3WD0A

Serratia marcescens chitinase b, tetragonal form
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
total genus 165
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd0A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd0A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd0A01
4XX6A 1VIWA 3SUVA 1W9BM 1LQ0A 3F4VA 1E71M 4M1RA 1ITCA 3WH7A 3EMZA 1WDPA 4AIOA 1V6VA 2CBJA 1B3YA 1MW0A 5A6AA 1EDGA 2DIJA 3DECA 5IDIA 2O9PA 3W4RA 1H0GA 4KH2A 4AXNA 1U33A 2UY4A 4LYQA 1MQRA 3WL0A 2XWEA 2W4XA 5ABEA 5IHSA 3I3BA 3AIVA 5I0DA 2CBIA 2PWEA 5CPQA 1X6NA 1B3XA 1VRXA 2BFGA 2BY1A 4GO9A 5GNXA 4DUXA 2X1IA 3K4AA 1B3VA 4JCMA 3ALFA 1LL4A 2EPNA 3T2QA 2GVYA 5D8ZA 5CSYA 4ZXOA 2VQTA 3DYPA 2D23A 2GK1A 3FAXA 5D4YA 4DM1A 1EXPA 4YPJA 2EJ1A 5CLWA 1FFQA 4PCTA 4GI6A 2DT1A 3WFZA 1GQLA 3VX1A 3CUGA 3TONA 3VILA 1MVYA 3GXMA 2XIIA 4QLJA 1XD0A 4PMZA 5I23A 3A6OA 3WDHA 3CZKA 4D6EA 3SCNA 4ZE4A 3HN3A 2W91A 3CTTA 3VPLA 5KEZA 2OSYA 3WDPP 1AQHA 9CGTA 4Y7EA 1NWSA 1GHRA 3L2MA 3OBAA 4HOZA 2WLZA 4D6CA 3SCSA 1HKIA 3AROA 2AMGA 2CERA 1H09A 4CCCA 4AZGA 3NJ3A 1B2YA 1XH2A 2V3GA 3IJ7A 3A4AA 1DWAM 1X1NA 1E73M 3VD9A 4UFLA 4QLKA 1JZ5A 5JBFA 1H11A 1V3HA 5CJ5A 2VI0A 3K46A 3DYMA 3A3HA 3UG5A 1KBKA 2VX5A 2XVKA 1QNPA 2EO7A 5I2UA 3TTOA 2QV4A 2BV9A 3ALGA 4AD5A 3VO0A 1LWJA 5KZ6A 1TA3A 4P8UA 1BTCA 5EB8A 1HKMA 4J28A 1EH9A 1V6XA 2ZUMA 2D20A 1CGWA 1V03A 1HP5A 3AXXA 2VNCA 3DHPA 4LYPA 1Y7VA 3W27A 3EMCA 3WF2A 2WWDA 2YA0A 4D71A 3A47A 2O9OA 1UKOA 2VR4A 1SYTA 3GH4A 1B3ZA 1TCMA 5E6YA 2WCGA 2BXZA 3RJXA 3WF1A 4WSKA 1FH7A 2WBGA 1I1WA 4OOUA 2J8FA 3WNKA 1GUVA 3WL1A 1KWGA 4AY1A 1H1NA 4XV0A 1NP2A 1W3LA 5DT7A 2WKLA 5IXEA 1J0IA 3K8LA 3VIMA 4D6GA 3MMUA 4CUCA 2QMKA 3SUWA 3SCUA 1PX8A 3W81A 3TTSA 3N04A 3WBEA 1JDAA 4TVCA 4FMVA 4L4OA 5CGTA 1ITXA 1QHOA 3SCWA 4HMCA 3PZMA 4UFKA 4U2YA 3UG4A 2J77A 1MXGA 3ZSSA 1WO2A 3SCRA 2WLYA 5GQBA 1V3MA 1ODZA 3NYDA 2VCCA 2WW5A 4MNMA 4QAWA 3PTMA 4R27A 2YDRA 2VMFA 1MQQA 2FH6A 3K4DA 5A6BA 1UQZA 1NOUA 4NRRA 4UQBA 3EDJA 3NIYA 4BQ3A 3EDDA 1MW3A 1E6QM 2ZWZA 1G1YA 1ISWA 1W32A 2DPEA 4TX6A 3OA5A 3WN6A 3U7VA 3MANA 5M17A 4MB1A 3MMWA 4W7VA 4CU6A 2GDVA 4JL2A 1WZLA 1IZJA 3KL3A 1UA7A 2EPOA 2VURA 2X0HA 3VDBA 2WHKA 1PEZA 5AYIA 1JI1A 2VZUA 1W3KA 4F9JA 1UD4A 2PWDA 3OGVA 3WUEA 3WELA 4P7QA 2DGAA 1JAKA 4TUFA 3WUFA 1FH9A 3AXHA 1OIFA 4WJXA 3ZT7A 4WKAA 1JFXA 2VX4A 1E1FA 4JKLA 5A95A 3VNYA 1WKYA 2OWWA 4JKKA 4UQDA 1EHAA 1UD8A 2XWDA 3OG2A 5I77A 1BVZA 2WANA 1GOMA 8A3HA 5IFTA 3VGBA 3BAIA 1MFUA 5JIPA 2A3EA 2X09A 4HP5A 5M5DA 4M24A 1DHKA 1M04A 1E6RA 2IXVA 1JNEA 2D0HA 2Y8VA 3VIHA 3D5HA 3ZJ7A 1K9TA 3W38A 2GFTA 2J7EA 1XYZA 5FOOA 3FNDA 3IAQA 1C8YA 3U5UA 6CGTA 4PMRA 3K1DA 2CCRA 3L4XA 1J0HA 3N12A 3WNLA 3OZOA 3W26A 4CKQA 1KBBA 4M8UA 4JZ5A 2GJXB 3FN9A 3LMYA 2YBUA 2W67A 3WDIA 1UD2A 4AZ6A 2YL6A 1NP0A 2WMGA 5EFDA 4WIWA 1E70M 3AIBA 1D3CA 3T08A 5ABFB 2E8ZA 1BGAA 1FHDA 1CGTA 1H5VA 1JYXA 3M07A 2W66A 2VQUA 2FHFA 3RM4A 2VZOA 1AVAA 1BYBA 4H8HA 2YKKA 1J0YA 7A3HA 3NSXA 2X8RA 2C8NA 1I75A 2J75A 4MNJA 5D8WA 3SUSA 5HXMA 1JGIA 4GXPA 1U30A 5DO8A 1S46A 3VD4A 1B90A 3SCTA 4ZEPA 2D3NA 2E0PA 3ZJ6A 1E5JA 1ZB5A 1LWHA 1XSKA 4H7VA 2CETA 2WMKA 1W2VA 1A3HA 1MQPA 2DIEA 3MSGA 1QVBA 1QBAA 1E6XM 5CPSA 3PZ9A 3UEQA 1MWOA 2CHNA 3VX0A 3WNNA 4F79A 5DEZA 4X0NA 3N11A 3O9NA 2VR5A 5A2BA 2WCAA 4PTWA 1UD3A 1GQKA 1RD6A 1CGUA 2A3HA 2F2HA 2ZIDA 1W1VA 1EQPA 2Y5EA 4GQRA 2UY3A 3AIRA 1UWQA 1CXHA 4AZCB 2JEQA 1ISZA 3BSHA 3M6DA 3DC0A 5DT5A 3BMWA 2FH8A 3OLIA 5FIPA 1EQCA 1KFWA 4PMQA 1CPUA 4ACZA 3VMNA 4UZSA 4N42A 4C7DA 4H41A 5M3WA 3J7HA 3WF3A 1V0MA 5BXTA 4QP0A 1GOQA 1JL8A 4MJ2A 4PSPA 5A3HA 1J18A 3NSNA 1G9HA 2WBKA 3SIMA 1H0IA 1DWIM 2WWCA 2YOCA 3ARYA 4JAWA 1UH2A 4ATWA 4S3KA 2V5DA 1U2YA 3W0KA 1BYAA 1FFRA 1E6SM 1RH9A 5D9MA 2VT0A 3TP4A 1HJQA 2MANA 4XZWA 4XB3A 2DH3A 4HZ7A 4UZUA 1Q6FA 2WNWA 3WDQA 5FCZA 2XPKA 2V3FA 2VX6A 2PBGA 3VGFA 2G4FA 1JI2A 1VFUA 3VGEA 1JD7A 3WNMA 3U5YA 3II1A 2WHJA 2YBTA 2E4TA 2WPGA 3SCQA 2YL5A 1KB3A 4BQ4A 4AISA 3L2LA 4CVUA 1LLOA 2G3IA 3CPUA 1KGUA 4CD7A 3MMDA 2WZEA 1WZKA 3RDKA 3CUIA 2BY0A 3WH8A 3KL0A 4OIFA 3PHAA 1K6AA 1E6NA 3UERA 3W29A 2YIHA 1M01A 2E9BA 1WB0A 1GORA 5A6KA 3PZIA 4RE4A 2XYLA 2Y24A 5E70A 1R85A 4XZBA 4ATDA 2DSKA 2DDXA 4ZE5A 5TD4A 3CBWA 1O7AA 5BXSA 2Y4SA 4ATLA 1V02A 1GOWA 1QW8A 3RJYA 1J0JA 5I5RA 2YJQA 1FP9A 3AJ7A 4HA4A 4M80A 3GNRA 1PZ2A 3SCPA 3UETA 4DUVA 3AHZA 2PWHA 4GQQA 2WVVA 1GCYA 1HNYA 2Z1SA 2J7CA 2J7DA 2EQDA 4AZBA 1F4AA 2FDMA 1J0ZA 4W5ZA 4PUEA 6TAAA 4X0VA 3EYPA 1JYNA 1MW2A 1TG7A 2ZUSA 4U5KA 1C7SA 1JDDA 3AS3A 3FAWA 1EOMA 3VKKA 1UG6A 3AS1A 1FHLA 1I1XA 1JZ6A 3PTKA 3L4YA 2PBOA 3POHA 3WF4A 1UKTA 2VVSA 2GK1B 5BROA 4CN4A 2Z1KA 3LPPA 1XH0A 1CEOA 3EMQA 1UR8A 3F5JA 2XVNA 5A8NA 4MDOA 1FH8A 5CXPA 4BZYA 4GZIA 2WMIA 4AEEA 2XM2A 3AI0A 1KCKA 2ZUTA 4QFUA 3VIIA 5D9OA 2PB1A 5JBDA 1QI4A 3T2OA 2J47A 1E0WA 3WD3A 1PIFA 3ZJ8A 3SUTA 3WH5A 1LJYA 2WCSA 4M82A 3ARXA 1V6YA 2ZX7A 4W8AA 2OWXA 4UR9A 2JFEX 3T2PA 1AQMA 1NH6A 2DSUA 4GO8A 5LA1A 2AAAA 3OB8A 2XVLA 4PUDA 1K9EA 4PTVA 3BAJA 3GM8A 4PTXA 1ZS2A 2VL4A 3BCDA 1C8QA 1E4IA 5AC5A 4NF7A 1N82A 4W5UA 1QHPA 2PWGA 3NDYA 1CGVA 1CXKA 3RM8A 2PF0A 4P7NA 5A69A 4AD4A 1WZMA 2BHUA 5EBAA 1TVPA 4CCDA 4M56A 8CGTA 4F8XA 3S6TA 3LPOA 1V08A 1EDTA 4KWUA 1TA3B 5JUVA 3F5KA 4L4PA 5JIWA 1JG9A 1TMQA 3ZR6A 4WK9A 1E0XA 3WY1A 3RILA 5D9PA 1UR0A 4D6JA 2BXYA 3TTQA 2D49A 5DF0A 3EDKA 3A4WA 4CN6A 1WE5A 2V5CA 3EDEA 4ML4A 5IFPA 4MDPA 3WMSA 5FL1A 5BXPA 1WZAA 4E8DA 1EIBA 1XSJA 4BA0A 2EPKX 1K9FA 1XCWA 4WKFA 2W5FA 1XGZA 4W7UA 1CZ1A 3HMCA 2OSXA 2UY5A 4AWEA 4KGJA 1DEDA 2GUYA 3VGGA 4BF7A 1B30A 3WKZA 1R86A 1HKKA 4PTMA 4WKHA 1PX4A 5FD0A 3U57A 1ZU8A 1HT6A 3RCNA 4CD4A 3WNPA 4CD6A 2ZUVA 2J4GA 3GH5A 5I79A 2EXOA 1J12A 4CN1A 3T0DA 3CO4A 4C7GA 5M03A 3AHYA 4W8LA 3MKKA 2EPLX 3O2LA 2CIPA 1UWTA 4JIEA 5HOSA 3IANA 1HJUA 1ZBVA 2V38A 3SCVA 3L4VA 3L4WA 1KXHA 1NOWA 3CUJA 1WDSA 4KMQA 1W2PA 1PJ9A 4QLLA 3CLWA 1C91A 1GQJA 5DFAA 3VIGA 4HA3A 1AIWA 4NI3A 3POCA 5HNNA 4HU8A 2ZE0A 4W86A 4CD8A 3ZT6A 1ZBCA 5GNYA 1H41A 5E6ZA 1KR1A 2QPUA 3CZJA 5FKYA 4H2CA 2DT0A 4D1JA 3VIPA 3WIJA 4U3CA 3AMLA 4PMOA 2G3JA 4UFHA 4HPGA 3CGTA 4YHEA 4N0RA 1FP8A 3VGDA 1E4LA 2VTFA 3AYSA 1G5AA 3KL5A 3WSUA 4HTYA 1Z32X 4Z2IA 1GOIA 3KE0A 2VCBA 5FL0A 3ZMRA 5AC4A 4J3WA 1JD9A 3U7BA 7CGTA 4NSBA 1VB9A 2J62A 2NT1A 1OWQA 1DP0A 3BAYA 4JFUA 5BRQA 2UWFA 1UKPA 3NUKA 4B15A 2ZICA 4OUEA 1HL9A 1ZJAA 1D2KA 1JFHA 3K8KA 4FLSA 3IJ8A 3ARQA 1GPFA 3W37A 1E5NA 4PMVA 2WXDM 1MFVA 4PEEA 4BCEA 2DSWA 3VTRA 2XHYA 3PN8A 1W91A 1V02E 4GZJA 3UG3A 3CHEA 3CZ8A 1UHVA 2YL9A 1UR2A 1V6UA 5DMYA 1UYQA 4JKMA 1HJWA 2PWFA 1E15A 2OSWA 1W1YA 4IM4A 3CZGA 3RMEA 3AMCA 4Q22A 2WSKA 5F7UA 4MB4A 3AZSA 1ESWA 1HX0A 1V3JA 1JZ7A 2EPMX 4FLRA 1CLXA 1UWSA 3ARPA 2RGMA 1OGSA 4PMYA 1OINA 4AEFA 3WFLA 2JE8A 5HDRA 3WQ6A 4MAZA 4AW7A 2CEQA 3EDFA 2VUYA 1NOFA 1KQYA 5HPOA 1JXKA 1OT1A 1UKSA 3PZTA 1C92A 1LF1A 3BCFA 1R87A 3B9DA 1XD1A 3BMVA 4S3JA 1VJSA 3N17A 4J27A 2CNCA 1UZ1A 3MUY1 2WC3A 2VZTA 1R8LA 3LPGA 1V3KA 2WB5A 1TUXA 5CLTA 4UFJA 2O9RA 2X05A 3VIKA 3IK2A 5C70A 2VC9A 3SEPA 4KGLA 1Q6EA 2NT0A 1J01A 1V0LA 1R7AA 3UR8A 3L4UA 1BFNA 3VDCA 4E4PA 2BS9A 2D2OA 4AIUA 4RE2A 4P7RA 3CHFA 4UCFA 1HIZA 3VD3A 2XFYA 3W6MA 1Q4NX 3GZAA 4PCSA 4A3HA 3GBEA 1E43A 5HPCA 1KR0A 3N15A 3MUAA 3D3AA 1JNDA 3W53A 4EAMA 4W7WA 1EA9C 4DWSB 2J78A 4LQ1A 2D0GA 4C7FA 1B9ZA 1GVYA 1H3GA 1BAGA 1J10A 3QHMA 5CZKA 1M03A 1UOKA 3ARZA 3AMDA 5IHRA 2XGBA 3G6LA 4X9YA 1C93A 2E40A 3VIOA 4U2ZA 1BLIA 3VIFA 1JZ2A 1GHSA 2XSAA 4DWSC 1ISXA 5CQ1A 5GPRA 3RIKA 1HN1A 2B31A 4AD3A 5A8QA 3N18A 4ACZB 2Q8XA 2GJRA 3UR7A 1BHGA 3WUGA 1QI5A 1SMDA 4UTFA 2FHBA 1H49A 1RP8A 3T0BA 1QNQA 4JFSA 1MYRA 1BPLB 4CVWA 1XYFA 2XVGA 2ESCA 5C71A 2W92A 1ISYA 4CD5A 2VRJA 4EK7A 2E9MA 1DWJM 2VO5A 3K8MA 1CGXA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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