 4HMDA 2ZX6A 3WENA 1BGAA 4HA4A 2XTKA 1HJSA 5D9NA 3K8MA 1WCGA 4W7UA 2X09A 4URIA 5DO8A 3WD3A 2XSAA 4J3SA 3VM7A 1LQ0A 2GSJA 2BHZA 1CLVA 4CKQA 3TTQA 2X05A 2OLHA 4MJ4A 2MANA 4M24A 4MNLA 2WMIA 4MB3A 3A4AA 3DYMA 2JFEX 3W29A 2WKGA 5CLTA 1I1XA 2BY3A 3U57A 2O92A 1VBUA 2CHNA 3AICA 3F5LA 2YKKA 3RDKA 3AIBA 5HXMA 2BXYA 1EDQA 2OYKA 4J3XA 5I2UA 2JF6A 4DUVA 2WVTA 5HOSA 2CXGA 1CWYA 1PPIA 2FDMA 1UYQA 2DH3A 1W32A 3BXWA 1G1YA 3W37A 1WZMA 3AXHA 5CPQA 3GXFA 1C8YA 2EPOA 2XM1A 5HNNA 1CXFA 3B8SA 4UTFA 4NF7A 5GQBA 1CXLA 4TX6A 1LL7A 1MVYA 2YJQA 6A3HA 2XVLA 1E5NA 3W38A 3AHXA 4BF7A 4CU6A 2WM0A 2BV9A 3WDJA 2VOTA 3O6AA 4W89A 3NCOA 3ZR5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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