3WD1A

Serratia marcescens chitinase b complexed with syn-triazole inhibitor
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 162
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd1A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd1A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd1A01
5FL0A 3GZAA 4WK9A 1GQJA 1LL4A 1K6AA 3S6TA 3ZM8A 1ZU8A 1JZ7A 4ZFMA 3ECQA 2BNJA 3CHCA 1V6WA 2WYSA 1CGYA 1EO5A 1CZ1A 3CZGA 1VIWA 3K4DA 2OLHA 3CGTA 4ATWA 1UKSA 4IPLA 1PBGA 3PZGA 1ZJAA 1EDGA 4AZ7A 4EAMA 3RILA 3ARZA 1UQZA 1QPKA 1FA2A 1CDGA 1E56A 2EPKX 3VD4A 1GOWA 3VIHA 3VNYA 1HT6A 3WDHA 1WZMA 8CGTA 1PPIA 3EMZA 2G41A 1PX4A 2X0YA 3K4AA 1ITCA 1UYQA 1V6UA 2D3NA 3S2CA 2W4XA 2WCAA 4XB3A 3SCTA 1V6XA 4V27A 3W27A 1E1FA 1TUXA 4WSKA 2WW5A 4WIWA 3BAWA 2XVPA 4D1IA 4KH2A 3W25A 5JUVA 5E0CA 1CLXA 1E0XA 2PWHA 1HL8A 4IISA 1VFUA 4HMCA 3WF2A 4F8XA 2FDMA 4E4PA 1UKQA 3B9DA 2WZHA 4TVCA 4F9JA 3SCWA 2XWEA 3CPUA 5M17A 4S3JA 3VGDA 4L4OA 2E9BA 2PWFA 4E8DA 1NOUA 1US2A 4D6CA 2J25A 4NRSA 1V0KA 5JIPA 3M46A 3IANA 3VUPA 1JYNA 4W7UA 1BYCA 3EMCA 1H2JA 1R8LA 2VX5A 2YL6A 1YQ2A 2GDVA 2BXYA 4D6IA 3U57A 5I77A 1CGXA 3A6OA 2GVYA 4PTXA 2BY2A 4UFJA 4B15A 3VD9A 1LWJA 1VRXA 2PWDA 2VL4A 3OBAA 4GIAA 4UFMA 1FH9A 3VGGA 2WAGA 4EK7A 1QNOA 3CMGA 3IJ7A 1RP9A 4W8LA 1EO7A 1GQLA 1VFOA 4ATDA 3AXIA 2BHYA 1GPFA 1GOIA 4YPJA 3VMPA 2GFTA 3N18A 3ZQ9A 2JALA 4BF7A 1C91A 1K9FA 1WDQA 3CMJA 4Q7NA 3ZIZA 1JZ5A 6CGTA 1EOKA 3TONA 3BXWA 3AIEA 5EFDA 3T0BA 4GQRA 4X0NA 2NT0A 4DM1A 1ISWA 1ZBCA 4CU7A 3O6AA 3WUGA 3N11A 1UZ4A 5A8PA 4W7VA 1QI3A 4TTUA 4Y7EA 4XX6A 1MW3A 1E6PA 3T0DA 2QPUA 5LA1A 1W9UA 1KBBA 5I78A 3AIVA 3SCVA 1TMQA 3WBAA 1H5VA 1UR8A 4MB1A 3GH7A 1WDPA 4Z2GA 2FGLA 3F5JA 4JIEA 1CGUA 1HJVA 3W4RA 1V03A 2WC3A 3QOKA 3CZKA 2XM2A 1XH1A 4PMRA 4JKLA 4LYRA 3OLGA 1RP8A 3VGHA 2WXDM 4HMDA 3VDBA 3AOFA 2ZUTA 1NWSA 3WUEA 2CCRA 4OOZA 4AC1X 1QI0A 4M80A 1XC6A 1DWHM 4DUWA 3WNKA 2EJ1A 4D6GA 4TX8A 3OIHA 1KXHA 5A6SA 2XUCA 3RJXA 2J75A 1CLVA 3SUTA 3L4YA 3LMYA 2G3MA 1UR1A 1EIBA 5CQ1A 1GUVA 4M82A 3MUY1 3WEOA 2BVDA 1J0KA 2JEQA 5CXPA 4AEFA 4KWUA 1DWAM 1QNSA 4NRRA 1V6YA 1BYDA 1F4AA 6A3HA 1J9YA 2ZX8A 2RTSA 1GVYA 1E5NA 1JFXA 2V38A 4X0VA 2VRKA 1UR4A 1VAHA 4GPNA 4MNJA 2XVGA 4H8VA 1QNQA 4MAVA 1W3LA 1UD5A 3A47A 1MYRA 3O9NA 3WY1A 4DWSB 2O9TA 2UY2A 2YA0A 5C71A 1JZ6A 2E4TA 1VJSA 2XFRA 1DWIM 4U31A 4TVDA 3N9KA 3WQ4A 5M5DA 1AQMA 1D3CA 5C70A 1RPKA 3I3DA 2FGZA 2WMIA 3MMWA 3PTKA 3WNPA 1HKIA 3SIMA 3ZJKA 5JBFA 3CO4A 4XZBA 3IJ9A 1K9DA 3WF0A 1CXEA 3WUBA 1UD2A 3OG2A 2XTKA 4NI3A 1ECEA 1GOMA 1D7FA 3TTOA 1LLOA 1Q4NX 2F2HA 1ZL1A 4QCEA 2NW0A 3TTSA 3AICA 4ZE4A 2D20A 2VR4A 3B8SA 1OGSA 3CLWA 3WD3A 5BCAA 1LJYA 1VEPA 3RM9A 5A2CA 3K8LA 1JF6A 1HKJA 3NCOA 1Q6CA 2WC4A 3NSXA 1PIGA 4CN6A 3U7BA 1V3JA 3RPMA 5CLWA 2ZXQA 4OJYA 3CZJA 2YBTA 1JDAA 3POHA 1UWUA 2WVVA 1GJWA 2NSXA 5A8NA 2A3HA 2V5DA 2B31A 2VT0A 3GM8A 1B1YA 2J7BA 2WMJA 2YA1A 3GXFA 2YIHA 2DEPA 1XH0A 2CBIA 4UFHA 1E6XM 3AMGA 1EH9A 3VGEA 1U30A 3THCA 1C7TA 1B30A 3TOPA 2XVKA 2D24A 3SCNA 2VUYA 1E43A 3EMQA 5IXEA 1G94A 4AEEA 1IZJA 4C7DA 2WKLA 2W92A 3AMLA 3IAPA 3SURA 3QHMA 1NH6A 1HP5A 2WZIA 3T09A 2E40A 1H41A 2QMJA 4UOQA 3ZO9A 1CEOA 3FAWA 1W3HA 3CUJA 1QHZA 5HNNA 1CXKA 3AXHA 3AS3A 1JDDA 1ZS2A 2EBNA 1NOWA 3VDAA 2JF7A 3U5UA 4PMDA 3GH5A 4HMEA 2XWDA 1QHPA 2JIEA 4K68A 1GOKA 2TAAA 1UR9A 3BC9A 1M04A 3KZSA 3BAIA 1J18A 1HJXA 2X1IA 3N12A 4A4AA 1E55A 2CKRA 2ZIDA 5HPOA 5AC5A 4UZSA 4JL1A 3ZSTA 4PUDA 4KRUA 2VOTA 4RE4A 2WK2A 4ML4A 2WLZA 1B0IA 4QLLA 1UH3A 1KCLA 1DWJM 2D2OA 1JYWA 3WFZA 1JIBA 2YL9A 2J7GA 4WKAA 3AHTA 1NWUA 1KQYA 4HOWA 1NP2A 2WHJA 1V0MA 3WMBA 4AZCB 4URIA 1H09A 1BG9A 3OB8A 2ZICA 4TTGA 3WNNA 5E9AA 2DT2A 1E6NA 1XD1A 1VFMA 1C93A 4J3VA 1H3GA 1C8YA 2DT3A 3A4XA 5A69A 3WEZA 2VNCA 1A47A 4F79A 4LYQA 1CPUA 1FP8A 3EDFA 3VGFA 3VGBA 4D72A 1E4LA 3VMNA 4AXNA 4CD6A 2Y8VA 2PBOA 4GZEA 1W1TA 1VENA 4XZWA 2WKGA 3AS2A 3AYRA 3PZVA 5GPRA 3PZUA 1UKOA 4Z2JA 4AZ6A 2G3JA 5BRQA 7A3HA 2ZX7A 2BVTA 1E0WA 5JBDA 2O92A 1GQKA 3FHAA 2UWFA 1E3ZA 5GQBA 1KBKA 1TCMA 4PSPA 2GJXB 4QP0A 3A4WA 5FL1A 3JUGA 3CIVA 2VI0A 3MMUA 2WMGA 3II1A 3ALGA 3WENA 1CECA 1JAEA 2V5CA 2XHYA 2VQUA 2CBJA 3WD1A 4HPGA 3WUFA 1V08A 3N1AA 4CN4A 1EOMA 3B9EA 2WHMA 2YKKA 1QI4A 2OSWA 1BFNA 4D6JA 2PWEA 1ZJBA 2BFGA 1MVYA 1NP0A 4AD4A 1UKPA 4PMUA 4U2ZA 4FLOA 4PMOA 1JNEA 4UFLA 2E0PA 3AISA 3HN3A 4QLJA 1B3YA 1R87A 2V3EA 2X8RA 1VEOA 2PC8A 2GK1B 5GNXA 4W88A 1WNOA 5DT7A 3SCPA 3AHVA 4LXFA 4TX6A 4QCFA 3CUFA 1R86A 1QBBA 5C8BB 1PX3A 4J3XA 3FXYA 4OOUA 3ARVA 3WD2A 5I0DA 4UCFA 5ABHA 1UH2A 4PUEA 4AD5A 3VD7A 1HNYA 1J0YA 1AVAA 3CUIA 3VIGA 4CVWA 2J78A 1W2VA 1FH7A 2QMKA 1W91A 3SUWA 2W62A 3RCNA 1KGUA 1TG7A 1GCYA 1EGZA 1OWQA 1JYVA 4GXPA 2YBUA 3PZ9A 1OT2A 2X2YA 1GVIA 3ZT7A 1TA3A 2Y8KA 1CXLA 3QGVA 3D3AA 4KRTA 2EEXA 3PHAA 3VOCA 2F8QA 1OT1A 1W2PA 3CHFA 4B3KA 4IUGA 2W63A 1B3WA 1KR1A 1BQCA 2NT1A 2JEPA 3N17A 4WSJA 1V3LA 2YJQA 3CZ8A 4W87A 4V28A 3NYDA 2WANA 1CTNA 4ZXOA 2VMFA 3VD5A 2C0HA 4RL3A 4FLSA 1Y7VA 1SR0A 2XJ7A 4AD3A 5HBFA 2XSBA 3LPFA 5GNYA 1CWYA 5HOSA 1PAMA 1CYGA 4PMVA 3ZJ7A 3VIFA 5CLTA 4BCEA 5ABFB 1V02E 1GW1A 1WKYA 3DYOA 2BY3A 1PJ9A 4MB4A 1C90A 1HIZA 2ZUSA 4UZUA 1EDQA 1XH2A 4B9ZA 3ARXA 2HISA 5LA2A 1E3XA 5DT5A 1BG4A 2GSJA 4U33A 1E9LA 3PTQA 1SMDA 3CHDA 1J01A 4AIEA 4CVUA 5A8OA 4W7WA 3POCA 2VZUA 3AZRA 2ZX6A 5CGTA 2AOSA 1UHVA 1V02A 4DM2A 2J7DA 1PX8A 1UD4A 3RO8A 5E6YA 4HA4A 4MNLA 3CH9A 1G01A 3PZNA 4KGLA 4W86A 5BXTA 1EHAA 3MUAA 1E40A 3WBEA 4TXEA 3PZQA 1KGWA 1AQ0A 4JKMA 3GXMA 1XCWA 1XRVA 2J7CA 5GNZA 1W1YA 4AW7A 1X6LA 4Z2IA 4DWSD 1M01A 2VQTA 4ZEPA 3WSUA 1E4MM 2VVSA 2W67A 2XPKA 2E8ZA 3NJ3A 3UEQA 1EXPA 2J7FA 2QF8A 1XYFA 5I3DA 2DSUA 2E9LA 5D8WA 3SEPA 3ARQA 3D5HA 3WH7A 5LA0A 4ACZA 5CGMA 4HZ8A 1OIFA 1MFVA 4V2XA 4AWEA 3OGSA 3APGA 2WWCA 3T0AA 3EDJA 2XGIA 2Y2WA 4UR9A 1JGIA 2ZUNA 4JFVA 2BY0A 4AYSA 1ZBKA 2BS9A 3AMCA 1E6ZA 3IJ8A 3BLPX 4M81A 5EFFA 2BXZA 1JL8A 1GOOA 3AIUA 4J7RA 2Y24A 1HVXA 4D6EA 1HKMA 2CETA 1XSKA 2Q8XA 2OWWA 3W37A 2GJRA 3WF3A 3WELA 1WPCA 1TZ7A 2E3ZA 1UWQA 1ESWA 4D1JA 3OLDA 4GKLA 2YOCA 3WN6A 2YDRA 3WH6A 1JDCA 5I79A 4PMYA 3NSNA 4M1RA 2DQXA 3DYMA 1JF5A 4HPHA 2D22A 1U2YA 1WDRA 4HTYA 2WC7A 1AQHA 1XHGA 3MANA 4BQ4A 4QAWA 2VZOA 3BCDA 4UQCA 1L0PA 4DUXA 4AIUA 4DWSC 5KZ6A 3IAQA 3KEHA 4UQAA 3W29A 1UG6A 3BAJA 2CHNA 1UOKA 3BAKA 3I3BA 3U5YA 5I23A 1QVBA 1E6QM 3PZTA 4OUEA 3GTNA 3ARYA 4JKKA 3WFLA 3RM4A 5CPSA 4JL2A 3PZIA 1MXDA 1BSIA 1UA3A 3SUVA 3T2OA 3GNOA 3WDQA 4CU6A 3MV01 1B3VA 2EPLX 4D71A 2OYLA 2G3NA 3CHEA 4JFTA 1KXVA 2D0HA 4LYPA 1H49A 4EANA 2CKSA 4GINA 3GXIA 1UWIA 4PN2A 3MSGA 4PRWA 5M03A 4PEEA 4MNKA 3F5LA 1B9ZA 3MO4A 2GJPA 4A3YA 3UCQA 3I3EA 2BVYA 4MJ2A 1QOXA 1G1YA 2OSYA 4BZYA 3N04A 1UR0A 2PB1A 3KE0A 1VF8A 2OSXA 2YA2A 2ZUWA 4H41A 2WSPA 4D6HA 1UA7A 1DEDA 3ZT6A 2WPGA 1NQ6A 5DF0A 3UG3A 4CU8A 4EKJA 3VKKA 1IT0A 1KFWA 5EB8A 3W81A 1CXHA 1QI2A 4CN1A 5A6KA 3WQ6A 2V3GA 1UQYA 1HN1A 1V3MA 4PBGA 2E8YA 1HXJA 2X0HA 3TP4A 5IFTA 4AZGA 3AMDA 4R5EA 3WF4A 4M29A 3K8KA 1Z32X 3ARWA 1E73M 2ZXBA 2DSKA 1OBAA 2CBUA 3VIJA 1TA3B 4N0RA 4KGJA 3GNPA 3EDDA 3VMOA 4AD0A 4QLKA 1KB3A 3VU2A 2BY1A 2J8FA 1ITXA 3AHYA 4NF7A 2IXUA 2VVNA 1JZ2A 1H0IA 4YHGA 3CUHA 3W26A 3WNLA 3PTMA 1V3IA 4OIFA 1BVZA 4P7RA 5A2AA 2G3IA 5D9NA 3GDBA 2W61A 4HA3A 2CIPA 4PMQA 3UR7A 4U3AA 5D9OA 2XVLA 1JI1A 4Z2HA 3M7SA 4UQEA 1BF2A 2ZX9A 5JBEA 4P8XA 2XFYA 1UD6A 4JFUA 2ZE0A 3RMEA 5CZKA 5I24A 3BMVA 4AMCA 1G5AA 2OWCA 2DSVA 1OD0A 1EQPA 2WB5A 1VFFA 1VJZA 3TTYA 1Q6FA 4WKFA 1XD0A 5CPQA 3WDPP 2EPNA 2PF0A 5A94A 1JFHA 3WF1A 2UY4A 2V3FA 4HZ6A 4H8UA 2XFFA 4P7LA 3FY1A 3OZOA 4PCSA 4CD8A 3SCOA 3VIIA 2VR5A 2VCBA 3ARSA 1S46A 1U33A 3UETA 1AIWA 4J28A 5E0FA 3O2LA 1BGGA 3HJEA 4U5IA 4Z2KA 5D8ZA 1WDSA 1ED7A 1LG1A 3WD4A 1BPLB 2CXGA 1GJUA 2J8GA 4FMVA 1HKKA 2WHLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4GZJ A;  2D3L A;  1L8N A;  2PBG A;  2XSA A;  4UFI A;  3AIR A;  5I2U A;  4D6F A;  3L4V A;  3L4Z A;  4P8V A;  2ZOX A;  3FHQ A;  4MDP A;  1C7S A;  4LX4 A;  3THD A;  3ZMR A;  1SMA A;  3VIO A;  3MU7 A;  5ABG A;  3BGA A;  1WZK A;  2Y4S A;  3QR3 A;  1JG9 A;  1LQ0 A;  1NOF A;  3GH4 A;  2FH6 A;  2CPU A;  1SYT A;  2DH2 A;  2WZE A;  3VIN A;  3EDE A;  1OGB A;  1J0Z A;  1HJW A;  1QBA A;  2JE8 A;  4J27 A;  1XYZ A;  2DT0 A;  2WBG A;  3VX0 A;  1PZ3 A;  3WQ8 A;  3AXX A;  1BAG A;  5A6J A;  3VX1 A;  4NZC A;  1X6N A;  3L4U A;  5JIW A;  3PZO A;  4M8U A;  4Q22 A;  2VTF A;  4JZ5 A;  1US3 A;  4X9Y A;  1E4N A;  3DHU A;  3MS8 A;  5AYI A;  3SCS A;  3WKZ A;  5FIP A;  1WCG A;  1C3F A;  1FFQ A;  1GOQ A;  1CGV A;  3BMW A;  4MAZ A;  2PI6 A;  5FD0 A;  3G6M A;  1UZ1 A;  4WLC A;  3LPG A;  3T2Q A;  2WVU A;  4AIO A;  3EDK A;  5AYB A;  3FND A;  1XGZ A;  3UR8 A;  4CCE A;  2FHC A;  1W32 A;  1HJS A;  4GZI A;  4PYS A;  2EQD A;  1WAW A;  1OIN A;  4U5K A;  3VD3 A;  1E6S M;  1EA9 C;  1Q6G A;  4MAD A;  3RIK A;  2VC9 A;  1FP9 A;  1W9P A;  3TA9 A;  1HF6 A;  1JZ8 A;  2VCC A;  1CIU A;  3MUZ 1;  3NDY A;  2D49 A;  4KMQ A;  1JZ4 A;  4W8B A;  2CER A;  3U7V A;  2XGB A;  4FLR A;  3AFB A;  1BYA A;  2WHK A;  3ZJ8 A;  1W3K A;  4E8C A;  4UQD A;  3LPO A;  1DTU A;  3ARP A;  1OSE A;  1CXF A;  3TTQ A;  2ESC A;  2O9R A;  1DHK A;  2DPE A;  3FW6 A;  1UUQ A;  4H04 A;  4JCM A;  3E1F 1;  1GON A;  3J7H A;  1I1W A;  4CGT A;  2VRQ A;  2DSW A;  1V0L A;  1RH9 A;  1UWR A;  1C92 A;  2A3C A;  1C8Q A;  1E4I A;  4HOZ A;  2QLY A;  4CKQ A;  1QW9 A;  1W9V A;  1DWF M;  1D2K A;  1FHL A;  2CBV A;  2EPM X;  3IK2 A;  2WCS A;  1HL9 A;  1P6W A;  1W9B M;  3GBE A;  5A6A A;  1ODZ A;  4U3C A;  1M7X A;  1H11 A;  3SCR A;  4JHO A;  4AY1 A;  1V0N A;  2ZXA A;  1ODU A;  1M53 A;  1LF1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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