4Z2KA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 32
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 164
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2kA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2kA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2kA01
4N0RA 1HXJA 4CN6A 4GI8A 1ZBVA 3WMSA 3CO4A 1H3GA 4MPKA 3AHXA 1V0NA 2Z1SA 3GBEA 1V03A 1KGUA 1UA3A 1KQZA 1GORA 2G3MA 4ACYA 1O6IA 3CGTA 2NW0A 3T0BA 4W85A 3OLEA 3CTTA 4UTFA 4P7OA 1HJSA 5CXPA 4J27A 1MVYA 2BY1A 1GOWA 3VMPA 1UWUA 1E70M 4JHZA 4MAVA 3GNRA 2D24A 5IXEA 1MFVA 3CHFA 2ZUWA 1BGGA 2D23A 4X0NA 3FNDA 4GINA 7A3HA 4U2ZA 2EEXA 2QPUA 3K8LA 1QNSA 4CKQA 1GQJA 3GYCA 4GIAA 4UFJA 1JDDA 2WVUA 4PMZA 1LL6A 3SIMA 3AXHA 4WSKA 4PMRA 3UCQA 1KXTA 5DMYA 3MV11 5GQBA 5FL1A 3RCNA 5IHRA 1H09A 4J3TA 1JFHA 2X2YA 2J77A 1GHRA 2ZIDA 2DT3A 2YIHA 3FHQA 5JUVA 4M24A 5CJ5A 1XSKA 1Y7VA 5EB8A 3OLDA 5A6BD 2BY3A 1QHZA 1VFOA 3IJ7A 4AD4A 3MANA 4AD0A 3AHZA 3FY1A 3WNMA 1R8LA 1NWUA 1FFRA 3DECA 3MMWA 1C8QA 4CD7A 1Z32X 2BY2A 3BAXA 3GXFA 2JE8A 1OWQA 1KB3A 5A6LA 2W63A 3VD9A 2YKKA 1CPUA 1KR1A 3TTQA 1XC6A 2V3EA 3ARRA 4MJ4A 1RD6A 2DSKA 1FP9A 1XV8A 1JZ6A 1K6AA 5C70A 1V3MA 4JL2A 1QI2A 1R7AA 4KWUA 1JI2A 5ECUA 4Q7NA 2J47A 4MNJA 4FLSA 1H2JA 3KWXA 1E73M 1P6WA 1E4LA 1Q6DA 4V2XA 8CGTA 3WDPP 1C92A 3WL1A 4HOXA 1UKTA 1OIMA 3PZTA 1K9DA 3N12A 4CD8A 2A3EA 4RL3A 1Q4NX 1RP8A 3VGDA 1CYGA 1PIFA 3VUPA 1CGXA 3AMCA 1UYQA 3EDKA 3VNYA 3VKKA 3WUGA 3AQUA 1D3CA 3F5KA 2ZUNA 1LF1A 3EYPA 2V38A 3WQ6A 3NSNA 1E3XA 3PTMA 4AXNA 3DC0A 2WB5A 2XG9A 4YN5A 2B31A 4X0VA 2F8QA 2WMIA 4PBGA 2E9MA 2EPLX 4OUEA 1ISVA 1W9BM 2WXDM 3GZAA 1ODZA 1B3XA 4PRWA 1ESWA 2W66A 4AD5A 1G9HA 1V6UA 3WN6A 3GBDA 4Z2LA 2BVDA 1HP5A 5A95A 1JXKA 4CCEA 1OGBA 4M81A 2OSYA 3T0DA 1V02A 2G8ZA 2OYMA 2VX4A 3U7BA 3QHOA 2VL4A 3SCWA 2XPKA 4JCLA 3VD5A 3W26A 4H8VA 4ML4A 2UWFA 1JYNA 3N11A 2EPKX 3AMLA 4FLRA 2OYLA 2W61A 3D5HA 2O92A 2GK1B 3APGA 2BXZA 1PJ9A 1PAMA 3VDAA 1DWGM 1FA2A 1H1NA 4D6JA 5D9PA 3VIGA 4AIUA 4HU8A 3CMJA 3EMCA 5JBFA 2VCAA 2AOSA 2WVVB 3G6LA 4OKDA 3T2PA 4YHGA 1DEDA 4AY1A 3BAYA 3LPFA 3OGSA 3IK2A 2Y4SA 3IAQA 3N15A 3WEZA 4EK7A 3WQ5A 5I0DA 4MDOA 9CGTA 1MYRA 3L4ZA 5M03A 1PEZA 4KRTA 4UFMA 3W24A 5HPOA 4UQBA 4UZUA 5LA1A 4PN2A 5IFPA 4PMYA 3MO4A 4U2YA 2GDUA 3S6TA 4AEEA 5A8PA 3BCFA 3AZSA 3HN3A 1EHAA 2YL9A 4J28A 2QV4A 2CHOA 4NZCA 4PTWA 1B3ZA 1QBBA 3WDIA 2WHKA 4MB4A 4FLOA 4UFIA 2DQXA 1V3KA 2UY2A 1W1VA 3WDQA 2VX7A 3EDDA 1VBRA 4Z2IA 3B8SA 2ZUMA 3WMBA 2WMFA 2XUCA 3FAWA 1CECA 2HVMA 4NF7A 2V5CA 2VQUA 1ITCA 3THDA 2MANA 4PTVA 4P7NA 4OOZA 4YHEA 1XHGA 2G3IA 1BQCA 3WH6A 1GNXA 4HA4A 1OD0A 5CSUA 1HKMA 2J8FA 1NWTA 4D6IA 3SUVA 4MNMA 4J7RA 4B9YA 4QLJA 2HISA 1Q6EA 4JZ5A 1EQPA 1KWKA 1CXIA 3SCNA 2EQDA 1E0VA 2XJ7A 5AC4A 1OGSA 2EO7A 5HBFA 5E09A 2RTSA 3F5JA 3WD1A 1JD7A 3PTKA 1E6SM 3N18A 1XCWA 1L8NA 1NM9A 5KZ6A 2ZOXA 4PUDA 1E5JA 1V3LA 1NP0A 1JZ7A 4J3XA 1LLOA 4ATWA 2DSWA 4WJXA 1ECEA 1RPKA 4Z2JA 3MUIA 1ZJAA 1M03A 1VFMA 2PBGA 1UR1A 2XIIA 2WM0A 4S3JA 1VRXA 3GH7A 1TVPA 1C7SA 1E1EA 1WKYA 5TD4A 1XH1A 1NARA 2QPSA 1KCKA 3CUJA 1QI3A 1C8YA 1W1TA 1ISWA 3CLWA 1LJYA 1J12A 2D1ZA 4QP0A 1EA9C 3GNPA 4E4PA 4FK9A 4MB5A 3BXWA 5CLTA 5I78A 3VGEA 2J7BA 3PZMA 5CQ1A 3WD4A 5AY7A 2DSZA 3MMUA 1UR0A 1V3HA 1V3IA 3VIOA 3WENA 2JIEA 3VD4A 3HJEA 2WLYA 1F4AA 4ZENA 3WF3A 2RGMA 3ZO9A 1BVZA 2ZUSA 3AI0A 4N42A 3T0AA 2WZIA 4X9YA 3ARWA 3WDHA 2ZXAA 3L4YA 3BAIA 1V6YA 1GOQA 4CU7A 3W25A 5FD0A 1JNDA 1B3YA 4YPJA 2WMJA 4UOQA 2ZXDA 2QMKA 5GNZA 4ZXLA 4MB3A 4OBSA 5AC5A 3VIMA 3VDBA 2CBUA 3NUKA 4AD3A 2EXOA 3AS2A 1W1YA 3UG5A 2GJPA 3WQVA 1E6XM 3W29A 2CPUA 3L2LA 3ZJ6A 3SCPA 2IUZA 2ZX9A 3OA5A 1NQ6A 4TX6A 3SUUA 1C90A 1MWOA 1Q6FA 1WZMA 3PN8A 1CLXA 1D2KA 1E72M 1H4PA 3L4VA 2XFRA 3SCOA 2J8GA 1WZAA 1J0YA 2CKSA 3PZOA 4LPCA 1NOFA 2OWCA 3QHMA 4XB3A 4HA1A 1ZJBA 2J7FA 1DWJM 4V27A 3BGAA 4GZEA 1OM0A 1ZS2A 3OLIA 4QCFA 2J7CA 5BXSA 4JFSA 1XD1A 4GKLA 3WQWA 4BQ2A 1EH9A 4UOZA 4HPGA 4P8XA 2VRKA 3OZOA 1BYDA 3AHYA 4CCCA 1HKIA 4UFLA 3PBGA 4AW7A 1E0XA 1JG9A 1GONA 1BF2A 2WHLA 3WUFA 4W84A 3NSMA 4PCSA 3NYDA 1LWJA 1UD3A 4CVUA 5A8OA 3WD2A 1C8XA 1MXGA 1VEPA 2J4GA 4JFUA 4PMXA 3OGVA 1WPCA 3ZIZA 1V6VA 4BF7A 3KL0A 3AIVA 2IXVA 1H41A 4H41A 1E3ZA 2V5DA 2BXYA 2WMKA 5E9AA 5CG0A 5I3DA 4PSPA 4W8LA 5AYIA 4TTUA 3SCQA 1UUQA 4W88A 4S3KA 1GOMA 2PC8A 2QHAA 3AYRA 2VO5A 3ZJ7A 2BNJA 1YHTA 1BHGA 4MNKA 2Y8KA 3AYSA 3L4XA 3WNKA 1RH9A 1QI4A 1VIWA 1RP9A 1XYZA 4B15A 1BG9A 4UOJA 3RMEA 3UESA 4J3UA 1C3FA 2XGBA 5IDIA 3IJ9A 2VZVA 1I1WA 4HOZA 5ABEA 1CBGA 5DO8A 4D71A 3L4UA 1K9TA 1W9DM 3RO8A 5ABFA 1B31A 3L2MA 4HMDA 1QNOA 3ARTA 3SCTA 1LL4A 3EBVA 3VMOA 1EOKA 1W9PA 2VMFA 1GUVA 1QHOA 4H8HA 4UFHA 5A69A 2GDVA 5CLWA 1PZ2A 4PTXA 3BCDA 1ISXA 3AMKA 3ARXA 5DFAA 4HPHA 1UWSA 1W91A 1QW9A 3WH8A 2WBKA 2FH8A 3AIUA 2WVTA 4MB1A 2J75A 3N13A 3T2QA 3K8MA 3VGBA 2YBUA 4IPNB 1UZ1A 4H2CA 1B2YA 7CGTA 4MAZA 1X6NA 1W3KA 4OZOA 2BHZA 2YDSA 4QFUA 3IANA 5A6KA 4W5UA 2BVTA 4GO9A 2DEPA 4HMCA 1IV8A 1E4MM 2E3ZA 1ZL1A 2X05A 1Q6CA 3VPLA 5LA0A 1AMYA 4A4AA 3AIQA 1HL8A 4M82A 3U5UA 4EE9A 4B3LA 4ZEPA 1NOUA 2JF7A 1E6PA 4HMEA 1VJSA 4PUEA 4TTGA 1UKOA 4C7DA 2CITA 1VF8A 3AXXA 5GPRA 2J7EA 3CHEA 1J0ZA 4NI3A 2E8YA 5I23A 4W8AA 1GOIA 3W37A 1JI1A 3FN9A 5FOOA 4WK9A 1AQHA 1JF5A 3CZJA 4CU6A 4AZCB 2VCCA 1J0IA 3PTQA 1XGZA 1V0LA 1EDTA 2XHYA 2V3DA 5A8QA 1QNQA 3WF2A 1CXKA 5BWFA 1CEOA 2XVGA 3RDKA 4R5EA 1QNRA 3VX0A 1BYAA 3KEHA 1E5NA 4B16A 1XSIA 1CXEA 2WHMA 4BS0A 1HP4A 5DT5A 1HJQA 3AISA 3WFZA 2YA1A 1E0WA 2OSWA 2WK2A 1FOBA 3CZLA 3MU7A 1NH6A 3GTNA 4HOWA 2Y2WA 1UWQA 2YL6A 4D1JA 3AIWA 4F9JA 4Y7EA 1J0HA 4PSRA 1CZ1A 2WAGA 1SMAA 5C8BB 4EANA 4U3AA 2WZHA 1TA3A 3NJ3A 1B1YA 2O9PA 1E9LA 4MDPA 3N1AA 2VRQA 1E56A 2WMIB 2E9BA 3AHTA 5A94A 2D22A 4J3VA 5CGTA 1IZKA 2VQTA 4TVDA 2UY5A 5E0CA 3BSGA 2YA2A 1NWSA 2CBJA 4TUFA 1E6QM 3WD3A 2YDQA 5M17A 1B3VA 2VR5A 1JDAA 3AFBA 4GPNA 4E8DA 1E6RA 4W8BA 2D2OA 5A6AA 3W81A 5JH8A 2NSXA 1WNOA 1DWAM 2EPNA 5CSYA 3ARSA 2GSJA 3ZR5A 1CGYA 3TTSA 4D6EA 5JIWA 3DYPA 2VVSA 4D6HA 1KXHA 3CH9A 3TTYA 2CBIA 4HU0A 3N04A 2XVNA 4JKKA 1J0JA 1NOWA 3U5YA 4WKAA 1WZKA 1EIBA 3D3AA 4DWSA 2VTFA 4CN1A 5HNNA 2CETA 1M01A 1FHDA 2BS9A 1EQCA 1W9XA 1OT2A 4DWSC 4ATLA 4QLLA 1DWFM 3N9KA 3MKKA 3OG2A 4P7LA 3RJYA 1W2VA 4CU8A 2YOCA 1TVNA 1S46A 4M29A 5GNXA 3BMVA 4PMVA 1A47A 1R86A 3CPUA 4MADA 1HIZA 4FF5A 3QR3A 4ZE5A 2VCBA 5BXRA 5KEZA 3N17A 1CWYA 4AEFA 4CCDA 1FFQA 2O9RA 2GJXA 2W92A 2WC4A 3LPOA 3WUEA 3AJ7A 5ABHA 2WMGA 4JCMA 4AZ5A 4QAWA 4LXFA 3AOFA 1UZ4A 3K8KA 1DWHM 1OIFA 2J7GA 2CKRA 2GK1A 1UKQA 4W87A 1WE5A 3AIEA 2D0HA 3T08A 2O9OA 4QCEA 5JBDA 2JF6A 1LQ0A 2DT0A 1UD5A 2YBTA 3U57A 4F9DA 1W9UA 2V3GA 3WFLA 3MS8A 1CXFA 3CHCA 1ODUA 4OJYA 5CGMA 1G1YA 2FHBA 1IT0A 5C71A 4IM4A 1CDGA 3NDZA 2FH6A 1UH3A 5LYRA 4IPLA 2W4XA 3WNLA 3EMQA 1VEMA 3BH4A 1LWHA 1AVAA 1QNPA 1KGWA 1BAGA 1WP6A 1B30A 1IZJA 2FGZA 1CENA 3CUFA 1W3LA 5BXTA 2DH2A 3WF0A 3AS0A 4D6DA 1UA7A 2DT1A 2WC7A 4AIEA 1E43A 4UQDA 1C7TA 1VENA 1HJUA 4UR9A 1BPLB 3VINA 1E71M 1BYCA 2E4TA 1MW2A 4RE2A 5I77A 1JL8A 2CESA 4JFVA 4HZ7A 1JYWA 5HXMA 2IXUA 3PZVA 2DH3A 4IUGA 1HJVA 4TVCA 1L0PA 5DF0A 2JEQA 2DSUA 1KWGA 1GZJA 2C8NA 4C7FA 3O9NA 3OLGA 4TX8A 3MMDA 1B90A 4DWSD 1V6WA 4DUWA 3KL5A 1X6LA 4W7WA 8A3HA 3SCSA 5E6YA 2AAAA 1HL9A 2YLAA 4OIFA 4B3KA 3IAPA 3CHDA 2V3FA 1KBBA 1FH7A 4PMDA 1UR9A 2J25A 3K46A 2CCRA 1GQLA 4KH2A 2D0FA 1KFWA 4W5ZA 1GVIA 2CBVA 5EFDA 1PX8A 2J7DA 3VVGA 4BQ4A 1ZBWA 4A3HA 3UETA 2E8ZA 3NIYA 3BMWA 3ZSTA 1DHKA 2Y24A 4JKMA 4GQQA 5D8ZA 3VO0A 2VUYA 3PZGA 5D9MA 1OSEA 5LA2A 2WHJA 3G6MA 4Z2GA 3VIJA 3ZSSA 4Z2HA 1GVYA 1UG6A 2CNCA 3MV01 3CMGA 3I3EA 4DUXA 3AZTA 2D3NA 3VIHA 5M3WA 2YL8A 3WH9A 3TOPA 2ZXBA 1GQIA 2WSPA 2J74A 4FMVA 5A6MA 2TAAA 2WCAA 1LL7A 1US2A 2G3NA 2ZUTA 2CHNA 1QI0A 3LMYA 4PEEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3KL3 A;  3CZG A;  1FHL A;  3GM8 A;  3VIF A;  2Y8V A;  2WPG A;  4JHO A;  1HN1 A;  1J9Y A;  4P8U A;  1Q6G A;  3AIB A;  5A6B A;  2CER A;  4WLC A;  1R85 A;  1PX3 A;  1WB0 A;  1UD8 A;  3WKZ A;  2YDR A;  3TP4 A;  3VGG A;  2XFF A;  2XWE A;  2A3H A;  3CZK A;  2VX5 A;  1C91 A;  2JAL A;  1HVQ A;  5BRP A;  3ARU A;  1GQK A;  4BZY A;  2ZX6 A;  1BFN A;  3AHV A;  1G5A A;  1UWR A;  3NSX A;  5ABF B;  2W91 A;  5D9N A;  2PF0 A;  3E1F 1;  1BVN P;  2ZWZ A;  2YJQ A;  1W1P A;  2XIB A;  3RPM A;  4ACZ B;  3WUB A;  4LGX A;  1J18 A;  1GJU A;  4W7V A;  3A47 A;  1HJX A;  4U3C A;  5E6Z A;  1UR4 A;  2WWD A;  4K68 A;  3EDF A;  3W0K A;  2XFY A;  1CTN A;  1V08 A;  4MJ2 A;  4W93 A;  2PI6 A;  2WZE A;  3WEO A;  2J62 A;  2XSB A;  1ZB5 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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