4Z2LA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 33
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2lA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2lA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2lA01
1CGYA 1V3HA 5CJ5A 3K8MA 1YQ2A 4W8BA 4Z2IA 2G3JA 2XTKA 3OZOA 1FFRA 4P7RA 1HIZA 2D3LA 4KMQA 1M7XA 3N13A 4ATDA 3WNNA 1OCQA 3ARZA 1GORA 1CXHA 2GUYA 4F66A 4UQBA 2ZX6A 3U7BA 2XYLA 1HP4A 3BC9A 2OYLA 3ZR5A 3S6TA 4AD5A 5D9OA 4W86A 2V38A 1VRXA 1ITXA 2EPKX 1B3XA 1XRVA 3AIUA 2VOTA 4RL3A 1GVYA 2J25A 1BG9A 2YDRA 2J7FA 3IJ9A 5DO8A 4UCFA 4LYRA 4S3KA 3WF3A 3MO4A 2JEPA 3VGHA 4W85A 2XSBA 4LXFA 4PYSA 3HU7A 2VCCA 4IM4A 4CD7A 4PMQA 4NZCA 3I3DA 1QHOA 3VD9A 1NOWA 4MDOA 2JE8A 4UQEA 4Z2GA 5A8OA 3T0DA 1CXFA 1S46A 3ALGA 4W5ZA 3II1A 3POHA 1FH8A 4MNJA 2Y8VA 4M56A 2VNCA 1OIFA 2WMHA 2ZOXA 3UG4A 4PMYA 4QAWA 1B90A 1GOQA 3AHXA 1JD9A 4WKFA 3D5HA 3M46A 3VIHA 3VO0A 7TAAA 5DF0A 1KXVA 1X1NA 1M53A 4Z2JA 2AOSA 1ZB5A 2BNJA 1JAEA 3W82A 1GPFA 4HA4A 5CGMA 1BVNP 2VCAA 1E4LA 1BLIA 3W27A 4F9DA 1V3JA 4P8VA 4BQ2A 4CD8A 3WMCA 2FH8A 1G1YA 1CGXA 3A4AA 1QI0A 2XVNA 4LX4A 4JKMA 4HOWA 1B3YA 2RGLA 3BMVA 3MSDA 2YBTA 4AD3A 4JFUA 1J10A 4PMDA 1JYXA 1WKYA 5HNNA 1VIWA 2WMGA 3TP4A 1HJSA 3CUFA 4ACYA 3WFLA 5BXRA 4KGJA 4BQ3A 1HN1A 4BQ5A 2WLYA 3OLIA 1ZBKA 1FP8A 2DSUA 4UQDA 1OIMA 4E8CA 1JXJA 1C7SA 1LQ0A 4PCSA 3GH5A 1TUXA 2J7BA 3LPFA 4UZUA 1B9ZA 5DT5A 1KCKA 1W9DM 1TVNA 4HA1A 4GZEA 2D0HA 3VM5A 4A3YA 1MFVA 2VZTA 2E8YA 5CPSA 5ABGA 3BAXA 3WF0A 2XWEA 1V0KA 3SUWA 4AZGA 3B8SA 5HPOA 1GW1A 3BAKA 3AIVA 1VB9A 2J77A 4TVDA 2CBVA 1LG1A 5HDRA 1ZL1A 3RIKA 1TMQA 1ISZA 3ZJ8A 1HT6A 4J28A 2W92A 3U57A 1MQRA 4MAZA 1CXEA 2WHLA 4E4PA 1FA2A 5A2BA 4XZBA 3OGRA 2PF0A 4PMVA 4D6CA 4JFWA 2EXOA 3VGFA 4ZENA 3GNPA 4PUDA 3AXIA 4CVWA 3F4VA 1CNVA 3B9EA 5GPRA 3VGBA 4AXNA 3CBWA 1E55A 4B3LA 1E43A 2CITA 3AIQA 1O6IA 1E6NA 5I24A 1E15A 2GJPA 4U2YA 1CGWA 1RP8A 1EOKA 1OB0A 1XD1A 1WCGA 1XH0A 3CZJA 5DEZA 3A3HA 2DH3A 2BVYA 7CGTA 3W38A 4D71A 3THCA 3SCUA 1JXKA 2FHCA 1MQQA 3MANA 3WUFA 4PMRA 4GPNA 3RM9A 4ATWA 3VTRA 2O9OA 1JF5A 4Z2KA 2Y4SA 5CLTA 6CGTA 1CBGA 3AZRA 2WVVA 3WD2A 1UH2A 3GH7A 1C7TA 1ZBVA 1BYBA 4LGXA 4W8LA 3VMNA 3KL5A 3WDRA 1EXPA 2JEQA 2BXZA 1UA7A 1PZ3A 2QV4A 1J18A 1G5AA 5ABHA 4DM1A 1VJSA 4C7GA 1UWIA 3WH6A 3MMWA 4LQ1A 2QMKA 2WVUA 5D9NA 1FHLA 1LLOA 2FGLA 1KQZA 4HTYA 3TA9A 1JL8A 1ZBWA 3WQVA 3RM4A 1UR1A 2WANA 5E6ZA 3VIGA 1LWJA 5BROA 3PZVA 4N0RA 4WSJA 5ABFA 3VX1A 3WL1A 2J4GA 3DYPA 1JDAA 3FW6A 1PX4A 3VU2A 4UR9A 3ALFA 1XSIA 5IFPA 1JDDA 1VFUA 1JZ3A 1QI3A 4JAWA 4P7LA 2VI0A 3ZR6A 2YIHA 5BXSA 2BHZA 1C8YA 2V3DA 1JYWA 3CUIA 3WH8A 3N17A 1VJZA 1V6YA 1LWHA 3OLEA 2D49A 5FL0A 2X05A 1CTNA 1XCWA 5CZKA 1C93A 1UD2A 3NCOA 3S2CA 2QMJA 4MADA 8CGTA 5JBEA 3GTNA 2OWWA 1KWGA 4PTWA 4D6JA 3K8LA 5IFTA 2V3FA 1W1YA 4H2CA 1UKTA 3ARQA 2QLYA 4UQAA 3PZIA 4CD4A 3KL3A 2JF7A 3VIOA 4QLJA 1R85A 2D2OA 5AC4A 1FH9A 2O9PA 2UY4A 3KZSA 4MJ2A 2WYSA 1EDTA 2WC4A 6TAAA 3O9NA 1R8LA 3TTSA 2XFYA 1UA3A 3RCNA 4D6EA 3GNOA 4B16A 4D6FA 2XJ7A 2BY2A 2VTFA 4J3SA 4U5KA 4KRTA 3CZGA 2CBJA 2CKSA 4JL1A 4D1JA 3J7HA 1HKKA 2CERA 3CPUA 5FCZA 4GINA 1ZJAA 3FN9A 2GJXB 1J0YA 3MV01 3WD1A 1E4NA 1JZ2A 2NT0A 1E3XA 4KH2A 1BYCA 3ZJ7A 3BSGA 4NSBA 4DWSC 1UWUA 4PSRA 4CD5A 1E0VA 3WQ4A 1JZ6A 2W66A 1JZ8A 4BA0A 2YA2A 1W3LA 2E0PA 3RILA 2VQTA 1OWQA 1UZ4A 4BZYA 5A6MA 1XV8A 1UWRA 4P7QA 3HMCA 4JFSA 5DMYA 1H5VA 3L4VA 1V0MA 1G0CA 1GOKA 2VUYA 2J75A 3VIJA 3VPLA 2ZXBA 4TXEA 4W7UA 2V3GA 4JFTA 2V3EA 4UOJA 1NM9A 1GZJA 1NWSA 1UKPA 3AISA 4J3UA 1V3KA 1HKJA 3K8KA 3ZSTA 3F5KA 2WPGA 1MXGA 3MUY1 1D7FA 1BHGA 2WBKA 5BRQA 4QFUA 1W3HA 1D2KA 1CZ1A 2GFTA 3WEMA 3GBEA 3KE0A 3CHCA 3BGAA 4LYPA 1TA3B 1CYGA 1XYFA 5A1AA 3NSMA 1GQJA 3CHDA 4DWSB 5I23A 1WZLA 4U2ZA 3AS2A 3CZEA 3IK2A 1W1PA 1AQMA 3FXYA 1VBRA 5D9MA 2VRKA 2E4TA 3AICA 3VGGA 1JYNA 2WC3A 1HJUA 5KEZA 1PPIA 1WAWA 4WJXA 2VX5A 3AIRA 2PWGA 4DUVA 4B9YA 3FAXA 1Q6DA 4Y7EA 1UR4A 1V6XA 4WKHA 2BY1A 2J7GA 1E71M 1PX3A 3L4UA 3DHUA 1QBBA 1CPUA 1XH2A 3GZAA 3UETA 4N42A 4AZCB 1UR0A 3DYMA 5AC5A 2W5FA 1CLXA 5TD4A 3N18A 3SCNA 3L4ZA 3RPMA 5HXMA 2WNWA 3BH4A 3VKKA 1ISYA 3SCVA 1TFVA 2WZEA 3GBDA 3QOMA 2PC8A 1CXIA 1O7AA 3WDIA 1U2YA 3AMGA 5CLWA 4QLLA 3K4AA 5GQBA 3CHFA 2EPLX 1EHAA 2DT3A 1E5JA 1OSEA 2W91A 1WDPA 1G94A 2E9BA 3OLDA 1FH7A 1UQYA 1OBAA 2WWDA 3AIWA 2XPKA 1VEPA 2WKGA 3PZNA 2ZUVA 4CD6A 2J78A 3ARRA 2ZUNA 4AD0A 4GXPA 4FLOA 2CBUA 3QR3A 1MW2A 1LL7A 3ZT6A 4TVCA 3DYOA 2UY3A 1Q6CA 1E5NA 5DFAA 1PIGA 1BTCA 2BV9A 2XWDA 1H49A 3WMBA 1NH6A 2VZOA 4QCFA 1KGXA 4DUXA 1DWIM 2Z1KA 2VMFA 2J79A 4L4PA 2ZUUA 5CPQA 4IPNB 3FY1A 2NSXA 5A6AA 1UH4A 1W9PA 5EMYA 2YLLA 3ARWA 2EPNA 1LL4A 2CCRA 4PEEA 4V2XA 1MYRA 1W3JA 3WQ5A 1ITCA 2E9LA 1JF6A 2Z1SA 2CEQA 2YA0A 1BSIA 3NDYA 3MS8A 4MPKA 3PZMA 2XIBA 4E2OA 3LMYA 3UEQA 3PTMA 1NP2A 1JG9A 1ODUA 3QHOA 2ZIDA 1BGAA 3MSGA 2VX4A 1QNRA 3CZKA 1KXTA 1EA9C 1JNEA 4CCDA 2GVYA 3SCQA 3BCDA 2GK1A 1GOOA 1EIBA 1EHNA 1JIBA 4IPLA 4EE9A 2Q8XA 3AMLA 1R86A 3CH9A 1EQPA 2WMIB 1HKIA 3OGVA 1H0GA 2IUZA 3AZSA 4CN6A 4HMDA 2YL8A 1ISWA 2CYGA 1HJXA 5I6SA 2FHBA 2WZIA 3ZSSA 4M29A 1E6ZA 3W6MA 2DT1A 3N9KA 1OGBA 1WZMA 4NF7A 1CGVA 2Y5EA 3GYCA 3MU7A 1E73M 4PMOA 3SCWA 4GZJA 2DT2A 4DM2A 5FL1A 9CGTA 1VEOA 2DSZA 1PJ9A 1K9DA 4A3HA 1L0PA 2PBGA 3VNZA 4U33A 3AXHA 4B3KA 2XVLA 2EQDA 1WZKA 2J47A 3VD5A 3KL0A 1KGWA 4NRRA 4QCEA 1ESWA 3SUTA 2XVGA 1J0ZA 4MB3A 3W29A 4AZBA 2WXDM 2D0FA 2WHKA 2PWFA 3UERA 2XG9A 4GQQA 1E70M 4OJYA 1K9EA 1EQCA 3TOPA 1BPLB 2YKKA 3ARTA 1YHTA 5JBDA 1MFUA 3PZTA 4OZOA 3TONA 4XX6A 4KRUA 5CG0A 2JIEA 1A3HA 1W3KA 1DWGM 1V03A 1B2YA 5IHRA 4OOUA 1GOMA 5E0CA 1BAGA 3EBVA 4UFHA 4PCTA 4JZ5A 2CXGA 5CSUA 1Y7VA 4X0VA 1KBBA 4JHOA 4W84A 4JKKA 5CQ1A 4ZE4A 3UG5A 5A8NA 4CKQA 3ECQA 4X0NA 3EDJA 4FMVA 4JCLA 3VX0A 1OT2A 2WVTA 3ARVA 4F79A 1GVIA 1GJUA 1DHKA 3AQUA 1JAKA 2F8QA 2WSPA 1MW3A 4P7NA 4URIA 3AHVA 1IZJA 4ACZA 3SCSA 1UR8A 4RE4A 1ODZA 1GONA 3WL0A 3O2LA 3K4DA 3RMEA 2A3EA 3BAJA 4ATLA 4D6IA 3AI0A 4GI9A 4XUYA 1XSKA 3NIYA 4PUEA 4PMXA 1J0JA 1JI2A 4H8HA 3WEOA 4AC1X 2BHYA 2XFFA 4CVUA 2AMGA 1UD6A 1E6QM 4J27A 5JUVA 3GXIA 3SEPA 2DEPA 1XYZA 1H41A 7A3HA 2FHFA 5KZ6A 1QNQA 4TVUA 1ECEA 1C90A 1VEMA 4B9ZA 4HP5A 5BYWA 3WD3A 3W26A 1EH9A 2Y2WA 4YPJA 4Q7NA 4DWSA 4WIWA 3W6LA 4H8UA 2D3NA 4TOQA 1QW8A 1H0IA 1OGSA 4K68A 4PRWA 2QPSA 2WC7A 4W93A 5A6BA 4UQ9A 3QHMA 4CU7A 3L2MA 2WW5A 1GCYA 1SR0A 2WB5A 5LA2A 1VBUA 1Q6EA 4UNIA 4CCEA 1BYAA 2WK2A 3WY1A 1B3WA 4ZEPA 3WF2A 2O9RA 4AZCA 1UD3A 4LYQA 2EBNA 2JFEX 4BQ4A 3A4WA 4J3WA 2W62A 3ZM8A 4AIUA 1E6PA 3NUKA 2BVTA 3M07A 1PZ2A 4IUGA 3VD7A 1B3ZA 3N1AA 1J0KA 1BG4A 3WUBA 4AD2A 4L4OA 1MVYA 4OBRA 3TTYA 3WD4A 1LG2A 1LJYA 2YLAA 2ZXQA 1FHDA 1UD5A 4AZ5A 3BAWA 2BVDA 1E6XM 4WK9A 4AZHA 2E40A 3U7VA 5A8QA 3F5JA 4H04A 4W89A 5CSYA 3BAIA 5I0DA 4M24A 2W63A 2X09A 2VZVA 3AS1A 5A6SA 3EMCA 3SUUA 1C8XA 1PBGA 2HISA 3IANA 5EB8A 3VINA 3RDKA 2Y8KA 5FOOA 4H8VA 2V5DA 1AIWA 4TTUA 3VDHA 4U5IA 2IXUA 5A6JA 2PI6A 4X9YA 3WNPA 5E9AA 4ZXLA 4PMNA 5M03A 3EDDA 2XHYA 1V3IA 4EANA 3POCA 3BAYA 2ZUWA 3WEZA 1GJWA 3AS3A 4W87A 1XGZA 4P8WA 2YA1A 1CIUA 1E0XA 4Z2LA 1EO7A 1WZAA 2VVSA 5E09A 4UTFA 5BWFA 2ZXDA 4CCCA 3MMUA 4Q22A 1XH1A 3VMOA 3MKKA 1UQZA 1WE5A 5AYBA 2J8FA 3MV11 1BGGA 3AHTA 4JKLA 1B3VA 1CDGA 5GNXA 3G6MA 2ZX8A 1CLVA 1NWTA 3BLPX 4OUEA 2FDMA 4WLCA 1TVPA 1Z32X 2F61A 3CZLA 1V6UA 4W5UA 4GI6A 2BS9A 3HJEA 3ZJKA 3UESA 4MNKA 2WWCA 1KR1A 4M82A 5LA1A 2Y24A 4JL2A 4AISA 2WMIA 2GDVA 3O6AA 5CXPA 3WD0A 1M04A 2ZUMA 3AHZA 4P7OA 5M17A 3SCTA 2A3HA 3VD4A 5FKYA 1KR0A 1HJWA 3W25A 5A95A 2W61A 2DT0A 1W9BM 3OGSA 3GNRA 3GH4A 2XIIA 2E9MA 1IT0A 1E6RA 1JD7A 3DECA 1QW9A 1Q6FA 2EO7A 1KQYA 3EDKA 2DH2A 3VNYA 3AOFA 1HKMA 1VF8A 4J3VA 4AIEA 5FD0A 2ZUSA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3STP A;  3MHG A;  3QMR A;  2DSK A;  1Q3N A;  5CZT A;  5BCA A;  3FEM A;  1VBJ A;  4HIB A;  4C6N A;  4NU7 A;  3E2V A;  3WNL A;  3FYP A;  3A4X A;  4QX4 A;  3OIH A;  4D6H A;  4H7C A;  3R94 A;  1G7U A;  5FIP A;  2BG5 A;  1PL9 A;  1DWH M;  5FA5 A;  1K02 A;  4N4P A;  1B0I A;  4LEF A;  1JCM P;  4XZL X;  3FA4 A;  1UW9 A;  4ACZ B;  3MZ2 A;  1Z48 A;  1V51 A;  2BB0 A;  2G96 A;  2OSW A;  1EL3 A;  3BQ6 A;  4IQL A;  2Y2Q A;  1FKB A;  1O66 A;  3MUX A;  1XBV A;  1GEQ A;  2F2D A;  1EXB A;  2A7N A;  4M6V A;  2RSE A;  3H2E A;  3QHN A;  3IJ8 A;  3DI1 A;  2VO5 A;  1MO0 A;  4C1K A;  2DUX A;  1IT7 A;  2OLS A;  4G50 A;  1U1U A;  4DJE A;  1E0U A;  3USB A;  3H4X A;  1T8Q A;  2X2Y A;  5FEX A;  2PPP A;  2FAP A;  1KFW A;  3RGC A;  2FTW A;  5CSS A;  1NY1 A;  1T99 A;  3KOF A;  4F0M A;  3WQ6 A;  3PUL A;  4IOT A;  1UAS A;  4TTG A;  2J8T A;  1UR9 A;  1EDQ A;  1M41 A;  1R30 A;  3ZLG A;  4JTG A;  4NNB A;  3WUG A;  4YVV A;  4ZXO A;  1I8J A;  5F4W A;  4O1A A;  2ANU A;  1OFB A;  3DFP A;  1XLA A;  3MWA A;  2QPU A;  4UFI A;  2BSL A;  1XRT A;  4R5E A;  1TCM A;  1YAT A;  2FZM A;  3CZ8 A;  4MWA A;  1ONE A;  1YBQ A;  1F3E A;  5E0F A;  1EPV A;  2EUL A;  4GIS A;  3WLM A;  2QUV A;  3DHF A;  3SUS A;  4YWI A;  4IQ2 A;  3UG3 A;  3SR7 A;  2WBG A;  4WKA A;  4FR6 A;  3DH7 A;  1KM0 A;  3BSH A;  3K4W A;  3T09 A;  2UV8 G;  3W7D A;  5I06 A;  1QHZ A;  3B8V A;  3TN5 A;  5KET A;  5I3J A;  1E6S M;  1FP9 A;  1TIW A;  2ZZ1 A;  3THQ A;  1VYR A;  4LRT A;  3CIX A;  1H7W A;  3ZZ1 A;  3MQT A;  1SQ7 A;  1BF2 A;  3CAK A;  4PUL A;  1L9W A;  1PZ0 A;  5HWN A;  8A3H A;  3OO2 A;  4S2C A;  4DF1 A;  2W3Z A;  4OKD A;  1X6N A;  4XD4 A;  5LIK X;  4OJ6 A;  4OOZ A;  3M64 A;  2XIJ A;  3EOL A;  2XGI A;  3ICJ A;  1KCX A;  3VOJ A;  2OZ3 A;  4PBG A;  3FHA A;  4XB3 A;  1WP6 A;  2WKL A;  2ZTK A;  3A47 A;  3DEN A;  4K38 A;  1Q6Q A;  2ZRY A;  4Q8U A;  4JTD A;  1RK5 A;  1XSJ A;  4AW7 A;  3VM7 A;  1HF6 A;  1H11 A;  4DN1 A;  4ICN A;  4CUC A;  2IOU A;  3LI0 A;  2GLK A;  5LA0 A;  2YCI X;  3UCQ A;  3HGO A;  1CXL A;  3WBE A;  3GXD A;  4LNY A;  1A5U A;  3IKD A;  1OFQ A;  1SFS A;  3ZVH B;  3N3M A;  1PAM A;  3T4C A;  4E8D A;  3LRM A;  1K1D A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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