4Z2JA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 31
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
total genus 161
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2jA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2jA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2jA01
1E43A 4BQ2A 3APGA 1H11A 2QMJA 4GO8A 1SR0A 1ZB5A 1US2A 1E70M 2YLLA 1VFUA 2VR4A 4Z2IA 3NUKA 1B31A 2PWEA 1HT6A 1MXDA 3N11A 1GJUA 2VRKA 3D3AA 4UQCA 1C7TA 5A6AA 4UFJA 1HJWA 1V6WA 2D0FA 1H3GA 2O9TA 2ZWYA 4D6FA 2ZUUA 3PTMA 2DH3A 1CGYA 5I3DA 2X2YA 1EA9C 4UQBA 1BAGA 3VDCA 3KL0A 1VIWA 2Y24A 4TVCA 5M3WA 5D9OA 1HXJA 3BMVA 3VGBA 1J0ZA 1R87A 3MO4A 2TAAA 1SMDA 2DH2A 3T09A 5A6JA 3T0DA 1PEZA 3ZJ6A 3GM8A 3ZSTA 1KQYA 2F8QA 1KXVA 3SCRA 2CBUA 3M07A 9CGTA 3N1AA 3CBWA 3LPGA 3ALGA 3AIUA 5JH8A 1KGUA 2VRQA 1ODZA 1J10A 5M5DA 5EFFA 4F9JA 4UOZA 4M8UA 2ZUMA 1BYCA 3O9NA 4PRWA 1LWJA 4B16A 2CEQA 4MNMA 3BC9A 1MQRA 3WKZA 1UWRA 4P8XA 1LG1A 4M1RA 3ARWA 1CENA 2J77A 3ALFA 4BF7A 1RP8A 3GXDA 4GI9A 3WN6A 2J4GA 4UTFA 4V28A 1GVIA 3L2MA 1FFQA 3WUBA 1JYNA 4M80A 3GXFA 2ZE0A 5GNZA 4NRSA 2OLHA 3AIEA 2WMHA 1UA3A 4CCEA 1KCLA 2J7FA 5C71A 4H2CA 3CMGA 1PIGA 1KGXA 4TVUA 3HN3A 1NP0A 2YBTA 2F2HA 4UR9A 3GH7A 3SCTA 2WNWA 2YA0A 3L4XA 1US3A 3W25A 2E8ZA 5I79A 1A47A 4JHOA 2ZOXA 2OYMA 1V0MA 1VEPA 4C7GA 4MJ2A 3KL3A 1QNSA 2XUCA 2E8YA 1CECA 1HJXA 1PX4A 2XSAA 4CD5A 2VZUA 3I3BA 3AXHA 1WDPA 3MV11 1E1FA 3F5JA 2O9OA 3OB8A 4JL1A 3M6DA 1UR9A 1W2PA 2E9BA 4W93A 2BVDA 5LYRA 1SMAA 1H49A 5BXPA 1GW1A 3L4ZA 2W62A 1NM9A 1S46A 2PWFA 2WKGA 4AIOA 1HP4A 4JAWA 3WQWA 3RO8A 2VZVA 4PSRA 3U5UA 4TTGA 2X05A 5A8NA 5A95A 1TVNA 1WPCA 1NWTA 2ZX7A 2ZUWA 5D9MA 2DSKA 3VM5A 4CU8A 2E9LA 3EMCA 5CQ1A 3ARXA 3QOMA 4U2ZA 3W29A 3ARVA 2PBGA 3SCVA 2VOTA 1W9PA 1W2VA 2CIPA 2WWDA 2WC3A 1MWOA 1BGGA 3WDIA 1UWIA 1NOWA 5E70A 1MYRA 3W0KA 3VIOA 3VX1A 3QOKA 1B3XA 3CUGA 3PN8A 3VIPA 2D2OA 3EDJA 2J7CA 3AJ7A 1EIBA 4QLLA 4AD5A 4DWSC 1R85A 1C8XA 1QI4A 1VBRA 2ZXBA 2WMGA 2XGBA 1EH9A 1U33A 1U2YA 1LQ0A 4IPNB 4GIAA 2CESA 3A6OA 1V6YA 3AZSA 1TVPA 4W8LA 2BHZA 2D22A 3ARSA 4GXPA 1TE1A 1EGZA 2V3DA 4UNIA 4DM1A 3PTQA 1QPKA 1MW1A 3AMCA 2XJ7A 1JD9A 4H04A 4J27A 2XVPA 2CNCA 3AMKA 1KWKA 1VBUA 3PZTA 4PCSA 3ZIZA 3OLEA 1QW9A 4NZCA 1CTNA 1ISZA 4J3WA 3TP4A 4JKLA 3WQ8A 1C92A 2CBJA 3AHXA 2O9RA 1I1WA 3ZT5A 3VOCA 1OT2A 2J7EA 1WB0A 5A8PA 1TMQA 1B2YA 4MDOA 1B3YA 5CLTA 1E5NA 1DP0A 2XM2A 4DUWA 4UFLA 3QHMA 3BH4A 1LL7A 5D8WA 5I6SA 2BS9A 4CD8A 3PZGA 4QAWA 5BWFA 3VGGA 3SEPA 1W1PA 2DIEA 5ABFA 4ZXLA 4AZ6A 3LPPA 1UR2A 4PMQA 1ECEA 5CGMA 3NCOA 3AHVA 2X0YA 3AHTA 2A3BA 3MUZ1 4OUEA 4HA1A 1H0IA 2WVTA 1ZJAA 3FAWA 2NT1A 3CHFA 1MVYA 4JL2A 5C8BB 2E3ZA 2W61A 1B3WA 2DPEA 3BLPX 2ZXAA 1C90A 2XVKA 3SUTA 3UERA 3WL0A 1QVBA 1HVQA 1V3IA 3CZLA 1W3JA 1E73M 3SCNA 2WLYA 1K9EA 2WZEA 4QCEA 4R27A 5HOSA 1HNYA 2V3FA 2XVNA 2VZSA 2XYLA 1H41A 4HOZA 5GNXA 2EPKX 1ZJBA 4HZ6A 4M29A 1J0YA 3WEZA 4UOJA 1Q6CA 3ZQ9A 3GBDA 2E9MA 4P8WA 4BQ4A 2WPGA 4MAZA 4GKLA 2BY2A 2G3NA 2VC9A 4CGTA 2D0HA 4H41A 2ZIDA 3I3DA 1QW8A 4W88A 3S6TA 1DWIM 4MADA 2DT1A 2A3AA 1WZKA 3VDAA 4ZE5A 2B31A 3FHQA 2D0GA 3VVGA 1BTCA 2D20A 1UH3A 1QI2A 6TAAA 1V3MA 2G8ZA 1E5JA 1B9ZA 1V6UA 3VGEA 5FKYA 3CHCA 4H8HA 2XFFA 1UZ1A 3UR8A 3CZKA 4HZ7A 2BV9A 5IFPA 3WDPP 3DYPA 4FF5A 2QV4A 4QP0A 2CBVA 1OD8A 3UR7A 1V08A 3AI0A 3WF2A 1CYGA 2QF8A 4ZE4A 5E09A 2YOCA 1NOUA 1LWHA 4XB3A 3CMJA 2VVSA 4PMVA 3WBEA 4HA4A 2DT0A 2YA1A 2DDXA 2GVYA 3WUFA 4AIUA 5A69A 3RJXA 2PWDA 3U57A 5CGTA 3SCQA 4F66A 3VIFA 1WAWA 1KXHA 5LA2A 3BLKA 3EDFA 1Q4NX 3OG2A 3VILA 4ATDA 3U5YA 3ZO9A 4YHEA 3K4DA 1ZL1A 5AY7A 5CSUA 3VDHA 4PMDA 1DWJM 5BROA 1E4LA 1M7XA 3FXYA 4B9YA 4KGJA 3POHA 7CGTA 3T0BA 3VD7A 3QHNA 1HN1A 1FH8A 3WF0A 2WLZA 4ACZB 1O6IA 5FIPA 4LQ1A 2FGZA 3K8MA 2DSZA 4J3VA 4WKAA 4PYSA 2C7FA 2HISA 1GPFA 4A3HA 4C7DA 2G3JA 3CZGA 3VMNA 4E8CA 3TOPA 1CGXA 3CHDA 2QPUA 1VFOA 3HJEA 2J74A 1VFFA 3BSHA 2CERA 4CCDA 1ISYA 1HKKA 2ESCA 1OGGA 1WNOA 1OSEA 4HPGA 1DWGM 1JAEA 1BSIA 4P7LA 3AIRA 4J3XA 3II1A 4Z2KA 3ZJKA 1ESWA 2X0HA 1ODUA 1V0KA 1EOKA 4FLSA 4GZIA 4AYSA 4U31A 2BHUA 1XRVA 3NSXA 4XUYA 2XG9A 5CXPA 1MFUA 1WDRA 1E6PA 4W86A 3SCPA 3UESA 1XC6A 3WUGA 3AS1A 2IXUA 2PBOA 4GO9A 3NIYA 4CN4A 1P6WA 1PIFA 1GQKA 2CBIA 4B9ZA 4RE4A 1K9FA 5CSYA 1JD7A 3GXMA 4A4AA 2C0HA 1Q6GA 1N82A 1NP2A 3DECA 1IV8A 2J79A 4GQQA 4EAMA 1BVZA 3OA5A 4UCFA 2ZXQA 2CCRA 4NF7A 1VRXA 1V02E 1GOQA 1QOXA 4AISA 1BYDA 1QNQA 2BVTA 2WMFA 1O7AA 4IISA 2GJXA 2WMIB 1GQJA 2HVMA 3NSNA 3KL5A 2OSYA 1CWYA 1TUXA 3HMCA 1FA2A 2AMGA 1VENA 1CLVA 1ZBKA 1G0CA 3L4TA 2VI0A 3WIJA 3T2QA 3SUWA 3MV01 4L4OA 1XD1A 1UWSA 2W92A 3WDRA 2BFGA 4GINA 3WDQA 2EPNA 3WD4A 1PBGA 4N42A 3AMGA 2W67A 3A47A 1LL4A 3CLWA 2CYGA 2Y8KA 4J3UA 3IANA 7A3HA 1HIZA 5A6BD 1UD4A 4BCEA 1FHDA 5BRPA 2QMKA 4WLCA 4JFWA 4W89A 4U3CA 2D24A 2YIHA 1CPUA 5JUVA 2WB5A 3WMCA 3MMUA 3SUSA 5FD0A 1MQPA 4KGLA 1E6QM 3IJ9A 2UY4A 4JZ5A 4U5IA 2CKSA 1CXLA 2GUYA 2DIJA 1UR1A 3WEOA 2VRJA 4WSJA 2WC7A 5KEZA 1JZ6A 2CHOA 8A3HA 4FLQA 2E0PA 4AEEA 1E4IA 3AQUA 3WSUA 1F4AA 3L4VA 4NSBA 4U5KA 4JKKA 4AZCB 2VURA 4V2XA 1WE5A 2WHJA 4E8DA 2UY2A 2J47A 2RGMA 3KE0A 4CUCA 3VD4A 1UKTA 5EB8A 1E1EA 1JZ5A 4DUVA 5A6SA 1E6XM 4HMEA 4AZBA 5DFAA 1VJSA 2V5CA 4PMUA 5CG0A 3CUJA 5HNNA 5A2BA 3PBGA 4PTVA 1I1XA 1XSIA 1CLXA 4UFMA 4MTVA 3NJ3A 1V6VA 3AYSA 4QDMA 5JIPA 1SYTA 1Q6DA 1GONA 5ECUA 1L8NA 3W37A 3ARUA 5A8OA 1JYVA 3WQ5A 1CGWA 5BCAA 4W5UA 1BF2A 2FH6A 3WEMA 1DWFM 1TG7A 1E6RA 1B3ZA 4YPJA 4D6CA 1VF8A 3W38A 4OKDA 1UKPA 2ZUTA 1XSJA 1JI2A 4UQ9A 2VUYA 3LMYA 3FNDA 3QHOA 1LJYA 1FFRA 1BYBA 2GJPA 4JFVA 1MW0A 3TTOA 4HTYA 4Z2JA 4CCCA 4S3JA 3BMWA 3WFLA 1XH1A 4YHGA 5DF0A 1UR0A 5I78A 1W1TA 5CZKA 2FGLA 3TONA 2WZIA 1PAMA 5TD4A 3S2CA 1CEOA 1ZU8A 2VX7A 3WNMA 1XHGA 5D4YA 5HPOA 3MSGA 3W4RA 4D1IA 4GI8A 2WM0A 4XV0A 1CXKA 1J0KA 2F61A 3IJ8A 2J7GA 4OJYA 4BS0A 4URIA 1HJQA 1W9VA 4L4PA 1UWTA 4MB1A 2W4XA 1GUVA 1AQ0A 2CXGA 4DM2A 1E15A 1C7SA 1UD3A 2JF6A 4AW7A 1WZAA 3RILA 2D1ZA 3ARZA 2XIIA 3GNRA 1G01A 2WVVB 1QI5A 1B30A 1G1YA 3BAJA 2YKKA 3WF1A 3FHAA 4DWSB 4GI6A 1BLIA 1Q6EA 1QNPA 1R86A 2VJXA 2AOSA 1UR8A 2VO5A 1JDCA 3WQVA 1GQLA 4MNLA 3VIMA 1X6NA 1HVXA 2BVYA 3AFBA 2Y5EA 3EBVA 5E0FA 3VTRA 2QLYA 3HU7A 3VMPA 5LA1A 3AOFA 4AZIA 3VGDA 4Q7NA 3TA9A 4ACZA 5I5RA 4WJXA 4IPLA 1E71M 1ISWA 3U7BA 2PF0A 2XHYA 4CN6A 1ED7A 3VPLA 4QCFA 2JEPA 4P8VA 4OOUA 3MSDA 1NWRA 1E6SM 2V3GA 5DMYA 1D2KA 5A8QA 4CN1A 1JZ8A 1WDQA 3WH7A 3VGFA 3PZMA 3AS2A 2IUZA 2CPUA 4W85A 1E3ZA 4TXEA 1PX3A 3U7VA 2VT0A 1E72M 1JL8A 2XFYA 5I23A 3IAPA 1HL8A 1E6ZA 2XTKA 3BAKA 2YDSA 1XD0A 2G3IA 5DT5A 3BGAA 5FCZA 4P7QA 3FN9A 3NDZA 3O6AA 2Z1SA 1AIWA 1UH2A 1YHTA 2V3EA 3EDKA 1GZJA 4C7FA 5HDRA 4MB4A 2VVNA 5I0DA 1J0HA 2IXVA 4HMCA 5AC4A 4OOZA 5A8MA 1NQ6A 1V02A 4LX4A 2FDMA 3ARYA 1MFVA 4JCLA 1PX8A 4PN2A 3GNOA 5FL1A 1W32A 1FH9A 1E0WA 5HBFA 2EJ1A 1UD2A 1G9HA 1DTUA 3VIHA 2NSXA 2WBKA 2JE8A 4OZOA 1GOWA 1GOOA 1EDGA 1EXPA 4D1JA 1NARA 3WH9A 2ZX8A 3W81A 4RE3A 2YL6A 4X0NA 3OGSA 4D6IA 1JZ3A 1UKOA 4TOQA 4ZFMA 5ABEA 3ZT6A 2XM1A 4HOWA 1GOKA 2PWGA 4R5EA 1XSKA 3SURA 1UYQA 2ZICA 1W3LA 4PMZA 4LXFA 4JIEA 1WZMA 1DHKA 3NYDA 3K4AA 4KH2A 4Z2GA 4M56A 3A4AA 2NW0A 2OWXA 2WK2A 1EOMA 1GCYA 2WVUA 3FY1A 2Q8XA 3I3EA 1KBBA 1H2JA 3SUVA 3CZ8A 2X1IA 1JZ4A 2PC8A 1OWQA 1VB9A 2WZHA 1QHZA 1K9DA 3OGVA 1ZBCA 2FHFA 1KGWA 3TTSA 5JIWA 4HZ8A 4AZGA 2VL4A 3RIKA 4PUDA 1UH4A 1BG9A 4LYQA 4QFUA 5CPQA 1OD0A 4HOXA 2PI6A 1L0PA 4AZHA 1E4NA 1QI3A 3UG3A 3K1DA 3UCQA 2BY0A 5JBDA 1JAKA 1KR1A 4PMNA 2OSWA 3F5KA 3W6MA 1ITXA 1UG6A 3G6LA 1H1NA 3CUHA 4QLKA 4OBRA 3B9DA 4B3LA 2W66A 1LF1A 5E0CA 2O9PA 2D49A 2W5FA 1WO2A 4WSKA 3SCSA 1VAHA 3A3HA 2J75A 4W8BA 4HP5A 5D9NA 1NOFA 2WWCA 1KQZA 1M03A 1Y7VA 3WF3A 3T0AA 1PPIA 1JXKA 2VNCA 2WC4A 4FLRA 4ML4A 1E6NA 4E2OA 1WKYA 3AXIA 2ZUSA 3WUEA 4H8UA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3M7W A;  4ICC X;  3OO2 A;  1P6C A;  4TQT A;  3W1M A;  5AB3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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