3WD4A

Serratia marcescens chitinase b complexed with azide inhibitor and quinoline compound
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 165
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd4A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd4A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd4A01
1J0YA 2W67A 2W61A 1GCYA 1MXDA 3N04A 4BQ2A 4E8DA 3AJ7A 4ZFMA 4BCEA 4L4OA 2WLYA 2D23A 4M80A 2XWEA 4W93A 1GOQA 2ZXDA 5TD4A 3PZNA 4OKDA 2CBIA 4TTUA 1E5NA 5CXPA 1V3IA 1LWHA 1NWTA 4RL3A 3VGEA 5CQ1A 1GOWA 1TA3A 2D20A 1RPKA 1GOOA 2AAAA 1JAEA 2E8YA 4U31A 1JZ7A 5E70A 3FW6A 1HJWA 1VFMA 2XVNA 3VIIA 2VX6A 1JNDA 3CZEA 3QHMA 4B15A 3VM5A 4AZBA 5ABHA 4TTGA 1CXEA 3MUIA 3FY1A 4FK9A 3NDZA 3BAYA 5LA0A 5HPCA 1EA9C 3MMUA 1BYBA 3ARYA 5JIWA 3O9NA 4X0NA 4CU6A 3K8LA 2XVGA 4QCEA 1NOWA 4AIEA 2ZIDA 3CIVA 3G6MA 1E3XA 1E15A 5CLTA 2WM0A 4OUEA 1I1WA 5E09A 4ACZA 1HL9A 1LL6A 1VFOA 3DYOA 1NWRA 4WK9A 1W9UA 2WC7A 3T2OA 3WNMA 5C8BB 1QNQA 3AYSA 3WQVA 1EHAA 2GJRA 2QPSA 1ITXA 1EO7A 3DYPA 4B9YA 1FHLA 4W89A 3A4AA 4QLLA 3BGAA 3O2LA 3VX1A 1ITCA 1PAMA 2VNCA 2XJ7A 3CPUA 1FH9A 5E6YA 4XX6A 4AMCA 4CD8A 1PZ3A 3WNLA 1E9LA 2WZIA 4P7OA 2RGMA 3NUKA 4GQQA 4B9ZA 4Z2GA 1VENA 4W8AA 1QNRA 1QBBA 1QOXA 2PBGA 3IJ7A 2XG9A 4AD2A 1I1XA 2O9RA 4S3KA 3N18A 1HN1A 3FXYA 3F4VA 3WN6A 4IPLA 1Z32X 1W3KA 4TXEA 1KFWA 1MW1A 5ABEA 1WZLA 3ZOAA 1V03A 1AQMA 1QPKA 4PSPA 4URIA 5A6BA 2VC9A 1QI5A 5CGTA 2XPKA 2J7DA 1WO2A 2WC4A 2V3EA 4YPJA 1UYQA 4CVUA 5BRPA 3FNDA 4JKKA 2WANA 3T2PA 1EDQA 3PTMA 4HOWA 2J79A 1JZ5A 2GDUA 1UKTA 1IZKA 2WBGA 3VMOA 2JIWA 1R7OA 1JFXA 3MMWA 1SR0A 4CKQA 3WH5A 1J10A 1W9BM 5M5DA 3E1F1 1BFNA 3SCQA 3VDAA 3CHEA 2DQXA 4MDPA 3WFZA 2J77A 4J3TA 4DUVA 3OZOA 1PEZA 2CHOA 3ZO9A 4W5UA 3W38A 5FL1A 2XM2A 3OBAA 1UD2A 4NSBA 1XV8A 5BXSA 3UR8A 3M6DA 3AMGA 2W92A 1K9TA 2A3EA 1XCWA 4D6CA 3B8SA 4PCTA 1MXGA 7TAAA 1VBUA 4UQ9A 4MAZA 2E9MA 1JI1A 1AQHA 1OIMA 1HKKA 2WMHA 4OZOA 2WMKA 4ML4A 3ZJ7A 2WHKA 5C70A 5D9NA 3W37A 1CZ1A 4UZUA 2V38A 1EOKA 2WCGA 4JKLA 4P7LA 1E6QM 2D22A 1UWTA 2OSXA 2YA1A 3F5KA 3SIMA 5BXPA 3DYMA 1MW3A 3WEOA 3WDIA 1XSIA 4JHOA 1ISYA 2VX5A 4W84A 1LQ0A 3AOFA 1V0NA 4CCDA 1E72M 1QBAA 8A3HA 2QPUA 2QV4A 2XYLA 2ZUSA 4H2CA 4OBRA 3WBEA 4N0RA 1QI3A 1E6RA 4CD4A 1H4PA 1JFHA 2PB1A 5I77A 4Z2HA 2WVVA 1ESWA 1VEPA 4HZ6A 4W7VA 2XTKA 1AQ0A 1Q6EA 4B3LA 1C7SA 1K9DA 2NT1A 4UQCA 3W29A 5IFPA 1MFUA 5ABGA 5HPOA 1KXHA 2J7GA 5I0DA 1W9PA 1H3GA 3UETA 1V0KA 5D4YA 3K8KA 5IFTA 4C7DA 2NSXA 3N17A 2CBVA 1I75A 2WYSA 1U33A 1KCKA 1DWHM 1H0IA 3SUUA 1EQPA 2VR4A 1CDGA 1GQJA 2EPNA 4D6HA 1TUXA 3BSGA 2EXOA 2VJXA 4UFIA 2AOSA 4JIEA 4P7QA 4UFKA 1WP6A 1KCLA 1UUQA 4J3SA 4PBGA 5E6ZA 4RE4A 3ZMRA 2WMIA 1CLXA 1MWOA 1HKMA 2DSKA 4PSRA 1JF6A 1KQYA 3LPFA 1LLOA 2E0PA 4TX6A 2JFEX 3F5LA 2XFYA 1R8LA 4JKMA 1E4LA 4GI9A 4QDMA 1HJVA 1DWJM 2WCAA 3VO0A 3OLGA 2DPEA 3A4XA 4AEEA 3WKZA 1XH0A 1DWIM 1UD5A 1DWAM 1NOUA 4OOZA 2ESCA 4AISA 5D8ZA 2A3HA 3MS8A 4A3HA 1BHGA 2CIPA 1ZJAA 2V3GA 1UWUA 1E56A 3RPMA 3GTNA 3S2CA 2X0YA 1KGWA 3SURA 4AZCB 3OA5A 3ARRA 4GKLA 1UR8A 3RJYA 3NDYA 1QW9A 3WDJA 2XHYA 3L4ZA 4LPCA 1WPCA 3VIHA 4W85A 3K8MA 4RE2A 1D3CA 3N1AA 1F4AA 4H7VA 4TUFA 1HJUA 3BMWA 5HXMA 1R86A 4HP5A 4GQRA 1V0LA 2JIEA 3D5HA 1H09A 5HDRA 3CZGA 1E4IA 3QOKA 3WD0A 2J7BA 2ZXBA 5BROA 3WBAA 4KGLA 2J47A 2WBKA 2Y5EA 4PCSA 3LPPA 2ZX6A 1C7TA 1LJYA 2QHAA 2JE8A 2XVLA 5HOSA 3W27A 3W81A 1X6NA 3AZTA 4KMQA 1J01A 2YDQA 3WF3A 5E0CA 1W3JA 2IXVA 2WVTA 5JBDA 2YBUA 2G3JA 3OLEA 3KL3A 3B9EA 2C7FA 3RILA 1XC6A 3IANA 5CZKA 4ZE4A 4W87A 3HU7A 1HVQA 1Q6GA 3B9DA 2VL4A 1BF2A 1JF5A 2PWEA 3TTSA 2QMJA 4A3YA 4HMCA 4H8UA 3VGHA 4M81A 3ARUA 5D9MA 2J8GA 4B3KA 2C8NA 2DIEA 1WKYA 4PUEA 4C7FA 4KGJA 4DWSB 3CHCA 1E0XA 3WDQA 1RD6A 2PWFA 4BQ5A 1GQIA 2MANA 1UKOA 1J11A 1V02A 1JYNA 1JZ6A 1XSKA 2CHNA 1B30A 5C71A 3AMCA 2CBUA 3OGSA 2Y2WA 1DTUA 4MNMA 1E3ZA 3W82A 2GDVA 3TTOA 1HJQA 2X2YA 2XIIA 2PWHA 5AC4A 3AHZA 4EAMA 1OBAA 2D0FA 2Y24A 1G1YA 3RIKA 3VINA 4OBSA 1E43A 3WD1A 3OLIA 2WKGA 6CGTA 3WQ5A 4AZGA 1JZ4A 1EIBA 3NSNA 1UWIA 4PMVA 3ECQA 2VCCA 2VZUA 2D3LA 3AMDA 2DSWA 4PMYA 2VI0A 3CUHA 4Z2LA 3N9KA 4HMEA 2XM1A 1CTNA 3L4VA 2D1ZA 5DO8A 3I3EA 1E6ZA 3WUEA 1B31A 5I3DA 3AXIA 5M17A 2FHCA 2J62A 3APGA 2VQTA 1GVIA 4ZEPA 3VIKA 4J27A 1KR0A 3ZIZA 4D1JA 5LA2A 3WIJA 4MADA 1W9DM 2IUZA 2YIHA 3GYCA 3OIHA 1C91A 1D2KA 2PI6A 3WDHA 3BH4A 3EDDA 3GH4A 3MMDA 1HJSA 4LQ1A 3VD9A 1D7FA 1DP0A 4LX4A 2WLZA 5A2AA 1CNVA 1UWQA 1ODUA 1CECA 1B3VA 3BC9A 1KXTA 3LPGA 2PBOA 2DDXA 2XFRA 4DWSC 2EPOA 1BGGA 2WVSA 3AZRA 3L2MA 4ZXLA 1MYRA 4IPNB 4AIUA 4EKJA 5A3HA 1E4MM 3DHUA 1XH1A 1JZ3A 1W2VA 2DT3A 4D6DA 3ZT6A 4AZHA 1BG4A 4F66A 1OWQA 4QCFA 4UOZA 1IV8A 3N13A 4MB5A 2C0HA 4PRWA 3KEHA 2PC8A 2G3IA 3JUGA 1GOIA 1CXHA 4UR9A 3QGVA 5CJ5A 3T2QA 4J28A 1L8NA 4HA1A 1XCXA 2OYLA 3VGGA 1LL4A 1G5AA 1QVBA 3EMQA 4HOXA 4ATWA 3W6MA 1B9ZA 4K68A 4PMUA 3ARWA 3W0KA 3HN3A 1GONA 1SMAA 1E55A 1FH8A 5BRQA 3WMSA 1OD0A 2WKLA 1OSEA 2WC3A 1W9XA 1TCMA 4BQ3A 2YDSA 3BLKA 3VGBA 3RDKA 5AYBA 1WDRA 4AC1X 3WH7A 4GPNA 1E6XM 1OB0A 1DEDA 4CU7A 3ARTA 3EMZA 5A6KA 3OG2A 3EDJA 2RGLA 1PIGA 4TOQA 3CLWA 2XSAA 4W7UA 2FHBA 4MJ4A 1HX0A 1E6PA 1K9FA 4D6JA 4WIWA 4J7RA 1EGZA 1GNXA 2WHMA 4CN6A 1QHPA 1H41A 1XRVA 2W91A 4AD5A 2D0HA 1C92A 5A2CA 5GPRA 5BWFA 3RJXA 4U5KA 4CCEA 4W5ZA 1UQZA 4YN5A 3ZR6A 5JBEA 5GQBA 3ZJKA 4UFHA 3GDBA 3O6AA 5IHRA 1XSJA 5I5RA 2YJQA 4GZIA 1ISVA 4AZCA 4Q22A 4W8BA 3CGTA 5E0FA 3IJ8A 1PZ2A 3AS2A 3QR3A 1W9VA 3PZOA 1UG6A 1MFVA 1UH2A 4P7NA 3WUGA 2BVDA 5FKYA 5CLWA 2WXDM 4Q7NA 3ZJ6A 4AZIA 1E0WA 3U5YA 1VB9A 3N15A 3T09A 2UY4A 5A1AA 1LWJA 3WD2A 4AZ6A 1O7AA 3VDCA 4PMRA 4D6IA 2VVSA 5A6JA 1WZKA 5CSUA 5A2BA 3VGDA 1UKPA 4GINA 2J78A 1JDAA 1UH4A 2V5CA 4P7RA 3VD5A 3NSMA 2EO7A 3I3DA 1PX3A 4V2XA 2YL9A 3VIPA 2JALA 4XZWA 3UCQA 4BS0A 4F9DA 3KL0A 4BA0A 1KWGA 1YHTA 3WQWA 3AHYA 3KZSA 1WCGA 5BXRA 4Z2JA 2YA2A 4MNLA 3U7VA 4GI6A 1UH3A 5DFAA 1KR1A 2ZE0A 3W26A 1HIZA 2WCSA 1CXKA 1W1TA 1JZ2A 4B16A 3MV11 1IT0A 4LYPA 4MAVA 1CWYA 2FDMA 2DSUA 2YDRA 4EANA 1E73M 4GO9A 4HPGA 2A3CA 1JIBA 2GJPA 2WSKA 5CPSA 2VZOA 3VILA 5GNZA 1CGYA 2WWDA 3L4XA 2V3FA 2GJXB 2DT1A 1FP9A 1PX8A 1C3FA 1E1FA 3AS1A 1VF8A 1VFUA 1A3HA 4MB4A 3AS0A 4DWSA 3EDKA 1GOKA 3LPOA 1P6WA 2D0GA 4HZ7A 1FA2A 3VD3A 2BHZA 1XHGA 1XD0A 1NP2A 1ISWA 3RMEA 1HT6A 1VBRA 5A8PA 1B1YA 4ATDA 1UQYA 1KXVA 1XYFA 5I23A 4YHGA 4TVDA 2WPGA 2OYKA 4P8VA 3DC0A 1TR1A 3CHFA 3THCA 4PMQA 5A94A 3HMCA 1V3HA 4YHEA 2VVNA 3K46A 1E70M 3AROA 2DH2A 3BAJA 1L0PA 3CZ8A 3VIMA 1GJWA 2OLHA 1HXJA 4CD6A 4P8WA 4JFVA 4LXFA 3AI0A 1HL8A 1BYCA 3U7BA 3CTTA 2DGAA 2FH6A 1HNYA 3QHOA 3AQUA 4JL2A 1TA3B 3WF2A 4OOUA 2WHJA 3TA9A 4HU0A 1QW8A 1UD8A 4UNIA 1HP4A 1OM0A 3EDEA 1GW1A 1GOMA 4JCLA 4J3VA 1UKSA 4M56A 3WF0A 3OLDA 5AY7A 4UQDA 2W4XA 4WKAA 3BAIA 3WL0A 2BXZA 4E8CA 2J7HA 1OIFA 2V3DA 1V3JA 4KRTA 4NZCA 5IDIA 4F8XA 3RCNA 5DEZA 1ZU8A 2J74A 2ZWYA 2Z1KA 2OSWA 1W32A 1ODZA 4GZEA 3L4UA 4ZXOA 3II1A 1NOFA 3AZSA 4W86A 3U5UA 4ACZB 4UQAA 3OB8A 1CGWA 2VQUA 1EDTA 3AIRA 3DHPA 3GH5A 4CCCA 1JD9A 3CMJA 4D6FA 5DMYA 8CGTA 4QAWA 5IHSA 3CZLA 5IXEA 5KEZA 1FH7A 4DM2A 2VZTA 4IM4A 1JYWA 3DECA 3FHQA 3WFLA 1H11A 4MDOA 2VT0A 2ZX8A 4U5IA 1ZJBA 3SCPA 5A8NA 4RE3A 1GORA 4CN1A 1LG1A 2G8ZA 3WNNA 2UWFA 2QLYA 1EDGA 4TVUA 3GXIA 2BHYA 1SYTA 3WENA 1JYVA 1V6YA 4QLJA 1V3LA 3A4WA 4U2YA 4PMZA 1CGTA 1JXJA 3ARSA 1GQLA 5ABFB 5FL0A 3AS3A 2DEPA 4PN2A 1CGXA 1VIWA 3GXMA 5AC5A 5JIPA 4HOZA 4PEEA 1DWFM 4Z2KA 7A3HA 3VTRA 3PN8A 4PUDA 1JG9A 2JEQA 1E0VA 5CSYA 4BF7A 1CYGA 4LGXA 3PZGA 3AYRA 1R87A 4QP0A 1WDSA 4HTYA 3BCDA 2OWXA 4E2OA 1B3YA 1OT1A 1B3ZA 3UR7A 5A6AA 2CXGA 2ZUNA 4PTWA 1OGBA 5A8OA 1J0KA 6TAAA 4CU8A 2WMGA 3GNOA 2VUYA 1CGUA 3PBGA 3UESA 5EFFA 2XFFA 3WEZA 3VX0A 4CD7A 4HMDA 1V6VA 2YL5A 3AICA 2J8FA 3PZMA 4JZ5A 1W3LA 2X0HA 1EXPA 1AVAA 4AD3A 2YA0A 1UA7A 3GNRA 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 4AZ5 A;  2BY0 A;  4J3X A;  1UD4 A;  3AHX A;  1V6X A;  1CXL A;  2W66 A;  2WVV B;  4MJ2 A;  4D1I A;  4KH2 A;  3SEP A;  2ZIC A;  3RM9 A;  2EBN A;  4H8H A;  3W25 A;  1VAH A;  1KQZ A;  1VJS A;  3WDP P;  4AEF A;  1RP8 A;  1TVN A;  4PMX A;  1GUV A;  4OJY A;  3SUW A;  1CEN A;  2ZX7 A;  4UFL A;  3L2L A;  4ZE5 A;  5CPT A;  2XIB A;  3GH7 A;  2ZOX A;  2VRQ A;  4U2Z A;  1A47 A;  1KB3 A;  1E40 A;  4UZS A;  1UR1 A;  3TTY A;  3VNY A;  3VDB A;  1QHZ A;  2HIS A;  4AZ7 A;  5CG0 A;  3VD7 A;  1CEO A;  3CO4 A;  1SFS A;  2CPU A;  3SUS A;  3CUF A;  3QOM A;  1QI0 A;  1NAR A;  3MSD A;  1PPI A;  2XGI A;  1R85 A;  3AIW A;  2ZUW A;  2WMI B;  1C90 A;  4E4P A;  1HKJ A;  3WDR A;  2AMG A;  1C93 A;  1BQC A;  2Y8K A;  2ZXA A;  4FLS A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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