3WD2A

Serratia marcescens chitinase b complexed with azide inhibitor
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 165
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd2A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd2A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd2A01
1RH9A 1JD9A 2DSZA 4MNLA 2EEXA 1WZKA 3K46A 4J3SA 4J3WA 5CLWA 3WDPP 3WELA 4PUDA 1J9YA 1DWHM 4LXFA 2CBVA 3SUTA 2AMGA 2DH3A 2X2YA 3NDZA 3WH5A 1QNQA 4M56A 1HVXA 3FNDA 4TVCA 4GI6A 4M29A 2XIBA 5FD0A 3TTQA 4F9DA 2IUZA 1CXEA 3VX0A 3IANA 1E15A 2WBKA 1G94A 1C8XA 4WF7A 1H09A 4M8UA 4UZSA 2JIEA 3ALGA 5AY7A 4PMNA 1HKIA 1SMDA 3DYOA 1ISVA 4FLRA 2BHZA 2PC8A 1KB3A 1VEMA 1DHKA 1R8LA 1NWTA 2O9OA 4AD0A 3UR8A 2C7FA 2V38A 5DFAA 1VB9A 1WB0A 3LPGA 5CXPA 1UD8A 2QHAA 5I79A 1C93A 3VDCA 1O7AA 4BF7A 4B3KA 1CLXA 4E8CA 4AZ7A 2BVYA 3T2OA 2QMJA 1R86A 2XIIA 4AD3A 4TTUA 1WNOA 1BGGA 2WMGA 5CSYA 1C7SA 1LF1A 3WENA 4ZEPA 3FY1A 1Q6FA 4H2CA 2BXYA 1K9TA 4HZ8A 2BHUA 5C8BB 4RE3A 4U5IA 3SCUA 3FXYA 2VX5A 3NIYA 1J01A 3CZLA 1PIFA 3GM8A 3K8KA 1B3WA 2V5CA 3OZPA 2MANA 1FH9A 3IAQA 3VMNA 1UQYA 1NM9A 1Y7VA 3A4WA 3CZKA 5A2BA 1BYDA 5ABFA 1E4LA 2V3GA 1JDDA 2WMJA 1UKQA 5CGTA 4P8UA 5KEZA 3N13A 1GHRA 1VFMA 2Z1SA 5DO8A 3EMZA 1HIZA 1CYGA 2QV4A 1UH4A 3W6MA 4AY1A 1E71M 2PB1A 2YL9A 2D49A 3U5UA 1UD4A 3VIKA 4H8VA 4TVUA 3VM7A 4WJXA 1UWQA 4PMDA 3AS2A 1JXKA 4U5KA 2VQTA 2W61A 1PEZA 1W1PA 8A3HA 1BG9A 4YHEA 1PIGA 3AMCA 2ZE0A 1TUXA 3GZAA 1ESWA 3F5KA 2G3NA 2VZOA 4GO8A 1ZU8A 4UQEA 1KGUA 3VIGA 1CIUA 3K1DA 4JKKA 3AISA 3KL5A 1QBBA 4ZXOA 5C71A 1K9DA 1V3IA 2XGIA 4ZXLA 4AIUA 4BQ4A 1XD0A 4AXNA 2BV9A 2V3EA 3BCFA 3I3BA 1FHDA 4FLOA 4IM4A 1JZ6A 3M7SA 3CLWA 4W5ZA 1M53A 1VIWA 2E9MA 4MB4A 1UR4A 2WAGA 5A1AA 1E6ZA 3WMCA 2J78A 3GH7A 5JIPA 1JL8A 2WHJA 3W25A 2J8FA 1HN1A 2DT1A 4B9YA 2E0PA 4FF5A 1CXIA 4JFTA 1UKPA 2EO7A 2FHFA 1BLIA 1OSEA 4ML4A 4HP5A 4RE2A 5A6KA 3TTOA 3OLGA 1C92A 4HA3A 5DEZA 3AXXA 4J7RA 2WPGA 3RM9A 1B3ZA 1XH0A 2PI6A 3WEOA 3WQ5A 4MB5A 1MW0A 3BSGA 1HNYA 3VIOA 1VRXA 3ARPA 3GBEA 4A4AA 4ATWA 2WWDA 2X8RA 2ZUNA 2XVKA 4H41A 2YKKA 1E4IA 4AZHA 4RE4A 1V03A 2ZXQA 1CZ1A 1JNDA 4D6JA 3CZ8A 5I78A 2WMIB 3LPFA 1MWOA 2F2HA 1WDQA 2EPOA 1C8YA 2YLAA 1EO5A 3ZJKA 1NP0A 2X0YA 4JKMA 3VTRA 1HVQA 1UKSA 1BTCA 1EHAA 2DEPA 4TX8A 4HPGA 2XFFA 3WNLA 3U7VA 4DUVA 4CD8A 3BAWA 1M04A 1GUVA 1UUQA 1E40A 2HVMA 1HXJA 3POHA 1QNOA 1UA7A 2J77A 3TOPA 3UERA 1Q6DA 4WLCA 1LQ0A 4B16A 4QLLA 3WMBA 2YA2A 2YBUA 1MYRA 3VMPA 2JIWA 1NH6A 2W67A 3VNYA 1AQMA 4NI3A 2BFGA 4BA0A 3FHAA 3B9EA 1NWUA 1OD8A 5M03A 1KGXA 5HXMA 5ABHA 2FGLA 2YBTA 1UHVA 3PZQA 1GVIA 4IISA 1XSJA 3W4RA 1MXDA 2OSWA 2DIJA 3CZGA 4JCLA 2OYMA 3PTMA 2FH8A 5BROA 1EGZA 3SUSA 4KRTA 3ZJ8A 3AICA 1CPUA 3MUIA 3AJ7A 4PUEA 4YHGA 1V3LA 4EKJA 1J12A 1JD7A 3CMGA 3LMYA 3MV11 2PWDA 3VD5A 4EAMA 1UR9A 4C7DA 5HOSA 2QMKA 1M01A 1H1NA 1QBAA 4MAZA 3NCOA 1UYQA 4J3TA 1Q6GA 1WDPA 2CHNA 3AROA 3DHUA 2VVSA 3T2PA 5A6BA 2VX7A 5FKYA 2D0HA 4GQQA 3ARRA 1NOFA 1V3HA 1HJVA 1OM0A 3WF2A 3CHFA 1X6LA 3CGTA 4GKLA 4QLKA 3MANA 4K68A 1FOBA 4P7OA 3MSGA 3WY1A 3BAYA 3AMKA 1JFXA 4BQ5A 3D3AA 1CTNA 3ARSA 1JF5A 5BRPA 2ZICA 5ABGA 1CEOA 2J75A 4CN4A 3N18A 5A69A 1PPIA 3PHAA 1KXVA 5JBFA 1UA3A 1ZBCA 1B2YA 1Q4NX 1UD3A 2W63A 4GINA 5TD4A 1MW3A 1E73M 3WUEA 3T0BA 1DEDA 4PYSA 1UR0A 3ARTA 3WH9A 3WUGA 3U57A 4TUFA 1O6IA 1LWHA 1E72M 4CUCA 2CERA 2GJXA 2CXGA 2PWHA 4B3LA 4IPNB 2VJXA 3RM8A 3GXFA 4W7VA 3CBWA 1CGTA 1LG2A 1DTUA 2D0GA 3VIFA 3VD3A 3EMCA 3GH5A 2VUYA 1OD0A 3RIKA 3EDKA 3ZR6A 1VFUA 3S6TA 1OGBA 4Q22A 4FLQA 1DWJM 3MMWA 5F7UA 3W0KA 6CGTA 4PMZA 4WK9A 3T09A 3F5LA 2VL4A 1E3ZA 5EMYA 3PTKA 1J11A 3SCQA 1W1VA 2HISA 3VGHA 4ATLA 2VR4A 3U7BA 4F9JA 5CSUA 4PMXA 1JZ5A 3WIJA 3WH7A 2FGZA 2ZX8A 4UFKA 2EXOA 5IHSA 1QI3A 2JFEX 2VOTA 4YN5A 4D6CA 1KGWA 4MADA 4M1RA 2AOSA 2OWXA 1QI2A 3OG2A 1KWKA 1E3XA 3W53A 3BCDA 1KQZA 2X1IA 2DSVA 1V0NA 4LGXA 2E9LA 4YPJA 3MMDA 4D6FA 3EYPA 4ZE4A 3RM4A 4P8VA 5GNZA 3IJ9A 5HNNA 1GVYA 1CENA 3QHNA 1U30A 2OYKA 3RDKA 2E40A 8CGTA 2RGMA 5IFPA 4W89A 4JAWA 1GOOA 2BNJA 1J0YA 2CESA 2CETA 4HZ7A 1IT0A 2WC4A 1K9FA 4J3XA 2VC9A 4GIAA 1H2JA 1TA3B 3TTYA 3AIVA 1CNVA 1PZ2A 2D0FA 4LPCA 3AI0A 5KZ6A 1FP9A 5ABFB 1V0LA 2BY1A 5FL0A 3NUKA 3CUGA 4F79A 1G5AA 2GSJA 4OBRA 3UG4A 1XC6A 1J0ZA 5DT7A 4HOXA 1EQPA 2J7DA 1ZBWA 2PWGA 5FOOA 2EJ1A 4JFWA 4OJYA 3VIJA 2WCAA 1XSIA 1NARA 1B3XA 3AZSA 3BAKA 4PTMA 4D6EA 1JF6A 4V27A 5BWFA 7TAAA 4XV0A 5AC4A 1VBUA 1RP8A 1E6QM 4V2XA 2VCAA 3CZEA 2WK2A 5HPOA 4HMEA 1HX0A 4TOQA 3APGA 2YDRA 3VDBA 2NT1A 1US2A 3A6OA 4DUWA 2ZUWA 5JBDA 2OSXA 3AMDA 2WMFA 4AIOA 1GJUA 1B1YA 1A47A 1OB0A 5A6LA 2G4FA 4W85A 2A3AA 3HMCA 5D8WA 4AD1A 3MMUA 1EOMA 3WEZA 4UCFA 5LA0A 4LX4A 2X09A 3DYMA 3WD2A 4XUYA 1TZ7A 1AIWA 2F61A 1XRVA 1KXHA 1FH8A 2WNWA 3T0AA 5D9OA 4PSRA 4OKDA 3AHZA 4GPNA 4BCEA 1D3CA 2DSUA 4M81A 3N17A 4X0VA 3ZQ9A 1UWSA 2CIPA 2DGAA 3ARWA 4PCTA 3ZIZA 3RCNA 3PZNA 4GI9A 4MNKA 1E6SM 3A3HA 2DIEA 1QHPA 1V3JA 1BF2A 1KR1A 3B9AA 2XVGA 3NYDA 3WEMA 1ITCA 3AYRA 7CGTA 2XHYA 2WBGA 3WDIA 3WDHA 5DMYA 4P7LA 5CLTA 1KBBA 1MQPA 3BAXA 1C91A 2G8ZA 2WLZA 2XPKA 3NDYA 2FH6A 2RTSA 2ZOXA 4GI8A 1BFNA 1BAGA 1XSKA 3AIUA 2XYLA 2DQXA 2DT2A 1HJWA 4PTXA 1JZ8A 1TVPA 2YL5A 1E4MM 3VDHA 2W4XA 3AHTA 1HL9A 4UFMA 5LA1A 2EPLX 1WCGA 1RP9A 4MDOA 4P8XA 4E2OA 4JHOA 1ZJBA 2VCCA 3VVGA 1JXJA 2XFRA 4DM1A 3VIPA 5JH8A 2D1ZA 2YOCA 3JUGA 4XZWA 1JZ3A 1UWRA 5BRQA 3WD4A 4EK7A 4FK9A 1U33A 1W3LA 4AW7A 1CGWA 1EHNA 4D6HA 2WHLA 3HU7A 3RPMA 4KH2A 1WDRA 2YA0A 2CEQA 2Y8KA 4ATDA 4QLJA 1X1NA 5E6YA 4ACYA 3FHQA 3UCQA 3VINA 2XWEA 4HZ6A 3WQ8A 5IFTA 2XFYA 2A3HA 2Y4SA 1VBRA 1Z32X 4CU8A 1ED7A 3AIRA 1W9VA 1R7OA 1I1WA 4JL1A 4CCEA 3EDEA 5E0FA 1V3MA 2XM2A 1R85A 1E6XM 1AQHA 6TAAA 3TONA 2ZUTA 2YDSA 4QP0A 2V3DA 1EDQA 3SCNA 4OBSA 4AC1X 3W27A 2CCRA 1OWQA 4OOZA 1G9HA 4WKHA 2UY4A 1GOWA 3GNOA 4P7NA 2QLYA 2J74A 4FLSA 5I2UA 1UD5A 4UOJA 1QI0A 2WYSA 3OLIA 1VEPA 5CPSA 3QOMA 4W87A 3SUWA 4AZCA 2PWFA 5FCZA 4UFLA 4URIA 3PZOA 3WNPA 3MS8A 3WBEA 2G3JA 1BHGA 5A8NA 4PSPA 4PCSA 4ACZA 1KWGA 1UWIA 3A4XA 2XVPA 2GJXB 3GXMA 4S3JA 3LPPA 5A6JA 1HJQA 1JDCA 5I5RA 4HU8A 3N12A 4QCEA 2FHCA 2EPMX 1MW1A 5BXRA 3ZT6A 4W7WA 2O9RA 4PN2A 3CMJA 3SCRA 3EDFA 1OINA 2A3EA 5D9PA 1W3JA 1EDTA 3O2LA 5A8MA 7A3HA 3ARXA 1B0IA 3WNKA 1K6AA 2TAAA 3T2QA 4C7GA 3WH6A 1UZ4A 1LWJA 4AZBA 1E1EA 1JI2A 2XVNA 3VGEA 4F8XA 3WMSA 1YHTA 2CBIA 4BZYA 1CXHA 1QHZA 2GUYA 3THDA 2EPNA 3J7HA 3RO8A 1E6NA 2EBNA 1M7XA 1VJSA 3SIMA 5HBFA 1GOIA 1BVZA 3VOCA 3QHOA 2J62A 3M6DA 4CD6A 1DWIM 2DSKA 3L4ZA 2ZWZA 1NOUA 1JAEA 1CECA 3MU7A 3VDAA 4B15A 4CU6A 2GK1A 3U5YA 9CGTA 4J27A 2WXDM 3FN9A 4AEEA 2CBUA 4CVUA 4GZEA 2FHBA 4W93A 1YQ2A 5DF0A 1WZLA 1GZJA 1W3KA 3O6AA 3ZJ7A 2J7FA 4Z2IA 5A6MA 1PJ9A 1E5JA 3ARZA 4UOZA 1QNSA 2W91A 2WVTA 3CUHA 4WKAA 2ZX5A 5EFFA 1D2KA 5DT5A 3UG5A 2YDQA 2O9PA 2VRQA 5AC5A 1GQIA 1FHLA 3II1A 2QPSA 1LL7A 5A8PA 1B30A 2X0HA 5D9NA 2QF8A 4NSBA 3OGVA 3UEQA 3L4UA 4D6IA 4CCDA 1V6VA 1TVNA 4KGLA 1CLVA 4WSKA 3L4YA 3BMVA 4Z2LA 3I3DA 1UR2A 2CKSA 3ZSSA 2DH2A 4W8LA 3W28A 4U31A 2JEPA 4UQDA 1V6YA 1GJWA 3F4VA 4AMCA 4MPKA 3AMGA 3MUAA 3AHYA 2FDMA 4UZUA 3TP4A 2VZSA 3BC9A 2BY3A 2YLLA 6A3HA 1H3GA 1XCXA 2RGLA 4FMVA 1R87A 4Z2GA 2DT0A 4DWSC 1LL6A 2PF0A 4R5EA 3WL0A 1ISWA 4P8WA 1PBGA 1XH1A 4CN6A 2WMIA 1UWTA 4Z2KA 1ISYA 4MJ4A 5A6AA 2VCBA 1CGUA 2DPEA 2VZTA 5JBEA 3WF4A 4HU0A 4UOQA 1E6RA 2D3NA 3WFLA 1J0KA 2JEQA 1JAKA 2OSYA 2BY0A 1E0WA 1MW2A 5I24A 1QVBA 2BS9A 2GDVA 3VM5A 2G41A 1V02A 1CXKA 1DWFM 4D1IA 4B9ZA 3DYPA 3SCOA 4CGTA 1US3A 2WVVA 4H04A 3OGRA 2Y2WA 3A47A 1PX4A 5I6SA 1FP8A 1W3HA 2UY3A 4HOZA 3GNPA 5BYWA 4HTYA 3ALFA 1GQJA 3VKKA 4D1JA 3AS0A 3QOKA 2D22A 2D3LA 1MFVA 4UFHA 3CUJA 2J8GA 1JZ2A 4CD7A 3VUPA 1SR0A 2ZX6A 1UG6A 4R27A 2NSXA 1E5NA 1CGXA 5D8ZA 3W29A 4H8UA 3WQ6A 1NWSA 4NRSA 2DSWA 3BLKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4FHA A;  1B3Y A;  5HQE A;  2Q8L A;  1B3O A;  1P0D A;  3W7R A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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