3WD3A

Serratia marcescens chitinase b complexed with azide inhibitor
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd3A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd3A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd3A01
4BF7A 1UHVA 1FH8A 1NH6A 2C8NA 4PN2A 2X8RA 1HJQA 5I5RA 3BGAA 2CBUA 4CKQA 1NQ6A 1TZ7A 2AMGA 5D9MA 3ZM8A 4AY1A 4HPHA 1UH3A 2X09A 4F9DA 1M7XA 2G3NA 5A94A 8A3HA 3CZJA 5A3HA 4BS0A 1BG9A 2JE8A 1HJUA 3UG3A 2UY3A 4JFUA 3CZ8A 1EDGA 3AQUA 1DWHM 3U5YA 3SCQA 2DIEA 4D1IA 3WELA 3NUKA 2WHJA 1E1EA 4CGTA 2DT1A 1GQJA 3PZUA 2JEPA 2WCAA 2Y8KA 1OT1A 2E4TA 5BRQA 1GQKA 5CSUA 2YDQA 1EO5A 3HU7A 3AYSA 3NDZA 2XWEA 3WEOA 2ZXQA 1B3ZA 4OJYA 4MB3A 1V08A 4ACZA 1JNDA 5FD0A 3W25A 4UQEA 1EDTA 3BH4A 2ZWYA 2FH8A 2W5FA 4E4PA 1OB0A 1UKTA 3EBVA 2TAAA 4CCCA 4PTWA 2XM1A 1AQMA 1E1FA 2QPUA 3CUHA 3WQWA 3PZTA 1YHTA 2EPNA 1I1XA 2G41A 2YOCA 1ITCA 4HPGA 2Y24A 5CZKA 4GZJA 4U2ZA 1QW8A 1VEMA 4PSPA 4E8CA 1FP9A 2OWCA 3MV01 2D49A 2FHCA 4UQBA 2VZUA 2CERA 2W61A 3WNKA 1CNVA 2FHFA 4W86A 2BV9A 4AISA 3WDQA 3B9EA 1W9XA 2JIWA 1BYDA 1UA3A 3MSGA 5GNZA 3ZSTA 5E6ZA 3OB8A 3VX0A 2D24A 4PMQA 5CQ1A 1MW3A 3PZNA 4CD5A 4HU8A 4LGXA 1DWGM 5A6BD 1JZ3A 3CBWA 4HTYA 1WO2A 4HOZA 1E6XM 2OYMA 4PUEA 4MJ2A 1D3CA 3FHQA 3VDCA 3KEHA 4Z2HA 1WDPA 3OLIA 4AD0A 1KXHA 1UR9A 1CWYA 3SUWA 3N18A 2VTFA 3A6OA 3WUBA 1E70M 3VGDA 3EMZA 1V3JA 4XV0A 3UERA 2EPOA 3NSMA 2A3EA 2BY2A 1TUXA 4CUCA 4B3KA 4Z2KA 3BAJA 1AIWA 2OSWA 3WN6A 3WD1A 4N42A 1WZAA 4UOJA 2NSXA 4PTMA 3RILA 4W7UA 3WD2A 3MUAA 1W32A 2YDRA 2J7FA 1HKKA 3L4TA 4AEEA 4CD6A 1JYVA 2QHAA 4MNMA 4QAWA 3OIHA 2WSKA 1UWSA 5HOSA 2OYLA 2CXGA 5CXPA 3ZO9A 1JZ6A 1C92A 1E43A 1EXPA 2XSAA 2WXDM 3K4DA 3PZQA 3KL5A 3ZR5A 1UUQA 5M5DA 3K8LA 2J7HA 5A8PA 2PC8A 4S3KA 1BQCA 1NWSA 4HA4A 1OD8A 4W5UA 3DYOA 3WNLA 1E0VA 4C7FA 4UFIA 1DWFM 4H7VA 4E2OA 3ARQA 1NM9A 1LG2A 1CXHA 1V3HA 1CXLA 1EQPA 3UG5A 5A6JA 1LL7A 3ARYA 4B16A 1QOXA 3T2OA 1MWOA 2EEXA 4D1JA 1C93A 2E9LA 2XHYA 1UWUA 4J3UA 2WCSA 1XYFA 1OGBA 2V3EA 1HP4A 3PZMA 4D6CA 4MDPA 4AZCB 2WCGA 5ABEA 1GOMA 1WDQA 5FOOA 3ARXA 1HJSA 3WQ8A 1LL6A 1QI5A 2D2OA 4TX8A 4J7RA 3VOCA 1I75A 1MFUA 2J8FA 2WYSA 4AIEA 1VJZA 4J3VA 4OBSA 3FW6A 1V6VA 1G1YA 2V3GA 3VDBA 5JBEA 1MXGA 2WNWA 2OLHA 3ZJKA 4MJ4A 1HNYA 4NZCA 3S6TA 3T0BA 4J3SA 3VD7A 5TD4A 1Q6FA 1SFSA 4S3JA 2C7FA 1WZKA 4H41A 3B8SA 1E6PA 1E73M 3ZJ8A 1G9HA 3MS8A 5C8BB 3WMCA 1ITXA 5IXEA 1J9YA 2PBOA 4U2YA 5A2CA 3OLDA 4AW7A 1QHOA 3VVGA 1KQYA 2UY4A 3W6MA 1H4PA 5ECUA 3LMYA 4H04A 1FFRA 3VIMA 1ZBVA 3TP4A 2WHKA 2XVKA 1H41A 2PF0A 2PB1A 2WB5A 4CN1A 2Y5EA 4L4OA 1KFWA 3F4VA 1V6XA 4OUEA 1H1NA 4MPKA 1HP5A 3ZQ9A 3SIMA 4AMCA 3EDFA 1YQ2A 4DUWA 3SCPA 1E4LA 3OLGA 2WMKA 1R7OA 1M53A 3F5JA 1CEOA 3QHNA 3W0KA 1BSIA 4GO8A 2XG9A 1ZJAA 1LQ0A 5D8WA 1JDAA 4EAMA 2WC3A 3LPPA 1JZ7A 4Z2GA 1L8NA 2NW0A 2PBGA 1TE1A 2ZE0A 3RM8A 2A3HA 1OGSA 4WKFA 1VJSA 3MUY1 4HMDA 1EIBA 2O9OA 1WB0A 2X1IA 5FKYA 3IAQA 2DSWA 2WVUA 1CGUA 2WVVB 3WD0A 2WANA 1MFVA 4HOWA 3AMDA 1JAEA 3ALFA 1PBGA 1J0KA 3CO4A 3FN9A 3M6DA 5BWFA 3WMSA 4P8WA 1DEDA 2XIBA 4AZCA 1KR0A 1UWQA 2VI0A 2YLLA 4H8HA 2VJXA 3K8KA 1CYGA 3OA5A 2VMFA 3T08A 3AXIA 2ZXBA 4W8AA 1B3YA 4CVUA 2OYKA 2W4XA 1J12A 1MYRA 2QLYA 2VX5A 5DEZA 4IUGA 3OGSA 1FHDA 3WIJA 1JYXA 4BQ5A 4IISA 3SUSA 4P7OA 3T09A 2CHOA 5A8QA 1UR1A 3VIKA 2ZX8A 2J47A 3N13A 1CENA 3HMCA 1VB9A 1XCXA 3SCNA 1GHSA 1GOKA 3WKZA 3WNMA 4M8UA 5CGMA 3U7BA 1E15A 4D71A 5DT5A 2WMHA 1E4MM 2VCBA 1TFVA 4TTUA 2WLZA 1W9UA 1RP9A 3CMGA 1W3JA 4FMVA 3WDJA 4LPCA 4UQDA 1XH2A 1EHAA 2VCAA 2X0YA 3UETA 5JBFA 3APGA 4CVWA 1BPLB 1BVNP 4JKKA 1ZB5A 4AEFA 1QNOA 1MVYA 5M03A 1W2VA 1XSKA 1H09A 1WP6A 3KL0A 3CUGA 4CCDA 2WVSA 4HZ7A 4AZ5A 4DUVA 2A3CA 2FGZA 2WC7A 4GQRA 3WUEA 5BYWA 1US2A 5BXPA 4W5ZA 4ACYA 2DSZA 2Y2WA 2DH3A 2GJPA 1ISWA 3AHTA 2WZHA 1BG4A 2AOSA 3WUFA 2VQTA 5I0DA 4URIA 4Z2IA 1BGGA 3L2MA 2RGLA 3BSGA 3AIVA 2BY0A 2YJQA 1TVPA 3SUTA 2G3JA 1X1NA 2Z1KA 3GXFA 4WIWA 4H8UA 1BYAA 1ISYA 3BXWA 1D7FA 4JL1A 4PBGA 2ZOXA 1OINA 3VDAA 1MQQA 2WVVA 4PMVA 2FH6A 1JZ4A 1IZKA 4UFLA 3EMQA 3O9NA 3CHDA 1V0NA 2WZIA 3GH7A 5I24A 1KR1A 1FFQA 1QHPA 3N1AA 4GPNA 4JFTA 1VFOA 1HIZA 3AHVA 5D4YA 2J77A 5A6AA 1J01A 1DWIM 4MB5A 4NF7A 4PMXA 3PZVA 2CKRA 3F5LA 3PTMA 4LX4A 4U31A 5BRPA 1QHZA 4K68A 4CD7A 3B9AA 3WENA 1V3LA 2E8YA 3ARSA 2WC4A 1CZ1A 2YBUA 3VNYA 3FAWA 2OWWA 4MNLA 1B3VA 2CNCA 2X2YA 4D6FA 3CZGA 2VRKA 1IT0A 1XHGA 4JZ5A 4HA3A 3L2LA 2IXVA 5JIWA 1PX3A 3GBEA 2UY2A 2NT1A 4ML4A 3ALGA 4CD8A 3ZIZA 2J62A 4DWSB 3PTQA 1LF1A 1E6RA 2F61A 3VIPA 1Q6CA 1B3WA 3WD4A 5E09A 1VRXA 3WNPA 2Z1SA 1KBBA 1GUVA 3SCTA 4NRSA 1AVAA 1AQ0A 3AS2A 2CBVA 1LWJA 2EPLX 2WPGA 5FIPA 3DECA 4TVDA 4GI6A 1TA3A 2BVYA 3PHAA 2EBNA 4XZBA 1UYQA 5A8OA 2WKLA 2PWHA 4QLKA 1KGWA 3KL3A 3VIHA 3WNNA 4KRUA 5IHSA 1JZ2A 4M1RA 1L0PA 1D2KA 3SURA 3W27A 3CZLA 3EDKA 5AY7A 1XGZA 1NWUA 4Z2LA 3WH7A 1CXEA 1CGTA 5ABHA 2ZUMA 4PEEA 4LYPA 2WAGA 3F5KA 5A8NA 1N82A 4F8XA 1JF5A 4AZ7A 5HXMA 2W66A 1V3MA 4JFSA 2VX4A 1UD3A 1UKSA 4AZBA 3AIWA 2GK1A 5A2BA 3ZT7A 1M01A 1H49A 1OSEA 1M04A 1V02A 3MMWA 3MUIA 1KBKA 4FLSA 4QDMA 3FAXA 1RD6A 1EDQA 4QCFA 1OIFA 3POHA 4EE9A 1DTUA 4OZOA 5IFPA 1NOWA 1R7AA 3WH8A 5A1AA 4MNKA 5KZ6A 1UKOA 2WMIA 1B1YA 3RDKA 4Z2JA 3WNOA 5I23A 1JYWA 2EPMX 1MW1A 3ARUA 1A47A 3W81A 3ZJ6A 4B3LA 4HMEA 2YA2A 2VVSA 3AOFA 3VO0A 2XVNA 1XSJA 1X6NA 4GIAA 4ZXLA 3W82A 4AZ6A 3WH5A 1ISZA 4AIOA 3OBAA 2EQDA 4Y7EA 4F66A 1EH9A 1OM0A 1W1YA 3CZEA 4W8BA 1W3LA 4OIFA 4R27A 3ARPA 3ARTA 2YKKA 2CPUA 3GXDA 1H0IA 1JI1A 1WDSA 1FHLA 2QPSA 3CIVA 4MADA 1FA2A 5DMYA 4JAWA 1JDCA 1KCLA 4DWSA 4U5KA 1CXFA 1BYBA 1ZL1A 3CZKA 4MAVA 1ED7A 1R8LA 4J27A 3VMPA 1PIFA 2D23A 1VIWA 3VGHA 5I79A 1C91A 4W89A 1BVZA 2WM0A 3AIRA 4AIUA 3VIGA 1V03A 3LPGA 5ABFA 4GZEA 4HZ6A 3FY1A 1W3HA 4JHOA 4CU8A 3PZ9A 2G3IA 2YIHA 4D72A 1E55A 3AYRA 1Q4NX 1RPKA 7CGTA 3DYPA 1KGXA 3DYMA 1PJ9A 1F4AA 1H5VA 2WBGA 5A95A 4BZYA 1K6AA 2CHNA 3POCA 2XJ7A 3AICA 3OGVA 2XGIA 1GJWA 1AMYA 2BHZA 5FL1A 1V0MA 4YHEA 1WPCA 2FGLA 3VILA 2D20A 2WLYA 3TA9A 2AAAA 2J7BA 1VEPA 1O7AA 3QHOA 4MB4A 3SCUA 3W6LA 2XGBA 3WQVA 1VEOA 1H11A 3BAIA 4W7WA 5A6BA 3RJYA 3O6AA 1CTNA 3RM4A 3N17A 4ZE4A 2F8QA 4RE4A 2ZUWA 1C8YA 2VR4A 2CBJA 1E6SM 2VVNA 4PUDA 3HN3A 1QBBA 5E6YA 1VFFA 1CLXA 1E72M 1UH4A 1BGAA 4A3YA 3K8MA 4D6GA 3MKKA 2ESCA 1V3KA 2BXYA 5M17A 1SMAA 3L4VA 4FF5A 2XUCA 3U7VA 2D0FA 1GHRA 1MXDA 1WZLA 1C3FA 1U2YA 2BY1A 4KMQA 1K9TA 1XH1A 1HVQA 4PMNA 3BSHA 1GONA 3PN8A 1V6YA 2WHMA 4D6EA 4NI3A 4MNJA 1I1WA 2DT2A 2CEQA 4D6JA 1XH0A 4HOXA 5CLWA 1TCMA 4B15A 1UZ4A 1WZMA 2V38A 1UR8A 3AMCA 4GKLA 2D3NA 1JYNA 2E8ZA 1JXJA 4PRWA 1UQYA 6CGTA 1UOKA 4BCEA 1GOQA 2EO7A 1KB3A 3T2QA 4PMYA 3SCVA 1W9BM 3AIBA 4A4AA 2ZUVA 4PMOA 5LA0A 3T2PA 3GH4A 3G6MA 4CU7A 3VU2A 3W53A 2JIEA 3EMCA 2V3FA 1VAHA 4KGLA 2DEPA 4F9JA 2E9BA 1CGXA 5AYIA 3MMUA 4XUYA 4F79A 4TXEA 1JGIA 5FCZA 2XSBA 4P8XA 5CGTA 2WKGA 4LQ1A 5A8MA 4UNIA 1CGYA 5A6KA 1ZS2A 1E4IA 1GOWA 1EOKA 4U5IA 4PTVA 1JFHA 1R85A 4JHZA 4B9YA 4UR9A 2ZUNA 2VZSA 4GI8A 1W9VA 1P6WA 1JIBA 5HNNA 1F4HA 4WF7A 1B3XA 1OCQA 1MQRA 4JL2A 1K9FA 1ZBCA 1BHGA 1WE5A 4M56A 3SEPA 2WBKA 3IK2A 4JCMA 4HA1A 2DH2A 4ZFMA 4P7RA 2ZX9A 4H2CA 1QI0A 3WQ4A 4WJXA 4HZ8A 2CIPA 2YBTA 1C7SA 4J3XA 4X9YA 3GXMA 1PX4A 2PWGA 2ZXAA 1QPKA 5LYRA 1W1VA 4ZEPA 4X0VA 5E0CA 2GJXB 1CBGA 1UD4A 3RJXA 1GVYA 4QLLA 2O92A 1B2YA 3AS1A 2J8GA 2F2HA 4J3WA 3WEMA 3BLKA 1HN1A 1QNPA 1PZ3A 2CITA 1OT2A 1W3KA 1G5AA 2BNJA 5A6LA 2DSVA 4WKHA 5C70A 2VQUA 3VMNA 3UEQA 3WF3A 4P7QA 1V0KA 3RMEA 2D3LA 4IM4A 4UQCA 4W85A 1EHNA 1SMDA 1W2PA 5A69A 5D9NA 1ZBWA 2VRJA 3TTOA 5GPRA 2J79A 3E1F1 2NT0A 1LLOA 4MTVA 1B90A 3IANA 2BY3A 4UFKA 4JCLA 3RIKA 1C7TA 5A2AA 1JD7A 2VR5A 3ZJ7A 3U5UA 3RCNA 1SYTA 1XCWA 1S46A 5D9OA 3SCWA 4QCEA 1W1TA 5BXTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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