4Z2GA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 26
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 156
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2gA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2gA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2gA01
2ZXDA 3WN6A 4R5EA 3W6MA 5BWFA 1O7AA 1VF8A 3VUPA 2CIPA 3AMGA 2XVLA 4HOXA 1VFUA 1I1WA 2WB5A 4M1RA 4W93A 5IDIA 1XC6A 2F61A 1FA2A 1AQHA 3RM9A 5TD4A 4CU7A 4R27A 3QGVA 3VIGA 5ABEA 1FFQA 4U33A 2D23A 1JZ6A 2E4TA 5I3DA 3K8LA 4CU6A 4FF5A 2ZX6A 4W84A 4OZOA 3APGA 1W1VA 1W91A 3DECA 3BAWA 3OBAA 4J3TA 2E0PA 4GI9A 3WQ6A 5FIPA 5DO8A 4MPKA 4TVCA 3W82A 4OBRA 3MO4A 2BXZA 3WQ5A 4D1JA 3GBEA 1UD4A 4AC1X 1EDQA 2J7GA 1MQRA 3ECQA 3NSXA 5FD0A 3VGHA 5A8PA 1JYXA 4AZ7A 1D2KA 2YKKA 1HL8A 3CPUA 2VR4A 2D0GA 1C93A 3VIOA 2XPKA 1WDRA 4DUVA 1ZBWA 2QPUA 3GDBA 2XFFA 3EDDA 3A4WA 3J7HA 3TTOA 5EFFA 3WUGA 1NH6A 4W8BA 4MJ4A 3HMCA 2G3NA 5BXRA 3OB8A 5BROA 2BY2A 3THCA 4L4OA 1WAWA 2X09A 2CBJA 3WFLA 1J9YA 2ZUTA 1UWQA 3U7VA 1E72M 4FLOA 1B9ZA 4GI6A 2W66A 2XGIA 1X6NA 4LYQA 2EBNA 3TOPA 2CHOA 1BG9A 1PPIA 4D6HA 3BGAA 3AZTA 2DQXA 2WCAA 4CN4A 1SYTA 4TVDA 5I77A 2PWDA 1HJVA 3AHYA 4ATLA 1Q4NX 4N42A 3IAQA 4MAZA 4PUDA 3BH4A 1JZ5A 3ZR5A 3GH5A 3AHTA 1XCXA 3NDZA 4LYPA 2WBGA 1HJWA 3POCA 1ISWA 4OOZA 2ZXAA 4D6CA 1UWUA 3MSGA 2XG9A 3WH9A 4D6IA 1LG2A 2W63A 2DT3A 3A4XA 2VZOA 4ACZA 4MNLA 1C8XA 2BHYA 5JIPA 2WMJA 4OJYA 3FAWA 2EPLX 3VMOA 4B9ZA 1QNPA 3JUGA 1XSKA 1EDTA 4UR9A 4YPJA 3VM7A 2V5DA 3DC0A 3CZKA 1F4AA 2VX6A 1MXDA 1QBAA 3ARVA 4D6JA 5DMYA 4PTMA 3OZPA 1JL8A 1PX8A 3EMZA 2EJ1A 1CEOA 1UZ1A 4TTGA 4AIUA 1CXFA 1JYNA 4W85A 4BA0A 1G01A 2W4XA 3AIWA 1G5AA 5A6KA 2YLLA 4UFMA 4NF7A 2CITA 3ARQA 1M01A 2V3GA 1C7TA 1UR9A 1KXQA 2BFGA 3GXFA 2AMGA 5A69A 1EXPA 2YOCA 1UR8A 3N12A 1J0HA 4HU8A 1WDQA 2E9LA 4M29A 4JIEA 1GQKA 1QVBA 2EQDA 1EGZA 4CVUA 3VGBA 3O2LA 1NP2A 2WHMA 4QFUA 4AIEA 3CUGA 1CENA 4UOQA 3OA5A 2XM1A 2PWEA 3QHNA 1RPKA 2ZUNA 1JNEA 3RO8A 3SUSA 3WEOA 1ODUA 2C8NA 1LWJA 2WWCA 3VX0A 4NI3A 1ZBVA 4QLKA 3WDIA 1WKYA 4OBSA 1KWGA 3UR8A 1K9DA 4NRRA 2WMKA 2OWWA 1BYCA 4S3KA 2ESCA 1W9DM 4JFWA 1W9XA 4PTVA 4MJ2A 3VDBA 1V02E 3DHPA 1KXVA 3QOMA 4L4PA 3ZIZA 5ABHA 2OSWA 3BAXA 2D22A 2E8YA 1GPFA 1H11A 2WANA 1NWTA 3TONA 5A6BD 2X8RA 4UTFA 4UZSA 4AW7A 4PMYA 1OCQA 1XSIA 3PHAA 2RGMA 2FHFA 2VRJA 4CU8A 4CUCA 1UR2A 2NSXA 4UFHA 3LPOA 1BVZA 3OLEA 3T0DA 1VIWA 4NZCA 1V0LA 2WMIA 2WVSA 3N17A 1S46A 2QMJA 4AZGA 4WF7A 1FHDA 4NSBA 1HJQA 3GBDA 3SCWA 1XYZA 1XCWA 1W3KA 2E9BA 4HA4A 2ZIDA 5FKYA 1UD6A 3AISA 1QHZA 1W9PA 3PZ9A 2PWGA 4JKLA 2VI0A 3BAJA 1CDGA 1GOOA 1OSEA 2XWEA 1EH9A 4AD5A 5D9NA 3ALFA 4MB1A 1RD6A 3AMCA 2WXDM 1UOKA 4M8UA 5AC4A 2ZXBA 2QLYA 2XVPA 5ECUA 3II1A 2GJXB 1PZ2A 4PMXA 4QLLA 3CMGA 2WCSA 2X2YA 3T2PA 4ZFMA 3GNRA 1OGGA 4XX6A 2J7FA 3RMEA 5I23A 1RP9A 4KGLA 4WIWA 5EBAA 1US2A 1QPKA 1J12A 4V27A 1K9FA 1QNSA 5CGMA 3MANA 1G0CA 1LL4A 1W1PA 1GW1A 1FFRA 4TX6A 4LYRA 1BYBA 1W3HA 5I5RA 5HOSA 2WAGA 3RJYA 2VJXA 1E0WA 4U2YA 1KXTA 3U5UA 3WH8A 2ZUUA 1KGUA 4MAVA 1DWFM 3D3AA 3GZAA 4P7QA 4CD8A 1B3WA 2UWFA 3WD0A 2G4FA 2IUZA 4MNKA 4BS0A 4AD4A 5A95A 4J3XA 2XTKA 3GNPA 1JDDA 3L2LA 5D9PA 1E43A 4B3KA 4M56A 1C3FA 4D72A 3WDRA 3VDHA 4PTWA 5A6SA 1V3IA 4GKLA 1KGXA 5A6MA 4JHZA 3MS8A 4WKHA 5C71A 1M03A 1Z32X 1CGVA 4IUGA 3SCVA 4U2ZA 3ZM8A 4AIOA 4AZBA 3NSNA 3K4DA 3D5HA 3ZOAA 1JZ8A 3UR7A 4HA3A 3AXHA 2CNCA 1CNVA 3AS3A 2VCAA 1CGUA 5BRQA 1HP5A 1F4HA 2J62A 1K9EA 1D7FA 1JFHA 2J75A 4MB5A 1E73M 1BF2A 4JFTA 2VVNA 3GXIA 1HVXA 1E3ZA 3CIVA 3HU7A 4JAWA 1UH4A 3WF1A 3BAIA 2DH3A 3W28A 1NOWA 5FL0A 2PI6A 1QBBA 1BGAA 5JUVA 1ITCA 1GQIA 1V6YA 1EDGA 1B1YA 3AJ7A 1E4IA 1XD0A 3WQVA 2WVTA 1W1YA 4PSPA 4Z2IA 1BYDA 1US3A 1LJYA 3ARSA 2DSVA 1U33A 2VL4A 3WEZA 1L8NA 4GIAA 1BQCA 5IFTA 3NSMA 3KEHA 1ESWA 2BHUA 2IXUA 3BCFA 5JBDA 3WDPP 5E9AA 1CIUA 4WJXA 3VDAA 1FP8A 2VX7A 1JG9A 3WD3A 4F66A 1ZS2A 2WHJA 3MKKA 4LXFA 2WM0A 2DSUA 2A3HA 1V0KA 1BTCA 5CXPA 1RH9A 1VRXA 2D0HA 5C70A 3B9EA 3M7SA 2J77A 2VC9A 5FL1A 2GJXA 1LL6A 3WY1A 1TVPA 1CECA 1YHTA 1LG1A 3AYRA 4WSJA 3NUKA 4GZJA 1E0VA 2ZUMA 4B16A 4TUFA 3WH6A 4DWSC 3PZOA 1E6SM 3VD7A 4PTXA 1TVNA 2PBGA 3HN3A 3MU7A 5JBEA 1M04A 1GHSA 4YHEA 4Z2LA 2C7FA 1ISYA 3OZOA 4HPHA 4B9YA 4X0NA 2J7CA 1FH8A 1UD8A 5BXTA 5DF0A 1GVYA 4D6FA 2DPEA 1ITXA 1Y7VA 4B15A 5KZ6A 4ATWA 4W8LA 4J27A 4AD3A 3UESA 3A47A 1B3VA 1JD9A 2O9PA 3W53A 4W88A 1PBGA 1WB0A 3VGFA 1E70M 1DWGM 2BY0A 4PMNA 1WPCA 4KWUA 3ZR6A 1ZBKA 1HL9A 2WWDA 1UZ4A 5BXPA 3NIYA 1TUXA 1E56A 1NOFA 3KL3A 2A3AA 5E6ZA 4PMVA 3GH4A 4JL2A 2PBOA 1CGYA 3PZNA 2XGBA 3BAYA 4AZCA 1EQCA 1E9LA 1C8YA 1JZ3A 3GNOA 3LPPA 2Y8KA 3WH5A 1VFMA 2J4GA 1WZKA 1ISZA 2XHYA 2WKLA 2YA0A 1B90A 2WKGA 5A6LA 1GJWA 3N18A 1GHRA 2D2OA 4ZXOA 1VJSA 4DUWA 4Q7NA 1J0JA 4PCSA 1TZ7A 1XGZA 4GI8A 3AS0A 3OLIA 1E40A 4NRSA 2C0HA 1SR0A 1E1FA 5CG0A 2CKRA 4H04A 4H8VA 3VIKA 5M5DA 2VRQA 1H4PA 1CGWA 4RE2A 1FOBA 1JYWA 1UKQA 3W27A 4IPLA 1NARA 1MYRA 2E8ZA 2W61A 1HIZA 3W26A 5A2CA 3L4VA 2HVMA 4U5KA 2W62A 1WZLA 4DWSD 3CZJA 1E71M 3W81A 2HISA 1UKPA 3DHUA 1X1NA 1VBUA 1E6ZA 3BLKA 4GZIA 1RP8A 1V0NA 3AS1A 2CKSA 3UEQA 1OD8A 1B31A 2OYMA 1J01A 1CZ1A 3BAKA 3T0AA 1UYQA 4JL1A 4PMDA 3UCQA 3A3HA 4PCTA 1KR0A 1PX4A 4KRTA 2WLYA 3VPLA 1ZL1A 2DT2A 4ZE5A 1X6LA 1HXJA 3SCQA 2VVSA 2AAAA 5AC5A 4P8XA 1ECEA 3CUIA 4LPCA 1TCMA 2YBUA 1XD1A 4HZ8A 1VEMA 4U31A 2V38A 1FH9A 2XJ7A 3TP4A 5LA0A 3G6LA 3GYCA 1SMDA 1NM9A 2DIEA 4DM1A 1OWQA 1H49A 2AOSA 4AZ5A 2D3LA 2FH6A 3O9NA 2VZTA 1LQ0A 3UETA 4MDOA 3AIBA 4P7LA 4P8UA 3CUFA 4E8DA 1W9UA 3OLGA 4BQ3A 4UQDA 5A3HA 2J8GA 1Q6GA 3CZ8A 5ABGA 1EIBA 4P8VA 4N0RA 4U5IA 4UZUA 4BCEA 2WC3A 2XUCA 1H09A 2Y2WA 4D6EA 2CBIA 1KR1A 3SIMA 1O6IA 1HJUA 4AWEA 4P8WA 5M3WA 2NT1A 5EMYA 4UFJA 4MB3A 3GXMA 2DIJA 1C7SA 1KCLA 4DUXA 3IANA 3WEMA 4CD5A 1AQ0A 2PC8A 2OWCA 3VIFA 1JXJA 2W92A 4CGTA 3CHDA 3B9AA 3K4AA 1QI0A 3WNLA 1B3YA 1R87A 1JFXA 1VEPA 1GZJA 1NOUA 4UCFA 3WQWA 1KB3A 2O92A 3WL0A 1AMYA 3WF4A 1W32A 3RPMA 4AZIA 3BMVA 4LGXA 4MDPA 2PF0A 4OIFA 2Y4SA 4HA1A 3DYMA 1CXLA 4GXPA 5DEZA 1FHLA 2ZX7A 4XZBA 4A4AA 5JH8A 3T08A 1AQMA 1HN1A 2ZE0A 1E6RA 3AMKA 3M46A 3T09A 2DSZA 2UY2A 3AROA 5A8OA 2WYSA 2JFEX 2GK1B 3AYSA 3L4ZA 1HF6A 5IHRA 1PZ3A 1JAEA 2UY3A 2BVYA 4ZXLA 3WF0A 3OIHA 1MFUA 3VIJA 3VO0A 1OM0A 3W25A 3AICA 1GOIA 4AY1A 3SCUA 1CXIA 2BY3A 3RILA 2EPKX 1Q6CA 1UH3A 2J7EA 4J3WA 4B3LA 2D0FA 4WK9A 1ODZA 5AY7A 1HT6A 1V03A 3I3DA 4GZEA 3NDYA 1J0KA 1UD3A 1UHVA 4X9YA 4XZWA 4MNJA 3FW6A 3MUY1 1DEDA 1BAGA 4EKJA 2BVDA 1WZMA 2J7HA 1V3MA 1TR1A 1UUQA 3WD4A 3OGVA 5A8NA 4XB3A 3WDJA 8A3HA 2X0HA 2PWHA 5A8MA 4TOQA 3WMBA 4J7RA 3PZIA 3OGRA 4RE4A 3VX1A 1KQYA 4DWSB 1DP0A 2VZUA 3FXYA 3ARZA 1LF1A 3PN8A 2W5FA 4QP0A 3EMQA 3ZT7A 3I3EA 4FLSA 3EBVA 5CPQA 5M03A 4H7VA 4CVWA 4EAMA 1C8QA 1V3KA 4UQCA 1ISXA 1GOKA 2D3NA 3GXDA 4IPNB 2QV4A 1WZAA 1JI1A 3AHXA 4QCEA 1OGSA 1EA9C 1UQZA 3CBWA 4MNMA 3W38A 4W8AA 1OT1A 4GO9A 4JFUA 3ZMRA 3N04A 3HJEA 5C8BB 3VTRA 3N1AA 2JF7A 7A3HA 1E6XM 3T0BA 2IXVA 5KEZA 1CGTA 2GUYA 3PTMA 4K68A 5LA1A 1U2YA 2WC7A 4TXEA 2WNWA 1NWSA 1ZBCA 1CGXA 3FHQA 9CGTA 2XSAA 3ZT5A 4WLCA 3VIMA 2CCRA 5A6AA 5GNXA 5CQ1A 1W2PA 1CPUA 3ZJ7A 3E1F1 4BZYA 5BXSA 1GOQA 1G1YA 3UERA 4AEFA 2VMFA 2G3IA 1GNXA 1GONA 1MVYA 2F8QA 3WMSA 3ARUA 4CD6A 1XSJA 1V6WA 3AS2A 3NYDA 3L4YA 4HU0A 2VT0A 4V2XA 2D49A 1HNYA 4HMEA 2WZEA 5HBFA 2G41A 2VOTA 2Y24A 3FAXA 4WSKA 1HKJA 2G8ZA 2FHBA 2CXGA 1E4LA 1W3JA 3N11A 2OYLA 3AXIA 1C91A 4PN2A 4C7DA 4ZEPA 1H0GA 3ARYA 5A94A 3WUEA 4E4PA 3W0KA 3WBEA 1QW9A 3VIIA 3ARRA 1CWYA 3WSUA 4IM4A 3UG5A 4JHOA 5IXEA 4UOZA 1E3XA 4HOZA 4AXNA 3SUTA 2VCBA 1W3LA 1LWHA 5D4YA 1XHGA 1BFNA 3SUUA 1A3HA 3ARPA 3PZTA 4PMOA 1HJXA 2OWXA 3WIJA 1OT2A 2D20A 3ZT6A 4XUYA 3SURA 2E9MA 3ZSSA 1DWJM 3RDKA 3VMPA 4WKAA 2PWFA 2WW5A 2WMHA 1UWSA 4PRWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CGT A;  1FH7 A;  3WKZ A;  2ZXQ A;  1R85 A;  4M82 A;  1CLX A;  1KBK A;  2WC4 A;  3CUH A;  2WPG A;  2A3E A;  1QHO A;  3U5Y A;  2CBV A;  4C7G A;  1L0P A;  3LPG A;  2E3Z A;  2DT0 A;  4W89 A;  2J78 A;  2JAL A;  3W6L A;  2EEX A;  3CH9 A;  1JZ7 A;  1KCK A;  3KL0 A;  4JFS A;  3TTS A;  1JF6 A;  3IJ8 A;  1W2V A;  2WVU A;  5I78 A;  1HKI A;  4GO8 A;  3SUW A;  4CN1 A;  2J79 A;  3MUA A;  4PMZ A;  6TAA A;  1H41 A;  2CEQ A;  2YL5 A;  4WKF A;  4JKM A;  1MW3 A;  1J0Y A;  3TTY A;  4PMR A;  4ATD A;  3SEP A;  1TMQ A;  3S6T A;  3M6D A;  1J18 A;  1UG6 A;  2GSJ A;  2YL6 A;  3K1D A;  5I0D A;  4FLQ A;  5E09 A;  5I79 A;  4ACZ B;  5DT5 A;  3VGG A;  1R86 A;  4CCD A;  4M80 A;  1PEZ A;  4F8X A;  1AVA A;  1E5N A;  1QOX A;  3WD2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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