4Z2GA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 26
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
total genus 156
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2gA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2gA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2gA01
4OIFA 2Y24A 3VDCA 4P7QA 4MNMA 1VENA 1C92A 1UWTA 2CHOA 4KMQA 3AMLA 2E8YA 4MAZA 4U33A 4Q7NA 1NM9A 4LPCA 4DM2A 4E4PA 2X05A 5A2AA 6TAAA 4OOUA 3BCDA 2ZIDA 2VMFA 4DWSB 1CTNA 2UY2A 1ZBCA 3SUVA 5D4YA 1V6YA 1H09A 2EO7A 2DIEA 4EK7A 4PUDA 2UY3A 1M53A 3GXMA 5ABFB 3VGFA 3VIPA 1UR9A 1US2A 1A3HA 3UERA 2J62A 4ACZA 3JUGA 1ZU8A 2YBTA 2XPKA 1E9LA 1UUQA 1WKYA 4UZUA 3CPUA 4AW7A 5IDIA 3DECA 5E0FA 1TMQA 1IT0A 1K9DA 5EMYA 4MDPA 4HZ8A 1O7AA 2J47A 3II1A 3K4DA 1XCWA 2W62A 3VU2A 5GQBA 3OLEA 2CBUA 1XCXA 4LX4A 4FK9A 3CZ8A 3WNMA 1DHKA 5E70A 3LPGA 1BAGA 4ACYA 3RJXA 2GSJA 2VX5A 1CECA 5M5DA 3SUTA 2E40A 1VBRA 2QV4A 2E0PA 3VMOA 1XRVA 1UH2A 2WW5A 1MQRA 3OIHA 3E1F1 4ZE5A 4AISA 4HA3A 4D1IA 3W24A 4LQ1A 3GXFA 1BVZA 3GYCA 1ZBWA 5HNNA 3AIEA 1ZJBA 4OBRA 5I2UA 4UQDA 4XX6A 4YN5A 3FY1A 2NW0A 4DWSA 1UR2A 4KRUA 1E1FA 2Y4SA 1VFMA 3T2PA 4NF7A 1B0IA 2CESA 9CGTA 3ZM8A 1KCLA 2RGMA 5C8BB 4B3KA 1VEOA 4UOJA 1C93A 5ABFA 4IISA 1E0WA 2WCAA 1UKOA 2V38A 3CLWA 4S3KA 3W6MA 1G01A 3OZOA 4H8HA 4LYRA 3BSGA 3F5LA 3PZTA 2ZUNA 4ZFMA 1NWTA 5AC5A 2HISA 3WL0A 3N18A 1B1YA 3B8SA 1GONA 4D71A 4ZE4A 1UD2A 1JD9A 2E3ZA 2ZUWA 2CETA 2DGAA 5CGTA 3ZJ6A 3WELA 3GBEA 2XM2A 4QFUA 3POHA 2VTFA 2BHZA 4P8WA 4XZBA 2JALA 1ZS2A 3GXIA 4BF7A 3MUZ1 1CXKA 2XSBA 1G0CA 3SUUA 1RH9A 3WH9A 3TTOA 4FLOA 4U5IA 2CEQA 3T08A 2GVYA 1LL7A 2PI6A 2XFFA 4KWUA 4CU6A 1EHAA 1WB0A 3ARPA 3ZIZA 4GZEA 1V3KA 1NH6A 3GZAA 4QAWA 5EB8A 5IXEA 1DWAM 1G1YA 1YQ2A 4UFJA 3PTKA 1JDAA 5A6LA 5AC4A 1OM0A 1K9EA 1LL6A 3RM9A 2WHLA 1J0IA 3MSDA 1G9HA 3A4AA 1HJWA 2VQTA 3VPLA 4UOQA 2VX7A 5E6YA 3VINA 3AYRA 4GINA 5E0CA 5KZ6A 3WEOA 4F9DA 4OOZA 4PSRA 2DIJA 1E4NA 3CUGA 5A8NA 5CJ5A 3AHXA 1BVNP 1JXJA 1XH0A 3NDZA 4R27A 1MW3A 4BQ2A 1AMYA 1KQYA 3MO4A 2JF7A 4U31A 1OSEA 3RO8A 2YA1A 3KL0A 1DWIM 1CGXA 2F8QA 2BXZA 2JE8A 1W9VA 5CPTA 2J74A 3LPOA 3TTQA 3CBWA 1HX0A 3ARTA 4AWEA 4AD0A 1MXGA 4MDOA 5C70A 4UZSA 4L4OA 4W84A 1EQCA 3WMBA 1UD4A 3W4RA 3PTMA 2WHKA 4PMVA 4D6EA 1EQPA 2WANA 4HTYA 1JXKA 2DQXA 4UTFA 1V03A 2CYGA 2VCAA 3VD4A 4P7RA 3UCQA 2W91A 3W82A 1B30A 3L4XA 2VZTA 4JFSA 3U7VA 1CXLA 3A4XA 1HIZA 4W8LA 3W81A 3WF1A 1NOFA 2QPUA 1QOXA 1TZ7A 1ED7A 3AROA 4BA0A 4U5KA 1W9DM 3VIFA 3GH4A 3AXHA 1OT2A 1UWUA 2VVNA 1MW2A 4JCLA 3RCNA 2W92A 4J3XA 1Q6DA 2ZX7A 2D1ZA 3BLKA 2CERA 4HPHA 3WDQA 3SCOA 2ZUMA 1PX4A 1DWGM 3NSMA 2VC9A 3VIMA 4AZ7A 1E56A 2DSKA 5A6BA 1US3A 2EPNA 5BXTA 2VRKA 3PZUA 4P7LA 3WDIA 3OZPA 3M7SA 2ZWZA 1WDPA 1ZBKA 4W86A 1QNRA 1B90A 4NRSA 3OLGA 3SCQA 4A3YA 1Q6FA 4MTVA 2YA2A 4IPLA 1ZB5A 4MNLA 3GM8A 3N1AA 2CKRA 2J7GA 4C7GA 2WMKA 4UQBA 3O2LA 2A3CA 3EMCA 3VUPA 2X0YA 2XVLA 1UQZA 2AOSA 1MFVA 3EMZA 4ZXLA 3QHNA 4B9ZA 3BCFA 1VFUA 4W8BA 2CBJA 2NSXA 3WD2A 3WNKA 5M3WA 3AMGA 3N17A 5IFTA 4WJXA 1JG9A 1LL4A 2DEPA 4HOZA 1ITCA 5ABEA 1QHPA 4URIA 1KR0A 1NP2A 2BNJA 1QI2A 4LGXA 1QVBA 2XJ7A 1UA7A 1BFNA 1UHVA 4F79A 1UH3A 4QP0A 1JZ5A 2J8GA 1CGVA 4B15A 3EDJA 3MV01 3ZR6A 4UQ9A 1B31A 2OWCA 1MW0A 2PWEA 2ZX9A 3W27A 4CN4A 1FFQA 1U30A 4M24A 1V3LA 2DT3A 2W61A 2WK2A 4WLCA 2WMIA 1UYQA 3CTTA 3HN3A 1OD0A 1H1NA 4OKDA 4W8AA 1W9XA 3ZMRA 3KL3A 4E2OA 4E8DA 3F5JA 5D9PA 5JBDA 2D23A 5A1AA 2OSXA 3KZSA 1OCQA 1SYTA 1HKIA 2E9BA 1V0NA 3ALGA 3WQ8A 3BAWA 1BGAA 3PZGA 5BXRA 3UEQA 1UZ1A 2Y2WA 1FP9A 3WQ5A 3WMSA 4UFIA 3WDHA 3AS1A 5HBFA 4MJ4A 3PZIA 2WVVB 4DWSD 3AOFA 1MVYA 2VR5A 5ABHA 3ZR5A 3RM4A 1KFWA 2QPSA 3PTQA 3MMUA 4EE9A 5I78A 3ZSTA 2WVTA 1OGGA 3ZSSA 2XUCA 2XGIA 1CXHA 4M56A 1BLIA 4PTWA 2EQDA 1XC6A 3WF2A 1V3JA 5A6SA 2WVUA 3VM5A 3IK2A 2YDSA 1U33A 2YDQA 1UA3A 2EXOA 1BYDA 4M82A 3VIHA 4UOZA 1PZ2A 4U3CA 4PCSA 2J8FA 1KGXA 2W5FA 4H41A 7TAAA 3VDBA 3VILA 1MFUA 3AHZA 1DP0A 2OYLA 4N42A 4UQCA 1GOKA 2CKSA 3QR3A 3WN6A 5D8WA 2WBKA 8A3HA 1J12A 1B3YA 3KEHA 2WZEA 5EFFA 5DEZA 1OGSA 3AISA 1M01A 2D2OA 2ZX6A 1H41A 3AQUA 2WMHA 3AIWA 1JGIA 4P8XA 3A47A 3BC9A 2V3DA 3ZT7A 2UWFA 1E6XM 2VZVA 3VO0A 3NSNA 5DO8A 2JIWA 4W7WA 2XIBA 2WVVA 2EPKX 4J27A 3EDKA 5C71A 5BRQA 3WF0A 4AD1A 1W2VA 5DMYA 2D0GA 2XYLA 4J7RA 1AIWA 1CWYA 4TVUA 5JBEA 3VD7A 2EJ1A 5E09A 2YJQA 4U2ZA 3VX1A 4HA4A 2VVSA 2VZSA 3AI0A 5E9AA 1E71M 1QI4A 2F2HA 1VEMA 3NJ3A 2C7FA 2ZUUA 2Z1SA 4J3VA 1ZBVA 3WBAA 4HU8A 1ISYA 2Y5EA 4R5EA 2V3FA 3A4WA 2WMGA 4QCEA 1JZ3A 3SCRA 3DHPA 3WKZA 2G41A 1ODZA 3IAPA 4F8XA 1E73M 5BCAA 1CNVA 1E6SM 4CD4A 3ARZA 1XSIA 5A6AA 2Z1KA 3IJ7A 3VGBA 4CD6A 1UWRA 1NOWA 1HJVA 1JDCA 1XGZA 5LA2A 1AQ0A 1GHSA 3WNPA 1TE1A 1C8YA 1EOKA 1E70M 4RE2A 2DT2A 4ATWA 1MQPA 2PWDA 3WL1A 4CD8A 1J0JA 1KQZA 4D6JA 3ARUA 1JI1A 1Y7VA 4MADA 2UY4A 1E6PA 1HT6A 2BHUA 2GDVA 4JL2A 1V0MA 1LJYA 1R85A 1EOMA 3QOMA 4H8UA 3NUKA 5JUVA 5I5RA 4U3AA 1KXVA 3CMGA 2CBVA 2XM1A 1UR1A 3O9NA 1B3ZA 1H4PA 1R8LA 3WF3A 3SEPA 3O6AA 5BXPA 4CCEA 3WFZA 3CHEA 4AXNA 5A6BD 2FH8A 1VBUA 4TTGA 1JAEA 2WM0A 1ESWA 1IZJA 2IXVA 3TOPA 1KXQA 5AY7A 4TX6A 2YIHA 1HVQA 5HXMA 1WPCA 3HJEA 4PMXA 5A8OA 1NOUA 3L4ZA 2V3EA 2VOTA 4PMQA 1FH9A 2D3LA 4HU0A 1RD6A 2CBIA 2E9MA 1NWUA 3CZEA 3FHAA 2Y8VA 1KXTA 5I0DA 1J11A 1EO5A 1NP0A 3TP4A 3AS3A 2WC7A 2VX4A 3ZJKA 4W7UA 4TVCA 2O9PA 5IHSA 4RE4A 3AHYA 3LPPA 3T0DA 3DC0A 2ZUVA 4D1JA 3CIVA 1UKTA 1EDTA 3GDBA 3GBDA 3MSGA 3TTYA 2WB5A 1VIWA 1W9UA 3N11A 4H8VA 3ZT6A 3FN9A 3FNDA 4HZ7A 2G3JA 3FW6A 3WNOA 4JCMA 3MS8A 3WH6A 4CCDA 4D6FA 4N0RA 1HN1A 2ZWYA 1JYXA 1SFSA 1LF1A 4OJYA 1D2KA 1JAKA 1Q6EA 5CG0A 4GKLA 3SIMA 2CITA 4AZBA 2AAAA 4GZIA 5A6JA 3MMDA 2FDMA 2YLLA 1TCMA 1UKSA 2ZX8A 3TONA 1VFOA 2J7BA 4GO9A 4QDMA 4ZENA 1E4LA 1QW8A 5LA1A 1GQKA 1JZ7A 2PF0A 3TTSA 3MMWA 5BROA 2EBNA 4MJ2A 3AJ7A 1Q6GA 5CLWA 3K8KA 3WUFA 4AMCA 1WDSA 4Z2HA 1OBAA 4IM4A 3WD0A 1KB3A 1LWHA 1PAMA 5IHRA 2FHFA 2CXGA 2PBOA 3PZNA 1TFVA 1NWRA 2QMKA 2D3NA 3ARWA 4CUCA 2Q8XA 5A95A 1EDQA 4WK9A 3AXIA 3PN8A 2WLZA 1BG9A 3QGVA 1H0GA 1M7XA 2VI0A 2GDUA 3WIJA 4RE3A 4C7FA 1GCYA 1UKQA 1UWQA 4U2YA 2VUYA 1KR1A 2PBGA 1E15A 2XVGA 2A3HA 4TX8A 4Q22A 4V2XA 2DSZA 1QNQA 4CKQA 4MAVA 4GI8A 2XVNA 3IJ8A 1HL8A 3VNYA 1L0PA 3NDYA 1BHGA 2F61A 3CHDA 1WZLA 3PHAA 1QI0A 1E6RA 4PMNA 3VNZA 1WZMA 2WPGA 3VGGA 3N15A 2DDXA 2IXUA 4X0NA 4JZ5A 3VMPA 4DM1A 1F4AA 4PSPA 1MXDA 2PB1A 1PIFA 3OLIA 2DT1A 4AZCB 1UG6A 3AZSA 2VRJA 2X09A 5I24A 1C8XA 1J0KA 4QLLA 5CPSA 1FHDA 4D6IA 4W5UA 2FH6A 5GPRA 4PUEA 4AZIA 4J28A 2WCGA 1NWSA 4WKAA 2X1IA 4OZOA 3ARRA 1CXIA 4K68A 4CVWA 1TUXA 2AMGA 1A47A 1J0HA 2ZXQA 4ZXOA 2XWEA 1FA2A 1QBBA 2ZE0A 1TG7A 1J0ZA 1KBBA 4HMDA 4JHZA 3WH7A 3QHMA 3PZQA 2IUZA 5A3HA 3W53A 1WNOA 1G5AA 1R86A 4CD5A 2J79A 3L4VA 4MPKA 2W66A 1ISVA 3K46A 2WMIB 3HMCA 1W9PA 3MU7A 1JI2A 4UR9A 5CSYA 3GNRA 3RPMA 4AZHA 4UCFA 5I6SA 1NARA 1HKMA 4CN1A 5DF0A 6CGTA 1RP8A 1MWOA 2HVMA 2WC3A 1MQQA 4BQ3A 4KGJA 1I1WA 3FXYA 3ZOAA 1GOWA 3BAXA 3DYPA 1R87A 1UR8A 3EDEA 3UETA 4QLJA 3S6TA 3VD5A 1PIGA 4ATDA 1GQJA 4GXPA 3CUIA 1FHLA 2CIPA 3FAWA 2PC8A 4CGTA 3RIKA 2GJXB 1J9YA 2WVSA 2YA0A 5FOOA 4AZCA 1IZKA 3CHCA 1C7SA 3BLPX 1GQIA 1I75A 3BXWA 1MW1A 1UZ4A 4P8VA 2ZX5A 5D9NA 2WHMA 2WSKA 4MB3A 3W38A 3VDAA 4PN2A 2VCBA 1BTCA 2GK1B 3ARQA 3D5HA 1HF6A 3APGA 3THDA 1XV8A 5EBAA 2WCSA 4JFTA 3WUEA 4P8UA 1V02A 2YKKA 4D6DA 2W63A 2WKGA 4D6CA 4TTUA 4P7NA 3BSHA 2MANA 1WZAA 1Z32X 1C90A 1W9BM 2CCRA 1KXHA 3AYSA 4UFLA 2FHBA 1GPFA 1VRXA 3BAYA 1UD5A 4PMYA 3AFBA 4BQ4A 1W1YA 5FKYA 2WMFA 4HOXA 3WUBA 3OGVA 1SMDA 2D24A 3ARVA 5GNXA 1W3JA 1CIUA 3VIJA 2VJXA 2ESCA 2EPOA 1BGGA 4GI6A 4UQEA 1E6ZA 4BCEA 1E3ZA 4WF7A 3WY1A 2CNCA 1OT1A 5JH8A 2OWXA 5TD4A 3WDPP 2J7DA 3LPFA 3VKKA 3SCTA 4J3WA 5CSUA 2BV9A 2O9RA 1HKJA 1UQYA 3B9AA 4B9YA 3WNLA 3QOKA 1OD8A 2WC4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1CGU A;  2VX6 A;  3EDF A;  3BAI A;  4WKF A;  4UFM A;  3ZQ9 A;  1V3H A;  2ZIC A;  1VEP A;  4BZY A;  1OGB A;  1HXJ A;  4WSJ A;  1LWJ A;  3WMC A;  1CDG A;  3BGA A;  2J77 A;  3NSX A;  1JZ2 A;  2C0H A;  4J3T A;  4ZEP A;  4JAW A;  1UR0 A;  1OWQ A;  2B31 A;  2YBU A;  5A8P A;  1VJS A;  1BYB A;  4DWS C;  1Q6C A;  2PWG A;  2DH3 A;  3M07 A;  1Q4N X;  2J4G A;  4W7V A;  1WCG A;  3I3B A;  1UWI A;  1DTU A;  1JYV A;  3L2L A;  1AVA A;  2WZH A;  3S2C A;  1PZ3 A;  3CGT A;  3WQV A;  2DSV A;  3AMK A;  4AEE A;  4UFH A;  3NYD A;  1G94 A;  1GOI A;  1C7T A;  3GNO A;  3F5K A;  3SCS A;  4CU7 A;  3W37 A;  4FLS A;  5JIW A;  1JF5 A;  4GI9 A;  1XSJ A;  3AHT A;  3AZR A;  1CEN A;  4NI3 A;  2QHA A;  1VFF A;  2WZI A;  4FMV A;  4HMC A;  2D0F A;  2D49 A;  2JEQ A;  2JEP A;  1W3L A;  3OGR A;  1FH7 A;  1YHT A;  3U7B A;  4Z2L A;  3IJ9 A;  2EPM X;  2W67 A;  4GQQ A;  5BWF A;  6A3H A;  1KWK A;  1QNO A;  4C7D A;  4FLR A;  4PTX A;  3PZ9 A;  4H04 A;  1KGU A;  2WMJ A;  2O9O A;  5HPO A;  2J7F A;  1E72 M;  3OA5 A;  1LG2 A;  3MKK A;  4BS0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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