3WD3A

Serratia marcescens chitinase b complexed with azide inhibitor
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd3A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd3A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd3A01
3BCDA 5C70A 3RJYA 2VQUA 1E55A 2A3EA 2NT0A 1GVYA 1EH9A 4PCSA 2FHBA 4LX4A 4P7QA 1W3LA 2UY2A 4U5IA 2YA1A 1HT6A 2WCSA 2EJ1A 4LYRA 3ALFA 3CUHA 3W82A 1CGWA 3CZKA 1C7SA 3IAQA 3AROA 4Z2JA 2AMGA 3M46A 3SCNA 3SUUA 1F4HA 3WDJA 3MU7A 1JI1A 3SUSA 3OIHA 5A69A 2AOSA 1UR9A 2HVMA 4J3UA 3VDHA 4MPKA 3VIJA 3ZT7A 3FW6A 4YN5A 4U33A 3MUIA 3VIOA 4EK7A 4HOZA 1QW9A 2QPSA 3ECQA 4D1JA 3UG4A 4KWUA 5FD0A 2X1IA 1JNEA 2DSUA 4KMQA 3ZQ9A 1XCWA 3VM7A 2O9RA 1OIMA 3AISA 4WJXA 3SCUA 1EOKA 1WDSA 3U57A 1WDPA 1JYXA 1AQMA 3CMJA 4KGJA 1C93A 3FAWA 1Q6GA 1TVNA 2XIIA 4TTUA 3W53A 4M82A 1E5NA 2WMKA 4B9YA 1CNVA 3MO4A 2WKGA 1B0IA 2YDRA 3T0DA 1X1NA 2GJXB 4WIWA 1WDQA 1QVBA 5I3DA 4RE3A 3TTQA 1LWJA 3CHCA 1VFFA 3PHAA 1WZMA 3UERA 2W63A 3TTOA 1E1FA 3BSGA 3DC0A 1WDRA 1PZ3A 2TAAA 4UZUA 1G1YA 1KWKA 2J47A 3POHA 4FMVA 4OBRA 3A4XA 1E6ZA 1SFSA 1VB9A 2FGZA 4AZ5A 1XYFA 3WNNA 1XGZA 1BFNA 1RPKA 3VGEA 5FKYA 2GJXA 3FAXA 3EYPA 3GM8A 4HA4A 5BXSA 2CCRA 4HU8A 1CGXA 2WKLA 1C8XA 2ZICA 2VX5A 1MFUA 1HL9A 2WHMA 4AZBA 3NUKA 3N15A 1VIWA 1CXLA 3PZMA 3ZJ8A 2J7DA 2DGAA 4UQCA 1XV8A 1V6VA 3ARYA 5CQ1A 3VGDA 3RM9A 1ZS2A 4CD8A 1HN1A 1ZJAA 3IANA 3AS3A 1GW1A 4TVUA 8A3HA 3VD5A 1JZ2A 3CH9A 3ZT5A 1OCQA 3BCFA 1OINA 2VZUA 3VU2A 4UQEA 1BYBA 1LL7A 3VIMA 2XJ7A 4NRSA 5A6JA 4H04A 1W1PA 3MKKA 3ZT6A 2E9BA 2XVNA 3S6TA 2QMKA 1AMYA 1B3ZA 4UFJA 3GH7A 4CN4A 4HOWA 5ABFB 3ZR5A 1DTUA 2BNJA 1NOWA 1NWSA 2CESA 4OBSA 2JFEX 5IDIA 4YHGA 1UD2A 4CCEA 4CCCA 2QV4A 1IV8A 3AMLA 4HZ8A 5A6SA 1J0HA 2E8YA 2WCAA 4HOXA 4M29A 3MS8A 1HKKA 2VX7A 1JZ4A 2WZHA 1VFUA 5DT7A 4JHZA 1O6IA 4GI8A 5A6BD 2CYGA 2XVPA 3WF3A 4UQBA 5I6SA 1M01A 3W28A 3QOKA 1FOBA 1LG2A 4JHOA 2V5DA 4JAWA 4PMYA 4F9DA 3NYDA 3QHOA 2D0GA 1CGUA 3CGTA 2D1ZA 3LPOA 5ABFA 4HU0A 2PWFA 2YA0A 1J0IA 4IISA 3UCQA 4AD5A 1C91A 4TUFA 4JL1A 3GNRA 1GHRA 4KH2A 2NSXA 3AHXA 3PN8A 2DEPA 1ZJBA 3MANA 5ABHA 1GQLA 4PUDA 1W2PA 1ISYA 4F79A 1CLXA 1US3A 1EOMA 3JUGA 2PBGA 3RM8A 5CGMA 2GJPA 2ZX9A 3KL0A 3TONA 2JEQA 2OSYA 2WVTA 3GZAA 5I5RA 4JL2A 1MQRA 2WB5A 2J7CA 3L4UA 3AOFA 4KGLA 5HPCA 1LQ0A 1HNYA 1QHZA 2WLYA 4PSPA 1KBKA 4BQ3A 1BQCA 2BHZA 1AIWA 1I75A 3K46A 2X05A 4MNKA 1HJQA 1W91A 4PN2A 3M07A 1JZ6A 1FHDA 1G5AA 4DM2A 2BHYA 2J25A 4ZE4A 3BAYA 4A3YA 3GXMA 1W9UA 1HJSA 3VDAA 6CGTA 1UYQA 4PMUA 1P6WA 3OZOA 2WW5A 3IJ8A 3NCOA 3ZOAA 1JYNA 2VNCA 1C7TA 2WAGA 4Z2KA 3DHPA 1UWTA 2BXZA 1OD0A 1BVZA 3OA5A 8CGTA 3LPGA 4AZ6A 3GXDA 1KCKA 3WNPA 2XFRA 3PZOA 3BAWA 5EFFA 3TP4A 1W1YA 1UWQA 1ZL1A 1S46A 2VURA 1EDQA 1H0IA 4X0VA 4AZIA 1RP9A 1EGZA 2XHYA 3EDKA 1OBAA 1ODZA 3PZTA 4YHEA 3T0AA 1ISVA 3WF4A 4MDOA 1V3MA 2V3GA 3SCWA 2J79A 2JE8A 1JD9A 3OLDA 2CETA 2EPNA 2UY4A 4MB3A 1J0YA 4YPJA 2OSXA 1UUQA 3ZSSA 4UQ9A 4S3JA 1XSJA 3ZM8A 3B9AA 4W7WA 4AWEA 3WUBA 3RMEA 4HMEA 4GO9A 2CBIA 5DT5A 4GKLA 2A3CA 2J77A 2BVTA 4W86A 3VX0A 3AYSA 1XD1A 3SIMA 4DUXA 2UY5A 4GPNA 1MW2A 2WMGA 5GNYA 3VMOA 1TA3B 2GUYA 1V3LA 2J62A 1I1WA 3RDKA 4JCMA 1TUXA 2VZOA 4PMOA 5GQBA 4OKDA 3ZJ7A 3N11A 3OLEA 1QI2A 3RM4A 3OB8A 3NJ3A 2ZXAA 4FLOA 5M03A 1BAGA 1EO5A 1M53A 4HA3A 2YDSA 3ARSA 1PX4A 4N42A 2J74A 5FL0A 2D24A 4PSRA 3WDPP 1HVXA 2EPOA 3VIHA 2DSKA 3CHEA 1TA3A 3KL5A 3S2CA 2D22A 3VM5A 2X0YA 2EPMX 1GJUA 3ARUA 3LPFA 3W38A 3GXIA 4PEEA 3PTKA 3WKZA 3KE0A 1JFHA 2E3ZA 3WEZA 1Q6FA 4WKFA 3AXXA 1HKJA 1CXKA 4RL3A 2GJRA 2BY3A 2XSAA 2E40A 2DPEA 4PTVA 4FLRA 1ED7A 3D3AA 4M56A 3VDCA 2GDUA 1ZBWA 4PBGA 4W5ZA 2J7EA 1HX0A 4PMNA 3U7VA 2FGLA 2WBGA 1QPKA 1BYAA 3AHVA 3QHNA 5IFPA 4Y7EA 5CPQA 3F5LA 1PIFA 3I3EA 1DWGM 1SMAA 2OLHA 3K4AA 3BSHA 4C7GA 1V08A 4GQQA 1PPIA 1XH2A 4UFKA 4ATLA 3L4YA 2VZSA 2WMHA 4UCFA 4Z2HA 3THDA 4XX6A 3ARZA 2DT2A 1VFMA 3GBEA 3VIFA 1DWIM 4TTGA 4MTVA 4PMRA 4QLLA 3WENA 1H4PA 4FLSA 3U5YA 4PMVA 3AQUA 4LQ1A 1QBAA 1UD6A 3E1F1 4UTFA 3ALGA 1E6NA 1QI4A 1ISWA 3II1A 1B3XA 2WC4A 5A2CA 2ZUTA 4GZEA 4OJYA 1B2YA 5TD4A 3ZMRA 3MUAA 3WQ6A 4TXEA 4LPCA 3VILA 2A3BA 4JZ5A 3UR8A 4GIAA 4F8XA 2ZXBA 2W5FA 1TR1A 1MW0A 1XH1A 2WNWA 1V3KA 2VO5A 1JNDA 1UH3A 1Q4NX 4BA0A 1WP6A 1JZ5A 4ACYA 1FH9A 5JH8A 2YOCA 4J3WA 5A6BA 2E9LA 1BTCA 3T2QA 3CMGA 3CUGA 4ZXOA 5A6KA 3SUTA 3AHYA 2ZX8A 2WVVB 2CBUA 1KGXA 3SCTA 1J12A 1E15A 3WH9A 3WDIA 1WZLA 3AXIA 3SCRA 1R85A 4W7VA 4AC1X 2BY0A 3DECA 1R86A 3GDBA 1FP8A 3WBEA 1DHKA 1V3IA 3APGA 2VRJA 1TZ7A 3WDHA 1GPFA 1V0NA 4GI6A 5D9PA 1HVQA 3AZSA 4AMCA 1X6NA 2ZX7A 5A8QA 1QI3A 1JG9A 4EE9A 2WVVA 2VT0A 1E0WA 3BGAA 4C7DA 1V6UA 4DUWA 4IM4A 2GK1B 2IUZA 3VX1A 2DT0A 2CEQA 1K9EA 2DDXA 4HMCA 2ZX6A 1ZBCA 3A47A 2VVSA 1NWUA 5AC5A 1DWJM 3AIRA 3OZPA 1W1VA 1PZ2A 3L4VA 5DEZA 3W4RA 4JKKA 4V2XA 1GHSA 1UHVA 4AXNA 1KQYA 3PZIA 2ZOXA 4PMXA 1W2VA 2WZEA 4B3LA 1UR1A 3OGVA 4AD0A 3AMCA 2GK1A 3UG5A 1UG6A 3BH4A 1ZBKA 3AHZA 1XC6A 1PEZA 2WMJA 2DSVA 5KZ6A 1GZJA 3ZJ6A 3W6LA 4XZBA 2WVUA 1D7FA 3WN6A 3AI0A 4UOQA 2CKSA 1OGGA 2BV9A 3TA9A 1MFVA 2XGBA 1W9BM 2ZUMA 1M04A 2EBNA 4P7LA 3OLGA 2YIHA 3NSNA 1MXDA 3WNLA 1J0KA 1H11A 3AIWA 3L4WA 1C8YA 1XRVA 2ZUSA 4UFMA 2ZUWA 4AIEA 3WQ5A 4M24A 3TOPA 3BMWA 1I1XA 2UY3A 1OGBA 3KEHA 2C0HA 4KRUA 1CBGA 2YKKA 4QAWA 5A8NA 5E6ZA 4MNJA 4CD7A 3TTSA 3L4TA 3PZ9A 5I24A 1XD0A 4H41A 3FN9A 4WSKA 4D6DA 5D4YA 3O2LA 5A8OA 2OWCA 2D3NA 3AIVA 3WMBA 3MUZ1 4M81A 5CZKA 1BG9A 5LA2A 2BHUA 5F7UA 2XWEA 2EPKX 1H09A 2XGIA 4JFUA 3WELA 3VUPA 2JEPA 1QOXA 4LGXA 1UQZA 1CDGA 3HU7A 4QCFA 1WO2A 5M17A 1J01A 1E40A 4F66A 1M7XA 3RJXA 5E0FA 1B3WA 3AS2A 2F61A 4CU6A 3WF1A 1H0GA 3G6MA 1XSIA 4ACZB 4AZHA 3WNMA 3AXHA 2CERA 2FHCA 5BXPA 5GNXA 5DFAA 5HXMA 1UOKA 3EDFA 2XYLA 1JGIA 2WANA 1NM9A 1EHNA 2BXYA 4UNIA 1W9XA 3O9NA 3GYCA 5ABGA 4PTWA 3VNZA 1H1NA 5AYIA 5AC4A 5KEZA 2WSKA 6TAAA 3I3BA 3ZJKA 2VZVA 4UFHA 2YL6A 4MAZA 1B3YA 2XPKA 3MMUA 4ATWA 3I3DA 1AQHA 5FIPA 1R7AA 1VBRA 4OIFA 1C92A 5A1AA 2XUCA 4ACZA 1KWGA 3CLWA 2EXOA 4W8BA 3POCA 3PBGA 2YDQA 2B31A 4D6FA 5M3WA 3ARTA 4AZ7A 1EDGA 3W24A 2DIEA 3VGBA 3AS0A 4TX8A 1J18A 3UETA 1AVAA 2VVNA 4E2OA 2YA2A 4H7VA 3AIBA 5I2UA 4PRWA 3NDZA 2WHLA 1TE1A 3FXYA 3W27A 4A4AA 1EHAA 1E0XA 1JDCA 4X0NA 2PF0A 4TX6A 3VOCA 1W9VA 1UWUA 2G3NA 2J75A 3F5KA 1NP0A 4BS0A 2YLAA 4MJ2A 1CTNA 1SMDA 1B3VA 1OB0A 3VDBA 3VMPA 2OSWA 1JF6A 3T2PA 1C3FA 1E71M 4LYPA 4HZ6A 3GNOA 2C8NA 1K9FA 1E4LA 5M5DA 1QW8A 1YQ2A 1J0JA 4CVUA 2XVKA 4J3XA 4NZCA 3WFZA 2QPUA 4BQ2A 2PWHA 1QNRA 2XSBA 1BYDA 1GQJA 1V02A 4PMQA 4PCTA 1RH9A 4PTMA 1JDAA 4JFTA 4UZSA 4MJ4A 4QP0A 1HJVA 1HP5A 1V0LA 1F4AA 2W62A 5AYBA 2FH8A 3SUVA 3VO0A 5JBEA 3D5HA 3MV01 1GNXA 1FH8A 3VGGA 5IHRA 1QI5A 2X0HA 1U30A 2RGMA 2DSZA 3WMSA 3PTQA 2PWDA 2WZIA 1CIUA 3WUFA 3WL1A 4GXPA 5D8ZA 1KCLA 1MW1A 3RILA 2NW0A 1BGAA 1V0MA 3FY1A 3DHUA 2WPGA 3WQ8A 1WE5A 1CENA 1BGGA 2GVYA 3ZIZA 1OD8A 3F4VA 2VRQA 3VIGA 5BCAA 2J7HA 1UWRA 3J7HA 2PB1A 2DT3A 3MMDA 4CU8A 1QNPA 3N17A 1JXKA 3CZEA 1E56A 1PX3A 2WC7A 1QHPA 1XSKA 1ZB5A 2WVSA 2X2YA 3WH8A 4W8LA 1VJZA 4B3KA 3EDDA 2W4XA 2V3EA 1GQKA 1W3JA 3M6DA 2W66A 4WKAA 5BROA 2DIJA 3BAXA 1JF5A 4CN1A 1BLIA 1E9LA 3AICA 2D0HA 7TAAA 5I77A 1VEPA 1KXVA 1KXTA 1WZKA 9CGTA 1E6PA 1TVPA 4D71A 3VD9A 3VNYA 4S3KA 2D0FA 4J27A 2WSPA 2WK2A 4D6JA 4F9JA 2CXGA 2MANA 5BXTA 2ZUVA 4W88A 3IK2A 3W81A 1UH4A 4GI9A 3PZQA 3VIIA 1CYGA 3VD7A 1XH0A 1C90A 4P7RA 1VF8A 4AYSA 5LYRA 1E0VA 1UA3A 4PTXA 2V3DA 2QHAA 3WD1A 1AQ0A 3B8SA 1DWAM 1H3GA 1NOFA 2EEXA 2XFYA 2YBTA 3MMWA 3NIYA 1E43A 1MVYA 1FFQA 2O9PA 1BPLB 3N13A 5BRQA 4E8DA 3FNDA 1W9DM 2X09A 1HKIA 4EKJA 1WB0A 1WCGA 2WLZA 2BY1A 2QF8A 1LWHA 3WD3A 2VCAA 1D2KA 2ZX5A 3T09A 3RO8A 4D6EA 2J4GA 1ESWA 3CO4A 3WUEA 4UOZA 3AZRA 3WNKA 1BVNP 3GBDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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