4Z2HA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 29
Total Genus 163
50100150200250300350400450020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
50100150200250300350400450400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
total genus 163
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2hA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2hA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2hA01
3SEPA 2D3LA 4LYQA 2D0FA 1M04A 1CGWA 4IPLA 4PN2A 1EA9C 3WUBA 4KGLA 3BAKA 2DT2A 4A4AA 5A6LA 2QPUA 4D1IA 1NQ6A 5CPTA 4HMDA 3VKKA 4UFHA 1P6WA 1QNPA 3AXXA 3WENA 4QAWA 3QGVA 3VPLA 2YDSA 5FOOA 2VRJA 3VD5A 3N15A 1UQYA 1ZBVA 1K9EA 4GO8A 1CGUA 3IANA 3THDA 3VIHA 5JBDA 3F5LA 3K8LA 1W9VA 5E9AA 3MMDA 3CZ8A 1F4HA 3W82A 4H2CA 2BHYA 1VB9A 1UR2A 2E4TA 4PRWA 2ZUVA 4UNIA 2PWHA 4MPKA 1E55A 1V3IA 5E6YA 2XVLA 1PZ3A 4W5UA 3VILA 1DWAM 1AIWA 1LL6A 4PMXA 5I79A 3WQ8A 3M7SA 3MKKA 1L0PA 5BYWA 1V3KA 5HDRA 1TUXA 1QHOA 1BTCA 1GQLA 1HJSA 1WP6A 2VZSA 1V08A 1LG1A 3LPPA 2OYMA 3POHA 2CBIA 1XSKA 4JFWA 2ZX8A 3KL5A 4BQ5A 1BSIA 2D1ZA 1BPLB 4J3SA 1KBBA 1LQ0A 3OGRA 3VVGA 4V27A 4FLOA 4NF7A 4OIFA 2D2OA 2DSKA 3WDIA 4NI3A 4QFUA 1V3HA 3WF1A 5BROA 4ZFMA 3T2OA 1J0IA 1PJ9A 3GH5A 5ECUA 1BVZA 3KEHA 5M5DA 2FDMA 1HL9A 2AMGA 2OWWA 1JZ4A 4OJYA 3W4RA 3NCOA 5M3WA 1E5NA 1K9FA 3ZMRA 4HOWA 2WAGA 5DF0A 1UH2A 3SCUA 1LJYA 3NUKA 2WC3A 3IAQA 4ATWA 4PMZA 2O9OA 3A3HA 5A1AA 1QI2A 5A95A 4P7OA 4MNMA 1V6WA 5JBEA 1MQRA 2W4XA 1VEMA 4GI8A 3VOCA 3WH5A 4H8UA 4W93A 2VZUA 3UR7A 1KXVA 2WVTA 3CUFA 3QHNA 2ZXAA 5BCAA 3VGGA 2J7DA 3NSNA 2BFGA 1W9UA 3E1F1 3MMUA 3WUEA 5BXPA 3F5JA 3AIQA 2RTSA 2BVTA 2VL4A 3MUIA 4D6CA 3VIOA 1BG4A 1GOQA 5HBFA 4TUFA 3VD3A 3WNKA 2F2HA 2BY2A 1OD0A 4A3HA 3ZR5A 1GQJA 2J47A 3SURA 5A6JA 1XYZA 3CUIA 2ZE0A 4E8DA 2J25A 2ZXBA 4AC1X 1UD6A 3IAPA 3WQ4A 3MV01 1ED7A 4UZSA 5GQBA 5BXSA 4UQ9A 4P8VA 5DEZA 1I75A 3FHQA 3ZT6A 2WK2A 2ZUSA 3WD3A 1O7AA 2E0PA 3MSGA 1JNDA 2AAAA 2ZXDA 3UCQA 2Y24A 5BRQA 3BC9A 2A3HA 3N04A 4UZUA 4AZ6A 1JF5A 4FF5A 1C3FA 5A6AA 4KRTA 2VRQA 2JEQA 2W5FA 1JZ6A 1BVNP 2YLLA 1J11A 4UTFA 5DMYA 1C92A 1CLVA 3VINA 5HPCA 3AZTA 2VCAA 1WE5A 1WZMA 2VOTA 3CMGA 3EMZA 4H7VA 2JIWA 4HOXA 1JZ8A 4HA1A 3W37A 2JE8A 2VJXA 5JUVA 1FHLA 2CXGA 1BQCA 2JALA 2QF8A 3OGSA 2D49A 1Q6CA 3WN6A 4UOQA 4MNLA 5A2BA 2X09A 1V3MA 1J0JA 1FA2A 2BV9A 4MTVA 4LGXA 3ARTA 1QBAA 3PTQA 3OG2A 2VX5A 2DH2A 3CHFA 3IK2A 1VENA 1NARA 2VCCA 2J7GA 2EXOA 1UKSA 2EQDA 2OYKA 1WKYA 4AIOA 2YL8A 3TTYA 3SCPA 4OUEA 4CU6A 1J0ZA 4E8CA 2WLZA 1QI0A 2WYSA 1NWRA 1E70M 4WSJA 1C93A 3GNOA 2WBKA 3W53A 1K6AA 4ZXOA 1W1YA 3WDJA 1XCXA 4J3WA 2YBTA 2YOCA 1MW0A 4Z2IA 3PZTA 1DWFM 3T2PA 4TOQA 2A3BA 3OIHA 3B9DA 4M80A 3HJEA 6CGTA 2WMJA 3SUTA 4MB4A 2BNJA 2Y4SA 2W63A 4XUYA 1HF6A 4PCSA 2OSYA 1J10A 2VC9A 1KR1A 3AIWA 4EE9A 3CZEA 4EAMA 3OB8A 1R8LA 4PBGA 4H04A 3OBAA 1JAKA 2WWCA 3DYOA 1A3HA 1G9HA 4AIUA 3OLIA 5F7UA 1CXLA 3ZJ8A 5A8NA 2EEXA 1VEOA 2D3NA 1ZL1A 4IM4A 1JXJA 5FKYA 4U2ZA 4F9JA 1W2VA 4TVUA 2VUYA 1A47A 1UWUA 4QDMA 1W1VA 2XYLA 4LPCA 2DSWA 1CECA 1XH2A 3VGFA 3VD4A 2WBGA 3QHOA 3U5UA 1ISWA 1QHZA 3ECQA 1PIFA 2X8RA 3VMPA 4W8AA 1M01A 1YQ2A 1J0HA 5JIPA 1BYBA 3I3EA 1B3ZA 4M56A 2J62A 3TOPA 4DUWA 4HTYA 2WVVB 1JGIA 1KGWA 4M24A 1Q6EA 1E73M 1UWRA 4M8UA 4GXPA 2WZHA 4N42A 2CIPA 1GOIA 3UESA 4BCEA 4J28A 1E5JA 3VGBA 2W66A 3W24A 1HKMA 4NRRA 1DWHM 1C7TA 3BAIA 1H41A 1OIMA 1D2KA 2VURA 4C7GA 4FLRA 2WSPA 4AD0A 4AMCA 3U57A 3WUFA 3QOKA 4DWSC 2DIEA 3OLDA 2GFTA 1UKQA 1NWUA 1AQMA 3CTTA 2BY1A 1HX0A 4QCEA 3CZLA 1VJZA 1E9LA 2WSKA 4F66A 1GOMA 2W91A 1H5VA 2QMKA 4Q22A 1EIBA 3NIYA 3WUGA 3FXYA 3ARVA 3ARPA 2ZWYA 1KWKA 2V38A 2EBNA 4MNJA 2X0HA 1O6IA 2V5CA 2MANA 2XVKA 2PWDA 3ZO9A 1B30A 4BA0A 5DT7A 1UZ1A 3WNMA 3BAJA 3FAXA 3B9AA 4D6JA 3VU2A 1E4LA 1GVYA 2WMGA 4CVUA 4CD8A 4AYSA 5M03A 4IUGA 5E09A 5A6BA 3OGVA 3WL1A 1WDQA 2E9LA 5I2UA 1OD8A 3IJ8A 1ITCA 1TMQA 1TVPA 2NT1A 4PSPA 2V5DA 5A6KA 3QR3A 2V3FA 4RL3A 1BYDA 1AMYA 1CGTA 5DO8A 3GH7A 1M03A 2Y8KA 1KCLA 1OBAA 2WM0A 1B3WA 2VMFA 5CJ5A 3AIEA 2ZWZA 1FH9A 4TXEA 1G01A 3RJYA 3CUHA 1V3LA 4MB3A 1LWHA 2DIJA 1V0LA 2E3ZA 1FFQA 2ZIDA 3NSXA 3WH6A 2GDUA 4GI9A 2WVVA 1B0IA 3QOMA 4PMOA 1G1YA 1W1TA 1HKIA 1KXQA 1EGZA 4JKLA 1H49A 3WKZA 4L4PA 4UQEA 2G4FA 2VNCA 4CCEA 2Y8VA 1TZ7A 1PX3A 3D5HA 4D6GA 5GPRA 3VO0A 4WJXA 1WPCA 4AZHA 5A8QA 1CGYA 5GNXA 4P7NA 1QI4A 3RM4A 2WHKA 1VAHA 2PB1A 3ZJKA 1UA7A 1C7SA 1HL8A 1E4IA 1L8NA 3VIJA 1E56A 4E4PA 3II1A 3VD7A 2VZOA 2WLYA 1OT1A 1V03A 1JYXA 1H11A 4D71A 3WF3A 3O2LA 1PIGA 4AEFA 2J74A 4LQ1A 3RM8A 5FCZA 4CU8A 5JIWA 5CPQA 3WNOA 2XFFA 2YA0A 4WIWA 3PZVA 4W7UA 3U5YA 4E2OA 2CYGA 4JL2A 3WNNA 1Z32X 2X1IA 4ATDA 1W9PA 2CPUA 2EPLX 4MAZA 4AD3A 1KQYA 4AZ5A 5D8ZA 1HVQA 3ZR6A 1UZ4A 4JFTA 3VM7A 1ZB5A 1WZAA 4AY1A 1C8YA 4PUDA 3MS8A 1E6SM 3WFLA 3VIPA 2Y5EA 5EFDA 1EH9A 3M6DA 2XPKA 1GOKA 4CD5A 1JG9A 1H09A 3DYPA 2GJPA 2O9TA 4MADA 3KE0A 3VGEA 2WCAA 4RE3A 3VGHA 3ZJ6A 5EBAA 3WEZA 2WC7A 4J3XA 2YKKA 4W88A 1VFMA 1H3GA 4UFKA 4IISA 1SMAA 2J75A 2ZUTA 1VFFA 1GVIA 1MXGA 3PBGA 4BS0A 2CERA 1CXIA 2DH3A 2PBOA 3TTQA 3AHTA 1KR0A 2XJ7A 1JZ2A 4DWSA 1RP8A 1JD7A 5AYIA 5C8BB 2WB5A 1TVNA 2W92A 1NP0A 1HKKA 1GZJA 1R7OA 1TCMA 1ODZA 2G3JA 1KXTA 5IXEA 2ZUWA 4Y7EA 1ESWA 3CZKA 2ZX6A 5BXRA 3AI0A 4GIAA 2J8FA 3L4ZA 2EPKX 1HP5A 4HMEA 4PMYA 5M17A 1QI5A 1F4AA 4W85A 1BYCA 2WZEA 1SYTA 1HJUA 5KZ6A 3VX0A 3N9KA 2FHFA 4RE4A 3N11A 2PWFA 1C90A 4OBRA 1C8QA 1UD4A 3RIKA 4W86A 5JH8A 2NW0A 2BHUA 4NSBA 1W9XA 5A3HA 3SUUA 2GUYA 2DT0A 3AIRA 1CLXA 4X0VA 3CUJA 1UH4A 3F4VA 4M1RA 3SUSA 4AZCB 5FL0A 3WQ5A 3WMSA 4CN4A 1JDCA 1GCYA 1RP9A 3CUGA 2QLYA 4J7RA 5E0CA 4P8UA 1W9BM 1U33A 2DGAA 4UFMA 1ZBCA 6TAAA 3LPOA 1VRXA 3O6AA 4L4OA 4LYPA 3W26A 4F8XA 2UY2A 3WMCA 4BF7A 4KRUA 4EKJA 3NDYA 3GXDA 3TTOA 3T0DA 1JYVA 4B9ZA 2TAAA 2Y2WA 1J18A 3GNPA 1ODUA 1VBUA 2XVGA 4W5ZA 3VIMA 1OCQA 2PF0A 3PTKA 3T08A 4W89A 3WBAA 3AROA 4JIEA 2XUCA 2GK1A 3FAWA 5ABGA 3W6MA 3AHXA 2EPMX 3B8SA 5I77A 1JIBA 3L2MA 4ZE4A 3A4AA 2XFYA 3AHVA 3W0KA 4OBSA 1JF6A 2QPSA 3AIBA 1B3VA 1BFNA 4WSKA 4PMVA 3BCDA 1E0XA 3WQWA 4Z2JA 1HXJA 2O9RA 3ARRA 5IDIA 4OOZA 3K46A 3VX1A 2J7EA 1TG7A 1W1PA 3AYRA 1ZBWA 4K68A 4D6DA 1OT2A 1PX4A 1VF8A 4KH2A 4LYRA 4AZGA 2UY5A 1GOOA 1HJWA 1FH7A 3TA9A 5D9OA 1SMDA 5I23A 3JUGA 1FFRA 3ARUA 1IZJA 3VNZA 1H0GA 2X2YA 1W3JA 1E4NA 1H4PA 3SCTA 1KQZA 1MFVA 3CMJA 4B9YA 4XZWA 2G3NA 4PMQA 4AZCA 5AC4A 3RM9A 4QLLA 3CHEA 3LPFA 4TTUA 4W7WA 4D6FA 4KGJA 3VD9A 1US3A 1E4MM 3GXIA 2VCBA 5CSYA 1H0IA 4W84A 3WD1A 1GHSA 2XIIA 1IZKA 4XV0A 4DM1A 5DT5A 3VIIA 2ZOXA 1OB0A 2VI0A 4JFVA 2CESA 2YJQA 1FHDA 1KWGA 1W3LA 3GZAA 3CHCA 4BQ4A 3WSUA 2XG9A 3CIVA 4GO9A 1JXKA 4UFIA 4PTWA 5KEZA 4HP5A 1QNSA 4BQ3A 2G3IA 3L4YA 3U7BA 3AZSA 1DWIM 2C0HA 2YBUA 4KMQA 1UR4A 5FL1A 5BRPA 3MUAA 1QBBA 4UQCA 3SIMA 1NP2A 3BCFA 1D7FA 4FLSA 5E70A 1V02A 3PZIA 1NWSA 2UY3A 3PZMA 3EDEA 3GXFA 5D9MA 1BF2A 2VR4A 2XTKA 3FNDA 4MB1A 2XVPA 3K1DA 3L2LA 3VUPA 1Q6FA 3CH9A 4AXNA 2BXYA 2V3DA 3N12A 3KL3A 2PBGA 2JF7A 3EDKA 1OGBA 1C91A 9CGTA 5CXPA 2D22A 2ZX5A 4AD5A 1FH8A 3AFBA 4GZJA 4AD2A 3M46A 1PEZA 1PZ2A 3OA5A 3PZQA 2FHBA 4MNKA 4GKLA 3GBDA 1UWTA 1X1NA 1JL8A 3BAWA 1GONA 3PZUA 2VZVA 2CKRA 3EYPA 3BLKA 1JZ7A 4HA4A 4UFLA 2CBUA 1NOWA 3ZJ7A 3FW6A 2VX6A 4BZYA 2WHMA 1NOFA 3ZSSA 3AJ7A 1CWYA 5C70A 1E1EA 1EDGA 4C7FA 2XWDA 1YHTA 5HPOA 1XHGA 2JIEA 2XM2A 2Q8XA 2E40A 4YPJA 2CCRA 1J0KA 4D1JA 1PAMA 2DSUA 1B3XA 3RILA 4CCDA 2PC8A 3WH7A 1QNOA 1UH3A 1XYFA 4HU0A 4F9DA 2WCGA 1W32A 2VRKA 4JHZA 3PTMA 3IJ7A 5A69A 4WK9A 4DUXA 1E0WA 2J8GA 2V3GA 3CHDA 4JCMA 2BY0A 5A6MA 3SCQA 4D6IA 2DSZA 1AQ0A 1E6PA 3AZRA 4AZBA 3CZJA 4V28A 3SCWA 2OSXA 3U7VA 4R5EA 4CCCA 1NWTA 8A3HA 1UD2A 1B90A 1Q6GA 1MYRA 1XD0A 1J01A 3AXIA 1TE1A 2WPGA 4TX8A 3WNLA 3WIJA 3ARWA 4A3YA 1JDAA 1BAGA 2CEQA 2XFRA 3NYDA 1I1XA 4CUCA 3WDPP 1UQZA 4CD7A 1G0CA 4PMRA 4HPHA 1XV8A 4JFUA 2AOSA 1GJUA 1V0MA 1Y7VA 3K8KA 4GZEA 4NZCA 3MUY1 3M07A 1AQHA 4JCLA 1EDQA 1KGUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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